基于GEO数据集和网络药理学的石都高治疗肛门湿疹的疗效及潜在通路机制

摘要

这项调查工作旨在通过网络药理学和基因表达综合 （GEO） 数据集的协同整合来阐明局部给药的机制。本文评价了石度高（SDG）治疗肛门湿疹的可行性、靶点和机制。

摘要

肛门湿疹是一种影响肛门周围区域的慢性复发性炎症性皮肤病。虽然病变主要发生在肛门和肛周皮肤，但它们也可以延伸到会阴或生殖器。石度高 （SDG） 已被发现具有显着的修复特性，可防止肛门瘙痒、控制渗出、减少水分和修复皮肤。然而，SDG对肛门湿疹的遗传靶点和药理机制尚未得到全面阐明和讨论。因此，本研究采用网络药理学方法，并利用基因表达综合（GEO）数据集来研究基因靶点。此外，还建立了蛋白质-蛋白质相互作用网络（PPI），从而在“药物-靶点-疾病”相互作用网络中鉴定了149个靶点，其中59个被认为是枢纽基因。

通过利用京都基因和基因组百科全书（KEGG）和基因本体（GO）分析评估SDG在治疗肛周湿疹中的基因功能。随后，采用分子对接方法验证了网络药理学分析中确定的SDG的抗肛周湿疹功能和潜在通路。在肛门湿疹治疗中，与SDG靶向基因和蛋白质相关的生物过程主要包括细胞因子介导的反应、炎症反应和对脂多糖的反应等。通路富集和功能注释分析的结果表明，SDG通过调节志贺菌病和单纯疱疹病毒1型感染途径，在预防和管理肛门湿疹方面发挥着至关重要的作用。网络药理学和GEO数据库分析证实了SDG在治疗肛门湿疹方面的多靶点性质，特别是通过调节TNF、MAPK14和CASP3，它们是TNF和MAPK信号通路中的关键枢纽靶点。这些发现为进一步研究SDG对肛门湿疹的治疗机制提供了明确的方向，同时强调了其作为这种衰弱性疾病的有效治疗方法的潜力。

引言

肛门湿疹是一种影响肛周区域和粘膜的过敏性皮肤病，表现出多种临床表现¹.特征性症状包括肛门红斑、丘疹、水疱、糜烂、渗出物和结痂。这些症状主要是由于受影响区域的划痕、增厚和粗糙^{而引起的 2}.

肛门湿疹的特征是病程长、反复发作和具有挑战性的治疗，会对患者的身心健康产生不良影响³.肛门湿疹的发病机制尚不清楚，现代医学提示可能与局部肛门病变、饮食、环境、遗传等因素有关⁴。肛门湿疹的治疗除了避免接触刺激物和潜在过敏原外，主要集中在抑制炎症、抗过敏、缓解瘙痒等方法^上5。

SDG已被广泛用于治疗肛门湿疹和其他肛门疾病。SDG调节肛门皮肤渗出，减少水分，修复肛门皮肤，并有效解决瘙痒^6,7,8。此外，SDG具有调节肛门菌群的潜力，从而改善肛门湿疹^9,10。

研究方案

本研究不涉及伦理批准和参与同意。本研究中使用的数据来自基因数据库。

1. 疾病靶点预测

1. 访问 GeneCards 数据库 （https://www.genecards.org） 和在线孟德尔遗传人类数据库 （OMIM， https://www.omim.org），使用“肛门湿疹”作为疾病靶点的搜索词。
2. 下载疾病目标的电子表格。删除重复目标，获取肛门湿疹目标。

2.活性成分的选择

1. 在中医药系统药理学数据库（TCMSP;http://tcmspw.com/tcmsp.php）上搜索关键词“靛蓝、金柏、煅烧石膏、炉甘石和中国瘿”，即可获得SDG的候选活性成分和靶点清单。
2. 将该组分委托给瑞士ADME数据库（http://www.swissadme.ch/index.php），提取那些表现出“高”GI吸收的成分的详细信息，并至少有两个“是”DL值作为活性元素。
   注意：通常，只有数据库中类药物 （DL） 值 ≥0.18 的成分才作为活性成分包含在内。

3. PPI网络的构建和核心蛋白的筛选

1. 在Venny2.1（https://bioinfogp.cn....

讨论

特应性皮炎是一种特殊形式的湿疹，与湿疹具有共同的潜在机制。被认为与这种情况相关的中心基因是 TNF、MAPK14 和 CASP3。SDG对肛门湿疹的治疗作用主要归因于其通过这三个枢纽基因对TNF和MAPK信号通路的作用¹⁷。

SDG包括五种不同的药物：天然靛蓝、金柏、煅烧石膏、炉甘石和中国瘿。在中药中，煅烧石膏和炉甘石可以起到促进伤口愈合和干燥湿气的作用，而.......

材料

Name	Company	Catalog Number	Comments
AutoDockTools	AutoDock	https://autodocksuite.scripps.edu/adt/
Cytoscape 3.9.1	Cytoscape	https://cytoscape.org/
GeneCards database	GeneCards	https://www.genecards.org
GEO database	National Center for Biotechnology Information	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
GEO2R tool	National Center for Biotechnology Information	https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/
Metascape	Metascape	https://metascape.org/
Online Mendelian inheritance in man database	OMIM	https://www.omim.org
RCSB protein database	RCSB Protein Data Bank (RCSB PDB)	http://www.pdb.org/
STRING database	STRING	https://string-db.org/
Swiss ADME database	Swiss Institute of Bioinformatics	http://www.swissadme.ch/index.php
Traditional Chinese Medicine system's pharmacology database (TCMSP)	Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform	http://tcmspw.com/tcmsp.php
Venny2.1	BioinfoGP	https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html