Обнаружение вируса SARS-CoV-2 с помощью изотермической амплификации, опосредованной петлей обратной транскрипции

Наше исследование направлено на стандартизацию LAMP в качестве предварительного диагностического теста, подходящего для полевых или первичных медицинских учреждений, не имеющих развитой лабораторной инфраструктуры. Мы стремимся продвигать использование буферов местного производства и альтернативных красителей, снижая зависимость от импортных коммерческих наборов. В настоящее время CRISPR-Cas является эффективной системой, используемой для разработки быстрых, специфичных и чувствительных методов диагностики патогенов.

Теперь эта система имеет широкий спектр добавок для обнаружения мишеней РНК или ДНК в различных образцах, представляющих интерес. Текущие экспериментальные задачи связаны с предотвращением нецелевой амплификации в результате загрязнения ампликонов и первичных клеток, особенно с длинными праймерами, склонными к образованию димеров. Кроме того, мы стремимся определить оптимальные условия реакции для достижения визуально различимого изменения цвета красителя.

После того, как он стандартизирован и полностью проверен, этот метод может быть легко внедрен и адаптирован к любой лаборатории или месту оказания медицинской помощи в течение 60 минут, с низкими затратами и использованием недорогого оборудования, для обнаружения практически любого патогена. Таким образом, он потенциально может быть использован в центрах первичной медико-санитарной помощи для проведения своевременного эпидемиологического надзора. Наша междисциплинарная группа занимается открытием молекул из местных колумбийских растений, пытаясь определить потенциал ингибирования репликации вирусов, таких как денге, Зика или SARS-COVID-2.

Кроме того, мы проводим исследования по разработке молекулярных методов диагностики этих вирусов.