JoVE Logo

Sign In

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

In This Article

  • Summary
  • Abstract
  • Introduction
  • Protocol
  • النتائج
  • Discussion
  • Disclosures
  • Acknowledgements
  • Materials
  • References
  • Reprints and Permissions

Summary

علينا أن نبرهن على أساس مقايسة على microfluidics لقياس الزمني للخلايا لعبور سلسلة من التشنج ميكرون النطاق.

Abstract

نحن هنا التفاصيل تصميم وتصنيع واستخدام جهاز ميكروفلويديك لتقييم التشوه من عدد كبير من الخلايا الفردية بطريقة فعالة. عادة، يمكن الحصول على البيانات الخاصة ب ~ 10 2 الخلايا داخل تجربة 1 ساعة. يتيح برنامج تحليل الصور آليا بعد تحليل التجربة كفاءة من بيانات الصورة، مما يتيح تجهيز أن يكتمل في غضون ساعات قليلة. هندسة الجهاز لدينا هي فريدة من نوعها في أن الخلايا يجب أن تشوه من خلال سلسلة من التشنج ميكرون النطاق، وبالتالي تمكين تشوه الأولي وتعتمد على الوقت للاسترخاء من الخلايا الفردية أن يعاير. ويتجلى مدى انطباق هذا الأسلوب لاللوكيميا البشري (HL-60) الخلايا. القيادة الخلايا لتشوه من خلال التشنج ميكرون النطاق باستخدام تدفق ضغط يحركها، نلاحظ أن البرولمفوسيت البشري (HL-60) خلايا تسد حظات انقباض الأول لفترة وسيطة من 9.3 ميللي ثانية قبل الركض بسرعة أكبر من خلال انقباض لاحقالأيونات مع الوقت عبور المتوسط ​​من 4.0 ميللي ثانية في انقباض. على النقيض من ذلك، جميع العابر حمض الريتينويك المعالجة (العدلات من نوع) HL-60 خلايا تسد انقباض الأول فقط 4.3 مللي ثانية قبل الركض من خلال التشنج اللاحقة مع الوقت عبور المتوسط ​​من 3.3 ميللي ثانية. هذه الطريقة يمكن توفير نظرة ثاقبة لطبيعة اللزجة من الخلايا، وتكشف في النهاية أصول الجزيئية من هذا السلوك.

Introduction

التغييرات في شكل الخلية هي الحاسمة في السياقات البيولوجية عديدة. على سبيل المثال، كريات الدم الحمراء وكريات الدم البيضاء تشوه من خلال الشعيرات الدموية التي تكون أصغر من قطر الخاصة بهم 1. في ورم خبيث، يجب أن تشوه الخلايا السرطانية من خلال الثغرات الضيقة الخلالي وكذلك الأوعية الدموية متعرج والشبكات اللمفاوية البذور في مواقع الثانوية 2. للتحقيق في السلوك المادي للخلايا فردية، وأجهزة ميكروفلويديك تمثل منصة مثالية التي يمكن تخصيصها لدراسة مجموعة من السلوكيات الخلية بما في ذلك قدرتهم على الهجرة من خلال الثغرات الضيقة 3 وتشوه بشكل سلبي من خلال التشنج ميكرون النطاق 3- 9. Polydimethylsiloxane (PDMS) أجهزة ميكروفلويديك شفافة بصريا، مما التشوهات الخلية المراد تصور باستخدام المجهر الضوئي وتحليلها باستخدام أدوات معالجة الصور الأساسية. وعلاوة على ذلك، صفائف التشنج يمكن تعريفها بدقة، مما يتيح تحليل خلايا متعددة في وقت واحد معالإنتاجية التي تتجاوز العديد من التقنيات القائمة 10،11.

هنا نقدم بروتوكول تجريبي مفصل لبحث التشوه الخلية باستخدام جهاز ميكروفلويديك في "خلية Deformer" PDMS. الجهاز مصمم بحيث خلايا المرور عبر التشنج متتابعة. هذه الهندسة هو شائع في سياقات الفسيولوجية، مثل الشعيرات الرئوية سرير 12. لقياس التشوه خلية، وقت العبور يوفر متري مريحة أن تقاس بسهولة والوقت اللازم للخلية الفردية لعبور خلال 4،6 انقباض واحد. للحفاظ على انخفاض الضغط المستمر عبر قنوات ضيقة أثناء العبور خلية، ونحن نستخدم تدفق ضغط يحركها. ويتضمن بروتوكول لدينا تعليمات مفصلة عن تصميم الجهاز وتصنيع وتشغيل الجهاز عن طريق ضغط يحركها تدفق وإعداد وتصوير من الخلايا، وكذلك معالجة الصور لقياس الوقت للخلايا لتشويه من خلال سلسلة من التشنج. ندرجكلا التصاميم جهاز ورمز معالجة البيانات كملفات رؤية تكميلية. على عينة تمثيلية من البيانات، وتبين لنا خلية العبور مرة من خلال سلسلة من التشنج بوصفها وظيفة من عدد من التشنج passaged. تحليل الجدول الزمني للخلايا لعبور الرغم من التشنج الضيقة للجهاز ميكروفلويديك يمكن أن تكشف عن الاختلافات في التشوه مجموعة متنوعة من أنواع الخلايا 4،5،13. الجهاز أثبت هنا يستكشف فريد عبور الخلية من خلال سلسلة من التشنج ميكرون الحجم؛ هذا التصميم يحاكي مسار متعرج تلك التجربة الخلايا في الدورة الدموية وتمكن أيضا سبر الخصائص الفيزيائية إضافية من الخلايا مثل وقت الاسترخاء.

Protocol

1. ميكروفلويديك تصميم الجهاز

ملاحظة: تصميم الجهاز لديه أربع مناطق وظيفية أساسية هي: ميناء الدخول، وتصفية خلية، مجموعة انقباض، وميناء الخروج (الشكل 1). التصميم العام يمكن تطبيقها على مجموعة واسعة من أنواع الخلايا، مع تعديلات طفيفة على الأبعاد. المقدمة هنا هي بعض التوصيات الأساسية جنبا إلى جنب مع تصميم جهاز المعلمات التي هي فعالة لمجموعة مختارة من كل من الخلايا الأولية وخلد.

  1. حدد عرض مجموعة من القنوات انقباض (الشكل 1B) أن ما يقرب من 30-50٪ من متوسط ​​قطر الخلية؛ هذا انقباض الى خلية حجم النتائج نسبة تشوه في الخلية كبير ولكن الحد الأدنى من انسداد. إعطاء نوع من الخلايا التي لم يتم اختباره سابقا، فإنه من الحكمة لتصميم مجموعة من الاعراض انقباض من ~ 30-50٪ قطر خلية للعثور على العرض الأمثل. كما هو الحال مع العديد من أنواع الأجهزة ميكروفلويديك، أكثر من 120 جهاز قوالب رئيسية يمكن منقوشة على الخطيئةغلي 4 بوصة رقاقة السيليكون، وتمكين مجموعة من التصاميم المختلفة لجهاز تكون ملفقة في عملية تلفيق واحدة.
  2. حدد ارتفاع قناة أن تكون على الأقل 50٪ من قطر الخلية؛ وهذا يضمن يقتصر الخلية في 2 أبعاد. لمنع انهيار قناة خلال الترابط، تأكد من أن نسبة الارتفاع القناة لا يقل عن 1:10 (الطول: العرض) في جميع أنحاء الجهاز. للقنوات التي يجب أن تتجاوز هذه النسبة الجانب، إضافة وظائف الدعم لمنع الانهيار. وظائف الدعم الفضاء على مسافة التي هي على الأقل ضعف قطرها خلية حتى لا تعيق تدفق الخلية.
  3. تشمل مرشح في موانئ الدخول إلى إزالة الحطام وتفصيل مجموعات الخلايا (الشكل 1B). ضبط حجم وتباعد من المشاركات مرشح بحيث تكون المسافة التي تفصل المشاركات التي تساوي تقريبا قطرها خلية واحدة.
    ملاحظة: يتم تعيين الحد الأدنى من حجم الميزة من خلال القرار الذي تتم طباعة قناع الطباعة الحجرية. التأكد من أن جميع الميزات ضمن الدقةالحد olution التي يحددها المورد قناع.

2. اللوازم وإعداد

ملاحظة: قبل البدء في أي تجربة، يجب أن يكون مستعدا العناصر التالية. ويرد التخطيطي من الإعداد بأكمله في الشكل 1.

  1. افتعال سيد الجهاز باستخدام التقنيات القياسية لمتناهي الصغر معدني 14،15. تحقق من ارتفاع ملامح نمط باستخدام profilometer.
    ملاحظة: في حين يمكن أن تكون ملفقة الماجستير بسهولة في منشأة غرف الأبحاث، وضعت بعض معامل الطباعة الحجرية طرق غير مكلفة للاستخدام في بيئة شبه نظيفة 16،17.
  2. إعداد مصدر الهواء لتدفق ضغط يحركها، وذلك باستخدام خزان الهواء المضغوط وتسلسل المنظمين الهواء وحديد التسليح (الشكل 1A).
    1. انشاء خزان العرض الجوي ومنظم اليدوي.
      ملاحظة: تكوين 5٪ CO 2 في الهواء يحافظ على بيئة مماثلة نموذجية ثقافة الخلية incubatoص، ولكن مخاليط الغاز أخرى يمكن أن تستخدم أيضا.
    2. إنشاء منظم الضغط التي تسيطر عليها الكترونيا تماشيا مع المنظم اليدوي. استخدام محول الكهربائية الهوائية لتنظيم والحفاظ على انخفاض الضغط مستقر عبر القنوات، مع تقلبات ضغط أقل من 2 كيلو باسكال. استخدام رمز بسيط مكتوب في ابفيف (معلومات تكميلية) لإدخال الضغط المطلوب.
      ملاحظة: تحويل الكهربائية الهوائية يستخدم حلقة ردود الفعل الداخلية لضبط ضغط صمام مأخذ لتتناسب مع ضغط محدد عبر الجهاز ميكروفلويديك.
    3. انشاء غرفة الضغط لدفع تدفق تعليق خلية. تجميع الغرفة تعليق خلية من تدفق قياسي عداد الكريات أنبوب وقبعة تشكيله أن يخلق ختم ضغط محكم على أنبوب.
      ملاحظة: سقف غرفة الضغط يحتوي على اثنين من فتحات: والذي يربط مدخل إلى خزان الهواء المضغوط، ومنفذا من خلالها تدفق الخلايا من غرفة الضغط في الجهاز (شملت رقمه 2).
  3. انشاء مجهر مقلوب مزودة بكاميرا يحتوي على نسبة الاستحواذ على ما لا يقل عن 100 لقطة في الثانية لالتقاط الصور من الخلايا التي تتدفق من خلال مجموعة انقباض. واجهة الكاميرا مع بطاقة التقاط الفيديو والكمبيوتر.
  4. إعداد محلول المخزون السطحي 10٪ ث / ث بلورونيك F-127 في الفوسفات مخزنة المالحة (PBS) وإضافة كمية صغيرة من F127 إلى الحل سائل الإعلام خلية سوف تساعد على تقليل التصاق الخلية إلى جدران PDMS. لإعداد حل F127، دوامة والحرارة بلطف عند 37 درجة مئوية لإذابة F127. قبل الاستخدام، وتمرير حل من خلال مرشح حقنة 0.2 ميكرون وتخزينها في درجة حرارة الغرفة. إعداد الحل السطحي مقدما كما vortexing لوتصفية سيولد الفقاعات التي سوف تستمر لأكثر من 24 ساعة.

3. تصنيع جهاز ميكروفلويديك

  1. كتلة افتعال PDMS مع قنوات ميكروفلويديك.
    1. مزيج PDMS بدقة ونسبة تا 1:10 (ث / ث) وكيل المعالجة إلى القاعدة.
    2. صب الخليط فوق سيد جهاز (الخطوة 2.1). ديغا في جرة الجرس مع فراغ التطبيقية حتى تختفي فقاعات شرك، أو لمدة 10-20 دقيقة.
      ملاحظة: بعد هذا الوقت، قد يكون هناك فقاعات لا يزال في واجهة الهواء PDMS، وهو أمر طبيعي؛ هذه سوف تتبدد عادة خلال الخبز. هو الأكثر أهمية لضمان عدم وجود فقاعات المتبقية المجاورة للقنوات.
    3. خبز الجهاز نزع الغاز عند 65 درجة مئوية لمدة 4 ساعة. لمنع القنوات من الانهيار، خبز الجهاز بين عشية وضحاها لمواصلة تشعبي PDMS لجهاز مع أعلى معامل المرونة التي هي أكثر مقاومة للقناة الانهيار. ومع ذلك، علما بأن تمديد الخبز embrittles أيضا PDMS وربما يؤدي إلى تكسير عند اللكم ثقوب (الخطوة 3.3).
  2. إزالة الأجهزة ميكروفلويديك من القالب الرئيسي. قطع الأجهزة ميكروفلويديك الفردية خارج الكتلة PDMS بشفرة حلاقة وإزالة الجهاز من الصاريإيه. تبدأ من خلال رفع بلطف من زاوية واحدة من الجهاز. تقشير لطيف وبطيء، في مقابل رفع كتلة PDMS على التوالي، ويقلل من الإجهاد على كل من PDMS وسيد.
  3. لكمة ثقوب في الجهاز PDMS لخلق منافذ اتصال للوصول بين أنابيب وmicrochannels. خلق الثقوب باستخدام لكمة خزعة، ولكمة من الجانب من خلال قناة الى الجانب الخارجي للجهاز.
    ملاحظة: لكمة خزعة مع 0.75 مم حجم ثقب الثقوب التي تخلق واجهة تماما مع polyetheretherketone (نظرة خاطفة) أنابيب (القطر الخارجي = 1/32 "أو 0.79 ملم) أو أنابيب البولي إيثيلين (PE-20، القطر الخارجي = 0.043" مم أو 1.09 ). استخدام ضوء حلقة للمساعدة في تصور ثقوب في الأجهزة مع قنوات ضحلة 18. تأكد من أن لكمة خزعة حادة. بعد تكرار استخدام يبلد طليعة ويجب التخلص من لكمة خزعة واستبدالها.
  4. شطف الجهاز PDMS مع الأيزوبروبانول (HPLC الصف) لإزالة الغبار وقدمت قطعا من PDMS. تأكد من أنثقبا واضحة من الحطام عن طريق توجيه دفق مستمر من الأيزوبروبانول النقي من زجاجة ضغط من خلال الثقوب. ضربة الجافة مع الهواء تصفيتها. بعد التنظيف، ومكان كتل PDMS مع قنوات مكشوفة في طبق بيتري نظيفة للحفاظ على نظافة الجهاز. إذا لزم الأمر، وأجهزة تخزين هذا النموذج حتى في الترابط.
  5. تنظيف الركيزة الزجاج من قبل الشطف مع الميثانول (HPLC الصف)، ضربة الجافة مع الهواء تصفيتها، ووضع على 200 درجة مئوية لمدة 5-10 دقيقة موقد لضمان زجاج نظيف وجاف تماما قبل العلاج البلازما.
    ملاحظة: الركيزة الزجاج تشكل الجزء السفلي من كل قناة. عادة شريحة زجاجية يكفي، لأن الهدف 10X 20X أو مثالية لتصوير قنوات متعددة في نفس الوقت. للدقة أعلى والتصوير، والسندات الجهاز إلى ساترة (# 1.5 سمك).
  6. السندات الجهاز PDMS إلى الركيزة الزجاج.
    1. الأكسجين البلازما علاج الجانب القناة من كتلة PDMS و1 جانب شريحة زجاجية.
      ملاحظة: Wإيث وحدة التفريغ باليد، استخدم وقت العلاج من 1 دقيقة، ولكن تحسين وقت العلاج لكل جهاز البلازما الأكسجين.
    2. وضع الجانب القناة من PDMS على رأس الجانب المعالج من الزجاج مباشرة بعد العلاج.
    3. عقد معا مع الضغط الخفيف ل~ 10 ثانية لتعزيز الترابط. خبز الجهاز بأكمله في درجة حرارة مرتفعة (60-80 درجة مئوية) لمدة 15 دقيقة على الأقل لتحسين قوة السندات.

4. التشويه الخلايا من خلال قنوات ضيقة

  1. فحص الجهاز ميكروفلويديك تحت المجهر. ضمان أن القنوات لا انهار أو مكسورة وأن كلا من مدخل ومخرج الثقوب تربط مباشرة في قنوات الجهاز باستخدام هدفا الطاقة المنخفضة (10X). تعيين الأجهزة المعيبة بتسجيله سطح PDMS بشفرة حلاقة وعدم استخدامها لإجراء التجارب.
  2. تحضير عينات ثقافة الخلية إلى أن يعاير. خلايا ثقافة استخدام الظروف القياسية.
    1. Fأو المثال، والثقافة HL-60 الخلايا في المتوسط ​​RPMI-1640 تستكمل مع 1٪ من محلول البنسلين والستربتومايسين 10٪ مصل بقري جنيني في 5٪ CO 2 الحاضنة عند 37 درجة مئوية.
    2. لخلايا ملتصقة، حصادها من قبل trypsinization و resuspend في متوسطة النمو الطازجة. استخدام بروتوكول trypsinization القياسية. على سبيل المثال، إضافة ~ 0.5 مل التربسين إلى قارورة مع 25 سم 2 منطقة ثقافة، و resuspend في ~ 30 مل متوسطة جديدة. التفريق HL-60 خلايا في الخلايا العدلة من نوع من جميع العابر الريتينول (ATRA) بتركيز نهائي من 5 ميكرومتر في 1 × 10 5 خلية / مل كما هو موضح سابقا 19،20.
    3. الطرد المركزي الخلايا في 300 x ج لمدة 3 دقائق، ونضح بعناية الخلايا طاف و resuspend إلى كثافة النهائية المناسبة في مستنبت الطازجة بنسبة 0.1٪ V / V F-127.
  3. عد الخلايا باستخدام عداد كولتر، عدادة الكريات، أو تدفق عداد الكريات. ضبط خلية إلى تعليق كثافة من 1 × 06-5 أكتوبر × 10 6 خلية / مل. مرة واحدة يتم تعيين كثافة تعليق، ملحق مع ما يقرب من 0.1٪ V / V F-127.
    ملاحظة: قد تحتاج كثافة الخلية وتركيز السطحي إلى تعديل تبعا للنظم خلايا معينة؛ يوفر الجدول 1 سجل التركيزات المستخدمة سابقا من الخلايا وF-127 لأنواع مختلفة من الخلايا.
  4. ضع تعليق الخلية في أنبوب تدفق عداد الكريات والاتصال غطاء الضغط. قبل توصيل الأنابيب إلى الجهاز ميكروفلويديك، وضبط الضغط إلى حوالي 14-21 كيلو باسكال ومطاردة حتى يخرج تعليق خلية من طرف الأنبوب. هذا سوف يساعد على تقليل فقاعات الهواء في الأنبوب والجهاز.
  5. إدراج غيض من الأنابيب التي تحتوي على تعليق خلية في مدخل الجهاز. إذا تم المستعبدين الجهاز إلى ساترة، ضع الجهاز على سطح صلب مسطح مثل المسرح المجهر قبل توصيل الأنابيب. ساترة هشة وربما كسر خلاف ذلك.
  6. اضافة الى وجود قطعة من الأنابيب كثافة العملياتس ميناء الخروج والطريق عليه في أنبوب فارغ لجمع النفايات مثل أنبوب فارغ الصقر مسجلة إلى جانب المسرح المجهر. من أجل التناسق في المقاومة الموائعية العام للجهاز بين التجارب، تأكد من أن مدخل ومخرج الأنابيب هو من نفس القطر وتقريبا نفس طول لكل تجربة.
  7. المنحدر بلطف الضغط إلى حوالي 28 كيلو باسكال أو حتى تتدفق الخلايا من خلال القنوات. وضع الجهاز بحيث قنوات متعددة تقع في مجال الرؤية وتكون متعامدة على الجزء السفلي من الشاشة. إذا الكاميرا محدودة بسبب حجم البيانات، والحصول على العديد من أشرطة الفيديو لتوليد عدد كاف من نقاط البيانات المستقلة. ضبط معدل الإطار وضرورية لإخراج البيانات المطلوبة. لالتقاط التغيرات في شكل الخلية، استخدم التصوير عالية السرعة 300 لقطة في الثانية (FPS). لقياس أوقات الترانزيت من الخلايا، استخدام معدلات الإطار من حوالي 100 إطارا في الثانية.

