Method Article
Здесь мы представляем высокопроизводительный протокол для временной трансфектации миллионов протопластов кукурузы для тестирования больших библиотек плазмид в клетках мезофилла кукурузы.
Трансфекция клеток мезофилла кукурузы часто включает в себя переваривание клеточных стенок растений для создания протопластов, а затем вставку ДНК с помощью электропорации или полиэтиленгликоля (ПЭГ). Предыдущие методы были разработаны для получения десятков тысяч трансфицированных протопластов одновременно. Здесь мы описываем простой метод выделения и трансфекции миллионов протопластов мезофилла листьев в кукурузе (Zea mays L.). Этот оптимизированный процесс устраняет некоторые распространенные этапы протопления, такие как промывка в W5. Кроме того, такие этапы, как центрифугирование, трансфекция, опосредованная ПЭГ, и инкубация были модифицированы для работы с большим количеством протопластов. Способность экспрессировать большие библиотеки плазмидных конструкций позволяет проводить эксперименты в масштабе генома, такие как массово-параллельные репортерные анализы кукурузы.
Транзиторная экспрессия генов является мощным инструментом в биологии растений. Однако растительные клетки трудно трансфицировать, потому что они окружены клеточной стенкой. Этот барьер для проникновения ДНК отсутствует в других широко изучаемых типах клеток, таких как клетки млекопитающих или насекомых. Прошлые исследования решали эту проблему, используя протопласты: растительные клетки, клеточные стенки которых были переварены и удалены. В отличие от необработанной ткани листа, с растительными протопластами легко работать в суспензии и они поддаются методам трансфекции, опосредованным электропорацией или полиэтиленгликолем (ПЭГ)1. Растительные клетки сохраняют большую часть своей функциональности даже после удаления клеточной стенки. Таким образом, протопласты используются у различных растений для изучения функции генов и белков2,3, для понимания сигнальной трансдукции4 и для определения возможных мишеней для селекции растений5. Протопласты также являются удобным средством для скрининга конструкций редактирования генома у различных видов сельскохозяйственных культур, включая пшеницу и картофель 6,7. Короче говоря, переходные анализы протопластов необходимы для сельскохозяйственной биотехнологии.
Кукуруза (Zea mays L.) является ведущей в мире зерновой культурой по тоннажу; Как таковой, он является одним из основных направлений фундаментальных и прикладных исследований в области растениеводства8. Однако, в отличие от модельных растений, таких как Nicotiana tabacum9, транзиторная экспрессия трансгена в неповрежденных листьях кукурузы обычно не выполняется. Протопластинг был использован для получения и трансфицирования клеток мезофилла листьев кукурузы10,11. Предыдущие методы достигали эффективности трансфекции до 75% с помощью электропорации и производили трансфицированные протопласты в масштабе10,15 десятков тысяч.
В этом протоколе подробно описано, как протопластировать миллионы клеток мезофилла кукурузы и трансфицировать их с эффективностью, сравнимой с предыдущими методами. Основными этапами являются выращивание этиолированных проростков кукурузы, сбор ткани листа, переваривание клеточной стенки растений и доставка плазмидной ДНК в клетки с помощью ПЭГ. Ключевым вкладом этого протокола является способность масштабировать трансфекцию протопластов при сохранении жизнеспособности клеток, необходимой для функциональных анализов. Это позволяет использовать эксперименты в масштабе генома, такие как массово-параллельные репортерные анализы, которые могут проверить функцию сотен тысяч областей по всему геному кукурузы. Этот метод недавно был использован для исследования больших библиотек цис-регуляторных элементов ДНК, включая энхансеры и промоторы12,13,14.
1. Рост растительного материала
2. Выделение плазмиды
3. Изоляция протопласта
4. ПЭГ-опосредованная трансфекция
5. Восстановление протопласта и проверка экспрессии
Ткань, лучше всего подходящая для выделения протопласта, — это второй и третий листы 10-11-дневной сеянцы (рис. 1). В этой работе мы получили примерно 10 миллионов протопластов из 16 листовых срезов, каждый из которых имел длину 10 см. Количество выделенных протопластов зависит от массы листового материала и ширины листовых срезов, которые перевариваются в растворе фермента.
