Kombine Tek Çekirdekli RNA Dizileme ve ATAC-Dizileme ve Toplu Metabolomikler için Donmuş İnsan Olmayan Primat Fetal Adacıklarının Hazırlanması

Hamilelik sırasında anne diyeti ve ilaç tüketiminin yavrulardaki pankreas adacıklarının embriyonik gelişimini ve doğum sonrası işlevini nasıl etkilediğini değerlendirmek için oldukça translasyonel, insan olmayan bir primat modeli kullanıyoruz. Gelişimsel olarak programlanmış değişiklikler, yaşamın ilerleyen dönemlerinde hastalığa yatkınlığı değiştirebilir. İnsan olmayan primatlardan alınanlar gibi elde edilmesi zor örneklerle çalışırken karşılaşılan bir zorluk, aynı bireyden gelen birden fazla soruyu verimli bir şekilde değerlendirmektir.

Ne yazık ki, metabolom ve genomdan aynı anda bilgi çıkarmak, ölçülecek moleküllerin zamana duyarlı bozunmasındaki tahlil reaktiflerinin uyumsuzluğu nedeniyle zor olabilir. Protokolümüz, aynı başlangıç materyalinden metabolit bolluğunun, kromatin erişilebilirliğinin ve diferansiyel gen ekspresyonunun ekstrapolasyonuna izin verir. Bu çok katmanlı yaklaşım, metabolizmanın pankreas adacıklarındaki genomu nasıl değiştirebileceğine dair fikir verir.