This work was supported by the Engineering and Physical Sciences Research Council [grant number EP/M028739/1]. RSE was supported by a Santander Postgraduate Research Award 2015.

Dikkat: Biyolojik güvenlik protokolleri ve kullanılmadan önce ilgili tüm malzeme güvenlik bilgi formlarını (MSDS) danışın. Bu deneylerde kullanılan lazer sınıfı 3B lazer olduğu; Sistemin güvenli bir kullanım için yerel kurallara uyulması gereklidir. kişisel koruyucu ekipman (koruyucu gözlük) kullanımı da dahil olmak üzere lazer spektroskopisi ölçümü yaparken tüm uygun güvenlik uygulamalarını kullanın. Kuyruk tendonlar AB düzenlemelerine 1099/2009 uyarınca ve Hayvanların Refahı (kesim veya öldürme) 1995 Sığır ense ligament yerel bir mezbahaya elde edilen Yönetmelikte başka amaçlar için ötenazi 7-8 haftalık Wistar sıçanların elde edilmiştir. Örnek Elyaf hazırlanması 1. Not: hücre dışı matrisin protein liflerin farklı prosedürler kullanılarak, çeşitli dokulardan elde edilebilir. Protokoller yaygın uygulanan prosedürlere dayanan rafine edildi. <ol><li><strosıçan kuyruğu kolajen liflerinin ng&gt; Ekstraksiyon <ol><li> Vücut ağırlığı, sodyum pentobarbıton 100 mg / kg intraperitonal enjeksiyon ile bir sıçan Kurban. Sonra tek kenar jilet ile bastırarak, vücut ile temas noktasında doğrudan kuyruk sever. ince film kuyruk sarın ve gerekene kadar -20 ° C&#39;de dondurulur saklayın. </li><li> Dondurucu kuyruk toplamak yine oda sıcaklığında fosfat tamponlu serum fizyolojik (PBS) çözeltisi (pH 7.4) ile doldurulmuş bir petri tabağına çözülme bırakın, sonra dondurulmuş ve iken yakın ucundan 20 mm uzunluğunda bir bölümü kesilmiş. </li><li> kuyruk çözülmüş sonra, cildi bölmek için bir neşter kullanılarak segmentin uzunluğu boyunca bir kesi yapmak. Sonra kuyruk omur dört kılıflı tendon demetleri ortaya çıkarmak için geri soyma. </li><li> Ince forseps kullanarak ve herhangi bir ön gerginlik uygulamak için dikkatli olmak, pr yavaşça kılıf dışına her lif çekmek ve v sodyum asid w /% 0.01 ile distile su içeren bir şişede (NaN 3) için koyunolay bakteriyel büyüme ve mağaza buzdolabında. Tek bir kuyruk etrafında otuz tendon lifleri verir. </li><li> I kolajen saf lifli türü elde etmek için, proteoglikanlar ve diğer tüm nonkollagenöz malzemeyi çıkarmak için tendon liflerine üç bölüm enzimatik sindirim sürecini 10 uygulanır. <ol><li> Önce, 200 rpm&#39;de bir çalkalama inkübatöründe 37 ° C&#39;de 24 saat süre ile, pH 8.0, 0.05 M Tris-tamponu, 0.06 M sodyum asetat (CH3 COONa) 0,125 U / ml kondroitinaz ABC lifleri bırakın. </li><li> Daha sonra, pH 6.0&#39;da 0.05 M Tris tamponu, 0.15 M sodyum klorür (NaCI) &#39;de 1 U / ml streptomis hyaluronidaz lifleri sokmak ve 37 ° C&#39;de 24 saat boyunca çalkalama inkübatöründe dönün. </li><li> Son olarak, 37 ° C&#39;de çalkalama inkübatöründe 16 saat pH 7.2&#39;de 0.05 M sodyum fosfat (NaHPO 4) ve 0.15 M NaCl tripsin, 1 mg / ml lifleri bırakın. </li></ol></li><li> damıtılmış su ihtiva eden viyaller içinde soğutulmuş saflaştırılmış elyafı depolayacaktır wiÖlçüm için gerekene kadar inci% 0.01 NaN3 bakteriyel büyümeyi önlemek için. </li></ol></li><li> Sığır ense ligament gelen elastin liflerin Ekstraksiyon <ol><li> , Mezbahaya sığır ense ligament elde sarılmak film sarın ve kullanılana kadar -20 ° C&#39;de dondurulmuş saklayın. </li><li> Saf elastin üretmek için, dondurucu bağ toplamak aşağıdaki gibi, Lansing edilen prosedüre göre bir kaynar su banyosu içinde 11 bağ, oda sıcaklığında çözülme bir neşter kullanarak bozabilir ve sindirimi için izin verir. <ol><li> damıtılmış su içinde bir sodyum hidroksit (NaOH) içindeki bir 0.1 M çözelti hazırlayın ve dokuları kapsayan konik bir şişe içinde yağdan arındırılmış bağ ekleyin. </li><li> 45 dakika boyunca 95 ° C&#39;de bir su banyosu içinde balon kaynatın. </li><li> sindirim şişesi ligament çıkarın ve pH 7.0 (pH metre kullanılarak izlenmiştir) elde edilinceye kadar damıtılmış su içinde sürekli olarak çözünmeyen doku bloğu yıkayın. </li><li> Nihai doku kaldırmakçözelti yıkama ve kapalı bir kap içinde (bakteri büyümesini önlemek için,% 0.01 NaN3 ile karışık) ve buzdolabında saklayın damıtılmış su içinde daldırın. </li></ol></li><li> Buzdolabından doku toplamak ve daha büyük blok (uzun 20 50 mm, yaklaşık 2 mm kalınlığında) uzakta hafifçe daha küçük elastin kesimleri çekmek için çok fazla kuvvet ve ön gerginlik, kullanım cımbız uygulamak için dikkatli olmak ve koyun PBS çözeltisi (pH 7.4) içeren bir Petri kabı. </li><li> Ince forseps kullanarak, yavaşça 1 mm kalınlığında çevresinde küçük lif demetleri alay ve bir neşter kullanılarak birkaç mm uzunlukta kesin. </li><li> (Bakteri büyümesini önlemek,% 0.01 NaN3) ile ve ölçüm için gerekli kadar bunları buzdolabında saklayın damıtılmış su ihtiva eden şişelere lifleri aktarın. </li></ol></li><li> Yansıtıcı tabaka üzerine lifleri Montaj <ol><li> Bir elmas kesici kullanılarak, yansıtıcı silikon slayt bir parça kesti. </li><li> Bir hidratlanmış compartme oluşturmak içinnt, (bir elyafın sığacağı kadar geniş) merkezinde içi boş bir kesim ile silikon slayt üzerinde uygun ve silikon alt-tabaka üzerine yerleştirmek için Parafilm bir şerit kesilir. Not: Adım 1.3.4 mühürlü, dört tarafın bir havaya açık kalır, böylece kuru elyaf ölçümler için, U-biçimli bir parafilm kesilir. </li><li> Depolama çözeltisinden tek bir lifin toplamak ve örnek yıkamak için 5 dakika boyunca oda sıcaklığında saf su dolu küçük bir Petri tabağına yerleştirin ince forseps bir çift kullanımı, buzdolabı lifleri çıkarın. Sonra, lif toplamak ve silikon tabaka üzerinde parafilm oyuk merkezine transfer. Dikkatli: Bu işlem sırasında gererek lif zarar kaçının ve bu mekanik özelliklerinde bir değişiklik neden olabileceğinden tabaka üzerinde örnek yeni bir yön kaçının. </li><li> fiber üzerinden ince bir cam lamel yerleştirin ve altındaki parafilm eritmek için cam yüzey üzerinde hafifçe ısıtılmış havyaya geçirerek odasına mühürcam. Dikkatli: çok yakın lehim ucu getiren veya aşırı substrat ısıtma vermeyerek lif zarar kaçının. </li><li> Küçük bir ağırlığı altında düz bir yüzeye mühürlü odasına yerleştirin ve numuneye zarar kaçınarak numune ve silikon substrat arasında iyi bir temas sağlamak için yaklaşık 12 saat boyunca bekletin. </li><li> vidaları kullanarak, ağırlık kaldırmak ve alt tabaka üzerinde yerinde odasının sabitleyin. </li></ol></li></ol> 2. Brillouin Deney kurma ve Fiber Spectra Edinme <ol><li> Numune kompartımanı hazırlanması <ol><li> Ve hacim konumunu saçılması (Şekil SI-1&#39;e bakınız 2 Φ = 90 °) sabit bir saçılma açısı korurken örnek düzlem döndürme etkinleştirmek için bir gonyometre ile donatılmış dikey bir tutucu üzerine bir parçası 1.3 olarak hazırlanan örnek monte edin. </li><li> le ile örnek lazer ışığı doğru bir odak ayarlaması gerçekleştirmekns. 9 Dikkatli: Lazer çıkış gücü çok yüksek olabilir ve örnek bir yanık üretebilir. örneğe zarar vermemek için çok yüksek iyi bir hassasiyet verecek şekilde yeterince yüksek ayarlanmış değil emin olun. İşte örnek üzerinde yaklaşık 76 mW gücünde kullanılır. Bu husus, bu ince ve lazer yanması ile üretilen ısıyı yardımcı olan bir alt-tabaka ile temas içinde olduğu dikkate alındığında, örnek yanma olmadan iyi bir duyarlılık elde etmek için yeterli olmuştur. </li><li> Bir Vernier ölçeğini kullanarak olay lazer ışınına 45 ° açı (Φ) de örnek yerleştirin. bir ölçüm çalışan ve (aşağıya bakınız) spektrumunda piklerin yoğunluğu maksimize ederek en uygun konumlandırma elde edin. </li></ol></li><li> Spektrometre kurma <ol><li> Edinimi ve verilerin manipülasyonu için yazılımı açın ve örnek 12 bir Brillouin spektrumunun satın kurdu. Burada açıklanan prosedür mu geçerlidirltipass tandem interferometre (Şekil SI-1A). </li><li> bağımsız kontrol ünitesi tarafından piezo uygulanan gerilimleri değişen iki Fabry-Perot (FP) interferometreleri hizalayın. Bu ön-hizalama işlemi için, her FP tarafından yansıyan ışık görüyoruz. İki hekimleri tarafından yansıtılan yoğunluğu sıfır eğilimi, doğru hizalama ulaşılır. </li><li> Tayfı kalibre: erişilebilir frekans aralığı ya da serbest spektral aralığının (FSR), iki adet birinci AP boşluğun aynalar, L, FSR = C / 2 L&#39;lik, c, ışığın hızı ile arasındaki uzaklığa bağlı olduğu, L dial-ölçü ile ölçülür. </li><li> İki FP interferometreler taramalarını senkronize etmek ve tandem multipass konfigürasyonuna optik sistemini açmak. iletilen lazer ışık yoğunluğu bir geri besleme kontrolü otomatik olarak ölçüm sırasında iki FP hizalanmasını koruyacaktır. </li></ol></li><li> Ölçüm of Brillouin Spectra Dikkatli: Brillouin spektrum numune ve bu parametrelerin çok dikkatli kontrol sıcaklık ve hidrasyon son derece bağlıdır tekrarlanabilir spektrumları elde anahtarıdır. <ol><li> numunenin bir Brillouin spektrumu kazanılmasını başlatın ve iyi bir sinyal-gürültü oranı elde edilene kadar çalıştırın. Bu numunenin saçılma tesir kesiti, konsantrasyon ve kalınlığına bağlı olarak birkaç dakika sürebilir. NOT: Orada işaret-gürültü oranı için pratik kural değil ama spektral kalite analiz belirli örneğe dayalı deneye tarafından kontrol edilir. spektral kalite ve ölçüm süresi arasında bir trade-off, bu nedenle deneysel parametreler belirli uygulamaya göre seçilmesi gerekir vardır. </li><li> kuru numune ölçümü için, birbirini izleyen spektrumları alır - her biri için, aşama 2.3.1 şu - tepe noktalarının konumu kadar olan herhangi bir değişiklik Is görülmektedir. Numune oda atmosferi ile dengede olduğu ve daha fazla kurutma spektrumu etkiler, bu başarılır. </li><li> (V saçılma düzlemine ışık polarizasyon göreceli yatay yönde dikey ve H açılımı VV veya VH) ve lif eksenine her açıda spektrumları elde ışık polarizasyonu seçiniz (Î¸ Şekil SI-1) örneği de çevirerek elle düzlem. </li><li> sonraki işlemler için dosya Brillouin spektrumları kaydedin. </li></ol></li></ol> Brillouin Spectra 3. Analizi NOT: Brillouin zirveleri Fit analizi çeşitli fonksiyonları kullanılarak yapılabilir. Bu viskoelastik medyada sönümlü akustik modları kaynaklanan zirveleri için geçerli bir model olarak bir sönümlü harmonik osilatör (DHO) işlevi 4,13 seçildi. <ol><li> Brillouin zirveleri Fit analizi <ol><li> inci ilgi zirve için spektral aralığı seçine Brillouin spektrum. </li><li> spektral arka plan sıfırdan çok daha yüksek olması durumunda uyum içinde bir temel etkinleştirin. NOT: Bazal spektrumları arasında değişebilir. Düzeltme sistematik ve tekrarlanabilir bir şekilde tatbik olduğundan emin olun. </li><li> Yakınsama elde edilir ve en iyi eğri uydurma elde iteratif kadar ilgi Brillouin zirvesine bir DHO işlevi 4,13 kullanarak uydurma detaylı en küçük kareler uygulayın. Ardından, dosyaya uygun sonuçları kaydedin. </li><li> Her Brillouin ikilisinin iki doruklarına uyum parametrelerinden ortalama değerler elde. </li><li> tepe frekansı akustik dalga hızını hesaplayın (aşağıda ifadesini kullanarak). </li><li> Θ grafikler, örneğin, lif eksenine açısı vs akustik dalga hızı aracılığıyla uygun sonuçlar çizilir Ve bu elastikiyet tensör katsayıları gibi mekanik miktarlarda ayıklamak için (9 akustik anizotropik sistemler için, örneğin) ilgili modeller uygulamak. </li></ol>
	</li>
</ol>

