L’un des défis de la recherche sur l’élégance de la mer est d’isoler les effets d’un régime bactérien vivant des effets des manipulations expérimentales. Il peut être difficile de déterminer si la manipulation a un impact direct sur l’hôte ou indirectement sur les vers par le biais d’interactions entre le microbiome de l’hôte. Les bactéries traitées au paraformaldéhyde relèvent le défi d’isoler les effets du métabolisme bactérien de la physiologie de l’hôte.
Le traitement au paraformaldéhyde est à haut débit et rend systématiquement les bactéries répliquées et métaboliquement inactives. En plus de leur consistance, les bactéries traitées au PFA restent une source de nourriture appétissante et nutritive.