This work was supported by a Howard Hughes Medical Institute Education Grant and an internal grant from the Saint Joseph's University chapter of Sigma Xi. We would also like to thank the three anonymous reviewers who helped strengthen the protocol and interpretations.

Le seguenti metodologie per la custodia, la cura e lo studio di zebrafish sono stati approvati dal di San Giuseppe Università IACUC. 1. Zebrafish alloggio e cure <ol><li> Ottenere il pesce zebra soggetto da un fornitore locale, o da popolazioni catturati in natura. Si prega di notare che gli alloggi il pesce zebra è soggetto alle linee guida IACUC e permessi aggiuntivi sono necessari per abitazioni popolazioni catturati in natura. </li><li> Identificare e zebrafish separata a seconda del sesso. In alternativa, saltare questo passaggio o sostituirlo con un diverso metodo di separazione basato sull&#39;ipotesi di studio. NOTA: caratteristiche sessuali sono difficili da determinare in zebrafish, soprattutto nelle femmine. Fare riferimento a queste linee guida 10 o manuali online utili per distinguere il sesso. </li><li> Casualmente separare le popolazioni ulteriormente nel rapporto appropriato di pesci focale allo stimolo di pesce. Nota: i pesci focale sono i soggetti del test hanno seguito attraverso la serie di behaviosaggi RAL, e pesce di stimolo sono le persone che occuperanno le camere di stimolo nei saggi di aggressione e shoaling. NOTA: Tradizionalmente, tra 1 e 5 pesci di stimolo per i pesci focale nelle analisi shoaling e un 1: 1 di stimolo: sono utilizzati focale rapporto pesce in saggi aggressione 14,17. Tuttavia, il ricercatore ha bisogno di progettare specificamente allo studio con l&#39;ipotesi in mente (ad esempio, dovrebbe stimolo pesce essere mantenuta costante per mantenere la coerenza nel comportamento dei pesci focale, o dovrebbe stimolo pesce essere ruotato tra ogni test per garantire una corretta randomizzazione). </li><li> Conservare tutti i pesci in rack abitative zebrafish (27,5-28,5 ° C) sotto un rigoroso 00:12 ciclo luce / buio. Nutrire tutti gli alimenti focale e di stimolo pesce fiocco giornaliera e settimanale artemie, nei giorni non di ricerca. </li><li> Assicurarsi che tutti i test si fanno tra ZT1 e ZT5 (tempo zeitgeber) per evitare gli effetti del ritmo circadiano 26. </li></ol> 2. Installazione randomizzazione e serbatoio <ol><li> RAndomize tutti gli individui a priori una determinata sequenza di test comportamentali. Impostare uno schema di randomizzazione coerente utilizzando un generatore di sequenza casuale linea 27 o un generatore di sequenza casuale da un pacchetto software statistico (R). <ol><li> Etichetta ogni saggio 1-3 e mantenere questo incarico coerente. Assegnare una sequenza casuale di ogni individuo e mappare la sequenza secondo l&#39;etichetta test comportamentale. Ad esempio, per tre saggi totali (1 mappati a shoaling, 2 mappato audacia, e 3 mappati per aggressione), un dato individuo può avere una sequenza randomizzata di &#39;2,3,1&#39;, che richiederà loro di svolgere la specifica test comportamentali nella sequenza specificata. </li></ol></li><li> Impostare i serbatoi del test (coraggio, aggressività, e shoaling) in laboratorio in luoghi che riducano al minimo la possibilità di stimoli esterni negativi ed essere sicuri di avere abbastanza spazio per una videocamera per catturare l&#39;intero serbatoio. Assicurarsi che la videocamera è enough chiarezza per visualizzare le etichette del serbatoio così come essere in grado di distinguere sottili comportamenti dei pesci focale e messa a punto la videocamera in questa posizione. </li><li> Registra tutti i test comportamentali con la fotocamera mantenuto nella stessa posizione con una vista completa del serbatoio specificata per minimizzare le differenze indesiderate scoring comportamentale come risultato di registrazioni differenziali. NOTA: Evitare di posizionare i serbatoi in aree soggette a traffico pesante e da porte come movimento e suono influenzerà il comportamento zebrafish. </li><li> Stabilire protocolli JWatcher unici 24 per aver eseguito ogni test comportamentale. Fare riferimento al manuale JWatcher per imparare a creare file master focali per assegnare i comportamenti a combinazioni di tasti e archivi di analisi focali per riassumere i dati raccolti. NOTA: JWatcher è un software di punteggio comportamentale che permette di scoring comportamentale affidabile e ripetibile misura 24. </li><li> Definire un sistema di etichettatura per monitorare la data, il numero di pesci, e il numero di test per tutte le analisi del comportamento (ad esempio,&#39;F5-B-123.115&#39; che implica Pesce 5, saggio di audacia, dicembre 31, 2015) e l&#39;etichetta all&#39;esterno del serbatoio con del nastro in vista e nel fuoco della telecamera. Tenere e registrare queste informazioni in un quaderno di laboratorio per una rapida consultazione e controllo di qualità futuro. </li><li> Impostare un serbatoio di acclimatazione che verrà utilizzato tra tutti i dosaggi e subito dopo gli individui sono rimossi dal rack custodia. NOTA: I serbatoi di acclimatazione e serbatoi terminali sono piccoli acquari (40 cm x 20 cm x 25 cm) con ghiaia e un filtro che assomigliano da vicino il rack custodia. </li><li> Dopo che i test sono tutti completati, trasferire l&#39;individuo in un serbatoio terminale separato che servirà come il serbatoio di destinazione finale per tutti gli individui focali utilizzate. Utilizzare un serbatoio che è grande abbastanza per ospitare un gruppo di individui per il resto delle loro vite (ad esempio, 25 litri). NOTA: E &#39;molto importante per mantenere le temperature e le condizioni dell&#39;acqua coerenti e simili Across tutti i serbatoi. Questo include l&#39;alloggio, acclimatazione, e tutti i serbatoi di test. </li></ol> 3. Lo svolgimento del saggio Aggressione <ol><li> Eseguire il test aggressione in una vasca rettangolare 19 L misura 30 cm x 15 cm x 10 cm. Outfit il serbatoio in pareti opache esterne circostanti tre lati del serbatoio aggressione, lasciando il fronte esposto per la visualizzazione, per ridurre stimoli esterni indesiderati. Dividere il serbatoio con una marcatura esterna in quattro quadranti rettangolari uguali e fissare uno specchio permanente (con mastice silicone) all&#39;interno del quadrante inferiore sinistro, inclinata di 22,5 ° formando un triangolo rettangolo contro all&#39;estrema sinistra del serbatoio. </li><li> Assicurarsi che la temperatura dell&#39;acqua nel serbatoio serbatoio di acclimatazione e aggressività è a 2 ° C del rack custodia. Per farlo, hanno acqua fresca età pre-riscaldato a 27,5-28,5 ° C pronti ad aggiungere al serbatoio aggressione. Si prega di notare che è importante per cambiare l&#39;acqua tra ogni test per eliminare ingiustificatistimoli olfattivi. </li><li> Trasferimento, da cupping, un pesce focale dalla rastrelliera custodia ad un serbatoio acclimatazione separata dove sarà acclimatarsi per 10 min. NOTA: E &#39;importante ridurre lo stimolo introdotte per il pesce attraverso un uso improprio. Individui di trasferimento come precedentemente descritto 27. <ol><li> In particolare, manualmente e con attenzione inserire un piccolo, bicchiere di plastica trasparente nel serbatoio di interesse. Senza interrompere il pesce tanto quanto il trasferimento, utilizzando una rete, lentamente raccogliere il pesce nella tazza. </li></ol></li><li> Assicurarsi che la videocamera è pronta a registrare confermando che il serbatoio di dosaggio aggressione (vedi punto 3.1) è a fuoco e subito prima di trasferire l&#39;individuo nel serbatoio aggressione, premere RECORD sul dispositivo. Trasferire il pesce focale tramite coppa dal serbatoio di acclimatazione al serbatoio aggressione. NOTA: E &#39;importante registrare prima che il pesce entrare nel serbatoio di aggressione per monitorare l&#39;ora esatta di entrata. </li><li> Registrare il AggrSerbatoio ESSIONE per 10 min e 30 sec e poi tazza il pesce focale dal serbatoio aggressioni nel serbatoio acclimatazione. </li><li> Durante la visione della registrazione, attendere 30 secondi dopo che il pesce è stato introdotto al serbatoio come un periodo di acclimatazione supplementare prima comportamenti di punteggio. </li><li> Utilizzando il sistema di punteggio JWatcher definito per comportamenti aggressivi, quantificare i seguenti comportamenti per 10 minuti: tempo trascorso vicino a specchio, serie di approcci specchio, il numero di freccette, il numero di tentativi di morsi (apertura della bocca in direzione dello specchio), e il numero di schermi laterali (dorsale, pettorali, anale e caudale erezione fin) 9. </li><li> Segna un singolo test aggressione almeno due volte, fino a quando il test viene segnato con alto accordo tra le iterazioni. </li></ol> 4. L&#39;esecuzione L&#39;audacia Assay <ol><li> Effettuare il test coraggio in un piccolo serbatoio trapezoidale 1.5 L, che misura 15 cm di altezza x 26,5 centimetri sopra x 22,5 cm di larghezza inferiore x 6 cm. Avvolgere carta opaca su tutti i lati of serbatoio ma lasciare il fronte esposto per la visualizzazione. Posizionare un unico pezzo sottile di nastro esterna al serbatoio per delimitare all&#39;inizio dalla parte inferiore del serbatoio. </li><li> Garantire che la temperatura dell&#39;acqua nel serbatoio coraggio è a 2 ° C del rack dell&#39;alloggiamento (vedi punto 3.2) </li><li> Trasferire il pesce focale dal rack custodia al serbatoio acclimatazione (vedi punto 3.3) e lasciare acclimatare per 10 min. </li><li> Assicurarsi che la videocamera è pronta a registrare il test audacia e, una volta pronti a trasferire il pesce focale, premere RECORD sul dispositivo. Trasferire il pesce focale dal serbatoio di acclimatazione al serbatoio audacia e record per 8 min e 30 sec. </li><li> Quando si guarda la registrazione, consentire un ulteriore periodo di acclimatazione 30 sec dopo il pesce viene introdotto nel serbatoio prima di punteggio. </li><li> Utilizzando il software JWatcher, quantificare i comportamenti audacia per 8 min. In particolare, quantificare i seguenti comportamenti: Tempo vicino alla superficie, la latenza di entrare parte superiore, il numero di Transitions nella parte superiore, e il numero di movimenti erratici (freccette) 29. </li><li> Segna un singolo test audacia almeno due volte, fino a quando il test viene segnato con alto accordo tra le iterazioni. </li></ol> 5. L&#39;esecuzione del saggio shoaling <ol><li> Effettuare il test shoaling in un serbatoio 76 L che ha tre scomparti divisi da due divisori di vetro sigillate con mastice siliconico (conseguenti tre scomparti sono costituiti da due zone di stimolo e uno scomparto focale). Esternamente, segnare due zone di preferenza designati 6.35 cm da ciascuno dei divisori in vetro delle zone di stimolo &quot;, indicativo di due lunghezze corpo 30. Applicare pareti opache esternamente attorno a tre lati del serbatoio shoaling, ma lasciare il fronte esposto per la visualizzazione. NOTA: Questa zona preferenza può essere personalizzato per verificare ipotesi specifiche per le specie di dimensioni diverse. </li><li> A seconda della natura dello studio, selezionare banchi stimolo per acclimatare per almeno 12 ore before testare e rimanere nel serbatoio shoaling tutto il corso dell&#39;esperimento. NOTA: banchi di stimolo sono raccolte di singoli pesci che vengono utilizzati per valutare come il pesce focale si comporta in presenza o in assenza di questi banchi. Diverse combinazioni di stimolo del banco possono essere selezionati per testare una serie di diverse ipotesi shoaling. Assicurarsi che i banchi di stimolo sono ruotati tra ogni zona di stimolo per evitare distorsioni lato e sono anche permesso di acclimatare per almeno 12 ore prima del test. </li><li> Trasferire il pesce focale nel serbatoio acclimatazione come descritto in precedenza (vedi punto 3.3) </li><li> Trasferimento, da cupping, il pesce focale dal serbatoio acclimatazione intermedio al compartimento centrale nel serbatoio shoaling. </li><li> Lasciare per un periodo di acclimatazione 10 minuti prima di un periodo di osservazione dal vivo di punteggio 10 min. In alternativa, registrare i saggi shoaling e segnare in seguito utilizzando JWatcher. I pesci sono determinato a essere shoaling quando sono all&#39;interno della zona di preferenza nella cameraospita il banco di destinazione. </li><li> Quantificare il tempo trascorso in ogni zona preferenza e il tempo trascorso nel volume centrale. </li><li> Come misura descrittivo, il calcolo &#39;la forza di shoaling&#39; (SOS). Assegnare un valore compreso tra -1 e +1 in cui la grandezza descrive come spesso un individuo banchi di pesci. </li><li> Calcolare il rapporto fra tempo dedicato shoaling divisa per l&#39;area delle zone shoaling e sottrarre la proporzione di tempo trascorso non shoaling e l&#39;area delle zone non shoaling. Inserire questa quantità rispetto alla somma del tempo trascorso in ciascuna zona divisa per il volume di ogni singola zona. Maggiori informazioni su questo calcolo può essere trovato in uno studio precedente 14. </li></ol> 6. Controllo di qualità dei dati <ol><li> Analizzare i dati utilizzando i dati tradizionali strumenti di analisi 31-32. </li><li> Test per l&#39;omogeneità della varianza con il test non parametrico di Levene per tutti i comportamenti. Se un comportamento è non omogenea effettuare un log-trasformazione33. </li><li> Verificare che non vi sono effetti sequenza (ad esempio, che l&#39;ordine randomizzazione non ha influenzato il comportamento degli individui) utilizzando un Kruskal-Wallis ANOVA sui dati omogenei 34. </li><li> Verificare che non vi siano pregiudizi laterali per il dosaggio shoaling creando modelli lineari generali univariati su indici sos con lato come un fattore fisso 35. NOTA: Se non ci sono poco o nessun problema con i dati, le analisi possono essere condotte a valle. Se ci sono problemi, riconciliarsi con le trasformazioni aggiuntive, razionalizzare con spiegazioni biologicamente plausibile, e / o aumentare le dimensioni del campione. </li></ol> 7. Analisi dei dati <ol><li> Calcolare a due code di Spearman correlazioni 36 per tutti i comportamenti a parte all&#39;interno dei saggi audacia e aggressione. </li><li> Calcolare i coefficienti di correlazione intraclasse (ICC) come un modello misto a due vie con coerenza per i test comportamentali che sono stati condotti più di un time per un dato individuo 36. In questo contesto, la Corte penale internazionale è una misura di quanto costantemente un pesce comportato in un determinato dosaggio misurato più di una volta. </li><li> Pre-elaborazione audacia e aggressione comportamenti di centraggio e norming tutti i comportamenti di prepararsi per l&#39;ingresso ad una analisi delle componenti principali (PCA) 25. NOTA: Pre-elaborazione delle misure per la centratura e norming è un passo fondamentale. Senza questa pre-elaborazione comportamenti passo che si verificano con maggiore frequenza e più variabile sarà eccessivamente influenzare le interpretazioni dei componenti estratti. Il processo di centraggio e norming rimuoverà questo pregiudizio. </li><li> Eseguire un PCA con una matrice di correlazione per determinare se l&#39;audacia e l&#39;aggressione sono collegati tra loro da una sindrome comportamentale. Interpretare carichi comportamentali di ogni significativa componente a&gt; 0,6. Vedere Budaev 2010 24 per una guida completa per la segnalazione PCA per studi comportamentali. Un grafico decrescente sarà informativo su cui eigenvectors dovrebbero essere tenuti per l&#39;interpretazione. </li><li> Utilizzando software statistico, come R o SPSS 31,32, estrarre i punteggi per ogni componente per ogni individuo. Le colonne rappresentano quante comportamento dell&#39;individuo proposta può essere spiegato dal componente particolare. </li><li> Calcola Spearman correlazioni rango tra i punteggi di regressione dei fattori e la forza del shoaling 36. NOTA: una sindrome comportamentale è considerato presente se audacia e aggressione comportamenti caricare sullo stesso componente o, se qualsiasi componente con notevoli carichi interpretabili si correla con la forza di shoaling. Si noti inoltre che la forza di shoaling non è incluso nel PCA per consentire una migliore interpretazione delle quantificazioni comportamentali più complessi (audacia e aggressività). La PCA si ortogonalmente crollare coraggio e aggressività caratteristiche in autovettori per massimizzare la quantità di variazione spiegata ed è adatto per queste misure complesse. Interpretazionela conseguente autovettori e regressione la nostra forza di misurazioni shoaling su ciascuno di loro dà un&#39;interpretazione molto più intuitivo di come ciascuno dei comportamenti complessi (coraggio e aggressività) si riferiscono ad una misurazione shoaling binario più ben definito (ad esempio, il pesce è shoaling o non shoaling). </li></ol>

