La eficacia y los mecanismos de vía subyacentes del tratamiento con ShiDuGao para el eczema del ano basados en conjuntos de datos GEO y farmacología de red

Resumen

Este esfuerzo de investigación buscó dilucidar el mecanismo de administración tópica de medicamentos utilizando una integración sinérgica de conjuntos de datos ómnibus de farmacología de red y expresión génica (GEO). Este artículo evaluó la viabilidad, el objetivo y el mecanismo de ShiDuGao (SDG) en el tratamiento del eccema del ano.

Resumen

El eczema del ano es una enfermedad inflamatoria crónica y recurrente de la piel que afecta a la zona que rodea el ano. Si bien las lesiones ocurren principalmente en la piel anal y perianal, también pueden extenderse al perineo o los genitales. Se ha descubierto que ShiDuGao (SDG) posee importantes propiedades reparadoras contra el prurito anal, control de la exudación, reducción de la humedad y reparación de la piel. Sin embargo, las dianas genéticas y los mecanismos farmacológicos de los ODS sobre el eccema anal aún no se han dilucidado ni discutido de forma exhaustiva. En consecuencia, este estudio empleó un enfoque farmacológico de red y utilizó conjuntos de datos ómnibus de expresión génica (GEO) para investigar dianas génicas. Además, se estableció una red de interacción proteína-proteína (PPI), lo que resultó en la identificación de 149 dianas, de las cuales 59 se consideraron genes centrales, dentro de la red de interacción "fármaco-diana-enfermedad".

La función génica de SDG en el tratamiento del eccema perianal se evaluó mediante la utilización de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kioto (KEGG) y el análisis de Gene Ontology (GO). Posteriormente, se validó la función del eczema antiperiano y la posible vía de SDG, identificada en el análisis farmacológico de la red, utilizando la metodología de acoplamiento molecular. Los procesos biológicos asociados con los genes y proteínas dirigidos a los ODS en el tratamiento del eccema del ano abarcan principalmente las respuestas mediadas por citocinas, las respuestas inflamatorias y las respuestas a los lipopolisacáridos, entre otros. Los resultados de los análisis de enriquecimiento de vías y anotación funcional sugieren que los ODS desempeñan un papel crucial en la prevención y el tratamiento del eccema anal mediante la regulación de las vías de infección por el virus de la shigelosis y el herpes simple 1. La farmacología de la red y el análisis de la base de datos GEO confirman la naturaleza multidiana de los ODS en el tratamiento del eccema anal, específicamente mediante la modulación de TNF, MAPK14 y CASP3, que son objetivos centrales cruciales en las vías de señalización de TNF y MAPK. Estos hallazgos proporcionan una dirección clara para una mayor investigación sobre el mecanismo terapéutico de SDG para el eccema anal, al tiempo que destacan su potencial como un enfoque de tratamiento eficaz para esta afección debilitante.

Introducción

El eccema anal es una afección alérgica de la piel que afecta a la región perianal y a la mucosa, presentando diversas manifestaciones clínicas¹. Los síntomas característicos incluyen eritema anal, pápulas, ampollas, erosión, exudados y costras. Estos síntomas surgen principalmente debido al rascado, engrosamiento y aspereza del área afectada².

El eccema anal, caracterizado por una duración prolongada de la enfermedad, ataques recurrentes y tratamientos difíciles, puede tener efectos adversos en la salud física y mental de los pacientes³. La patogenia del eccema anal aú....

Protocolo

Este estudio no se refiere a la aprobación ética y el consentimiento para participar. Los datos utilizados en este estudio se obtuvieron de bases de datos de genes.

1. Predicción de dianas de enfermedades

1. Acceda a la base de datos GeneCards (https://www.genecards.org) y a la base de datos en línea sobre la herencia mendeliana en el hombre (OMIM, https://www.omim.org), utilizando "eczema ano" como término de búsqueda para objetivos de enfermedades.
2. Descargue las hojas de cálculo de los objetivos de la enfermedad. Elimine los objetivos repetidos para obtener los objetivos de eczema del ano.

Discusión

La dermatitis atópica es una forma específica de eccema que comparte mecanismos subyacentes con el eccema. Los genes centrales que se cree que están relacionados con esta afección son TNF, MAPK14 y CASP3. Los efectos terapéuticos de SDG sobre el eczema anal se atribuyen principalmente a su acción sobre las vías de señalización TNF y MAPK a través de estos tres genes centrales¹⁷.

SDG incluye cinco medicamentos distintos: índigo naturalis, ciprés dorado, yeso .......

Materiales

Name	Company	Catalog Number	Comments
AutoDockTools	AutoDock	https://autodocksuite.scripps.edu/adt/
Cytoscape 3.9.1	Cytoscape	https://cytoscape.org/
GeneCards database	GeneCards	https://www.genecards.org
GEO database	National Center for Biotechnology Information	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
GEO2R tool	National Center for Biotechnology Information	https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/
Metascape	Metascape	https://metascape.org/
Online Mendelian inheritance in man database	OMIM	https://www.omim.org
RCSB protein database	RCSB Protein Data Bank (RCSB PDB)	http://www.pdb.org/
STRING database	STRING	https://string-db.org/
Swiss ADME database	Swiss Institute of Bioinformatics	http://www.swissadme.ch/index.php
Traditional Chinese Medicine system's pharmacology database (TCMSP)	Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform	http://tcmspw.com/tcmsp.php
Venny2.1	BioinfoGP	https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html