Quantitative Messung der Immunantwort und Sleep in<em&gt; Drosophila</em

Zusammenfassung

Um eine Verbindung zwischen der Immunantwort und Verhalten zu verstehen, beschreiben wir eine Methode, um Bewegungs-Verhalten zu messen Drosophila Während bakterielle Infektion als auch die Fähigkeit der Fliegen, um eine Immunantwort durch Überwachung Überleben, bakterielle Belastung und Echtzeit-Aktivität eines zentraler Regulator der angeborenen Immunität, NFKB montieren.

Zusammenfassung

Eine komplexe Wechselwirkung zwischen der Immunantwort und Host Verhalten wurde in einer Vielzahl von Arten beschrieben worden. Überschüssiges Schlaf, insbesondere, ist bekannt, als Reaktion auf eine Infektion in Säugern ¹ auftreten und kürzlich auch in Drosophila melanogaster ² beschrieben. Es ist allgemein anerkannt, daß der Schlaf nützlich zum Host während einer Infektion ist, und dass es für die Beibehaltung einer robusten Immunsystems ^3,4 wichtig. Jedoch gibt experimentelle Hinweise, dass diese Hypothese unterstützt begrenzte ^4, und die Funktion des Schlafes Überschuß bei einer Immunantwort bleibt unklar. Wir haben einen multidisziplinären Ansatz verwendet, um dieses komplexe Problem anzugehen, und habe durchgeführten Studien in der einfachen genetischen Modellsystem der Fruchtfliege Drosophila melanogaster. Wir verwenden eine Standard-Test zur Messung lokomotorische Verhalten und schlafen in Fliegen, und zeigen, wie dieser Test verwendet wird, um das Verhalten der Fliegen infecte messend mit einem pathogenen Stamm von Bakterien. Dieser Assay ist auch nützlich zur Überwachung der Dauer des Überlebens in einzelnen Fliegen während einer Infektion. Zusätzliche Maßnahmen der Immunfunktion umfassen die Fähigkeit der Fliegen, um eine Infektion und die Aktivierung von NFkB, ein wichtiger Transkriptionsfaktor, der von zentraler Bedeutung für die angeborene Immunantwort in Drosophila ist klar. Sowohl das Überleben Ergebnis und bakterielle Clearance während der Infektion zusammen sind Indikatoren für Widerstand und Toleranz gegenüber Infektionen. Widerstand bezieht sich auf die Fähigkeit der Fliegen, um eine Infektion zu löschen, während Toleranz als die Fähigkeit des Wirts, um eine Beschädigung von einer Infektion zu begrenzen und dadurch trotz hoher Pathogen innerhalb des Systems ⁵ überleben definiert ist. Echtzeit-Überwachung von NFKB Aktivität während der Infektion gibt einen Einblick in einen molekularen Mechanismus des Überlebens während der Infektion. Die Verwendung von Drosophila in diesen einfachen Tests erleichtert die genetische und molekulare Analysen des Schlafesund die Immunantwort und wie diese beiden komplexen Systemen wechselseitig beeinflusst.

Protokoll

Dieses Protokoll verwendet zwei Setups (Abbildung 1) zu vier verschiedenen Anzeigen von Fliegen, die einer bakteriellen Infektion gesammelt erwerben. Diese Ausgänge sind 1) Schlaf / Wach-Verhalten; 2) das Überleben Ergebnis; 3) Keimbelastung in der Fliege, und 4) Echtzeit-Messung von NFKB Reporter Aktivität in vivo. In Kombination mit den genetischen Werkzeuge, die verfügbar sind in Drosophila, bieten diese Messungen mechanistischen Einblick in die molekulare Verbindung zwischen Immunfunktion und Verhalten.