تحليل البيانات 5.

  1. فتح ملف ماستer_script.m (الملف التكميلي للتحميل) وتشغيل البرنامج.
  2. حدد أول فيديو ليتم تحليلها من مستكشف Windows النافذة التي تظهر. تحديد معدل الإطار للفيديو مختارة واضغط مفتاح الإدخال.
    ملاحظة: سوف يظهر الرقم الذي يطالب المستخدم لتحديد نافذة مستطيلة الاقتصاص للفيديو الأول.
  3. تحديد الإطار الذي يشمل جميع القنوات من اليسار إلى اليمين ويتقاطع القنوات فقط فوق مبة الأولى من مجموعة من القنوات في أعلى وأسفل (الشكل 3).
  4. تحديد المناطق انقباض من الصورة التي تم اقتصاصها. إيلاء اهتمام خاص للحفاظ على مسافة ثابتة بكسل بين أعلى وأسفل نافذة الحدود لكل الفيديو المحدد.
    ملاحظة: تحدد الإطار العلوي حافة انقباض العلوي والسفلي حافة نافذة تحدد bottommost انقباض (الشكل 4)؛ ويقترب من هذا التشنج وسيطة إدخال المستخدم. التالي، تعرض خوارزمية لياليegmentation الخلايا للإطارات 50 الأولى من كل فيديو (الشكل 5).
  5. مراقبة الصورة اليسرى العليا (الشكل 5A) عن كثب لتحديد ما إذا الخوارزمية هي تحديد مكان الخلايا بدقة. تم فرضه صورة binarized على مصدر الفيديو لإظهار مكان الخلايا التي تم تحديدها.
    ملاحظة: نوافذ مختلفة، (الأرقام 5B-5D) هي لكود التشخيص وتظهر إطارات الفيديو بعد عمليات معالجة الصور المحددة.
  6. حدد مقطع الفيديو التالي لتتم معالجتها من نافذة مستكشف Windows.
    ملاحظة: الخوارزمية وكرر الخطوات من 5،2-5،5 لكل الفيديو المحدد.
  7. حدد إلغاء مرة واحدة تم إضافة جميع مقاطع الفيديو المرجوة من خلال نافذة ويندوز إكسبلورر لإرشاد وظيفة أن قائمة الفيديو كاملة.
    ملاحظة: سوف الخوارزمية تنفيذ العمليات المتبقية دون تدخل المستخدم. وهذا سوف يستغرق حوالي 1-2 ساعة اعتمادا على عدد من أشرطة الفيديو معالجتها والمؤسسة العامة الكمبيوترrformance. عند الانتهاء، سوف تنتج خوارزمية الرسم البياني للبيانات وقت العبور وحفظ البيانات في الدليل كملف حصيرة MATLAB وملف .xls مايكروسوفت إكسل.

النتائج

للتحقيق في أنواع مختلفة من التشوه الخلايا، وخلايا سرطان الدم النخاعي الإنسان (HL-60)، خلايا العدلات متباينة، والخلايا اللمفاوية الماوس، والمبيض خطوط الخلايا السرطانية البشرية (OVCAR8، HEYA8) يتم تقييمها باستخدام تقنية على "خلية Deformer" ميكروفلويديك. نتائج ممثلة للمرة ع?...

Discussion

نحن هنا توفير إجراء تجريبي شامل لتحليل تشوه الخلايا تمر عبر قنوات ميكروفلويديك مقيدة باستخدام تدفق ضغط يحركها. وهناك سيناريو MATLAB يمكن معالجة البيانات الآلي (المواد التكميلية). يتم الاحتفاظ نسخة محدثة من قانون ( www.ibp.ucla.edu/research/rowat )....

Disclosures

الكتاب ليس لديهم تضارب المصالح في الكشف عنها.

Acknowledgements

فإن الكتاب أود أن نعترف لويد اونغ لإدخال بناء في الإصدارات الأولى من هذه التقنية، والدكتور جيريمي Agresti لغطاء الضغط نصائح التصميم، والدكتور دونغبينغ تشى لمساعدته في افتعال غطاء الضغط. نحن ممتنون للمختبرات M. Teitell وP. Gunaratne لتوفير مجموعة متنوعة من العينات خلية للاختبار. نحن ممتنون لمؤسسة العلوم الوطنية (التوظيف جائزة DBI-1254185)، ومركز جونسون الشامل للسرطان في جامعة كاليفورنيا، وجامعة كاليفورنيا ومعهد العلوم السريرية بالحركة لدعم هذا العمل.

Materials

NameCompanyCatalog NumberComments
Pluronic F-127 Block Copolymer Surfactant Fisher Scientific 8409400Produced by BASF, also available through Sigma
PDMS base and crosslinkerEssex BrownellDC-184-1.1Product commonly named Sylgard 184 Elastomer
Oxygen plasma discharge unitEnerconDyne-A-Mite 3D Treater
Biopsy Punch, Harris Uni-Core (0.75 mm)Ted Pella, Inc.15072
Fingertight Ferrule, 1/32"Upchurch ScientificUP-F-113
Fingertight III Fitting, 10-32Upchurch ScientificUP-F-300X
Polyetheretherketone (PEEK) tubing, outer diameter = 1/32"or 0.79 mmValcoTPK.515-25M
Polyethylene (PE-20) tubing, 0.043" or 1.09 mmBecton Dickinson427406
Pressure regulatorAirgas or Praxair
Polyurethane tubing, 5/32” ODMcMaster Carr5648K284
Push-to-connect fittingsMcMaster Carr5111K91
Voltage to Pressure (E/P) Electropneumatic ConverterOmegaIP413-020
16-bit, 250 kS/S, 80 Analog Inputs Multifunction DAQNational InstrumentsNI PCI 6225-779295-01
Analog Connector Block-Screw TerminalNational InstrumentsSCB-68-776844-01
LabView System Design SoftwareNational Instruments
MATLAB SoftwareThe MathWorks, Inc.MATLAB R2012aCode requires the Image Processing Toolbox
Shielded CableNational InstrumentsSHC68-68

References

  1. Doerschuk, C. M., Beyers, N., Coxson, H. O., Wiggs, B., Hogg, J. C. Comparison of neutrophil and capillary diameters and their relation to neutrophil sequestration in the lung. Journal of applied physiology. 74 (6), 3040-3045 (1993).
  2. Fidler, I. J. The pathogenesis of cancer metastasis: the `seed and soil’ hypothesis revisited. Nature Reviews Cancer. 3, 453-458 (2003).
  3. Jowhar, D., Wright, G., Samson, P. C., Wikswo, J. P., Janetopoulos, C. Open access microfluidic device for the study of cell migration during chemotaxis. Integrative biology: quantitative biosciences from nano to macro. 2 (11-12), 648-658 (2010).
  4. Hou, H. W., Li, Q. S., Lee, G. Y. H., Kumar, A. P., Ong, C. N., Lim, C. T. Deformability study of breast cancer cells using microfluidics. Biomedical microdevices. 11 (3), 557-564 (2009).
  5. Byun, S., et al. Characterizing deformability and surface friction of cancer cells. Proceedings of the National Academy of Sciences. 110 (19), 7580-7585 (2013).
  6. Rosenbluth, M. J., Lam, W. A., Fletcher, D. A. Analyzing cell mechanics in hematologic diseases with microfluidic biophysical flow cytometry. Lab on a chip. 8 (7), 1062-1070 (2008).
  7. Chen, J., et al. Classification of cell types using a microfluidic device for mechanical and electrical measurement on single cells. Lab on a Chip. 11 (18), 3174 (2011).
  8. Zheng, Y., Shojaei-Baghini, E., Azad, A., Wang, C., Sun, Y. High-throughput biophysical measurement of human red blood cells. Lab on a Chip. 12 (14), 2560 (2012).
  9. Zheng, Y., Nguyen, J., Wang, C., Sun, Y. Electrical measurement of red blood cell deformability on a microfluidic device. Lab on a Chip. 13 (16), 3275 (2013).
  10. Hogg, J. C. Neutrophil kinetics and lung injury. Journal of applied physiology. 67 (4), 1249-1295 (1987).
  11. Hochmuth, R. M. Micropipette aspiration of living cells. Journal of biomechanics. 33 (1), 15-22 (2000).
  12. Yap, B., Kamm, R. D. Cytoskeletal remodeling and cellular activation during deformation of neutrophils into narrow channels. Journal of applied physiology. 99 (6), 2323-2330 (2005).
  13. Bow, H., et al. A microfabricated deformability-based flow cytometer with application to malaria. Lab on a Chip. 11 (6), 1065-1073 (2011).
  14. Qi, D., Hoelzle, D. J., Rowat, A. C. Probing single cells using flow in microfluidic devices. The European Physical Journal Special Topics. 204 (1), 85-101 (2012).
  15. Doll, J. C., et al. SU-8 force sensing pillar arrays for biological measurements. Lab on a Chip. 9, 1449-1454 (2009).
  16. Huntington, M. D., Odom, T. W. A Portable, Benchtop Photolithography System Based on a Solid-State Light Source. Small. 7 (22), 3144-3147 (2011).
  17. Grimes, A., Breslauer, D. N., Long, M., Pegan, J., Lee, L. P., Khine, M. Shrinky-Dink microfluidics: rapid generation of deep and rounded patterns. Lab on a chip. 8 (1), 170-172 (2008).
  18. Rowat, A. C., Weitz, D. A. Chips & Tips: see where to punch holes easily in a PDMS microfluidic device. Lab on a Chip. 8, 1888-1895 (2008).
  19. Meyer, P., Kleinschnitz, C. Retinoic Acid Induced Differentiation and Commitment in HL-60 cells. Environmental Health Perspectives. 88, 179-182 (1990).
  20. Olins, A., Herrmann, H., Lichter, P., Olins, D. E. Retinoic Acid Differentiation of HL-60 Cells Promotes Cytoskeletal Polarization. Experimental Cell Research. 254 (1), 130-142 (2000).
  21. Rosenbluth, M. J., Lam, W. A., Fletcher, D. A. Force Microscopy of Nonadherent Cells: A Comparison of Leukemia Cell Deformability . Biophysical Journal. 90 (8), 2994-3003 (2006).
  22. Tsai, M., Waugh, R., Keng, P. Changes in HL-60 cell deformability during differentiation induced by DMSO. Biorheology. 33 (1), 1-15 (1996).
  23. Rowat, A. C., et al. Nuclear Envelope Composition Determines the Ability of Neutrophil-type Cells to Passage through Micron-scale Constrictions. Journal of Biological Chemistry. 288 (12), 8610-8618 (2013).
  24. Lam, W. A., Rosenbluth, M. J., Fletcher, D. A. Chemotherapy exposure increases leukemia cell stiffness. Blood. 109 (8), 3505-3508 (2007).
  25. Bhattacharya, S., Datta, A., Berg, J. M., Gangopadhyay, S. Studies on surface wettability of poly(dimethyl) siloxane (PDMS) and glass under oxgen-plasma treatment and correlation with bond strength. Journal of Microelectromechanical Systems. 14 (3), 590-597 (2005).
  26. Wu, M. H. Simple poly(dimethylsiloxane) surface modification to control cell adhesion. Surface and Interface Analysis. 41 (1), 11-16 (2009).
  27. Unger, M. A., Chou, H. P., Thorsen, T., Scherer, A., Quake, S. R. Monolithic Microfabricated Valves and Pumps by Multilayer Soft Lithography. Science. 288 (5463), 113-116 (2000).

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Explore More Articles

91 microfluidics

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved