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基因编码荧光是一种受欢迎的非侵入性的转基因记者。使用自动纵向荧光成像气体和温度优化记录仪 (鳄鱼), 使纵向记录从生物发光细胞在广泛的条件。在这里, 我们展示了如何在生理节律研究的背景下使用鳄鱼。
Luciferase-based 记者的细胞基因表达是广泛使用的纵向和 end-point 的生物活性测定。例如, 在昼夜节律研究中, 与萤火虫荧光的时钟基因融合, 在细胞生物发光中产生了强健的节律, 持续了许多天。与光电倍增管 (PMT) 或常规 microscopy-based 方法相关的技术限制通常要求在相当 non-physiological 的条件下维持细胞和组织记录, 在灵敏度和吞吐量之间进行权衡。在这里, 我们报告了以前的方法, 允许长期生物荧光成像高灵敏度和吞吐量, 支持广泛的文化条件, 包括可变气体和湿度控制, 并接受许多不同组织培养皿和盘子。这种自动纵向荧光成像气体和温度优化记录仪 (鳄鱼) 也允许观察空间变化的荧光表达横跨细胞单层或组织, 这是不能轻易地观察到传统方法.我们强调了鳄鱼是如何提供极大的灵活性, 以检测荧光活动与现有的方法相比。
luciferases 作为基因表达和蛋白质活动的记者, 已成为分子和细胞生物学研究的热门技术。在昼夜节律领域是如此, 萤火虫荧光合成和催化失活的动力学特别适合报告在大约 24 h 昼夜周期内发生的基因表达的纵向变化。因此, 荧光被用来作为一个昼夜记者横跨广泛的有机体, 包括真菌, 植物, 苍蝇和哺乳动物1,2,3,4。
当量化的昼夜节律基因表达在体外, 光电倍增管 (PMT) 通常用于记录生物发光信号。PMT-based 测量的灵活性有限, 但通常被限制在预先确定的盘子或盘子的大小。也不可能从使用 PMT 进行监测的样本中收集任何空间信息, 这可能导致在荧光表达式中显示空间变化的图像样本时丢失信息。此外, 由于 PMT 和相关电子产品在标准细胞培养孵化器的湿化环境中容易发生故障, 因此使用并联的纵向荧光记录总是在 non-humidified 恒温箱中进行。因此, 细胞培养皿必须密封密闭, 以防止蒸发水分流失, 因此培养基必须缓冲 3-(N-吗) 磺酸 (拖把) 或 4-(2-羟乙基)-1-piperazineethanesulfonic 酸 (HEPES), 而不是 CO2/碳酸氢盐缓冲系统, 功能的在体内和日常使用的哺乳动物组织培养。
由于这些限制, 并联的生物荧光测量通常会对实验期间维持细胞的条件施加严格的限制。为了克服这些问题, 也为了增加可能的实验条件的范围, 我们使用了一个标准 CO2/N 个2 170 L 组织培养孵化器, 它已经适应了添加一个 water-chilled 电子倍增电荷耦合器件 (EMCCD) 相机与 anti-mist 光学和数字控制的温度和气体水平。这被称为自动纵向荧光成像气体和温度优化录音机, 或鳄鱼。鳄鱼允许极大地增加生物荧光成像的灵活性, 既用于标准组织培养皿的高通量成像 (同时可达 6 x 96-或 384-井板), 也可用于非标准的组织培养系统, 如作为微流控装置中的灌注细胞。该仪器还允许在湿化条件下进行成像, 并可对 CO2和 O2分压以及温度进行可变控制。
下面的协议描述了一种使用鳄鱼 (从今以后称为 "生物发光孵化器") 的哺乳动物细胞和组织培养系统的生物发光记录方法。然而, 应该指出的是, 该系统将非常适合生物荧光成像, 并在一些修改, 荧光成像, 在一些其他的生物学系统和环境。
1. 细胞的播种和温度夹带
注意: 该协议已被严格测试使用主要和永生的小鼠成纤维细胞表达 PERIOD2::LUCIFERASE (PER2::LUC) 融合蛋白4。可能需要对使用其他细胞系的实验进行调整。
2. NS21 制剂
注: NS21 是一种无血清补充剂, 用于维持神经细胞和其他细胞培养物。这是一个类似的补充称为 B27 的细化, 这是商业可用的, 可以作为一个血清置换在昼夜生物发光记录9。任何一种补充都可以在记录介质中交替使用, 用于下面描述的实验协议。NS21 in-house 是相当可行和成本效益的, 如陈et al.10, 如下所述。
3. 记录介质准备