Ein. Measure Bewegungsaktivität und Hotels in Flies

1. Das Setup verwendet, um Bewegungsaktivität zu messen und Hotels in Fliegen, die auch die Drosophila Activity Monitoring System (DAM2, Trikinetics), Inkubatoren, dunklen Raum, und die Vorbereitung der Versuchstiere und Aktivität Röhren, wurde bereits ⁶ beschrieben. Der gleiche Ansatz wird hier, mit einigen geringfügigen Änderungen verwendet.
   1. Die Beleuchtung des Inkubators durch den Inkubator selbst gesteuert. Daher ist es wichtig, die Zeit Einstellung bei Computer-und Gründerzentren synchronisieren.
   2. Aktivität Röhrchen werden zur Wiederverwendung durch Kochen auf einer Heizplatte in entionisiertem Wasser gereinigt. Eine geringe Menge an Detergens für das erste Kochen zugesetzt werden Rohre gut gespült und kochte noch zweimal. Wenn Garn verwendet wird, um das Rohr anschließen, können verwendet Aktivität Rohre (Aufnahme von Lebensmitteln, Wachs, Fliegen und Garne) ohne vorherige Entfernung des Garns gereinigt werden.
2. Vor Beginn eines Experiments, inszeniert Ort Kulturen mit späten Puppenstadium Fliegen in Inkubatoren für drei bis vier Tage an experimentelle Beleuchtung und andere Umweltbedingungen anzupassen. Light: dunkel oder konstanten Bedingungen wurden häufig verwendet, um das Schlafverhalten messen. In diesem Beispiel werden entfernt, um konstantes Licht, um den Einfluss der circadianen Uhr auf die Immunantwort und Verhalten ^2,7,8 eliminieren akklimatisiert. Wie in 1A beschriebenen , Load 1-4 Tage alten Fliegen in der Trikinetics DAM2 Tätigkeit überwacht als ⁶ und Rekord für ein Minimum von drei Tagen beschrieben vor der Infektion.

