We appreciate and would like to thank the Howard Hughes Medical Institute for the HHMI Professor award to U.B. which made this project possible. We thank the college at the University of California, Los Angeles for providing facilities and teaching infrastructure support for this work. The work was also supported with funding from Midwestern University and a generous donation from the Charity Fidelity Gift Fund. We thank John VandenBrooks for comments on the manuscript and Krista Pearman for her technical assistance.

הליך זה הוא הליך 2 יום. יום 1 (שעה 2 + לנתח זמן) Dissection 1. גלמי עין הדיסק <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בחר גולם לנתיחה. הערה: גיל הגולם להיות גזורים תיקבע על ידי צרכי הניסיוניים. עם זאת, אם בוחן את המורפולוגיה של תאים, זה נעשה לעתים קרובות על 42 שעות לאחר היווצרות הגולם (APF) של 25 מעלות צלזיוס, שהוא הגיל של הגלמים ניתן לראות בסרטון. אסוף לבנים גלמים (APF 0 שעה הנחשבת) עם מכחול רטוב ולסדר אותם בסדר כרונולוגי (המבוסס על זמן איסוף) בבקבוקון אוכל לטוס חדש נשמר על 25 מעלות צלזיוס. לנתח את הגלמים המיושנים באותו סדר כרונולוגי זה כדי לשמור על פרש הזמן בין שני גלמים קרובים ככל האפשר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> העבר את הגולם לירידה של פוספט שנאגרו מלוח (PBS, pH 7.4, לראות חומרים למתכון) על צלחת לנתח סיליקון. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> החזק את החלק העליון של המקרה גלמי עם מלקחיים ופירס ולפתוח את lחלק ower של המקרה גלמי עם זוג מלקחיים חדים. הסר את הגולם מהמקרה לחור שהוקם זה עתה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לעשות חתך אלכסוני במספריים, באמצע בית חזה-, בגולם. הסר את הפסולת או להעביר את ראש הגולם לירידה חדשה של PBS. נקה באמצעות צינור מפוח פיפטה (ראה חומרים ואיור 1 לפרטים נוספים) ולהוסיף PBS נוסף בהתאם לצורך. ודא כדי למנוע התייבשות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> אחיזה מאובטחת העליון של ציפורן ראש גלמים עם זוג המלקחיים. באמצעות הקצה של מפוח הצינור, דחף בעדינות על המקרה גלמי כדי למתוח את המוח וברקמות אחרות, כוללים דיסקי העין, מתוך המקרה גלמי. הקפד להימנע תופס את כל רקמה בתוך הציפורן. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השימוש במפוח הצינור מלא PBS, בעדינות לפוצץ את רקמת שומן בגוף ופסולת אחרת ממקרה הראש להפריד באופן ברור ולזהות דיסקי המוח ועיניים. הערה: שמירה על המוח המצורף במקרה ראש גלמים תאפשר לחוקר להשתמשמקרה מודעה כ&quot; ידית &quot;למניפולצית עתיד של הרקמה מבלי לפגוע בדיסקי עין או במוח. עם זאת, זה נפוץ כדי לסלק את דיסקי המוח והעין ממקרה הראש וזה לא פוגע בהליך והתוצאות הכוללים. זה לוקח בדרך כלל ניסיונות מרובים של פיצוץ ודוחף להצלחה לחלץ את דיסקי העין ומוח מבפנים מקרה ראש גלמים וכך שהם באופן ברור, בנפרד מרקמה הסובבת. נקי יותר ויותר נפרד אחד יכולים לקבל דיסקי עין מן הרקמה הסובבת יסייעו למנוע רקמות זרות מתיקון לדיסקי עין. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בעקבות נתיחה, להעביר באופן מיידי את הרקמה לצלחת זכוכית 3 גם על קרח עם 0.5 מיליליטר של תמיסת תקן (ראה חומרים). לצוף הרקמה על פני השטח של פתרון תקן לכמה דקות (בדרך כלל הזמן שלוקח לנתח את הסדרה הבאה של דיסקי העין). הערה: אם זה לא דיסק העין הראשון להיות גזור בסיבוב הנתיחה, completel זהy להטביע את דיסק העין הקודם לפתרון תקן. אם ביצוע נהלים מיוחדים צביעה (לדוגמא, מיני חמצן תגובתי, lysosomes, וכו &#39;) זה חייב להיעשות לפני הקיבוע. כדי לעשות זאת, לאחסן את תקליטורי עין גזורים בPBS קר כקרח לפני המשך הפרוטוקול מכתים המתאים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בעקבות נתיחה והטמעה של כל דיסקי העין עוברת ניתוחים, להעביר את צלחת זכוכית 3 גם לנדנדה ורוק בטמפרטורת חדר למשך 30 דקות. </li></ol> 2. Immunostaining <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מוציא בזהירות את פתרון התיקון ומוסיף 0.5 מיליליטר של PBS עם 0.3% Triton X-100 (PBT 0.3%, לראות חומרים) ולשטוף את הרקמה על כיסא נדנדה במשך 10 דקות. חזור על פעולה זו שלוש פעמים נוספות עבור הסכום כולל של 4 שטיפות (10 דקות כל אחד). הערה: הסרה זהירה של הפתרון מהבאר ניתן לבצע תחת מיקרוסקופ לנתח כדי למנוע נזק לרקמות או הפסד. הפתרון יכול להישאף בזהירות עם pipet; אנחנו מעדיפים עדין tippeד, pipet העברה חד פעמי כי יש לו הפתיחה השטוחה כדי להקטין את הסיכוי של aspirating רקמה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בסופו של השטיפה 4, להסיר את לשטוף ולהוסיף 0.5 מיליליטר פתרון לחסום (ראה חומרים) ולדגירה במשך 30 דקות. הערה: מסגרת זמן זו ניתנת להארכה בהתאם לצרכים שלך. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בסופו של זמן חסימת 30 דקות, pipet 10 μl של ראשי נוגדני פתרון (בדילול מלא פתרון בלוק) למספר המתאים של בארות בצלחת microwell. הערה: גם אחד מצלחת microwell יהיה להכיל כ 4 זוגות של דיסקי עין מצורפים במקרה גלמים או 8 זוגות בודדים של דיסקי עין עם המוח המצורף. הנוגדנים העיקריים בשימוש בפרוטוקול זה לנתונים הנציג הם אנטי-phosphotyrosine (1: 500 דילול) ואנטי-Cut (1: 200 דילול). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> העברת הרקמה גזור לתוך בארות צלחת microwell מלאות היסודי נוגדני הפתרון מצלחת זכוכית 3 גם. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מקוםצלחת microwell על מגבת נייר רטובה (כדי למנוע התייבשות) בתיבת pipet הריק קצה (או מיכל דומה אחר) ולאחסן ב 4 ° C למשך הלילה. </li></ol> יום 2 (4 שעות + ההרכבה זמן) <ol start="6" style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> העברת הרקמה מצלחת microwell לצלחת זכוכית 3 גם חדשה עם 0.3% PBT (≈0.5 מיליליטר) ולשטוף את הרקמות של 10 דקות על הנדנדה. חזור על פעולה זו שלוש פעמים נוספות עבור הסכום כולל של 4 שטיפות (10 דקות כל אחד) </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את השטיפה האחרונה ומוסיף 0.5 מיליליטר של תמיסת הבלוק לבאר. לחסום למשך 30 דקות. הערה: מסגרת זמן זו ניתנת להארכה בהתאם לצרכים שלך. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את פתרון החסימה ולהוסיף 0.5 מיליליטר של משני נוגדני הפתרון (עשוי מנוגדנים שכותרתו fluorescently מתאימים לנוגדן העיקרי שלך ואורך גל ניאון, בדילול מלא בפתרון בלוק) לטוב ולהגן על צלחת זכוכית 3 גם מהאור עם כיסוי או אלומיניום לסכל ודגירה של לפחות 2 שעות בחדרטמפרטורה. הערה: כל הצעדים הבאים צריכים להיות מוגנים באופן דומה מחשיפה לאור. דגירה זה יכול להתארך עד הלילה ב 4 ° C, בהתקנה דומה לדגירת הנוגדן הראשונית, אך הוא גם יכול להתבצע בכלי זכוכית 3 גם מכוסים בסרט מעבדה, או צלחת microwell אם שימור נוגדן הוא רצוי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בסוף הדגירה הנוגדנים, להסיר משני נוגדני הפתרון ולהוסיף 0.5 מיליליטר של PBT 0.3% לטובים ולשטוף בנדנדה במשך 10 דקות. חזור על שלב זה עבור הסכום כולל של 4 שטיפות (10 דקות כל אחד). הערה: אם מכתים DAPI הוא רצוי, לפני שמתחילים לשטוף הראשון, להוסיף 0.5 μl של פתרון מניות DAPI (ראה חומרים) ל-500 μl של PBT שישמש להדחה הראשונה (1: 1,000 דילול). </li></ol> 3. הרכבה <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בסופו של השטיפה האחרונה, הר דיסקי מחושים / עין על שקופית באמצעות גליצרול 70% או PBS כמדיום כדי להסיר את brעין וברקמות לא רצויות אחרות בבריכה בצד אחד של השקופיות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בזהירות להזיז את הרקמות באמצעות לחץ ההידרוסטטי בין המלקחיים, או בעדינות עם קצה מלקחיים, ושורת דיסקי עין בטור לכיוון המרכז של השקופית. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את כל גליצרול הזר או PBS מכל רחבי הרקמה (באמצעות פעולת הפתילה של מעבדה נגבתה או המלקחיים לעבוד על זה). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מניחים כמות קטנה (≈10 μl) של מדיום גובר בצד אחד של טור דיסק העין ובמקום coverslip על הרקמה על מנת להפיץ את המדיום גובר על דיסקי עין. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בואו לשבת שקופיות 1 עד 2 דקות כדי לאפשר לרקמות / ההרכבה בינונית להתפשט לחלוטין. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> נגב כל מדיום הרכבה נוסף מן מסביב לקצוות של coverslip ולאטום אותו עם לק ברור. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> צלם תמונות ניאון של דיסקי העין באמצעות מיקרוסקופ confocal. </li></ol>

<ol>
	<li>Ready, D. F., Hanson, T. E., Benzer, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+the+Drosophila+retina,+a+neurocrystalline+lattice.">Development of the Drosophila retina, a neurocrystalline lattice.</a> Dev Biol. 53 (2), 217-240 (1976).</li><li>Wolff, T., Ready, D. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+beginning+of+pattern+formation+in+the+Drosophila+compound+eye:+the+morphogenetic+furrow+and+the+second+mitotic+wave.">The beginning of pattern formation in the Drosophila compound eye: the morphogenetic furrow and the second mitotic wave.</a> Development. 113 (3), 841-850 (1991).</li><li>Carthew, R. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pattern+formation+in+the+Drosophila+eye.">Pattern formation in the Drosophila eye.</a> Curr Opin Genet Dev. 17 (4), 309-313 (2007).</li><li>Bao, S., Cagan, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preferential+adhesion+mediated+by+Hibris+and+Roughest+regulates+morphogenesis+and+patterning+in+the+Drosophila+eye.">Preferential adhesion mediated by Hibris and Roughest regulates morphogenesis and patterning in the Drosophila eye.</a> Dev cell. 8 (6), 925-935 (2005).</li><li>Grzeschik, N. A., Knust, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=IrreC/rst-mediated+cell+sorting+during+Drosophila+pupal+eye+development+depends+on+proper+localisation+of+DE-cadherin.">IrreC/rst-mediated cell sorting during Drosophila pupal eye development depends on proper localisation of DE-cadherin.</a> Development. 132 (9), 2035-2045 (2005).</li><li>Sprecher, S. G., Desplan, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Switch+of+rhodopsin+expression+in+terminally+differentiated+Drosophila+sensory+neurons.">Switch of rhodopsin expression in terminally differentiated Drosophila sensory neurons.</a> Nature. 454 (7203), 533-537 (2008).</li><li>Zuker, C. S., Cowman, A. F., Rubin, G. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+and+structure+of+a+rhodopsin+gene+from+D.+melanogaster.">Isolation and structure of a rhodopsin gene from D. melanogaster.</a> Cell. 40 (4), 851-858 (1985).</li><li>Voas, M. G., Rebay, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Signal+integration+during+development:+insights+from+the+Drosophila+eye.">Signal integration during development: insights from the Drosophila eye.</a> Dev Dyn. 229 (1), 162-175 (2004).</li><li>Hsiao, H. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dissection+and+immunohistochemistry+of+larval,+pupal+and+adult+Drosophila+retinas.">Dissection and immunohistochemistry of larval, pupal and adult Drosophila retinas.</a> J Vis Exp. , 4347 (2012).</li><li>Call, G. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genomewide+clonal+analysis+of+lethal+mutations+in+the+Drosophila+melanogaster+eye:+comparison+of+the+X+chromosome+and+autosomes.">Genomewide clonal analysis of lethal mutations in the Drosophila melanogaster eye: comparison of the X chromosome and autosomes.</a> Genetics. 177 (2), 689-697 (2007).</li><li>Chen, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Discovery-based+science+education:+functional+genomic+dissection+in+Drosophila+by+undergraduate+researchers.">Discovery-based science education: functional genomic dissection in Drosophila by undergraduate researchers.</a> PLoS Biol. 3 (2), 59 (2005).</li><li>Wolff, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dissection+techniques+for+pupal+and+larval+Drosophila+eyes.">Dissection techniques for pupal and larval Drosophila eyes.</a> CSH Protoc. 2007, (2007).</li><li>Williamson, W. R., Hiesinger, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preparation+of+developing+and+adult+Drosophila+brains+and+retinae+for+live+imaging.">Preparation of developing and adult Drosophila brains and retinae for live imaging.</a> J Vis Exp. 37, 1936 (2010).</li><li>Xu, T., Rubin, G. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+genetic+mosaics+in+developing+and+adult+Drosophila+tissues.">Analysis of genetic mosaics in developing and adult Drosophila tissues.</a> Development. 117 (4), 1223-1237 (1993).</li><li>Duffy, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=GAL4+system+in+Drosophila:+a+fly+geneticist's+Swiss+army+knife.">GAL4 system in Drosophila: a fly geneticist's Swiss army knife.</a> Genesis. 34 (1-2), 1-15 (2002).</li></ol>

