一个<em&gt;在体外</em&gt;对雌激素敏感的乳腺癌休眠模式在骨髓中:分子机理研究与假设生成的一个工具

摘要

We developed an in vitro model of dormancy in the bone marrow for estrogen-sensitive breast cancer cells. The goal of this protocol is to demonstrate use of the model for the study of the molecular and cellular biology of dormancy and for generation of hypotheses for subsequent testing in vivo.

摘要

The study of breast cancer dormancy in the bone marrow is an exceptionally difficult undertaking due to the complexity of the interactions of dormant cells with their microenvironment, their rarity and the overwhelming excess of hematopoietic cells. Towards this end, we developed an in vitro 2D clonogenic model of dormancy of estrogen-sensitive breast cancer cells in the bone marrow. The model consists of a few key elements necessary for dormancy. These include 1) the use of estrogen sensitive breast cancer cells, which are the type likely to remain dormant for extended periods, 2) incubation of cells at clonogenic density, where the structural interaction of each cell is primarily with the substratum, 3) fibronectin, a key structural element of the marrow and 4) FGF-2, a growth factor abundantly synthesized by bone marrow stromal cells and heavily deposited in the extracellular matrix. Cells incubated with FGF-2 form dormant clones after 6 days, which consist of 12 or less cells that have a distinct flat appearance, are significantly larger and more spread out than growing cells and have large cytoplasm to nucleus ratios. In contrast, cells incubated without FGF-2 form primarily growing colonies consisting of >30 relatively small cells. Perturbations of the system with antibodies, inhibitors, peptides or nucleic acids on day 3 after incubation can significantly affect various phenotypic and molecular aspects of the dormant cells at 6 days and can be used to assess the roles of membrane-localized or intracellular molecules, factors or signaling pathways on the dormant state or survival of dormant cells. While recognizing the in vitro nature of the assay, it can function as a highly useful tool to glean significant information about the molecular mechanisms necessary for establishment and survival of dormant cells. This data can be used to generate hypotheses to be tested in vivo models.

引言

乳腺癌细胞转移到骨髓病前是可检测^1，只要小的肿瘤发展的血管^2,3。转移过程是快，但效率不高。细胞迅速进入新的血管，在数百万个⁴天，但行程到远处器官⁵几年生存。尽管如此，一些微生存在骨和可以发现以单细胞或在从初诊患者¹骨髓抽吸小细胞团块。这些细胞抗蚀辅助化疗，其施用于消除他们⁶的根本目的。这种阻力被赋予的，基本上，通过存活通过与骨髓微^7,8-相互作用信令发起的。微转移可以在大约三分之一的妇女局部乳腺癌的发现，代表了生存的独立指标时，单因素分析分析^9。一些microme转移瘤是开始增长，但复发模式依赖于细胞类型。例三阴性乳腺癌往往1〜4年之间复发，这表明穷人控制了休眠状态。其他类型的细胞，包括ER / PR +细胞，可以保持休眠长达20年，复发¹⁰的稳定，连续速率。而在ER +和ER-乳腺癌细胞系和肿瘤之间休眠的 ​​基因表达签名的差异反映了不同的休眠潜力^11，与骨髓基质相互作用可能代表到休眠一个显著的贡献。

休眠体内的研究是非常困难的，因为微是罕见的，是由寡不敌众造血细胞超过10倍^6。因此，相关模型必须产生提供体外数据可以建议机制和产生体内检验的假设。一些休眠模式，包括MATHEmatical车型^12,13， 在体外模型^7,8,14,15， 体内异种移植模型^16， 在体外组合和异种移植模型^17,18和自发肿瘤和转移模型^19，已经取得了一些见解，癌细胞休眠²⁰ 。这些模型有其自身的局限性和本身用于产生有关的分子信号和支配休眠到在多种生物相关模型中进行测试的相互作用的假设主要是有用的。

