Sur l’ordinateur, ouvrez MATLAB. Ajoutez le dossier contenant le script MouseWalker au répertoire de travail et exécutez MouseWalker. M sur la ligne de commande principale.
Chargez le dossier vidéo comme répertoire d’entrée. Accédez à la fenêtre Paramètres où se trouvent tous les paramètres d’étalonnage et de seuil. Testez l’effet de la modification de certains paramètres en cliquant sur le bouton Aperçu.
Après avoir ajusté les paramètres de seuil, vérifiez que la vidéo est prête pour le suivi automatisé. Accédez à la première image et cliquez sur auto pour démarrer le suivi. Une fois le suivi terminé, si nécessaire, effectuez une correction manuelle en sélectionnant l’empreinte appropriée.
Enregistrez les modifications en appuyant sur le bouton Enregistrer. Cliquez ensuite sur Évaluer pour générer les fichiers de sortie à partir de la vidéo suivie. Vérifiez que tous les tracés de données de sortie graphiques sont enregistrés dans le dossier Résultats.
Ensuite, vérifiez que toutes les mesures quantitatives générées par le logiciel MouseWalker sont enregistrées sur une feuille de calcul Excel et résumées sur 1.Information_Sheet. Utilisez MouseMultievaluate. M pour rassembler les mesures de toutes les exécutions dans un nouveau fichier pour analyse.
Pour effectuer une analyse en composantes principales, PCA, ouvrez pcaplotgenerator. py dans Spyder et exécutez le code en cliquant sur le bouton Lecture. Sélectionnez le fichier Excel à analyser et le nom de la feuille dans la fenêtre automatique.
Si le nom de la feuille n’est pas modifié, écrivez la feuille 1. Dans le test à l’encre numérique, un manque de soutien pour les pattes postérieures a été détecté. Avec une diminution de la zone d’empreinte pour les pattes postérieures gauche et droite.
Les traces de position générales présentaient plusieurs caractéristiques uniques. Après une lésion de la moelle épinière, les pattes postérieures présentaient des traces de position plus courtes et un positionnement des pores plus aléatoire au toucher et au décollage à partir de 15 jours après la blessure. L’analyse en composantes principales de tous les paramètres moteurs cinématiques a montré une variance de 40 % dans les données de la première composante, qui séparait le groupe d’animaux ayant subi une lésion de la moelle épinière du reste à tous les moments.
En utilisant d’autres scripts tels que le script de la carte thermique, il a été constaté que les animaux blessés à la moelle épinière présentaient des altérations dans les stratégies de marche à tous les moments. Les souris lésion de la moelle épinière ont également montré un indice de rectitude de position plus bas dans les membres antérieurs et postérieurs.
