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Method Article
使用干细胞来源的心肌细胞进行生物工程改造的三维心脏组织已成为在 体外 研究健康和患病人类心肌的有前途的模型,同时概括了天然心脏生态位的关键方面。该手稿描述了一种用于制造和分析由人类诱导的多能干细胞来源的心肌细胞产生的高内涵工程心脏组织的方案。
心力衰竭仍然是全球死亡的主要原因,因此迫切需要更好的人类心脏临床前模型。组织工程对于基础科学心脏研究至关重要; 体外 人类细胞培养消除了动物模型的种间差异,而更像组织的 3D 环境(例如,具有细胞外基质和异细胞偶联)比塑料培养皿上的传统二维培养更能模拟 体内 条件。然而,每个模型系统都需要专门的设备,例如定制设计的生物反应器和功能评估设备。此外,这些方案通常很复杂,劳动密集型,并且受到小而脆弱组织的失败的困扰。
本文描述了一种使用诱导多能干细胞来源的心肌细胞生成强大的人类工程心脏组织 (hECT) 模型系统的过程,用于组织功能的纵向测量。并行培养六个具有线性条形几何形状的 hECT,每个 hECT 悬挂在连接到 PDMS 架上的一对力感应聚二甲基硅氧烷 (PDMS) 柱上。每个帖子都有一个黑色的PDMS稳定帖子跟踪器(SPoT),这是一项新功能,可提高易用性、通量、组织保留率和数据质量。该形状允许对柱子挠度进行可靠的光学跟踪,从而产生具有绝对主动和被动张力的改进的抽搐力跟踪。帽的几何形状消除了由于 hECT 从柱子上滑落而导致的组织失效,并且由于它们涉及 PDMS 支架制造后的第二步,因此可以将 SPoT 添加到现有的基于 PDMS 柱子的设计中,而无需对生物反应器制造过程进行重大更改。
该系统用于证明在生理温度下测量 hECT 功能的重要性,并在数据采集过程中显示稳定的组织功能。总之,我们描述了一种最先进的模型系统,该系统再现了关键的生理条件,以提高体 外 应用工程心脏组织的生物保真度、效率和严谨性。
工程心脏组织模型具有多种几何形状和配置,用于概括传统二维细胞培养难以实现的天然心脏生态位的各个方面。最常见的配置之一是线性组织条,两端都有柔性锚点以诱导组织自组装,并为组织提供定义的预紧力和由此产生的抽搐力的读数 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12、13、14、15、16、17、18、19、20、21
,22,23,24,25,26,27.通过对组织缩短的光学跟踪,并使用弹性束理论根据测得的挠度和锚栓的弹簧常数计算力,可以稳健地确定产生的力 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12、13、14、15、16、17、18、19、20、
21,22,25,26,28。
然而,心脏组织工程仍然是一个不断发展的领域,仍然存在一些挑战。每个模型系统10,29,30,31都需要专用设备,例如定制的生物反应器和功能评估设备。由于劳动密集型方案、大量细胞和组织脆性,这些构建体的微环境的大小和复杂性通常受到低通量的限制。为了解决这个问题,一些研究小组已经转向制造仅包含数百或数千个细胞的微组织,以促进对药物发现有用的高通量测定。然而,这种缩小的规模使功能12的准确评估变得复杂,消除了天然心脏生态位的关键方面(如营养/氧扩散梯度和复杂结构36),并限制了可用于后续分子和结构分析的材料数量(通常需要组织混合)。表1总结了文献1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15, 16,17,18,19,20,
21,22,23,24,25,26,37,38,39,40。
群 | 每个组织的细胞数 | 每块板的组织 | 板格式 | 锚定功能 | 功能数据采集方法 | 共享媒体浴? | 功能测量- 原地? | ||||
吉田 (ECT)38 | 400万 | 6 | 改良的 6 孔板* | 力传感器 | 直接力测量 | 不 | 不 | ||||
陈 (hESC-CM-ECT)26 | 310 千米 | 6 | 定制 6 孔培养皿 | PDMS帖子 | 直接力测量 | 是的 | 不 | ||||
范伯格 (dyn-EHT)16 | 150万 | 6 | 定制 6 孔培养皿 | PDMS线 | 组织形状 | 不 | 是的 | ||||
RADISIC(生物线)39、40 | 110 千米 | 8 | 高分子线材 | 线材形状 | 是的 | 是的 | |||||
Costa(单 hECT)1, 2 | 1-200万 | 4** | 10 厘米培养皿** | PDMS帖子 | 光学偏转(边缘/物体跟踪) | 是的 | 是的 | ||||
Costa(多 hECT)3–9 | 500 K-100万 | 6 | 6厘米培养皿 | PDMS帖子 | 光学偏转(边缘/物体跟踪) | 是的 | 是的 | ||||
Costa(多 hECT 带 SPoT) | 100万 | 6 | 6厘米培养皿 | 带黑色大写字母的 PDMS 帖子 | 光学偏转(物体跟踪) | 是的 | 是的 | ||||
帕西尔掀背/两厢车(EHT)17 | 245 千米 | 36 | 12孔板 | 带黑色大写字母的 PDMS 帖子 | 光学偏转(物体跟踪) | 是的 | 是的 | ||||
Vunjak-Novakovic13, 18 | 100万 | 12 | 6厘米培养皿 | 带大盖的 PDMS 柱 | 光学偏转(边缘检测) | 是的 | 是的 | ||||
Vunjak-Novakovic(MilliPillar)14 | 550 千米 | 6 | 定制 6 孔培养皿 | 带大盖的 PDMS 柱 | 光学偏转(物体跟踪);钙成像 | 不 | 是的 | ||||
埃申哈根 (EHT)10, 19–21 | 100万 | 12 | 12孔板 | 带大盖的 PDMS 柱 | 光学偏转(后偏转的边缘检测);钙成像 | 不 | 是的 | ||||
赞德斯特拉 (CaMiRi)22 | 25-150 千米 | 96 | 96孔板 | 带钩子的PDMS柱 | 光学偏转(边缘检测) | 不 | 是的 | ||||
穆里23, 24 | 900 千米 | 24 | 24孔板 | 带盖的PDMS接线柱,集成磁铁 | 磁性传感器 | 不 | 是的 | ||||
帝国 (μTUG)11, 12, 25 | 定义 | 156 | 156孔培养皿 | 带盖的PDMS接线柱,集成磁铁 | 光学跟踪(荧光珠) | 是的 | 是的 |
表1:文献中一些线性工程心脏组织模型的特征。 线性工程心脏组织模型在大小、通量、锚定特征设计、共享介质浴的便利性以及对用于功能表征的单独肌肉浴系统的要求方面各不相同。* 研究人员使用了基于标准 6 孔板尺寸的市售工程组织系统。** 一种模块化系统,其中单组织生物反应器以所需的数量和位置锚定在任何塑料培养皿上。
本文描述了构建我们建立的线性人类工程心脏组织 (hECT) 模型的最新协议1,2,3,4,5,6,7,8,9,15,27 以及评估 hECT 收缩功能的方法。每个多组织生物反应器在共享培养基浴中最多可容纳 6 个 hECT,并由两个由有机硅弹性体聚二甲基硅氧烷 (PDMS) 制成的"架"件组成,安装在刚性聚砜框架上。每个PDMS机架包含六个直径为0.5 mm,长为3.25 mm的柔性集成力传感柱,两个机架共同提供六对立柱,每个柱可容纳一个hECT。生物反应器的倒置有助于克服由于培养基中的水冷凝或气液界面弯月面的变形而对hECT的可视化的任何障碍。hECT 的每次收缩都会导致集成端柱的偏转,并且偏转信号的光学测量被处理成表示 hECT 收缩函数的力与时间的追踪 1,2,3,4,5,6,7,8,9,15,27 .与通常用于这种大小组织的单组织生物反应器相比,多组织设计提高了实验通量,并能够研究具有潜在不同细胞组成的相邻组织之间的旁分泌信号传导。该系统已在已发表的研究中得到验证,这些研究描述了疾病建模 4,8、旁分泌信号转导 6,7、异细胞培养 5,9 和治疗筛查 7,9 中的应用。
在该系统中,hECT 设计为长约 6 mm,直径约 0.5 mm,以便以低噪声对力测量进行稳健的光学跟踪。此外,扩散梯度和细胞组织等组织复杂性的各个方面都与每个组织 100 万个细胞的可管理要求相平衡。使用标准CCD相机技术,低至1 μN的力(表示小于5 μm的偏转后)会产生清晰的信号,确保即使是极弱的收缩功能,如某些hECT疾病模型所观察到的那样,也可以准确测量。这也有助于对抽搐力曲线进行详细分析,从而能够对多达 16 个收缩力指标41 进行高内涵分析,包括发展力、收缩率 (+dF/dt) 和松弛率 (−dF/dt) 以及节拍率变异性。
该协议从制造生物反应器组件的说明开始。特别注意最大限度地提高hECT产量,减少组织功能的技术差异,并优化组织评估的质量和深度的步骤。大多数心脏组织工程研究没有报告制造和长期测试期间的组织损失率,尽管这是该领域众所周知的挑战,并降低了研究的通量和效率27。这里描述的组织工程方法经过多年的改进,以确保所有hECT在大多数生物反应器中保留(无论PDMS架是如何制造的)。然而,即使是 5%-20% 的组织损失也会显着影响统计功效,特别是在受可用心肌细胞数量限制的小型实验中(例如,由于某些患病细胞系的分化挑战4 或由于商业购买的心肌细胞的高成本),或受治疗条件(例如,各种治疗化合物的可用性有限或成本高)。
该协议描述了稳定柱跟踪器(SPoTs)的制造,这是PDMS机架的一个新功能,其功能是固定hECT27的力感应柱末端的盖子。它展示了帽的几何形状如何显着减少因掉落或拉下柱子而造成的 hECT 损失,从而为培养具有更多刚度和张力的 hECT 开辟了新的机会,这在无盖柱上培养具有挑战性。此外,SPoT提供了一个高对比度的物体,通过一致且定义明确的形状27来改善hECT收缩的光学跟踪。接下来是根据先前发表的方案 3,42,43 描述培养人诱导多能干细胞 (iPSC) 和心肌细胞分化,并解释 hECT 制造、培养和功能测量。
本文还讨论了在生理温度下测量组织功能的必要性。人心肌(胎儿以及成人健康和患病组织)以及来自多种动物物种(包括大鼠、猫、小鼠、雪貂和兔子)的心脏组织44,45,与生理温度相比,在28°C-32°C的温度下,频率匹配的抽搐力显着增加 - 这种现象称为低温正性肌力45,46.然而,温度对工程心肌组织功能的影响仍未得到充分研究。文献中许多最近的工程心脏组织模型被设计为在37°C下进行功能评估,以接近生理条件13,14,37。然而,据我们所知,尚未系统地研究温度对工程心脏组织产生的力的影响。该协议描述了一种起搏电极设计,该设计可最大限度地减少测试期间的热损失,并允许将绝缘加热元件合并到设置中以进行功能测量,这可以将 hECT 保持在生理温度而不会影响无菌性 27。然后,我们报告了温度对hECT功能的一些观察到的影响,包括对产生的力,自发跳动频率,+dF / dt和−dF / dt。总而言之,本文提供了制造这种多组织力感应生物反应器系统所需的细节,以制造人类工程心脏组织并评估其收缩功能,并提供了一组数据,为室温和 37 °C 下的测量结果提供了比较基础27。
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该协议使用了去识别化的 iPSC 系 SkiPS 31.3(最初使用来自健康 45 岁男性的真皮成纤维细胞重新编程)47,因此,根据该机构的人类研究伦理委员会指南,免于特定的机构审查委员会批准。在无菌条件下,在HEPA过滤的II类生物安全柜或层流工作台中进行所有细胞和hECT操作。通过0.22μm过滤器过滤对所有非无菌溶液进行灭菌,并将所有细胞和hECT保持在37°C,95%相对湿度和5%CO2的培养箱中。
