3CでAを取得する:学部生のための染色体コンフォメーションキャプチャ

染色体コンフォメーションキャプチャ(3C)は、クロマチンの3次元構成の詳細な情報を提供する同様の技術(たとえば、Hi-C、4C、および5C、ここでは3C技術と呼びます)のファミリーを生み出した強力なツールです。3C技術は、がん細胞におけるクロマチン組織の変化のモニタリングから、遺伝子プロモーターとのエンハンサー接触の同定まで、幅広い研究で使用されています。これらの手法を用いた研究の多くは、複雑なサンプルタイプ(すなわち、シングルセル解析)でゲノム全体の大きな質問をしていますが、しばしば失われているのは、3C技術が幅広い研究に適用できる基本的な分子生物学的手法に基づいていることです。クロマチン構成の焦点を絞った質問に取り組むことにより、この最先端の手法を使用して、学部の研究と教育ラボの経験を向上させることができます。この論文は、3Cプロトコルを提示し、学部の研究および教育経験において主に学部機関で実施するための適応と強調点を提供します。