שיטת הדמיה מבוססת סמארטפון עבור C. elegans Lawn Avoidance Assay

בין ההתנהגויות הרבות המוצגות על ידי C-elegans, הימנעות מדשאות פתוגניות היא אסטרטגיית ההגנה של התולעת כדי למזער את חשיפתה לפתוגנים מזיקים. במעבדה שלנו אנו משתמשים בהתנהגות זו ככלי לזיהוי גנים המעורבים בתפקוד תקין של תאי העצב המתווכים התנהגות זו. התנהגות הימנעות מדשאה היא בדיקה פשוטה, אולם היא מתפתחת במשך שעות רבות.

לפיכך, נוח אם ניתן להקליט את הבדיקה כדי לצפות בהתנהגות לאורך תקופות זמן ארוכות. כמו כן, אם ניתן להקליט מספר בדיקות בו זמנית, זה אפילו טוב יותר. למרות שישנם פתרונות הדמיה רבים המתוארים בספרות, אפילו כמה מצלמות במחיר צנוע עשויות להיות מחוץ להישג ידן של מעבדות עם משאבים מוגבלים.

כמו כן, חלקם עשויים לרצות לנסות את הבדיקה, אבל לא מתכננים לעשות את זה לטווח ארוך. במקרים כאלה, פתרונות לטווח קצר כגון פרוטוקול זה עשויים לעזור. הפרוטוקול המדהים שלנו מציע דרך קלה וזולה לתעד התנהגות תולעים.

אנו משתמשים בסמארטפונים כדי להקליט את הבדיקה, ואז מעבדים את הווידאו באמצעות סקריפט Python שהופך אותו מתאים לספירה.