1. 生物反应器制造
图 1:hECT 生物反应器组件。 (A) PTFE底板的顶视图(左)和侧视图(右),有六个均匀分布的孔,用于形成hECT(白色箭头)。(B) PDMS 机架的铝负极母铸件的侧视图(左)和顶视图(右),带有六个均匀分布的柱子(洋红色箭头)和三个用于连接到生物反应器框架的间隙(绿色星号)。(C) PDMS 机架聚砜框架的侧视图(左)和底视图(右),具有三个均匀分布的框架支架(绿色星号),对应于 PDMS 机架铸件中的框架支架(面板 B)。(D) 铝铸件支架的顶视图(顶部)和侧视图(底部),带有四个用于 PDMS 机架铸件的插槽,每个插槽都有一个 0.25 毫米高的三角形搁板(最左侧的搁板以橙色突出显示)。这个数字是从van Neste27修改而来的。缩写:hECT = 人类工程心脏组织;Ø = 直径;PTFE = 聚四氟乙烯;PDMS = 聚二甲基硅氧烷;R = 半径。 请点击这里查看此图的较大版本.
图 2:PDMS 机架的制造。 (A) CAD 效果图显示了铸造设备的倾斜视图。(I) 将负 PDMS 机架主铸件插入铸件支架的四个槽中的每一个,形成 PDMS 柱(洋红色箭头)的孔放置在三角形搁板对面的死角上(图 1D,橙色三角形)。(II)将PDMS倒入负极母铸件的每个型腔中。(III) 将彩色珠子作为颜色编码识别系统添加到未固化的 PDMS 中。(B) 照片显示了组装好的 PDMS 机架铸造装置,该装置用两个 3D 打印支架夹在两侧,由螺丝夹固定到位,并用 0.5 毫米厚的硅胶片(白色箭头)包裹以密封夹紧的侧面。放置彩色珠子,使它们不会覆盖形成柱子的直径为 0.5 毫米的孔(洋红色箭头)。(C) 一旦PDMS固化,铸件就会从铸件支架上取下。(I) 在铸件和铸件支架之间插入钝的不锈钢剃须刀片或类似的薄金属工具,以将铸件从铸件支架 (II) 中撬开。(III) PDMS流经柱子孔形成的薄膜(绿松石支架)附着在柱子的尖端,必须用锋利的刀片(IV,V)切掉。(D) PDMS 机架与铸件分离。(E) 显示 PDMS 机架的倾斜(顶部)、侧面(中部)和底部(底部)视图的照片,其中嵌入了玻璃珠以进行识别(蓝色箭头)。柱子的尖端(橙色箭头)用黑色墨水标记。比例尺 = 1 厘米。这个数字是从van Neste27修改而来的。缩写:CAD = 计算机辅助设计;PDMS = 聚二甲基硅氧烷。请点击这里查看此图的较大版本.
图 3:SPoT 制造。 (A) CAD 效果图,显示 SPoT 铸造夹具的 (I) 底座和 (II) 三叉件的关键尺寸。圆形 SPoT 表单(AI,黑色箭头)的尺寸设置为深 0.2 mm x 直径 1.2 mm,每个表单都包含单个 SPoT 的黑色 PDMS。顶视图(AII,顶部,绿松石矩形)中看到的 11.1 mm x 27 mm 搁板被压低 0.4 mm(如下图侧视图所示),以在固化过程中将 PDMS 搁板固定到位。(B) 显示 SPoT 铸造设备组装的 CAD 渲染图。(C) 组装的 SPoT 铸造设备的照片。(D) PDMS 固化后,将三叉夹具从 PDMS 架下方滑出,并使用细镊子将 SPoT 从孔中释放出来。(E) 不带(顶部)和带(底部)SPoT 的 PDMS 机架的照片。插图显示帖子的放大视图。比例尺 = 1 cm (E)、2.5 cm( E 的放大图像)。这个数字是从van Neste27修改而来的。缩写:CAD = 计算机辅助设计;Ø = 直径;PDMS = 聚二甲基硅氧烷;R = 半径;SPoT = 稳定的帖子跟踪器。 请点击这里查看此图的较大版本.
