Preparazione di isole fetali di primati non umani congelate per il sequenziamento combinato di RNA a nuclei singoli e il sequenziamento ATAC e la metabolomica di massa

Utilizziamo un modello altamente traslazionale di primati non umani per valutare come la dieta materna e il consumo di farmaci durante la gravidanza influenzino lo sviluppo embrionale e la funzione postnatale delle isole pancreatiche nella prole. I cambiamenti programmati in base allo sviluppo potrebbero alterare la suscettibilità alla malattia più avanti nella vita. Una sfida quando si lavora con campioni difficili da acquisire, come quelli provenienti da primati non umani, è valutare in modo efficiente più domande dello stesso individuo.

Sfortunatamente, l'estrazione simultanea di informazioni dal metaboloma e dal genoma può essere difficile a causa dell'incompatibilità dei reagenti del saggio nella degradazione sensibile al tempo delle molecole da quantificare. Il nostro protocollo consente l'estrapolazione dell'abbondanza dei metaboliti, dell'accessibilità della cromatina e dell'espressione genica differenziale dallo stesso materiale di partenza. Questo approccio a più livelli fornisce informazioni su come il metabolismo può alterare il genoma nelle isole pancreatiche.