Под светлопольным световым микроскопом неповрежденные протопласты выглядят примерно сферическими, с пластидами, испещренными поверхностью (рис. 2А). Прежде чем приступить к трансфекции, жизнеспособность можно проверить, окрашивая небольшую аликвоту протопластов флуоресцеиндиацетатом (FDA). Окрашенные FDA протопласты, которые флуоресцируют под ультрафиолетовым светом, считаются жизнеспособными (рис. 2B, C). Не все протопласты, которые кажутся неповрежденными, все еще жизнеспособны, а некоторые жизнеспособные протопласты могут умирать в результате эвакуации (рис. 2C). В этих клетках вакуоль набухает и в конечном итоге выбрасывается из клеточной мембраны.
На рисунке 3 показаны протопласты, трансформированные с помощью pJT01, плазмиды экспрессии кукурузы размером 4,3 кб, полученной из CD3-911 (ABRC)15. Трансфекция приводит к экспрессии sGFP, помеченного сигналом ядерной локализации C-концевого ядра от c-Myc (рис. 3A). Долю протопластов, экспрессирующих sGFP, измеряли в ходе нескольких экспериментов с использованием гемоцитометра. Медиана эффективности трансфекции, достигнутая этим методом, составила 40% после ночной инкубации (n = 9, рисунок 4, таблица 1), что сопоставимо с ранее опубликованными методами15. В зависимости от экспериментального применения, если в плазмиде или плазмидной библиотеке отсутствует флуоресцентный репортер, рекомендуется включить положительный контроль для подтверждения трансфекции.
Рисунок 1: Репрезентативные этиолированные саженцы кукурузы, выращенные в темноте в течение 10 дней после появления всходов. Стрелками обозначены второй и третий листы, которые лучше всего подходят для протопластирования. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 2: Флуоресцентная микроскопия жизнеспособности протопластов после выделения. (A) Светлопольное изображение протопластов сразу после выделения. (B) Сигнал флуоресценции протопластов, окрашенных FDA. (C) Перекрытие светлого поля и флуоресценции, показывающее жизнеспособные протопласты. Стрелка показывает протопласт, подвергающийся эвакуации. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 3: Флуоресцентная микроскопия протопластов, трансфицированных sGFP . (A) Светлопольное изображение протопластов после трансфекции. (B) Сигнал флуоресценции трансфицированных протопластов в канале GFP. (C) Перекрытие светлого поля и флуоресценции, показывающее трансформированные протопласты. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 4: Процент протопластов, демонстрирующих флуоресценцию GFP после 16 ч инкубации. Эффективность трансфекции варьировала в разных независимых исследованиях, при этом самая низкая эффективность составляла около 20%, а самая высокая - около 50%. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Испытание | Подсчет клеток GFP | Общее количество подсчитанных ячеек | Процент GFP |
1 | 104 | 261 | 39.8 |
2 | 148 | 298 | 49.5 |
3 | 84 | 258 | 32.6 |
4 | 137 | 271 | 50.6 |
5 | 127 | 299 | 42.5 |
6 | 107 | 235 | 45.5 |
7 | 83 | 360 | 23.1 |
8 | 134 | 549 | 24.4 |
9 | 61 | 201 | 30.3 |
Значить | 109 | 304 | 36 |
Стандартное отклонение | 29 | 102 | 10 |
Таблица 1: Репрезентативная эффективность трансфекции протопласта. Данные девяти недавних исследований протопластинга в лаборатории авторов.
Дополнительный файл 1: текстовый файл в формате GenBank с последовательностью pJT01. Плазмида экспрессии sGFP размером 4,3 кб служит положительным контролем в трансфицированных протопластах кукурузы. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить этот файл.
Как сообщалось ранее, качество растительного материала, используемого для протопласта, имеет важное значение для получения высококачественных протопластов16,17,18. Очень важно отбирать здоровые незапятнанные листья. В этой работе использовался популярный исследовательский сорт кукурузы B73. Мы не тестировали другие сорта. Проростки кукурузы, использованные для этого протокола, были выращены в темноте, потому что этиолированные листья производят протопласты с большей жизнеспособностью через 16 часов после трансфекции по сравнению с протопластами из зеленых листьев. Для применений, которые не требуют ночной инкубации, можно использовать зеленый или зеленеющий листовой материал.
Важным этапом является правильная нарезка листового материала тонкими ломтиками перед ферментативным перевариванием. Этот процесс увеличивает площадь поверхности клеток мезофилла, подвергающихся воздействию раствора фермента, что увеличивает количество восстановленных протопластов. Дистальные кончики листьев отбрасывают, а тонкие (≤1 мм) ломтики нарезают новыми бритвенными лезвиями, которые сразу же вынимаются, когда начинают тупиться. Для данного количества ткани более тонкие ломтики дают больше протопластов при условии, что используется правильная техника, чтобы свести к минимуму раздавливание листьев.
Правильная промывка протопластов также важна, так как они довольно деликатны после удаления клеточной стенки. После переваривания все растворы выдерживают на льду, а темные протопласты защищают от света. Осмолярность и рН буферизуются путем промывки в растворе MMG. Чтобы выделить протопласты из менее плотного клеточного мусора, центрифугирование проводят при 100 x g. Протопласты, центрифугированные при 200 x g , демонстрируют аналогичную жизнеспособность после выделения, но более низкую жизнеспособность на следующий день, и они также трансформируются примерно вдвое. Мы рекомендуем проверять жизнеспособность протопластов путем окрашивания FDA (флуоресцеин диацетат) сразу после выделения; Нормальная жизнеспособность колеблется в пределах 70-90%. Протопласты с жизнеспособностью менее 40% после выделения дают мало трансформаторов.
Гранулирование и промывка облегчаются при работе со многими протопластами, потому что после трансфекции получается хорошо видимая гранула. По этой причине трансфекцию проводят с 1 миллионом и более протопластов. При расширении протокола следует выбрать сосуд соответствующего размера для этапов инкубации (центрифужная пробирка объемом 1,5 мл, 15 мл или 50 мл), а объем раствора, используемый для этапов промывки, должен быть соответствующим образом увеличен. В любом случае, полезно центрифугировать аликвоты объемом ≤10 мл, чтобы гарантировать, что протопласты не останутся в надосадочной жидкости. Одним из нововведений этого протокола является удаление 1-часовой стадии инкубации и промывки в растворе W5, которая указана в других протоколах14,19, которая оказалась ненужной в наших руках.
Как видно из других исследований, количество и качество ДНК имеют решающее значение для успешной трансфекции19. Для плазмид в диапазоне 4-6 кб используется 15 мкг ДНК на 1 млн протопластов. Некачественные препараты ДНК могут привести к снижению жизнеспособности после трансфекции, поэтому мы рекомендуем использовать коммерческий набор для выделения ДНК при выделении плазмид из бактерий. Инкубация протопластов в течение ночи проводится при комнатной температуре в темноте, чтобы обеспечить транскрипцию плазмиды или библиотеки плазмид при минимизации стресса. После ночной инкубации восстанавливается примерно половина первоначально трансфицированных протопластов. Протопласты разбавляют до концентрации 500-1000 клеток/мкл для ночной инкубации. Протопласты, оставленные для инкубации на ночь в концентрациях выше 1000 клеток/мкл, имеют более низкую скорость восстановления и меньшую жизнеспособность. При более высоких концентрациях обломки поврежденных и мертвых протопластов могут способствовать гибели соседних протопластов. Промывание протопластов после ночной инкубации служит как для удаления этого мусора, так и для удаления излишков плазмиды.
Такие протоколы имеют ограничение, заключающееся в том, что не все виды растений или типы тканей поддаются протопластированию. Кроме того, различия в экспрессии генов могут быть вызваны протопластическим процессом.
