Drosophila'da Tek Moleküllü Ölçeklerde Kas Transkripsiyon Dinamiğinin İncelenmesi

Ekibimizde kas gelişimi ve onarımını yöneten hücresel ve moleküler mekanizmaları inceledik. Aslında, mRNA moleküllerinin özel dağılımının çeşitli hücresel süreçleri düzenlediği bilinmektedir. Ve burada, mRNA'ların özellikle sineğin kas dokusu içinde nasıl dağıldığını araştırmak için Drosophila'yı bir model olarak kullanıyoruz.

Gen ekspresyon dinamiğinin çeşitli kas biyolojik süreçlerini düzenlediği kanıtlanmıştır. Yüksek verimli tek hücreli ve tek çekirdekli RNA dizileme tekniklerinin ortaya çıkışı, transkripsiyonel dinamiklerin kapsamlı bir şekilde araştırılmasını sağlamıştır. Klasik omik tekniklerin dikkate değer bir sınırlaması, Drosophila kas lifleri içindeki mRNA moleküllerinin uzamsal dağılımını sağlayamamasıdır.

Bu özellik, tek moleküllü floresan in situ hibridizasyon ile araştırılabilir. Mevcut yöntemler, Drosophila kas sistemi içindeki mRNA transkripsiyonel dinamiklerini ve uzaysal dağılımını belirlemek için yetersizdir. Bu sınırlamayı ele almak için, Drosophila kas liflerindeki tek tek mRNA moleküllerini yüksek uzamsal çözünürlük ve sinyal molekülü ölçekleriyle tespit etmek ve kodlamak için bir yöntemi optimize ettik.

Alandaki güncel bir zorluk, kas rejenerasyon dinamiğini gerçek zamanlı olarak ve canlı hayvanlarda görselleştirmektir. Bu nedenle, kas kök hücresinin doğal ortamındaki davranışını görselleştirmek için canlı bir görüntüleme yaklaşımı geliştirmeye çalışıyoruz ve ayrıca örneğin kas rejenerasyonu sırasında ve ayrıca farklılaşmaları sırasında ve bu eşi benzeri görülmemiş bir çözünürlükle göç şekilleri ve aralıkları sorusunu ele almaya çalışıyoruz.