Preparação de ilhotas fetais de primatas não humanos congelados para sequenciamento combinado de RNA de núcleo único e sequenciamento ATAC e metabolômica em massa

Utilizamos um modelo de primata não humano altamente translacional para avaliar como a dieta materna e o consumo de medicamentos durante a gravidez influenciam o desenvolvimento embrionário e a função pós-natal das ilhotas pancreáticas na prole. Mudanças programadas no desenvolvimento podem alterar a suscetibilidade à doença mais tarde na vida. Um desafio ao trabalhar com amostras difíceis de adquirir, como as de primatas não humanos, é avaliar várias perguntas do mesmo indivíduo de forma eficiente.

Infelizmente, extrair simultaneamente informações do metaboloma e do genoma pode ser difícil devido à incompatibilidade dos reagentes de ensaio na degradação sensível ao tempo das moléculas a serem quantificadas. Nosso protocolo permite a extrapolação da abundância de metabólitos, acessibilidade da cromatina e expressão gênica diferencial do mesmo material de partida. Essa abordagem em várias camadas fornece informações sobre como o metabolismo pode alterar o genoma nas ilhotas pancreáticas.