Authors
Contact Us

Sign In

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

In This Article

  • Summary
  • Abstract
  • Introduction
  • Protocol
  • תוצאות
  • Discussion
  • Disclosures
  • Acknowledgements
  • Materials
  • References
  • Reprints and Permissions

Summary

מאמץ חקירה זה ביקש להבהיר את המנגנון של מתן תרופות אקטואלי באמצעות שילוב סינרגטי של פרמקולוגיה רשתית ומערכי נתונים של ביטוי גנים (GEO). מאמר זה העריך את ההיתכנות, המטרה והמנגנון של ShiDuGao (SDG) בטיפול באקזמה של פי הטבעת.

Abstract

אקזמה של פי הטבעת היא מחלת עור דלקתית כרונית וחוזרת המשפיעה על האזור סביב פי הטבעת. בעוד הנגעים מופיעים בעיקר בעור פי הטבעת והפריאנאלי, הם יכולים גם להתרחב לפרינאום או לאיברי המין. ShiDuGao (SDG) נמצא כבעל תכונות תיקון משמעותיות נגד גרד אנאלי, בקרת הפרשה, הפחתת לחות ותיקון העור. עם זאת, המטרות הגנטיות והמנגנונים הפרמקולוגיים של SDG על אקזמה אנאלית טרם הובהרו ונדונו באופן מקיף. כתוצאה מכך, מחקר זה השתמש בגישה פרמקולוגית רשתית והשתמש במערכי נתונים של ביטוי גנים אומניבוס (GEO) כדי לחקור מטרות גנים. בנוסף, הוקמה רשת אינטראקציה חלבון-חלבון (PPI), שהביאה לזיהוי של 149 מטרות, מתוכן 59 הוגדרו כגני רכזת, בתוך רשת האינטראקציה "תרופה-מטרה-מחלה".

תפקוד הגנים של SDG בטיפול באקזמה פריאנאלית הוערך באמצעות שימוש באנציקלופדיה קיוטו לגנים וגנומים (KEGG) וניתוח אונטולוגיה גנטית (GO). לאחר מכן, פונקציית האקזמה האנטי-פריאנאלית והמסלול הפוטנציאלי של SDG, כפי שזוהו בניתוח פרמקולוגי רשת, אומתו באמצעות מתודולוגיית עגינה מולקולרית. התהליכים הביולוגיים הקשורים לגנים וחלבונים ממוקדי SDG בטיפול באקזמה של פי הטבעת כוללים בעיקר תגובות בתיווך ציטוקינים, תגובות דלקתיות ותגובות לליפופוליסכרידים, בין היתר. תוצאות העשרת המסלול וניתוחי הביאור הפונקציונלי מצביעות על כך של-SDG תפקיד מכריע במניעה וניהול של אקזמה אנאלית על ידי ויסות מסלולי ההדבקה של נגיף שיגלוזיס והרפס סימפלקס 1. פרמקולוגיה של רשת וניתוח מסדי נתונים של GEO מאשרים את האופי הרב-תכליתי של SDG בטיפול באקזמה אנאלית, במיוחד על ידי אפנון TNF, MAPK14 ו- CASP3, שהם יעדי רכזת חיוניים במסלולי האיתות TNF ו- MAPK. ממצאים אלה מספקים כיוון ברור לחקירה נוספת של המנגנון הטיפולי של SDG לאקזמה אנאלית, תוך הדגשת הפוטנציאל שלו כגישה טיפולית יעילה למצב מתיש זה.

Introduction

אקזמה אנאלית היא מחלת עור אלרגית המשפיעה על האזור הפריאנאלי והרירית, המציגה ביטויים קליניים שונים1. הסימפטומים האופייניים כוללים אריתמה אנאלית, papules, שלפוחיות, שחיקה, exudates, ו crusting. תסמינים אלה מתעוררים בעיקר עקב גירוד, עיבוי וחספוס של האזור הפגוע2.

אקזמה אנאלית, המאופיינת במשך ממושך של המחלה, התקפים חוזרים ונשנים וטיפול מאתגר, עלולה להשפיע לרעה על בריאותם הגופנית והנפשית של החולים3. הפתוגנזה של אקזמה אנאלית עדיין אינה ברורה, והרפואה המודרנית מציעה כי היא עשויה להיות קשורה לנגעים אנאליים מקומיים, תזונה, סביבה, גנטיקה וגורמים אחרים4. בנוסף למניעת מגע עם חומרים מגרים ואלרגנים פוטנציאליים, הטיפול באקזמה אנאלית מתמקד בעיקר בשיטות כגון עיכוב דלקת, אנטי אלרגיה והקלה על גירוד5.

