אימונולוקליזציה פלואורסצנטית של חלבונים ערבינוגלקטניים ופקטינים בחומת התא של רקמות הצמח

Summary

פרוטוקול זה מתאר בפירוט כיצד החומר הצמחי לאימונולוקליזציה של חלבונים ופקטינים ערבינוגלקטניים קבוע, מוטבע בשרף אקרילי הידרופילי, חתוכה ומורכבת על מגלשות זכוכית. אנו מראים אפיטופים הקשורים לקיר התא יזוהו עם נוגדנים ספציפיים.

Abstract

פיתוח הצמח כרוך בהתאמות מתמידות של הרכב ומבנה דופן התא בתגובה לגירויים פנימיים וחיצוניים כאחד. קירות התא מורכבים מפוליסכרידים תאיים ולא צלולוסיים יחד עם חלבונים, תרכובות פנוליות ומים. 90% מקיר התא מורכב מפוליסכרידים (למשל, פקטינים) וחלבונים ערבינוגלקטים (AGPs). האימונולוקליזציה הפלואורסצנטית של אפיטופים גליקן ספציפיים בחלקים היסטולוגיים של הצמח נותרה כלי מרכזי לחשיפת שיפוץ של רשתות פוליסכריד בקיר, מבנה ורכיבים.

כאן, אנו מדווחים על הליך אימונולוקליזציה פלואורסצנטי אופטימיזציה לגילוי אפיטופים גליקן מ- AGPs ופקטינים ברקמות הצמח. קיבוע Paraformaldehyde / glutaraldehyde שימש יחד עם הטמעת LR-לבן של דגימות הצמח, המאפשר שימור טוב יותר של מבנה הרקמה והרכב. חלקים דקים של הדגימות המוטבעות שהושגו עם אולטרה מיקרוטום שימשו לאימונולוקליזציה עם נוגדנים ספציפיים. טכניקה זו מציעה רזולוציה רבה, ספציפיות גבוהה, ואת ההזדמנות לזהות אפיטופים גליקן מרובים באותה דגימה. טכניקה זו מאפשרת לוקליזציה תת-תאית של גליצנים ומזהה את רמת ההצטברות שלהם בקיר התא. זה גם מאפשר קביעת דפוסים מרחביים-זמניים של הפצת AGP ופסטין במהלך תהליכים התפתחותיים. השימוש בכלי זה עשוי בסופו של דבר להנחות כיווני מחקר ולקשר גליצנים לפונקציות ספציפיות בצמחים. יתר על כן, המידע המתקבל יכול להשלים מחקרים ביוכימיים וביטוי גנים.

Introduction

קירות תאי הצמח הם מבנים מורכבים המורכבים מפוליסכרידים וגליקופרוטאינים. קירות התא הם מבנים דינמיים ביותר שהארכיטקטורה, הארגון וההרכב שלהם משתנים בהתאם לסוג התא, לוקליזציה, שלב התפתחותי, גירויים חיצוניים ופנימיים¹. חלבונים ערבינוגלקטנים (AGPs) ופקטינים הם מרכיבים חשובים של דופן תאי הצמח. AGPs הם חלבונים glycosylated מאוד פקטינים הם פוליסכרידים homogalacturonan אשר הרכב, כמות ומבנה להשתנות מאוד בשלבים התפתחותיים שונים של הצמח^2,3,4. AGPs ומחקרי פקטין חשפו את מעורבותם במספר תהליכים צמחיים כגון מוות תאי מתוכנת, תגובה ללחצים אביוטיים, רבייה של צמחים מיניים, בין רבים אחרים⁵. רוב המחקרים הללו החלו עם מידע שהתקבל ממחקרי אימונולוקליזציה.

בהתחשב במורכבותו, חקר קירות התא דורש כלים רבים ושונים. זיהוי אפיטופים גליקן באמצעות נוגדנים חד שבטיים (mAbs) היא גישה חשובה כדי לפתור את התפלגות פוליסכריד וגליקופרוטאין לאורך מבנה זה. יש אוסף גדול של mAbs זמין כדי לזהות אפיטופים גליצן ואת הספציפיות של כל mAb הוא ללא הרף להיות משופר גם⁶. הטכניקה המתוארת כאן חלה על כל מיני הצמחים, והיא כלי מושלם להנחיית כיווני מחקר עתידיים שעשויים לכלול טכניקות יקרות ומורכבות יותר.

בטכניקה זו, נוגדנים ספציפיים הם מצומדים כימית צבעים פלואורסצנטיים כגון FITC (פלואורסצנטין isothiocyanate), TRITC (tetramethylrhodamine-5-(ו 6)-isothiocyanate) או כמה צבעי אלקסה פלואור. אימונופלואורסצנטיות מציעה מספר יתרונות, המאפשר לוקליזציה תת-תאית ברורה ומהירה של גליצנים שניתן לצפות בהם ישירות תחת מיקרוסקופ פלואורסצנטי. זה מאוד ספציפי ורגיש, שכן הכנת המדגם יכול להגן ביעילות על המבנה הטבעי של האנטיגן, גם אם קיים בכמויות נמוכות יותר. זה מאפשר זיהוי של אנטיגנים מרובים באותה מדגם והכי חשוב, מציע תוצאות באיכות גבוהה ויפה ויזואלית. למרות הכוח הרב שמציעים מחקרי אימונולוקליזציה פלואורסצנטיים, הם נחשבים לעתים קרובות כקשים לביצוע וליישם ככל הנראה בשל היעדר פרוטוקולים מפורטים המאפשרים הדמיה של השלבים השונים של ההליך. כאן, אנו מספקים כמה הנחיות פשוטות על איך לבצע טכניקה זו וכיצד להשיג תמונות באיכות גבוהה.

עבור הפרוטוקול המוצג כאן, יש לתקן ולהטבע תחילה דוגמאות באמצעות התיקון המתאים ביותר. למרות נחשב טכניקה זמן רב ומייגע יחסית, קיבעון נאות והטבעה של מדגם הצמח הוא המפתח כדי להבטיח מבחני אימונולוקליזציה מוצלחת. לשם כך, הרגיל ביותר הוא קיבעון כימי באמצעות קיבועים crosslinking, כמו אלדהידים. תיקונים חוצי קישורים יוצרים קשרים כימיים בין מולקולות של הרקמה, מייצבים ומקשיחים את המדגם. פורמלדהיד וגולדארלדהיד הם מתקנים מקשרים צולבים, ולפעמים נעשה שימוש בשילוב של שני התיקונים⁷. פורמלדהיד מציע שימור מבני נהדר של רקמות ולמשך פרקי זמן ממושכים, לייצר נסיגות רקמות קטנות ולהיות תואם immunostaining. Glutaraldehyde הוא תיקון חזק ויציב המשמש בדרך כלל בשילוב עם פורמלדהיד. השימוש glutaraldehyde יש כמה חסרונות שיש לקחת בחשבון כפי שהוא מציג כמה קבוצות אלדהיד חינם לתוך הרקמה הקבועה, אשר עשוי ליצור כמה תיוג לא ספציפי. גם ההצלבה בין חלבונים ומולקולות אחרות מדי פעם עלולה להפוך כמה אפיטופים היעד נגיש עבור הנוגדנים. כדי להימנע מכך, יש להגדיר בזהירות את הכמות ומשך הקיבעון.

לאחר הקיבעון, הדוגמאות מוטבעות בשוחלת המתאימה כדי להקשיח לפני קבלת המקטעים. שרף לונדון (LR-לבן) שרף אקרילי הוא השרף של בחירה עבור מחקרים immunolocalization. שלא כמו שרפים אחרים, LR-White הוא הידרופילי, המאפשר לנוגדנים להגיע לאנטיגנים שלהם, ללא צורך בטיפול כלשהו כדי להקל עליו. LR-White יש גם את היתרון של הצעת פלואורסצנטיות אוטומטית נמוכה, המאפשר ירידה ברעש רקע במהלך הדמיה immunofluorescence.

ישנן טכניקות כתמים רבות הזמינות לגילוי רכיבים שונים של דופן התא, כגון כתמים כחולים אלסיאניים, כתמי כחול טולואידין או כתמי חומצה תקופתית-שיף (PAS). אף אחד מאלה אינו מציע את הכוח של ניתוחי אימונולוקליזציה⁸. גישה זו מעניקה ספציפיות רבה יותר בזיהוי הגליקנים, ומציעה מידע נרחב יותר לגבי הרכב ומבנה דופן התא.