<ol>
	<li>Brillouin, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Diffusion+de+la+lumi&#232;re+et+des+rayonnes+X+par+un+corps+transparent+homog&#232;ne;+influence+de+l'agitation+thermique.">Diffusion de la lumi&#232;re et des rayonnes X par un corps transparent homog&#232;ne; influence de l'agitation thermique.</a> Ann. Phys. 17, 88-122 (1922).</li><li>Caponi, S., Corezzi, S., Mattarelli, M., Fioretto, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stress+effects+on+the+elastic+properties+of+amorphous+polymeric+materials.">Stress effects on the elastic properties of amorphous polymeric materials.</a> J. Chem. Phys. 141 (21), 214901 (2014).</li><li>Mattarelli, M., Montagna, M., Still, T., Schneider, D., Fytas, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Vibration+spectroscopy+of+weakly+interacting+mesoscopic+colloids.">Vibration spectroscopy of weakly interacting mesoscopic colloids.</a> Soft Matter. 8 (15), 4235-4243 (2012).</li><li>Comez, L., Masciovecchio, C., Monaco, G., Fioretto, D., Robert, E. C., Robert, L. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Solid State Physics. 63, 1-77 (2012).</li><li>Madami, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Direct+observation+of+a+propagating+spin+wave+induced+by+spin-transfer+torque.">Direct observation of a propagating spin wave induced by spin-transfer torque.</a> Nat. Nanotechnol. 6 (10), 635-638 (2011).</li><li>Harley, R., James, D., Miller, A., White, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phonons+and+the+elastic+moduli+of+collagen+and+muscle.">Phonons and the elastic moduli of collagen and muscle.</a> Nature. 267 (5608), 285-287 (1977).</li><li>Cusack, S., Miller, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determination+of+the+elastic+constants+of+collagen+by+Brillouin+light+scattering.">Determination of the elastic constants of collagen by Brillouin light scattering.</a> J. Mol. Biol. 135 (1), 39-51 (1979).</li><li>Vaughan, J. M., Randall, J. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Brillouin+scattering,+density+and+elastic+properties+of+the+lens+and+cornea+of+the+eye.">Brillouin scattering, density and elastic properties of the lens and cornea of the eye.</a> Nature. 284 (5755), 489-491 (1980).</li><li>Palombo, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biomechanics+of+fibrous+proteins+of+the+extracellular+matrix+studied+by+Brillouin+scattering.">Biomechanics of fibrous proteins of the extracellular matrix studied by Brillouin scattering.</a> J. R. Soc. Interface. 11 (101), (2014).</li><li>Sivan, S. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Age-related+accumulation+of+pentosidine+in+aggrecan+and+collagen+from+normal+and+degenerate+human+intervertebral+discs.">Age-related accumulation of pentosidine in aggrecan and collagen from normal and degenerate human intervertebral discs.</a> Biochem. J. 399 (1), 29-35 (2006).</li><li>Soskel, N. T., Wolt, T. B., Sandberg, L. B., Leon, W. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Methods in Enzymology. 144, 196-214 (1987).</li><li>Fioretto, D., Scarponi, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dynamics+of+a+glassy+polymer+studied+by+Brillouin+light+scattering.">Dynamics of a glassy polymer studied by Brillouin light scattering.</a> Mater. Sci. Eng. A. 521-522, 243-246 (2009).</li><li>Palombo, F., Madami, M., Stone, N., Fioretto, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanical+mapping+with+chemical+specificity+by+confocal+Brillouin+and+Raman+microscopy.">Mechanical mapping with chemical specificity by confocal Brillouin and Raman microscopy.</a> Analyst. 139 (4), 729-733 (2014).</li><li>Scarcelli, G., Yun, S. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multistage+VIPA+etalons+for+high-extinction+parallel+Brillouin+spectroscopy.">Multistage VIPA etalons for high-extinction parallel Brillouin spectroscopy.</a> Opt. Express. 19 (11), 10913-10922 (2011).</li><li>Scarcelli, G., Kim, P., Yun, S. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+Vivo+Measurement+of+Age-Related+Stiffening+in+the+Crystalline+Lens+by+Brillouin+Optical+Microscopy.">In Vivo Measurement of Age-Related Stiffening in the Crystalline Lens by Brillouin Optical Microscopy.</a> Biophys. J. 101 (6), 1539-1545 (2011).</li><li>Scarcelli, G., Yun, S. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vivo+Brillouin+optical+microscopy+of+the+human+eye.">In vivo Brillouin optical microscopy of the human eye.</a> Opt. Express. 20 (8), 9197-9202 (2012).</li></ol>