SDG נמצא בשימוש נרחב לטיפול באקזמה אנאלית ובמצבים אנאליים אחרים. SDG מווסת את ההפרשה של עור פי הטבעת, מפחית לחות, מתקן את עור פי הטבעת, ומטפל ביעילות בגרד 6,7,8. יתר על כן, SDG יש פוטנציאל לווסת את המיקרוביוטה perianus, ובכך לשפר אקזמהפי הטבעת 9,10.

פרמקולוגיה רשתית, גישה ביואינפורמטית חדשנית ובין-תחומית בתחום הבינה המלאכותית והביג דאטה, מספקת חקירה מעמיקה של הרפואה הסינית המסורתית. דיסציפלינה זו מדגישה את ההסבר המערכתי של כללי המתאם המולקולרי בין תרופות ומחלות מנקודת מבט של רשת אקולוגית. הוא אומץ באופן נרחב להיבטים שונים, כולל זיהוי מרכיבים פעילים מרכזיים בתמציות צמחים, פענוח מנגנוני הפעולה הגלובליים שלהם, גיבוש שילובי תרופות וחקר תאימות מרשם. מרשמים סיניים מסורתיים מציגים את התכונות של ריבוי רכיבים ורב-מטרות, המסמלות את יכולת ההסתגלות המשמעותית שלהם לתחום הפרמקולוגיה הרשתית. מונע על ידי מתודולוגיה זו, פרספקטיבות חדשות התפתחו בבחינת מערכות מורכבות של רפואה סינית מסורתית, המספקות תמיכה טכנית איתנה לרציונליזציה של יישומים קליניים וחדשנות תרופות 11,12,13,14.

מחקר זה נועד לחקור את מנגנון היעילות של SDG בטיפול באקזמה אנאלית. מאמץ חקירה זה ביקש להבהיר את המנגנון של מתן תרופות אקטואלי באמצעות שילוב סינרגטי של פרמקולוגיה רשתית ומערכי נתונים של GEO. הממצאים מספקים תובנות חשובות לגבי היעילות והמנגנונים הבסיסיים של SDG בניהול אקזמה לפי הטבעת, ומצביעים על הפוטנציאל שלה כגישה טיפולית יעילה למצב זה. דיאגרמת זרימת העבודה המפורטת של המחקר מוצגת באיור 1.

Protocol

מחקר זה אינו מתייחס לאישור אתי ולהסכמה להשתתף. הנתונים ששימשו במחקר זה התקבלו ממאגרי גנים.

1. חיזוי מטרות המחלה

  1. גש למסד הנתונים GeneCards (https://www.genecards.org) ולמסד הנתונים המקוון של תורשה מנדליאנית באדם (OMIM, https://www.omim.org), תוך שימוש ב"אקזמה של פי הטבעת" כמונח החיפוש ליעדי מחלה.
  2. הורד את הגיליונות האלקטרוניים של יעדי המחלה. מחק את המטרות החוזרות כדי להשיג את מטרות האקזמה של פי הטבעת.

2. בחירת רכיבים פעילים

  1. חפש את מילת המפתח "indigo naturalis, ברוש זהוב, גבס calcined, קלמין ומרה סינית" במסד הנתונים הפרמקולוגיה של מערכת הרפואה הסינית המסורתית (TCMSP; http://tcmspw.com/tcmsp.php) כדי לקבל את רשימת החומרים הפעילים המועמדים והמטרות של SDG.
  2. הפקד את הרכיב במסד הנתונים השוויצרי ADME (http://www.swissadme.ch/index.php), תוך חילוץ פרטים של אלה המציגים ספיגת GI "גבוהה", יחד עם לפחות שני ערכי DL "כן" כרכיבים פעילים.
    הערה: בדרך כלל, רק רכיבים עם ערכים דמויי תרופה (DL) ≥0.18 במסד הנתונים נכללים כמרכיבים פעילים.