界定休眠的 ​​分子机制，以导致在周期停滞，再分化和治疗抗性和机制的微环境造成复发的ER +细胞的相互作用的总体目标，我们开发了提供选择的相关内容的体外模型基质微环境^7。这种模式，而在其康波相对稀疏堂费，是足够坚固，以​​允许研究者得出影响休眠显著职能特定的分子机制。这些实验产生可在体内直接测试假设。该模型依赖于我们证明是有关休眠中的几个关键要素。它们包括在一个克隆的密度，其中它们的相互作用是主要与基质和介质的可溶性组分，纤连蛋白基质和碱性成纤维细胞生长因子的存在下，用雌激素 - 依赖的乳腺癌细胞中，细胞培养物（FGF-2）在介质中。

我们特征在于支配系统在体外机制，包括诱导细胞周期阻滞由FGF-2的^21中 ，通过^TGFβ22介导的，生存通过PI3激酶^7,8和ERK ⁸和形态发生分化信令上皮表型，这依赖于RhoA的失活，整45;5β1上调和间质纤维连接蛋白生存^7,15结扎（ 图1）。 FGF-2对MCF-7细胞的体外细胞周期的影响开始在浓度至少一个对数低于10毫微克/毫升^21,23。基本原理是基于FGF-2的表达治乳腺导管形态，循环扩张和衰退在许多哺乳动物系统^24-27的时间控制。我们证明了FGF-2的诱导分化，包括导管形态发生在3D培养^28，而FGF-2的表达通常失去了与人类肿瘤²⁹的恶变。 FGR1的表达仍然完好无损调查中的²⁹和MCF-7细胞乳腺癌继续对所有4 FGF受体^30。在休眠的 ​​上下文中，FGF-2是由出口和重沉积在骨髓基质^31,32在那里它在造血干细胞³³的保存功能。我们DEMonstrated的FGF-2诱导ER +乳腺癌细胞纤维连接蛋白基质，还含有丰富的骨髓，它诱导分化形态培养⁷休眠状态。在模型中，乳腺癌细胞的生长抑制，灭活的Rho一种贯穿RhoGap GRAF，再分化到上皮表型和重新表达整联α5β1lost与恶性进展。它们结合纤连蛋白通过整合素α5β1和激活存活信号使得它们对细胞毒药物治疗^7,8,15（ 图1）的抵抗力。卢的GTP酶类的抑制先前已证明诱导休眠型^34。

在这里，我们将概述的具体程序，将允许调查人员建立模型，并研究规范ER +乳腺癌细胞的休眠特异的分子和细胞机制。在这里介绍的实验来说明使用该模型的我们靶向PI3K途径（ 图1B）与Akt的抑制剂和PI3K抑制剂和Rho家族（ 图1B）与泛Rho抑制剂和作为Rho激酶（ROCK）抑制剂的所有成员。

