Метод визуализации на основе смартфона для анализа избегания газонов C. elegans

Среди многих видов поведения, демонстрируемых C-elegans, патогенное избегание газонов является защитной стратегией червя, направленной на минимизацию воздействия вредных патогенов. В нашей лаборатории мы используем это поведение в качестве инструмента для идентификации генов, участвующих в правильном функционировании нейронов, которые опосредуют это поведение. Поведение избегания газона является простым анализом, однако оно развивается в течение многих часов.

Следовательно, удобно, если анализ может быть записан для наблюдения за поведением в течение длительных периодов времени. Кроме того, если несколько анализов могут быть записаны одновременно, это еще лучше. Несмотря на то, что в литературе описано множество решений для обработки изображений, даже несколько камер по скромной цене могут быть недоступны для лабораторий с ограниченными ресурсами.

Кроме того, некоторые могут захотеть попробовать анализ, но не планируют делать это в долгосрочной перспективе. В таких случаях могут помочь краткосрочные решения, такие как этот протокол. Наш удивительный протокол предлагает простой и недорогой способ записи поведения червя.

Мы используем смартфоны для записи анализа, а затем обрабатываем видео с помощью скрипта Python, который делает его пригодным для подсчета.