2. Infect Fliegen mit einem pathogenen Stamm von Bakterien

1. Das hier beschriebene Protokoll ist spezifisch für S. marcescens, die einfach zu züchten und zu warten sind. Protokolle für Langzeitspeicherung und Kulturbedingungen für andere bakterielle Spezies variieren. S. marcescens in 15-50% Glycerin bei -80 ° C gelagert Um für die langfristige Lagerung vorbereiten, mischen 2 Volumina Nacht Bakterienkultur (OD ₆₀₀ = 0,5 - 1,0) bis 1 Volumen autoklavierten 50% Glycerin in 1,5 ml Mikrozentrifugenröhrchen. Diese werden in einem abschließenden Glycerinkonzentration von 17% führen. Röhrchen bei -80 ° C. Um einen kurzfristigen in-use Quelle von Bakterien vorzubereiten, kratzen die gefrorenen Aktie mit einem sterilen 200 ul Pipettenspitze und führen eine Drei-Wege-Streifen auf einer LB-Agarplatte. Inkubieren Sie die Platte über Nacht bei 37 & dzB, C, um isolierte Kolonien zu erhalten. Bewahren Sie die Platte bei 4 ° C.
   Einen Tag vor der geplanten Infektion, wählen Sie eine einzelne Kolonie von der LB-Agar-Platte mit einem sterilen 200 ul Pipettenspitze und tauchen die Spitze in einer Kultur Röhrchen mit 5 ml LB-Medium. Bakterien wachsen über Nacht, oder bis zu 16 Stunden innerhalb eines Inkubationsschüttler bei 37 ° C und 250 rpm bis zum Erreichen der exponentiellen Wachstumsphase. Messen der Konzentration mit einem Spektrophotometer bei OD _600. Die Konzentration in dieser Phase im Bereich von 0,5 zu 1 beträgt. Ist die Konzentration zu hoch ist, subkultivieren Bakterien und wachsen noch mehrere Stunden, um eine optimale Konzentration zu erhalten. Führen Sie das Verfahren in der Nähe einer Flamme Quelle. Einige Bakterienstämme für Antibiotikaresistenz konstruiert und gezüchtet werden und ausgewählt geeigneten Antibiotika zu dem Medium hinzugefügt. S. marcescens (ATCC # 8100) sind keine Antibiotika-resistente und werden daher in sterilen Medium ohne Antibiotikum gezüchtet. Um sterile Technik überprüfen, gehen Sie ein Mock cultuerneut ohne Bakterien als Kontrolle.
   Die Lösung, um Fliegen zu infizieren enthält Bakterien (verdünnt auf OD ₆₀₀ = 0,1) und 1% Lebensmittelfarbe (Brilliant Blue FCF) in PBS. Bereiten Sie eine Lösung zur Injektion Kontrolle, indem äquivalente Menge LB-Medium in Infektion Lösung und 1% blaue Lebensmittelfarbe in PBS verwendet. Store Solutions auf Eis.
2. Bereiten Glasnadeln zum Einspritzen die Fliegen. Ziehen Sie Glaskapillaren (od = 1 mm, id = 0,58 mm, WPI) zu einer feinen Spitze mit einem Feinpipettenziehvorrichtung (Narishige). Unter einem Präpariermikroskop, verwenden feinen Pinzette zum Abbruch der Spitze der Nadel, so daß die Öffnung groß genug ist, um mit Injektionsflüssigkeit durch Saugwirkung mit einer Spritze zu füllen, aber klein genug, um eine Beschädigung der Fliege während der Injektion zu minimieren. Nach dem Bruch der Spitze, sollte die Spitze Größe ca. 40-50 um betragen. Das Glas Nadel wird zu einer 3 cc-Kunststoffspritze mit einem Länge Rohr befestigt. Der Fluss der Injektion Medium manuell gesteuert Anwendung Überdruck oder suction mit der Spritze. Vermeiden Sie Verschmutzung der Gummischlauch mit Injektionsflüssigkeit, wie die Spritze Gerät sowohl für Infektionen und Kontrolle Injektionen verwendet wird.
3. Anesthetize Fliegen, indem sie auf eine CO _2-Pad. CO ₂ wird durch einen abgedichteten Behälter mit Wasser geleitet, um das Kissen zu befeuchten und um statische Elektrizität, die Manipulation der Fliegen an den Pad kann verkomplizieren reduzieren. Injizieren Fliegen durch Stossen das Glas Nadel in den Bereich oberhalb des Scutellum des dorsalen Thorax. Die Weitergabe der Injektion Medium in-the-fly durch die Lebensmittelfarbe überprüft - Fliegen drehen blau wie die Lebensmittelfarbe Spreads durch das System. Die Dosis von Bakterien, die Fliegen empfangen kann quantifiziert, wie in Abschnitt 3 beschrieben, weiter unten. Einige experimentelle Designs gehören eine Kontrollgruppe, die aseptische Verletzungen erhält durch die Injektion Fliegen mit PBS und Lebensmittelfarbe aber ohne Bakterien.

3. Bestimmen Sie die bakterielle Belastung

Ein Ansatz zur evaluating die Immunantwort gegen eine bakterielle Infektion ist, um die bakterielle Belastung nach der Infektion bestimmt. D. melanogaster ist ein großes Vorbild, um diesen Parameter zu bestimmen, weil die ganze Fliege kann homogenisiert, um die Summe der Keimzahlen innerhalb eines einzelnen zu schätzen. Das Grundprinzip hinter diesem Protokoll ist, wenn sie auf einem festen Medium wie Luria Broth (LB)-Agar in einer Petrischale (LB-Platte) gezüchtet, ein einzelnes Bakterium eine sichtbare unterscheidbare Kolonie bildet. Daher kann durch Homogenisieren infizierten Fliegen in LB-Flüssigmedium, Erzeugen von seriellen Verdünnungen des Homogenats und Spreizen des verdünnten Homogenat auf LB-Platten, kann die Anzahl der Bakterienzellen Infizieren einer Fliege bestimmt werden. Eine Kontrollgruppe von Fliegen mit PBS und Lebensmittelfarbe, aber ohne Bakterien injiziert sollte verwendet werden, um sicherzustellen, dass die Infektion nicht mit anderen bakteriellen Spezies kontaminiert werden. Es sollte keine Kolonien auf der LB-Agar-Platte in diesem Zustand sein.

1. Autoklavieren alle Materialien, die dafür verwendet werden sollenVerfahren vor Durchführung der eigentlichen Homogenisierung Schritt. Dazu gehören 200 ul Pipettenspitzen mit einer Schere, LB Medien und Stößel für die Homogenisierung verwendet geschnitten. Bereiten Platten durch Gießen autoklavierten LB / Agar-Medium in 10 cm sterile Petrischalen mindestens 1 Tag vor Homogenisieren Fliegen.
2. Anesthetize sammeln und fliegt in 1,5 ml Reaktionsgefäße und Shop Röhrchen auf Eis.
3. Führen Sie die Homogenisierung in der Nähe einer Flamme, um eine Kontamination zu verhindern. Eine Steuerung Homogenisierung mit Fliegen ohne Infektion wird empfohlen, insbesondere bei Verwendung eines Bakterienstamm wie S. marcescens, die nicht Antibiotikum resistent. Homogenisieren ein Minimum von 2 Gruppen von 10 Fliegen pro Tier experimentellen Zustand. Die Zahl der Fliegen pro Homogenat verwendet wird vom Experimentator bestimmt. Einige Gruppen haben eine Fliege pro Homogenat verwendet, was nützlich ist, zum Auswerten Variation zwischen einzelnen bakteriellen Belastung entfernt ^8, während andere 3-10 Fliegen pro Homogenat verwendet habenum über Genotyp oder experimentelle Bedingung ^9-12 vergleichen.
   1. Fügen Sie 400 ul LB-Medium zu jedem Mikrozentrifugenröhrchen mit Fliegen und homogenisieren mit einem kleinen Motor und Stößel (Kontes).
   2. Mit sterilisiert geschnitten Pipettenspitzen verdünnen serielle das Homogenat 1.10 durch Zugabe von 20 ul homogenisierte LB / bakterielle mittel-bis 1,5 ul Mikrozentrifugenröhrchen mit 180 ul LB-Medium. Schneiden Pipettenspitzen verhindert das Blockieren von fly Schutt und stellt sicher, dass ein geeignetes Volumen wird übertragen.
   3. Verdünnungsfaktor wird empirisch bestimmt und hängt von der Genotyp des fliegen, der Bakterienstamm verwendet, und experimentellen Bedingungen. Für Wildtyp Fliegen mit S. infiziert marcescens, verwenden Verdünnungen von 1:10 oder 1:10 ^{3 2} für Fliegen sofort nach der Infektion homogenisiert und Verdünnungen von 1:10 oder 1:10 ^{4 5} für Fliegen homogenisiert 24 h nach der Infektion.
   4. Fügen Sie 100 ul LB / bakterielle Medium aus der microcentrifuge Röhrchen mit dem Endverdünnung und verteilt das Medium auf einer LB-Platte unter Verwendung von Glaskugeln (VWR), um eine gleichmäßige Verteilung zu gewährleisten.
   5. Entsorgen Sie die Glaskugeln in 100% EtOH Lösung. Legen Sie die LB-Platten in einem 37 ° C Inkubator über Nacht.
   6. Als optionaler Schritt, verwenden ein Abbildungssystem mit sichtbarem Licht, um ein Bild der LB-Platten (FluorChem 8900; Alpha Innotech) zu erhalten. Zählen der Anzahl von Kolonien entweder auf der Platte selbst oder aus dem Bild der Platte mit dem Werkzeug auf das Zählen Photoshop Software (Adobe Photoshop CS3).
   7. Berechnen der Anzahl der Kolonie-bildenden Einheiten pro Fliege unter Verwendung der Formel: [n / (N * T * v)] * V, wobei n = Anzahl der Kolonien auf dem LB-Platte gezüchtet, N = die Anzahl der Fliegen in einem gepoolten Mikrozentrifugenröhrchen, D = Verdünnungsfaktor, und v = Volumen der Lösung auf jeder Platte zu verbreiten; V = ursprüngliches Volumen der Homogenat.

4. Bewerten Sleep and Survival-Dauer nach der Infektion

1. FürFliegen, die nicht für die Messung bakterielle Belastung geerntet werden, weiterhin überwachen Verhalten für weitere 7-10 Tage. Überlebensdauer von Genotyp der Fliege, die Umgebungsbedingungen beeinflusst und Bakterienarten für die Infektion verwendet.
2. Nach ca. 10 Tagen zu kündigen das Experiment, herunterzuladen und zu verarbeiten Verhaltensdaten wie zuvor ⁶ beschrieben. Insomniac2 kundenspezifische Software, die in Matlab basiert, wird verwendet, um Schlaf-Parameter zu analysieren. Es ist wichtig zu toten Fliegen aus der Verhaltensanalyse eliminieren. Normalerweise schränkt dies Analysen innerhalb der ersten Tage nach der Infektion, je nach Art der Infektion und Fliege Genotyp. Tod im Assay wird durch die Zeit alle Aktivitäten zählt Null erreicht angegeben haben. Um die Analyse des Überlebens zu erleichtern, Drosonex, kundenspezifische Software in Microsoft Visual C + + 6.0, wird verwendet, um Rohdaten aus dem Trikinetics DAM-System zu verarbeiten. Die Software-Berichte als Excel-Dateien, Überleben Dauer jedes fly (in Stunden), kompiliert Aktivität data von allen Monitoren in einer einzigen Tabelle, und meldet die prozentuale fliegt überlebende im Laufe der Zeit, wie sie durch den Benutzer. Die Excel-Dateien sind zum Einbau in andere statistische Software-Pakete für die weitere Analyse zu integrieren.

5. Messen NFKB Aktivität während der Infektion mit einem Luciferase Reporter Assay

Transgene Fliegen kappaB-luc in diesem Test verwendet wurden erzeugt, wie in vorher Kuo et al., 2010 ^2. Kurz gesagt, enthält die KB-luc Reporter 8 Wiederholungen einer NFKB Bindungssequenz, die in einen Promotor eingefügt wurden stromaufwärts eines Luciferase offenen Leserahmens.