研究方案

1.克隆分析

1. 制备的雌激素依赖性乳腺癌细胞系的单个细胞悬浮液使用步骤MCF-7和T47D细胞概述如下
   1. 从10cm的组织培养皿这是不超过50％的汇合与MCF-7或T-47D细胞吸出培养基（DMEM / 10％热灭活的胎牛血清/谷氨酰胺和青霉素/链霉素）。冲洗用PBS。孵育胰蛋白酶0.25％/ 2.21毫摩尔EDTA溶解在DMEM高葡萄糖，在37℃下进行1-4分钟。
   2. 检查细胞在相差显微镜下1分钟的间隔，以确保单细胞分布。悬浮细胞用2毫升吸管吹打上下数次以破坏细胞 - 细胞接触，以实现一个几乎不变的，单细胞的状态。
   3. 继续培养细胞中的胰蛋白酶在37℃至4分钟，如果你只有2分钟的潜伏期后观察细胞团块。如果他们仍然附着到e不要使用这些细胞克隆研究ACH胰酶消化后4分钟，因为其他错误将在菌落数收益率被引入。
      注意:如果细胞结块，形成的菌落的数量将反映细胞比孵育数少的乘积。如果细胞过度胰蛋白酶，它们的克隆潜力可能会减少。
   4. 制备1500个细胞/ ml培养基的单细胞悬浮液为24孔板，或更小，（+ 500细胞/ ml，这取决于细胞类型或通道数），由在一个主管含有所需的整个卷系列稀释所有实验中的变量。
      注意:我们的目标是一个最终细胞800细胞/ cm ^2（约500至1100个细胞/ cm ²的范围内）的密度。我们的目标是产生大约100±50菌落，这允许相对容易计数，防止拥挤并允许足够菌落导致显著统计差异，当菌落增加或减少实验perturba系统蒸发散。
2. 在克隆形成密度使用步骤细胞培养下文概述
   1. 孵育细胞一式四份孔24以及纤连蛋白包被的板在1500细胞的产克隆密度/孔从1500个细胞/ ml的主单细胞悬浮液管。通过制定3毫升和分配在每2个孔1毫升介质磨碎含有细胞用5毫升吸管的介质。
      注:纤连蛋白包被的平板应该购买预涂覆从商业供应商。控制的质量的外涂层板，自动化过程导致不平坦的表面不适合于该测定。
   2. 吹打向上和向下混合悬浮液5毫升吸管，吸取涨3 mL细胞悬液，并填写2井每1ml。填补只2孔中从一个移液管的任何一个时间。再次归还剩余量在吸管的细胞悬液在主管，悬浮细胞吹打向上和向下，并拟定另有3毫升填补另外2 WELLS与每1ml。
      注:主管的连续混合是必要的，因为细胞会不断沉降。制订足够的体积，以填补仅2个孔是必要的，以类似的细胞数增加至每孔，因为细胞中的吸移管沉淀为好。
   3. 工作迅速分发大量细胞，因为使细胞坐在悬浮液在室温和CO ₂浓度将调节其克隆生成电位（未发表意见）。
   4. 吹打成井菌落检测的行为在优化细胞的空间分布。这样做通过缓慢吹打含有最终细胞浓度入井的中间暂停。不要使板进一步动作之前，细胞沉淀在底部。不要摇动板，因为圆形混合将有效地离心细胞井创造高细胞密度和不可数合流菌落周边6天。
      注意:不要混用，除非必要，因为这比没有混合不太理想，在所有引进的细胞悬液卷后。如果需要以混合细胞，通过移动板来回在垂直的方向上，而在于在一个平面上这样做。
   5. 孵育细胞，在37℃，5％CO _2，而不更换培养基为6天。在一个6后以及天少量细胞不会显著影响营养或细胞因子组合物也没有原始介质的pH。
   6. 设计该试验的时间过程如下:孵育细胞上在第1天纤连蛋白涂覆的基质替换现有介质用1ml新鲜培养基或含有新鲜培养基的FGF-2 10上如下面第6天0天染色细胞纳克/毫升1.4）。 130进行3天的任何实验扰动，如下）。
3. 分子信号或粘附分子的设立实验扰动
   1. 在第3天，添加10056;升含有扰动剂的最终预期浓度的10倍，以1毫升培养基中的孔中的溶液。不要混用。继续孵育细胞在37℃，5％CO ₂的额外的3天。
      注:扰动剂可以包括多种抑制剂和粘附分子，受体或其它表面蛋白，细胞内信号通路，分子，因子，辅因子或结构蛋白的抑制剂的阻断剂，这可能在支持休眠状态中起作用。
   2. 第6天色斑殖民地，如下所示。
4. 染色殖民地
   1. 6天后在培养用新鲜的0.1％结晶紫在2％乙醇/ 10mM的硼酸钠（pH9.0）中的溶液染色细胞。抽吸培养基并添加1毫升结晶紫溶液到各孔20分钟。
   2. 通过与国内外开口朝下锐角变成一个冰桶洋溢着不断流动的自来水浸泡洗净他们板水在水槽。倾斜板水平角度水下后，开井下来，然后向后倾斜锐角在一个温和的流动动除去时。
   3. 重复浸渍2次或3次，直到水在孔的底部是不再蓝色。剧烈洗涤可除去细胞或菌落不太粘附由于实验介入，显著在数量和数据的误差加。
   4. 干板隔夜放置它们在邻近其相应的标记覆盖了台式毛巾倒挂。
5. 菌落计数
   1. 计数在各后阱6天孵育，染色和干燥生长和休眠的菌落数。在倒置相差显微镜最佳为40X放大率计数菌落。计数> 30个细胞的集落作为生长和12个或更少细胞的集落，以相比生长的细胞，大EXPA非常大尺寸的外观形态nded细胞质大细胞质至细胞核的比率，在图1 ^7,15所示。
      注:13-29细胞簇通常不计算在内，因为它们不是很频繁，直截了当休眠测定。他们如果能转移的扰动无论是增长还是在休眠细胞的增长潜力被计算在内。然后这些结果将需要与生物学意义相关联。

2.克隆形成孵化的免疫荧光研究

1. 在6孔板调整细胞数约为7,500-8,000细胞/孔，以对应于细胞数/表面积类似于24孔试验。
2. 将一个圆，无菌，纤维连接蛋白包盖玻片到每口井基地的6孔板之前除了细胞成像研究。吸管细胞在3ml体积为每孔2个孔，在一个时间，在浓度概述的，如在1.2中描述的克隆形成实验段）。
3. 细胞培养6天，如在1.2.4和1.2.5以上。加入扰动因素，在第3天在10倍浓度的300微升量，如在1.3中集落检测过程中的说明）。
4. 染色的细胞在第6天用抗体与细胞黏附分子如整合素α4，α5，α6，β1，β3，例如，粘着斑复合分子FAK，桩蛋白和纽蛋白，例如，涉及能动性蛋白质如α微管蛋白，例如，信号通路成员如磷酸化Akt，磷酸-ERK，磷酸化p38，磷酸化JNK，例如，或任何其他蛋白质即调查其在休眠作用的目标，使用标准技术进行直接或间接的免疫荧光染色。
   1. 用钳子一天丙酮去除幻灯片6.修复/甲醇1:1 -20 °下进行20分钟，并风干。一个替代的固定剂，如多聚甲醛，也可以使用，如果有必要的。透细胞用0.1％的Triton X-100，0.1％柠檬酸钠2分钟˚F或检测细胞内的抗原。用PBS洗涤细胞。
   2. 对于间接免疫荧光染色，进行1小时，在室温下用5％BSA或与来自在其中产生的二次抗体的物种的10％免疫前血清块滑动。
   3. 孵育过夜，在4℃下用初级抗体与细胞粘附分子，焦复杂分子，信号传导途径的成员或任何其它蛋白，其调查其在休眠作用稀释至在PBS中由制造商推荐特定稀释度的目标0.1％TRITON X -100。
   4. 用PBS洗3次。孵育盖玻片用荧光团标记的抗体，在室温下搅拌2小时。作为一个例子，的Alexa Fluor 488驴抗小鼠IgG抗体可用于检测鼠单克隆初级抗体。山盖玻片细胞面朝下放在使用抗淬灭剂达皮载玻片上。密封用指甲油的周长。
   5. 对于直接免疫荧光法，开展BSA如上述2.4.2）阻挡，孵育荧光团共轭的第一抗体过夜，在4℃。用PBS洗3次。孵化与抗淬灭剂和DAPI和密封用指甲油的幻灯片。
   6. 盖滑动托盘铝箔和储存在4 °下成像和摄影随时随地长达数星期后。在使用放大1000倍配备有照相机任何荧光显微成像系统查看和照片细胞。
   7. 为纤维状的肌动蛋白染色，在1％牛血清白蛋白（BSA）30分钟，并在室温下孵育在BODIPY FL-Phallacidin（绿色）或罗丹明鬼笔环肽（红色）20分钟块滑动。添加抗淬灭剂和密封以上。