Protocol

1. הכנת מדגם: קיבעון, התייבשות, הטבעה LR-לבן

1. קיבוע והתייבשות
   הערה: תהליך הקיבעון הוא קריטי לשמירה על הדגימה; על ידי הצלבת מולקולות חילוף החומרים התאי נעצר, הבטחת שלמות הסלולר ומניעת דיפוזיה מולקולרית. סוכנים מתקנים ואת הריכוז בשימוש חייב להיות מותאם למטרה זו, משאיר את האנטיגנים חשופים מספיק כדי לקיים אינטראקציה עם הנוגדנים. הפרוטוקול הבא משלב את היכולת הקיבעון המתון של paraformaldehyde, עם ההשפעה החזקה יותר של גלוטארלדהיד. הפרופורציות שלהם היו ממוטבות עבור AGPs ורכיבי קיר התא, אבל זה מתאים חלבונים אחרים ומבני תאים. תהליך ההתייבשות הבא יכין את הדגימות להטמעה LR-לבן. בניסוי זה נעשה שימוש ברקמות צמחים ממספר מיני צמחים. דגימות משנה Quercus נאספו מעצים הגדלים בשדה. דגימות שקיעה טריתוריה חולקו איתנו בחביבות על ידי פאולה רודול (גני קיו, לונדון, בריטניה).
   1. לזרוע את כל הצמחים Arabidopsis ישירות על הקרקע ולגדול במתקן צמיחה מקורה עם 60% לחות יחסית ומחזור יום / לילה של 16 שעות אור ב 21 °C (66 °F) ו 8 שעות חושך ב 18 °C (60 °F). בחר את רקמות הצמח שיש לנתח, לקצץ דגימות להיות לא יותר מ 16 מ"מ² בגודל.
   2. מיד להעביר את המדגם בקבוקון זכוכית מלא בעבר עם פתרון קיבוע קר מספיק (2% פורמלדהיד (w / v), 2.5% glutaraldehyde (w / v), 25 mM PIPES pH 7 ו 0.001% Tween-20 (v / v)) כדי להטביע לחלוטין את הדגימות (איור 1A).
      התראה: פורמלדהיד וגולדלדהיד הם סוכנים קיבעוניים שיכולים להזיק על ידי שאיפה ומגע. בצע את צעד הקיבעון על מכסה המנוע אדים וללבוש בגדים מגן נאותה כפפות ניטריל. כל הפתרונות משלב זה ואילך, כולל סדרת אלכוהול עד 70%, יש לאחסן לטיהור מאוחר יותר על ידי צוות מיוחד.
   3. לאחר איסוף כל הדגימות, רענן את התיקון.
   4. מעבירים את הבקבוקונים לתא ואקום, ולאט לאט מורים ואקום. עם ההגעה ל-60 קילוואט-אפ, החומר הצף יתחיל לשקוע לתחתית הבקבוקון (איור 1B).
   5. יש לשמור תחת ואקום של לא יותר מ-80 קילוואט למשך 2 שעות בטמפרטורת החדר.
   6. משחררים לאט את הוואקום, אוטמים את בקבוקון הזכוכית ומניחים לילה ב-4 מעלות צלזיוס.