3. בניית רשת PPI וסינון חלבוני הליבה

  1. ב- Venny2.1( https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html), הזן את המטרות של SDG ואקזמה של פי הטבעת לתוך LIST1 ו- LIST2, בהתאמה. ייצוג חזותי של הצומת נוצר באופן מיידי. לחץ על האזור המשותף כדי לחשוף את המטרות הנפוצות במקטע תוצאות .
  2. גש למסד הנתונים STRING (https://string-db.org/). הזן את היעדים בשדה רשימת שמות . לאחר מכן בחר הומו ספיינס כאורגניזם והמשך בחיפוש > המשך.
  3. כאשר התוצאות זמינות, פתח את Advanced Settings ובחר באפשרות hide disconnected nodes in the network. בציון האינטראקציה המינימלי הנדרש, הגדר את רמת הביטחון הגבוהה ביותר (0.900) ולאחר מכן לחץ על עדכן.
  4. לחץ על ייצוא כדי להוריד את הטקסט של רשת אינטראקציית חלבון-חלבון (PPI) בפורמט .png ו- .tsv.

4. בניית רשת תרופות-רכיב-מחלה-מטרה

  1. פתח את Cytoscape 3.9.1 וייבא את קובץ ה- .tsv המוזכר בשלב 3.4. לחץ על סרגל הסגנון בלוח הבקרה כדי למטב את הצבע, הגופן והצד של צמתי הרשת.
  2. לניתוח טופולוגיית רשת, השתמש בפונקציה נתח רשת . כדי להשיג גנים רכזת, השתמש CytoHubba בתוכנת Cytoscape. להקים את רשת היעד של התרופה-רכיב-מחלה.

5. ניתוח העשרה של GO ו-KEGG

  1. גש לאתר Metascape (https://metascape.org/). בחר קובץ או הדבק רשימת גנים בתיבת הדו-שיח ולחץ על הלחצן Submit . לאחר מכן בחר H. sapiens הן בקלט כמינים והן בניתוח כמינים; לאחר מכן, הפעל את הפונקציה ניתוח מותאם אישית .
  2. באפשרות ההעשרה, בחר GO Molecular Functions, GO Biological Processes, GO Cellular Components ומסד הנתונים KEGG Pathway. סמן את Pick Selective GO Clusters, ולאחר מכן לחץ על הלחצן Enrichment Analysis . עם השלמת מד ההתקדמות, התחל לחץ על דף דוח ניתוח כדי לאחזר את תוצאות ההעשרה.

6. ניתוח מערך נתונים של שבבי גנים GEO

  1. חפש ונתח את ערכת הנתונים של שבב הגן GEO (GDS3806) באמצעות הכלי GEO2R (https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/) כדי לחקור את הביטוי של גנים מרכזיים בקבוצות נתונים שונות (קבוצת ביקורת-לא אטופיק דרמטיטיס; ניסוי קבוצתי-אטופיק דרמטיטיס).
  2. היכנס לאתר מסד הנתונים של GEO (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/). הזן מילת מפתח או GEO Accession, ולחץ על כפתור החיפוש . בחר את התוצאה התואמת הטובה ביותר. מצא את סידרת העזר (GSE26952).
  3. היכנס לאתר הכלי GEO2R (https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/), הזן את סדרת הפניות בתיבה GEO Accession ולחץ על הלחצן Set . בחר אטופיק דרמטיטיס כקבוצת הניסוי, בחר Nonatopic Control כקבוצת הביקורת ולחץ על הלחצן נתח . לאחר השלמת החישוב, תופיע התוצאה.