The authors have nothing to disclose.

Brillouin saçılım spektroskopisi bir protein lif esnekliği tansörünün bileşenleri tek tek görülmemiş detaylı olarak karakterize edilebilir bir benzersiz bir araçtır. Ayrıca, ölçümler mikroskopik ölçekte yapılabilir ve böylece karmaşıklığı, önemi, mekanik ve muhtemelen işlevsel anlamak için, ilk defa, bize izin biyolojik yapıların mikro ölçekli mekaniği içine yeni anlayışlar bize verecektir matris mimarisi ve biyokimya son yıllarda açığa edildiği. teknik GHz frekans aralığında mekanik özelliklerini ölçer. Bu etki, yapısal Biyopolimerlere için daha önce araştırılmış olmamıştı ve her iki yükseltir ve elastikiyet moleküler mekanizmaları hakkında temel soruları yanıtlamak için araçlar sağlar. Biz hayvan dokularından kolajen ve elastin lifleri ayıklamak ve Brillouin scatteri ölçmek için adımlar tarifFiber biyomekanik tam açıklamasını elde etmek için bir yansıtıcı substrat kullanılarak ng spektrumları. protokolü içinde kritik adımlar saflaştırılmış lifler edilen ve uygun deneysel koşullar lifli proteinlerin tekrarlanabilir ölçümler için yerinde olmasını sağlamak olanlardır. Ancak, ekstraksiyon işlemleri liflerin mekanik özellikleri değiştirebilir akılda tutulmalıdır. Tekniğin Değişiklikler microfocused Brillouin saçılımı ve haritalama için optik mikroskop ile bağlantı 13 yaklaşır içerir ve tamamlayıcı teknikler ile mümkün kombinasyonu (örneğin, Raman saçılması). Tekniğin Güncel uygulamalar ağırlıklı olarak eksize biyolojik materyaller üzerinde duruldu, ancak önemli gelişmeler, örneğin, çoklu VIPA etalonu 14 dayananlar, zaten uygulamaları bir dizi iblis ile başucunda benchtop bu tekniğin çevirisini mümkün yapıyoruzin vivo uygulamalarında potansiyeli dahil 15,16 strated. VIPA yaklaşımı açıklamak ne bir alternatiftir; daha hızlı bir alma zamanına sahip ancak burada analiz gibi zorunlu opak örnekleri için uygun değildir. onların kontrast yarı-elastik ışık reddetmek için yeterli olmaz çünkü Ayrıca, bir yansıtıcı yüzeye kullanımı VIPA etalonları kullanmak set-up pratik değildir. Bir spektral veri kümesi ve malzeme doğal olarak zayıf saçılma kesit alımı hızına ilişkin sınırlamalar dinamik biyolojik sistemlere ve derin dokularda veri edinimi uygulamaları sınırlayabilir, ancak teknik iyileştirmeler mevcut performansı artırabilir. BLS ekstraselüler matriks üzerinde temel biyofizik araştırma önemli bir araç olmayı vaat ve böylece yeni matris büyüme sırasında mekanik özelliklerinin evriminin anlayışlar ve patolojik onların kaybı üretmek içindejenerasyon. Ancak, ölçümler invaziv olmayan ve bu nedenle in vivo üstlenilen olabileceğini hatırlamak önemlidir. Nitekim, bu zaten kornea 16 elde edilmiştir ve bu çalışma bağ dokusu hastalıklarının geniş bir yelpazede için yeni tanı araçlarının geliştirilmesi için bir platform sağlayabilir. Ultrason elastografi ve atomik kuvvet mikroskopisi (AFM) mikromekanik ölçüm alternatif yöntemler vardır, ancak TYD tekniği, AFM aksine, eski ve daha (bir hücre içi ölçekte) daha iyi uzaysal çözünürlük sunuyor numune üzerinde hiçbir mekanik kuvvetleri dayatır ve sınırlı değildir sadece yüzey özelliklerinin analizi. makroskopik suşları Young modülü Mpa için (daha detaylı bilgi başka bir yerde rapor edilecektir) ait iken kolajen ve elastin Brillouin modülleri, GPa aralığında. Bu sonuca bağlı olarak, uyarım frekansı üzerinde güçlü bir bağımlılığı olan bir difransiyel esneklik katsayısı gösterirliflerin viskoelastik davranış. TYD biyomedikal sorunlar ve geniş bir malzeme yelpazesi uygulanabilir. Bu fizyoloji ve biyolojik dokuların patolojisi sorularını yanıtlayan yardımcı yanı sıra moleküler düzeyde malzeme ve etkileşimlerin temel olarak anlaşılması için fiziksel bir araç sağlayabilir.

Brillouin ışık saçılması (TYD) etkisi bir malzemede termal olarak aktive edilmiş akustik fononların görünür ışığın esnek olmayan saçılma oluşur 1922 yılında 1 Léon Brillouin tarafından keşfedilmiştir. Katı hal fiziği ise, akustik fononlar bir kafes içinde tüm atomların tutarlı titreşimler vardır. Bir kafes içinde atomların iki alternatif türlerinin tek boyutlu zincir IR absorpsiyon ve Raman saçılması (Şekil 1) probed BLS tarafından ortaya akustik fononların, ve optik fononların arasındaki farkı gösteren basit bir modeldir. Optik Fononlar atomların dışı faz hareketler iken akustik fononlar, (boyuna akustik fononlar) ya da yayılma yönüne (enine akustik fononlar) dik yayılma doğrultusu boyunca bir deplasman zinciri içindeki atom faz-hareketler salınımlı elektrik dipol momenti üreten (boyuna veya enine mod). BLS spectroskopi 1920&#39;lerden beri analitik bilim kullanılmıştır; Ancak, 1980&#39;lerde tek beri yüksek kontrast ölçümleri tandem multipass Fabry-Perot spektrometresi kullanımı ile mümkün. O zamandan beri, 2-4 ve manyetik malzemeler (foton-magnon etkileşimi yoluyla) (foton-fonon etkileşmesi istismar edilir) Yoğun madde analitik uygulamalar için TYD gelişmelerin giderek artan sayıda yaklaşık 5 getirilmiştir. Biyomedikal uygulamalarda 6-8 seminal eserler burada uygulanan bir ve esnekliği tansörünün tam açıklamasını ulaşmak için trombosit benzeri konfigürasyonda bir yansıtıcı substrat kullanılarak önceden 9 açıklanan dahil olmak üzere, çeşitli yaklaşımların geliştirilmesi rotayı açmıştır Bir örnek. Bu çalışmada, biz, lifli proteinler elastin bağ dokusunda hücre dışı matriks temel bileşenlerinin TYD spektroskopi uygulamak ve ben-kollajen yazın. TI kolajen ype örneğin tendon gibi dokularda, esas itibariyle katı lifler oluşturmak için kapsamlı çapraz bağlama ile yanal ve boylamsal olarak monte sert, üçlü sarmal bir moleküldür. kollajen ağları genellikle elastin ağları ile, alışılmadık, entropi ve çevresi ile hidrofobik etkileşimlerin bir kombinasyonu yoluyla uzun menzilli elastikiyetini üretir ve bu tür akciğer ve deri gibi dokuların fonksiyonları için gerekli olan bir protein bir arada yaşıyor. Her iki lifler güncel araştırma bir altıgen kristal modeli kullanılarak modellenmiştir. 9 bölüm 1, biz hayvan dokularından lifleri ayıklamak ve spektroskopik ölçümler için numune hazırlamak için protokol açıklar. part 2, Brillouin cihazı kurma ve elyaftan spektrumları elde etmek için prosedür sunulmuştur. Part 3 burada yer alan ilgili mekanik bilgileri ayıklamak için Brillouin spektrumları uygulanan veri analizi ayrıntılarını verir. Ardından, temsili sonuçlar sunulmuş ve Tartışılan vardırd.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="762">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Chondroitinase ABC</td>
			<td style="width:119px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:151px;">C2905</td>
			<td style="width:291px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Tris Buffer</td>
			<td style="width:119px;">Fluka</td>
			<td style="width:151px;">93358</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Sodium Acetate</td>
			<td style="width:119px;">Fisher Scientific</td>
			<td>S608-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">PBS</td>
			<td style="width:119px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>P4417</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Sodium Azide</td>
			<td style="width:119px;">Fisher Scientific</td>
			<td>S2002</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Streptomyces Hyaluronidase&#160;</td>
			<td style="width:119px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>H1136-1AMP</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Sodium Chloride</td>
			<td style="width:119px;">Fisher Scientific</td>
			<td>S7653</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Trypsin</td>
			<td style="width:119px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:151px;">T4665</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Sodium Phosphate</td>
			<td style="width:119px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:151px;">S9638</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Sodium Hydroxide</td>
			<td style="width:119px;">Fisher Scientific</td>
			<td>S320-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Pure Water</td>
			<td style="width:119px;">Millipore</td>
			<td>ZRQS0P3WW</td>
			<td>Produced In-House&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:204px;">Distilled Water</td>
			<td style="width:119px;">Bibby Scientific Limited</td>
			<td style="width:151px;">D4000</td>
			<td>Produced In-House from water still</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Euthatal</td>
			<td style="width:119px;">Merial&#160;</td>
			<td style="width:151px;">J01601A&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:204px;">Tandem Interferometer TFP-1</td>
			<td style="width:119px;">JRS Scientific Instruments</td>
			<td style="width:151px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Freezer</td>
			<td style="width:119px;">Lec</td>
			<td style="width:151px;">TU55144</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Refrigerator</td>
			<td style="width:119px;">Zanussi</td>
			<td style="width:151px;">ZBA15021SA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Hot Plate</td>
			<td style="width:119px;">Fisher Scientific</td>
			<td>SP88857206</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Clamps</td>
			<td style="width:119px;">VWR</td>
			<td>241-7311 &#38; 241-7201</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Clamp Stand</td>
			<td style="width:119px;">VWR</td>
			<td>&#160;241-0093</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Thermometer</td>
			<td style="width:119px;">Fisher Scientific</td>
			<td>13-201-401</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Cling Film</td>
			<td style="width:119px;">Sainsbury&#39;s</td>
			<td>7650540</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Parafilm</td>
			<td style="width:119px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>P7793-1EA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:204px;">Silicone</td>
			<td style="width:119px;">IDB Technologies</td>
			<td>N/A</td>
			<td>No catalogue number. Order upon request</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Cover Glass</td>
			<td style="width:119px;">VWR</td>
			<td>631-1571</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Conical Flask</td>
			<td style="width:119px;">VWR</td>
			<td>214-1175</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Beaker</td>
			<td style="width:119px;">VWR</td>
			<td>213-0469</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Measuring Cylinder</td>
			<td style="width:119px;">VWR</td>
			<td>612-3838</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Vial</td>
			<td style="width:119px;">VWR</td>
			<td>548-0051 &#38; 548-0863</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Petri Dish</td>
			<td style="width:119px;">VWR</td>
			<td>391-0441</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:204px;">Scalpel</td>
			<td style="width:119px;">Swann Morton Ltd</td>
			<td>&#160;0914 &#38; 0308</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Diamond Scribe</td>
			<td style="width:119px;">RS Instruments</td>
			<td>394-217</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Soldering Iron</td>
			<td style="width:119px;">RS Instruments</td>
			<td>231-5332</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Fine Forceps</td>
			<td style="width:119px;">VWR</td>
			<td style="width:151px;">232-0188</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:204px;">Double Micro-Spatula</td>
			<td style="width:119px;">VWR</td>
			<td>Various Sizes</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:204px;">pH Meter</td>
			<td style="width:119px;">Hanna Instruments</td>
			<td style="width:151px;">HI-2210-02</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:204px;">Orbital Shaker</td>
			<td style="width:119px;">IKA</td>
			<td style="width:151px;">&#160;0002819000</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

preparation of extracellular matrix protein fibers for brillouin spectroscopy

Brillouin spectroscopy is an emerging technique in the biomedical field. It probes the mechanical properties of a sample through the interaction of visible light with thermally induced acoustic waves or phonons propagating at a speed of a few km/sec. Information on the elasticity and structure of the material is obtained in a nondestructive contactless manner, hence opening the way to in vivo applications and potential diagnosis of pathology. This work describes the application of Brillouin spectroscopy to the study of biomechanics in elastin and trypsin-digested type I collagen fibers of the extracellular matrix. Fibrous proteins of the extracellular matrix are the building blocks of biological tissues and investigating their mechanical and physical behavior is key to establishing structure-function relationships in normal tissues and the changes which occur in disease. The procedures of sample preparation followed by measurement of Brillouin spectra using a reflective substrate are presented together with details of the optical system and methods of spectral data analysis.

Bu deneme için (Şekil SI-1A) &#39;da kullanılan Brillouin spektroskopisi cihazı daha önce tarif edilmiştir. Şekil 9&#39;da, tek modlu örnek 76 mW&#39;lık çıkış gücü 532 nm katı-hal lazer kullanmaktadır. A 20 cm akromatik objektif numune üzerine lazer ışığını odaklanır ve bir backscattering geometri örnekten saçılan ışık toplar. Tandem pasolu Fabry-Perot interferometre sonra düşük gürültü fotodiyot detektörü tarafından tespit edilir saçılan ışık, filtre edilmesi için kullanılır. Bu yaklaşım, son derece etalonu oynak piezo-tarama yoluyla yüksek kontrast (yaklaşık 120 dB) ve istikrar sağlar. Bir polarizör ve analizör olaydan ve dağınık ışık polarizasyonu seçmek tanıtılmaktadır. Spectra genellikle o polarize olay ışık kutuplaşma dikey (V) yön ve alternatif dikey (V) seçerek analizörü seçerek sabit tutulur ile elde edilirdağınık ışık kutuplaşma r yatay (H) yönünde. Bu yapılandırmada, boyuna ve enine akustik modlar sırası ile tespit edilir. Tipik Brillouin spektrumu nedeniyle esnek saçılma ve örneğin mekanik imzası olan eşit kaydırılmış tepe veya Brillouin çifti, bir veya daha fazla grup için yoğun bir merkezi tepe noktasına sahiptir. Bu ölçümlerde, dağınık ışık yüzeyi (PS modları) paralel seyahat toplu fononların gelen numune substrat arayüzünde gelen ışığın yansıması sonra, numune yarı dik ve seyahat toplu fononların hem kaynaklı olabilir. 9 Şekil 2 30 GHz ücretsiz spektral aralığı, 0.2 GHz çözünürlükte VV kutuplaşma ile elde edilen kuru ve sulandırılmış tripsin-sindirilmiş kollajen liflerinin BLS spektrumlarını göstermektedir ve yaklaşık 10 dk toplama zamanıYelpazenin başına. Her spektrum θ dönme belirli bir açıya karşılık gelir (Şekil SI-1C). PS modu (9.85 ± 0.03) GHz (Şekil 2A) de iken İçeride ISTV melerin RWMAIWi&#39;nin = 0 ° C&#39;de kuru kollajen lif, uzunlamasına modları (18.92 ± 0.02) GHz&#39;de toplu zirve doğurur. Aynı aralıkta İçeride ISTV melerin RWMAIWi&#39;nin değiştirilmesi üzerine düşük frekanslarda PS pik değişimleri θ 90 ° (fonon radyal yön sondalama) 0 ° (lifin eksenel yönlendirme tarama fonon) arasında gider, dökme tepe ise sadece hafif kırmızı kaymalar (fonon rotasyon boyunca bir yarı-radyal yönde sondalama). Islak kollajen lif nedeniyle boyuna fononların iki tepe noktası yaklaşık 10.5 GHz hızında toplu tepe ve 4.9 GHz (Şekil 2B) PS tepe, deney boyunca temelde değişmemiştir. Bu 18.92 verilerine göre en yüksek frekansı 80 ila% 100 azalma gösterir (ve 9.85 GHz sırasıyla) ve bu yüzden hidrasyon nedeniyle malzemenin sertliği, bir. hidratlı kollajen toplu ve PS modları elastik sabitleri su oynadığı baskın rol ile, su ve lif katkılarının bir arada olduğunu öne sürerek, saf su modları frekansında yakın yalan olduğunu unutmayın. Şekil 3, θ = VH polarizasyonda 30 ° ölçülen kuru tripsin ile sindirilmiş kollajen lif spektrumunu gösterir; VV polarizasyon bir kaçak PS ve dökme pikleri de dikkat edilmesi sağlar. Enine modları (4.1 ± 0.2) GHz (θ = 0 °) 0 ° 90 ° &#39;ye kadar θ değişiklikler olarak biraz mavi-vardiya bir tepe oluşturmaktadır. Enine ve PS zirveleri hem Fit sonuçları da gösterilmiştir. Tepe parametreler çıkarıldı ve akustik dalga hızları V L = v l / √2 olarak türetilmiştir <em&gt; v eğrisi-fit zirveleri analizi ve l ile elde edilen mod frekans dalgaboyu, 532 nm olmasıdır. Bu geometri, malzemenin kırılma indisi bilgisi akustik modu hızının elde edilmesi için gerekli değildir Not (saçılma geometrisine bağlı olarak, qS k = 2 i (Φ) sin Şekil SI-1b, c), bu nedenle Bu yaklaşım özellikle avantajlı hale. Şekil 4, açılı Î¸&#39;nın bir fonksiyonu olarak boyuna ve enine metodları ile elde edilen akustik dalga hızı (PS T tepe) bir grafiğidir . Aşağıdaki denklemler A1 ve A2 - - altıgen simetrik elastik katı 7 modeline uyum analizi kuru tripsin-sindirilmiş Çeşidi elastikiyet tensörün beş bileşenlerini ben lifleri (Tablo 1) kollajenin sağlar. 9 tarafından verilen = <img alt="denklem 1" src="/files/ftp_upload/54648/54648eq1.jpg" /> (A1) <img alt="denklem 2" src="/files/ftp_upload/54648/54648eq2.jpg" /> (A2) ρ malzemenin yoğunluğu ve C 11, C 33, 44 ° C ve C 13 olduğu altıgen simetrili sistemler karakterize beş elastik sabitlerinin dörttür. Beşinci sabit 12 C, 12 ° C 11 C, yaklaşık ilişki elde edilebilir -. 2 C 44 7 Katsayılar, daha önce saflaştırılmamış kollajen fibe elde edilenlere benzerdirrs. 9 A fark fark elastik modülü E ǁ ve e benzer değerlere yansıdığı 13 c katsayısı oluşur <img alt="Dik" src="/files/ftp_upload/54648/54648fig_flippedT.jpg" /> saflaştırılmış kolajen için (yaklaşık 7.2 ve 7.7 GPa). Şekil 5 θ karşı Islak kollajen uzunlamasına akustik dalga hızının bir grafiğidir . Bu durumda, frekansta hiçbir periyodik değişimi hatası içinde sabit bir hız vererek görülmektedir. 6 θ = 0 ° C&#39;de ölçülen kuru ve sulu elastin lifleri spektrumunu göstermektedir. Enine modları, bu örnekler için tespit edilememiştir. Kuru elastin, dökme pik 8.2 GHz 9 (13 ve kuru kollajen gelen bir zirve daha düşük% 20) PS modunda iken 16.8 GHz meydana gelir. Islak elastin lifleri toplu p sunmakeak de (12.30 ± 0.01) GHz (kuru elastin toplu zirve fazla sıklıkta% 37 daha düşük). Islak elastin PS modu çünkü bu frekanslarda elastik tepe yoğun kuyruk spektrumunda belirgin değildir. Öte yandan, yaklaşık 7.5 GHz hızında tepe toplu suya atfedilir. Şekil 7 İçeride ISTV melerin RWMAIWi&#39;nin kuru elastin lif akustik dalga hızının bağımlılığını gösterir. Bu verilerden, esneklik tensör parçaları (ve mekanik modülü), ıslak kolajen gibi (Tablo 1). 9 elde edildi, suyla elastin lifleri mekanik modülünde izotropi kanıt vardır. Bu sonuçlar Brillouin spektroskopisi sertlik, kompozisyon ve malzemenin yapısal yönleri ile ilgili bilgi verebilir nasıl gösterir. <img alt="Şekil 1" src="/files/ftp_upload/54648/54648fig1.jpg" /> Fi1. şekil akustik ve atomların tek boyutlu zincir optik Fononlar. tek boyutlu bir iki atomlu zincir akustik ve optik titreşimlerin şematik. Atomlar kitle m 1 ve m 2 ve dönüşümlü edilir. Oklar atomların yer değiştirmeleri göstermektedir. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54648/54648fig1large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> <img alt="şekil 2" src="/files/ftp_upload/54648/54648fig2.jpg" /> Tripsin ile saflaştırılmış Çeşidi Şekil 2. Brillouin spektrumlan I fare kuyruk tendon lifleri hücre oranında yerleştirilmiştir. (A) Kuru lif ve (B) spektrumu derece olarak, lif eksen İçeride ISTV melerin RWMAIWi&#39;nin farklı açıda VV ölçümlerinden fiber hidratlanmış. Saf damıtılmış su bir spektrumu da gösterilmiştir. Spektrumlar toplu tepe yoğunluğuna (yükseklik) normalize edilmiştir.