Таким образом, мы подробно описали простой и масштабируемый протокол для выделения и трансфекции миллионов жизнеспособных протопластов из основной сельскохозяйственной культуры Z. mays. Этот метод может трансфицировать гораздо больше протопластов с использованием ПЭГ с эффективностью трансформации, почти такой же высокой, как и методы, основанные на электропорации15. Большее суммарное количество трансформаторов позволяет тестировать сотни или тысячи конструкций в крупномасштабных экспериментах, таких как массивно-параллельные репортерные анализы12,13. Будущие эксперименты на уровне генома кукурузы позволят ученым лучше понять экспрессию генов кукурузы и регуляцию генов.
Авторы заявляют об отсутствии конкурирующих интересов.
Эта работа была поддержана Национальным научно-исследовательским институтом генома человека, междисциплинарным обучением в области геномных наук (грант на обучение T32 No HG000035 для J.T.) и Национальным институтом здравоохранения (NIGMS 1R35GM139532 для C.Q.), а также Национальным научным фондом (RESEARCH-PGR IOS-1748843 и PlantSynBio 2240888 в CQ). Мы благодарим Андреа Галловатти из Университета Рутгерса за подарок семян кукурузы.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1.5 mL graduated microcentrifuge tubes | VWR | 490004-444 | |
15 mL Falcon conical centrifuge tube | Corning | 05-527-90 | |
250 mL Pyrex glass beaker | Fisher | 50-121-5005 | |
40 um nylon mesh cell strainer | Fisher | 22363547 | |
50 mL Falcon tube | Corning | 14-432-22 | |
72 cell propagation tray | T.O. Plastics | 725607C | |
Aluminum foil | VWR | 89107-732 | |
Bell jar | Bel-Art | F42022-0000 | |
Benchtop centrifuge | Eppendorf | 5424-R | |
Beta-mercaptoethanol | Sigma-Aldrich | M6250-250ML | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Store at room temperature. |
Bovine serum albumin | Sigma-Aldrich | A2153 | |
Calcium chloride dihydrate (CaCl2*2H2O) | PhytoTech Labs | C135 | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Store at room temperature. |
Cellulase Onozuka R-10 | Duchefa Biochemie | C8001.0010 | |
D-Mannitol | PhytoTech Labs | M562 | |
Dissecting scope | Reichert | Microstar IV | |
Fluorescein Diacetate (FDA) | Thermofischer Scientific | F1303 | Dissolve in acetone at 0.5% weight/volume to make a 1000X stock solution. Protect from light and store at -20 °C. |
Fluorescence Illumination Systems | Prior | Lumen200 | |
Fluorescence microscope | Leica | MDG36 | |
High-capacity centrifuge | Eppendorf | 5810 R | |
Macerozyme | Duchefa Biochemie | M8002.0005 | |
Magnesium chloride (MgCl2) | Sigma-Aldrich | M292-1KG | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Store at room temperature. |
Maize seeds | B73 | USDA-ARS | https://npgsweb.ars-grin.gov/gringlobal/accessiondetail?accid=PI+550473 |
Medium binder clip | Uline | S-24649 | |
MES | Sigma-Aldrich | M5287-250G | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Adjust pH to 5.7 using KOH. Protect from light and store at room temperature. |
Micropipette 20-200 uL | Gilson | F123601G | |
Nanodrop microvolume spectrophotometer | Thermofischer Scientific | ND-1000 | |
NEB 5-alpha competent E. coli | New England BioLabs | C2987H | |
Neubauer hemocytometer | Daigger Scientific | EF16034F | |
No. 9 Single-edge razor blade | Excel | 20009 | |
Orbital shaker | VWR | 89032-104 | |
Poly(ethylene) glycol 4,000 | Sigma-Aldrich | 81240-1KG | |
Potassium chloride (KCl) | Sigma-Aldrich | P9541-1KG | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Store at room temperature. |
Professional Grade Vermiculite | NK Lawn & Garden | G208 | |
Round-bottom glass centrifuge tube 30 mL | Kimble Chase | 45500-30 | |
Rubber adapter for Corex centrifuge tubes | Corning | CLS8445AO | |
Sphagnum peat moss | Premier Horticulture | 0128P | |
TRIzol Reagent | Thermofischer Scientific | 15596018 | |
Tygon vacuum tubing | VWR | 76336-844 | |
Vacuum gauge | Wika | 4269978 |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены