Yazarlar mali destek için kendi Erken Araştırmacılar Ödülü Programı aracılığıyla Doğa Bilimleri ve Kanada&#39;nın Mühendislik Araştırma Kurumu, Kanada Araştırma Sandalyeler Programı, Sağlık Araştırma Kanada Enstitüleri ve Araştırma ve Yenilik Bakanlığı Ankara teşekkür etmek istiyorum.

1. Usta Kalıp İmalat için Fotolitografi <ol><li> 30 saniye sonra 30 saniye ve metanol için aseton içinde silikon in 3 batırın. 5 dakika boyunca dH 2 0 su ile durulayın. </li><li> Bir N2 darbe silahla gofret yüzeyini kurulayın. 2 dakika süreyle 140 ° C sıcak bir plaka üzerinde gofret ısıtın. </li><li> Plazma silikon (1 dk, 50 B) yüzeyi okside eder. </li><li> 3 ml SU-8 100 fotorezist (; 1.750 rpm 40 saniye) ile Spin-kat gofret yüzeyi. </li><li> 65 sıcak bir plaka üzerinde önceden fırında kaplı gofret ° C 10 dakika, daha sonra 95 ° C üzerinde 2 dakika sıcaklık rampa. Ek olarak 1 saat boyunca bu ayar koruyun. </li><li> İstenen kanal tasarımı içeren bir photomask hizalayın. 550-600 UV ışık mJ / cm 2 (350-400 nm) için karşı Açığa. PHOTOMASKS AutoCAD tasarlanmış ve yüksek çözünürlüklü baskı ile bir şeffaflık üzerine basılabilir. </li><li> T rampa, 10 dakika için 1 dakika ve 95 ° C 65 ° C sıcak bir plaka üzerinde gofret Post-fırındadaha önce olduğu gibi o sıcaklığı. </li><li> 10-15 dakika SU-8 geliştirici çözüm gofret bırakın. Izopropanol ile durulayarak geliştirme tamamlanması için kontrol edin. Beyaz bir çökelti görünürse, geliştirmeye devam. Ana kalıp Şekil 2A&#39;da gösterilmiştir. </li></ol> 2. Mikrokanal İmalat için yumuşak Litografi <ol><li> 3.5 ml PDMS sertleştirici ile 35 ml polidimetilsiloksan (PDMS) elastomer temel karıştırın. </li><li> Alüminyum folyo ile kaplı Petri kapları içine fabrikasyon ana kalıp (kalıp yukarı bakacak şekilde) ve boş bir silikon yonga yerleştirin. </li><li> İkinci çanak içine ana kalıp çanak ve 15 ml içine 20 ml PDMS prepolimer dökün. Hafifçe bir tek tahta aplikatör ile onlara basarak gofret altında hava cepleri ortadan kaldırın. </li><li> Hem yemekler Kapak ve tedavi için bir gün için kenara koyun. Alternatif 2 için, daha hızlı kür için, bir vakum degazör kullanarak PDMS içindeki hava kabarcıklarını çıkarın ve daha sonra 80 sıcak bir plaka üzerinde yemekleri bırakın ° Csa. </li><li> Gofret folyo ve PDMS soyma çıkarın. </li><li> Kanalın her iki ucunda akışkan erişim noktaları yumruk Harris Uni-Çekirdek (2,5 mm) kullanın. Benzer büyüklükteki şeritler halinde kanal ve boş PDMS kesin. </li><li> Bir plazma oksitleyici içine kanalı, boş PDMS şerit ve bir cam slayt (75 × 25 mm 2) Yük, muhtemelen bir temiz oda bulunmaktadır. 40 W gücünde 40 saniye oksijen plazma maruz. </li><li> Boş şeridin zıt kenarlarına kanal parçası ve cam slayt sopa. Bağ tamamlamak için 2 saat için kenara koyun. </li><li> 120 sıcak bir plaka üzerine montaj yerleştirin ° C PDMS prepolimer kullanarak delikli rezervuarlar için, her uzun inç en az 6, (iç çapı 1/32 &quot;, dış çapı 3/32&quot;) plastik boru takın. Bir veya iki tüplere yapıştırmayın bir akışkan plastik konektör şırınga eki izin veya ticari bağlantı parçaları kullanmak. </li><li> PDMS tedavi için tüp güvence izin ver. EAC içine 22 ayar yalıtılmış bakır tel 3 &quot;uzunlukları takıngiriş borusu ve kanal ve PDMS prepolimer ile güvenli arasında saat rezervuar,. Bitmiş ürün, Şekil 2B&#39;de gösterilmiştir. </li></ol> 3. Electrotaxis Deney <ol><li> Bir monitör (Şekil 1) bağlı bir monte kamera ile mikroskop aşamasında (tercihen XY-hareketli) üzerine Mikrokanallı yerleştirin. </li><li> En Mikrokanallı elektrotlar için güç kaynağı veya amplifikatörün çıkış kablolarını bağlayın. Yalnızca DC sinyali istendiği takdirde basit bir DC güç kaynağı yeterli olan, ancak bir fonksiyon jeneratörü bağlı bir yükseltici hem darbeli DC ve AC sinyali uygulama sağlar. </li><li> Tek kullanımlık enjektöre en Mikrokanallı çıkış tüpü takın. Batmak M9 fizyolojik tampon giriş borusunun ağız ve yavaşça şırınga içinde bir negatif basınç (el ile veya bir şırınga pompası kullanılarak) uygulayarak kanal içine sıvı talip. Giriş ve çıkış boruları M9 ile doldurulur de, şırınga F ayırınrom tüpü. Hidrostatik tahrik akışını önlemek için aynı yüksekliğe hem tüpler Seviye. </li><li> Kanala bir DC gerilim uygulayın ve (R = V / I) (uzun bir 50 mm 0.3 mm genişliğinde ve ~ 0.1 mm derinliğinde Mikrokanallı) MQ 0.6 civarında olduğu direnci sağlamak. </li><li> Kanal bütünlüğünü memnun ise, kanal içine seyreltilmiş süspansiyon solucanlar yüklemek için yukarıdaki adımları izleyin. </li><li> Şırınga çıkarın ve hidrostatik tüpler &#39;göreceli yüksekliğini ayarlayarak akışını manipüle. Kanalın merkezinde bir solucan yerleştirin ve daha sonra aynı yükseklikte iki tüp düz koymak için bu yöntemi kullanın. </li><li> L3 sahne hayvanlar için 4-12 V / cm, L4S için 4-10 V / cm, ve 2-4 V / genç yetişkinler için cm: uygun voltaja güç kaynağı ayarlayın. Elektrik sinyali etkinleştirin ve alana iklime alıştırmak için solucan için önceden maruz kalma 1 dakika izin verir. Solucan katot doğru hareket başlamalıdır. Dakika geçtikten sonra, kayıt başlamak için fotoğraf makinesi kullanın. </li><li> AC ve darbe için7, 8, istenildiği gibi D DC deneylerde, en fazla duyarlı elektrik alan, sinyalin yukarıda ve frekans ve görev döngüsü kabul edilebilir modüle edilebilir. </li><li> Deney bittiğinde, kanal tüm sıvı (ve solucanlar) çıkarın, dH 2 0 ile durulayın ve ° C kuru 125 sıcak bir plaka cihazı bırakın. </li><li> Elle NIH ImageJ (kullanarak kaydedilen videoları ettirici veri ayıklamak <a href="http://rsbweb.nih.gov/ij/" target="_blank">http://rsbweb.nih.gov/ij/</a> ) veya özel MATLAB tabanlı solucan izleme yazılımı. </li></ol>

<ol>
	<li>Kuwahara, T., Koyama, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Familial+Parkinson+mutant+&#945;-synuclein+causes+dopamine+neuron+dysfunction+in+transgenic+Caenorhabditis+elegans.">Familial Parkinson mutant &#945;-synuclein causes dopamine neuron dysfunction in transgenic Caenorhabditis elegans.</a> J. Biol. Chem. 281 (1), 334-340 (2006).</li><li>Kuwahara, T., Koyama, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+systematic+RNAi+screen+reveals+involvement+of+endocytic+pathway+in+neuronal+dysfunction+in+a-synuclein+transgenic.">A systematic RNAi screen reveals involvement of endocytic pathway in neuronal dysfunction in a-synuclein transgenic.</a> 17 (19), 2997-3009 (2008).</li><li>Su, L. J., Auluck, P. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Compounds+from+an+unbiased+chemical+screen+reverse+both+ER-to-Golgi+trafficking+defects+and+mitochondrial+dysfunction+in+Parkinson's+disease+models.">Compounds from an unbiased chemical screen reverse both ER-to-Golgi trafficking defects and mitochondrial dysfunction in Parkinson's disease models.</a> Dis. Model Mech. 3 (3-4), 194-208 (2010).</li><li>Rezai, P., Siddiqui, A., Selvaganapathy, P. R., Gupta, B. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Electrotaxis+of+Caenorhabditis+elegans+in+a+microfluidic+environment.">Electrotaxis of Caenorhabditis elegans in a microfluidic environment.</a> Lab Chip. 10 (2), 220-226 (2010).</li><li>Salam, S., Ansari, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+microfluidics+set+up+to+study+neuronal+degeneration+and+identification+of+neuroprotective+compounds+in+C.+elegans.">A microfluidics set up to study neuronal degeneration and identification of neuroprotective compounds in C. elegans.</a> , (2013).</li><li>Rezai, P., Salam, S., Selvaganapathy, P. R., Gupta, B. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Electrical+sorting+of+Caenorhabditis+elegans.">Electrical sorting of Caenorhabditis elegans.</a> Lab Chip. 12 (10), 1831-1840 (2012).</li><li>Rezai, P., Salam, S., Selvaganapathy, P. R., Gupta, B. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effect+of+pulse+direct+current+signals+on+electrotactic+movement+of+nematodes+Caenorhabditis+elegans+and+Caenorhabditis+briggsae.">Effect of pulse direct current signals on electrotactic movement of nematodes Caenorhabditis elegans and Caenorhabditis briggsae.</a> Biomicrofluidics. 5 (4), 044116 (2011).</li><li>Rezai, P., Siddiqui, A., Selvaganapathy, P. R., Gupta, B. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavior+of+Caenorhabditis+elegans+in+alternating+electric+field+and+its+application+to+their+localization+and+control.">Behavior of Caenorhabditis elegans in alternating electric field and its application to their localization and control.</a> Appl. Phys. Lett. 96 (15), 153702 (2010).</li><li>van Ham, T. J., Thijssen, K. L., Breitling, R., Hofstra, R. M., Plasterk, R. H., Nollen, E. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=C.+elegans+model+identifies+genetic+modifiers+of+alpha-synuclein+inclusion+formation+during+aging.">C. elegans model identifies genetic modifiers of alpha-synuclein inclusion formation during aging.</a> PLoS Genet. 4, e1000027 (2008).</li><li>Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+genetics+of+Caenorhabditis+elegans.">The genetics of Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 77 (1), 71-94 (1974).</li><li>Gabel, C. V., Gabel, H., Pavlichin, D., Kao, A., Clark, D. A., Samuel, A. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neural+circuits+mediate+electrosensory+behavior+in+Caenorhabditis+elegans.">Neural circuits mediate electrosensory behavior in Caenorhabditis elegans.</a> J. Neurosci. 27 (28), 7586-7596 (2007).</li><li>Chuang, H. -. S., Raizen, D. M., Lamb, A., Dabbish, N., Bau, H. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dielectrophoresis+of+Caenorhabditis+elegans.">Dielectrophoresis of Caenorhabditis elegans.</a> Lab Chip. 11 (4), 599-604 (2011).</li><li>Cronin, C. J., Mendel, J. E., Mukhtar, S., Kim, Y. -. M., Stirbl, R. C., Bruck, J., Sternberg, P. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+automated+system+for+measuring+parameters+of+nematode+sinusoidal+movement.">An automated system for measuring parameters of nematode sinusoidal movement.</a> BMC Genet. 6, 5 (2005).</li><li>Mani&#232;re, X., Lebois, F., Matic, I., Ladoux, B., Meglio, J. -. M. D. i., Hersen, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Running+worms:+C.+elegans+self-sorting+by+electrotaxis.">Running worms: C. elegans self-sorting by electrotaxis.</a> PLoS One. 6 (2), e16637 (2011).</li></ol>

Mikroakışkan electrotaxis testi teknoloji Amerika ve Kanada ABD&#39;de patent için dava açılmıştır.

İlk Chuang ve arkadaşları 11,12 dielectrophoretic manipülasyon çalışmaları Gabel ve arkadaşları ve bina tarafından tanımlanan davranış fenomen yararlanarak, bizim mikroakışkan tabanlı electrotaxis tahlil hareket olarak kullanarak solucanlar nöronal aktivite soruşturma için, kolay sağlam ve duyarlı bir yöntem sağlar bir çıkış. Hareket parametrelerin analizi farklı genotipleri arasında kantitatif karşılaştırılması sağlar. Birlikte Mikrokanallı imalat ve elektrik alan uygula...

<table border="1">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Name of the reagent</td>
			<td>Company</td>
			<td>Catalogue number</td>
			<td>Comments (optional)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acetone</td>
			<td>CALEDON Labs</td>
			<td>1200-1-30</td>
			<td>&nbsp;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>CALEDON Labs</td>
			<td>6700-1-30</td>
			<td>&nbsp;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Isopropanol</td>
			<td>CALEDON Labs</td>
			<td>8600-1-40</td>
			<td>&nbsp;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SU-8</td>
			<td>Microchem Corp.</td>
			<td>Y131273</td>
			<td>SU-8 100</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SU-8 Developer</td>
			<td>Microchem Corp.</td>
			<td>Y020100</td>
			<td>&nbsp;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>92x16 mm Petri dish</td>
			<td>Sarstedt</td>
			<td>82.1473.001</td>
			<td>&nbsp;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sylgard 184 Silicone Elastomer Kit</td>
			<td>Dow Corning</td>
			<td>&nbsp;</td>
			<td>Contains elastomer base and curing agent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Function generator</td>
			<td>Tektronix Inc.</td>
			<td>&nbsp;</td>
			<td>Model AFG3022B</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Amplifier</td>
			<td>Trek Inc.</td>
			<td>&nbsp;</td>
			<td>Model 2210-CE</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Syringe pump</td>
			<td>Harvard Apparatus</td>
			<td>70-4506</td>
			<td>Model 11 ELITE</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hot plate</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>11675916Q</td>
			<td>Model HP131725Q</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

microfluidic-based electrotaxis for on-demand quantitative analysis of caenorhabditis elegans' locomotion

Nematod Caenorhabditis elegans için hastalıkla ilişkili gen ve yollar yanı sıra yetiştirme kolaylığı onun korunması biyomedikal araştırmalar için çok yönlü bir model organizmadır. Çeşitli C. elegans hastalık modelleri gibi dopaminerjik (DA) nöronlar 1 dejenerasyon içeren Parkinson hastalığı (PD), nörodejeneratif hastalıkların da dahil olmak üzere, bildirilmiştir. Transgenlerin ve nörotoksik kimyasal hem de nörodejenerasyonun ve sinir-koruyucu genler ve bileşikler için ekranlar 2,3 temelinde soruşturma sağlayan, DA ve nörodejenerasyonunun solucanlar buna bağlı olarak hareket kusurlar ikna etmek için kullanılmıştır. C gibi düşük ökaryotlarda Ekranlar elegans nöronal sinyal etkileyen bileşikler ve genleri tanımlamak için verimli ve ekonomik bir yol sağlar. Geleneksel ekranlar genellikle elle yapılan ve görsel kontrol atacak, dolayısıyla, zaman-eksileriniuming ve insan hataları eğilimli. Ayrıca, hücresel seviyede analiz en odak hareket ihmal ederek, bu hareket bozuklukları için özellikle önemli bir parametredir. Biz C. kontrol ve rakamlarla yeni bir mikroakışkan tarama sistemi (Şekil 1) geliştirdik elegans &#39;hareket mikro içinde elektrik alan uyaranlara kullanarak. Bir Doğru Akım (DC) alanında sağlam katot doğru hareket (&quot;electrotaxis&quot;) 4-talep neden olduğunu göstermiştir. Alanın kutup değiştirme solucan hızlı bir şekilde de yönünü tersine çevirmek için neden olur. Ayrıca dopaminerjik ve diğer duyusal nöronlarda kusurları yüzme yanıt 5 değiştirebilir göstermiştir. Bu nedenle, nöronal sinyal anormallikleri bir okuma-out olarak hareket kullanılarak belirlenebilir. Hareket cevap doğru hız, vücut bükme frekans ve ters zaman yüzme gibi parametreleri bir dizi kullanarak ölçülebilir. <p class = &quot;jove_content&quot;&gt; Çalışmalarımız electrotactic yanıt yaşla birlikte değişir olduğunu ortaya koymuştur. Özellikle, genç yetişkinler elektrik alanları daha düşük bir dizi cevap ve larva 4 ile karşılaştırıldığında daha hızlı hareket. Bu bulgular bize pasif yaş ve fenotip 6 ile solucanlar sıralamak için yeni bir mikroakışkan cihaz tasarımı yol açtı. Ayrıca darbeli DC solucanlar tepki test edilmiş ve Akım (AC) elektrik alanları Alternatif var. C. hem de çeşitli İş döngülerinin Pulsed DC alanlarında etkili oluşturulan electrotaxis elegans ve kuzeni C 7 briggsae. Başka bir deneyde, 1 Hz ila 3 kHz arasında frekanslarda simetrik AC alanları kanal 8 içine solucanlar immobilize. Microfluidic ortamda elektrik alan uygulanması electrotaxis testin hızlı ve otomatik yürütme sağlar. Bu yaklaşım faktörler için yüksek verimli genetik ve kimyasal ekranlar kolaylaştırmak için vaat ediyornöronal fonksiyonu ve canlılığı etkileyen.