2. 细胞培养
3. hECT培养
元件 | 体积 (μL) | |||||||
蒸馏 H2O | 13.442 | 2.9 mg/mL 胶原蛋白溶液 | "ECM组合" | 最终的hECT细胞混合物 | ||||
氢氧化钠 1N | 0.638 | |||||||
PBS 10x | 4.4 | |||||||
5 mg/mL 胶原蛋白原液 | 25.52 | |||||||
0.2 N pH 9 HEPES | 5.5 | |||||||
10倍内存 | 5.5 | |||||||
要转移到细胞沉淀的 ECM 混合物的体积 | 35.2 | |||||||
基质胶体积 | 4.4 |
表2:hECT试剂。 这些成分应按所列顺序添加并保存在冰上。
图 4:生物反应器组装和 hECT 制造。 (一) (I) 两个PDMS支架(左,浅蓝色)安装在聚砜框架上(右,棕褐色)。(II) 然后将 PTFE 底板(黑色,左)安装到框架(右)上,使每对柱子都适合基板的孔中。(B) (I) 将基于胶原蛋白的细胞外基质中的 44 微升心肌细胞悬浮液添加到六个基板孔中的每一个孔中。(二、三)带有PDMS机架的框架压合到底板上。1-4 天后,可以从底板上取出 hECT。(IV) 首先,在(V)底板从框架上抬起之前,将生物反应器倒置。(VI) 具有六个 hECT 的生物反应器的侧视图。插图:放大视图,显示柱子上相对于 SPoT 的 hECT 位置(插图)。(C) CAD 渲染图,通过聚砜框架的间隙显示三个级别的 hECT 压实([I] 低、[II] 中和 [III] 高)。这个数字是从van Neste27修改而来的。缩写:CAD = 计算机辅助设计;PDMS = 聚二甲基硅氧烷;PTFE = 聚四氟乙烯;SPoT = 稳定帖子跟踪器;hECT = 人类工程心脏组织。 请点击这里查看此图的较大版本.
4. hECT起搏设备
图 5:用于隔热加热玻璃舞台的亚克力护套。 CAD图像显示了为玻璃桌设计的亚克力护套的关键尺寸。(A) 顶部面板有一个 27 cm x 18.5 cm 的孔切口,允许生物反应器培养皿位于加热元件上。角落中的橙色矩形表示建议放置小垫片,以在护套顶部和加热元件之间提供空间。(B) 护套的底部有两个切口,以允许加热台的腿滑入(绿色星号)。(C&D)两个侧板安装在顶部下方。(D) 左侧面板包括一个 3 cm x 0.3 cm 的切口(插图),用于舞台电源线。(E) 长面板适合正面和背面。(F) 一旦桌子进入内部,就会添加插入物以填补间隙。(G) (I) 将侧板和背板连接到底件上,然后 (II) 添加顶板。(III) 将玻璃桌滑入夹克(洋红色箭头)。(IV) 插入物连接在桌子的腿之间,背面贴合开口以关闭盒子。(五)完成的护套装配。这个数字是从van Neste27修改而来的。缩写:CAD = 计算机辅助设计;R = 半径;Ø = 直径。 请点击这里查看此图的较大版本.