1. Passen Fliegen zu experimentellen Lichtverhältnissen, wie in Abschnitt 1.2 beschrieben. In diesem Beispiel sind 1-4 Tage alte kappaB-luc Fliegen in Fläschchen, die eine 5% Saccharose, 2% Agar Nährboden und in Gleichlicht (LL) für 2 Tage, um die gleiche Alter als andere während der Infektion entfernt erreichen untergebracht.
2. Bereiten Sie eine 96-well Mikrotiterplatten für Fliegen. Jede Vertiefung enthält 2 Schichten von Lebensmitteln Medium (Abbildung 2), die obere Schicht enthält Luciferin, das Substrat der Luciferase. Fügen Sie 300 ul einer 5% Saccharose, 2% Agar-Lösung in jede Vertiefung und lassen Sie sich zu verfestigen. Weiter, einen 50 ul Deckschicht zu jedem Well, enthaltend 5% Sucrose, 1% Agar, und 2 mM Luciferin (Gold Biotechnology, Inc.). Luciferin Konzentrationen für Mess-Reporter-Aktivität in Drosophila verwendet wurden in der Literatur unterschiedlich und haben so niedrig wie 100 uM ¹³ gewesen. Die erforderliche Konzentration kann empirisch ermittelt werden. Zwischen Abgabe der Lebensmittel Schichten, decken Sie die Platte mit einem feinmaschigen Gewebe zu erleichtern Trocknen unter Beibehaltung Sterilität. Die Platte sollte gründlich trocknen gelassen werden, bis zu einer Stunde, um Fliegen aus immer in Kondensationstropfen steckenbleiben. Da Luciferin ist lichtempfindlich, vermeiden Platten mehr als nötig leuchten.
3. Tragen Sie eine klare Klebefolie (Top-Seal-A; Perkin Elmer) in eine 96-well-Mikrotiterplatte und perforierten mit einer feinen Nadel in einer Menge von 2 Löcher pro Vertiefung. Diese Löcher werden nicht nur ermöglichen Luftaustausch in jede Vertiefung, sondern auch eine Möglichkeit, um Fliegen auf einer individuellen Basis zu betäuben. Mit einem scharfen Messer und Lineal, stellen einen Schnitt zwischen den einzelnen Spalten. Dies wird eine einfache Möglichkeit zum Laden / Entladen Fliegen in Gruppen von 8 zu einem Zeitpunkt.
   Um Fliegen in die Mikrotiterplatte zu laden, entfernen Sie die Fläschchen aus dem Inkubator und betäuben Fliegen auf einen CO _2-Pad. Last fliegt ein-by-one zu jeder Vertiefung Spalte für Spalte. Sollte ein Versehen fliegen Klebe-/Dichtungsmasse stecken, lassen die Fliege allein, wie sie oft in der Lage, sich ohne Intervention befreien. Bringen Sie die Mikrotiterplatte in den Inkubator in LL für 8-24 Stunden an die neue Umgebung anzupassen und die Luciferinsubstrat verbrauchen.
4. Kultur Bakterien, S. marcescens, und bereiten eine Lösung für eine Infektion wie oben beschrieben.
5. Betäuben tfliegt er mit einer Mikropipette Spitze an einer Niederdruck-CO _2-Leitung. Legen Sie die Mikropipettenspitze direkt über den Lüftungsöffnungen für jeden gut gemacht. Vorsicht geboten, um zu gewährleisten, dass der CO _2-Druck hoch genug, um die Fliege betäuben, aber niedrig genug, um eine Verletzung des fly vermeiden. In Gruppen von acht einzeln übertragen jede Fliege zu einer CO _2-Pad, und infizieren wie oben beschrieben. Nach der Infektion wieder jede Fliege auf seine ursprüngliche gut und versiegeln Sie den Mikroplatten.
6. Maßnahme Lumineszenz (TopCount NXT-Lumineszenz und Scintillation Counter; Perkin-Elmer). Die Lumineszenz TopCount Zähler enthält eine Stapelkassette für Platten, die für den programmierten und automatisierte Messungen ermöglicht kontinuierlich an gewünschten Inkremente für längere Zeit (in der Regel bis zu fünf Tagen). Diese Funktion ist nicht auf allen Instrumenten und Datenerfassung für Experimente mit anderen Instrumenten durchgeführt werden daher seltener. Die Lumineszenz-Zähler in einem ro untergebrachtom mit einer kontrollierten Temperatur und Beleuchtung Zeitplan. Beim Laden Platten in die Stapelkassette, stapeln Sie die Platten mit den Fliegen zwischen klaren Blindplatten um sicherzustellen, dass Fliegen Licht zu empfangen. Programm das Luminometer nach den Angaben des Herstellers zu sammeln Lesungen jede Stunde für ein Minimum von 24 Stunden. In diesem Beispiel werden die Detektoren programmiert, um alle Vertiefungen für 10 sec zu lesen und das Ergebnis als Zählungen (willkürliche Einheiten) pro Sekunde abzugeben. Dieser Wert wird auf 3 Lesungen pro Vertiefung gemittelt. Exportieren Sie die Dateien in ein Tabellenkalkulationsprogramm und führen Sie eine Standard-Analyse, grafische Darstellung der Ergebnisse der Lumineszenz.

Ergebnisse

1. Infektion fördert den Schlaf. In diesem Beispiel, Canton-S (CS) Wildtyp Mutante Fliegen und Fliegen fehlt ein NFKB Gens, Relish (Rel ^{E20) 14} wurden in zwei DAM2 Aktivitätsmonitore geladen (n = 32 für jeden Genotyp) infiziert und, wie oben beschrieben. Fliegen wurden in konstantes Licht, um den Einfluss der circadianen Uhr auf Verhalten und Infektion zu eliminieren ^2,7,8 aufrechterhalten. Die Rel ^E20 Mutanten wurden CS isogenized wie zuvor beschrieben ^11. Beide S?...