The authors have nothing to disclose.

While it appears that the process is simple and easy to perform, in reality, this technique requires a great deal of practice to master. Routinely, we start students off by learning to dissect and mount third instar eye discs12, which are much easier to work with. This practice helps to develop an appropriate dissection position of the arms, hands and fingers13 so that manipulation of the forceps under the dissecting microscope is stable, easy and experienced. In essence, the practice period shou...

תחומי ביולוגיה התפתחותית ותא כבר הושפע רב מאורגניזם המודל: דרוזופילה melanogaster. בתוך מודל זה, מחקרים של דיסק העין תרמו רב איתות ידע הנוגע ל, ביולוגיה של תא ובאזורים אחרים. דיסק הזחל השלישי מאוחר עין instar נחקר בהרחבה והוא מודל רב עוצמה לנצל, כפי שהוא נותן תמונת מצב של סדרה של תקופות התפתחותיות, כל אחד עם המולקולות שלו האיתות ייחודית ותהליכים, כמו תלם המוךפו&quot;גנטי מתקדם פני דיסק העין 8. עם זאת, יש צורך להרחיב עוד יותר את ההבנה של תהליכים התפתחותיים שלנו לשלב גלמים של פיתוח. אמנם היו מחקרים על דיסק עין גלמי 3-7, הידע שלנו לא מתקרב לרוחבה של עבודה שבוצעה על דיסק עין instar השלישי. זאת בשל, בחלקו, לקושי הגדול יותר בלנתח את דיסק עין גלמים. לכן, הצגתשיטה נכונה של נתיחה יכולה להרחיב מאוד את המחקר בתחום זה. אמנם יש שלבים בהתפתחות דיסק עין גלמים שבקלות גזורים, במיוחד סביב תקופת אמצע גלמים-, תקופות זמן אחרות הן הרבה יותר מאתגר לנתח. פרוטוקול זה מייצג שיטה אחת ללנתח דיסקי עין גלמים שניתן להשתמש בי אוניברסלי לכל מסגרות הזמן התפתחותי גלמים. פרוטוקול זה יכול לשמש כתחליף לעוד פרוטוקול 9 שמראה שיטה קלה ומהירה יותר לנתח דיסקי עין מנקודות זמן midpupal. פרוטוקול זה צולם במקור ופיתח להכשרת סטודנטים לתואר ראשון מתקדמים באוניברסיטת UCLA לתואר ראשון קונסורציום המחקר בגנומיקה פונקציונלית (URCFG) 10,11 בטכניקה של נתיחת עין גלמים. סטודנטים לתואר ראשון רבים היו מסוגלים לנצל את וידאו ובשיטה זו כדי ללמוד את הטכניקה מאתגרת זו.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Phosphate-buffered saline (PBS, pH 7.4)</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>80g NaCl, 2g&#160; KCl, 14.4g Na2HPO4, 2.4g KH2PO4, Bring volume to 1 l, adjust the pH to 7.4, autoclave or filter sterilize, dilute to 1X PBS with autoclaved ddH2O before using.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triton X-100</td>
			<td>Promega</td>
			<td>H5142</td>
			<td>Caution: Irritant! Wear gloves.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>0.3% PBT</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>1.5 ml of Triton X-100, 500 ml 1X PBS.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>37% formaldehyde solution</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>F75P1GAL</td>
			<td>Caution: Toxic, probable human carcinogen! Wear gloves.&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fix Solution</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>(&#8776;4% Formaldehyde in PBS) 50 &#956;l of 37% Formaldehyde, 450 &#956;l 1XPBS, make fresh before use</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Normal goat serum</td>
			<td>Rockland antibodies &#38; assays</td>
			<td>B304</td>
			<td>Aliquot in 1 ml volumes and store at -80C</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Block Solution</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>10% NGS in PBT.&#160; This can be made and stored at 4 &#176;C for a few days prior to use.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DAPI stock solution</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>D3571</td>
			<td>For coutnerstaining nuclei. Prepare a 1 mg/ml solution with ddH2O.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>VectaShield Mounting Medium</td>
			<td>Vector Labs</td>
			<td>H-1000</td>