Solucan izleme yazılımı, vahşi tip en genç yetişkin nematod electrotaxis ve pozisyon ve hız çıkış temsili bir video Yardımcı video 1 ve Şekil 3 &#39;de gösterilmiştir. Hareket analiz yazılımı kendi alanında kutup yönünü ve kutup değiştirme sırasında tanımıyor, bunun yerine, bu bilgileri kaynak video alınmalıdır. Bu video bir ses veya görsel işaret kullanarak ya da deneysel koşullar ve manipülasyon yazmak yapılabilir. Yaba...

Watch this Scientific Journal Video about Microfluidic-based Electrotaxis for On-demand Quantitative Analysis of Caenorhabditis elegans' Locomotion at JoVE.com

Microfluidic-based Electrotaxis for On-demand Quantitative Analysis of Caenorhabditis elegans&#039; Locomotion

Içinde isteğe bağlı hareket ikna etmek için bir yarı-otomatik mikro-elektro-akışkan yöntemi<em&gt; Caenorhabditis elegans</em&gt; Tarif edilmektedir. Bu yöntem mikroakışkan kanalları içinde hafif elektrik alanlar (&quot;electrotaxis&quot;) yanıt solucanlar nörofizyolojik fenomen dayanmaktadır. Mikroakışkan electrotaxis nöronal sağlığı etkileyen faktörler için ekrana bir hızlı, duyarlı, düşük maliyetli ve ölçeklenebilir tekniği olarak hizmet vermektedir.

On-talep Kantitatif Analiz için mikroakışkan tabanlı Electrotaxis<em&gt; Caenorhabditis elegans</em&gt; &#39;Locomotion

The nematode Caenorhabditis elegans is a versatile model organism for biomedical research because of its conservation of disease-related genes and ...

microfluidic-based-electrotaxis-for-on-demand-quantitative-analysis

Research

JoVE Journal

Bioengineering

Microfluidic-based Electrotaxis for On-demand Quantitative Analysis of Caenorhabditis elegans' Locomotion

9.7K Görüntüleme.  McMaster University. Içinde isteğe bağlı hareket ikna etmek için bir yarı-otomatik mikro-elektro-akışkan yöntemi Caenorhabditis elegans Tarif edilmektedir. Bu yöntem mikroakışkan kanalları içinde hafif elektrik alanlar ("electrotaxis") yanıt solucanlar nörofizyolojik fenomen dayanmaktadır. Mikroakışkan electrotaxis nöronal sağlığı etkileyen faktörler için ekrana bir hızlı, duyarlı, düşük maliyetli ve ölçeklenebilir tekniği olarak hiz...