   7. השלך את כל הדגימות שלא שקעו במהלך הקיבעון בן הלילה. לשטוף את הדגימות הנותרות עם 25 mM PBS pH 7 במשך 10 דקות, ואחריו לשטוף 20 דקות ב 25 mM PIPES מאגר pH 7.2.
   8. לייבש את הדגימות בסדרת אתנול (25%, 35%, 50%, 70%, 80%, 90%, ו 3x 100% אתנול) במשך 20 דקות כל אחד. מעבירים מיד את הדגימות המיובשות לבקבוקוני זכוכית מסומנים להטבעה (איור 1C).
      הערה: ניתן להשהות את תהליך ההתייבשות בשלב 70% האתנול.
2. הטבעת שרף LR-לבן
   הערה: LR-לבן הוא שרף אקרילי לא הידרופובי עם צמיגות נמוכה, מה שהופך אותו אידיאלי עבור רקמות חודרות עם שכבות רבות של קירות תאים עבים. LR-לבן מגיע גם בכמה ציונים קשיות תואם לחיתוך רוב דגימות הצמח. אנא ודא כי שוסף משומש כבר מסופק עם הזרז הנכון מעורבב, או בצע את הוראות הספק כדי להכין את הרשף. תהליך ההטבעה הבא איטי אך התוצאות מצדיקות במידה רבה את האמצעים.
   1. לחלחל הדגימות על ידי דגירה עם שרף LR-לבן בסדרה של ריכוז חצי סהר של שרף (1:3, 2:3, 1:1, 3:2, 3:1, 1:0) באתנול, דגירה במשך 24 שעות ב 4 מעלות צלזיוס בכל צעד.
      התראה: שרף LR-לבן הוא שרף אקרילי רעילות נמוכה; עם זאת, זה עשוי להיות מגרה לעור על ידי מגע ושאיפת. מומלץ מאוד לעבוד באזור מאוורר היטב או מתחת למכסה אדים עם בגדי מגן מתאימים וכפפות ניטריל.
   2. רענן את שרף LR לבן דגירה עבור 12 שעות נוספות ב 4 °C (60 °F).
   3. הכינו כמוסות ג'לטין בגודל המתאים (גודל 1 (0.5 מ"ל) לדגימות של עד 3 מ"מ, 2 x 0.37 מ"ל לדגימות של עד 5 מ"מ או 3 x 0.3 מ"ל לדגימות עד 8 מ"מ ותגי נייר (איור 1D).
      הערה: בחר את גודל הקפסולה להיות מעט גדול יותר מאשר המדגם, כך הדגימה יכולה להיות סגורה לחלוטין שרף. כמו כן, זכור לתייג את התגים בעיפרון, מכיוון שעט או צבעי דיו מודפסים יזהמו את שף, ויהרסו את הדגימה.
   4. יש למרוח טיפה אחת של שרף LR-לבן טרי על החלק התחתון של כל כמוסה.
   5. מניחים דגימה בכל כמוסת ג'לטין וממלאים לקיבולת מקסימלית עם שף טרי. מניחים את מכסה הקפסולה ונולחים בעדינות ליצירת חותם הרמטי(איור 1E).
   6. פולמריזציה של שף במשך 24 עד 48 שעות ב 58 מעלות צלזיוס, או עד התקשות מלאה.
   7. אחסן דגימות בטמפרטורת החדר.
      הערה: שרף LR-לבן לאחר פולמורציה הוא אינרטי.