注意: 生物发光孵化器的主要优势是其他设备的记录纵向生物发光是, 由于能够 humidify 孵化器和变化的部分压力, O2和 CO2, 它是可能使用更广泛的媒体条件来记录生物荧光-包括更接近于不同细胞类型体内的生理生态位的条件。下面我们描述了改编自黑斯廷斯et al.的记录介质的配方9, 我们经常使用培养成纤维细胞和其他细胞类型。第一个是密封培养条件 (没有气体交换), 第二个是生理相关的条件, 应在湿润条件下使用, 5% CO2。许多其他的变体都是可能的和可取的, 这取决于确切的应用和细胞类型。
注意: 素浓度应根据每个细胞类型和上下文进行经验判断。有关详细信息, 请参阅菲尼et al.11血清和 NS21 (或 B27 如果使用) 浓度可以根据应用变化。然而, 我们确实建议, 除非经实证检验, 否则, 血清和 NS21 (或替代无血清补充剂) 使用, 因为这些促进细胞存活和依恋。在不接触抑制的细胞系中, 可能有必要降低记录介质中的血清浓度, 以防止增殖的混杂效应, 这也是由血清促进的。
4. 记录
5. 灌流组织培养 (可选)
注: 如导言所述, 生物发光培养器适用于非标准组织文化系统的成像。这在发展细胞培养系统中得到了例证。
6. 录音过程中的处理
注意: 有时候, 通过记录来治疗细胞是可取的, 无论是药物还是荷尔蒙。在这种情况下, 必须小心处理细胞, 以防细胞振荡在治疗过程中复位。因此, 这是特别重要的是, 细胞保持在一个恒定的温度, 因为这是一个主要的提示为细胞昼夜节律5,6。
7. 分析
注意: 生物发光孵化器以一系列个人图像的形式生成数据。我们主要使用斐济12来管理这些图像, 然后导出每个区域 (ROI) 的平均像素强度数据以进行进一步分析。
本文概述了一个协议的生物发光成像的哺乳动物细胞使用鳄鱼 (生物发光孵化器)。这种技术允许在成像生物发光系统的物理设置和细胞外条件的灵活性。本文介绍了简单静态组织培养方法 (图 1、辅助视频 1) 和灌流细胞培养 (图 2、辅助视频 2), 但可以使用该系统对许多其他设置进行映像。所有数据都是使用7节所述的方法进行量化的。
图 1A显示了一个生物发光记录的示例视频, 其中包含 PER2::LUC 成纤维细胞的 6 x 96 井板,4。最外层的井不包含细胞, 因为这些不是这个实验所需要的。细胞经历了不同温度的夹带, 藉以他们接受任一温度周期 12 h, 在32° c 跟随 12 h 37 ° c 为 72 h 或逆 (12 h, 在37° c 跟随 12 h, 在32° c 为 72 h), 在被拿着在恒定的37° c 为录音之前。 每小时服用60分钟。其中的两个条件在图 1B中进行了量化。
图 2A显示了用于灌注组织培养的系统的设置示意图。这包括两个通道幻灯片连接与油管。介质通过注射器泵通过细胞驱动。第一个这些幻灯片的作用是气体渗透气泡陷阱 (缓冲幻灯片) 和不包含细胞, 与第二个包含的细胞, 生物荧光记录。在图 2B中显示了来自此系统的代表录制视频。每15分钟服用15分钟。在这里, 细胞维持在标准灌注条件下或在酪蛋白激酶抑制剂 PF670462 的存在, 这已经显示延长昼夜周期和减少时钟基因表达节律在培养哺乳动物细胞14。对 PER2::LUC 表达式的影响在图 2C (顶部面板) 中显示, 在图 2C (底部面板) 所示的标准静态细胞培养条件下, 使用相同浓度的药物处理的细胞, 具有周期的量化如图 2D所示。从这是清楚的那治疗与 PF670462 影响 PER2::LUC 表示在两套条件之下。然而, 在灌流条件下处理 PF670462 的细胞显示周期延长约 3 h (3 ±0.9 h), 在静态条件下治疗的细胞在药物显示大的时期延长至 #62 期; 48 小时。这可以由一个阻尼余弦, 如7节所述, (extra-sum-of-squares F 测试vs一条直线, p & #60; 0.0001)。有趣的是, 灌注期延长的幅度更接近于观察到的在体内14。
图 1: 数据示例.(A) 示例生物发光孵化器中 6 x 96 井板中永生化 PER2::LUC 生物发光的视频快照。在补充视频 1中用黄色突出显示了要量化的井。(B) 从 A 的生物荧光定量。两组3片细胞采用温度循环 (12 h, 在32° c; 12 h, 在37摄氏度) 相互 anti-phasic, 产生 PER2 蛋白表达的相反阶段 (n = 6, 平均± SEM)。请单击此处查看此图的较大版本.
图 2: 用 CK1δ抑制剂进行灌注.(A) 灌注系统示意图。(B) 示例 PER2::LUC 细胞在灌注下的生物荧光记录的视频快照。量化的样本区域以黄色突出显示。(C) 对 PER2::LUC 成纤维细胞在灌注和静态条件下的生物发光进行量化, 并在无3µM CK1 抑制剂 PF670462 (n = 3, 均值± SEM)。生物发光已经被标准化为最小值和最大数值。(D) 期间分析 (双向方差计算, 栎-Sidak 的多重比较测试)。请点击这里查看更大版本的这个数字。
组件 | 最终介质浓度 (μ m) | 库存 (毫克/毫升) | 400毫升 NS21 |
牛白蛋白 | 37 | - | 50克 |
过氧化氢 | 0.01 | - | 50毫克 |
胱 | 3。2 | - | 20毫克 |
胰岛素 | 0。6 | 10 | 8毫升 |
超氧化物歧化酶 | 0.077 | - | 50毫克 |
全息-转铁蛋白 | 0.062 | - | 100毫克 |
T3 (triiodo-甲状腺素) | 0.0026 | 2 | 20µL |
l-肉碱 | 12 | - | 40毫克 |
胺 | 16 | 液体 (1 克/毫升) | 20µL |
d-(+)-半乳糖 | 83 | - | 300毫克 |
腐 | 183 | - | 322毫克 |
亚硒酸钠 | 0.083 | 1 | 280µL |
皮质 | 0.058 | 2 | 0.2 毫升 |
亚油酸 | 3。5 | 100 | 0.2 毫升 |
亚麻酸 | 3。5 | 100 | 0.2 毫升 |
硫辛酸 | 0。2 | 4。7 | 0.2 毫升 |
孕 | 0.02 | 3。2 | 0.04 毫升 |
醋酸黄醇 | 0。2 | 20 | 0.1 毫升 |
视黄醇, 所有反式 | 0。3 | 10 | 0.2 毫升 |
D, l-α-生育酚 | 2。3 | 100 | 0. 2 毫升 |
D, l-α-生育酚醋酸酯 | 2。1 | 100 | 0.2 毫升 |
表 1: NS21 准备。
补充视频 1: 来自井板的生物发光的示例视频。例子视频快照的生物发光从永生化 PER2::LUC 在 6 x 96 井板在生物发光孵化器。要量化的水井用黄色突出显示。请单击此处下载此文件.
补充视频 2: 在灌注下 PER2::LUC 细胞的生物发光记录的示例视频快照.量化的样本区域以黄色突出显示。请单击此处下载此文件.
这里所描述的协议是哺乳动物细胞培养, 无论是在灌注和静态条件。然而, 鳄鱼可以很容易地适应其他模型系统。事实上, 它已经被证明是提供一个优秀的平台, 同时监测运动, 睡眠, 和周边基因表达节律在果蝇在恒定的黑暗中保持15.另据指出, 根据申请的不同, 此处提到的相机类型可能是合适的。我们设想, 使用适当的过滤器, 现有设置的修改版本可以在主体中用于荧光定量。
唯一的应用, 鳄鱼可能不适当的是那些特别高的空间分辨率需要, 如成像的时空组织的 PER2::LUC 表达在器官切片的哺乳动物交叉核, 或其他小组织切片。
鳄鱼使许多实验被执行, 到目前为止不容易地是可实现的由常规录音技术。与目前的生物发光测量方法相比, 鳄鱼在细胞培养皿或滑动片中提供了更大的灵活性, 外部介质条件、灵敏度和 processivity。
这是特别相关的时候, 当有一个远离标准的2D 细胞培养模式, 以3D 化和流培养系统。因此, 预计鳄鱼将提供一种可适应的方法, 在广泛的条件下, 生物荧光可以在许多天和数周内测量。
不存在利益冲突。
我们要感谢凯恩的研究工作, 与我们一起开发这个系统, 特别是马克-汉森, 格雷厄姆和 Correia。我们还感谢大卫威尔士和 Akhilesh 在设计阶段有价值的讨论, 以及彼得 Laskey (以前的滨) 安排贷款的演示相机和大卫王为他的关键投入的手稿。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
DMEM (1x) + GlutaMAX | Gibco | 31966-021 | |
Hyclone FetalClone III Serum | GE Healthcare | SH30109.03 | |
Neurobasal medium | Thermofisher | 21103049 | basal medium |
Bovine Serum Albumin | Sigma | A4919 | |
Catalase | Sigma | C40 | |
Glutathione | Sigma | G6013 | |
Insulin | Sigma | I1882 | |
Superoxide Dismutase | Sigma | S5395 | |
Holo-transferrin | Calbiochem | 616424 | |
T3 (triiodo-L-thyronine | Sigma | T6397 | |
L-Carnitine | Sigma | C7518 | |
Ethanolamine | Sigma | E9508 | |
D (+)-Galactose | Sigma | G0625 | |
Putrescine | Sigma | P5780 | |
Sodium Selenite | Sigma | S9133 | |
Corticosterone | Sigma | C2505 | |
Linoleic Acid | Sigma | L1012 | |
Linolenic Acid | Sigma | L2376 | |
Lipoic Acid | Sigma | T1395 | |
Progesterone | Sigma | P8783 | |
Retinol Acetate | Sigma | R7882 | |
Retinol, all trans | Sigma | 95144 | |
D,L-alpha-Tocopherol | Sigma | 95240 | |
D,L-alpha-Tocopherol acetate | Sigma | T3001 | |
Sodium Bicarbonate Solution | Sigma | S8761-100ML | |
GlutaMAX (100x) | Gibco | 35050-038 | |
Penicillin-Streptomycin | Sigma | P4333 | |
Galaxy 170R incubator | Eppendorf | CO17301001 | |
Luciferin | Biosynth | L-8220 | |
D -(+)-Glucose solution | Sigma | G8644-100ML | |
DMEM powder | Sigma | D5030 | |
MOPS | Sigma | PHG0007 | |
1 mm I.D. silicone tubing | GE Healthcare | 19-4692-01 | |
Elbow luer connector | Ibidi | 10802 | |
Male luer fittings | Ibidi | 10826 | |
Female luer fittings | Ibidi | 10825 | |
µ-slide luer I 0.6 | Ibidi | 80196 | |
BD plastipak 20ml syringe | Becton Dickinson | 300613 | |
1mm I.D. ETFE tubing | GE Healthcare | 18-1142-38 | |
PF670462 | Sigma | SML0795 | |
B27 Supplement (50x) | ThermoFisher | 17504044 | |
iXon Ultra EMCCD camera | Andor | iXon 888 | |
Fiji | ImageJ | N/A | |
Prism 7.0 | Graphpad Software | N/A | |
Trypan blue | Sigma | T8154 | |
Deltaphase Isothermal Pad | Braintree Scientific | 39DP | |
Heated neutral density filter | Cairn Research | Custom item | |
Osmomat 030 | Gonotech | Discontinued | |
300 mOsmol/kg calibration standard | Gonotech | 30.9.0020 | |
Measuring vessel | Gonotech | 30.9.0010 | |
Focusing cylinder | Cairn Research | Custom item | |
NE-1600 programmable syringe pump | Pump Systems inc. | NE-1600 | |
Andor Solis Software | Andor | N/A |
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