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In diesem Artikel

  • Zusammenfassung
  • Zusammenfassung
  • Einleitung
  • Protokoll
  • Ergebnisse
  • Diskussion
  • Offenlegungen
  • Danksagungen
  • Materialien
  • Referenzen
  • Nachdrucke und Genehmigungen

Zusammenfassung

Dieser Artikel beschreibt eine detaillierte Methode für zufällige Mutagenese Zielgen in Spalthefe. Als Beispiel Ziel ist es, rpt4 +, die kodiert eine Untereinheit der 19 s Proteasom und Bildschirm für Mutationen, die Heterochromatin destabilisieren.

Zusammenfassung

Zufällige Mutagenese eines Ziel-Gens wird häufig verwendet, um Mutationen zu identifizieren, die zu den gewünschten Phänotyp führen. Die Methoden, die verwendet werden, um zufällige Mutagenese zu erreichen, fehleranfällige PCR ist eine komfortable und effiziente Strategie für die Erzeugung von einem vielfältigen Pool von Mutanten (i.e., einer mutierten Bibliothek). Fehleranfällige PCR ist die Methode der Wahl, wenn ein Forscher versucht, eine vordefinierten Region, wie der kodierenden Region eines Gens und ohne Auswirkung auf andere genomischen Regionen zu mutieren. Nachdem die mutierte Bibliothek durch fehleranfällige PCR verstärkt wird, muss es in einem geeigneten Plasmid geklont werden. Die Größe der Bibliothek generiert durch fehleranfällige PCR ist von der Leistungsfähigkeit des Klonens Schritt eingeschränkt. Jedoch kann der Klonen Schritt in der Spalthefe Schizosaccharomyces Pombe, durch den Einsatz einer hocheffizienten einstufige Fusion PCR Konstrukte für die Transformation zu generieren ersetzt werden. Mutanten der gewünschten Phänotypen können dann mit entsprechenden Reporter ausgewählt werden. Hier beschreiben wir diese Strategie im Detail, nehmen wir als Beispiel, ein Reporter am Zentromer Heterochromatin eingefügt.

Einleitung

Nach vorne Genetik ist eine klassische Methode, in der Forscher suchen natürlich vorkommende Mutanten, die einen bestimmten Phänotyp anzeigen und genetische Analysen durchführen. In reverse Genetik Mutationen in einem gen des Interesses eingebracht werden und der Phänotyp wird untersucht. Im letzteren Fall wird zufällige Mutagenese eines Ziel-Gens häufig verwendet, um einen Pool von Mutanten zu generieren, die anschließend zum gewünschten Phänotypen, wie z. B. die Temperaturempfindlichkeit ausgewählt oder enzymatische Aktivität verändert. Verschiedene Methoden können verwendet werden, um zufällige Mutagenese, inklusive fehleranfällige PCR1zu erreichen; UV-Bestrahlung-2; chemische Mutagene wie Ethyl Methanesulfonate (EMS) oder Salpetrige Säure3; die Verwendung von temporären Mutator Stämme, wie Sie zum Ausdruck zu bringen mutD5 4; und DNA Schlurfen5.

Hier beschreiben wir eine Reverse-Genetik-Strategie, in der wir fehleranfällige PCR um mutierte Pools für ein Target-gen in der Spalthefe erzeugen nutzen. Wie man aus seinem Namen vorstellen kann, erzeugt diese Methode Mutationen durch die Einführung von absichtlich Fehler während der PCR. Im Gegensatz zu anderen Methoden der Mutagenese ermöglicht fehleranfällige PCR dem Benutzer, die Region um mutagenisierter werden zu definieren. Dies macht es besonders geeignet bei den Bemühungen um die Funktion einer Protein/Domäne von Interesse zu untersuchen.

Um dieses zufällige Mutagenese-Verfahren zu demonstrieren, verwenden wir hierin rpt4 +, die die 19 s Proteasom Untereinheit kodiert, als Beispiel. Rpt4 hat gezeigt, dass Proteolyse-unabhängige Funktionen in anderen Organismen als Kernspaltung Hefe6,7,8,9haben, und ein Defekt in der Proteolyse bewirken indirekte Effekte durch die Veränderung von Proteinen Ebenen. Wir daher geschirmt für Mutanten, die Proteolyse-unabhängige Veränderungen, mit dem Ziel der Erforschung der Funktion des Proteasoms auf Heterochromatin ausgelöst.

Fehleranfällige PCR kann in jeder beliebigen Region gen angewendet werden, durch den Standort, an dem die Primer binden-tuning. Durch Mutation entstehende Variationen, die die gewünschte phänotypische Veränderung aufweisen können mit entsprechenden Reportern identifiziert werden. Hier, wir nahmen einen ade6 + Reporter eingefügt in das Zentromer 1 äußere wiederholen (Otr) Region10. Konstitutive Heterochromatin ist in dieser Region11, gebildet, so dass die ade6 + Reporter in der Wildtyp Bedingung zum Schweigen gebracht wird; Dies wird durch rote Kolonien10angezeigt. Eine Mutation, die das konstitutive Heterochromatin an das Zentromer destabilisiert führt auf den Ausdruck ade6 + Reporter, die als weiße Kolonien visualisiert wird.

Protokoll

1. Vorbereitung von Medien

  1. Bereiten Sie Hefeextrakt mit Ergänzungen (ja), ja ohne Adenin (ja Low Ade), Pombe Glutamate Medium (PMG-12) und PMG ohne Adenin (PMG-Ade) durch Mischen der Komponenten, wie in Tabelle 1beschrieben. Ja-Ade (Low Ade) und PMG-Ade Platten haben alle die gleichen Komponenten, aber die Adenin ist von letzterem ausgelassen.
    1. Verwenden Sie die folgenden Salz (50 X) Lager: 52,5 g/L MgCl2·6H2O, 2 g/L CaCl2·2H2O, 50 g/L KCl, 2 g/L Na2SO4 in Wasser destilliertem. Filter mit einem 0,22 µm Porengröße Filter zu sterilisieren und Lagerung bei 4 ° C.
    2. Verwenden Sie die folgende Vitamin (1, 000 X) Lager: 1 g/L panthothenat, Nikotinsäure 10 g/L, 10 g/L Inosit, Biotin 10 mg/L in destilliertem Wasser. Filter mit einem 0,22 µm Porengröße Filter zu sterilisieren und Lagerung bei 4 ° C.
    3. Verwenden Sie die folgende Mineral (10, 000 X) Lager: 5 g/L Borsäure, 4 g/L MnSO4, 4 g/L ZnSO4·7H2O, 2 g/L FeCl2·4H2O, 0,4 g/L MoO3, 1 g/L KI, 0,4 g/L CuSO4·5H2O , 10 g/L Zitronensäure in destilliertem Wasser. Filter mit einem 0,22 µm Porengröße Filter zu sterilisieren und Lagerung bei 4 ° C.
      Hinweis: Ja flüssiges Medium kann durch Weglassen der Agar gemacht werden.
  2. Autoklaven Medium und Abkühlen auf unter 60 ° C unter Rühren mit Stir Bar, mit einer Rate von 200 u/min.
  3. Fügen Sie 1 mL/L G418 Stammlösung ja + G418 (Geneticin) Platten hinzu das ja Medium.
    1. Verwenden Sie die folgenden G418 (1, 000 X) Lager: 100 mg/mL G418 in destilliertem Wasser. Filter zu sterilisieren, verwenden einen 0,22 µm Porengröße Filter, 1,5 mL Zentrifuge Röhren und Store aliquoten bei-20 ° C.
  4. Rühren Sie für eine weitere 5-10 min und aliquoten Medien in 90 mm Petrischalen (1 L des mittleren Aliquote, rund 40 Petrischalen. Speichern Sie die Platten bei 4 ° C.