2. הכנת שקופיות

הערה: שקופיות זכוכית חייבות להיות נקיות, ללא כל אבק, גריז או כל מזהם אחר. אפילו שקופיות חדשות יש לנקות כמו ספקים מסוימים להשתמש בשמנים וחומרי ניקוי כדי למנוע את השקופיות מלהידבק יחד. כל גריז או חומר ניקוי יפריע הידבקות החלק לשקופית, גם אם מטופלים עם פולי-L-לידין. מוך ואבק ישפיעו על תצפיות הדגימה וייתכן מאוד יהרסו את הניסוי. שקופיות מצופות טפלון עם בארות תגובה מושלמות למשימה זו. הם סבירים, לשימוש חוזר ולהפחית באופן דרסטי את כמות פתרון הנוגדנים הדרוש. עם ניקוי נכון, אימונולוקליזציה פלואורסצנטית באיכות מעולה יכולה להתבצע בעלות סבירה מאוד.

1. שטיפת שקופיות
   1. מניחים את השקופיות בארון תקשורת מכתים ומכסים בתמיסת ניקוי (0.1% SDS (w/v), 1% חומצה אצטית (v/v), 10% אתנול (v/v)).
   2. לשמור על תסיסה קלה במשך 20 דקות.
   3. מעבירים את מדפי הכתמים לאמבט DDH₂O עם תסיסה קלה במשך 10 דקות. חזור על הפעולה 4 פעמים.
   4. מסננים בזהירות את המדפים לפני טבילה קצרה באתנול של 100% ומניחים למגלשות להתייבש בסביבה נטולת אבק.
   5. יש לאחסן עד השימוש.
2. ציפוי פולי-ל-ליצין (אופציונלי)
   הערה: חלקים קטנים בדרך כלל מקל טוב מאוד כדי לנקות שקופיות זכוכית. שלב זה מומלץ רק עבור מקטעים גדולים יותר (>2 מ"מ²). חלקים גדולים יותר נוטים לקפל ולהתקמט, ואינם מומלצים. עם זאת, במידת הצורך להשתמש שקופיות תגובה עם חורים גדולים יותר. נקה אותם כאמור לעיל והמשך כדלקמן.
   1. מניחים שקופיות נקיות בצלחת פטרי מרובעת. פיפט 0.001% פולי-L-ליסין פתרון (w/v) כדי לכסות את החורים של השקופיות, מבלי לעלות על גדותיו.
   2. תן את המגלשות להתייבש לילה ב 40 מעלות צלזיוס במנות פטרי סגורות.
      הערה: המגלשות המצופה מוכנות לשימוש מיידי וניתן לאחסן אותן בסביבה נטולת אבק בטמפרטורת החדר, למשך מספר חודשים.

3. חיתוך וחיתוך לדוגמה

1. חיתוך לדוגמה
   1. בעזרת סכין גילוח חד, חותכים את גושי LR-White תחת סטריאומיקרוסקופ כדי ליצור מבנה בצורת פירמידה שבו השיא ניצב לאזור העניין של המדגם(איור 1A משלים).
      הערה: מחזיק הדגימה האולטרה-מיקרוטומי הוא כלי מצוין לאבטחת הבלוק. אם להתקן אין מחזיק דגימה אוניברסלי, השתמש בדגימה המתאימה ביותר לבלוקים עגולים.
   2. לקצץ את המבנה הפירמידלי על ידי הסרת פרוסות עדינות של עודף שף בניצב לציר הראשי הפירמידה.
   3. ממשיכים עד שהדגימה מגיעה ויוצרים את משטח החיתוך. בתוך משטח החיתוך, מדגם היעד צריך להיות מוקף באופן אידיאלי בצורת טרפז.
      הערה: ניתן לחתוך עוד יותר את בלוק שרף בזווית חתך כדי להפחית את שטח הפנים של המקטע עם להב חד(איור 1F).
2. חתך דק למחצה
   הערה: ייעשה שימוש במיקרוטום עם סכיני זכוכית. היכולת של הנוגדן להיקשר לאפיטופ תותנה את הצלחת התגובה האימונולהבלקטיבית. האופי ההידרופילי של שרף LR-לבן יאפשר מגע טוב של הנוגדנים עם קטעי המדגם. חלקים דקים יותר יציגו צבע קלקופלור עמום שישמש כדי לסייע באיתור החלקים ולסייע בתהליך ההדמיה. אותו הדבר נכון לגבי כתמים אחרים שעשויים להיות מיושמים מאוחר יותר. גם עובי מוגזם ישפיע על איכות רכישת התמונה. פשרה טובה לעובי קטע ניתן למצוא בין 200 ל 700 ננומטר, בהתאם למאפייני הרקמה. הר את הבלוקים בחוזקה על מחזיק הדגימה של אולטרה מיקרוטום.
   1. עם מיקרוטום אולטרה-מיקרו-אטומי, יש ליצור מקטעים בעובי שבין 200 ל-700 ננומטר (איור 1G).
   2. בדוק את אזור המקטע על-ידי העברת מקטעים מסוימים לנפילת ddH₂O בשקופית זכוכית. מניחים את המגלשה על צלחת חמה של 50 מעלות צלזיוס עד שהמים מתאדים. כתם הצבת טיפה של 1% טולוידין כחול O (w / v) ב 1% תמיסת חומצה בורית (w / v) על החלקים במשך 30 s. לשטוף ולהתבונן תחת המיקרוסקופ.
   3. לאחר מציאת המבנה הרצוי, להעביר קטע אחד או שניים לכל טיפה של ddH₂O להציב בעבר על כל באר של שקופית תגובה נקייה.
   4. מניחים כל שקופית בצלחת פטרי מרובעת נקייה סגורה בגודל 10 ס"מ ומניחים לה להתייבש ב-50 מעלות צלזיוס.
   5. אחסן שקופיות בתיבת ארכיון נקייה עד לשימוש.

4. אימונולוקליזציה

הערה: הליך האימונולוקליזציה הפלואורסצנטית מסתמך על שימוש רציף בשני נוגדנים. הנוגדן העיקרי מועלה נגד אנטיגן מטרה ספציפי. הנוגדן המשני מועלה במיוחד נגד הנוגדן העיקרי ולטכניקות פלואורסצנטיות הוא מצומד פלואורופור (FITC בפרוטוקול ספציפי זה). הנוגדן העיקרי ישמש לגילוי אנטיגן היעד במדגם, והנוגדן המשני ישמש לסימון המיקום שבו הנוגדן העיקרי המחובר לדגימה לאחר שטיפת עודף הנוגדן העיקרי. פקדים הם חלק חשוב של מבחנים אלה ויש לבצעם תמיד כדי להבטיח את דיוק התצפיות. באר אחת בשקופית צריכה להיות שמורה לשימוש כבקרה שלילית, שם ידלגו על הטיפול העיקרי בנוגדנים, ולכן אין לראות אות בסוף הניסוי. שליטה חיובית חייבת להיכלל בניסוי על ידי טיפול בבאר אחת עם נוגדן אשר תיוג כבר ידוע ובטוח. הבקרה החיובית משמשת לאישור יעילות תיוג הנוגדנים המשניים ותנאי התגובה בעוד שהבקרה השלילית בודקת את הספציפיות המשנית של הנוגדנים.

1. הכינו תא דגירה על ידי הנחת כמה מגבות נייר לחות בתחתית קופסת טיפים לפיפט ועטיפתו בנייר כסף(איור משלים 1B-1E). מניחים את השקופיות בתא הדגירה.
2. פיפטה טיפה 50 μL לכל 8 מ"מ גם של פתרון חסימה (5% חלב יבש דל שומן (w / v) ב 1 M PBS) ודגרת במשך 10 דקות. הסר את פתרון החסימה ולשטוף את כל בארות פעמיים עם PBS במשך 10 דקות.
3. הכן את פתרונות הנוגדנים העיקריים (ראה טבלה משלימה 1), נוגדן 1:5 (v/v) בתמיסת חסימה; לעשות הערכה של כ 40 μL לכל 8 מ"מ היטב.
   הערה: יש להתאים את ריכוז הנוגדן בהתאם לפרוטוקול הייצור.
4. בצעו שטיפה אחרונה עם ddH₂O במשך 5 דקות, לעולם אל תתנו לבארות להתייבש לחלוטין.
5. פיפט פתרון הנוגדנים העיקרי לבארות התגובה. פיפט חוסמת פתרון לבארות הבקרה.
6. סגור את תא הדגירה ולתת לעמוד במשך 2 שעות בטמפרטורת החדר ואחריו לילה ב 4 מעלות צלזיוס. הכן את פתרון הנוגדנים המשני, 1% בתמיסת חסימה (v / v) על 40 μL לבאר. שמור אותו מכוסה בנייר כסף.
7. לשטוף את כל בארות פעמיים עם PBS במשך 10 דקות, ואחריו 10 דקות נוספות עם ddH₂O. ודא כי אין עקבות של פתרון חסימה או הפקדות גלוי על בארות.
8. פיפטה פתרון הנוגדנים המשני לכל בארות. מעתה והלאה, הגן על השקופיות מפני אור.
9. דגירה במשך 3-4 שעות בחושך בטמפרטורת החדר.
10. לשטוף את כל בארות פעמיים במשך 10 דקות עם PBS ואחריו לשטוף עוד 10 דקות עם ddH₂O.
11. החל טיפה של calcofluor (1:10,000 (w / v) פלורסנט בהיר יותר 28 ב PBS) על כל באר. ללא שטיפה, יש למרוח טיפה של מדיום הרכבה (ראו טבלת חומרים)על כל באר ולמקם עט כיסוי (איור 1H).
12. שימו לב במיקרוסקופ פלואורסצנטי, המצויד בעדשה 10x/0.45, 20x/0.75, 40x/0.95 ו- 100x/1.40, השתמש ב- UV (עבור כתמי קלקולור) ובמסנני FITC, כדי לזהות קיר תאים ואימונולוקליזציה בהתאמה (איור 1I). השתמש באורכי הגל הבאים: עירור/פליטה (nm) 358/461 עבור UV ו- 485/530 עבור FITC.
13. לקבלת תצוגה חזותית טובה יותר של התוצאות חופפות שתי התמונות עם ImageJ או דומה.

תוצאות

בניסוי מוצלח, הנוגדן המשני יאתר באופן ספציפי את מיקומו של האפיטופ הספציפי בירוק בהיר, באופן עקבי, ויאפשר אפיון של הרכב דופן התא בשלב התפתחות מסוים של התא, הרקמה או האיבר. לדוגמה, לנוגדן LM6 יש זיקה גבוהה ל-1,5-arabinan, תרכובת עם סוג I rhamnogalacturonan שניתן למצוא מתייגת בשפע את דופן התא של קוורקוס suber ...

Discussion

שיטת האימונולוקליזציה הפלואורסצנטית בצמחים כאן תיארה, אף שהיא פשוטה בצורה חלקה, מסתמכת על ההצלחה של מספר צעדים קטנים. הראשון שבהם הוא הכנה וקיבעון לדוגמה. במהלך צעד ראשון זה, תערובת של פורמלדהיד ו glutaraldehyde משמש כדי crosslink רוב מרכיבי התא. הפורמלדהיד בתמיסה מספק קיבעון קל וניתן הפיכה בעוד הגלו...

Materials

Name	Company	Catalog Number	Comments
25% (w/v) Gluteraldehyde	Agar Scientific	AGR1010	aq. Solution, methanol free
8 wells Glass reaction slides	Marinfeld	MARI1216750	other brands may be used
Acetic acid	Sigma-Aldrich	A6283
Anti-Rat IgG (wole molecule)-FITC antibody produced in GOAT	Sigma-Aldrich	F6258
cover slips, 24 mm x 50 mm	Marinfeld	MARI0100222	The cover slip should cover all the wells. Other brands may be used
ddH2O	na	na
Absolute ethanol	na	na
Fluorescent brightner 28	Sigma-Aldrich	F-6259
Gelatin capsules	Agar scientific	AGG29211	The capsule size should fit the size of the sample.
Glass vials	na	na	Any simple unexpensive glass vials that can be sealed, may be used. The vials may be cleaned with 96% ethanol after use to remove LR-White residue and reused.
LR-white medium grade, embdeding resin	Agar Scientific	AGR1281	LR-White comes in several forms; the medium grade provides an adequate cutting support for most tissues, while for harder tissues a harder grade of LR-white may be recommendable. If possible use a resin already mixed with the polimeration activator (benzoyl peroxide), if not please follow the instructions of the supplier to prepare the resin.
Non fat dry milk	Nestlé	na	any non fat dry milk is adequate
Oven	na	na	generic laboratory oven
Petri dish, 10 cm x 10 cm square	na	na
PIPES	Sigma Aldrich	P1851
Rat generated Monoclonal Anti-Body	Plant probes	na	Several antibodies that recognize cell wall components are available at both the Complex Carbohydrate research center (CCRC, Georgia University USA) and Plant Probes (Paul Knox Cell Wall Lab, at Leeds University UK). A short list of some commonly used MABS and where they can be purchased is presented in Supplemental Table 1
Razor blades	na	na	regular razor blades
SDS	Sigma-Aldrich	L6026
Toluidine Blue-O	Agar Scientific	AGR1727
Tween 20	Sigma-Aldrich	P9416
Ultramicrotome	Leica Microsystems	UC7
Upright epifluorescence microscope with UV and FITC fluorescence filters	Leica Mycrosistems	DMLb
Vacuum chamber	na	na
Vacuum pump	na	na
Vectashield	vecta Labs	T-1000	Other anti-fade may be used. Please do check for compatibility with FITC and the Fluorescente brightner 28. (Note: for a non-commercial alternative, (see Jonhson et al 198218) An anti-fade medium can be made by mixing 25 mg/mL of 1,4-Diazobicyclo-(2,2,2)octane (DABCO) in 9:1 (v/v) glycerol to 1xPBS. Adjust pH to 8.6 with diluted HCl.)