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P., Krause, J., Couzin, I. D., Pitcher, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=When+fish+shoals+meet:+outcomes+for+evolution+and+fisheries.">When fish shoals meet: outcomes for evolution and fisheries.</a> Fish Fish. 4, 138-146 (2003).</li><li>Brown, M. B., Forsythe, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Robust+Tests+for+the+Equality+of+Variances.">Robust Tests for the Equality of Variances.</a> J Am Stat Assoc. 69 (346), (1974).</li><li>Kruskal, W. H., Wallis, W. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Use+of+Ranks+in+One-Criterion+Variance+Analysis.">Use of Ranks in One-Criterion Variance Analysis.</a> J Am Stat Assoc. 47 (260), 583-621 (1952).</li><li>Nelder, J. A., Wedderburn, R. W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Generalized+Linear+Models.">Generalized Linear Models.</a> J Roy Stat Soc A Sta. 135, 370-384 (1972).</li><li>Iman, R. L., Conover, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+distribution-free+approach+to+inducing+rank+correlation+among+input+variables.">A distribution-free approach to inducing rank correlation among input variables.</a> Commun Stat Simulat. 11 (3), 311-334 (1982).</li><li>Fleiss, J. L., Cohen, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Equivalence+of+Weighted+Kappa+and+the+Intraclass+Correlation+Coefficient+as+Measures+of+Reliability.">The Equivalence of Weighted Kappa and the Intraclass Correlation Coefficient as Measures of Reliability.</a> Educ Psychol Meas. 33 (3), 613-619 (1973).</li><li>Ruhl, N., McRobert, S. P., Currie, W. J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Shoaling+preferences+and+the+effects+of+sex+ratio+on+spawning+and+aggression+in+small+laboratory+populations+of+zebrafish+(Danio+rerio).">Shoaling preferences and the effects of sex ratio on spawning and aggression in small laboratory populations of zebrafish (Danio rerio).</a> Lab Animal. 38 (8), 264-269 (2009).</li><li>Bell, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavioural+differences+between+individuals+and+two+populations+of+stickleback+(Gasterosteus+aculeatus).">Behavioural differences between individuals and two populations of stickleback (Gasterosteus aculeatus).</a> J Evolution Biol. 18 (2), 464-473 (2005).</li><li>Wilson, A. D. M., Godin, J. -. G. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Boldness+and+behavioral+syndromes+in+the+bluegill+sunfish,+Lepomis+macrochirus.">Boldness and behavioral syndromes in the bluegill sunfish, Lepomis macrochirus.</a> Behav Ecol. 20 (2), 231-237 (2009).</li><li>Brodin, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavioral+syndrome+over+the+boundaries+of+life--carryovers+from+larvae+to+adult+damselfly.">Behavioral syndrome over the boundaries of life--carryovers from larvae to adult damselfly.</a> Behav Ecol. 20 (1), 30-37 (2008).</li><li>Noldus, L. P., Spink, A. J., Tegelenbosch, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=EthoVision:+a+versatile+video+tracking+system+for+automation+of+behavioral+experiments.">EthoVision: a versatile video tracking system for automation of behavioral experiments.</a> Behav Res Methods Instrum Comput. 33 (3), 398-414 (2001).</li><li>Cote, J., Fogarty, S., Weinersmith, K., Brodin, T., Sih, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Personality+traits+and+dispersal+tendency+in+the+invasive+mosquitofish+(Gambusia+affinis).">Personality traits and dispersal tendency in the invasive mosquitofish (Gambusia affinis).</a> Proc R Soc B. 277 (1687), 1571-1579 (2010).</li><li>Fraser, D. F., Gilliam, J. F., Daley, M. J., Le, A. N., Skalski, G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Explaining+leptokurtic+movement+distributions:+intrapopulation+variation+in+boldness+and+exploration.">Explaining leptokurtic movement distributions: intrapopulation variation in boldness and exploration.</a> Am Nat. 158 (2), 124-135 (2001).</li><li>Dingemanse, N. J., Wright, J., Kazem, A. J. N., Thomas, D. K., Hickling, R., Dawnay, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavioural+syndromes+differ+predictably+between+12+populations+of+three-spined+stickleback.">Behavioural syndromes differ predictably between 12 populations of three-spined stickleback.</a> J Anim Ecol. 76 (6), 1128-1138 (2007).</li></ol>

The authors (GW and SPM) have no competing financial interests or conflicts of interest.

Il protocollo determinerà se ci sono associazioni coerenti in coraggio, aggressività e comportamenti shoaling in zebrafish. Se vi sono associazioni consistenti in una data popolazione tra uno di questi comportamenti, quindi una sindrome comportamentale è presente. Studiando sindrome comportamentale naturale di una popolazione, i ricercatori possono avere una comprensione più completa della sua dinamica comportamentale, struttura della popolazione, e la storia evolutiva possibilmente 3. Inoltre, manipoland...

Vi è un crescente corpo di letteratura indagare le associazioni tra comportamenti distinti all&#39;interno dei singoli animali da una data popolazione. Queste associazioni sono denominate sindromi comportamentali, e le misure includono tipicamente coraggio, aggressività, comportamento esplorativo, e la socialità 1-5. sindromi comportamentali sono preziosi per ragioni sia diretti che indiretti. Direttamente, la conoscenza delle sindromi comportamentali in grado di fornire una visione più completa della teoria evoluzionistica, la struttura della popolazione, e la dinamica della popolazione 3. Indirettamente, la conoscenza per quanto riguarda le associazioni di comportamento può informare i campi che quantificano il comportamento, come la farmacologia 6, tossicologia 7, genetica comportamentale 8,9, ed endocrinologia 10. A causa di questi benefici diretti e indiretti, una maggiore conoscenza delle sindromi comportamentali è particolarmente importante in organismi modello di uso comune come il pesce zebra. Gli studi che utilizzano zebrafish si trovano ina varietà di discipline, tra cui l&#39;analisi delle sindromi comportamentali 11-13. Per progredire le conoscenze nel campo della ricerca sindrome comportamentale, e perché altre discipline usano anche misure comportamentali per la verifica di ipotesi, sono necessarie descrizioni affidabili e succinte di comportamento per le analisi e interpretazioni validi e protocolli standardizzati faciliterà il confronto inter-studio all&#39;interno delle specie. Il nostro protocollo è stato sviluppato per misurare una sindrome comportamentale audacia-aggressione-shoaling in una popolazione di zebrafish laboratorio-allevati 14. Tuttavia, in base al protocollo (monitoraggio singoli pesci, garantire una corretta randomizzazione, e le analisi del caso) può essere facilmente modificato per una serie di misure comportamentali alternativi. Inoltre, saggi di audacia, aggressione, o shoaling possono essere eseguiti singolarmente per la verifica delle ipotesi distinte. Pertanto, mentre è il nostro obiettivo di descrivere come condurre uno studio sindrome comportamentale e il protocollo per il successo l individualela misurazione del comportamento evel, ogni aspetto di questa procedura può stare da solo. La letteratura sulle sindromi comportamentali estende su diversi gruppi tassonomici, da artropodi all&#39;uomo 4 e, per misurare una sindrome comportamentale, almeno due contesti comportamentali devono essere quantificati. Purtroppo, vi è spesso scarsa coerenza nei saggi che vengono utilizzati per quantificare la misura del comportamento di tutti gli assi di comportamento. Ad esempio, nel pesce, l&#39;audacia può essere misurata mediante saggi T-labirinto, test in campo aperto, o l&#39;introduzione di un romanzo o di stimolo stranieri 15. Studi aggressione nei pesci potrebbero comportare interazioni diade, saggi video di stimolo, o saggi modello in creta 12,16,17. Analogamente, l&#39;analisi del comportamento shoaling, che in genere comporta la misurazione di preferenza shoalmate, può essere eseguita in diversi tipi di serbatoi, con metodi differenti per determinare il tempo sezione 21-23. In questo protocollo un sottogruppo specifico del overall comportamento saggio repertorio è presentato. In particolare, questo protocollo presenta una metodologia per monitorare gli individui attraverso l&#39;audacia, l&#39;aggressività, e saggi shoaling in modo da facilitare il confronto all&#39;interno di individui per determinare se i confronti sono coerenti in tutti gli individui all&#39;interno di una popolazione. Abbiamo effettuato questo protocollo con zebrafish e amatitlania nigrofasciata (Amatitlania nigrofasciata) in studi precedenti 14,18, e funzionerà con tutti i pesci d&#39;acqua dolce di dimensioni simili. saggi Boldness sono condotti in un serbatoio trapezoidale 1,5 L che ha una linea orizzontale che delimita aree uguali dimensioni in porzioni superiore e inferiore del serbatoio. comportamenti quantificati includono il numero di transizioni dal pesce di prova tra la parte superiore e inferiore del serbatoio, il tempo trascorso in ciascuna porzione, il numero di freccette, e la latenza di entrare nella porzione superiore. Il dosaggio aggressione avviene in una vasca rettangolare 19L che comprendeuno specchio 3 pollici x 5 pollici inclinato di circa 22 ° situato nell&#39;angolo in basso a sinistra della vasca 19. Comportamenti quantificati comprendono la quantità totale di tempo trascorso dai pesci bersaglio interagire con lo specchio 20, insieme a specifici indicatori aggressivi - il numero di punture, schermi laterali, freccette tra i pesci di prova e il suo riflesso. Per questi indicatori specifici, punture sono definiti come affondi rapidi verso lo specchio con una bocca aperta, schermi laterali sono definiti come la svasatura di alette laterali, pettorali, anale e dorsale nella direzione dello specchio, e freccette eventuali movimenti erratici che sono non diretto verso lo specchio. Infine, il saggio shoaling quantifica il comportamento di un pesce di prova nel centro della camera di un serbatoio tri-incamerata. Le camere laterali della vasca sono vuote, o contengono una &quot;target banco&quot; di pesce, e il momento in cui il pesce di prova passa in prossimità di ogni camera laterale viene misurata 21-23. Un unico punteggio composito, denominato Strength di shoaling (SOS), viene calcolato per ogni pesce singolo test, specifico agli stimoli, e può essere usato in analisi valle 14. Tutti i comportamenti sono segnati da un unico spettatore, o più spettatori del software gratuito quantificazione del comportamento noto come JWatcher 24. Verifica la presenza di una sindrome comportamentale è in primo luogo uno sforzo statistico, e si consiglia di seguire le linee guida così come presentato dal Budeav 2010 25. In particolare, si consiglia di eseguire una analisi delle componenti principali (PCA) in data centrati e normati in cui il gli ingressi sono i vettori di comportamenti di un individuo in analisi con più misure comportamentali (ad esempio, l&#39;audacia e l&#39;aggressione). Il PCA, eseguita su una matrice di correlazione, riduce la dimensionalità delle misure comportamentali, ed estrae quindi la conoscenza più importante che spiega la maggioranza della variazione. I componenti estratti possono quindi essere interpretate based in alti carichi di fattore per il comportamento individuale di interesse e di regressione colonne possono essere estratte per ogni individuo sulla base dei componenti esplicativi. Questi punteggi di regressione possono poi essere confrontati alla misurazione SoS e altre varie misurazioni non-comportamentali come la dimensione del pesce o il sesso. Questo flusso di lavoro è stato implementato in uno studio delle sindromi comportamentali zebrafish in cui è stato scoperto una sindrome comportamentale specifica il sesso che esiste tra audacia e shoaling 14. In questa situazione, più audaci maschi zebrafish sono più propensi ad associare con, specie più aggressiva grandi (D. albolineatus), ma questa associazione si perde nelle femmine. Questo flusso di lavoro è stata implementata anche in uno studio di giovane detenuto parente ciclidi (Amatitlania nigrofasciata) 18, in cui una sindrome comportamentale non è stato scoperto, potenzialmente indicando la plasticità comportamentale della specie. Pertanto, il seguente protocollo è presentato wesimo un obiettivo di delineare la natura dei tre saggi specifici (coraggio, aggressività, e shoaling) nel quadro di studiare una sindrome comportamentale livello individuale.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="783">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:352px;">Zebrafish Rack System</td>
			<td style="width:224px;">Aquaneering Inc</td>
			<td style="width:119px;">Cat. # ZS550</td>
			<td style="width:88px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Pet Valu Tropical Fish Food, 224.0g</td>
			<td>Pet Valu</td>
			<td>Cat. # 31700</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Premium Grade Brine Shrimp Eggs, 16 oz</td>
			<td>Brine Shrimp Direct</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">1.5 L Trapezoidal Tank</td>
			<td>Pentair Aquatic Ecosystems</td>
			<td>Cat. # itsts-a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">19L rectangular tank</td>
			<td>That Fish Place</td>
			<td align="right">211932</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">76L rectangular tank</td>
			<td>That Fish Place</td>
			<td align="right">212180</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Hitachi KP-D20A CCD Camera</td>
			<td>Prescott&#39;s, Inc.</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Nikon AF Nikkor 35-105mm f/305~4.5s MACRO lens</td>
			<td>Nikon Corporation</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">ArtMinds Square Mirror, Value Pack 3&#34;x3&#34;</td>
			<td>Michaels</td>
			<td>Cat. # 10334162</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Jwatcher</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">SPSS Statistics Base</td>
			<td>IBM</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">R</td>
			<td>The R Foundation</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

boldness, aggression, and shoaling assays for zebrafish behavioral syndromes

Una sindrome comportamentale esiste quando specifici comportamenti interagiscono in diversi contesti. Zebrafish sono stati soggetti di prova in studi recenti ed è importante standardizzare protocolli per garantire analisi adeguate e interpretazioni. Nei nostri studi precedenti, abbiamo misurato coraggio monitorando una serie di comportamenti (tempo in prossimità della superficie, la latenza nelle transizioni, numero di transizioni, e freccette) in una vasca trapezoidale 1.5 L. Allo stesso modo, abbiamo quantificato l&#39;aggressione da punture di osservazione, display laterali, freccette, e il tempo vicino a uno specchio inclinato in una forma rettangolare serbatoio 19 l. Dividendo un serbatoio di 76 L in tre parti, abbiamo anche esaminato le preferenze shoaling. Il saggio shoaling è un test altamente personalizzabile e può essere adattata per specifiche ipotesi. Tuttavia, protocolli per questo test anche devono essere standardizzati, però sufficientemente flessibile per la personalizzazione. In studi precedenti, camere di testa erano o vuoto, conteneva 5 o 10 zebrafish, o 5 danios Pearl (D. albolineatus). Nel following manoscritto, vi presentiamo un protocollo dettagliato e dati rappresentativi che accompagnano applicazioni di successo del protocollo, che permetterà per la replica degli esperimenti sindrome comportamentale.

A seconda della natura dello studio e protocollo specifico impiegato, diversi risultati distinte sono possibili in un esperimento sindromi comportamentale. Le tabelle e le figure, nei casi indicati di seguito, sono adattati dal nostro precedente studio pubblicato sulla rivista Behavioural Processes 14 e la rivista Zebrafish 17. Quando la proposta (come descritto sopra) è condotta nella sua interezza, due serie di risultati, &#39;entro correlazioni dosaggio&#39; e &...

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Boldness, Aggression, and Shoaling Assays for Zebrafish Behavioral Syndromes

This manuscript describes the setup, implementation, and analysis of boldness, aggression, and shoaling in zebrafish and testing for the presence of a behavioral syndrome. A standardized approach for behavioral quantification will allow for easier comparison across studies. Modifications to this protocol are possible as each assay can be run individually.

L&#39;audacia, l&#39;aggressività e saggi shoaling per Zebrafish comportamentali Sindromi

A behavioral syndrome exists when specific behaviors interact under different contexts. Zebrafish have been test subjects in recent studies and it is ...

boldness-aggression-shoaling-assays-for-zebrafish-behavioral

Research

JoVE Journal

Medicine

10.2K Views.  Saint Joseph’s University. This manuscript describes the setup, implementation, and analysis of boldness, aggression, and shoaling in zebrafish and testing for the presence of a behavioral syndrome. A standardized approach for behavioral quantification will allow for easier comparison across studies. Modifications to this protocol are possible as each assay can be run individually.

