As bactérias são ubíquas em ambientes complexos, tridimensionais e porosos, como tecidos biológicos e géis, solos e sedimentos subsuperficiais. Aqui desenvolvemos um método para imprimir em 3D colônias densas de bactérias em matrizes granulares de hidrogel para estudar seu crescimento e motilidade em ambientes complexos. Estudos têm revelado diferenças até então desconhecidas nas características de disseminação de bactérias que habitam ambientes porosos em comparação com aquelas em culturas líquidas em superfícies planas.
O desenvolvimento do uso de matrizes granulares de hidrogel compostas por partículas de hidrogel biocompatíveis emperradas inchadas em cultura bacteriana líquida como placas de Petri porosas para confinar células em 3D. Estudos anteriores foram limitados a pequenos volumes de amostra em torno de um ml e, portanto, escalas de tempo experimentais curtas, e também foram limitados em sua capacidade de definir geometrias de inóculos com alta resolução espacial. Estabelecemos que as características de propagação celular das bactérias dependem do tamanho dos poros e da motilidade da célula.