TIRFM et GFP-sondes sensibles au pH pour l'évaluation des vésicules de neurotransmetteur Dynamics dans les cellules SH-SY5Y neuroblastome: imagerie cellulaire et analyse des données

Résumé

This paper provides a method for investigating neurotransmitter vesicle dynamics in neuroblastoma cells, using a synaptobrevin2-pHluorin construct and Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy. The strategy developed for image processing and data analysis is also reported.

Résumé

Les vésicules synaptiques libèrent des neurotransmetteurs au niveau des synapses chimiques à travers un cycle dynamique de la fusion et la récupération. Suivi de l'activité synaptique en temps réel et disséquer les différentes étapes de exo-endocytose au niveau d'une seule vésicule sont cruciales pour comprendre les fonctions synaptiques dans la santé et la maladie.

Génétiquement codés sondes sensibles au pH visant directement les vésicules synaptiques et réflexion interne totale microscopie de fluorescence (TIRFM) fournissent la résolution spatio-temporelle nécessaire de suivre la dynamique de vésicules. Le champ évanescent généré par réflexion interne totale ne peut exciter des fluorophores placés dans une couche mince (<150 nm) au-dessus du couvercle de verre sur lequel les cellules adhèrent, exactement là où les processus de exo-endocytose ont lieu. Les images à contraste élevé qui en résultent sont parfaitement adaptés pour des vésicules suivi et l'analyse quantitative des événements de fusion.

Dans ce protocole, SH-SY5Y n humainecellules euroblastoma sont proposées comme un modèle précieux pour étudier la libération de neurotransmetteurs au niveau d'une seule vésicule par TIRFM, en raison de leur surface plane et la présence de vésicules dispersées. Les méthodes pour la culture de SH-SY5Y comme cellules adhérentes et pour leur transfection avec synapto-pHluorin sont fournis, ainsi que la technique pour effectuer l'imagerie et TIRFM. Enfin, une stratégie visant à sélectionner, compter et analyser les événements de fusion au niveau des cellules entières et unique vésicules est présenté.

Pour valider la procédure d'imagerie et l'analyse des données approche, la dynamique de vésicules pHluorin-marqués sont analysés en vertu de repos et stimulés (dépolarisants concentrations de potassium) conditions. Dépolarisation membranaire augmente la fréquence des événements de fusion et provoque une augmentation parallèle du signal de fluorescence nette enregistrée dans la cellule ensemble. Analyse d'un seul vésicules révèle modifications de comportement fusion-événement (hauteur accrue de pointe et la largeur). Ces données suggèrent eà la dépolarisation de potassium non seulement induit une libération de neurotransmetteurs massive, mais modifie également le mécanisme de la fusion des vésicules et le recyclage.

Avec la sonde fluorescente approprié, cette technique peut être utilisée dans différents systèmes cellulaires pour disséquer les mécanismes de sécrétion constitutive et stimulée.

Introduction

La transmission synaptique chimique entre les neurones est un mécanisme majeur de la communication dans le système nerveux. Elle se appuie sur la libération de neurotransmetteurs par un cycle dynamique de la fusion des vésicules et la récupération sur le site présynaptique. Un grand nombre de protéines impliquées dans la dynamique des vésicules ont été identifiés; Toutefois, leur contribution spécifique au phénomène reste à préciser ^une.

Notre compréhension est en partie limitée par le fait que les tests les plus largement utilisés pour exo / endocytose ne sont pas toujours les plus appropriées. Plusieurs études relatives à la fusion des vésicules et la dynamique reposent sur des techniques électrophysiologiques. Cette technique fournit une résolution temporelle optimale et est excellent pour enquêter sur la fusion initiale des vésicules à la membrane plasmique, mais est incapable de détecter la plupart des événements moléculaires sous-jacents qui soutiennent la fonction présynaptique. La microscopie électronique, de l'autre côté, fournit le meilleur morphological description de chaque étape singulière, mais l'aspect dynamique de l'événement ne peut pas être capturé, parce que les échantillons doivent être fixés de façon à être analysé.

L'avènement de nouvelles techniques d'enregistrement optique ^2,3, en combinaison avec les progrès de la fluorescence des sondes moléculaires développement ^4-6, permet la visualisation des processus d'exocytose dans les cellules vivantes, fournissant ainsi de nouveaux niveaux d'information sur la structure et la fonction synaptique.

Les premières études exploitées colorants dépendants de l'activité styryliques (FM1-43 et colorants organiques connexes) ^7,8. State-of-the-art techniques d'imagerie utilisent des variantes sensibles au pH de la protéine fluorescente verte (GFP) (pHluorin) attaché à vésicules luminal protéines ^neuf. Ces sondes sont normalement désactivés lorsqu'ils sont présents dans les vésicules en raison du faible pH luminal. Après la fusion avec la membrane plasmatique, l'intérieur des vésicules est exposée à l'espace extracellulaire neutre, le pH brusquement augmente, soulage la trempe de protons dépend de pHluorin et le signal fluorescent apparaît rapidement. Comme la variation de pHluorin est plus rapide que l'événement de fusion, en contrôlant la fluorescence augmente, la fusion des vésicules avec la membrane peut être mesurée et analysée. Étant donné que les molécules d'pHluorin surface sont marqués endocytose, le signal de fluorescence retourne ensuite au niveau de base, par conséquent la même construction peut également être utilisée pour contrôler le recyclage des vésicules ^9.

Bien que le capteur de pH des vésicules à marquage assure uniquement la visualisation de ces vésicules qui fusionnent vraiment avec la membrane plasmique, l'imagerie à résolution spatiale et temporelle élevée est nécessaire de décrire en détail les étapes intervenant dans les processus d'endocytose exo /. La technique optique qui fournit la résolution spatio-temporelle est nécessaire microscopie de réflexion totale interne de fluorescence (TIRFM), une demande de ¹⁰ microscopie à fluorescence.

"> La réflexion interne totale se produit à l'interface entre le verre lamelle et l'échantillon. Lorsque le trajet de la lumière atteint la lamelle de avec un angle d'incidence supérieur à l'angle critique, la lumière d'excitation ne est pas transmise dans l'échantillon, mais est complètement réfléchie. Dans ces conditions, un évanescentes formes d'onde de la lumière à l'interface et se propage dans le milieu avec moins de densité optique (l'échantillon). Comme l'intensité du champ évanescent décroît exponentiellement avec la distance de l'interface (avec une profondeur de pénétration environ 100 nm) que les fluorophores à proximité la plus proche de la lamelle couvre-objet peut être excité, tandis que ceux plus éloignés de la limite sont pas. Dans les cellules transfectées avec GFP-assemblage, cette profondeur correspond à des protéines exprimés sur la membrane plasmique ou dans des structures vésiculaires approcher. Comme fluorophores dans l'intérieur de la cellule ne peuvent pas être excités, la fluorescence de fond est minimisée, et une image avec un signal très élevé / fond ratio est formée ^11.

Plusieurs caractéristiques font TIRFM la technique de choix pour la surveillance de la dynamique des vésicules. Le contraste parfait et le rapport signal-bruit ratio élevé permettent la détection de très faibles signaux découlant de vésicules simples. acquisition d'image à base de puce dans chaque trame fournit la résolution temporelle nécessaire pour détecter des processus hautement dynamiques. Enfin, l'exposition minimal de cellules à la lumière à tout autre plan dans l'échantillon réduit fortement phototoxicité et permet l'enregistrement longue durée time-lapse ^12.

L'analyse des données reste l'aspect le plus difficile et crucial de cette technique. La façon la plus simple de contrôler la fusion des vésicules est de mesurer l'accumulation de protéines fluorescentes reporter à la surface de la cellule, au fil du temps ^13. Comme fusion augmente, le signal de fluorescence augmente ainsi nettes. Cependant, cette méthode peut sous-estimer le processus, en particulier dans les grandes cellules et dans des conditions de repos,parce que les processus d'endocytose et photoblanchiment compensé l'augmentation de l'intensité de fluorescence due à la vésicule exocytose. Une autre méthode consiste à suivre chaque événement de fusion unique ^14. Cette dernière méthode est très sensible et peut révéler des détails importants sur les mécanismes de fusion. Cependant, il nécessite la sélection manuelle des événements uniques, parce que les procédures à suivre complètement automatisés vésicules et d'enregistrer la fluctuation de leurs signaux fluorescents sont pas toujours disponibles. L'observation de la dynamique des vésicules nécessite cellules d'échantillonnage à haute fréquence. Cela génère une grande quantité de données qui peuvent difficilement être analysée manuellement.

La proposition de ce document est d'optimiser la technique d'imagerie de TIRFM de surveillance de la base et la libération de neurotransmetteurs stimulée dans la lignée de cellules de neuroblastome SH-5YSY, et de décrire, étape par étape, une procédure développée dans le laboratoire pour analyser les données, à la fois à des niveaux de cellules entières et unique vésicules.

Protocole

1. Culture cellulaire et transfection

1. Culture de cellules SH-SY5Y
   REMARQUE: Les expériences ont été effectuées en utilisant le neuroblastome humain SH SY5Y (ATCC # CRL-2266) ^15. SH-SY5Y grandir comme un mélange de grappes flottantes et les cellules adhérentes. Suivez les instructions figurant dans le protocole (de densité cellulaire, rapport de division, etc.) D'avoir des cellules qui se développent fermement attachés à couvercle en verre, qui est crucial pour TIRFM.
   1. Avant de commencer, sous le poste de sécurité microbiologique à flux laminaire, de porter le volume opportun de solution de phosphate stérile de solution saline tamponnée (PBS) et un milieu de culture.
      1. Ajouter 50 ml de PBS à la concentration de 150 mM de NaCl, 24 mM de tampon phosphate, pH 7,4. Filtrer la solution.
      2. Ajouter 50 ml de milieu cellulaire à partir du milieu de Eagle modifié par Dulbecco (DMEM) avec haute teneur en glucose, 10% de sérum bovin foetal inactivé par la chaleur (FBS), de la pénicilline (100 U / ml), streptomycine (100 ug / ml), L-glutamine ( 2 mM), etpyruvate de sodium (1 mM). Filtrer la solution.
   2. Éliminer le milieu de croissance complet et laver les cellules avec 3 ml de PBS.
   3. Incuber les cellules avec 2 ml de 0,05% de trypsine-acide éthylènediaminetétraacétique (EDTA) (par boîte de Petri de 6 cm) pendant 5 min à 37 ° C, 5% CO ₂ et détacher les cellules en utilisant une pipette.
   4. Inactiver la trypsine en ajoutant 2 ml de DMEM, et de recueillir les cellules par centrifugation à 300 g pendant 5 min.
   5. Eliminer le surnageant, ajouter 1 ml de DMEM à la pastille et pipeter la solution de haut en bas suffisamment pour disperser les cellules dans une suspension cellulaire unique.
   6. Diviser les 1: 4 dans une nouvelle boîte de diamètre de 6 cm de Pétri contenant 3 ml de milieu complet. Maintenir les cellules en culture dans des boîtes de Pétri de diamètre 6 cm, à 37 ° C dans un incubateur à _CO2 à 5%. Sous-culture une fois par semaine ou quand ils ont couvert 80 - 90% de la superficie de la surface.
2. SH-SY5Y placage pour l'imagerie de cellules
   1. Pour les expériences de TIRFM, plaquecellules sur les couvercles de verre. Employer verre couvre de 0,17 ± 0,005 mm d'épaisseur et un indice de réfraction 1,5255 ± 0,00015. Avant de commencer, préparer les lamelles de verre comme suit:
      1. Nettoyez le verre couvre de 90% d'éthanol, O / N.
      2. Rincez-les soigneusement à l'eau distillée (trois changements d'eau distillée). Verre couvre sec dans un four de séchage.
      3. Lieu couvre en verre boîtes de Pétri et stériliser dans un four préchauffé à 200 ° C pendant 3 heures.
   2. Le jour avant la transfection, placer chaque lamelle dans un plat 3,5 cm Petri, ajouter 1 ml de milieu de culture et incuber à 37 ° C dans un incubateur à _CO2 de 5%.
   3. Trypsiniser cellules comme décrit dans les étapes 1.1.3 - 1.1.5, suspendre le culot cellulaire dans 1 ml de milieu complet et compter. Calculer le volume correct de la suspension cellulaire à ajouter à chaque boîte de Petri pour obtenir 3 x 10 ⁵ cellules / puits. Cette densité est nécessaire pour une croissance cellulaire optimale et une transfection efficace. Incuber à 37 ° Cen 5% de CO ₂ incubateur O / N.
3. SH-SY5Ytransfection par polyéthylènimine (PEI)
   REMARQUE: Pour visualiser les vésicules synaptiques dynamique, vecteur pCB6 contenant synapto-pHluorin a été utilisé. Le synapto-pHluorin a été générée par fusion dans le cadre d'une variante sensible au pH de la protéine fluorescente verte (GFP) ¹⁶ et la protéine de membrane vésiculaire synaptobrévine 2. La construction a été largement utilisé pour étudier les propriétés des vésicules synaptiques dans les neurones ^9.
   1. Avant de commencer la transfection, faire 10 ml des solutions suivantes. Conserver les solutions que maximale que 1 mois.
      1. Faire une solution 150 mM de NaCl. Ajuster le pH à 5,5 avec du HCl 0,01.
      2. Faire une solution de PEI à 10% de polyéthylènimine (PEI; 25 kDa linéaire) en solution 150 mM de NaCl. Le pH de la solution se élève à 8,8. Ajuster le pH à 7,8 avec du HCl 0,01.
   2. 24 heures après l'étalement, éliminer le milieu et rafraîchir avec 1,5 ml demilieu complet. Maintenir les cellules à 37 ° C, dans un incubateur à _CO2 à 5%.
   3. Sous l'enceinte de sécurité biologique à flux laminaire, dans un tube à microcentrifugation de 1,5 ml, ajouter 3 pg d'ADN de plasmide à 25 ul d'une solution 150 mM de NaCl et 100 ul de solution de PEI 3,5 cm par boîte de Pétri.
   4. Vortex pendant 10 secondes, puis incuber le mélange ADN / PEI pendant 30 min à température ambiante.
   5. Ajouter délicatement le mélange ADN / PEI à la boîte de Petri contenant des lamelles avec des cellules et secouez doucement pour répartir équitablement le réactif dans la boîte de Pétri.
   6. Après 4 h changer le milieu et on incube les cellules O / N à 37 ° C dans un incubateur à _CO2 à 5%. Réaliser des expériences d'imagerie 24-48 heures après transfection.

2. imagerie cellulaire par réflexion interne totale microscopie de fluorescence (TIRFM)

1. Imagerie set-up
   1. Effectuer imagerie de la FRBR avec le set-up décrit à la figure 1. Il comprend un moteur inversémicroscope (Figure 1, encart A), la source laser (figure 1, encadré B) et la TIRF-coulisseau (Figure 1, encart C). Atteindre l'illumination TIRFM à travers une ouverture numérique élevée (NA 1,45 Alpha Plan-Fluar) d'huile 100X, objectif à immersion.
   2. Pour l'éclairage de TIRFM, employer un multi-ligne (458/488/514 nm) 100 mW laser argon-ion. Utilisation d'une fibre en mode mono, introduire la lumière laser polarisée linéairement dans le trajet du faisceau, par l'intermédiaire du coulisseau TIRF. Insérez le curseur TIRF dans le plan de la membrane champ lumineux de la trajectoire du faisceau de lumière réfléchie.
      1. Pour l'éclairage à grand champ, connectez le microscope à un HBO lumière blanche de la lampe au mercure à court d'arc classique. Un double prisme à maintien de polarisation dans le coulisseau assure la combinaison simultanée de TIRF illumination et la lumière blanche.
   3. On filtre la lumière laser avec un filtre d'excitation (largeur bande de 488/10 nm) monté sur une roue de filtre, introduit dans le trajet du laser. Employerune vitesse élevée, l'obturateur commandé par logiciel, afin de permettre un contrôle rapide de l'illumination laser. Pour l'analyse pHluorin, monter un passe-bande 525/50 nm filtre d'émission. Capturez des images numériques (512 x 512 pixels) sur une caméra CCD rapide refroidi avec l'image ProPlus logiciel.
2. La réalisation de l'éclairage de la FRBR (Figure 2)
   1. Tourner sur les lasers, l'ordinateur, l'appareil photo, la roue de filtre, et les contrôleurs d'obturation; puis, attendez 20 minutes avant de commencer l'expérience que les lasers ont besoin pour se réchauffer et se stabiliser.
   2. Avant imagerie, rendre le volume opportun des solutions suivantes.
      1. Ajouter 50 ml de Krebs (KRH) solution à 125 mM de NaCl, 5 mM de KCl, 1,2 mM MgSO4, 1,2 mM de KH ₂ PO _4, 25 mM de l'acide 4- (2-hydroxyéthyl) pipérazine-1-éthanesulfonique (HEPES) (tamponnée à pH 7,4), 2 mM de _CaCl2 et 6 mM de glucose.
      2. Ajouter 10 ml de solution KRH-KCl (pH 7,4) à 80 mM de NaCl, 50 mM de KCl, 1,2 mM MgSO4, 1,2 mM de KH ₂ PO ₄, 25 mM de HEPES (tamponnée à pH 7,4), 2 mM de _CaCl2 et 6 mM de glucose.
   3. Retirer le couvercle en verre avec des cellules transfectées et l'insérer dans la chambre d'imagerie approprié. Monter la chambre et ajouter 500 ul de solution KRH dans le centre de la vitre.
   4. Ajouter l'huile sur l'objectif. Placer la chambre d'imagerie sur la platine du microscope et la position de l'objectif sous la lamelle couvre-objet en verre. Positionner le couvercle sécuritaire sur l'échantillon.
   5. En mode épifluorescence, se concentrer sur la lamelle (surface supérieure) et choisissez cellules transfectées placés dans le centre de la chambre. Sélectionnez les cellules dont le signal fluorescent peut être clairement enregistrée en utilisant un temps d'exposition inférieure à 80 ms.
   6. Sous le contrôle du logiciel, passer à l'éclairage FRBR en mode direct.
   7. Pour définir la configuration de la FRBR, vérifier la position de la poutre qui émerge de l'objectif, sur la couverture de l'échantillon (figure 2B). Lorsque le faisceau est positionné dans le centre de til objectif (figure 2A, à gauche), un endroit est visible au centre de la couverture de l'échantillon de la FRBR (figure 2B, à gauche) et la cellule est imagé en mode épifluorescence (plusieurs avions de discussion, une forte fluorescence de fond; la figure 2C, gauche) .
   8. Pour atteindre l'angle critique, déplacer le point focalisé dans la direction Y (avant ou arrière; Figure 2B, centre) en utilisant l'angle vis de réglage sur le curseur de la FRBR (figure 1C). Lorsque le faisceau converge sur le plan de l'échantillon à un angle supérieur à l'angle critique (figure 2A, à droite), le spot disparaît et une droite, mince ligne axé est évident dans le milieu de la couverture de l'échantillon (figure 2B, à droite).
   9. Pour affiner l'angle FRBR utiliser l'échantillon de cellules (figure 2C). Regarder l'image de fluorescence sur la vidéo, à ce stade, une image à épifluorescence-like est encore visible. Doucement, déplacer la vis jusqu'à la FRBR concondition est atteint: un seul plan optique de la cellule est au point (ce est à dire, la membrane plasmique en contact avec la lamelle), il en résulte une image plate avec un contraste élevé (figure 2C, à droite).
3. imagerie de l'échantillon
   1. Réglez l'expérience time-lapse à canal unique. Pour minimiser photoblanchiment, capturer l'image en utilisant à faible temps d'exposition et gain élevé. Temps d'exposition appropriées sont entre 40 à 80 msec. Acquérir des images à 1-2 Hz fréquence d'échantillonnage. cinétique de vésicules échantillonnage peuvent être mieux appréciée à plus haute fréquence (10 Hz). Le temps d'observation régulière est généralement de 2 min.
   2. Ajouter 500 pi de cellules de solutions et d'enregistrer KRH en mode TIRFM. Ce est la condition de repos. Enregistrez les images séquentielles de temps.
   3. Concentrez-vous sur la même cellule et enregistrer dans les mêmes conditions de repos (de puissance laser, exposition de temps, le numéro de châssis). Après cinq cadres, ajouter 500 pi de solution KCl-KRH et de garder KCl dans la chambre.Ce est la condition stimulée; enregistrer les images séquentielles de temps.

3. Analyse de l'image et de traitement des données

REMARQUE: Pour analyser les images, les macros ont été développées dans le laboratoire, basée sur des fonctions existantes du logiciel d'analyse d'image; macros similaires sont disponibles en ligne (URL fournie dans le tableau des matériaux et équipements).

1. quantification de l'intensité de fluorescence
   1. Utiliser une macro "Séquence d'intensité de fluorescence" pour la quantification de l'intensité de fluorescence dans une région d'intérêt (ROI) de l'image, au cours de la séquence.
   2. Ouvrir les images séquentielles dans le temps. Allez dans le menu macro et sélectionnez «Séquence intensité de fluorescence. Dans la fenêtre "Analyse de apparaît" sélectionner le ROI ".
   3. Choisissez l'un des outils de sélection dans le menu pour créer le ROI. Placez 3 Rois dans les régions de la membrane cellulaire sans taches (fond ROI). Employer this "background ROI" pour évaluer le photoblanchiment et de fixer le seuil pour l'analyse des événements de fusion (figure 3A).
2. Photobleaching correction et la détermination de seuil (figure 3B)
   1. Pour évaluer le photoblanchiment, ouvrir les lignes de fluorescence d'intensité "de fond", ROI (Figure 3ba). Normaliser les valeurs d'intensité de fluorescence dans chaque trame à la valeur d'intensité initiale (F0) (F / F0) (figure 3Bb). La moyenne des valeurs.
   2. Mettez en surbrillance les données moyennes et de créer un terrain de ligne en utilisant les options de menu de graphique.
   3. Dans le menu d'analyse de données, sélectionnez "Trendline" pour ouvrir la boîte de dialogue d'analyse de la parcelle. Sélectionnez le type de régression. Réglez la régression "exponentielle". Ensuite, sélectionnez "équation d'affichage sur le tableau". Dans la fenêtre graphique, l'équation exponentielle apparaît et les valeurs des paramètres sont automatiquement attribué, (Figure 3bc ).
   4. Appliquer la correction exponentielle pour les valeurs d'intensité dans chaque trame comme suit:
      Fn (corrigé) = Fn / exp (-n * a)
      Fn = expérimentale intensité de fluorescence mesurée à la trame n; n = le nombre de trames; a = facteur de blanchiment (constante exprimant le taux de perte d'intensité en raison de photoblanchiment;   Figure 3BD).
   5. Pour définir le seuil, ouvrir un "background ROI" normalisée et corrigée, calculer le signal de fluorescence moyenne et son écart type (SD). La valeur moyenne plus 3 SD représente le seuil (Figure 3BE). Utilisez ce seuil pour l'analyse des données.
3. La sélection des événements de fusion en utilisant une procédure semi-automatique
   1. Ouvrir les images séquentielles dans le temps avec le logiciel d'analyse d'image. Application d'un filtre gaussien à la séquence d'image active.
   2. Analyser les images à l'aide de la fonction "compter des objets" ou une macro qui permet la sélectiond'un objet dont les pixels ont une intensité de fluorescence moyenne dans une plage définie. Réglez l'intensité gamme manuellement, en utilisant la fonction de seuil (aller à la barre de menu, réglez le seuil de mesure → pour sélectionner la zone d'intérêt). Un seuil adéquat est de 30% sur le signal de fond fluorescent locale.
   3. Appliquer une macro "Filtres objets" pour sélectionner uniquement les objets répondant aux critères suivants:
      1. Appliquer l'option gammes (min et max inclus) pour l'aspect. Aspect indique le rapport entre le grand axe et le petit axe de l'ellipse équivalente à l'objet. Aspect est toujours ≥1. Les valeurs adéquates sont min = 1, max = 3.
      2. Appliquer gammes de diamètre. Diamètre rapporte la longueur moyenne des diamètres mesurés à intervalles de deux degrés joignant deux points de contour et passant par le centre de gravité de l'objet. Définissez la plage de pixels (ou en pm, si vous utilisez un système calibré).
      3. Définir la gamme optimale dans preliminexpériences aires: sélectionner manuellement les points d'intérêt, puis de mesurer leur diamètre en utilisant la fonction de profil de la parcelle.
   4. Sélectionnez «objets d'affichage": objets sélectionnés apparaîtront superposée à l'image de TIRFM (figure 4B).
   5. Inclure dans l'analyse que les taches qui montrent une courte durée (de une à trois cadres) augmentation transitoire de l'intensité de fluorescence, immédiatement suivie d'une perte marquée de signaux transitoires (taches). Employer la sélection circulaire pour créer un retour sur investissement de diamètre environ une place radialement autour des vésicules / spots sélectionnés (ROI expérimental). Effectuez cette étape manuellement.
   6. Avec les ROI sélectionné, calculer l'intensité de fluorescence moyenne de chaque ROI au cours du film.
4. L'analyse des données (figure 3C-D)
   1. Exporter le décours temporel de l'évolution de fluorescence mesurés dans chaque "ROI expérimentale» dans un tableur; (Figure 3da). Normaliser la valeur d'intensité dans chaque trame à l'intensité de fluorescence initiale (F / F0), (figure 3dB).
   2. Appliquer la correction exponentielle pour les valeurs d'intensité dans chaque trame comme indiqué à l'étape 3.2.4 (Figure 3Dc).
   3. Pour calculer le nombre total d'événements de fusion (nombre crête), le temps que chaque fusion se produit (largeur de pic) et l'amplitude du pic fluorescent (hauteur de pic et l'ASC) appliquer des fonctions logiques en utilisant des tableurs ou mathématiques. Un exemple d'analyse d'événement de fusion en utilisant des formules logiques est rapporté dans la Figure 3DD et 3De.
   4. Supposons que l'augmentation de l'intensité de fluorescence supérieure au seuil (intensité moyenne de fluorescence de fond ± 3SD) comme la fusion des vésicules à la membrane plasmique et le pic résultant comme un événement de fusion.
   5. Calculer la largeur du pic en tant que différence entre la dernière et la première valeur x de chaque pic. Multipliez cette valeur pour 1 / (fréquence d'échantillonnage). Considérez cette valeur uns Le temps de fusion des vésicules et l'adhérence à la membrane plasmique vésiculaire avant ré-acidification et recyclage (Figure 3DD).
   6. Calculer la CUA cellule entière comme une somme de valeurs sur le seuil. Considérer cette valeur comme la variation nette fluorescente pendant la durée d'enregistrement en raison de la spontanée (repos) ou évoquée (stimulé) l'activité synaptique.
   7. Calculer la hauteur de pic comme la différence entre la valeur y de chaque pic maximal et le seuil. Considérer cette valeur comme indicative du type de fusion (un ou de fusion séquentielle / simultanée ou transitoire vs pleine fusion).

Résultats

Les procédures de la FRBR imagerie et analyse des données décrites sont conçus pour étudier la dynamique des vésicules dans les systèmes cellulaires. Cette technique peut être utilisée pour déterminer les effets de molécules de signalisation et des médicaments sur les événements de fusion et de la dynamique des vésicules ¹⁷ neurotransmetteur. Utilisation de protéines de membrane de plasma GFP étiqueté, l'analyse de la TIRFM a été utilisée pour caractériser le trafic constitutive de t...

Discussion

Cet article présente un protocole à l'image et à analyser la dynamique des vésicules dans les cellules sécrétant, utilisant des vecteurs et TIRFM ADNc codé fluorescentes. Les éléments clés de l'imagerie par TIRFM succès sont la sélection du modèle cellulaire et transfection de cellules avec des indicateurs optiques génétiquement codés de la libération des vésicules et le recyclage.

TIRFM est idéal pour la croissance des cellules adhérentes à un couvercle de verre...

matériels

Name	Company	Catalog Number	Comments
Equipment
Axio Observer Z1	Zeiss	491912-9850-000	inverted microscope http://www.zeiss.com/microscopy/en_de/products/light-microscopes/axio-observer-for-biology.html#introduction
Multiline Argon Laser Lasos 77	Lasos	00000-1312-752	multi-line (458/488/514 nm), 100mW argon-ion laser http://www.lasos.com/products/argon-ion-laser
Laser TIRF slider	Zeiss	423681-9901-000	http://www.zeiss.com/microscopy/en_de/products/imaging-systems/single-molecular-imaging-laser-tirf-3.html
100x Objective	Zeiss	421190-9900-000	Oil, NA 1.45 Alpha-Plan https://www.micro-shop.zeiss.com/?l=en&p=us&f=o&a=v&m=a&id=421 190-9900-000&ss=1
CCD Camera RetigaSRV Fast 1394	QImaging		http://www.qimaging.com/products/datasheets/Retiga-SRV.pdf
LAMBDA 10-3 optical filter changer with SmartShutter	Sutter Instrument Company		http://www.sutter.com/IMAGING/lambda103.html
Software
Image ProPlus 6.3 Software	Media Cybernetics		spot selection, ROI selection, fluorescence intensity determination http://www.mediacy.com/index.aspx?page=IPP
Excel	Microsoft		photobleaching correction, whole-cell and single-vesicle analyses http://office.microsoft.com/it-it/excel/
GraphPad Prism 4.00	GraphPad Software, Inc.		statistical analysis http://www.graphpad.com/scientific-software/prism/