2. Klonen von rpt4 + und seine 5' / 3' wo

  1. Führen Sie PCR Primer p1 und p2 (Abbildung 1A) mit Kernspaltung Hefe genomischen DNA (gDNA) als die Vorlage in einem Gesamtvolumen von 50 µL (~ 1 µg DNA, 20 U Enzym 1 x Reaktion Puffer) und Anwendung der Reaktionszyklen beschrieben in Tabelle 2 zu verstärken 3.315-Basis Paar (bp) Fragment, bestehend aus rpt4 + und seine 5' / 3' wo. Reinigen Sie das PCR-Produkt mit einer Reinigung Kit13 , wie vom Hersteller (Abbildung 1A) gerichtet.
  2. Die pBlueScript KS(-) Vektor14 und der amplifizierten DNA-Fragment mit rpt4 + mit seinen 5' / 3' wo mit BamH1 und Xho1 in einem Gesamtvolumen von 20 µL (~ 1 µg DNA, 20 U Enzym, 1 X Verdauung Puffer) bei 37 ° C in einem Wasserbad für 16-18 zu verdauen h (Abbildung 1 b).
  3. Gel reinigen des verdauten Vektors (1,2 % Agarose-Gel) und DNA durch TAE-basierte Agarose-Gelelektrophorese (100 V, 1 h), DNA-Bänder in den gewünschten Größen besteuert, und Isolierung der DNS mit einem Gel Extraction Kit15einfügen.
  4. Verbinden Sie den Vektor und DNA-Einlage mit T4 DNA-Ligase durch Durchführung einer 20 µL Ligatur Reaktion mit 50-100 ng der Vektor-DNA, ein ~ 3-fold molaren Überschuss von Einsatz DNA, 400 U T4-DNA-Ligase und 1 x Ligatur Puffer. Inkubieren Sie diese Mischung bei 18 ° C für 16-18 h.
  5. Verwandeln die aufgespaltenen DNA in 100 µL der E. Coli DH5α durch Anwendung von Hitze-Schock für 70 s bei 42 ° C. Fügen Sie 1 mL LB und inkubieren Sie für 1 h bei 37 ° C für die Wiederherstellung. Durchführen Sie Zentrifugation (13.800 x g), verwerfen Sie die überstand, Platte alle transformierten E. Coli Zellen auf LB Ampicillin (LA) Platten und Inkubation bei 37 ° C 16 h.
  6. Wählen Sie zwischen 4-8 Kolonien mit Zahnstochern und über Nacht bei 37 ° C in 3 mL LA Medium wachsen.
  7. Isolieren Sie der Plasmide mit einem Plasmid Reinigung Kit16 laut Protokoll des Herstellers verwendet und durchführen analytische Beschränkung Enzym Verdauung mit 5 µL des isolierten Plasmids, 5 U jedes Restriktionsenzym (BamH1 und Xho1) und 1 x Einschränkung Puffer. Inkubieren Sie die Reaktionsmischung bei 37 ° C in einem Wasserbad für 3 h bestätigen das Klonen durch Sequenzierung Kandidat Plasmide.

3. Einführung der Stille Mutation (Xho1 Beschränkung Site)

  1. Entwerfen Sie ein paar 33-bp-Primer (p3 und p4), die die gewünschte Mutation in der ansonsten komplementäre Sequenz enthalten.
  2. PCR mit High Fidelity Polymerase17 (Abbildung 1) in einem Gesamtvolumen von 25 µL führen (10 ng von geklonten Plasmid, 2 µL 10 Pmol Grundierung Mix, 2 U Enzym, 1 X Reaktion Puffer) mit Hilfe der Radsport Parameter in Tabelle 3aufgeführt.
  3. Die Vorlage Plasmid mit Dpnich in einem Gesamtvolumen von 20 µL (20 U Enzym, 1 X Verdauung Puffer) bei 37 ° C in Wasser für 1 h Bad zu verdauen.
  4. Verwandeln, propagieren, isolieren und das Plasmid enthält die Stille Mutation, wie beschrieben in Schritten 2,5-2,7-Sequenz.
    Hinweis: Die Stille Mutation kann auch über eine Klonmethode, die für das Verbinden von mehreren DNA-Fragmente in eine einzige Reaktion18ermöglicht eingeführt werden.

(4) Random Mutagenesis rpt4 + durch fehleranfällige PCR

  1. Durchführen Sie fehleranfällige PCR mit dem Plasmid mit der Stille Mutation (Xho1 Website) als die Vorlage, Primer p5 und p6, ein Gesamtvolumen von 50 µL (die Menge der Vorlage in Schritt 4.1.1, 2 µL 10 Pmol Grundierung Mix, 2,5 U Enzym, 1 X Reaktion Puffer definiert) , und eine speziellen Polymerase, die entworfen ist, um einen hohen Fehler generieren bewerten19 (Abbildung 1). Führen Sie PCR, wie in Tabelle 2beschrieben.
    1. Verwenden Sie ca. 4-5 µg der Vorlage Plasmid die Mutation Häufigkeit auf 1 bp/kb (Kilobase) steuern.
      Hinweis: Ein hoher Konzentration (> 500 ng/µL) Plasmid, das mit einem Mini-Prep Kit20gewonnen werden kann, erforderlich ist.
  2. Verwenden Sie Gelelektrophorese, um ein PCR-Produkt von 2670 bp (1,2 % Agarose-Gel) zu bestätigen. Gel reinigen das PCR-Produkt, wie in Schritt 2.5 beschrieben.

5. Vorbereitung der Fusion-PCR-Fragmente (KAN, 3' UTR)

  1. PCR mit pFA6a-KANMX621 als Vorlage, Primer p7 und p8 durchführen, und die Bedingungen aufgeführt, in Tabelle 4 Marker (KAN) Fragment zu erhalten. Gel reinigen das resultierende 1.480-bp Fragment wie in Schritt 2.5 (Abbildung 1E) beschrieben.
    1. Überprüfen Sie, ob das Stopcodon des Gens für Mutation und der kodierenden Region des angrenzenden gen gezielt werden getrennt von mehr als 500 bp. Der endogene Terminator dürfen nicht verwendet werden, wenn diese Region weniger als 500 ist bp; Vielmehr sollte der ADH -Terminator anstelle der endogenen Terminator verwendet werden. Die Protokoll-Änderungen erforderlich, um die ADH -Terminator zu verwenden sind in Tabelle 5dargestellt.
      Hinweis: Diese Änderungen gelten nur, wenn der ADH -Terminator, der in der pFA6a-3HA-KANMX6-Plasmid verfügbar ist, wird anstelle der endogenen Terminator verwendet.
  2. Führen Sie PCR mit dem geklonten rpt4 +-mit Vektor als Vorlage und Primer p9 und p10 in einem Gesamtvolumen von 50 µL (20 ng von geklonten Plasmid, 2 µL 10 Pmol Grundierung Mix, 2 U Enzym, 1 X Reaktion Puffer), mit den Bedingungen, die in Tabelle 6dargestellt. Gel reinigen die erhaltenen 506-bp 3' UTR-Fragment (Abbildung 1E).

6. Generation des Konstrukts Transformation durch Fusion PCR (Abbildung 1E)

  1. Bereiten Sie die 3 Fragmente (mutagenisierter rpt4 +KAN und der 3' UTR) bei 50 ng/µL.
  2. Durchführen Sie Fusion, die PCR der drei mit Primer p11 und p12, Fragmente wie in Tabelle 7 beschrieben. (Das Protokoll für die Fusion PCR ist eine Modifikation des ursprünglichen Protokolls22.) Reinigen Sie das große 4.398-bp-PCR-Produkt.
    1. Verwenden Sie rpt4 +: KAN:3'UTR Fragmente in einem Verhältnis von 1:3:1 für optimale Ergebnisse.
      Hinweis: Der Gesamtbetrag der Einsatz DNA sollte nicht mehr als 500 ng. Die empfohlene Menge an rpt4 +: KAN:3'UTR ist 50 Ng:150 Ng:50 ng. Die mutagenisierter Region ist etwa 1,6 kb, so ist die minimale Anzahl von Hefe-Kolonien, die alle möglichen Kombinationen von jede Basis wird mutiert, die anderen drei ausmachen würde 1.600 x 3 = 4.800 Kolonien. Da eine Transformation Reaktion in der Regel 400 bis 500 Kolonien ergibt, mindestens 10 Reaktionen Wert der Fusion PCR zu konstruieren ist erforderlich. Dieses Bedürfnis kann erfüllt werden, indem einfach mehr Reaktion (z. B. Anzahl der PCR-Röhrchen) um den Faktor zehn.