Diskussion

Dieses Protokoll beschreibt einen Ansatz zu untersuchen, wie Verhalten, insbesondere schlafen, um die Immunantwort Parametern verknüpft. Zu diesen Parametern gehören bakterielle Belastung, Überleben Ergebnis und NFkB-Aktivität, wie durch eine Luciferase-Reporter in vivo gemessen. Zusammen stellen diese Parameter liefern Informationen darüber, wie gut eine Fliege kann eine Infektion zu bekämpfen. Bakterielle Belastung und Überleben Ergebnis sind Immunantwort Parameter, die eine einfache Messung in Dro...

Materialien

Name	Company	Catalog Number	Comments
Material Name	Firma	Katalog-Nummer	Kommentare
			Ausrüstung
Inkubatoren	Percival Scientific, Inc.	I30BLLC8 I36VLC8	Jeder Inkubator lauffähig programmierten Licht / Temperatur Zeitpläne angemessen ist.
Drosophila activitiy Monitore	Trikinetics Inc., Waltham, MA	DAM2	Wie an anderer Stelle beschrieben 6, erfordert dieses System eine Computer-Schnittstelle, Software und anderes Zubehör.
Pyrex Glass Tubes	Trikinetics Inc., Waltham, MA	PGT-5x65
Microplate Szintillations-und Lumineszenz-Zähler	Perkin Elmer	TopCount NXT 12 Detektor	Jede Mikroplattenleser zum Aufspüren von Lumineszenz kann für diese Art von Reporter-Assay verwendet werden. TopCount enthält mehrere Detektoren und eine automatisierte Stapler, es fähig ist, programmiert, um kontinuierlich ausgelesen aus mehreren Platten.
FluorChem 8900	Alpha Innotech		Imaging von Bakterienkulturen ist optional; jede digitale Imaging-System mit sichtbarem Licht Fähigkeit ist ausreichend.
Feinpipettenziehvorrichtung	Tritech Research, Inc.	Narishige PC-10
			Vorräte
Borosilikatglas Kapillaren	World Precision Instruments Inc.	1B100F-4
3 ml Spritze	Fisher Scientific	BD 305482
Syringe Needles	Fisher Scientific	BD 305196	18 G - entzieht der Spitze der Nadel, um eine Beschädigung des Schlauches zu verhindern.
Silikonschlauch, id (0,030 ") od (0,065") Wandstärke (0,018 ")	VWR	60985-706	Gebrauchte zur Befestigung Glaskapillare Nadeln mit einer Spritze
3-Wege-Hahn	Amerikanischen Pharmaseal Unternehmen	K75
Kontes Pellet Pestle Cordless Motor	Fisher Scientific	K749540-0000
Kontes Pellet Pestle	Fisher Scientific	K749521-1590
Glaskugeln 3mm	VWR	26396-630
Microplate Microlite 1 +	Thermo Scientific	7571	Select 96-Well-Platten, die für Lumineszenz sind - sie sind opak.
TopSeal-A :96-well Mikrotiterplatten	PerkinElmer	6005185	Microplate Press-On Adhesive Sealing Film
D-Luciferin, Kaliumsalz	Gold Biotechnology, Inc.	LUCNA
			Software
Insomniac2	Erhältlich auf Anfrage bei den Autoren	custom; von Lesley Ashmore, Ph.D. geschrieben (Westminster College)	Matlab basierte Software, die verwendet wurde routinemäßig zur Analyse des Schlafes 2,6,11
Drosonex	Erhältlich auf Anfrage bei den Autoren	custom; Thomas Coradetti (Sidewalk Software) geschrieben	Ein PC MSVC6 Programm für das Überleben Analyse von Rohdaten verwendet mit den gesammeltenTrikinetics System
Photoshop CS3	Lehmziegel		Nützlich für den Erhalt Zahl der cfu / Platte aus digitalen Bildern (optional)