This work was supported by a Howard Hughes Medical Institute Education Grant and an internal grant from the Saint Joseph's University chapter of Sigma Xi. We would also like to thank the three anonymous reviewers who helped strengthen the protocol and interpretations.

Zebra balığı konut, bakım ve çalışma için aşağıdaki yöntemler Saint Joseph Üniversitesi IACUC tarafından onaylanmıştır. 1. Zebra balığı Konut ve Bakım <ol><li> Yerel bir tedarikçiden veya vahşi yakalanmış popülasyonları gelen konu zebrafish edinin. Zebra balığı konut vahşi yakalanmış popülasyonlar için gerekli olan IACUC kurallarına ve ek izinler tabi olduğunu konut unutmayınız. </li><li> cinsiyete göre belirlemek ve ayrı zebra balığı. Alternatif olarak, bu adımı atlayın ya da çalışma hipotezine dayalı ayırma farklı bir yöntem ile değiştirin. NOT: Seks özellikleri, özellikle kadınlarda, zebrafish belirlemek zordur. Seks ayırt etmek bu kurallar 10 veya kullanışlı çevrimiçi kılavuzlara bakın. </li><li> Rasgele balık uyarılara odak balık uygun oranı içine daha fazla popülasyonları ayırmak. Not: Odak balık denekler behavio dizi ile takip vardırral tahliller ve uyarıcı balık saldırganlık ve sığlaşma tahlillerinde uyaran odaları işgal edecek kişilerdir. NOT: Geleneksel olarak, sığlaşma tayinlerde fokal balık başına uyaran balık ve 1 1 ile 5: 1 uyaran: saldırganlık deneyleri 14,17 fokal balık oranı kullanılmıştır. Ancak, araştırmacı özellikle akılda hipotezi ile çalışmayı tasarlamak gerekiyor (yani, balık odak balık davranış tutarlılığı korumak için sabit tutulmalıdır uyarıcı olmalıdır, ya da balık düzgün randomizasyon sağlamak için her deneyde arasında döndürülebilir uyaran olmalıdır). </li><li> sıkı 12:12 ışık / karanlık döngüsü altında Zebra balığı konut rafları tüm balık (27,5-28,5 ° C) saklayın. günlük tüm odak ve uyarıcı balık pul gıda yem ve araştırma dışı günlerde salamura karides haftalık. </li><li> Tüm test sirkadiyen ritim etkileri 26 kaçınmak için ZT1 ve ZT5 (zeitgeber süresi) arasında yapıldığından emin olun. </li></ol> 2. rastgeleleştirme ve Tank Kurulumu <ol><li> Radavranışsal testlerin belirli bir sıra tüm bireylere önsel ndomize. Online rasgele dizi üreteci 27 veya istatistiksel bir yazılım paketi (R) rastgele bir dizi jeneratörü kullanarak tutarlı bir randomizasyon düzeni kurmak. <ol><li> 1 ile 3 arasında, her bir tayin etiketleyin ve tutarlı bu görevi tutun. her rastgele bir dizisini atama ve davranışsal deney etikete göre diziye harita. Örneğin, (agresyon eşlenen Cesaret eşleştirilmiş shoaling, 2 eşlenmiş 1 ve 3) toplam üç deney için, belirli bir bireyin belirli bir uygulamayı mümkün gerektirecek &#39;2,3,1&#39; randomize bir sekansa sahip olabilir belirtilen sırayla davranış testleri. </li></ol></li><li> olumsuz dış uyaranlara olasılığını en aza indirmek ve tüm tankı yakalamak için bir video kamera için yeterli oda var emin olun yerlerde laboratuvarda tahlil tankları (cesaret, saldırganlık ve sığlaşma) kurdu. Kamera enoug emin olunh netlik tankı etiketleri görmek yanı sıra fokal balık ve kurulum bu pozisyonda kamera ince davranışları ayırt edebilmek için. </li><li> diferansiyel kayıtları sonucunda davranış puanlama istenmeyen farklılıkları en aza indirmek için belirtilen tankın tam görünümü ile aynı konumda muhafaza kamera ile tüm davranış testleri kaydedin. NOT: Ağır ticareti alanlarda ve hareket olarak kapılardan tanklar yerleştirmekten kaçının ve Zebra balığı davranışını etkiler ses. </li><li> Her davranışsal tahlil puanlama için benzersiz JWatcher protokollerini 24 kurmak. toplanan verileri özetlemek için tuş vuruşlarını ve fokal analiz dosyalarına davranışları atamak için odak ana dosyaları oluşturmak öğrenmek için JWatcher kılavuzuna başvurun. NOT: JWatcher özelleştirilmiş, güvenilir ve tekrarlanabilir davranış puanlama 24 sağlar davranışsal puanlama yazılımıdır. </li><li> (Örn tüm davranışsal deneyleri için tarih, balık numarası ve tahlil sayısını izlemek için bir etiketleme şeması tanımlayın,31 Aralık st 2015 tarihinde &#39;F5-B-123115&#39; ima Fish 5, Boldness tahlil) ve görünümde ve kameranın odak bant ile tankın dışında etiket. Tutmak ve hızlı başvuru ve gelecekteki kalite kontrolü için bir laboratuar notebook bu bilgileri kaydetmek. </li><li> bireylerin konut rafa kaldırıldıktan sonra doğrudan yanı sıra tüm tahliller arasında kullanılacak bir aklimasyonundan tankı kurmak. NOT: acclimation tankları ve terminal tanklar küçük akvaryumlar çakıl (40 cm x 20 cm x 25 cm) ve yakından konut raf benzeyen bir filtre vardır. </li><li> tahlilleri tüm tamamlandıktan sonra, tüm kullanılan odak bireyler için son hedef tankı olarak görev yapacak ayrı bir klemens tanka bireyi aktarın. Yaşamları (örneğin, 25 galon) geri kalanı için bireylerin bir grup evine yeterince büyük bir tank kullanın. NOT: acros tutarlı ve benzeri su sıcaklıkları ve koşulları sağlamak için çok önemlidirhepsi tankları. Bu yuva, aklimasyon ve tüm test tankları bulunmaktadır. </li></ol> 3. Saldırganlık Testi yürütmek <ol><li> 30 cm x 15 cm x 10 cm boyutlarında bir 19 L dikdörtgen tankı saldırganlık deneyi yürütmek için. istenmeyen dış uyaranlara azaltmak için, görüntüleme için maruz ön bırakarak, saldırganlık tankının üç taraftan çevreleyen dış opak bölümlerde deposunu donatacak. dört eşit dikdörtgen parçaya bölünür dış işaretler ile tank bölün ve tankın en sol tarafına karşı bir dik üçgenin oluşturan 22.5 ° eğimli sol alt kadran içinde, (silikon kalafat ile) kalıcı bir ayna düzeltmek. </li><li> aklimasyonundan tankı ve saldırganlık tankındaki suyun sıcaklığı muhafaza rafın 2 ° C dahilinde olduğundan emin olun. Bunu yapmak için, taze yaşlı su saldırganlık tankı eklemek için hazır 27,5-28,5 ° C önceden ısıtılmış var. o yersiz ortadan kaldırmak için her deneyde arasında su değiştirmek için önemli olduğunu unutmayınkoku ipuçları. </li><li> Bu, 10 dakika boyunca ortama alışmaları olacak ayrı alıştırma tankına muhafaza raftan, çukurluğu ile fokal balık aktarma. NOT: yanlış kullanım yoluyla balık tanıtıldı uyarıcı azaltmak için önemlidir. Aktarım bireyler olarak önceden 27 nitelendirdi. <ol><li> Spesifik olarak, el ve dikkatli bir şekilde ilgi tanka bir küçük, şeffaf plastik bir kap yerleştirmek. balık kesintiye olduğu kadar bir net kullanarak aktarmadan, yavaş yavaş kap içine balık kadar kepçe. </li></ol></li><li> video kamera saldırganlık tahlil tankı (adım 3.1) odak olduğunu onaylayarak ve hemen cihazda saldırganlık tankı, basın kayıt içine bireyi aktarmadan önce kaydetmeye hazır olduğundan emin olun. aklimasyonundan tankından saldırganlık tankına hacamat yoluyla odak balık aktarın. NOT: giriş öncesinde tam zamanı izlemek için saldırganlık tanka giren balık kaydetmek önemlidir. </li><li> AGGR kaydedinDaha sonra 10 dakika ve 30 saniye ve fincan geri aklimasyonundan tankına saldırganlık tankından odak balık için salgılamanın tankı. </li><li> Kaydı izlerken balık puanlama davranışları önce ek alıştırma döneminden olarak tanka girmiştir sonra, 30 saniye bekleyin. </li><li> 10 dakika boyunca aşağıdaki davranışlardan ölçmek, saldırgan davranışlar için tanımlanan JWatcher skorlama sistemi kullanılarak: ayna yakın harcanan zaman, ayna yaklaşımları, dart sayısı, (ayna yönünde ağzını açarak) teşebbüs sokması sayısı