7. עגינה מולקולרית

  1. פתח את מסד הנתונים TCMSP והורד את המבנה התלת-ממדי של המרכיבים שנבחרו. השתמש בתיבת החיפוש שם כימי וחפש את שמות המרכיבים שנבחרו כדי להוריד את קובצי המבנה התלת-ממדי המתאימים בתבנית mol2.
  2. פתח את מסד הנתונים של חלבוני RCSB (http://www.pdb.org/) והורד את המבנים הגבישיים של המטרות העיקריות. בתיבת החיפוש, חפש את שמות היעד והורד את קובצי מבנה הגביש המתאימים בפורמט pdb.
  3. ייבוא רכיבים וקובצי מבנה יעד לתוכנת הניתוח. מחק מולקולות מים על ידי לחיצה על ערוך > מחק מים. הוסף מימן על ידי לחיצה על ערוך > מימן > הוסף. הגדר את המרכיבים כליגנד, בחר מטרות שלמות כקולטן ובצע עגינה עיוורת.
  4. לקבוע את טווח העגינה המולקולרית.
    1. בחר את הקולטן והליגנד ברצף. לחץ על Grid > Grid Box כדי להתאים את תיבת הרשת כך שתכלול את כל הדגם. לחץ על קובץ > סגור שמירת זרם כדי לשמור את מצב תיבת הרשת. שמור קבצים בפורמט gpf.
    2. לחץ על הפעל > הפעל Autogrid4 > שם קובץ פרמטר > עיון, בחר את קובץ gpf ולאחר מכן לחץ על הפעל לחצן.
  5. השתמש ב- AutoDock 4 לביצוע עגינה מולקולרית.
    1. לחץ על Docking > Macromolecule > Set Rigid Filename כדי לבחור את הקולטן. לחץ על Docking > Ligand > Open/ בחר לבחור את הליגנד.
    2. לחץ על Docking > Search Parameters כדי להגדיר אלגוריתמי הפעלה ועל Docking > Docking Parameters כדי להגדיר פרמטרי עגינה. בחר את קובץ ה- dpf ולאחר מכן לחץ על לחצן הפעל. שמור קבצים בתבנית dpf.
    3. לחץ על Analyze > Docking > Open, בחר את קובץ ה-dlg, לחץ על Analyze > Macromolecule כדי לפתוח את הקולטן, לחץ על Analyze > Conforms > Play, מדורג לפי אנרגיה כדי לנתח את התוצאות. לחץ על Set Play > Write Complex כדי לשמור את התוצאות בתבנית pdbqt.
  6. ייבא את קבצי העגינה לתוכנת PyMOL כדי לבנות הדמיה נוספת.
    1. בחר את הליגנד ולחץ על פעולה > מצא > אנשי קשר קוטביים > לאטומים אחרים בעצם כדי להציג קשרי מימן בין ליגנדות לסביבה החיצונית. לחץ על c כדי לשנות צבע.
    2. לחץ על פעולה > לחלץ אובייקט. לחץ על הצג > Sticks כדי להראות את מבנה המקל של הקולטן. זהה את השאריות המחוברות לליגנדות והראה את מבנה המקל.
    3. לחץ על Hide > Sticks כדי להסתיר את מבנה המקל של הקולטן. לחץ על Wizard > Measurement ולחץ על שני אטומים ברצף. לחץ על תווית > שאריות כדי להציג את תווית השאריות. התאימו את צבע הרקע והשקיפות במידת הצורך. לחץ על קובץ > ייצוא תמונה לגבי כדי לשמור את התמונה.

תוצאות

גנים הקשורים לאקזמה בפי הטבעת, גני מטרה SDG ומטרות נפוצות
958 גנים פוטנציאליים נבדקו ב-Genecards ו-634 במאגרי OMIM, בעוד שכפילויות לא נכללו. כדי להשיג הבנה מקיפה של גנים הקשורים לאקזמה אנאלית, אוחדו הממצאים ממסדי נתונים מרובים, והניבו בסך הכל 958 גנים שונים. כתוצאה מכך, נוסחה בקפדנות רשת אינט?...

Discussion

אטופיק דרמטיטיס היא צורה ספציפית של אקזמה החולקת מנגנונים בסיסיים עם אקזמה. גנים מרכזיים שמאמינים כי הם קשורים למצב זה הם TNF, MAPK14 ו-CASP3. ההשפעות הטיפוליות של SDG על אקזמה אנאלית מיוחסות בעיקר לפעולתו על מסלולי האיתות TNF ו- MAPK באמצעות שלושת הגנים הללו17.

SDG כוללת חמש ת...

Disclosures

למחברים אין מה לחשוף.

Acknowledgements

ללא.

Materials

NameCompanyCatalog NumberComments
AutoDockToolsAutoDockhttps://autodocksuite.scripps.edu/adt/
Cytoscape 3.9.1 Cytoscapehttps://cytoscape.org/
GeneCards database GeneCardshttps://www.genecards.org
GEO databaseNational Center for Biotechnology Informationhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
GEO2R tool National Center for Biotechnology Informationhttps://ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/
MetascapeMetascapehttps://metascape.org/
Online Mendelian inheritance in man databaseOMIMhttps://www.omim.org
RCSB protein database RCSB Protein Data Bank (RCSB PDB)http://www.pdb.org/
STRING database STRINGhttps://string-db.org/
Swiss ADME database Swiss Institute of Bioinformaticshttp://www.swissadme.ch/index.php
Traditional Chinese Medicine system's pharmacology database (TCMSP)Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platformhttp://tcmspw.com/tcmsp.php
Venny2.1BioinfoGPhttps://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

