Обогащение мРНК и бисульфит-мРНК Подготовка библиотек для секвенирования нового поколения

Данное исследование направлено на изучение роли метилирования РНК, в частности модификации 5-метилцитозина, при раке поджелудочной железы. Вопросы, на которые мы хотим ответить, заключаются в том, как повышающая или понижающая регуляция определенной РНК-метилтрансферазы влияет на фенотипы раковых клеток, а также через какие субстраты РНК. В этом исследовании представлен комплексный ландшафт РНК m5C с однобазовым разрешением с помощью стандартизированного оборудования.

Результаты этого исследования с использованием бисульфитного секвенирования РНК связывают ассоциацию модификации РНК m5C с плохой дифференцировкой раковых клеток. Это должно проложить путь для будущих исследований по выявлению эффектов специфического m5C в транскриптах РНК. С помощью этого метода мы можем идентифицировать набор дифференциально-метилированных РНК, которые могут участвовать в прогрессии опухоли.

Кроме того, эксперименты с одномолекулярными основаниями могут обеспечить более детальную регуляторную роль специфической РНК m5C.