图 6:hECT 收缩的数据采集。 (A) (I) 从石墨棒上切割的电极的照片。洋红色箭头表示用于连接不锈钢丝的孔。比例尺 = 1 cm。 (II) 倾斜视图(左)和顶视图(右)显示石墨电极在生物反应器中的位置。电极占据了 25 mm 宽的生物反应器和培养皿壁之间的空间,以确保电极之间的距离一致。电线弯曲以允许关闭碟盖。(B) 层流洁净工作台内的 hECT 起搏装置照片——所有设备都放置在隔振台上,以减少洁净工作台的振动噪音。生物反应器(洋红色箭头)位于夹套加热台上,由上方的 LED 光源照亮。解剖显微镜水平指向直角镜(橙色星号),从下方观察生物反应器,并配有CCD相机(左)。绿松石支架表示用于连续温度监控的水浴,以向闭环加热舞台控制器提供反馈。这个数字是从van Neste27修改而来的。缩写:hECT = 人类工程心脏组织;LED = 发光二极管。 请点击这里查看此图的较大版本.
5. hECT功能测量
图 7:后挠度数据采集接口。 (A) 用于运行软件的按钮。(B) 工具栏,分别包含用于长度测量和对象选择的线条和矩形工具。(C) 距离校准控制。(D) 用于测量三个不同点的hECT横截面积的工具。(E) 阈值开关和 (F) 滑块,用于将视频源实时转换为高对比度图像。(G) 预览窗口中可见的 SPoT。(H) 用于选择 SPoT 的工具。(I) 用于按大小过滤对象的滑块。(J) 实时显示被跟踪物体之间测量距离的图表。(K) 用于选择保存输出文件的目录的选项。(L) 用于设置后期跟踪程序 (M) 的频率范围、频率间隔、录制时间和录制间隔时间的选项。(N) 上次保存的记录的偏转曲线的傅里叶变换的图形输出。(O) 编程以找到刺激 hECT 所需的最小电压。(P) 计算柱子最大和最小挠度的程序。缩写:hECT = 人类工程心脏组织;SPoT = 稳定的帖子跟踪器。 请点击这里查看此图的较大版本.
6. PDMS机架测量
7. 使用自定义分析脚本进行功能数据处理
图 8:Twitch 力曲线计算。 (A) 在数据处理软件中运行"AnalyzeLogsGUI.m"文件将打开 GUI 窗口。(I) 日志选择框允许用户选择包含 hECT 功能数据的文件夹的目录。"天数"字段将从协议步骤 7.1 中创建的摘要文件的标题自动填充。使用组织下拉菜单选择要处理的 hECT。(II) "数据输入"框包含有关支持 hECT 的一对 PDMS 柱的信息,例如空载距离(在协议步骤 6.1 中获得)和柱半径 (0.25 mm)。(III) "分析约束"(Analysis Constraints) 框允许用户选择要省略或包含的频率,以及修剪录音。(IV) 过滤器参数框包含用于选择如何过滤原始抽搐力曲线的选项。多项式顺序和帧大小会改变过滤过程中的平滑级别。"峰值检测阈值"滑块决定脚本将识别的最小峰值大小。"尖峰移除"(Spike Removal) 选项可剪裁由伪影引起的高峰。(V) 其他选项包括后挠度分析(运行额外的峰值检测算法)、缩放图上的自动缩放 y 轴(作用于抽搐力曲线)、保存力轨迹曲线(保存抽搐力图)和保存力时间数据(保存绘制的抽搐力数据)。(B) 面板 A 的 GUI 屏幕截图生成的以 1 Hz 起搏的 hECT 的 30 秒记录的抽搐力曲线示例。红色抽搐力曲线显示 AIV 中参数产生的过滤力,叠加到原始抽搐力曲线上(深蓝色曲线,在 AV 中选择"显示未过滤的数据"选项时出现)。缩写:hECT = 人类工程心脏组织;GUI = 图形用户界面;PDMS = 聚二甲基硅氧烷。请点击这里查看此图的较大版本.
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按照上述方案,心肌细胞从我们 9,15 组先前使用的健康 iPSC 系中产生,并在培养 8-61 天后制成 hECT。图9A显示了从底部观察的hECT的代表性图像,这些图像是在没有(顶部)和(底部)SPoT的情况下创建的。在hECT制备后37天至52天之间,在室温(23°C)和生理温度(36°C)下进行功能测量。在PDMS机架的制造过程中,我们已经证明,有经?...
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文献中发表了许多线性工程心脏组织模型,其中一些在表1中进行了描述。一些模型涉及组织力的直接测量,但这些模型通常需要将结构转移到单独的肌肉浴38中。大多数型号的设计将组织永久固定在两端,最常见的是PDMS柱1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16
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K.D.C. 是 Novoheart 的联合创始人兼首席科学官,并持有控股公司 Medera Biopharmaceutical 的股权。Novoheart 没有为这项研究的资助、规划或执行做出贡献;然而,研究结果可能会对 Novoheart 和 Medera 产生财务影响。其他作者声明他们没有竞争利益。
作者感谢Timothy Cashman博士之前对这种方法所做的工作。这项研究得到了美国国立卫生研究院 (NIH)(R01-HL132226 和 K01 HL133424)和 Leducq 基金会国际卓越网络计划 (CURE-PLaN) 的资助。
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Name | Company | Catalog Number | Comments |
0.25 mm diamete 304 Stainless Steel Wire | McMaster Carr | 6517K61 | |
0.25% trypsin-EDTA | Gibco | 25200056 | |
1.7 mL Microtubes | Axygen | MCT-175-C | |
10 cm dishes (20 mm tall) | Corning | 353003 | |
10 mL Serological Pipette | Drummond | 6-000-010 | |
10 N NaOH | Fisher Scientific | SS225-1 | dilute 1:10 in sterile distilled water |
10X Modified Eagle Medium | Sigma Aldrich | M0275 | |
20 - 200 μL Micropipette | Eppendorf | 3123000055 | |
200 μL MicroPipette Tips | VWR | 76322-150 | |
5 mL Serological Pipette | Drummond | 6-000-005 | |
50 mL Conical Centrifuge Tubes | Falcon | 352070 | |
6 cm Petri Dish | Corning | 353002 | |
6 Watt LED Dual Gooseneck Illuminator | AmScope | LED-6W | |
6-Well Plates | Corning | 353046 | |
90 degree angle mirror | Edmund Optics | 45-594 | |
Acrylic bonding glue | SCIGRIP | #4 | |
Adjustable 10 cm x 10 cm jack | Fisher Scientific | 14-673-50 | |
Aluminum 6061 | McMaster Carr | 9008K82 | |
A-Plan 10X Objective Lens | ZEISS | 1020-863 | |
Autoclave Bags | Propper | 21002 | |
B-27 supplement | ThermoFisher | 17504044 | |
B-27 supplement (without insulin) | ThermoFisher | A1895601 | |
Benchtop Centrifuge | Eppendorf | 5810 R | |
Black ABS | Ultimaker | 2.85 mm wide | |
Bovine Collagen I | Gibco | A1064401 | |
CHIR99021 | Tocris | 4423 | |
Class II Biosafety Cabinet | Labconco | 3430009 | |
Clear Acrylic Sheeting | estreetplastics | 1002502436 | 6.25 mm thick |
CNC Vertical Mill | Haas | VF-1 | |
Conductive Graphite Bars | McMaster Carr | 1763T33 | |
Dissection microscope | Olympus | SZ61 | |
Dulbecco's Modified Eagle Medium/Ham's F-12 Nutrient Mix | ThermoFisher | 11330032 | |
Ethanol | Fisher Scientific | A4094 | Dilute to 70% in water |
EVE Automated Cell counter | NanoEntek | E1000 | |
EVE Cell Counting Slide | NanoEntek | EVS-050 | |
Fetal Bovine Serum | Life Technologies | 10438026 | |
Fine Curved Forceps | Fine Science Tools | 11253-25 | |
Forma Series II Water Jacketed CO2 Incubator | Thermo Electron Corporation | 3110 | AKA "incubator". With HEPA class 100 filter |
Fusion360 software | Autodesk | AKA "CAD software" | |
Glass Hemocytometer | Reichert | 1475 | 0.1 mm deep |
HEPES | Sigma Aldrich | H3784 | |
hESC qualified matrigel | Corning | 354277 | AKA "basement membrane matrix". Store in frozen aliquots |
High Speed CCD Camera | PixelLINK | P7410 | |
Inverted Microscope | Carl Zeiss Werk | Axiovert 40 CFL | 10X phase contrast objective |
IWR-1 | Selleck Chem | S7086 | |
LabView Software | National Instruments | 2016 | |
Laminar flow clean bench | NuAire | NU-201-330 | necessary for hECT functional analysis |
Laptop | AsusTek | Strix | Intel Core i& processor ,CPU 2.8GHz, 16GB RAM |
Laser Cutting Machine | Epilog | Helix 24 | |
Magnification headset | ExcelBlades | 70020 | Recommended for steps requiring fine manipulations |
Matlab | Mathworks | Version 2019b or later | AKA "data analysis software" |
Micro Vannas Scissors, 3 mm blade | WPI Instruments | 501839 | |
Microscope Boom Stand | Olympus | SZ2-STU1 | |
Penicillin-Streptomycin stock solution | ThermoFisher | 15140122 | 10,000 IU/ml penicillin; 10,000 μg/ml streptomycin |
Phosphate-buffered saline without divalent cations | Sigma Aldrich | P3813 | Diluted in distilled water to 1X and 10X concentrations |
Pipette Controller | Drummond | 4-000-100 | |
PixelLINK Capture OEM | PixelLINK | 10.2.1.6 | AKA "Camera Software" |
Polysulfone | McMaster Carr | 86735K73 | translucent amber color |
Polytetrafluoroethylene (PTFE) | McMaster Carr | 8545K176 | Black, molded |
ReLeSR | Stem Cell Technologies | 5872 | AKA "iPSC dissociation media" |
Rosewell Park Memorial Institute 1640 Media | ThermoFisher | 11875135 | |
Silicone Sheeting | SMI manufacturing | glossy, 0.02 in thickness, durometer 40 | |
Size 10/0 Blue, Green, Red, and Yellow Glass Seed Beads | Michael's | color should withstand autoclaving | |
Spatula | Fisher Scientific | 14-373 | used for mixing PDMS |
Square Pulse Stimulator | Astro-Med / Grass Technologies | S88X | |
Stainless Steel Razoblades | GEM | 62-0179-CTN | preferred over non-stainless steel due to lower hardness |
Stemflex | ThermoFisher | A3349401 | AKA "iPSC culture media" |
Sterile distilled water | ThermoFisher | 5230 | |
Sylgard 170 - Silicone Elastomer Encapsulant Black 0.9 kg Kit | Dow | DOWSIL 170 2LB KIT | AKA black Polydimethylsiloxane (black PDMS) |
Sylgard 184 - Silicone Elastomer Clear 1 lb Kit | Dow | DC 184 SYLGARD 0.5KG 1.1LB KIT | AKA Polydimethylsiloxane (PDMS) |
Temperature-controlled heated stage | Okolab | H401-HG-SMU | Set height to 10 cm |
Thermoplastic 3D printer | Ultimaker | Ultimaker 3 | |
Thiazovivin | Selleck Chem | S1459 | |
Trypan Blue | NanoEntek | EBT-001 | |
Vacuum Chamber | Bel-Art Parts | F42027-0000 | |
Variable Speed Mini Band Saw | Micro-Mark | 82203 | |
Variable Speed Miniature Drill Press | Micro-Mark | 82959 | |
Vibration Isolation Table | Labconco | 3618000 | |
Weighing Boats | VWR | 10803-140 | |
Talon Cylinder Bench Clamp | VWR | 97035-528 | AKA screw clamp |
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Designing a Bioreactor to Improve Data Acquisition and Model the Throughput of Engineered Cardiac Tissues
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