这种qRT-PCR方法可以解决与年龄依赖性肾损伤等条件下小鼠血清中microRNA表达谱相关的问题。该技术能够通过简单的过程以高精度和灵敏度检测microRNA表达,从而节省时间并防止技术错误。首先,用镊子和手术剪刀切开腹部皮肤。
切开腹膜中的肌肉,从膀胱到肋骨的左下边缘。用镊子提起腹膜,并用手术剪刀在上边缘做一个横向切口。继续沿着肋骨的最低边缘切口。
使用两根 PBS 湿棉签识别下腔静脉。将连接到1毫升注射器的30G针头插入下腔静脉,然后拉动注射器。慢慢拔出针头以避免溶血。
将血液转移到装有肝素的1毫升斯皮茨管中,并通过倒置混合。在室温下以3000倍G离心斯皮茨管10分钟。将上清液转移到新鲜的1.5毫升微量离心管中。
取200微升血清样品,加入1, 000微升苯酚/胍基裂解试剂。将混合物涡旋5秒钟,并在室温下孵育5分钟。加入200微升氯仿,倒置管混合15次。
将样品在室温下孵育3分钟,然后离心。在不干扰沉淀的情况下,将上清液转移到新鲜的1.5毫升微量离心管中。加入450微升100%乙醇,涡旋试管5秒钟。
然后将700微升样品加载到膜锚定的离心柱上,并离心。丢弃流通液,并加入试剂盒中提供的 700 微升洗涤缓冲液 1。再次离心,丢弃流出物。
用 500 微升洗涤缓冲液 2 重复洗涤以去除痕量盐。加入500微升80%乙醇,离心,并丢弃收集管中的流出物。再次离心离心柱,并将色谱柱转移到新鲜的1.5毫升收集管中。
然后加入14微升无RNase的水,并在室温下孵育5分钟。在室温下以15000倍G再次旋转色谱柱1分钟。准备预混液,并在 8 孔试管中每孔加入 8 微升。
在每个试管中加入12微升提取的总RNA,并在室温下以2000倍G离心管15秒。将试管放入热循环仪中,开始孵育以合成cDNA。孵育后,将cDNA转移到新鲜的微量离心管中。
用蒸馏水将cDNA稀释十倍。然后涡旋,然后在室温下以2000倍G离心5秒。在微量离心管中,按照文本协议中所述制备预混液,并涡旋溶液。
在 96 孔板的每个孔中加入 22.5 微升等分试样,然后加入 2.5 微升 cDNA。使用粘合膜密封板,并以1000倍G离心板30秒,将板放入实时PCR系统中。通过提供实验名称来修改设置。
然后选择96孔0.2毫升作为实验类型,比较CT作为定量方法,标准作为系统运行模式,SYBR Green试剂作为检测目标序列的试剂。提供样品的名称和每个孔中的目标miRNA。分配重复样品,选择参比样品和内源性对照,并选择无染料用作被动参比。
为了消除试剂交叉污染,设置阴性的逆转录酶和miRNA表达的非模板对照。接下来确保反应体积设置为20微升,PCR循环条件设置为95摄氏度15分钟,然后在94摄氏度下变性40次,持续15秒,在55摄氏度下退火30秒,在70摄氏度下延伸30秒。该过程完成后,单击“分析”以分析 qRT-PCR 数据。
确认程序自动选择的阈值线是否适合每个孔。检查每个样品中分析的内源性对照和靶向miRNA的阈值循环值。通过扩增曲线和阈值线的交点确定CT值。
年龄依赖性肾损伤模型的miRNA qRT-PCR数据显示,与SAMR1对照小鼠相比,SAMP1实验小鼠miRNA-7219-5p的肾脏水平显着升高,而miRNA-7218-5p的肾脏水平下降。miRNA-223-3p的表达水平在两种菌株中均未改变。SAMP1小鼠的miRNA-7219-5p和miRNA-7218-5p的血清水平显着增加,而miRNA-223-3p的水平保持不变。
您应该将针头插入下腔静脉并在不穿透血管的情况下提取血液。该方法可用于回答小鼠血清中各种病理状况的microRNA表达谱中的关键问题。