ve yan görüntüler sayısı sayısı (dorsal, göğüs, anal ve kuyruk yüzgeci ereksiyon) 9. </li><li> Tahlil yineleme arasında yüksek anlaşma ile atılırsa kadar en az iki defa tek bir saldırganlık tahlil puan. </li></ol> 4. Cesaret Testi İletken <ol><li> 26.5 cm üst x 22.5 cm alt x 6 cm genişliğinde x boyunda 15 cm boyutlarında, küçük bir 1.5 L trapez tankında cesaret testi yürütün. tüm tarafların etrafında opak kağıt sarın oancak tankın f görüntüleme için maruz ön bırakın. tankın taban kısmından üst ayırmak için tankın dış şeridinin tek ince parça yerleştirin. </li><li> boldness tankındaki suyun sıcaklığı muhafaza rafın 2 ° C içinde olduğu (adım 3.2) emin olun </li><li> aklimasyonundan tankına konut raf odak balık transferi (adım 3.3) ve 10 dakika gelmesini sağlar. </li><li> kamera cihazda odak balık, basın kayıt aktarmak için bir kez hazır, cesaret testi kaydetmek ve hazır olduğundan emin olun. 8 dakika ve 30 saniye süreyle cesaret tankı ve kayda aklimasyonundan tankından fokal balık aktarın. </li><li> Kayıt izlerken balık skorlama öncesi tankına ilave edilir sonra ek bir 30 saniye alıştırma döneminden izin verir. </li><li> JWatcher yazılımı kullanarak, 8 dakika boyunca cesaret davranışlarını ölçmek. Özellikle, aşağıdaki davranışlardan ölçmek: yüzeye yakın Zaman, gecikme tra üst kısmını, numarasını girmek içinüst kısmına nsitions ve düzensiz hareketler (dart) sayısı 29. </li><li> Tahlil yineleme arasında yüksek anlaşma ile atılırsa kadar en az iki defa tek bir cesaret testi puanı. </li></ol> 5. shoaling Testi yürütmek <ol><li> Silikon kalafat ile kapatılmış iki cam bölücüler bölünmesiyle üç bölmeleri olan bir 76 L tankında sığlaşma deneyi yapmak (elde edilen üç bölme iki uyaran bölgeleri ve bir odak bölmenin oluşur). Dışarıdan, 6,35 cm uyaran zonların cam bölme her birinden belirlenen iki tercih bölgeleri, iki vücudun göstergesi 30 uzunlukları işaretleyin. dışarıdan sığlaşma tankın üç tarafı etrafında opak bölümleri uygulayın, ancak görüntüleme için maruz ön bırakın. NOT: Bu tercih bölge farklı boyutlardaki türlere özgü hipotezler test etmek için özelleştirilebilir. </li><li> Çalışmanın doğasına bağlı olarak, seçme uyaran sürüler en az 12 saat süre ile uyum sağlamaya before test edilmesi ve deney süresince sığlaşma tankında devam etmektedir. NOT: Uyarıcı sürüler fokal balık bu sürüler varlığında veya yokluğunda nasıl davranacağını değerlendirmek için kullanılan bireysel balık koleksiyonları bulunmaktadır. Farklı uyaran sürü kombinasyonları çeşitli sığlaşma hipotez bir dizi test etmek için seçilebilir. uyarıcı sürüler yan önyargı önlemek için her uyaran bölge arasında döndürülür ve ayrıca test edilmeden önce en az 12 saat süreyle alışmaya bırakıldı emin olun. </li><li> Daha önce açıklandığı gibi aklimasyonundan tankına odak balık transferi (adım 3.3) </li><li> sığlaşma tankında merkezi bölmeye ara aklimasyonundan tankından, fokal balık çukurluğu ile, aktarın. </li><li> 10 dk canlı puanlama gözlem döneminden önce 10 dakika alıştırma dönemi için izin verin. Seçenek olarak ise, sığlaşma tahlilleri kayıt ve JWatcher kullanarak, daha sonra skor. onlar odasında tercih bölge içinde olduğunda balık shoaling olduğu belirlenmiştirHedef shoal konut. </li><li> merkez hacmi harcanan her tercih bölgesi ve zaman harcanan zamanı ölçmek. </li><li> Ek açıklayıcı bir önlem olarak, &#39;shoaling gücünü&#39; (SoS) hesaplayın. büyüklük ne sıklıkta bireysel balık sürüler açıklar nerede -1 ile +1 arasında bir değer atayın. </li><li> sığlaşma bölgelerinin alanına bölünmesi harcanan zaman shoaling oranı hesaplamak ve zaman oranı çıkarma olup shoaling olmayan sığlaşma alanların kapladığı alanların geçirdi. her bir bölgenin hacmi ile bölünen her bölgede geçirilen zaman toplamı üzerinden, bu miktar yerleştirin. Bu hesaplama ile ilgili daha fazla bilgi önceki bir çalışmada 14 bulunabilir. </li></ol> 6. Veri Kalite Kontrol <ol><li> Geleneksel veri analiz araçları 31-32 kullanarak verileri analiz edin. </li><li> tüm davranışlar için parametrik olmayan Levene testi kullanılarak varyans homojenliği test edin. Bir davranış homojen olmayan ise bir günlük dönüşümü gerçekleştirmek33. </li><li> Homojen verilere 34 bir Kruskal-Wallis ANOVA kullanılarak hiçbir dizi etkileri (örneğin randomizasyon sipariş bireylerin davranışını etkilemez ki,) olduğunu onaylayın. </li><li> Sabit faktör 35 olarak yüzü SoS endekse tek değişkenli genel lineer modeller yaratarak sığlaşma tahlil için hiçbir yan önyargıların olduğunu onaylayın. NOT: veri ile hiçbir sorunları az varsa, aşağı analizler yapılabilir. sorunlar varsa, ek dönüşümler ile bağdaştırmak biyolojik olarak makul açıklamalar ile rasyonalize ve / veya numune boyutları artar. </li></ol> 7. Verileri Analiz <ol><li> Hesaplayın iki kuyruklu Spearman ayrı cesaret ve saldırganlık deneyleri içindeki tüm davranışları için 36 korelasyonları. </li><li> Birden fazla tim yürütülmüştür davranış testleri için tutarlılık ile iki yönlü karma modeli olarak içi korelasyon katsayıları (ICC) hesaplayınBelirli bir tek 36 e. Bu ortamda, ICC verilen bir deneyde davranmış bir balık birden çok kez ölçülen nasıl tutarlı bir ölçüsüdür. </li><li> Tüm davranışları merkezleme ve norming tarafından önişlem cesaret ve saldırganlık davranışları temel bileşenler analizi (PCA) 25 giriş için hazırlamak. NOT: merkezleme ve norming tarafından ölçümleri Önişleme önemli bir adımdır. aşırı çıkarılan bileşenlerin yorumlarda etkileyecektir değişken daha fazla frekans ve daha fazlası ile meydana gelen bu ön işleme adımı davranışları olmadan. merkezleme ve norming süreci bu önyargı ortadan kaldıracaktır. </li><li> cesaret ve saldırganlık bir davranış sendromu olarak birbirine bağlı olup olmadığını belirlemek için bir korelasyon matrisi ile bir PCA gerçekleştirin. 0.6&gt; her bileşenin önemli davranışsal yüklemeleri yorumlayabilir. Davranışsal çalışmalar için PCA raporlama için kapsamlı bir rehber için Budaev 2010 24 Bkz. Bir kayşat arsa üzerinde eigenve bilgilendirici olacakvektörlerin içine klonlanabilir yorumlanması için tutulmalıdır. </li><li> Böyle R veya SPSS 31,32 olarak istatistik yazılım paketi kullanılarak, her birey için her bir bileşen için puanları ayıklayın. puanları verilen bireyin davranışı belirli bir bileşen tarafından izah edilebilir ne kadar temsil ediyor. </li><li> Faktör regresyon puanları ve 36 shoaling gücü arasında Spearman rank korelasyon hesaplayın. NOT: Önemli yorumlanabilir yüklemeler ile herhangi bir bileşen shoaling gücü ile ilişkilidir eğer cesaret ve saldırganlık davranışları, aynı bileşen üzerinde yük veya eğer bir davranış sendromu mevcut olarak kabul edilir. Ayrıca, shoaling gücü daha karmaşık davranışsal sayımsal (cesaret ve saldırganlık) daha iyi yorumlara izin PCA dahil değildir unutmayın. PCA dik cesaret çökecek ve saldırganlık açıkladı ve bu karmaşık ölçümler için uygundur varyasyonun miktarını maksimize etmek için özvektörler içine sahiptir. yorumlamaöz vektörlerini Ortaya çıkan ve karmaşık davranışlar (cesaret ve saldırganlık) her bir daha iyi tanımlanmış ikili sığlaşma ölçümü ile ilgili nasıl bir daha sezgisel bir yorumunu verir bunların her biri üzerinde sığlaşma ölçüm gücümüzü gerileme (yani, balık shoaling veya ) shoaling değil. </li></ol>