3.克隆形成孵化的分子生物学研究

1. 蛋白质印迹
   1. 孵育ER +乳腺癌细胞MCF-7或T47D以20,000个细胞/ 60毫米的钢板和50,000细胞/ 100毫米的钢板上fibronec克隆密度镀锡在5％CO ₂板在37℃。
   2. 孵育细胞以75,000细胞/ 100mm板为分子研究需要毫克量从裂解物蛋白质稍高的密度。最多可使用每个实验点十大板块，收集足够的蛋白质，使用Western印迹分子研究或RNA分离为北印迹。
   3. 细胞数量基凝胶负载是一个必要的辅助在大大不同大小的种植与休眠细胞比较蛋白的表达。通过胰蛋白酶处理收集细胞，并在0.2％台盼蓝的制备裂解物进行Western印迹，代替刮掉细胞用单刃刀片的计数血球的等分试样。
   4. 离心细胞以10,000 xg离心2分钟，通过抽吸除去培养基，加入200微升裂解缓冲液，超声处理的细胞在裂解缓冲液和测定的蛋白浓度。
   5. 通过将蛋白质产量通过细胞的数量计算每个细胞的蛋白质的量生成的量。加载裂解物成单独的聚丙烯酰胺凝胶，表示蛋白质的代表当量细胞数两者）当量的量，和b）蛋白质的量各孔中。至少25微克蛋白质应加载到每个孔中。
      注意:这将允许生长和休眠细胞，这是在大小和蛋白质含量（ 图1）显著不同之间的比较。
2. 流式细胞仪
   1. 收集从100毫米②塔板细胞通过胰蛋白酶消化，如在3.1，并通过标准荧光激活细胞分选使用伯或仲免疫荧光染色为任一细胞内或细胞外的抗原（FACS）协议分析，如在2.4中概述。
      注意:通过胰蛋白酶消化从组织培养皿拆卸细胞不影响膜蛋白的浓度通过抗体标记来确定。

结果

进行实验以概括的测定。实验的时间过程示于图2A中 。将细胞培养在克隆密度上-1天，FGF-2在新鲜的培养基中加入第0天和细胞进行培养，直到第6天，当它们被染色和菌落计数。任何扰动的系统都在100μl体积在10倍终浓度施用在第3天所需的。 图2B说明了生长和休眠菌落的典型外观。生长的菌落含有> 30个细胞和休眠的 ​​殖民地包含12个或更少的细胞，其许多倍的大?...

讨论

我们的模型是由休眠的骨髓中的几个关键要素。它由雌激素敏感细胞，这是可能保持休眠的 ​​骨髓长时间¹⁰的类型，它包括纤维连接蛋白，骨髓的关键结构元件，FGF-2，生长因子大量由骨髓基质合成的和大量沉积在骨髓细胞在克隆密度，其中它们之间的相互作用主要是与底层的^31,32和温育的细胞外基质。而骨髓微环境是更为复杂，因为需要问特定机械问题这个简单的系统可以建?...

材料

Name	Company	Catalog Number	Comments
MCF-7 cells	ATCC	HTB-22
T47D cells	ATCC	HTB-123
BD BioCoat Fibronectin 24 Well Clear Flat Bottom TC-Treated Multiwell Plate	Corning	354411
BD BioCoat Fibronectin 60 mm Culture Dishes	Corning	354403
BD BioCoat Fibronectin 100 mm Culture Dishes	Corning	354451
BD BioCoat 22x22mm #1 Glass Coverslip with a uniform application of human fibronectin	Corning	354088
6 Well tissue culture plate	CellTreat	229106
Dulbecco Modified Eagle Medium High Glucose 10X Powder	Corning Life Sciences	50-013-PB
Heat Inactivated, Fetal Bovine Serum	Serum Source International	FB02-500HI
0.25% Trypsin/2.21 mM EDTA	Corning	25-053-CI
Penicillin-Streptomycin Solution, 100X	Corning	30-002-CI
L-Glutamine, 100x, Liquid	Corning	25-005-CI
Recombinant Human FGF basic	R&D Systems	234-FSE-025
Akt Inhibitor (1L6-Hydroxymethyl-chiro-inositol-2-(R)-2-O-methyl-3-O-octadecyl-sn-glycerocarbonate)	CalBiochem	124005
LY294002	CalBiochem	19-142	Chenical PI3K inhibitor
C3 transferase	Cytoskeleton	CTO3	Inhibits RhoA, RhoB, and RhoC, but not related GTPases such as Cdc42 or Rac1
Y-27632 dihydrochloride	Santa Cruz Biotechnology	129830-28-2
BODIPY FL-Phallacidin (green)	Molecular Probes	B607	Fluorochrome for fibrillar actin staining
BODIPY FL-Rhodamine phalloidin (red)	Molecular Probes	R415	Fluorochrome for fibrillar actin staining
Alexa Fluor 488 Donkey anti-Mouse IgG Antibody, ReadyProbes Reagent	Molecular Probes	R37114
ProLong Gold Antifade Mountant with DAPI	Molecular Probes	P-36931