该方法将能够表征IM个体处于相同疾病状态的不同免疫细胞,这将扩展我们对EBV感染机制的理解。演示该程序的将是来自我们实验室的医生张琳琳。首先,将先前分离的PBMC置于1.5毫升微量离心管中,并在室温下以300G旋转10分钟。
弃去上清液,并用80微升制备的缓冲液重新悬浮细胞。接下来,向细胞悬液中加入20微升CD 14微珠,通过移液充分混合,并将管在冰上孵育15分钟。然后使用一毫升缓冲液洗涤PBMC,并在室温下以300G离心10分钟。
弃去整个上清液,并用500微升缓冲液重新悬浮细胞。对于磁分离,将一根色谱柱放在磁珠分离器上,然后用三毫升缓冲液洗涤色谱柱。接下来,将细胞悬液添加到列中。
让它通过,并将未标记的细胞收集到15毫升离心管中。用三毫升缓冲液洗涤柱三次,并将整个流出物收集在15毫升离心管中。现在,将色谱柱放入新的15毫升离心管中,并向色谱柱中加入5毫升缓冲液。
将柱塞牢固地推入色谱柱中,将磁性标记的细胞冲洗到管中。将磁性标记的细胞以300 G离心五分钟。除去上清液后,将细胞重新悬浮在500微升PBS中,并将细胞悬液转移到1.5毫升微量离心管中进行后续转录组测序。
通过以300G离心5分钟来沉淀收集的未标记细胞,并将细胞重新悬浮在1.5毫升微量离心管中的100微升PBS中。然后,向细胞悬液中加入两微升每种标记的抗体,并在冰上孵育30分钟,避光。接下来,将100微升PBMC细胞悬液等分到1.5毫升微量离心管中,以设置阴性对照样品CD 3,CD 4,CD 8和CD 19,单染色样品和CD 56或CD 16染色样品。
然后向每个试管中加入两微升相应的荧光标记抗体,并在冰上孵育30分钟,避光。孵育后,如前所述用PBS洗涤所有细胞,并重新悬浮在500微升PBS中。打开细胞分选系统,然后运行开机程序。
然后,安装85微米喷嘴,并打开分拣流。将分拣电压设置为 4, 500 伏,将频率设置为 47。在断路窗中将间隙设置为8,开启最佳点自动分选模式,自动确定液滴振幅值。
最后,在侧流窗口中将液滴延迟调整为 30.31。使用前向散射点图与侧向散射点图,绘制多边形门 P1 以识别完整的淋巴细胞群。接下来,使用前向散点面积与高度点图,绘制多边形门 P2 以标识单个像元,并排除双峰。
然后使用CD 19 FITC面积与CD 3每个CPCY 5.5面积点图,绘制矩形门P3以选择CD 3阳性T细胞和CD 19阳性B细胞。接下来,使用CD 4 APCCY 7区域与CD 8 PE区域点图,绘制矩形门以选择CD 4和CD 8阳性T细胞。最后,使用侧散射区域与CD 56或CD 16 APC面积点图,绘制矩形门以选择CD 56或CD 16阳性自然杀伤细胞。
对于阴性对照管,单击采集仪表板中的加载,然后在软件中选择细胞仪设置。在检查器窗口中,单击参数选项卡,然后调整正向散射、侧向散射和不同荧光染料的电压。将单染色管装入细胞仪后,单击采集仪表板中的加载,然后单击补偿选项卡以调整补偿,如文本中所述。
轻轻涡旋细胞悬液,然后将试管装入细胞仪。将200微升FBS加入四个收集流管中,并涡旋管。将它们放入细胞仪收集室中。
在四个流管中分别收集不同类型的细胞。将分离的细胞以 300 G 离心五分钟,然后将 200 μL RNA 分离试剂添加到细胞调色板中以进行转录组测序。本研究采用免疫磁珠和荧光活化细胞分选技术,从不同样本的外周血中高效分选免疫细胞亚群。
重要的是,在该协议中,细胞分选步骤已经过优化以提高细胞活力。与健康的EB病毒携带者和未感染的样本相比,分选的免疫细胞显示传染性单核细胞增多症患者中CD3,CD 8阳性T细胞的比例增加。相比之下,与健康EBV携带者和未感染EBV的儿童相比,在传染性单核细胞增多症患者中观察到CD 3,CD 4阳性T细胞和CD 19阳性B细胞的比例降低。
此外,与未感染EBV的儿童相比,在传染性单核细胞增多症患者中观察到CD 56或CD 16阳性自然杀伤细胞的比例降低。保持细胞活力对于后续实验至关重要。在分选过程中将细胞保存在冰上或冰箱中有利于细胞活力。