7. Veränderung der Spalthefe durch Elektroporation (Abb. 1F)

  1. Hefe, 10 mL ja Mittel-bis Sättigung von mehr als 16 h Inkubation zu impfen.
  2. Verdünnen Sie die Zellen zu einer optischen Dichte bei 600 nm (OD600) von 0,2 in 200 mL ja Medium und inkubieren Sie bei 30 ° C mit Schütteln für ca. 5-6 h, OD600 = 0,6 - 0,8.
  3. Konzentration Zellen auf OD600 = 30, verzichten auf vier 50 mL konische Röhrchen und chill für 10 min auf Eis.
  4. Ernte der Zellen durch Zentrifugation bei 1.050 x g für 3 min bei 4 ° c durchführen Legen Sie die Rohre und 10 Elektro-Küvetten auf Eis. Führen Sie die Schritte 7,3-7,8 auf Eis.
  5. Verwerfen Sie den überstand und 15 mL 1,2 M Sorbit. Schütteln Sie die Rohre, um die Zellen aufzuwirbeln.
  6. Zentrifugieren Sie die Zellen bei 1050 X g für 3 min bei 4 ° C.
  7. Wiederholen Sie die Schritte 7.4 und 7.5. Verwerfen Sie den überstand. Jedes Rohr 500 µL 1,2 M Sorbit hinzu, Aufschwemmen der Zellen, und sammeln Sie alle Zellen in einem 15 ml konische Rohr.
  8. Hinzufügen von 1,2 M Sorbit bis zu 2,4 mL (OD600 = 10 pro 0,2 mL). Halten Sie das Rohr auf dem Eis.
  9. Fügen Sie 200 µL Sorbit gefederten Zellen (stellen Sie sicher, sie werden vollständig ausgesetzt), eine EP-Röhrchen mit der Fusion PCR zu konstruieren, gut mischen und übertragen Sie die Probe auf eine Elektro-Küvette.
  10. Electroporate die Zellen mit den folgenden Optionen: Pilze, ShS (2.00kV, 1 Impuls).
  11. Jedes Elektro-Küvette für ein Gesamtvolumen von 800 µL 600 µL 1,2 M Sorbit hinzu, und breitete sich dann die Zellen auf vier ja-Platten (200 µL/Platte). Zehn Elektro-Küvetten werden ja auf 40 Platten verzichtet.
  12. Inkubieren Sie die Platten bei 30 ° C für 24 h.
  13. Führen Sie Replica Plattierung ja + G418 und inkubieren Sie die Platten bei 30 ° C für 3 Tage.

8. Auswahl von Heterochromatin destabilisieren Mutanten und Fehlalarme werden gesucht

  1. Führen Sie für jede Platte ja + G418 Replik Plattierung ja-Ade (Low Ade) und PMG-Ade (No Ade) Platten. 1-2 Tage bei 30 ° C, inkubieren Sie die Replik Platten bis einige Kolonien auf den ja-Ade-Platten einer roten Färbung (Abbildung 1 zeigen).
  2. Ja-Ade und PMG-Ade Platten und wählen Sie Zellen, rosa oder weiß auf die ja-Ade-Platte anzeigen und wachsen auch auf der PMG-Ade-Platte, zu vergleichen. Wählen Sie Kolonien ohne Wachstum auf PMG-Ade, nicht, wie sie Fehlalarme (z. B. widerspiegeln sind, dass die KAN-Kassette auf eine nicht-Ziel-Website an anderer Stelle im Genom integriert worden ist).
  3. Wählen Sie ca. 1 x 105 Zellen von jeder Kolonie und brüten in 10 µL des SPZ-Lösung enthält 2,5 mg/mL Zymolyase 100 T bei 37 ° C für mindestens 30 Minuten Einsatz 1 µL dieser Lösung als Ausgangspunkt Vorlage für Kolonie PCR (Abbildung 1 H) durchführen.
    1. Machen Sie SPZ (50 mL) durch Mischen 30 mL 2 M Sorbit, 4,05 mL 1 M Na2HPO4, 0,95 mL NaH2PO4 und 15 mL destilliertem Wasser (endgültige pH 7,5). Proben (5 mL) werden mit Zymolyase ergänzt und in 500 µL Aliquots bei-20 ° C bis zum Gebrauch gespeichert.
  4. Durchführen Sie Gelelektrophorese (1,2 % Agarosegel, 180V, 20 min) zur Visualisierung der Ergebnisse der + Kolonie PCR. Wählen Sie Reaktionen, die PCR Bands die richtige Größe aufweisen und verdauen 5 µL jedes Reaktionsprodukt mit XhoI (4 U Enzym, 1 X Verdauung Puffer, 37 ° C Wasserbad, 1 h), Fehlalarme (Abbildung 1 H) auf den Bildschirm.
  5. Führen Sie Gelelektrophorese um den XhoI Übersichten (1,2 % Agarose-Gel, 180 V, 20 min) zu visualisieren. Markieren Sie die Kolonien deren PCR-Produkte werden durch XhoIgeschnitten und Patchen sie ja + G418 Platten (Abbildung 1I).
  6. GDNA aus der Kernspaltung Hefezellen zu isolieren und Sequenzierung der PCR Produkte23durchführen. Vergleichen Sie die erhaltenen Sequenz mit Wildtyp Sequenz, die Mutationen (Abbildung 1I) zu identifizieren.
  7. Führen Sie direkt wieder das Auge zu Wildtyp Zellen mit Fusion-Konstrukten von mutierten Zellen23durch PCR verstärkt zu verwandeln ein. Verwenden Sie Schmierblutungen, um den Phänotyp in den neugebildeten mutierten Zellen (Abbildung 1J) zu bestätigen.
    1. Fusion Umwandlung Konstrukt kann leicht mittels PCR Primer p1 mit p10 verstärkt werden mithilfe der genomischen DNS der Mutanten als Vorlage in einem Gesamtvolumen von 50 µL (~ 1 µg DNA, 20 U Enzym 1 x Reaktion Puffer), und die Anwendung der Reaktionszyklen, beschrieben in Tabelle 2 . Umwandlung des Konstrukts kann erfolgen, indem Sie die Schritte 7.1-7.13.