References

  1. Ma, M., Lu, H., Yang, Z., Chen, L., Li, Y., Zhang, X. Differences in microbiota between acute and chronic perianal eczema. Medicine. 100 (16), e25623 (2021).
  2. Dietrich, C. F., Hoch, F. Anal eczema. Revue Therapeutique. 78 (9), 509-512 (2021).
  3. Dietrich, A., Ruzicka, T., Hermans, C. Differential diagnosis of anal eczema. Hautarzt. 66 (6), 400-407 (2015).
  4. Rohde, H. Anal eczema, condylomata acuminata. Deutsche Medizinische Wochenschrift. 133 (6), 245-246 (2008).
  5. Havlickova, B., Weyandt, G. H. Therapeutic management of anal eczema: an evidence-based review. International Journal of Clinical Practice. 68 (11), 1388-1399 (2014).
  6. Rainer, B. M., et al. Characterization and analysis of the skin microbiota in Rosacea: A case-control study. American Journal of Clinical Dermatology. 21 (1), 139-147 (2020).
  7. Park, S. Y., Kim, H. S., Lee, S. H., Kim, S. Characterization and analysis of the skin microbiota in acne: Impact of systemic antibiotics. Journal of Clinical Medicine. 9 (1), 168 (2020).
  8. Woo, Y. R., Lee, S. H., Cho, S. H., Lee, J. D., Kim, H. S. Characterization and analysis of the skin microbiota in Rosacea: Impact of systemic antibiotics. Journal of Clinical Medicine. 9 (1), 185 (2020).
  9. Zheng, Y., et al. Alterations in the skin microbiome are associated with disease severity and treatment in the perioral zone of the skin of infants with atopic dermatitis. European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 38 (9), 1677-1685 (2019).
  10. Totté, J. E. E., et al. Nasal and skin microbiomes are associated with disease severity in paediatric atopic dermatitis. The British Journal of Dermatology. 181 (4), 796-804 (2019).
  11. Zhao, X. Y., Yang, Y. Y., Jl Feng, ., Feng, C. I. Network pharmacology prediction and experimental validation of Trichosanthes-Fritillaria thunbergii action mechanism against lung adenocarcinoma. Journal of Visualized Experiments. (193), e64847 (2023).
  12. Zeng, B., et al. Network pharmacology prediction and metabolomics validation of the mechanism of Fructus Phyllanthi against hyperlipidemia. Journal of Visualized Experiments. (194), e65071 (2023).
  13. Wang, T., Jiang, X., Ruan, Y., Li, L., Chu, L. The mechanism of action of the combination of Astragalus membranaceus and Ligusticum chuanxiong in the treatment of ischemic stroke based on network pharmacology and molecular docking. Medicine. 101 (28), e29593 (2022).
  14. Wang, T., et al. Exploring the mechanism of luteolin by regulating microglia polarization based on network pharmacology and in vitro experiments. Scientific Reports. 13 (1), 13767 (2023).
  15. Qi-Yue, Y., et al. From natural dye to herbal medicine: a systematic review of chemical constituents, pharmacological effects and clinical applications of indigo naturalis. Chinese Medicine. 15 (1), 127 (2020).
  16. André, C., Dumur, J. P., Hrabina, M., Lefebvre, E., Sicard, H. Juniperus ashei: the gold standard of the Cuppressaceae. Allergie et Immunologie. 32 (3), 104-106 (2000).
  17. Weidinger, S., Novak, N. Atopic dermatitis. Lancet. 387 (10023), 1109-1122 (2016).
  18. Cai, L. L., Wu, Y., He, J. Network pharmacology of Shidu ointment in the treatment of EGFR-TKIs induced acneiform eruptions. China Pharmaceuticals. 29 (16), 5 (2020).
  19. Gu, S., et al. Mechanisms of indigo naturalis on treating ulcerative colitis explored by GEO gene chips combined with network pharmacology and molecular docking. Scientific Reports. 10 (1), 15204 (2020).
  20. Lou, Y., Ma, Y., Jin, J., Zhu, H. Oral realgar-indigo naturalis formula plus retinoic acid for acute promyelocytic leukemia. Frontiers in Oncology. 10, 597601 (2021).
  21. Zhang, Q., et al. Psoriasis treatment using Indigo Naturalis: Progress and strategy. Journal of Ethnopharmacology. 297, 115522 (2022).
  22. Naganuma, M., et al. Efficacy of Indigo Naturalis in a multicenter randomized controlled trial of patients with ulcerative colitis. Gastroenterology. 154 (4), 935-947 (2018).