<ol>
	<li>Huntingford, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+relationship+between+anti-predator+behaviour+and+aggression+among+conspecifics+in+the+three-spined+stickleback,+Gasterosteus+aculeatus.">The relationship between anti-predator behaviour and aggression among conspecifics in the three-spined stickleback, Gasterosteus aculeatus.</a> Anim Behav. 24, 245-260 (1976).</li><li>R&#233;ale, D., Reader, S. M., Sol, D., McDougall, P. T., Dingemanse, N. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Integrating+animal+temperament+within+ecology+and+evolution.">Integrating animal temperament within ecology and evolution.</a> Biol Rev. 82 (2), 291-318 (2007).</li><li>Sih, A., Bell, A., Johnson, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavioral+syndromes:+an+ecological+and+evolutionary+overview.">Behavioral syndromes: an ecological and evolutionary overview.</a> Trends Ecol Evol. 19 (7), 372-378 (2004).</li><li>Conrad, J. L., Weinersmith, K. L., Brodin, T., Saltz, J. B., Sih, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavioural+syndromes+in+fishes:+a+review+with+implications+for+ecology+and+fisheries+management.">Behavioural syndromes in fishes: a review with implications for ecology and fisheries management.</a> J Fish Biol. 78 (2), 395-435 (2011).</li><li>Wolf, M., Weissing, F. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Animal+personalities:+consequences+for+ecology+and+evolution.">Animal personalities: consequences for ecology and evolution.</a> Trends Ecol Evol. 27 (8), 452-461 (2012).</li><li>Langheinrich, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Zebrafish:+a+new+model+on+the+pharmaceutical+catwalk.">Zebrafish: a new model on the pharmaceutical catwalk.</a> BioEssays. 25 (9), 904-912 (2003).</li><li>Dai, Y. -. J., Jia, Y. -. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Zebrafish+as+a+model+system+to+study+toxicology:+Zebrafish+toxicology+monitoring.">Zebrafish as a model system to study toxicology: Zebrafish toxicology monitoring.</a> Environ Toxicol Chem. 33 (1), 11-17 (2014).</li><li>Norton, W., Bally-Cuif, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Adult+zebrafish+as+a+model+organism+for+behavioural+genetics.">Adult zebrafish as a model organism for behavioural genetics.</a> Neuroscience. 11 (1), 90 (2010).</li><li>Gerlai, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Zebra+fish:+an+uncharted+behavior+genetic+model.">Zebra fish: an uncharted behavior genetic model.</a> Behav Genet. 33 (5), 461-468 (2003).</li><li>Dzieweczynski, T. L., Campbell, B. A., Marks, J. M., Logan, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Acute+exposure+to+17&#945;-ethinylestradiol+alters+boldness+behavioral+syndrome+in+female+Siamese+fighting+fish.">Acute exposure to 17&#945;-ethinylestradiol alters boldness behavioral syndrome in female Siamese fighting fish.</a> Horm Behav. 66 (4), 577-584 (2014).</li><li>Mikl&#242;si, &. #. 1. 9. 3. ;., Andrew, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Zebrafish+as+a+Model+for+Behavioral+Studies.">The Zebrafish as a Model for Behavioral Studies.</a> Zebrafish. 3 (2), 227-234 (2006).</li><li>. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Zebrafish protocols for neurobehavioral research. , (2012).</li><li>Moretz, J. A., Martins, E. P., Robison, B. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavioral+syndromes+and+the+evolution+of+correlated+behavior+in+zebrafish.">Behavioral syndromes and the evolution of correlated behavior in zebrafish.</a> Behav Ecol. 18 (3), 556-562 (2007).</li><li>Way, G. P., Kiesel, A. L., Ruhl, N., Snekser, J. L., McRobert, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sex+differences+in+a+shoaling-boldness+behavioral+syndrome,+but+no+link+with+aggression.">Sex differences in a shoaling-boldness behavioral syndrome, but no link with aggression.</a> Behav Process. 113, 7-12 (2015).</li><li>Toms, C. N., Echevarria, D. J., Jouandot, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+methodological+review+of+personality-related+studies+in+fish:+Focus+on+the+shy-bold+axis+of+behavior.">A methodological review of personality-related studies in fish: Focus on the shy-bold axis of behavior.</a> J Comp Psychol. 23, 1-25 (2010).</li><li>Rowland, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Studying+visual+cues+in+fish+behavior:+A+review+of+ethological+techniques.">Studying visual cues in fish behavior: A review of ethological techniques.</a> Environ Biol Fish. 56 (3), 285-305 (1999).</li><li>Way, G. P., Ruhl, N., Snekser, J. L., Kiesel, A. L., McRobert, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Comparison+of+Methodologies+to+Test+Aggression+in+Zebrafish.">A Comparison of Methodologies to Test Aggression in Zebrafish.</a> Zebrafish. 12 (2), 144-151 (2015).</li><li>Moss, S., Tittaferrante, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interactions+between+aggression,+boldness+and+shoaling+within+a+brood+of+convict+cichlids+(Amatitlania+nigrofasciatus).">Interactions between aggression, boldness and shoaling within a brood of convict cichlids (Amatitlania nigrofasciatus).</a> Behav Process. 121, 63-69 (2015).</li><li>Ruhl, N., Kiesel, A. L., McRobert, S. P., Snekser, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavioural+syndromes+and+shoaling:+connections+between+aggression,+boldness+and+social+behaviour+in+three+different+Danios.">Behavioural syndromes and shoaling: connections between aggression, boldness and social behaviour in three different Danios.</a> Behaviour. 149 (10-12), 1155-1175 (2012).</li><li>Larson, E. T., O'Malley, D. M., Melloni, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Aggression+and+vasotocin+are+associated+with+dominant-subordinate+relationships+in+zebrafish.">Aggression and vasotocin are associated with dominant-subordinate relationships in zebrafish.</a> Behav Brain Res. 167 (1), 94-102 (2006).</li><li>McRobert, S., Bradner, <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+influence+of+body+coloration+on+shoaling+preferences+in+fish.">The influence of body coloration on shoaling preferences in fish.</a> Anim Behav. 56 (3), 611-615 (1998).</li><li>Ruhl, N., McRobert, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+sex+and+shoal+size+on+shoaling+behaviour+in+Danio+rerio.">The effect of sex and shoal size on shoaling behaviour in Danio rerio.</a> J Fish Biol. 67 (5), 1318-1326 (2005).</li><li>Snekser, J., Ruhl, N., Bauer, K., McRobert, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+influence+of+sex+and+phenotype+on+shoaling+decisions+in+zebrafish.">The influence of sex and phenotype on shoaling decisions in zebrafish.</a> J Comp Psychol. 23, 70-81 (2010).</li><li>Budaev, S. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Using+Principal+Components+and+Factor+Analysis+in+Animal+Behaviour+Research:+Caveats+and+Guidelines.">Using Principal Components and Factor Analysis in Animal Behaviour Research: Caveats and Guidelines.</a> Ethology. 116 (5), 472-480 (2010).</li><li>Paciorek, T., McRobert, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Daily+variation+in+the+shoaling+behavior+of+zebrafish+Danio+rerio.">Daily variation in the shoaling behavior of zebrafish Danio rerio.</a> Curr Zool. 58 (1), 129-137 (2012).</li><li>Wright, D., Krause, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Repeated+measures+of+shoaling+tendency+in+zebrafish+(Danio+rerio)+and+other+small+teleost+fishes.">Repeated measures of shoaling tendency in zebrafish (Danio rerio) and other small teleost fishes.</a> Nat Protoc. 1 (4), 1828-1831 (2006).</li><li>Cachat, J., Stewart, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Measuring+behavioral+and+endocrine+responses+to+novelty+stress+in+adult+zebrafish.">Measuring behavioral and endocrine responses to novelty stress in adult zebrafish.</a> Nat Protoc. 5 (11), 1786-1799 (2010).</li><li>Croft, D. P., Krause, J., Couzin, I. D., Pitcher, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=When+fish+shoals+meet:+outcomes+for+evolution+and+fisheries.">When fish shoals meet: outcomes for evolution and fisheries.</a> Fish Fish. 4, 138-146 (2003).</li><li>Brown, M. B., Forsythe, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Robust+Tests+for+the+Equality+of+Variances.">Robust Tests for the Equality of Variances.</a> J Am Stat Assoc. 69 (346), (1974).</li><li>Kruskal, W. H., Wallis, W. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Use+of+Ranks+in+One-Criterion+Variance+Analysis.">Use of Ranks in One-Criterion Variance Analysis.</a> J Am Stat Assoc. 47 (260), 583-621 (1952).</li><li>Nelder, J. A., Wedderburn, R. W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Generalized+Linear+Models.">Generalized Linear Models.</a> J Roy Stat Soc A Sta. 135, 370-384 (1972).</li><li>Iman, R. L., Conover, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+distribution-free+approach+to+inducing+rank+correlation+among+input+variables.">A distribution-free approach to inducing rank correlation among input variables.</a> Commun Stat Simulat. 11 (3), 311-334 (1982).</li><li>Fleiss, J. L., Cohen, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Equivalence+of+Weighted+Kappa+and+the+Intraclass+Correlation+Coefficient+as+Measures+of+Reliability.">The Equivalence of Weighted Kappa and the Intraclass Correlation Coefficient as Measures of Reliability.</a> Educ Psychol Meas. 33 (3), 613-619 (1973).</li><li>Ruhl, N., McRobert, S. P., Currie, W. J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Shoaling+preferences+and+the+effects+of+sex+ratio+on+spawning+and+aggression+in+small+laboratory+populations+of+zebrafish+(Danio+rerio).">Shoaling preferences and the effects of sex ratio on spawning and aggression in small laboratory populations of zebrafish (Danio rerio).</a> Lab Animal. 38 (8), 264-269 (2009).</li><li>Bell, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavioural+differences+between+individuals+and+two+populations+of+stickleback+(Gasterosteus+aculeatus).">Behavioural differences between individuals and two populations of stickleback (Gasterosteus aculeatus).</a> J Evolution Biol. 18 (2), 464-473 (2005).</li><li>Wilson, A. D. M., Godin, J. -. G. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Boldness+and+behavioral+syndromes+in+the+bluegill+sunfish,+Lepomis+macrochirus.">Boldness and behavioral syndromes in the bluegill sunfish, Lepomis macrochirus.</a> Behav Ecol. 20 (2), 231-237 (2009).</li><li>Brodin, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavioral+syndrome+over+the+boundaries+of+life--carryovers+from+larvae+to+adult+damselfly.">Behavioral syndrome over the boundaries of life--carryovers from larvae to adult damselfly.</a> Behav Ecol. 20 (1), 30-37 (2008).</li><li>Noldus, L. P., Spink, A. J., Tegelenbosch, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=EthoVision:+a+versatile+video+tracking+system+for+automation+of+behavioral+experiments.">EthoVision: a versatile video tracking system for automation of behavioral experiments.</a> Behav Res Methods Instrum Comput. 33 (3), 398-414 (2001).</li><li>Cote, J., Fogarty, S., Weinersmith, K., Brodin, T., Sih, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Personality+traits+and+dispersal+tendency+in+the+invasive+mosquitofish+(Gambusia+affinis).">Personality traits and dispersal tendency in the invasive mosquitofish (Gambusia affinis).</a> Proc R Soc B. 277 (1687), 1571-1579 (2010).</li><li>Fraser, D. F., Gilliam, J. F., Daley, M. J., Le, A. N., Skalski, G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Explaining+leptokurtic+movement+distributions:+intrapopulation+variation+in+boldness+and+exploration.">Explaining leptokurtic movement distributions: intrapopulation variation in boldness and exploration.</a> Am Nat. 158 (2), 124-135 (2001).</li><li>Dingemanse, N. J., Wright, J., Kazem, A. J. N., Thomas, D. K., Hickling, R., Dawnay, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavioural+syndromes+differ+predictably+between+12+populations+of+three-spined+stickleback.">Behavioural syndromes differ predictably between 12 populations of three-spined stickleback.</a> J Anim Ecol. 76 (6), 1128-1138 (2007).</li></ol>

The authors (GW and SPM) have no competing financial interests or conflicts of interest.

Zebra balığı tutarlı cesaret, saldırganlık dernekler ve sığlaşma davranışları varsa protokol belirleyecektir. Tutarlı dernekler bu davranışların hiçbirini diğerinden belirli bir nüfusta varsa, o zaman bir davranış sendromu mevcuttur. Bir popülasyonun doğal davranışsal sendromu inceleyerek, araştırmacılar daha tam olarak davranışsal dinamik anlayışı, nüfus yapısı, ve muhtemelen evrimsel tarihi 3 olabilir. Ayrıca, farmakoloji 6, toksikoloji 7, davranı?...

Belirli bir nüfus bireysel hayvanların içinde farklı davranışları arasındaki ilişkiyi inceleyen literatür büyüyen bir vücudu var. Bu dernekler davranış sendromları denir, ve ölçümler genellikle cesaret, saldırganlık, keşif davranışı ve sosyallik 1-5 arasındadır. Davranış sendromlar hem doğrudan hem de dolaylı nedenlerden dolayı değerlidir. Doğrudan, davranışsal sendromların bilgi evrim teorisinin, nüfus yapısı ve populasyon dinamiği 3 daha kapsamlı bir görünüm sağlayabilir. Dolaylı olarak, davranışsal dernekler ile ilgili bilgi gibi farmakoloji 6, toksikoloji 7, davranışsal genetik 8,9 ve endokrinoloji 10 olarak davranışlarını ölçmek alanları bildirebilir. Çünkü bu doğrudan ve dolaylı faydalar, davranışsal sendromların bir bilgi artışı gibi zebrabalıkları gibi yaygın olarak kullanılan model organizmaların özellikle değerlidir. zebrafish kullanan çalışmalar bulunmaktadır Idavranışsal sendromların 11-13 analizi de dahil olmak üzere disiplinleri, na çeşididir. davranışsal sendrom araştırma bilgilerini ilerletmek ve diğer disiplinler da hipotez testleri, davranışsal ölçümleri kullanın çünkü davranış güvenilir ve özlü açıklamalar türler içindeki arası çalışma karşılaştırmaları kolaylaştıracak geçerli analiz ve yorumların ve standardize protokoller için gereklidir. Bizim protokol laboratuvar yetiştirilen Zebra balığı 14 nüfuslu bir cesaret saldırmazlık-sığlaşma davranışsal sendromu ölçmek amacıyla geliştirilmiştir. Ancak, protokolün temeli kolayca alternatif davranış tedbirlerin çeşitli modifiye edilebilir (uygun randomizasyon ve uygun analizler sağlayarak, bireysel balık izleme). Ayrıca, cesaret, saldırganlık ya da sığlaşma tahlilleri farklı hipotezleri test için ayrı ayrı çalıştırılabilir. Bu nedenle, bizim hedefimiz ise bir davranış sendromu çalışma ve başarılı bireysel l için protokol yapmak için nasıl açıklamak içinevel davranışsal ölçümü, bu prosedürün her faset bağımsız olabilir. Davranışsal sendromlar üzerinde literatür bir davranış sendromu ölçmek amacıyla, insanlara 4 eklembacaklılardan, birkaç taksonomik gruplar yayılan ve en az iki davranış bağlamlar sayısal olmalıdır. Ne yazık ki, davranış eksenleri boyunca davranışsal ölçüm ölçmek için kullanılan deneylerde genellikle küçük tutarlılık yoktur. Örneğin, balık, cesaret T-labirent deneyleri, açık alan tahlilleri ya da bir roman veya yabancı uyaran 15 giriş kullanılarak ölçülebilir. Balıklarda Saldırganlık çalışmaları dyad&#39;ın etkileşimleri, Video uyaran deneyleri, ya da kil modeli deneyleri 12,16,17 içerebilir. Benzer şekilde, tipik haliyle shoalmate tercih ölçülmesini içerir sığlaşma davranış analizi, ilişki süresi 21-23 belirlemek için farklı yöntemler ile, tank farklı gerçekleştirilebilir. Overa Bu protokol belirli bir alt kümesill davranış tahlil repertuar sunulmuştur. Özellikle, bu protokol karşılaştırmaları nüfusu içindeki tüm bireylerin tutarlı olup olmadığını belirlemek için bireylerin içinde karşılaştırmalar kolaylaştıran bir şekilde cesaret, saldırganlık ve sığlaşma deneyleri yoluyla bireyleri izlemek için bir metodoloji sunar. Biz daha önceki çalışmalarda 14,18 zebrafish ve hükümlü çiklitleri (Amatitlania nigrofasciata) ile bu protokolü gerçekleştirdik ve herhangi benzer boyuttaki tatlısu balıkları ile çalışacaktır. Cesaret deneyleri tankının üst ve alt kısımları eşit büyüklükte alanları belirleyen yatay bir çizgi olan bir 1.5 L yamuk tankında gerçekleştirilir. Sayısallaştırılmış davranışlar tankın üst ve alt kısmı, her bir bölümünün, dart sayısında harcanan zaman arasında test balık geçişlerin sayısı ve üst kısım girmek için gecikme bulunmaktadır. saldırganlık tahlili içeren bir 19L dikdörtgen tankında gerçekleştirilir3 inç x 5 inç ayna tankının 19 sol alt köşesinde yer alan yaklaşık 22 ° eğimli. Test balık ve onun yansıması arasındaki sokması sayısını, yan görüntüler, dart - sayısal davranışlar toplam spesifik agresif göstergeleriyle birlikte ayna 20 ile etkileşim hedef balık tarafından harcanan süreyi içerir. Bu özel göstergeler, ısırıkları açık ağızlı ayna doğru hızlı lunges olarak tanımlanır, yan görüntüler aynanın yönünde yanal, göğüs, anal ve sırt yüzgeçleri alevlenişinden olarak tanımlanan ve dart Hiçbir düzensiz hareketler vardır ayna yönlendirilir değil. Son olarak, sığlaşma tahlil bir tri-odacıklı tankın merkezi odasında bir test balık davranışını ifade etmektedir. Tankın yan odaları ya boş olan, ya da balık &quot;hedef shoal&quot; içeren ve deney balıkları her iki tarafın odasının yakınında geçirdiği süre 21-23 ölçülür. Tek bir kompozit skor, Stren olarak anılacaktırshoaling arasında GTH (SOS), uyaranlara özgü her ayrı test balık için hesaplanır ve alt 14 analizlerinde kullanılabilir. Tüm davranışlar JWatcher 24 olarak bilinen serbest davranışsal miktar yazılımını kullanarak tek bir görüntüleyici veya birden fazla izleyici tarafından puanlanır. Davranışsal sendrom varlığını test öncelikle istatistiksel bir çaba ve Budeav 2010 tarafından sunulan gibi yönergeleri izleyin tavsiye edilir 25. Özellikle, merkezli ve normlu veriler üzerinde bir temel bileşenler analizi (PCA) gerçekleştirmek için tavsiye edildiği girişler birden davranışsal ölçümlerde (yani, cesaret ve saldırganlık) ile denemelerde bireyin davranışlarının vektörleri vardır. korelasyon matris üzerinde gerçekleştirilen PCA, davranış ölçümleri boyutunu azaltarak ve böylece değişim çoğunluğu açıklayan en önemli kısmını ayıklar. ekstre bileşenler daha sonra bas yorumlanabilirFaiz ve regresyon puanlarının bireysel davranış için yüksek faktör yükleri üzerinde ed açıklayıcı bileşenlerin temelinde her birey için elde edilebilir. Bu regresyon puanlar daha sonra SoS ölçümü ve balık boyutu veya cinsiyet gibi diğer çeşitli olmayan davranış ölçümlere göre yapılabilir. Bu iş akışı cesaret ve shoaling 14 arasında bulunan bir cinsiyete özgü davranış sendromu keşfedildi edildiği Zebra balığı davranışsal sendromların bir çalışmada uygulamaya konmuştur. Bu durumda, cesur zebrafish erkekler daha büyük, daha agresif türler (D. albolineatus) ile ilişkilendirmek daha olasıdır, ancak bu ilişki kadınlarda kaybolur. Bu iş akışı da davranışsal sendrom potansiyel türün davranışsal plastisite gösteren keşfedilmedi edildiği çocuk hükümlü çiklit akraba (Amatitlania nigrofasciata) 18 yapılan bir çalışmada uygulanmıştır. Bu nedenle, aşağıdaki protokol B sunulmuşturTek bir düzeyde davranışsal sendromu okuyan çerçevesinde üç belirli tahlillerin (cesaret, saldırganlık ve sığlaşma) doğasını belirleyen bir gol inci.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="783">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:352px;">Zebrafish Rack System</td>
			<td style="width:224px;">Aquaneering Inc</td>
			<td style="width:119px;">Cat. # ZS550</td>
			<td style="width:88px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Pet Valu Tropical Fish Food, 224.0g</td>
			<td>Pet Valu</td>
			<td>Cat. # 31700</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Premium Grade Brine Shrimp Eggs, 16 oz</td>
			<td>Brine Shrimp Direct</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">1.5 L Trapezoidal Tank</td>
			<td>Pentair Aquatic Ecosystems</td>
			<td>Cat. # itsts-a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">19L rectangular tank</td>
			<td>That Fish Place</td>
			<td align="right">211932</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">76L rectangular tank</td>
			<td>That Fish Place</td>
			<td align="right">212180</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Hitachi KP-D20A CCD Camera</td>
			<td>Prescott&#39;s, Inc.</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Nikon AF Nikkor 35-105mm f/305~4.5s MACRO lens</td>
			<td>Nikon Corporation</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">ArtMinds Square Mirror, Value Pack 3&#34;x3&#34;</td>
			<td>Michaels</td>
			<td>Cat. # 10334162</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Jwatcher</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">SPSS Statistics Base</td>
			<td>IBM</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">R</td>
			<td>The R Foundation</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

boldness, aggression, and shoaling assays for zebrafish behavioral syndromes

Belirli davranışları farklı bağlamlarda altında etkileşim zaman bir davranışsal sendrom var. Zebra balığı son yıllarda yapılan çalışmalarda denek olmuştur ve doğru analizler ve yorumlar sağlamak için protokoller standardize etmek önemlidir. Daha önceki çalışmalarda, biz 1.5 L trapez tankında davranışlar (yüzeye yakın zamanda, geçişlerde gecikme, geçişlerin sayısı ve dart) bir dizi izleyerek cesaret ölçüldü. Aynı şekilde, bir dikdörtgen 19 L tankında eğimli bir ayna yakın gözlem sokması, yan görüntüler, dart ve zamana göre saldırganlık sayılabilir. üçte bir 76 L tankı bölerek biz de sığlaşma tercihlerini inceledik. sığlaşma tahlil son derece özelleştirilebilir tahlil ve belirli hipotezler için uygun olabilir. Bununla birlikte, bu deneme için olan protokole uygun olarak standart, ama özelleştirme için yeterince esnek olması gerekir. Daha önceki çalışmalarda, son odaları vardı ya boş, 5 ya da 10 zebrafish, veya 5 inci Danios (D. albolineatus) içeriyordu. fol olarakyazının lowing, biz davranışsal sendrom deneylerin çoğaltma için izin verecek protokolü, başarılı uygulamalarını eşlik ayrıntılı bir protokol ve temsil veri mevcut.

çalışmanın doğası ve kullanılan spesifik protokolüne bağlı olarak, birçok farklı sonuçlar davranışsal sendromlar deneyde mümkündür. Aşağıdaki tablo ve gösterilen rakamlar, dergisinde yayımlanan önceki çalışmadan uyarlanmıştır Davranışsal 14 ve dergi Zebra balığı 17 Süreçleri. Teklif (yukarıda tarif edildiği gibi) &#39;deney korelasyon içinde &quot;tamamen sonuçları, iki set ve içinde gerçekleştirilmektedir zaman&#39; dene...

Watch this Scientific Journal Video about Boldness, Aggression, and Shoaling Assays for Zebrafish Behavioral Syndromes at JoVE.com

Boldness, Aggression, and Shoaling Assays for Zebrafish Behavioral Syndromes

This manuscript describes the setup, implementation, and analysis of boldness, aggression, and shoaling in zebrafish and testing for the presence of a behavioral syndrome. A standardized approach for behavioral quantification will allow for easier comparison across studies. Modifications to this protocol are possible as each assay can be run individually.

Zebra balığı Davranış Sendromlardaki için cesaret, Saldırganlık ve shoaling Tahliller

A behavioral syndrome exists when specific behaviors interact under different contexts. Zebrafish have been test subjects in recent studies and it is ...

boldness-aggression-shoaling-assays-for-zebrafish-behavioral

Research

JoVE Journal

Medicine

10.2K Görüntüleme.  Saint Joseph’s University. This manuscript describes the setup, implementation, and analysis of boldness, aggression, and shoaling in zebrafish and testing for the presence of a behavioral syndrome. A standardized approach for behavioral quantification will allow for easier comparison across studies. Modifications to this protocol are possible as each assay can be run individually.

Video: Boldness, Aggression, and Shoaling Assays for Zebrafish Behavioral Syndromes

Intra-Operative Behavioral Tasks in Awake Humans Undergoing Deep Brain Stimulation Surgery

Deep brain stimulation (DBS) is a surgical procedure that directs chronic, high frequency electrical stimulation to specific targets in the brain through implanted electrodes. Deep brain stimulation was first implemented as a therapeutic modality by Benabid et al. in the late 1980s, when he used this technique to stimulate the ventral intermediate nucleus of the thalamus for the treatment of tremor 1. Currently, the procedure is used to treat patients who fail to respond adequately to medical management for diseases such as Parkinson's, dystonia, and essential tremor. The efficacy of this procedure for the treatment of Parkinson's disease has been demonstrated in well-powered, randomized controlled trials 2. Presently, the U.S. Food and Drug Administration has approved DBS as a treatment for patients with medically refractory essential tremor, Parkinson's disease, and dystonia. Additionally, DBS is currently being evaluated for the treatment of other psychiatric and neurological disorders, such as obsessive compulsive disorder, major depressive disorder, and epilepsy. 
DBS has not only been shown to help people by improving their quality of life, it also provides researchers with the unique opportunity to study and understand the human brain. Microelectrode recordings are routinely performed during DBS surgery in order to enhance the precision of anatomical targeting. Firing patterns of individual neurons can therefore be recorded while the subject performs a behavioral task. Early studies using these data focused on descriptive aspects, including firing and burst rates, and frequency modulation 3. More recent studies have focused on cognitive aspects of behavior in relation to neuronal activity 4,5. This article will provide a description of the intra-operative methods used to perform behavioral tasks and record neuronal data with awake patients during DBS cases. Our exposition of the process of acquiring electrophysiological data will illuminate the current scope and limitations of intra-operative human experiments.

Deep brain stimulation surgery offers a unique opportunity to examine information encoding in the awake human brain. This article will describe intra-operative methods used to perform cognitive and behavioral tasks while simultaneously acquiring physiological data such as EMG, single-unit neuronal activity and/or local field potentials.

Derin beyin stimülasyonu Cerrahi Uygulanan Uyanık İnsanlar İntraoperatif Davranış Görevler

Deep brain stimulation (DBS) is a surgical procedure that directs chronic, high frequency electrical stimulation to specific targets in the brain through ...

Tıp

Using Visual and Narrative Methods to Achieve Fair Process in Clinical Care

The Institute of Medicine has targeted patient-centeredness as an important area of quality improvement. A major dimension of patient-centeredness is respect for patient's values, preferences, and expressed needs. Yet specific approaches to gaining this understanding and translating it to quality care in the clinical setting are lacking. From a patient perspective quality is not a simple concept but is best understood in terms of five dimensions: technical outcomes; decision-making efficiency; amenities and convenience; information and emotional support; and overall patient satisfaction. Failure to consider quality from this five-pronged perspective results in a focus on medical outcomes, without considering the processes central to quality from the patient's perspective and vital to achieving good outcomes. In this paper, we argue for applying the concept of fair process in clinical settings. Fair process involves using a collaborative approach to exploring diagnostic issues and treatments with patients, explaining the rationale for decisions, setting expectations about roles and responsibilities, and implementing a core plan and ongoing evaluation. Fair process opens the door to bringing patient expertise into the clinical setting and the work of developing health care goals and strategies. This paper provides a step by step illustration of an innovative visual approach, called photovoice or photo-elicitation, to achieve fair process in clinical work with acquired brain injury survivors and others living with chronic health conditions. Applying this visual tool and methodology in the clinical setting will enhance patient-provider communication; engage patients as partners in identifying challenges, strengths, goals, and strategies; and support evaluation of progress over time. Asking patients to bring visuals of their lives into the clinical interaction can help to illuminate gaps in clinical knowledge, forge better therapeutic relationships with patients living with chronic conditions such as brain injury, and identify patient-centered goals and possibilities for healing. The process illustrated here can be used by clinicians, (primary care physicians, rehabilitation therapists, neurologists, neuropsychologists, psychologists, and others) working with people living with chronic conditions such as acquired brain injury, mental illness, physical disabilities, HIV/AIDS, substance abuse, or post-traumatic stress, and by leaders of support groups for the types of patients described above and their family members or caregivers.

This paper illustrates an innovative visual approach (photovoice or photo-elicitation) to achieve fair process in clinical care for patients living with chronic health conditions, illuminate gaps in clinical knowledge, forge better therapeutic relationships, and identify patient-centered goals and possibilities for healing.

Klinik Bakımı Fuar Süreci elde Görsel ve Anlatı Yöntemlerle

The Institute of Medicine has targeted patient-centeredness as an important area of quality improvement. A major dimension of patient-centeredness is ...

Biomarkers in an Animal Model for Revealing Neural, Hematologic, and Behavioral Correlates of PTSD

Identification of biomarkers representing the evolution of the pathophysiology of Post Traumatic Stress Disorder (PTSD) is vitally important, not only for objective diagnosis but also for the evaluation of therapeutic efficacy and resilience to trauma. Ongoing research is directed at identifying molecular biomarkers for PTSD, including traumatic stress induced proteins, transcriptomes, genomic variances and genetic modulators, using biologic samples from subjects' blood, saliva, urine, and postmortem brain tissues. However, the correlation of these biomarker molecules in peripheral or postmortem samples to altered brain functions associated with psychiatric symptoms in PTSD remains unresolved. Here, we present an animal model of PTSD in which both peripheral blood and central brain biomarkers, as well as behavioral phenotype, can be collected and measured, thus providing the needed correlation of the central biomarkers of PTSD, which are mechanistic and pathognomonic but cannot be collected from people, with the peripheral biomarkers and behavioral phenotypes, which can.
Our animal model of PTSD employs restraint and tail shocks repeated for three continuous days - the inescapable tail-shock model (ITS) in rats. This ITS model mimics the pathophysiology of PTSD 17, 7, 4, 10. We and others have verified that the ITS model induces behavioral and neurobiological alterations similar to those found in PTSD subjects 17, 7, 10, 9. Specifically, these stressed rats exhibit (1) a delayed and exaggerated startle response appearing several days after stressor cessation, which given the compressed time scale of the rat's life compared to a humans, corresponds to the one to three months delay of symptoms in PTSD patients (DSM-IV-TR PTSD Criterian D/E 13), (2) enhanced plasma corticosterone (CORT) for several days, indicating compromise of the hypothalamopituitary axis (HPA), and (3) retarded body weight gain after stressor cessation, indicating dysfunction of metabolic regulation.
The experimental paradigms employed for this model are: (1) a learned helplessness paradigm in the rat assayed by measurement of acoustic startle response (ASR) and a charting of body mass; (2) microdissection of the rat brain into regions and nuclei; (3) enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) for blood levels of CORT; (4) a gene expression microarray plus related bioinformatics tools 18. This microarray, dubbed rMNChip, focuses on mitochondrial and mitochondria-related nuclear genes in the rat so as to specifically address the neuronal bioenergetics hypothesized to be involved in PTSD.

We describe a rat model of post traumatic stress disorder (PTSD) that reveals the persistent alterations in neuroendocrine function and the delayed long-term, exaggerated fear response, characteristic of PTSD patients. The animal model and methods described here are useful for correlating biomarkers in brain nuclei, which are mechanistic but cannot be measured in patients, with biomarkers in peripheral white blood cells, which can.

TSSB, Nöral Hematolojik ve Davranış Bağlantılı Revealing için Hayvan Modelinde Biyobelirteçler

Identification of biomarkers representing the evolution of the pathophysiology of Post Traumatic Stress Disorder (PTSD) is vitally important, not only for ...

Eye Tracking Young Children with Autism

The rise of accessible commercial eye-tracking systems has fueled a rapid increase in their use in psychological and psychiatric research. By providing a direct, detailed and objective measure of gaze behavior, eye-tracking has become a valuable tool for examining abnormal perceptual strategies in clinical populations and has been used to identify disorder-specific characteristics1, promote early identification2, and inform treatment3. In particular, investigators of autism spectrum disorders (ASD) have benefited from integrating eye-tracking into their research paradigms4-7. Eye-tracking has largely been used in these studies to reveal mechanisms underlying impaired task performance8 and abnormal brain functioning9, particularly during the processing of social information1,10-11. While older children and adults with ASD comprise the preponderance of research in this area, eye-tracking may be especially useful for studying young children with the disorder as it offers a non-invasive tool for assessing and quantifying early-emerging developmental abnormalities2,12-13. Implementing eye-tracking with young children with ASD, however, is associated with a number of unique challenges, including issues with compliant behavior resulting from specific task demands and disorder-related psychosocial considerations. In this protocol, we detail methodological considerations for optimizing research design, data acquisition and psychometric analysis while eye-tracking young children with ASD. The provided recommendations are also designed to be more broadly applicable for eye-tracking children with other developmental disabilities. By offering guidelines for best practices in these areas based upon lessons derived from our own work, we hope to help other investigators make sound research design and analysis choices while avoiding common pitfalls that can compromise data acquisition while eye-tracking young children with ASD or other developmental difficulties.

Eye tracking has long been used to study gaze patterns in typically-developing individuals, but recent technological advancements have made its use with clinical populations, including autism, more feasible. While eye-tracking young children with autism can offer insight into early symptom manifestations, it involves methodological challenges. Suggestions for best practices are provided.

Otizm ile Genç Çocuk İzleme Göz

The rise of accessible commercial eye-tracking systems has fueled a rapid increase in their use in psychological and psychiatric research. By providing a ...

Processing of Primary Brain Tumor Tissue for Stem Cell Assays and Flow Sorting

Brain tumors are typically comprised of morphologically diverse cells that express a variety of neural lineage markers. Only a relatively small fraction of cells in the tumor with stem cell properties, termed brain tumor initiating cells (BTICs), possess an ability to differentiate along multiple lineages, self-renew, and initiate tumors in vivo. We applied culture conditions originally used for normal neural stem cells (NSCs) to a variety of human brain tumors and found that this culture method specifically selects for stem-like populations. Serum-free medium (NSC) allows for the maintenance of an undifferentiated stem cell state, and the addition of bFGF and EGF allows for the proliferation of multi-potent, self-renewing, and expandable tumorspheres.
To further characterize each tumor's BTIC population, we evaluate cell surface markers by flow cytometry. We may also sort populations of interest for more specific characterization. Self-renewal assays are performed on single BTICs sorted into 96 well plates; the formation of tumorspheres following incubation at 37 &deg;C indicates the presence of a stem or progenitor cell. Multiple cell numbers of a particular population can also be sorted in different wells for limiting dilution analysis, to analyze self-renewal capacity. We can also study differential gene expression within a particular cell population by using single cell RT-PCR.
The following protocols describe our procedures for the dissociation and culturing of primary human samples to enrich for BTIC populations, as well as the dissociation of tumorspheres. Also included are protocols for staining for flow cytometry analysis or sorting, self-renewal assays, and single cell RT-PCR.

The identification of brain tumor initiating cells (BTICs), the rare cells within a heterogeneous tumor possessing stem cell properties, provides new insights into human brain tumor pathogenesis. We have refined specific culture conditions to enrich for BTICs, and we routinely use flow cytometry to further enrich these populations. Self-renewal assays and transcript analysis by single cell RT-PCR can subsequently be performed on these isolated cells.

Sıralama Kök Hücre Tahliller ve Akış Primer Beyin Tümörü Doku İşleme

Brain tumors are typically comprised of morphologically diverse cells that express a variety of neural lineage markers. Only a relatively small fraction ...

Screening for Melanoma Modifiers using a Zebrafish Autochthonous Tumor Model

Genomic studies of human cancers have yielded a wealth of information about genes that are altered in tumors1,2,3. A challenge arising from these studies is that many genes are altered, and it can be difficult to distinguish genetic alterations that drove tumorigenesis from that those arose incidentally during transformation. To draw this distinction it is beneficial to have an assay that can quantitatively measure the effect of an altered gene on tumor initiation and other processes that enable tumors to persist and disseminate. Here we present a rapid means to screen large numbers of candidate melanoma modifiers in zebrafish using an autochthonous tumor model4 that encompasses steps required for melanoma initiation and maintenance. A key reagent in this assay is the miniCoopR vector, which couples a wild-type copy of the mitfa melanocyte specification factor to a Gateway recombination cassette into which candidate melanoma genes can be recombined5. The miniCoopR vector has a mitfa rescuing minigene which contains the promoter, open reading frame and 3'-untranslated region of the wild-type mitfa gene. It allows us to make constructs using full-length open reading frames of candidate melanoma modifiers. These individual clones can then be injected into single cell Tg(mitfa:BRAFV600E);p53(lf);mitfa(lf)zebrafish embryos. The miniCoopR vector gets integrated by Tol2-mediated transgenesis6 and rescues melanocytes. Because they are physically coupled to the mitfa rescuing minigene, candidate genes are expressed in rescued melanocytes, some of which will transform and develop into tumors. The effect of a candidate gene on melanoma initiation and melanoma cell properties can be measured using melanoma-free survival curves, invasion assays, antibody staining and transplantation assays.

A rapid way to screen for melanoma modifiers using a zebrafish autochthonous tumor model is presented. It takes advantage of the miniCoopR vector which allows for expression of candidate melanoma genes in melanocytes. A method to obtain melanoma-free survival curves, an invasion assay, a protocol for antibody staining of scale melanocytes and a melanoma transplantation assay are described.

Bir Zebra balığı Otokton Tümör Modeli kullanılarak Melanom Değiştiricileri için Tarama

Genomic studies of  human cancers have yielded a wealth of information about genes that are altered  in tumors1,2,3. A challenge arising from these ...

Adaptation of Semiautomated Circulating Tumor Cell (CTC) Assays for Clinical and Preclinical Research Applications

The majority of cancer-related deaths occur subsequent to the development of metastatic disease. This highly lethal disease stage is associated with the presence of circulating tumor cells (CTCs). These rare cells have been demonstrated to be of clinical significance in metastatic breast, prostate, and colorectal cancers. The current gold standard in clinical CTC detection and enumeration is the FDA-cleared CellSearch system (CSS). This manuscript outlines the standard protocol utilized by this platform as well as two&#160;additional adapted protocols that describe the detailed process of user-defined marker optimization for protein characterization of patient CTCs and a comparable protocol for CTC capture in very low volumes of blood, using standard CSS reagents, for studying in vivo preclinical mouse models of metastasis. In addition, differences in CTC quality between healthy donor blood spiked with cells from tissue culture versus patient blood samples are highlighted. Finally, several commonly discrepant items that can lead to CTC misclassification errors are outlined. Taken together, these protocols will provide a useful resource for users of this platform interested in preclinical and clinical research pertaining to metastasis and CTCs.

Adaptation of Semiautomated Circulating Tumor Cell CTC Assays for Clinical and Preclinical Research Applications

Circulating tumor cells (CTCs) are prognostic in several metastatic cancers. This manuscript describes the gold standard CellSearch system (CSS) CTC enumeration platform and highlights common misclassification errors. In addition, two&#160;adapted protocols are described for user-defined marker characterization of CTCs and CTC enumeration in preclinical mouse models of metastasis using this technology.

Klinik ve Klinik Öncesi Araştırma Uygulamaları Tümör Hücre (CTC) Tahliller Sirkülasyon semiautomated adaptasyon

The majority of cancer-related deaths occur subsequent to the development of metastatic disease. This highly lethal disease stage is associated with the ...

A Novel in vivo Gene Transfer Technique and in vitro Cell Based Assays for the Study of Bone Loss in Musculoskeletal Disorders

Differentiation and activation of osteoclasts play a key role in the development of musculoskeletal diseases as these cells are primarily involved in bone resorption. Osteoclasts can be generated in vitro from monocyte/macrophage precursor cells in the presence of certain cytokines, which promote survival and differentiation. Here, both in vivo and in vitro techniques are demonstrated, which allow scientists to study different cytokine contributions towards osteoclast differentiation, signaling, and activation. The minicircle DNA delivery gene transfer system provides an alternative method to establish an osteoporosis-related model is particularly useful to study the efficacy of various pharmacological inhibitors in vivo. Similarly, in vitro culturing protocols for producing osteoclasts from human precursor cells in the presence of specific cytokines enables scientists to study osteoclastogenesis in human cells for translational applications. Combined, these techniques have the potential to accelerate drug discovery efforts for osteoclast-specific targeted therapeutics, which may benefit millions of osteoporosis and arthritis patients worldwide.

A Novel in vivo Gene Transfer Technique and in vitro Cell Based Assays for the Study of Bone Loss in Musculoskeletal Disorders

Differentiation of precursor cells into osteoclasts is regulated by cytokines and growth factors. Here, a novel gene transfer technique for differentiation of osteoclasts in vivo and cell culture protocols for differentiating precursor cells into osteoclasts in vitro as a method to study the effects of cytokines on osteoclastogenesis are described.

Bir Roman<em&gt; In vivo</em&gt; Gen Transferi Tekniği ve<em&gt; In vitro</emİskelet Hastalıkları Kemik Kaybı Çalışmaları&gt; Hücre Tabanlı Tahliller

Differentiation and activation of osteoclasts play a key role in the development of musculoskeletal diseases as these cells are primarily involved in bone ...

A Novel Model of Mild Traumatic Brain Injury for Juvenile Rats

Despite growing evidence that childhood represents a major risk period for mild traumatic brain injury (mTBI) from sports-related concussions, motor vehicle accidents, and falls, a reliable animal model of mTBI had previously not been developed for this important aspect of development. The modified weight-drop technique employs a glancing impact to the head of a freely moving rodent transmitting acceleration, deceleration, and rotational forces upon the brain. When applied to juvenile rats, this modified weight-drop technique induced clinically relevant behavioural outcomes that were representative of post-concussion symptomology. The technique is a rapidly applied procedure with an extremely low mortality rate, rendering it ideal for high-throughput studies of therapeutics. In addition, because the procedure involves a mild injury to a closed head, it can easily be used for studies of repetitive brain injury. Owing to the simplistic nature of this technique, and the clinically relevant biomechanics of the injury pathophysiology, the modified weight-drop technique provides researchers with a reliable model of mTBI that can be used in a wide variety of behavioural, molecular, and genetic studies.

The modified weight-drop technique is an easy, cost-effective procedure used for the induction of mild traumatic brain injury in juvenile rats. This novel technique produces clinically relevant symptomology that will advance the study of mild traumatic brain injury (mTBI) and concussion.

Çocuk Rats için Hafif Travmatik Beyin Hasarı Yeni Bir Model

Despite growing evidence that childhood represents a major risk period for mild traumatic brain injury (mTBI) from sports-related concussions, motor ...

Real-time Cytotoxicity Assays in Human Whole Blood

A live cell-based whole blood cytotoxicity assay (WCA) that allows access to temporal information of the overall cell cytotoxicity is developed with high-throughput cell positioning technology. The targeted tumor cell populations are first preprogrammed to immobilization into an array format, and labeled with green fluorescent cytosolic dyes. Following the cell array formation, antibody drugs are added in combination with human whole blood. Propidium iodide (PI) is then added to assess cell death. The cell array is analyzed with an automatic imaging system. While cytosolic dye labels the targeted tumor cell populations, PI labels the dead tumor cell populations. Thus, the percentage of target cancer cell killing can be quantified by calculating the number of surviving targeted cells to the number of dead targeted cells. With this method, researchers are able to access time-dependent and dose-dependent cell cytotoxicity information. Remarkably, no hazardous radiochemicals are used. The WCA presented here has been tested with lymphoma, leukemia, and solid tumor cell lines. Therefore, WCA allows researchers to assess drug efficacy in a highly relevant ex&#160;vivo condition.

The whole blood cytotoxicity assay (WCA) is a cytotoxicity assay developed by incorporating high-throughput cell positioning technology with fluorescence microscopy and automated image processing. Here, we describe how lymphoma cells treated with an anti-CD20 antibody can be analyzed real-time in human whole blood to provide quantitative cellular cytotoxicity analysis.

İnsan Tüm Kan gerçek zamanlı sitotoksisite deneyleri

A live cell-based whole blood cytotoxicity assay (WCA) that allows access to temporal information of the overall cell cytotoxicity is developed with ...