Koo BK y Mustata RC son apoyados por el Sir Henry Dale Fellowship de la Wellcome Trust y Andersson-Rolf A es apoyado por el Consejo de Investigación Médica (MRC). Fink J es apoyada por el Programa de Doctorado de 4 años Wellcome Trust.

Todos los ratones utilizados en el siguiente protocolo se mantuvieron en condiciones libres de patógenos específicos, y todos los procedimientos se realizaron de acuerdo a los reglamentos de los Estados Unido Home Office. 1. Preparación <ol><li> Preparar los medios de comunicación de 1 hora antes de su uso (véase la Tabla 1 y Lista de Materiales para más detalles) y pre-calentamiento en un baño de agua a 37 ° C por lo menos 10 minutos antes de su uso. </li></ol> 2. El cultivo del Intestino Delgado (SI) Organoides NOTA: A menos que se indique lo contrario, todas las incubaciones se realizaron a 37 ° C, 5% de CO2 en un incubador humidificado. Equipo y reactivos entren en contacto con las células vivas deben ser estériles. Pre-calentamiento de la placa de cultivo tisular es importante ya que evita que la matriz de sótano (Matrigel o BME) gotas se propague hacia fuera cuando la siembra. Además, la matriz de sótano debe mantenerse en hielo en todo momento. Almacenar a -20 ° C y descongelaciónen hielo antes de su uso. <ol><li> Aislar Criptas <ol><li> Para el aislamiento del intestino delgado sacrificar el ratón de acuerdo con las normas y reglamentos nacionales, a continuación, colocar al animal a su espalda y lavar el abdomen con etanol al 70%. Realizar una incisión de línea media longitudinal desde la ingle hasta el esternón. En primer lugar, cortar la piel y luego el tejido subcutáneo. Retire el intestino delgado desde el ciego hasta el estómago. Criptas aisladas de duodeno, yeyuno y el íleon se pueden utilizar para el cultivo de organoide. </li><li> Lavar el intestino delgado aislado con pre-enfriado solución salina tamponada con fosfato sin calcio o magnesio (PBS0). </li><li> Cortar el tejido en 3-5 cm piezas largas y usar las tijeras para cortar abrir longitudinalmente. Extender el tejido mediante el uso de fórceps. </li><li> Raspe vellosidades utilizando un cubreobjetos. Precaución, demasiada fuerza hará que el tejido a desgarrarse y se reducirá el rendimiento de las criptas en los siguientes pasos. </li><li> Transferir el tejido a un tubo de 50 ml que contiene pre-enfriado usin PBS0fórceps g. Lave los fragmentos de tejido a través de una agitación vigorosa y cambiar el PBS0. Repita 2-3 veces o hasta que el PBS0 resulta menos nublado. </li><li> Incubar el tejido en un tubo de 50 ml que contiene 30 ml de PBS0 con 1 mM de ácido etilendiaminotetraacético (EDTA) durante 30 min a 4 ° C en un tubo de rodillo. </li><li> Agite vigorosamente el tubo y transferir el tejido a otro tubo de 50 ml que contiene 30 ml de PBS0 con EDTA 5 mM. La solución 1 mM de EDTA (anteriormente que contiene el tejido) contendrá una mezcla de criptas y vellosidades. Esta fracción no es adecuado para la siembra de organoides ya que a menudo contiene un alto porcentaje de las vellosidades. </li><li> Incubar el tejido adicionalmente durante 1 hora a 4 ° C en un tubo de rodillo. </li><li> Agite vigorosamente el tubo y recoger la solución en un tubo de 50 ml limpio. Confirmar la presencia de criptas y estimar el número, por ejemplo, contando las criptas en 50 l por microscopía de luz. Calcular el volumen necesario para obtener 50-100 criptas y la transfiere a un 1,5 ml de tube. </li><li> Gira a 300 xg durante 5 min. Descartar el sobrenadante, resuspender el precipitado en 50 l de matriz sótano, y la semilla en una placa de 24 pocillos pre-calentado. Incubar la placa en un incubador de cultivo tisular durante 5-15 min por lo que la matriz de sótano polimeriza. </li><li> Superposición con 500 l medio ENR (ver Tabla 1). Aproximadamente 24 horas después de la siembra los organoides mostrará una pequeña forma quística ronda y después de otros 2-3 días en ciernes estructuras se hacen visibles. Cambie a los medios ENR frescas cada 3 días. </li><li> Pasaje organoid culturas cada 7 días. </li></ol></li><li> Propagación y Organoides Mantenimiento <ol><li> Mantener los organoides mediante la actualización de los medios cada 3 días y el paso 1: 3 o 1: 5 como el lumen se llena con las células muertas, aproximadamente cada 7 días. </li><li> Romper la cúpula matriz sótano con medio usando 1 ml punta Pipetman y transferirla desde el pozo a un tubo de 1,5 ml. </li><li> Mecánicamente disociar los organoides a través de un pipeteoproximadamente 50x utilizando un fino (por ejemplo, 200 l) de punta. </li><li> Gira a 300 xg durante 5 min. </li><li> Descartar el sobrenadante y resuspender el precipitado en 150-250 l de matriz sótano. Semilla en un pre-calentó placa de 24 pocillos (50 l de matriz de sótano / pocillo). Antes de la siembra de la matriz sótano pipeta arriba y abajo una vez para recubrir la pared de la punta. Pipeta lentamente para evitar burbujas y semilla en el centro del pozo para evitar la matriz sótano se propague hacia fuera. Se desea obtener una cúpula de matriz sótano en el centro del pozo. </li><li> Incubar en un incubador de cultivo tisular durante 5-15 min por lo que la matriz de sótano polimeriza. Superposición con 500 l de medios ENR por pocillo. </li></ol></li></ol> 3. Pre-tratamiento de la infección SI Organoides NOTA: La Figura 1 ilustra el procedimiento de transducción. <ol><li> Intercambio ENR a ENRWntNic (ver Tabla 1) medio y crecer los organoides en tsu medio por un mínimo de 3 días o hasta que hayan adoptado una morfología quística. Wnt3a aumenta el número de células madre y de Paneth mientras nicotinamida (NIC) mejora la eficiencia de la cultura. </li></ol> Producción 4. Virus <ol><li> Se necesita un 150 mm placa de células Platinum-E por infección. Semilla de aproximadamente 5 x 10 6 células con 15-18 ml de medio (DMEM + 10% FBS) en presencia de puromicina (1 mg / ml) y blasticidina (10 g / ml). Transfectar células después de 2-3 días, cuando han alcanzado el 70-80% de confluencia. Cambie el medio a DMEM + FBS al 10% y sin puromicina y blasticidin antes de la transfección. </li><li> Añadir 30 g de constructo de ADN retroviral y 240 l de polietilenimina (PEI) para separar tubos que contenían 1 ml de Opti-MEM. Mezclar e incubar a temperatura ambiente durante 5 min. </li><li> Reunir las dos soluciones y se incuba a temperatura ambiente durante 20-30 min. Añadir la mezcla completa al medio de las células Platinum-E y agitar con cuidado el plate para garantizar la distribución equitativa de los complejos ADN-PEI. </li><li> Se incuban las células Platinum-E con la mezcla de transfección durante la noche y refrescar el medio al día siguiente. Mantener las células en el nuevo medio durante 2 días. </li><li> Recoger sólo el medio en un tubo Falcon de 50 ml, pasarla a través de un filtro de 0,45 micras y se centrifuga a 8000 xg a 4 ° C durante 12-16 h. Desechar el sobrenadante y resuspender el sedimento en 250 l de medio de transducción (ver Tabla 1). </li></ol> 5. organoide Preparación Fragmento <ol><li> Por una infección se necesita un pocillo de una placa de 24 pocillos. Romper la cúpula matriz sótano con medio usando 1 ml punta Pipetman y transferirlo a un tubo de 1,5 ml. </li><li> Utilice una punta de volumen más fino (por ejemplo, 200 l consejos) para interrumpir mecánicamente los organoides través de pipeteado (30-50x). La solución se enturbie ni organoides enteros debe ser visible. </li><li> Centrifugar a temperatura ambiente, 900 xg durante 5 min<html> . </li><li> Desechar el sobrenadante y resuspender el sedimento en 500 l de proteasa recombinante de calidad para cultivo celular (por ejemplo, TrypLE). Se incuba a 37 ° C durante 5 min. Después de la incubación comprobar el tamaño de los fragmentos de organoides utilizando microscopía de luz, contando el número de células por fragmento. Los fragmentos que contienen 5-10 células son ideales. Si la mayoría de los fragmentos contienen un mayor número de células el tiempo de incubación puede aumentarse por 2 min a la vez. </li><li> Terminar el proceso de disociación mediante la adición de 500 l de medio ENR. </li><li> Centrifugar a temperatura ambiente, 900 xg durante 5 min. Eliminar el sobrenadante y mantener el sedimento en hielo o 4 ° C. </li></ol> 6. Transducción retroviral <ol><li> Combinar fragmentos de organoides con 250 l de la solución retroviral (de la sección 4.5) en un pocillo de una placa de 48 pocillos. Mezclar suavemente con la pipeta lentamente usando 1 ml de punta Pipetman. </li><li> Sellar la placa con Parafilm. </li></ol>e &quot;&gt; 7. espinoculación y Plating <ol><li> Centrifugar la placa a 32 ° C, 600 xg, durante 1 hora. Retire con cuidado el Parafilm e incubar la placa en un incubador de cultivo tisular durante 6 horas. </li></ol> 8. Siembra de infectados Fragmentos organoid <ol><li> La transferencia de los fragmentos de organoides infectadas y medios de transducción del pozo a un tubo de 1,5 ml y centrifugar a 900 xg durante 5 min. </li><li> Descartar el sobrenadante y poner el tubo que contiene el sedimento en hielo durante 5 min a fresco. Añadir 100 l de matriz sótano y volver a suspender el precipitado pipeteando lentamente arriba y abajo. </li><li> Gotas de semillas de &#39;matriz sótano -Cell mezclar&#39; 50 l en una nueva placa de 24 pocillos. Incubar la placa a 37 ° C durante 5-15 minutos hasta que se solidifica la matriz sótano. </li><li> Añadir un medio de transducción sin polibreno a los pocillos y se incuba la placa en una incubadora de cultivo de tejidos. Cambie los medios de comunicación cada 2-3 días. </li></ol> 9. Selección <ol><li> Iniciar sílection después de 2-3 días por la adición de puromicina (1 mg / ml) a los medios de comunicación. </li><li> Cuando los fragmentos están empezando a formar organoides reemplazar el medio de transducción con los medios suplementados con puromicina ENR (1 mg / ml). </li></ol> 10. Post-Tratamiento de la infección de la IS Organoides <ol><li> Cultura transdujo organoides de acuerdo con la &quot;Propagación y mantener organoides&quot; protocolo (sección 2.2.1). Después de 1-2 semanas los organoides SI recuperarán sus estructuras en ciernes. </li><li> Tras la aparición de estructuras en ciernes inducir la expresión de los genes miARN o de ADNc mediante la adición de 4-hidroxitamoxifeno (4-OHT) en una concentración de trabajo de 1 mM. Tenga en cuenta que este paso es válida sólo si el uso de vectores retrovirales Addgene (pMSCV-loxp-dsRed-loxp-eGFP-Puro-WPRE (32702), pMSCV-loxp-dsRed-loxp-3xHA-Puro-WPRE (32703), y pMSCV -flip-puro-dsRed-GFP-miRNA (32704)) y organoides que expresan Cre-ERT2. </li></ol> 11. La confirmación de la infección y Expresión / Supresión del gen de interés <ol><li> Si usando vectores retrovirales de Addgene (32702, 32703 y 32704) eficiencia de transducción puede ser confirmado por la observación de la expresión dsRed. Además, la expresión o supresión del gen de interés pueden ser confirmados por Western Blot, utilizando la GFP o 3xHA epítopo (por sobreexpresión de genes) y qPCR (por caída de genes), como se ejemplifica en Koo et al 4. </li></ol>

<ol>
	<li>Sato, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Single+Lgr5+stem+cells+build+crypt-villus+structures+in+vitro+without+a+mesenchymal+niche.">Single Lgr5 stem cells build crypt-villus structures in vitro without a mesenchymal niche.</a> Nature. 459, 262-265 (2009).</li><li>Sato, T., Clevers, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Growing+self-organizing+mini-guts+from+a+single+intestinal+stem+cell:+mechanism+and+applications.">Growing self-organizing mini-guts from a single intestinal stem cell: mechanism and applications.</a> Science. 340, 1190-1194 (2013).</li><li>Stelzner, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+nomenclature+for+intestinal+in+vitro+cultures.+American+journal+of+physiology.">A nomenclature for intestinal in vitro cultures. American journal of physiology.</a> Gastrointestinal and liver physiology. 302, G1359-G1363 (2012).</li><li>Koo, B. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Controlled+gene+expression+in+primary+Lgr5+organoid+cultures.">Controlled gene expression in primary Lgr5 organoid cultures.</a> Nature. 9, 81-83 (2012).</li><li>Schwank, G., Andersson-Rolf, A., Koo, B. K., Sasaki, N., Clevers, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Generation+of+BAC+Transgenic+Epithelial+Organoids.">Generation of BAC Transgenic Epithelial Organoids.</a> PloS one. 8, e76871 (2013).</li><li>Mustata, R. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lgr4+is+required+for+Paneth+cell+differentiation+and+maintenance+of+intestinal+stem+cells+ex+vivo.">Lgr4 is required for Paneth cell differentiation and maintenance of intestinal stem cells ex vivo.</a> EMBO reports. 12, 558-564 (2011).</li><li>Lau, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lgr5+homologues+associate+with+Wnt+receptors+and+mediate+R-spondin+signalling.">Lgr5 homologues associate with Wnt receptors and mediate R-spondin signalling.</a> Nature. 476, 293-297 (2011).</li><li>Koo, B. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tumour+suppressor+RNF43+is+a+stem-cell+E3+ligase+that+induces+endocytosis+of+Wnt+receptors.">Tumour suppressor RNF43 is a stem-cell E3 ligase that induces endocytosis of Wnt receptors.</a> Nature. 488, 665-669 (2012).</li><li>Huch, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Unlimited+in+vitro+expansion+of+adult+bi-potent+pancreas+progenitors+through+the+Lgr5/R-spondin+axis.">Unlimited in vitro expansion of adult bi-potent pancreas progenitors through the Lgr5/R-spondin axis.</a> The EMBO journal. 32, 2708-2721 (2013).</li><li>Sato, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Long-term+expansion+of+epithelial+organoids+from+human+colon,+adenoma,+adenocarcinoma,+and+Barrett's+epithelium.">Long-term expansion of epithelial organoids from human colon, adenoma, adenocarcinoma, and Barrett's epithelium.</a> Gastroenterology. 141, 1762-1772 (2011).</li><li>Huch, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vitro+expansion+of+single+Lgr5++liver+stem+cells+induced+by+Wnt-driven+regeneration.">In vitro expansion of single Lgr5+ liver stem cells induced by Wnt-driven regeneration.</a> Nature. 494, 247-250 (2013).</li></ol>

The authors have nothing to disclose. The authors have no conflict of interest declared.

<html> Para lograr ciertos aspectos de alta eficiencia de transducción son críticos. Uno es el pre-tratamiento de organoides con medios ENRWntNic hasta que adoptan una forma quística ronda. Esto aumenta el número de células madre y por lo tanto la posibilidad de obtener una integración estable del transgén, así como el aumento de la tasa de supervivencia de los organoides SI durante todo el procedimiento de transducción. Otro parámetro es el tiempo de incubación siguiente espinoculación. Resultados de incubación demasiado corto o demasiado largo en una pobre eficiencia de transducción y pobre supervivencia de los organoides, respectivamente. El paso espinoculación no es esencial aunque aumenta significativamente el porcentaje de organoides transducidas. Finalmente, el virus de alto título es clave para la transducción con éxito. Esto depende del tipo de línea celular de empaquetamiento y el virus. La combinación de la línea celular Platinum-E y virus murino de células madre (MSCV), fue encontrado para producir un título lo suficientemente alto como para la transducción de organoides. ve_content &quot;&gt; A continuación se presentan consejos para la solución de problemas que puede ayudar a lograr la transducción exitosa. primer lugar, si la transfección de la línea celular de empaquetamiento es pobre, asegúrese de que la confluencia de las células es entre 70 a 80% y que el tiempo de incubación de la mezcla combinado PEI-ADN es entre 20-30 min. La supervivencia de los organoides durante la transducción depende en gran medida del tamaño de los fragmentos. Demasiado largo tripsinización hace que la mayoría de los fragmentos que consisten en menos de 3 células y por lo tanto disminuye la supervivencia organoide. Otro factor es la actividad de Wnt el medio acondicionado, si la actividad es demasiado baja impulsando a través de la adición de CHIR99021 en una concentración de trabajo de 5 M pueden aumentar la supervivencia. CHIR99021 inhibe la GSK3, lo que resulta en un aumento de la señalización de Wnt. Además, Y-27362, lo que impide anoikis se añade a los medios de transducción para mejorar la supervivencia organoide, ya que los organoides se interrumpen a fragmentos (que contienen 1-10 células) antes de la transducción. Como60; mencionado, el tiempo de incubación después de la espinoculación no debe exceder de 6 hr. Por último, si se observa pobre transducción se deben considerar los factores antes mencionados que influyen en el título viral y el límite de tamaño de la inserción para el vector retroviral. La eficiencia de la caída es altamente dependiente de los genes miARN. Dado que la eficiencia varía con la combinación del gen diana y los genes miARN vale la pena realizar una pantalla de eficiencia para identificar los que mejor funcionan. La técnica se limita a los fenómenos epiteliales del sistema organoide. En el futuro puede ser que sea posible estudiar enfermedades infecciosas o inmunes mediadas a través de co-cultivo de patógenos o la reconstitución con componentes derivados del sistema inmune, respectivamente. Además, los retrovirus sólo se pueden llevar a insertos de un tamaño relativamente pequeño. En consecuencia, de origen natural regiones reguladoras tienen que ser excluidos y por lo tanto la expresión del transgén no pueden imitar la deel gen endógeno. Como se mencionó anteriormente, la eficiencia de caída depende de la gen diana y los genes miARN. Si no miARN con eficiencia desmontables adecuado se puede encontrar que puede limitar el uso de la técnica para ese gen diana particular. Teóricamente, organoides son compatibles con todas las técnicas de manipulación normalizados que se utilizan para las líneas celulares. Transducción retroviral fue el primer método que se informaron 4, y recientemente BAC (cromosomas artificiales bacterianos) -transgenesis se ha convertido en disponible 5. Con un tiempo total de generación de 2-3 semanas, después de la transfección del plásmido viral en la línea celular de empaquetamiento, que es significativamente más rápido que la generación de un transgénico (TG) de ratón. Por el mantenimiento de la arquitectura de las criptas in vivo-vellosidades mientras que contiene células madre, así como todos los linajes de células diferenciadas del epitelio intestinal, el sistema de cultivo organoide cierra la brecha entre el animal y tg cultivo celular utilizado anteriormente. <pclass = &quot;jove_content&quot;&gt; El protocolo descrito aquí proporciona un método para realizar análisis fenotípico de epitelio endodérmico in vitro a través de ganancia y deficitarias de estudios de la función. Esto hace que sea posible para hacer frente a las preguntas fisiológicamente relevantes de la biología de células madre adultas, con una necesidad mínima de ratones tg. Por ejemplo, la generación de ratones knockout condicional podría evitarse mediante el uso de organoides derivados de mutantes recién nacidos con letalidad perinatal 6. Además, la técnica se puede aplicar a organoides derivados de ratones knockout previamente establecidos para estudiar el papel de paralogues 7,8 mediante la realización de caída adicional. Tras el establecimiento de pequeños organoides intestinales, la adaptación del protocolo de cultivo original ha permitido el cultivo de páncreas, hígado, colon y estómago epitelios 9-11. Además, organoides intestinales humanos y organoides tumorales han sido derivados a partir de biopsias humanas normales, aden primariaoma y el cáncer colorrectal biopsias 10. El protocolo de infección viral se puede ampliar fácilmente a estos tipos de organoides y proporciona una manera sin precedentes de la realización de estudios funcionales en los tejidos humanos derivada. En conjunto, la transducción retroviral de pequeños organoides intestinales es un recurso valioso para la investigación de mantenimiento de células madre, diferenciación, y la decisión del destino celular, así como la señalización celular y de células por células interacciones.

Se necesita genética funcional de alta rendimiento para aumentar nuestra comprensión biológica del cuerpo, para mejorar la ciencia básica y la medicina actual. Genética del ratón ha sido el estándar de oro para la investigación de la función de genes in vivo, a pesar de que es a la vez que consume tiempo y costoso. Las líneas celulares, siendo la otra opción común, tienen una capacidad de caudal superior mientras que es menos costoso. Sin embargo, están impedidos por su incapacidad para reproducir el microambiente apropiado y con ello las respuestas fisiológicas visto in vivo. Por lo tanto, existe una necesidad inequívoca para un sistema de modelo-fácil de manejar, lo que permite costo / eficiente en el tiempo de análisis de alto rendimiento, mientras imitando las respuestas fisiológicas observadas en experimentos in vivo transgénicos (TG) de ratón. Para el epitelio endodérmico un sistema de este modelo apareció en 2009 1. Entre los conocimientos adquiridos desde el descubrimiento de las células madre intestinales Lgr5-positivos seinformación sobre el nicho correspondiente a los factores de crecimiento y de la matriz extra-celular necesarias para el mantenimiento de células madre. Utilizando esta información se hizo posible establecer &#39;mini-guts&#39; también conocidos como organoides 2. Recientemente se sugirió una nomenclatura de consenso para los cultivos in vitro, donde organoides se denominan &#39;enteroids&#39;, 3. Al igual que las líneas celulares, los organoides son cada vez más amplia y fácil de tratar con ligandos e inhibidores. Sin embargo, en lugar de ser de dos dimensiones que son estructuras tridimensionales de auto-organización que retienen la organización cripta-vellosidad, así como las células madre y linajes de células diferenciadas del intestino delgado (SI). Organoides constan de una sola capa de células epiteliales que rodean un área luminal. Estructuras salientes en ciernes corresponden a pequeñas criptas intestinales que contienen el compartimento de células madre. A partir de la punta de la estructura en ciernes células progenitoras se diferencian como MIrallar hacia el revestimiento epitelial, donde las células diferenciadas terminales se desprenden hacia la luz. En comparación con las líneas celulares, este sistema ex vivo recapitula más de cerca la fisiología normal y por lo tanto es un sistema modelo prometedor para el epitelio del intestino delgado. En este protocolo de vídeo de la transducción retroviral, se presenta un método que permite a los estudios ex vivo de la función de genes en este novedoso sistema de cultivo organoid. Comenzamos describiendo organoid cultura de una manera paso a paso, y seguimos demostrando la generación de los retrovirus, seguido por el procedimiento de transducción. Por último, hay una sección de consejos adicionales para la solución de problemas. Una ventaja de esta técnica es que se puede combinar con imágenes en vivo o cribado de fármacos para estudiar homeostasis, las decisiones del destino celular y las interacciones célula-célula en el epitelio intestinal. Debido a su arquitectura simple y tasa de rotación rápida, organoides representan un modelo s idealesistema para el estudio de la biología de células madre adultas. Además transducción retroviral se puede aplicar a organoides derivadas de ratones transgénicos preestablecidos, así como muestras de pacientes humanos. Cuando se acerca el knock-in y knock-out no puede extenderse a los seres humanos, los organoides humana SI constituyen una alternativa atractiva. En resumen, la manipulación genética a través de la transducción retroviral permite el análisis fenotípico en pequeñas organoides intestinales derivadas de ratones o muestras de tejidos humanos, complementando así la genética del ratón y líneas celulares, mientras que la apertura de nuevas vías para estudios en tejidos de origen humano. Transducción retroviral permite ganancia y la pérdida de función de los estudios a realizar en el sistema de cultivo organoide 4. Esto hace que sea un recurso valioso para la investigación de la función de genes, biología de células madre adultas y la enfermedad mientras está de acuerdo con las tres R (reducción, refinamiento y reemplazo).

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="1090">
	<tbody>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;width:220px;">Advanced DMEM/F12&#160;</td>
			<td style="width:157px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">12634-034</td>
			<td style="width:595px;"></td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">Glutamax 100x&#160;</td>
			<td style="width:157px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">35050-068</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">Hepes 1M&#160;</td>
			<td style="width:157px;">Invitrogen</td>
			<td>15630-056</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">Penicillin- Streptomycin 100x</td>
			<td style="width:157px;">Invitrogen</td>
			<td>15140-122</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">B27 supplement 50x</td>
			<td style="width:157px;">Invitrogen</td>
			<td>17504-044</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">N2 supplement 100x&#160;</td>
			<td>Invitrogen&#160;</td>
			<td>17502-048</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">n-Acetylcysteine 500 mM&#160;&#160;</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>A9165-5G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">mouse EGF 500 &#181;g/ml</td>
			<td>Invitrogen Biosource</td>
			<td>PMG8043</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">mouse Noggin 100 &#181;g/ml&#160;&#160;</td>
			<td>Peprotech</td>
			<td>250-38</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">R-Spondin conditioned medium</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>The conditioned media is generated&#160; from HEK293 cells, for details see Sato and Clevers 2013</td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">Wnt conditioned medium</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>The conditioned media is generated&#160; from L cells, for details see Sato and Clevers 2013</td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">Nicotinamide 1 M</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>N0636</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Y-27632 10 &#181;M</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>Y0503-1MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Polybrene 8 &#181;g/ml)</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>H9268-5G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="39">
			<td height="39" style="height:39px;">Standard BD Matrigel matrix</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>356231</td>
			<td style="width:595px;">Basement Matrix Extract (Cultrex PathClear BME Reduced Growth Factor Type 2, 3533-005-02 ) 
			supplied by AMSBIO can be used as an alterntive.</td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;width:220px;">24 well plate</td>
			<td>Greiner Bio One</td>
			<td>662960</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">48 well plate</td>
			<td>Greiner Bio One</td>
			<td>677980</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">CHIR99021</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A3734-1MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">Platinum- E cells</td>
			<td>Cell biolabs</td>
			<td>RV-102</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="19">
			<td height="19" style="height:19px;">Puromycin</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>A1113802</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:220px;">Blasticidin</td>
			<td style="width:157px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">A1113902</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:220px;">Polyethyleneimine (PEI)</td>
			<td style="width:157px;">Polysciences</td>
			<td style="width:119px;">23966</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:220px;">opti-MEM</td>
			<td style="width:157px;">Life Technologies</td>
			<td style="width:119px;">51985-034</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:220px;">TrypLE</td>
			<td style="width:157px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">12605-010</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:220px;">Parafilm</td>
			<td style="width:157px;">Sigma</td>
			<td style="width:119px;">P7793-1EA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:220px;">4-OHT</td>
			<td style="width:157px;">Sigma</td>
			<td style="width:119px;">H7904</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a video protocol of retroviral infection in primary intestinal organoid culture

Células madre LGR5 positivos se pueden complementar con el crecimiento esencial Factores Egf, Noggin, y R-Spondin, lo que nos permite a la cultura cada vez más amplia de estructuras epiteliales 3D primarias in vitro. Tanto las propiedades de arquitectura y fisiológicas de estos &quot;mini-guts &#39;, también llamados organoides, se parecen mucho a sus contrapartes en vivo. Esto les un sistema de modelo atractivo para el epitelio del intestino delgado hace. Uso de la transducción retroviral, genética funcional ahora se pueden realizar por la sobreexpresión de genes condicional o caída. Este vídeo muestra el procedimiento de la cultura organoide, la generación de los retrovirus, y la transducción retroviral de organoides para asistir el análisis fenotípico de la pequeña epitelio intestinal in vitro. Este novedoso sistema modelo organotípico en combinación con la expresión génica mediada por retroviral proporciona una valiosa herramienta para el análisis rápido de la función génica in vitro sin la necesidad de costlGeneración Y y requiere mucho tiempo para animales transgénicos.

Organoides están listos para ser dividido cuando el lumen central se oscurece debido a la presencia de células muertas (Figura 2). Después de 2-3 días de organoides pre-tratamiento debe adoptar una morfología quística redonda (Figura 3). Esto aumenta el número de células madre, la mejora de las posibilidades de obtener la integración estable. El tamaño de la pastilla viral puede variar después de la centrifugación del sobrenadante viral, lo más probable debido a la variación contribución de los residuos celulares con el tamaño del pellet. No se ha observado una clara correlación con la eficiencia de transducción. Durante el procedimiento de selección organoides no transducidas morirán, mientras que los que tiene una integración estable se mantendrá. La proteína fluorescente de retrovirus MSCV-eGFP se observa en células procedentes de organoides supervivientes, que tienen una morfología quística, el plazo de 2-3 días después de la transducción (Figura 4). <img alt<html> = &quot;Figura 1&quot; fo: contenido-width = src &quot;6 pulgadas&quot; = &quot;/ files / ftp_upload / 51765 / 51765fig1highres.jpg&quot; width = &quot;600&quot; /&gt; Figura 1 Un dibujo esquemático del procedimiento de transducción retroviral. Antes de organoides de infección son pre-tratados con ENRWntNic hasta que adoptan una estructura quística (paso 1). Células Platinum-E se utilizan como la línea celular de empaquetamiento, y se cultivan hasta que alcanzan 70-80% de confluencia. A partir de entonces son transfectadas con el constructo retroviral usando PEI. Los virus se recogieron 2 días más tarde (etapa 2). Organoides se tratan con tripsina para obtener fragmentos que contienen 1-10 células (paso 3), y luego se infectan (paso 4). Después de la espinoculación para aumentar la eficiencia de infección (paso 5), los fragmentos de organoides infectadas se sembraron (paso 6) y 2-3 días después de selección de clones positivos con la integración estable puede ser realizado (paso 7). 1765fig2highres.jpg &quot;width =&quot; 500 &quot;/&gt; Figura 2. imagen Representante de organoides después de 4-6 días de cultivo. El lumen se llena de células muertas, lo que parece oscuro. Organoides en esta etapa están listos para ser pases. <img alt="Figura 3" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51765/51765fig3highres.jpg" width="500" /> Figura 3. imagen Representante de pequeños organoides intestinales cultivadas en medios ENRWntNic durante 3-4 días. Los organoides adoptar una morfología quística. <img alt="Figura 4" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51765/51765fig4highres.jpg" width="500" /> Figura 4. imagen Representante de pequeños organoides intestinales (a) que muestran la expresión del transgén viral (b, eGFP). <table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr><td colspan="2"> AdvaCNED DMEM / F12 +++ </td></tr><tr><td colspan="2"> Almacenar a 4 ° C durante 4 semanas </td></tr><tr><td> Advanced DMEM / F12 </td><td> 500 ml </td></tr><tr><td> Glutamax 100x </td><td> 5 ml </td></tr><tr><td> Hepes 1 M </td><td> 5 ml </td></tr><tr><td> Antibióticos 100x </td><td> 5 ml </td></tr><tr><td colspan="2"> Medio ENRWntNic (20 ml) </td></tr><tr><td colspan="2"> Almacenar a 4 ° C durante 2 semanas </td></tr><tr><td> Advanced DMEM / F12 +++ </td><td> 7,2 ml </td></tr><tr><td> Suplemento de B27 (50x) </td><td> 400 l </td></tr><tr><td> Suplemento N2 (100x) </td><td> 200 l </td></tr><tr><td> n-acetilcisteína (500 mM) </td><td> 50 l </td></tr><tr><td> EGF de ratón (500 mg / ml) </td><td> 2 l </td></tr><tr><td> Noggin ratón (100 mg / ml) </td><td> 20 l </td></tr><tr><td> R-Spondin Conditmedio ioned </td><td> 2 ml </td></tr><tr><td> Wnt3a medio acondicionado </td><td> 10 ml </td></tr><tr><td> Nicotinamida (1 M) </td><td> 200 l </td></tr><tr><td colspan="2"> Transducción medio (para 20 ml) </td></tr><tr><td colspan="2"> Preparar fresco </td></tr><tr><td> Medio ENRWntNic </td><td> 20 ml </td></tr><tr><td> Y-27632 (10 mM) </td><td> 20 l </td></tr><tr><td> Polibreno (8 ug / ml) </td><td> 20 l </td></tr><tr><td colspan="2"> Medio ENR (para 20 ml) </td></tr><tr><td colspan="2"> Almacenar a 4 ° C durante 4 semanas </td></tr><tr><td> Advanced DMEM / F12 +++ </td><td> 17,4 ml </td></tr><tr><td> Suplemento de B27 (50x) </td><td> 400 l </td></tr><tr><td> Suplemento N2 (100x) </td><td> 200 l </td></tr><tr><td> n-acetilcisteína (500 mM) </td><td> 50 l </td&gt; </tr><tr><td> EGF de ratón (500 mg / ml) </td><td> 2 l </td></tr><tr><td> Noggin ratón (100 mg / ml) </td><td> 20 l </td></tr><tr><td> R-Spondin medio acondicionado </td><td> 2 ml </td></tr><tr><td colspan="2"> Medios de células Platinum-E (por 500 ml) </td></tr><tr><td colspan="2"> Almacenar a 4 ° C durante 12 semanas </td></tr><tr><td> DMEM </td><td> 449,45 ml </td></tr><tr><td> Suero Bovino Fetal (FBS) </td><td> 50 ml </td></tr><tr><td> Puromicina (1 g / ml) </td><td> 50 l </td></tr><tr><td> Blasticidina (10 g / ml) </td><td> 500 l </td></tr></tbody></table> Tabla 1. composición de Medios para Advanced DMEM / F12 +++, medio ENRWntNic, medio Transducción medio ENR, y medio para las células Platinum-E.

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A Video Protocol of Retroviral Infection in Primary Intestinal Organoid Culture

Este protocolo explica cultura organoid-Lgr5 positve primaria y la posterior ejecución de la transducción retroviral. Esto permite la sobreexpresión Cre-inducible o caída del transgén entregado y permite estudios funcionales que se llevarán a cabo en la novela en organotípico vitro sistema modelo.

Un Protocolo de vídeo de la infección retroviral en Primaria Intestinal organoide Cultura

Lgr5-positive stem cells can be supplemented with the essential growth factors Egf, Noggin, and R-Spondin, which allows us to culture ever-expanding ...

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Research

JoVE Journal

Biology

29.5K vistas.  University of Cambridge.  Este protocolo explica cultura organoid-Lgr5 positve primaria y la posterior ejecución de la transducción retroviral. Esto permite la sobreexpresión Cre-inducible o caída del transgén entregado y permite estudios funcionales que se llevarán a cabo en la novela en organotípico vitro sistema modelo. 

Video: A Video Protocol of Retroviral Infection in Primary Intestinal Organoid Culture

Protocol for Dengue Infections in Mosquitoes (A. aegypti) and Infection Phenotype Determination

The purpose of this procedure is to infect the Aedes mosquito with dengue virus in a laboratory condition and examine the infection level and dynamic of the virus in the mosquito tissues. This protocol is routinely used for studying mosquito-virus interactions, especially for identification of novel host factors that are able to determine vector competence. The entire experiment must be conducted in a BSL2 laboratory. Similar to Plasmodium falciparum infections, proper attire including gloves and lab coat must be worn at all times. After the experiment, all the materials that came in contact with the virus need to be treated with 75% ethanol and bleached before proceeding with normal washing. All other materials need to be autoclaved before discarding them.

Protocol for Dengue Infections in Mosquitoes A. aegypti and Infection Phenotype Determination

Once a gene is identified as potentially refractory for the dengue virus, it must be evaluated for it's role in preventing viral infections within the mosquito. This protocol illustrates how the extent of dengue infections of mosquitoes can be assayed. The techniques for growing up the virus in culture, membrane feeding mosquitoes human blood, and assaying viral titers in the mosquito midgut are demonstrated.

Protocolo para las infecciones de dengue en mosquitos (Aedes aegypti) y determinación de fenotipo infección

The purpose of this procedure is to infect the Aedes mosquito with dengue virus in a laboratory condition and examine the infection level and dynamic of ...

Investigación

Biología

Primary Culture and Plasmid Electroporation of the Murine Organ of Corti. 

In all mammals, the sensory epithelium for audition is located along the spiraling organ of Corti that resides within the conch shaped cochlea of the inner ear (fig 1). Hair cells in the developing cochlea, which are the mechanosensory cells of the auditory system, are aligned in one row of inner hair cells and three (in the base and mid-turns) to four (in the apical turn) rows of outer hair cells that span the length of the organ of Corti. Hair cells transduce sound-induced mechanical vibrations of the basilar membrane into neural impulses that the brain can interpret. Most cases of sensorineural hearing loss are caused by death or dysfunction of cochlear hair cells.
An increasingly essential tool in auditory research is the isolation and in vitro culture of the organ explant 1,2,9. Once isolated, the explants may be utilized in several ways to provide information regarding normative, anomalous, or therapeutic physiology. Gene expression, stereocilia motility, cell and molecular biology, as well as biological approaches for hair cell regeneration are examples of experimental applications of organ of Corti explants.
This protocol describes a method for the isolation and culture of the organ of Corti from neonatal mice. The accompanying video includes stepwise directions for the isolation of the temporal bone from mouse pups, and subsequent isolation of the cochlea, spiral ligament, and organ of Corti. Once isolated, the sensory epithelium can be plated and cultured in vitro in its entirety, or as a further dissected micro-isolate that lacks the spiral limbus and spiral ganglion neurons. Using this method, primary explants can be maintained for 7-10 days. As an example of the utility of this procedure, organ of Corti explants will be electroporated with an exogenous DsRed reporter gene. This method provides an improvement over other published methods because it provides reproducible, unambiguous, and stepwise directions for the isolation, microdissection, and primary culture of the organ of Corti.

Primary Culture and Plasmid Electroporation of the Murine Organ of Corti.

This procedure describes a method for the isolation and culture of the murine organ of Corti with or without the spiral limbus and spiral ganglion neurons. We also demonstrate a method for the expression of an exogenous reporter gene in the organ of Corti explant by electroporation.

Cultura primaria y electroporación plásmido del órgano de Corti murino.

In all mammals, the sensory epithelium for audition is located along the spiraling organ of Corti that resides within the conch shaped cochlea of the ...

Isolation and Primary Culture of Rat Hepatic Cells

Primary hepatocyte culture is a valuable tool that has been extensively used in basic research of liver function, disease, pathophysiology, pharmacology and other related subjects. The method based on two-step collagenase perfusion for isolation of intact hepatocytes was first introduced by Berry and Friend in 1969 1 and, since then, has undergone many modifications. The most commonly used technique was described by Seglenin 1976 2. Essentially, hepatocytes are dissociated from anesthetized adult rats by a non-recirculating collagenase perfusion through the portal vein. The isolated cells are then filtered through a 100 &mu;m pore size mesh nylon filter, and cultured onto plates. After 4-hour culture, the medium is replaced with serum-containing or serum-free medium, e.g. HepatoZYME-SFM, for additional time to culture. These procedures require surgical and sterile culture steps that can be better demonstrated by video than by text. Here, we document the detailed steps for these procedures by both video and written protocol, which allow consistently in the generation of viable hepatocytes in large numbers.

Primary hepatocytes provide a valuable tool to evaluate biochemical, molecular, and metabolic functions in a physiologically relevant experimental system. We describe a reliable protocol for rat in situ liver perfusion, which consistently generates viable hepatocytes up to 1.0 &times; 108 cells per preparation with cell viability between 88 ~ 96%.

Aislamiento y cultivo primario de células hepáticas de ratas

Primary hepatocyte culture is a valuable tool that has been extensively used in basic research of liver function, disease, pathophysiology, pharmacology ...

Retroviral Infection of Murine Embryonic Stem Cell Derived Embryoid Body Cells for Analysis of Hematopoietic Differentiation

Embryonic stem cells (ESCs) are an outstanding model for elucidating the molecular mechanisms of cellular differentiation. They are especially useful for investigating the development of early hematopoietic progenitor cells (HPCs). Gene expression in ESCs can be manipulated by several techniques that allow the role for individual molecules in development to be determined. One difficulty is that expression of specific genes often has different phenotypic effects dependent on their temporal expression. This problem can be circumvented by the generation of ESCs that inducibly express a gene of interest using technology such as the doxycycline-inducible transgene system. However, generation of these inducible cell lines is costly and time consuming. Described here is a method for disaggregating ESC-derived embryoid bodies (EBs) into single cell suspensions, retrovirally infecting the cell suspensions, and then reforming the EBs by hanging drop. Downstream differentiation is then evaluated by flow cytometry. Using this protocol, it was demonstrated that exogenous expression of a microRNA gene at the beginning of ESC differentiation blocks HPC generation. However, when expressed in EB derived cells after nascent mesoderm is produced, the microRNA gene enhances hematopoietic differentiation. This method is useful for investigating the role of genes after specific germ layer tissue is derived.

Manipulating temporal gene expression in differentiating embryonic stem cells (ESCs) can be achieved using inducible gene systems. However, generation of these cell lines is costly and time consuming. This protocol achieves rapid expression of a transgene in differentiating ES-derived cells and subsequent analysis of downstream hematopoietic differentiation.

Infección retroviral murino de células madre embrionarias células derivadas embrioide cuerpo para el Análisis de la diferenciación hematopoyética

Embryonic stem cells (ESCs) are an outstanding model for elucidating the molecular mechanisms of cellular differentiation. They are especially useful for ...

Real Time Analysis of Metabolic Profile in Ex Vivo Mouse Intestinal Crypt Organoid Cultures

The small intestinal mucosa exhibits a repetitive architecture organized into two fundamental structures: villi, projecting into the intestinal lumen and composed of mature enterocytes, goblet cells and enteroendocrine cells; and crypts, residing proximal to the submucosa and the muscularis, harboring adult stem and progenitor cells and mature Paneth cells, as well as stromal and immune cells of the crypt microenvironment. Until the last few years, in vitro studies of small intestine was limited to cell lines derived from either benign or malignant tumors, and did not represent the physiology of normal intestinal epithelia and the influence of the microenvironment in which they reside. Here, we demonstrate a method adapted from Sato et al. (2009) for culturing primary mouse intestinal crypt organoids derived from C57BL/6 mice. In addition, we present the use of crypt organoid cultures to assay the crypt metabolic profile in real time by measurement of basal oxygen consumption, glycolytic rate, ATP production and respiratory capacity. Organoids maintain properties defined by their source and retain aspects of their metabolic adaptation reflected by oxygen consumption and extracellular acidification rates. Real time metabolic studies in this crypt organoid culture system are a powerful tool to study crypt organoid energy metabolism, and how it can be modulated by nutritional and pharmacological factors.

Real Time Analysis of Metabolic Profile in Ex Vivo Mouse Intestinal Crypt Organoid Cultures

Small intestinal crypt organoids cultured ex vivo provide a tissue culture system that recapitulates growth of crypts dependent on stem cells and their niche. We established a method to assay the metabolic profile in real time in primary mouse crypt organoids. We found organoids maintain physiological properties defined by their source.

Bienes Análisis Tiempo de perfil metabólico en<em&gt; Ex Vivo</em&gt; Culturas ratón intestinal Cripta organoides

The small intestinal mucosa exhibits a repetitive architecture organized into two fundamental structures: villi, projecting into the intestinal lumen and ...

A Protocol for Lentiviral Transduction and Downstream Analysis of Intestinal Organoids

Intestinal crypt-villus structures termed organoids, can be kept in sustained culture three dimensionally when supplemented with the appropriate growth factors. Since organoids are highly similar to the original tissue in terms of homeostatic stem cell differentiation, cell polarity and presence of all terminally differentiated cell types known to the adult intestinal epithelium, they serve as an essential resource in experimental research on the epithelium. The possibility to express transgenes or interfering RNA using lentiviral or retroviral vectors in organoids has increased opportunities for functional analysis of the intestinal epithelium and intestinal stem cells, surpassing traditional mouse transgenics in speed and cost. In the current video protocol we show how to utilize transduction of small intestinal organoids with lentiviral vectors illustrated by use of doxycylin inducible transgenes, or IPTG inducible short hairpin RNA for overexpression or gene knockdown. Furthermore, considering organoid culture yields minute cell counts that may even be reduced by experimental treatment, we explain how to process organoids for downstream analysis aimed at quantitative RT-PCR, RNA-microarray and immunohistochemistry. Techniques that enable transgene expression and gene knock down in intestinal organoids contribute to the research potential that these intestinal epithelial structures hold, establishing organoid culture as a new standard in cell culture.

In this video protocol we give a step by step explanation of lentiviral transduction in organoids of primary intestinal epithelium and of processing and downstream analysis of these cultures by quantitative RT-PCR, RNA-microarray and immunohistochemistry.

Un protocolo para la de Lentiviral Transducción y Análisis de Aguas abajo de Intestinal organoides

Intestinal crypt-villus structures termed organoids, can be kept in sustained culture three dimensionally when supplemented with the appropriate growth ...

Isolation and Culture of Primary Mouse Keratinocytes from Neonatal and Adult Mouse Skin

The keratinocyte (KC) is the predominant cell type in the epidermis, the outermost layer of the skin. Epidermal KCs play a critical role in providing skin defense by forming an intact skin barrier against environmental insults, such as UVB irradiation or pathogens, and also by initiating an inflammatory response upon those insults. Here we describe methods to isolate KCs from neonatal mouse skin and from adult mouse tail skin. We also describe culturing conditions using defined growth supplements (dGS) in comparison to chelexed fetal bovine serum (cFBS). Functionally, we show that both neonatal and adult KCs are highly responsive to high calcium-induced terminal differentiation, tight junction formation and stratification. Additionally, cultured adult KCs are susceptible to UVB-triggered cell death and can release large amounts of TNF upon UVB irradiation. Together, the methods described here will be useful to researchers for the setup of in vitro models to study epidermal biology in the neonatal mouse and/or the adult mouse.

Epidermal keratinocytes form a functional skin barrier and are positioned at the front line of host defense against external environmental insults. Here we describe methods for isolation and primary culture of epidermal keratinocytes from neonatal and adult mouse skin, and induction of terminal differentiation and UVB-triggered inflammatory response from keratinocytes.

Aislamiento y cultivo de queratinocitos de ratón primario de piel de ratón neonatal y adulto

The keratinocyte (KC) is the predominant cell type in the epidermis, the outermost layer of the skin. Epidermal KCs play a critical role in providing skin ...

Apoptosis Induction and Detection in a Primary Culture of Sea Cucumber Intestinal Cells

Primary cultured cells are used in a variety of scientific disciplines as exceptionally important tools for the functional evaluation of biological substances or characterization of specific biological activities. However, due to the lack of universally applicable cell culture media and protocols, well described cell culture methods for marine organisms are still limited. Meanwhile, the commonly occurring microbial contamination and polytropic properties of marine invertebrate cells further impede the establishment of an effective cell culture strategy for marine invertebrates. Here, we describe an easy-to-handle method for culturing intestinal cells from sea cucumber Apostichopus japonicus; additionally, we provide an example of in vitro apoptosis induction and detection in primary cultured intestinal cells. Moreover, this experiment provides details about the appropriate culture medium and cell collection method. The described protocol is compatible with a variety of widely available tissue samples from marine organisms including Echinodermata, Mollusca, and Crustacea, and it can provide sufficient cells for multiple in vitro experimental applications. This technique would enable researchers to efficiently manipulate primary cell cultures from marine invertebrates and to facilitate the functional evaluation of targeted biological materials on cells.

This protocol provides an easy-to-handle method to culture the intestinal cells from sea cucumber Apostichopus japonicus and is compatible with a variety of widely available tissue samples from marine organisms including Echinodermata, Mollusca, and Crustacea.

Inducción y detección de apoptosis en un cultivo primario de células intestinales de pepino marino

Primary cultured cells are used in a variety of scientific disciplines as exceptionally important tools for the functional evaluation of biological ...

Organoid-Derived Epithelial Monolayer: A Clinically Relevant In Vitro Model for Intestinal Barrier Function

In the past, intestinal epithelial model systems were limited to transformed cell lines and primary tissue. These model systems have inherent limitations as the former do not faithfully represent original tissue physiology, and the availability of the latter is limited. Hence, their application hampers fundamental and drug development research. Adult stem-cell-based organoids (henceforth referred to as organoids) are miniatures of normal or diseased epithelial tissue from which they are derived. They can be established very efficiently from different gastrointestinal (GI) tract regions, have long-term expandability, and simulate tissue- and patient-specific responses to treatments in vitro. Here, the establishment of intestinal organoid-derived epithelial monolayers has been demonstrated along with methods to measure epithelial barrier integrity, permeability and transport,&#160;antimicrobial protein secretion, as well as histology. Moreover, intestinal organoid-derived monolayers can be enriched with proliferating stem and transit-amplifying cells as well as with key differentiated epithelial cells. Therefore, they represent a model system that can be tailored to study the effects of compounds on target cells and their mode of action. Although organoid cultures are technically more demanding than cell lines, once established, they can reduce failures in the later stages of drug development as they truly represent in vivo epithelium complexity and interpatient heterogeneity.

Here, we describe the preparation of human organoid-derived intestinal epithelial monolayers for studying intestinal barrier function, permeability, and transport. As organoids represent original epithelial tissue response to external stimuli, these models combine the advantages of expandability of cell lines and the relevance and complexity of primary tissue.

Monocapa epitelial derivada de organoides: un modelo in vitro clínicamente relevante para la función de barrera intestinal

In the past, intestinal epithelial model systems were limited to transformed cell lines and primary tissue. These model systems have inherent limitations ...

Culture Methods to Study Apical-Specific Interactions using Intestinal Organoid Models

The lining of the gut epithelium is made up of a simple layer of specialized epithelial cells that expose their apical side to the lumen and respond to external cues. Recent optimization of in vitro culture conditions allows for the re-creation of the intestinal stem cell niche and the development of advanced 3-dimensional (3D) culture systems that recapitulate the cell composition and the organization of the epithelium. Intestinal organoids embedded in an extracellular matrix (ECM) can be maintained for long-term and self-organize to generate a well-defined, polarized epithelium that encompasses an internal lumen and an external exposed basal side. This restrictive nature of the intestinal organoids presents challenges in accessing the apical surface of the epithelium in vitro and limits the investigation of biological mechanisms such as nutrient uptake and host-microbiota/host-pathogen interactions. Here, we describe two methods that facilitate access to the apical side of the organoid epithelium and support the differentiation of specific intestinal cell types. First, we show how ECM removal induces an inversion of the epithelial cell polarity and allows for the generation of apical-out 3D organoids. Second, we describe how to generate 2-dimensional (2D) monolayers from single cell suspensions derived from intestinal organoids, comprised of&#160;mature and differentiated cell types. These techniques provide novel tools to study apical-specific interactions of the epithelium with external cues in vitro and promote the use of organoids as a platform to facilitate precision medicine.

Here we present two protocols that allow the modeling of intestinal apical-specific interactions. Organoid-derived intestinal monolayers and Air-Liquid Interface (ALI) cultures facilitate the generation of well-differentiated epithelia accessible from both luminal and basolateral sides, whereas polarity-inverted intestinal organoids expose their apical side and are amenable to high throughput assays.

Métodos de cultivo para estudiar las interacciones apicales específicas utilizando modelos organoides intestinales

The lining of the gut epithelium is made up of a simple layer of specialized epithelial cells that expose their apical side to the lumen and respond to ...