<html> Etiketler B ve PS sırasıyla toplu ve paralel-yüzey modları ile ilgili zirveleri göstermek. Hata çubukları standart hata (sayılarında karekökü) gösterir. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54648/54648fig2large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> <img alt="Şekil 3," src="/files/ftp_upload/54648/54648fig3.jpg" /> Kuru tripsin-saflaştırılmış tip Şekil 3. Brillouin spektrum ben sıçan kuyruğu tendon lifleri kollajen. Spectrum İçeride ISTV melerin RWMAIWi&#39;nin bir VH ölçümden = 30 °. Etiketler T, PS ve B sırasıyla, paralel-yüzey ve toplu modları enine ilgili zirveleri göstermek. hem T ve PS modları için sönümlü harmonik osilatör (DHO) modeli kullanılarak fit analiz sonuçları da gösterilmiştir. Hata çubukları standart hatası (sayılarında karekökü) gösterir./54648fig3large.jpg &quot;Target =&quot; _ blank &quot;&gt; bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayınız. <img alt="Şekil 4," src="/files/ftp_upload/54648/54648fig4.jpg" /> Şekil lif eksenine açısı vs kuru tripsin-saflaştırılmış kollajen akustik dalga hızının 4. Konu. Brillouin zirveleri uygun analizlerden elde edilen kuru kollajen lif boyuna ve enine akustik dalga hızları. Veriler altıgen simetrik esnek katı bir model yerleştirilmiştir. Kırmızı çizgi: Denklem A1 (R2 = 0.99); mavi çizgi: Denklem A2 (R = 0.36 2). Hata çubukları Brillouin spektrumları uygun bir Levenberg-Marquardt doğrusal olmayan en küçük kareler sonra kovaryans matrisinin köşegen elemanları karekökü elde edilen standart hataları göstermektedir. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54648/54648fig4large.jpg" target="_blank">Daha büyük bir versi görmek için buraya tıklayınız</a><html> bu rakamın üzerinde. <img alt="Şekil 5," src="/files/ftp_upload/54648/54648fig5.jpg" /> Lif eksenine açısı vs ıslak tripsin-saflaştırılmış kollajen uzunlamasına akustik dalga hızı Şekil 5. Konu. Brillouin zirveleri uygun analizlerden elde edilen hidrate kollajen lif boyuna akustik dalga hızı. gösterilen çizgi göz için bir kılavuzdur ve bu aralıkta akustik dalga hızının ortalama değerini verir. Hata çubukları Brillouin spektrumları uygun bir Levenberg-Marquardt doğrusal olmayan en küçük kareler sonra kovaryans matrisinin köşegen elemanları karekökü elde edilen standart hataları göstermektedir. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54648/54648fig5large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> jpg &quot;/&gt; Sığır ense ligament gelen elastin liflerin Şekil 6. Brillouin spektrumları. İçeride ISTV melerin RWMAIWi&#39;nin kuru ve sulandırılmış fiber Spectra = 0 °. Spektrumlar toplu tepe yoğunluğuna (yükseklik) normalize edilmiştir. Etiketler B ve PS sırasıyla toplu ve paralel-yüzey modları ile ilgili zirveleri göstermek. B, F ve B W sırasıyla, lif ve su dökme zirveleri bakın. Hata çubukları standart hata (sayılarında karekökü) gösterir. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54648/54648fig6large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> <img alt="Şekil 7," src="/files/ftp_upload/54648/54648fig7.jpg" /> Lif eksenine açısı vs kuru elastin boyuna akustik dalga hızı Şekil 7. Konu. Kuru elastin yalan Boyuna akustik dalga hızıer Brillouin zirveleri uygun analizlerden elde edilen. Veriler altıgen simetrik esnek katı bir model yerleştirilmiştir. Kırmızı çizgi: Denklem A1 9 (R = 0.74 2). Hata çubukları Brillouin spektrumları uygun bir Levenberg-Marquardt doğrusal olmayan en küçük kareler sonra kovaryans matrisinin köşegen elemanları karekökü elde edilen standart hataları göstermektedir. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54648/54648fig7large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> <img alt="Yan Şekil 1" src="/files/ftp_upload/54648/54648supfig1.jpg" /> Şekil SI-1. Brillouin set-up ve TYD saçılma geometri şematik. (A) katı-hal lazer tarafından yayılan olay ışık bir akromatik lens aracılığıyla numune gönderilir. Toplu akustik fononların tarafından ve reflektör kaynaklanan kişiler tarafından saçılan ışıknumune ile temas halinde olan alt-tabaka yüzeyinin en ışık ection bir foto çoğaltıcı ile tandem pasolu Fabry-Perot interferometre ile filtre edildi ve tespit lens tarafından toplanır. FP1 ve FP2 tandem set-up oluşturan iki interferometreleri göstermektedir. Bir polarize gelen ışığın polarizasyonunun seçer ve çözümleyici saçılan ışığın polarizasyon seçmek için kullanılır. Yansıtıcı silikon alt-tabaka yüzeyi ile temas halinde olan bir örnek ile (B) TYD geometrisi. Bir cam slayt (gösterilmemiştir) bir bölme mühürlemek için numune üzerine yerleştirilmiştir ve hafif bir basınç taban köşelerinde ped vasıtasıyla uygulanır. Olay ışık (k i) merceğinden, hava numune arayüzü (k &#39;i) en kırılır ve numune substrat arayüzü odaklanmıştır geçer. Aynı lens tarafından toplanan dağınık ışık toplu fononların hem etkileşim sonuçları (q ( &#39;s k)b) ve numune (q s olanlar seyahat PS). . Işığın yön ve yüzey normali arasındaki açılar Φ ve Φ &#39;olarak belirtilen (C) örnek benimsenen koordinat sisteminin şematik diyagramıdır; z liflerin yönüne olağanüstü eksen paralel tanımlar. Açılar θ ve α z sırasıyla -Axis b fononlar q s yönü ve q arasında olanlardır s &#39;k, k s i&#39;, k i k. Olayın dalgasayıları ve hafif dağınık, q b, q s, sırasıyla dökme ve PS modları, dalga vektörleri. (Ref 9. yayımlanmaktadır) <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54648/54648supfig1large.jpg" target="_blank">bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> <pfo class = &quot;jove_content&quot;: keep-ile-next.within sayfa = &quot;always&quot;&gt; Tablo akustik dalga hızlarının uygun analizlerden elde edilen 1. Elastik tensör katsayıları Ben lifleri kollajen kuru tripsin-saflaştırılmış Çeşidi Elastik tensör katsayıları (. Bu iş) ve elastin lifleri (ref 9). <table border="1" fo:keep-together.within-page="1"><tbody><tr><td> örnek </td><td colspan="2"> Elastik katsayılar (GPa) </td></tr><tr><td> tripsin ile sindirilmiş kollajen </td><td> c 33 </td><td> 18.7 ± 0.1 </td></tr><tr><td></td><td> C 11 </td><td> 14.4 ± 0.2 </td></tr><tr><td></td><td> C 44 </td><td> 3.4 ± 0.1 </td></tr><tr><td></td><td> Cı 12 </td><td> 7.2 ± 0.2 </td></tr><tr><td></td><td> Cı 13 </td><td> 11.2 ± 0.3 </td></tr><tr><td> elastin </td><td> c 33 </td><td> 11.5 ± 0.2 </td></tr><tr><td></td><td> C 11 </td><td> 10.4 ± 0.1 </td></tr><tr><td></td><td> C 44 </td><td> 1.9 ± 0.2 </td></tr><tr><td></td><td> Cı 12 </td><td> 6.6 ± 0.2 </td></tr><tr><td></td><td> Cı 13 </td><td> 6.8 ± 0.3 </td></tr></tbody></table>

Watch this Scientific Journal Video about Preparation of Extracellular Matrix Protein Fibers for Brillouin Spectroscopy at JoVE.com

Preparation of Extracellular Matrix Protein Fibers for Brillouin Spectroscopy

We present a protocol for the application of Brillouin light scattering spectroscopy to elastin and trypsin-purified type I collagen fibers of the extracellular matrix to extract their full elastic properties.

Brillouin Spektroskopisi için Ekstraselüler Matriks Proteini Elyaf Hazırlama

Brillouin spectroscopy is an emerging technique in the biomedical field. It probes the mechanical properties of a sample through the interaction of ...

preparation-extracellular-matrix-protein-fibers-for-brillouin

Research

JoVE Journal

Bioengineering

10.3K Görüntüleme.  University of Exeter. We present a protocol for the application of Brillouin light scattering spectroscopy to elastin and trypsin-purified type I collagen fibers of the extracellular matrix to extract their full elastic properties.

Video: Preparation of Extracellular Matrix Protein Fibers for Brillouin Spectroscopy

Non-contact, Label-free Monitoring of Cells and Extracellular Matrix using Raman Spectroscopy

Non-destructive, non-contact and label-free technologies to monitor cell and tissue cultures are needed in the field of biomedical research.1-5 However, currently available routine methods require processing steps and alter sample integrity. Raman spectroscopy is a fast method that enables the measurement of biological samples without the need for further processing steps. This laser-based technology detects the inelastic scattering of monochromatic light.6 As every chemical vibration is assigned to a specific Raman band (wavenumber in cm-1), each biological sample features a typical spectral pattern due to their inherent biochemical composition.7-9 Within Raman spectra, the peak intensities correlate with the amount of the present molecular bonds.1 Similarities and differences of the spectral data sets can be detected by employing a multivariate analysis (e.g. principal component analysis (PCA)).10
Here, we perform Raman spectroscopy of living cells and native tissues. Cells are either seeded on glass bottom dishes or kept in suspension under normal cell culture conditions (37 &deg;C, 5% CO2) before measurement. Native tissues are dissected and stored in phosphate buffered saline (PBS) at 4 &deg;C prior measurements. Depending on our experimental set up, we then either focused on the cell nucleus or extracellular matrix (ECM) proteins such as elastin and collagen. For all studies, a minimum of 30 cells or 30 random points of interest within the ECM are measured. Data processing steps included background subtraction and normalization.

Raman spectroscopy is a suitable technique for the non-contact, label-free analysis of living cells, tissue-engineered constructs and native tissues. Source-specific spectral fingerprints can be generated and analyzed using multivariate analysis.

Raman Spektroskopisi kullanarak Hücreler ve Ekstrasellüler Matriks Temassız, Etiket ücretsiz izleme

Non-destructive, non-contact and label-free technologies to monitor cell and tissue cultures are needed in the field of biomedical research.1-5 However, ...

Biyomühendislik

Preparation of Light-responsive Membranes by a Combined Surface Grafting and Postmodification Process

In order to modify the surface tension of commercial available track-edged polymer membranes, a procedure of surface-initiated polymerization is presented. The polymerization from the membrane surface is induced by plasma treatment of the membrane, followed by reacting the membrane surface with a methanolic solution of 2-hydroxyethyl methacrylate (HEMA). Special attention is given to the process parameters for the plasma treatment prior to the polymerization on the surface. For example, the influence of the plasma-treatment on different types of membranes (e.g.&#160;polyester, polycarbonate, polyvinylidene fluoride) is studied. Furthermore, the time-dependent stability of the surface-grafted membranes is shown by contact angle measurements. When grafting poly(2-hydroxyethyl methacrylate) (PHEMA) in this way, the surface can be further modified by esterification of the alcohol moiety of the polymer with a carboxylic acid function of the desired substance. These reactions can therefore be used for the functionalization of the membrane surface. For example, the surface tension of the membrane can be changed or a desired functionality as the presented light-responsiveness can be inserted. This is demonstrated by reacting PHEMA with a carboxylic acid functionalized spirobenzopyran unit which leads to a light-responsive membrane. The choice of solvent plays a major role in the postmodification step and is discussed in more detail in this paper. The permeability measurements of such functionalized membranes are performed using a Franz cell with an external light source. By changing the wavelength of the light from the visible to the UV-range, a change of permeability of aqueous caffeine solutions is observed.

A plasma-induced polymerization procedure is described for the surface-initiated polymerization on polymer membranes. Further postmodification of the grafted polymer with photochromic substances is presented with a protocol of conducting permeability measurements of light-responsive membranes.

Bir Kombine Yüzey Tırnak ve Postmodification Süreci Işık duyarlı Membranların Hazırlanması

In order to modify the surface tension of commercial available track-edged polymer membranes, a procedure of surface-initiated polymerization is ...

Epithelial Cell Repopulation and Preparation of Rodent Extracellular Matrix Scaffolds for Renal Tissue Development

This protocol details the generation of acellular, yet biofunctional, renal extracellular matrix (ECM) scaffolds that are useful as small-scale model substrates for organ-scale tissue development. Sprague Dawley rat kidneys are cannulated by inserting a catheter into the renal artery and perfused with a series of low-concentration detergents (Triton X-100 and sodium dodecyl sulfate (SDS)) over 26 hr to derive intact, whole-kidney scaffolds with intact perfusable vasculature, glomeruli, and renal tubules. Following decellularization, the renal scaffold is placed inside a custom-designed perfusion bioreactor vessel, and the catheterized renal artery is connected to a perfusion circuit consisting of: a peristaltic pump; tubing; and optional probes for pH, dissolved oxygen, and pressure. After sterilizing the scaffold with peracetic acid and ethanol, and balancing the pH (7.4), the kidney scaffold is prepared for seeding via perfusion of culture medium within a large-capacity incubator maintained at 37 &#176;C and 5% CO2. Forty million renal cortical tubular epithelial (RCTE) cells are injected through the renal artery, and rapidly perfused through the scaffold under high flow (25 ml/min) and pressure (~230 mmHg) for 15 min before reducing the flow to a physiological rate (4 ml/min). RCTE cells primarily populate the tubular ECM niche within the renal cortex, proliferate, and form tubular epithelial structures over seven days of perfusion culture. A 44 &#181;M resazurin solution in culture medium is perfused through the kidney for 1 hr during medium exchanges to provide a fluorometric, redox-based metabolic assessment of cell viability and proliferation during tubulogenesis. The kidney perfusion bioreactor permits non-invasive sampling of medium for biochemical assessment, and multiple inlet ports allow alternative retrograde seeding through the renal vein or ureter. These protocols can be used to recellularize kidney scaffolds with a variety of cell types, including vascular endothelial, tubular epithelial, and stromal fibroblasts, for rapid evaluation within this system.

This protocol describes decellularization of Sprague Dawley rat kidneys by antegrade perfusion of detergents through the vasculature, producing acellular renal extracellular matrices that serve as templates for repopulation with human renal epithelial cells. Recellularization and use of the resazurin perfusion assay to monitor growth is performed within specially-designed perfusion bioreactors.

Epitel Hücre Repopulation ve Böbrek Doku Kalkınma Kemirgen Ekstrasellüler Matriks iskelelerinin hazırlanması

This protocol details the generation of acellular, yet biofunctional, renal extracellular matrix (ECM) scaffolds that are useful as small-scale model ...

High Speed Sub-GHz Spectrometer for Brillouin Scattering Analysis

The goal of this protocol is to build a parallel high-extinction and high-resolution optical Brillouin spectrometer. Brillouin spectroscopy is a non-contact measurement method that can be used to obtain direct readouts of viscoelastic material properties. It has been a useful tool in material characterization, structural monitoring and environmental sensing. In the past, Brillouin spectroscopy has usually employed scanning Fabry-Perot etalons to perform spectral analysis. This process requires high illumination power and long acquisition times, making the technique unsuitable for biomedical applications. A recently introduced novel spectrometer overcomes this challenge by employing two VIPAs in a cross-axis configuration. This innovation enables sub-Gigahertz (GHz) resolution spectral analysis with sub-second acquisition time and illumination power within the safety limits of biological tissue. The multiple new applications facilitated by this improvement are currently being explored in biological research and clinical application.

Here we present a protocol to build a rapid Brillouin spectrometer. Cascading virtually imaged phase array (VIPA) etalons achieve a measurement speed more than 1,000 times faster than traditional scanning Fabry-Perot spectrometers. This improvement provides the means for Brillouin analysis of tissue and biomaterials at low power levels in vivo.

Brillouin Saçılma Analiz Yüksek Hızlı Alt GHz Spektrometre

The goal of this protocol is to build a parallel high-extinction and high-resolution optical Brillouin spectrometer. Brillouin spectroscopy is a ...

Engineering Three-dimensional Epithelial Tissues Embedded within Extracellular Matrix

The architecture of branched organs such as the lungs, kidneys, and mammary glands arises through the developmental process of branching morphogenesis, which is regulated by a variety of soluble and physical signals in the microenvironment. Described here is a method created to study the process of branching morphogenesis by forming engineered three-dimensional (3D) epithelial tissues of defined shape and size that are completely embedded within an extracellular matrix (ECM). This method enables the formation of arrays of identical tissues and enables the control of a variety of environmental factors, including tissue geometry, spacing, and ECM composition. This method can also be combined with widely used techniques such as traction force microscopy (TFM) to gain more information about the interactions between cells and their surrounding ECM. The protocol can be used to investigate a variety of cell and tissue processes beyond branching morphogenesis, including cancer invasion.

This manuscript describes a soft lithography-based technique to engineer uniform arrays of three-dimensional (3D) epithelial tissues of defined geometry surrounded by extracellular matrix. This method is amenable to a wide variety of cell types and experimental contexts and allows for high-throughput screening of identical replicates.

Ekstraselüler Matrix içinde Gömülü Mühendislik Üç boyutlu Epitel Dokular

The architecture of branched organs such as the lungs, kidneys, and mammary glands arises through the developmental process of branching morphogenesis, ...

Tunable Hydrogels from Pulmonary Extracellular Matrix for 3D Cell Culture

Here we present a method for establishing multiple component cell culture hydrogels for in vitro lung cell culture. Beginning with healthy en bloc lung tissue from porcine, rat, or mouse, the tissue is perfused and submerged in subsequent chemical detergents to remove the cellular debris. Histological comparison of the tissue before and after processing confirms removal of over 95% of double stranded DNA and alpha galactosidase staining suggests the majority of cellular debris is removed. After decellularization, the tissue is lyophilized and then cryomilled into a powder. The matrix powder is digested for 48 hr in an acidic pepsin digestion solution and then neutralized to form the pregel solution. Gelation of the pregel solution can be induced by incubation at 37 &#176;C and can be used immediately following neutralization or stored at 4 &#176;C for up to two weeks. Coatings can be formed using the pregel solution on a non-treated plate for cell attachment. Cells can be suspended in the pregel prior to self-assembly to achieve a 3D culture, plated on the surface of a formed gel from which the cells can migrate through the scaffold, or plated on the coatings. Alterations to the strategy presented can impact gelation temperature, strength, or protein fragment sizes. Beyond hydrogel formation, the hydrogel stiffness may be increased using genipin.

This is a method to create a 3-dimensional cell culture scaffold from pulmonary extracellular matrix. Intact lung is processed into hydrogels that can support the growth of cells in three-dimensions.

3D Hücre Kültürü için Pulmoner Ekstrasellüler Matrix Ayarlanabilir Hidrojellerinin

Here we present a method for establishing multiple component cell culture hydrogels for in vitro lung cell culture. Beginning with healthy en bloc lung ...

Fabricating a Kidney Cortex Extracellular Matrix-Derived Hydrogel

Extracellular matrix (ECM) provides important biophysical and biochemical cues to maintain tissue homeostasis. Current synthetic hydrogels offer robust mechanical support for in vitro cell culture but lack the necessary protein and ligand composition to elicit physiological behavior from cells. This manuscript describes a fabrication method for a kidney cortex ECM-derived hydrogel with proper mechanical robustness and supportive biochemical composition. The hydrogel is fabricated by mechanically homogenizing and solubilizing decellularized human kidney cortex ECM. The matrix preserves native kidney cortex ECM protein ratios while also enabling gelation to physiological mechanical stiffnesses. The hydrogel serves as a substrate upon which kidney cortex-derived cells can be maintained under physiological conditions. Furthermore, the hydrogel composition can be manipulated to model a diseased environment which enables the future study of kidney diseases.

Here we present a protocol to fabricate a kidney cortex extracellular matrix-derived hydrogel to retain the native kidney extracellular matrix (ECM) structural and biochemical composition. The fabrication process and its applications are described. Finally, a perspective on using this hydrogel to support kidney-specific cellular and tissue regeneration and bioengineering is discussed.

Bir böbrek korteks ekstraselüler matrisi elde edilen hidrojel imalatı

Extracellular matrix (ECM) provides important biophysical and biochemical cues to maintain tissue homeostasis. Current synthetic hydrogels offer robust ...

Production of Extracellular Matrix Fibers via Sacrificial Hollow Fiber Membrane Cell Culture

Engineered scaffolds derived from extracellular matrix (ECM) have driven significant interest in medicine for their potential in expediting wound closure and healing. Extraction of extracellular matrix from fibrogenic cell cultures in vitro has potential for generation of ECM from human- and potentially patient-specific cell lines, minimizing the presence of xenogeneic epitopes which has hindered the clinical success of some existing ECM products. A significant challenge in in vitro production of ECM suitable for implantation is that ECM production by cell culture is typically of relatively low yield. In this work, protocols are described for the production of ECM by cells cultured within sacrificial hollow fiber membrane scaffolds. Hollow fiber membranes are cultured with fibroblast cell lines in a conventional cell medium and dissolved after cell culture to yield continuous threads of ECM. The resulting ECM fibers produced by this method can be decellularized and lyophilized, rendering it suitable for storage and implantation.

The goal of this protocol is production of whole extracellular matrix fibers targeted for wound repair which are suitable for preclinical evaluation as part of a regenerative scaffold implant. These fibers are produced by the culture of fibroblasts on hollow fiber membranes and extracted by dissolution of the membranes.

Hücre dışı matriks liflerinin kurban Hollow Fiber membran hücre kültürü ile üretim

Engineered scaffolds derived from extracellular matrix (ECM) have driven significant interest in medicine for their potential in expediting wound closure ...

Pancreatic Tissue-Derived Extracellular Matrix Bioink for Printing 3D Cell-Laden Pancreatic Tissue Constructs

The transplantation of pancreatic islets is a promising treatment for patients who suffer from type 1 diabetes accompanied by hypoglycemia and secondary complications. However, islet transplantation still has several limitations such as the low viability of transplanted islets due to poor islet engraftment and hostile environments. In addition, the insulin-producing cells differentiated from human pluripotent stem cells have limited ability to secrete sufficient hormones that can regulate the blood glucose level; therefore, improving the maturation by culturing cells with proper microenvironmental cues is strongly required. In this article, we elucidate protocols for preparing a pancreatic tissue-derived decellularized extracellular matrix (pdECM) bioink to provide a beneficial microenvironment that can increase glucose sensitivity of pancreatic islets, followed by describing the processes for generating 3D pancreatic tissue constructs using a microextrusion-based bioprinting technique.

Decellularized extracellular matrix (dECM) can provide suitable microenvironmental cues to recapitulate the inherent functions of target tissues in an engineered construct. This article elucidates the protocols for the decellularization of pancreatic tissue, evaluation of pancreatic tissue-derived dECM bioink, and generation of 3D pancreatic tissue constructs using a bioprinting technique.

3D Hücre Yüklü Pankreas Dokusu Yapıları Baskı için Pankreas Doku Türetilmiş Ekstrasellüler Matrix Bioink

The transplantation of pancreatic islets is a promising treatment for patients who suffer from type 1 diabetes accompanied by hypoglycemia and secondary ...

A Human 3D Extracellular Matrix-Adipocyte Culture Model for Studying Matrix-Cell Metabolic Crosstalk

The extracellular matrix (ECM) plays a central role in regulating tissue homeostasis, engaging in crosstalk with cells and regulating multiple aspects of cellular function. The ECM plays a particularly important role in adipose tissue function in obesity, and alterations in adipose tissue ECM deposition and composition are associated with metabolic disease in mice and humans. Tractable in vitro models that permit dissection of the roles of the ECM and cells in contributing to global tissue phenotype are sparse. We describe a novel 3D in vitro model of human ECM-adipocyte culture that permits study of the specific roles of the ECM and adipocytes in regulating adipose tissue metabolic phenotype. Human adipose tissue is decellularized to isolate ECM, which is subsequently repopulated with preadipocytes that are then differentiated within the ECM into mature adipocytes. This method creates ECM-adipocyte constructs that are metabolically active and retain characteristics of the tissues and patients from which they are derived. We have used this system to demonstrate disease-specific ECM-adipocyte crosstalk in human adipose tissue. This culture model provides a tool for dissecting the roles of the ECM and adipocytes in contributing to global adipose tissue metabolic phenotype and permits study of the role of the ECM in regulating adipose tissue homeostasis.

We describe a 3D human extracellular matrix-adipocyte in vitro culture system that permits dissection of the roles of the matrix and adipocytes in contributing to adipose tissue metabolic phenotype.

Bir İnsan 3D Ekstrasellüler Matrix-Adiposit Kültür Modeli Matrix-Hücre Metabolik Crosstalk Çalışma için

The extracellular matrix (ECM) plays a central role in regulating tissue homeostasis, engaging in crosstalk with cells and regulating multiple aspects of ...