Ergebnisse

Die erworbenen Rpt4 Mutanten gemäß die in Abbildung 1 beschriebenen Verfahren können analysiert werden, durch die Beurteilung der Farben der Kolonien. Die Farben der Kolonien sind auf die entsprechenden Teller in abnehmender Anzahl von Zellen in Abbildung 2gesichtet. Die ade6 + Reporter an der Heterochromatin Region eingefügt wird in Wildtyp zum Schweigen gebracht und zeigt rote Kolonien in ja-Ade-Platte. Sobald das ...

Diskussion

Zufällige Mutagenese über fehleranfällige PCR ist ein leistungsfähiges Werkzeug zur Erzeugung von einem vielfältigen Pool von Mutanten in einer bestimmten Region. Diese Technik eignet sich besonders für Studien, die versuchen, die Funktion eines Proteins unter bestimmten Umständen zu beurteilen. Zum Beispiel verwendeten wir hierin fehleranfällige PCR, um die Funktion der 19 s-Proteasom Untereinheit, Rpt4, im Heterochromatin Wartung zu beurteilen. Durch Variation die Region gezielt durch die fehleranfällige PCR u...

Offenlegungen

Die Autoren haben nichts preisgeben.

Danksagungen

Finanzielle Unterstützung für dieses Projekt lieferte die grundlegende Wissenschaft Forschungsprogramm durch die National Research Foundation von Korea (NRF) gefördert durch das Ministerium für Wissenschaft und IKT (2016R1A2B2006354).

Materialien

NameCompanyCatalog NumberComments
1. Media
GlucoseSigma-AldrichG8270-10KG
Yeast extractBD Biosciences212720
L-LeucineJUNSEI87070-0310
Adenine sulfateACR16363-0250
Uracil Sigma-AldrichU0750
L-HistidineSigma-AldrichH8125
KH2PO4Sigma-Aldrich1.05108.0050
NaClJUNSEI19015-0350
MgSO4•7H2OSigma-Aldrich63140
CaCl2Sigma-Aldrich12095
Potassium phthalateSigma-AldrichP6758-500g
InositolSigma-AldrichI7508-50G
BiotinSigma-AldrichB4501-100MG
Boric AcidSigma-AldrichB6768-1KG
MnSO4Sigma-AldrichM7634-500G
ZnSO4•7H2JUNSEI83060-031
FeCl2•4H2OKANTOCB8943686
Sodium molybdate dihydrateYAKURI31621
KIJUNSEI80090-0301
CuSO4•5H2OYAKURI09605
D-myo-inositolMP biomedicals102052
PantothenateYAKURI26003
Nicotinic AcidSigma-AldrichN4126-500G
(NH4)2SO4 Sigma-AldrichA4418-100G
AgaroseBiobasicD0012
G418, geneticinLPSG41805
2. Enzyme reactions
PfuUltra II Fusion HS DNA PolymeraseAglient600380For site-directed mutagenesis
GeneMorphII Random mutagenesis KitAglient200500For error-prone PCR
Phusion High-Fidelity DNA PolymeraseThermo FisherF-530LFor fusion PCR
Ex Taq DNA PolymeraseTakaraRR001bFor general PCR
BamH1New England BioLabsR0136S
Xho1New England BioLabsR0146S
Dpn1New England BioLabsR0176S
3. Equipment
Velveteen square, blackVWR89033-116For replica
Replica-plating toolVWR25395-380For replica
MicroPulser ElectroporatorBiorad1652100 For fission yeast transformation
Electroporation Cuvettes, 0.2 cm gapBiorad1652086 For fission yeast transformation
Thermal CyclerBioerBYQ6078For fusion PCR ramp reaction 

Referenzen

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