  23. Yang, Q. Y., et al. Exploring the mechanism of Indigo Naturalis in the treatment of ulcerative colitis based on TLR4/MyD88/NF-κB signaling pathway and gut microbiota. Frontiers in Pharmacology. 12, 674416 (2021).
  24. Sun, Z., et al. Indigo Naturalis alleviates dextran sulfate sodium-induced colitis in rats via altering gut microbiota. Frontiers in Microbiology. 11, 731 (2020).
  25. Cao, H., et al. Immune and metabolic regulation mechanism of Dangguiliuhuang decoction against insulin resistance and hepatic steatosis. Frontiers in Pharmacology. 8, 445 (2017).
  26. Min, S. Y., Park, C. H., Yu, H. W., Park, Y. J. Anti-inflammatory and anti-allergic effects of saponarin and its impact on signaling pathways of RAW 264.7, RBL-2H3, and HaCaT cells. International Journal of Molecular Sciences. 22 (16), 8431 (2021).
  27. Seo, K. H., et al. Saponarin from barley sprouts inhibits NF-κB and MAPK on LPS-induced RAW 264.7 cells. Food & Function. 5 (11), 3005-3013 (2014).
  28. Moreno-Anzúrez, N. E., et al. A cytotoxic and anti-inflammatory campesterol derivative from genetically transformed hairy roots of Lopezia racemosa Cav. (Onagraceae). Molecules. 22 (1), 118 (2017).
  29. Numao, N., et al. Tryptanthrin attenuates TLR3-mediated STAT1 activation in THP-1 cells. Immunologic Research. 70 (5), 688-697 (2022).
  30. Veni, A., Lokeswari, T. S., Pavithra, D., Sugapriya, T. Melianone inhibits secreted aspartic proteases (SAP), a virulence factor during hyphal formation in Candida albicans. Current Computer-Aided Drug Design. 18 (5), 327-336 (2022).
  31. Veni, A., Lokeswari, T. S., Krishna Kumari, G. N., Gayathri, D., Sudandiradoss, C. Bioactivity of melianone against Salmonella and in silico prediction of a membrane protein target. 3 Biotech. 10 (10), 460 (2020).
  32. Ma, M., Lu, H., Yang, Z., Chen, L., Li, Y., Zhang, X. Differences in microbiota between acute and chronic perianal eczema. Medicine. 100 (16), e25623 (2021).
  33. Williams, H. C., Chalmers, J. Prevention of atopic dermatitis. Acta Dermato-Venereologica. 100 (12), (2020).
  34. Nogales, C., Mamdouh, Z. M., List, M., Kiel, C., Casas, A. I., Schmidt, H. H. H. W. Network pharmacology: curing causal mechanisms instead of treating symptoms. Trends in Pharmacological Sciences. 43 (2), 136-150 (2022).
  35. Wang, T., Zhou, Y., Wang, K., Jiang, X., Wang, J., Chen, J. Prediction and validation of potential molecular targets for the combination of Astragalus membranaceus and Angelica sinensis in the treatment of atherosclerosis based on network pharmacology. Medicine (Baltimore). 101 (26), e29762 (2022).
  36. Jiang, X., et al. Exploration of Fuzheng Yugan mixture on COVID-19 based on network pharmacology and molecular docking. Medicine (Baltimore). 102 (3), e32693 (2023).
  37. Dong, Y., Zhao, Q., Wang, Y. Network pharmacology-based investigation of potential targets of astragalus membranaceous-angelica sinensis compound acting on diabetic nephropathy. Scientific Reports. 11 (1), 19496 (2021).
  38. Wang, T., Jiang, X., Lu, Y., Ruan, Y., Wang, J. Identification and integration analysis of a novel prognostic signature associated with cuproptosis-related ferroptosis genes and relevant lncRNA regulatory axis in lung adenocarcinoma. Aging (Albany NY). 15 (5), 1543-1563 (2023).
  39. Wang, T., Jiang, X., Ruan, Y., Zhuang, J., Yin, Y. Based on network pharmacology and in vitro experiments to prove the effective inhibition of myocardial fibrosis by Buyang Huanwu decoction). Bioengineered. 13 (5), 13767-13783 (2022).

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Explore More Articles

JoVE203ShiDuGaoTNFMAPKGEO

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Contact Us

Recommend to library

JoVE NEWSLETTERS

Research

Education

Authors

Librarians

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved