البكتيريا موجودة في كل مكان في البيئات المعقدة ثلاثية الأبعاد والمسامية مثل الأنسجة البيولوجية والمواد الهلامية والتربة تحت السطحية والرواسب. هنا نقوم بتطوير طريقة لطباعة مستعمرات كثيفة من البكتيريا 3D في مصفوفات هيدروجيل حبيبية محشورة لدراسة نموها وحركتها في البيئات المعقدة. كشفت الدراسات عن اختلافات غير معروفة سابقا في خصائص انتشار البكتيريا التي تعيش في البيئات المسامية مقارنة بتلك الموجودة في المزارع السائلة على الأسطح المستوية.
تطوير استخدام مصفوفات هيدروجيل حبيبية تتكون من جزيئات هيدروجيل متوافقة حيويا محشورة منتفخة في الثقافة البكتيرية السائلة كأطباق بتري مسامية لحصر الخلايا في 3D. اقتصرت الدراسات السابقة على أحجام عينات صغيرة حوالي مل واحد ، وبالتالي مقاييس زمنية تجريبية قصيرة ، وكانت محدودة أيضا في قدرتها على تحديد هندسة اللقاح بدقة مكانية عالية. لقد أثبتنا أن خصائص انتشار الخلايا للبكتيريا تعتمد على حجم المسام وحركة الخلية.