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Intra-Operative Behavioral Tasks in Awake Humans Undergoing Deep Brain Stimulation Surgery

Deep brain stimulation (DBS) is a surgical procedure that directs chronic, high frequency electrical stimulation to specific targets in the brain through implanted electrodes. Deep brain stimulation was first implemented as a therapeutic modality by Benabid et al. in the late 1980s, when he used this technique to stimulate the ventral intermediate nucleus of the thalamus for the treatment of tremor 1. Currently, the procedure is used to treat patients who fail to respond adequately to medical management for diseases such as Parkinson's, dystonia, and essential tremor. The efficacy of this procedure for the treatment of Parkinson's disease has been demonstrated in well-powered, randomized controlled trials 2. Presently, the U.S. Food and Drug Administration has approved DBS as a treatment for patients with medically refractory essential tremor, Parkinson's disease, and dystonia. Additionally, DBS is currently being evaluated for the treatment of other psychiatric and neurological disorders, such as obsessive compulsive disorder, major depressive disorder, and epilepsy. 
DBS has not only been shown to help people by improving their quality of life, it also provides researchers with the unique opportunity to study and understand the human brain. Microelectrode recordings are routinely performed during DBS surgery in order to enhance the precision of anatomical targeting. Firing patterns of individual neurons can therefore be recorded while the subject performs a behavioral task. Early studies using these data focused on descriptive aspects, including firing and burst rates, and frequency modulation 3. More recent studies have focused on cognitive aspects of behavior in relation to neuronal activity 4,5. This article will provide a description of the intra-operative methods used to perform behavioral tasks and record neuronal data with awake patients during DBS cases. Our exposition of the process of acquiring electrophysiological data will illuminate the current scope and limitations of intra-operative human experiments.

Deep brain stimulation surgery offers a unique opportunity to examine information encoding in the awake human brain. This article will describe intra-operative methods used to perform cognitive and behavioral tasks while simultaneously acquiring physiological data such as EMG, single-unit neuronal activity and/or local field potentials.

Compiti del comportamento Intra-Operative negli esseri umani sottoposti a profonda Awake Surgery Brain Stimulation

Deep brain stimulation (DBS) is a surgical procedure that directs chronic, high frequency electrical stimulation to specific targets in the brain through ...

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Using Visual and Narrative Methods to Achieve Fair Process in Clinical Care

The Institute of Medicine has targeted patient-centeredness as an important area of quality improvement. A major dimension of patient-centeredness is respect for patient's values, preferences, and expressed needs. Yet specific approaches to gaining this understanding and translating it to quality care in the clinical setting are lacking. From a patient perspective quality is not a simple concept but is best understood in terms of five dimensions: technical outcomes; decision-making efficiency; amenities and convenience; information and emotional support; and overall patient satisfaction. Failure to consider quality from this five-pronged perspective results in a focus on medical outcomes, without considering the processes central to quality from the patient's perspective and vital to achieving good outcomes. In this paper, we argue for applying the concept of fair process in clinical settings. Fair process involves using a collaborative approach to exploring diagnostic issues and treatments with patients, explaining the rationale for decisions, setting expectations about roles and responsibilities, and implementing a core plan and ongoing evaluation. Fair process opens the door to bringing patient expertise into the clinical setting and the work of developing health care goals and strategies. This paper provides a step by step illustration of an innovative visual approach, called photovoice or photo-elicitation, to achieve fair process in clinical work with acquired brain injury survivors and others living with chronic health conditions. Applying this visual tool and methodology in the clinical setting will enhance patient-provider communication; engage patients as partners in identifying challenges, strengths, goals, and strategies; and support evaluation of progress over time. Asking patients to bring visuals of their lives into the clinical interaction can help to illuminate gaps in clinical knowledge, forge better therapeutic relationships with patients living with chronic conditions such as brain injury, and identify patient-centered goals and possibilities for healing. The process illustrated here can be used by clinicians, (primary care physicians, rehabilitation therapists, neurologists, neuropsychologists, psychologists, and others) working with people living with chronic conditions such as acquired brain injury, mental illness, physical disabilities, HIV/AIDS, substance abuse, or post-traumatic stress, and by leaders of support groups for the types of patients described above and their family members or caregivers.

This paper illustrates an innovative visual approach (photovoice or photo-elicitation) to achieve fair process in clinical care for patients living with chronic health conditions, illuminate gaps in clinical knowledge, forge better therapeutic relationships, and identify patient-centered goals and possibilities for healing.

Utilizzo dei metodi visivi e narrativi a Raggiungere processo equo in Clinical Care

The Institute of Medicine has targeted patient-centeredness as an important area of quality improvement. A major dimension of patient-centeredness is ...

Biomarkers in an Animal Model for Revealing Neural, Hematologic, and Behavioral Correlates of PTSD

Identification of biomarkers representing the evolution of the pathophysiology of Post Traumatic Stress Disorder (PTSD) is vitally important, not only for objective diagnosis but also for the evaluation of therapeutic efficacy and resilience to trauma. Ongoing research is directed at identifying molecular biomarkers for PTSD, including traumatic stress induced proteins, transcriptomes, genomic variances and genetic modulators, using biologic samples from subjects' blood, saliva, urine, and postmortem brain tissues. However, the correlation of these biomarker molecules in peripheral or postmortem samples to altered brain functions associated with psychiatric symptoms in PTSD remains unresolved. Here, we present an animal model of PTSD in which both peripheral blood and central brain biomarkers, as well as behavioral phenotype, can be collected and measured, thus providing the needed correlation of the central biomarkers of PTSD, which are mechanistic and pathognomonic but cannot be collected from people, with the peripheral biomarkers and behavioral phenotypes, which can.
Our animal model of PTSD employs restraint and tail shocks repeated for three continuous days - the inescapable tail-shock model (ITS) in rats. This ITS model mimics the pathophysiology of PTSD 17, 7, 4, 10. We and others have verified that the ITS model induces behavioral and neurobiological alterations similar to those found in PTSD subjects 17, 7, 10, 9. Specifically, these stressed rats exhibit (1) a delayed and exaggerated startle response appearing several days after stressor cessation, which given the compressed time scale of the rat's life compared to a humans, corresponds to the one to three months delay of symptoms in PTSD patients (DSM-IV-TR PTSD Criterian D/E 13), (2) enhanced plasma corticosterone (CORT) for several days, indicating compromise of the hypothalamopituitary axis (HPA), and (3) retarded body weight gain after stressor cessation, indicating dysfunction of metabolic regulation.
The experimental paradigms employed for this model are: (1) a learned helplessness paradigm in the rat assayed by measurement of acoustic startle response (ASR) and a charting of body mass; (2) microdissection of the rat brain into regions and nuclei; (3) enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) for blood levels of CORT; (4) a gene expression microarray plus related bioinformatics tools 18. This microarray, dubbed rMNChip, focuses on mitochondrial and mitochondria-related nuclear genes in the rat so as to specifically address the neuronal bioenergetics hypothesized to be involved in PTSD.

We describe a rat model of post traumatic stress disorder (PTSD) that reveals the persistent alterations in neuroendocrine function and the delayed long-term, exaggerated fear response, characteristic of PTSD patients. The animal model and methods described here are useful for correlating biomarkers in brain nuclei, which are mechanistic but cannot be measured in patients, with biomarkers in peripheral white blood cells, which can.

Biomarcatori in un modello animale per Rivelare correlati neurali, ematologiche, e comportamentali di PTSD

Identification of biomarkers representing the evolution of the pathophysiology of Post Traumatic Stress Disorder (PTSD) is vitally important, not only for ...

Eye Tracking Young Children with Autism

The rise of accessible commercial eye-tracking systems has fueled a rapid increase in their use in psychological and psychiatric research. By providing a direct, detailed and objective measure of gaze behavior, eye-tracking has become a valuable tool for examining abnormal perceptual strategies in clinical populations and has been used to identify disorder-specific characteristics1, promote early identification2, and inform treatment3. In particular, investigators of autism spectrum disorders (ASD) have benefited from integrating eye-tracking into their research paradigms4-7. Eye-tracking has largely been used in these studies to reveal mechanisms underlying impaired task performance8 and abnormal brain functioning9, particularly during the processing of social information1,10-11. While older children and adults with ASD comprise the preponderance of research in this area, eye-tracking may be especially useful for studying young children with the disorder as it offers a non-invasive tool for assessing and quantifying early-emerging developmental abnormalities2,12-13. Implementing eye-tracking with young children with ASD, however, is associated with a number of unique challenges, including issues with compliant behavior resulting from specific task demands and disorder-related psychosocial considerations. In this protocol, we detail methodological considerations for optimizing research design, data acquisition and psychometric analysis while eye-tracking young children with ASD. The provided recommendations are also designed to be more broadly applicable for eye-tracking children with other developmental disabilities. By offering guidelines for best practices in these areas based upon lessons derived from our own work, we hope to help other investigators make sound research design and analysis choices while avoiding common pitfalls that can compromise data acquisition while eye-tracking young children with ASD or other developmental difficulties.

Eye tracking has long been used to study gaze patterns in typically-developing individuals, but recent technological advancements have made its use with clinical populations, including autism, more feasible. While eye-tracking young children with autism can offer insight into early symptom manifestations, it involves methodological challenges. Suggestions for best practices are provided.

Eye tracking bambini piccoli con autismo

The rise of accessible commercial eye-tracking systems has fueled a rapid increase in their use in psychological and psychiatric research. By providing a ...

Processing of Primary Brain Tumor Tissue for Stem Cell Assays and Flow Sorting

Brain tumors are typically comprised of morphologically diverse cells that express a variety of neural lineage markers. Only a relatively small fraction of cells in the tumor with stem cell properties, termed brain tumor initiating cells (BTICs), possess an ability to differentiate along multiple lineages, self-renew, and initiate tumors in vivo. We applied culture conditions originally used for normal neural stem cells (NSCs) to a variety of human brain tumors and found that this culture method specifically selects for stem-like populations. Serum-free medium (NSC) allows for the maintenance of an undifferentiated stem cell state, and the addition of bFGF and EGF allows for the proliferation of multi-potent, self-renewing, and expandable tumorspheres.
To further characterize each tumor's BTIC population, we evaluate cell surface markers by flow cytometry. We may also sort populations of interest for more specific characterization. Self-renewal assays are performed on single BTICs sorted into 96 well plates; the formation of tumorspheres following incubation at 37 &deg;C indicates the presence of a stem or progenitor cell. Multiple cell numbers of a particular population can also be sorted in different wells for limiting dilution analysis, to analyze self-renewal capacity. We can also study differential gene expression within a particular cell population by using single cell RT-PCR.
The following protocols describe our procedures for the dissociation and culturing of primary human samples to enrich for BTIC populations, as well as the dissociation of tumorspheres. Also included are protocols for staining for flow cytometry analysis or sorting, self-renewal assays, and single cell RT-PCR.

The identification of brain tumor initiating cells (BTICs), the rare cells within a heterogeneous tumor possessing stem cell properties, provides new insights into human brain tumor pathogenesis. We have refined specific culture conditions to enrich for BTICs, and we routinely use flow cytometry to further enrich these populations. Self-renewal assays and transcript analysis by single cell RT-PCR can subsequently be performed on these isolated cells.

Lavorazione dei tessuti primaria tumore al cervello per saggi su cellule staminali e flusso di Ordinamento

Brain tumors are typically comprised of morphologically diverse cells that express a variety of neural lineage markers. Only a relatively small fraction ...

Screening for Melanoma Modifiers using a Zebrafish Autochthonous Tumor Model

Genomic studies of human cancers have yielded a wealth of information about genes that are altered in tumors1,2,3. A challenge arising from these studies is that many genes are altered, and it can be difficult to distinguish genetic alterations that drove tumorigenesis from that those arose incidentally during transformation. To draw this distinction it is beneficial to have an assay that can quantitatively measure the effect of an altered gene on tumor initiation and other processes that enable tumors to persist and disseminate. Here we present a rapid means to screen large numbers of candidate melanoma modifiers in zebrafish using an autochthonous tumor model4 that encompasses steps required for melanoma initiation and maintenance. A key reagent in this assay is the miniCoopR vector, which couples a wild-type copy of the mitfa melanocyte specification factor to a Gateway recombination cassette into which candidate melanoma genes can be recombined5. The miniCoopR vector has a mitfa rescuing minigene which contains the promoter, open reading frame and 3'-untranslated region of the wild-type mitfa gene. It allows us to make constructs using full-length open reading frames of candidate melanoma modifiers. These individual clones can then be injected into single cell Tg(mitfa:BRAFV600E);p53(lf);mitfa(lf)zebrafish embryos. The miniCoopR vector gets integrated by Tol2-mediated transgenesis6 and rescues melanocytes. Because they are physically coupled to the mitfa rescuing minigene, candidate genes are expressed in rescued melanocytes, some of which will transform and develop into tumors. The effect of a candidate gene on melanoma initiation and melanoma cell properties can be measured using melanoma-free survival curves, invasion assays, antibody staining and transplantation assays.

A rapid way to screen for melanoma modifiers using a zebrafish autochthonous tumor model is presented. It takes advantage of the miniCoopR vector which allows for expression of candidate melanoma genes in melanocytes. A method to obtain melanoma-free survival curves, an invasion assay, a protocol for antibody staining of scale melanocytes and a melanoma transplantation assay are described.

Screening per Modificatori melanoma utilizzando un modello Zebrafish Tumore autoctone

Genomic studies of  human cancers have yielded a wealth of information about genes that are altered  in tumors1,2,3. A challenge arising from these ...

Adaptation of Semiautomated Circulating Tumor Cell (CTC) Assays for Clinical and Preclinical Research Applications

The majority of cancer-related deaths occur subsequent to the development of metastatic disease. This highly lethal disease stage is associated with the presence of circulating tumor cells (CTCs). These rare cells have been demonstrated to be of clinical significance in metastatic breast, prostate, and colorectal cancers. The current gold standard in clinical CTC detection and enumeration is the FDA-cleared CellSearch system (CSS). This manuscript outlines the standard protocol utilized by this platform as well as two&#160;additional adapted protocols that describe the detailed process of user-defined marker optimization for protein characterization of patient CTCs and a comparable protocol for CTC capture in very low volumes of blood, using standard CSS reagents, for studying in vivo preclinical mouse models of metastasis. In addition, differences in CTC quality between healthy donor blood spiked with cells from tissue culture versus patient blood samples are highlighted. Finally, several commonly discrepant items that can lead to CTC misclassification errors are outlined. Taken together, these protocols will provide a useful resource for users of this platform interested in preclinical and clinical research pertaining to metastasis and CTCs.

Adaptation of Semiautomated Circulating Tumor Cell CTC Assays for Clinical and Preclinical Research Applications

Circulating tumor cells (CTCs) are prognostic in several metastatic cancers. This manuscript describes the gold standard CellSearch system (CSS) CTC enumeration platform and highlights common misclassification errors. In addition, two&#160;adapted protocols are described for user-defined marker characterization of CTCs and CTC enumeration in preclinical mouse models of metastasis using this technology.

Adattamento del semiautomatico circolanti (CTC) Saggi Tumor Cell per applicazioni cliniche e di ricerca preclinica

The majority of cancer-related deaths occur subsequent to the development of metastatic disease. This highly lethal disease stage is associated with the ...

A Novel in vivo Gene Transfer Technique and in vitro Cell Based Assays for the Study of Bone Loss in Musculoskeletal Disorders

Differentiation and activation of osteoclasts play a key role in the development of musculoskeletal diseases as these cells are primarily involved in bone resorption. Osteoclasts can be generated in vitro from monocyte/macrophage precursor cells in the presence of certain cytokines, which promote survival and differentiation. Here, both in vivo and in vitro techniques are demonstrated, which allow scientists to study different cytokine contributions towards osteoclast differentiation, signaling, and activation. The minicircle DNA delivery gene transfer system provides an alternative method to establish an osteoporosis-related model is particularly useful to study the efficacy of various pharmacological inhibitors in vivo. Similarly, in vitro culturing protocols for producing osteoclasts from human precursor cells in the presence of specific cytokines enables scientists to study osteoclastogenesis in human cells for translational applications. Combined, these techniques have the potential to accelerate drug discovery efforts for osteoclast-specific targeted therapeutics, which may benefit millions of osteoporosis and arthritis patients worldwide.

A Novel in vivo Gene Transfer Technique and in vitro Cell Based Assays for the Study of Bone Loss in Musculoskeletal Disorders

Differentiation of precursor cells into osteoclasts is regulated by cytokines and growth factors. Here, a novel gene transfer technique for differentiation of osteoclasts in vivo and cell culture protocols for differentiating precursor cells into osteoclasts in vitro as a method to study the effects of cytokines on osteoclastogenesis are described.

A Novel<em&gt; In vivo</em&gt; Tecnica Gene Transfer e<em&gt; In vitro</em&gt; test cellulari per lo studio della perdita ossea nei disturbi muscoloscheletrici

Differentiation and activation of osteoclasts play a key role in the development of musculoskeletal diseases as these cells are primarily involved in bone ...

A Novel Model of Mild Traumatic Brain Injury for Juvenile Rats

Despite growing evidence that childhood represents a major risk period for mild traumatic brain injury (mTBI) from sports-related concussions, motor vehicle accidents, and falls, a reliable animal model of mTBI had previously not been developed for this important aspect of development. The modified weight-drop technique employs a glancing impact to the head of a freely moving rodent transmitting acceleration, deceleration, and rotational forces upon the brain. When applied to juvenile rats, this modified weight-drop technique induced clinically relevant behavioural outcomes that were representative of post-concussion symptomology. The technique is a rapidly applied procedure with an extremely low mortality rate, rendering it ideal for high-throughput studies of therapeutics. In addition, because the procedure involves a mild injury to a closed head, it can easily be used for studies of repetitive brain injury. Owing to the simplistic nature of this technique, and the clinically relevant biomechanics of the injury pathophysiology, the modified weight-drop technique provides researchers with a reliable model of mTBI that can be used in a wide variety of behavioural, molecular, and genetic studies.

The modified weight-drop technique is an easy, cost-effective procedure used for the induction of mild traumatic brain injury in juvenile rats. This novel technique produces clinically relevant symptomology that will advance the study of mild traumatic brain injury (mTBI) and concussion.

Un modello Novel di Mild Traumatic Brain Injury per ratti giovani

Despite growing evidence that childhood represents a major risk period for mild traumatic brain injury (mTBI) from sports-related concussions, motor ...

Real-time Cytotoxicity Assays in Human Whole Blood

A live cell-based whole blood cytotoxicity assay (WCA) that allows access to temporal information of the overall cell cytotoxicity is developed with high-throughput cell positioning technology. The targeted tumor cell populations are first preprogrammed to immobilization into an array format, and labeled with green fluorescent cytosolic dyes. Following the cell array formation, antibody drugs are added in combination with human whole blood. Propidium iodide (PI) is then added to assess cell death. The cell array is analyzed with an automatic imaging system. While cytosolic dye labels the targeted tumor cell populations, PI labels the dead tumor cell populations. Thus, the percentage of target cancer cell killing can be quantified by calculating the number of surviving targeted cells to the number of dead targeted cells. With this method, researchers are able to access time-dependent and dose-dependent cell cytotoxicity information. Remarkably, no hazardous radiochemicals are used. The WCA presented here has been tested with lymphoma, leukemia, and solid tumor cell lines. Therefore, WCA allows researchers to assess drug efficacy in a highly relevant ex&#160;vivo condition.

The whole blood cytotoxicity assay (WCA) is a cytotoxicity assay developed by incorporating high-throughput cell positioning technology with fluorescence microscopy and automated image processing. Here, we describe how lymphoma cells treated with an anti-CD20 antibody can be analyzed real-time in human whole blood to provide quantitative cellular cytotoxicity analysis.

In tempo reale citotossicità saggi in Human Sangue intero

A live cell-based whole blood cytotoxicity assay (WCA) that allows access to temporal information of the overall cell cytotoxicity is developed with ...