			<td>Mounting medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glycerol</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>G5516</td>
			<td>For mounting. Prepare 70% dilution with ddH2O.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Equipment</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nutating mixer</td>
			<td>VWR</td>
			<td>82007-202</td>
			<td>Used to rock tissue in 3 well glass dish</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SylGard 182 Silicone Elastomer Kit</td>
			<td>Krayden</td>
			<td>NC9897184</td>
			<td>Used to make silicone dissection dish</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Silicone dissecting dish</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Mix Sylgard elastomer kit (above) according to directions gently (to avoid bubbles). Pour mixture into Petri dish (any size). Allow SylGard to cure overnight in 37 &#176;C incubator.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>3 well glass dish</td>
			<td>Corning</td>
			<td>7220-85</td>
			<td>The 3 well variety of these are no longer available, this is the 9 well product.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>72 well microwell minitray</td>
			<td>Nunc</td>
			<td>438733</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sharp forceps (Dumont #55)</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>11255-20</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td><a name="RANGE!A19">Vannas-type Micro Scissors, Straight, 5mm blade</a></td>
			<td>Ted Pella</td>
			<td>1346</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>100 mm Borosilicate glass capillaries</td>
			<td>World Precision Instruments</td>
			<td>1B100-4</td>
			<td>Pull with needle puller to make fine point tip that allows a small stream of PBS to flow.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Disposable Transfer Pipets, Fine Tip</td>
			<td>Samco Scientific</td>
			<td>231</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Tubing dimensions given are inner diameter (ID) x outer diameter (OD) x wall thickness in inches</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PVC tubing (1/8 x 3/16 x 1/32)</td>
			<td>Nalgene</td>
			<td>8000-0010</td>
			<td rowspan="3">Use these with pulled needle to assemble the blower tube as shown in Figure 2.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tygon Silicone tubing (3/32 x 5/32 x 1/32)</td>
			<td>Saint Gobain Performance Plastics</td>
			<td>ABW00004</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tygon Silicone tubing (1/32 x 3/32 x 1/32)</td>
			<td>Saint Gobain Performance Plastics</td>
			<td>ABW00001</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

dissection and mounting of drosophila pupal eye discs

The Drosophila melanogaster eye disc is a powerful system that can be used to study many different biological processes. It contains approximately 800 separate eye units, termed ommatidia1. Each ommatidium contains eight neuronal photoreceptors that develop from undifferentiated cells following the passage of the morphogenetic furrow in the third larval instar2. Following the sequential differentiation of the photoreceptors, non-neuronal cells develop, including cone and pigment cells, along with mechanosensory bristle cells3. Final differentiation processes, including the structured arrangement of all the ommatidial cell types, programmed cell death of undifferentiated cell types and rhodopsin expression, occurs through the pupal phase4-7. This technique focuses on manipulating the pupal eye disc, providing insight and instruction on how to dissect the eye disc during the pupal phase, which is inherently more difficult to perform than the commonly dissected third instar eye disc. This technique also provides details on immunostaining to allow the visualization of various proteins and other cell components.

כדוגמא לשימוש בפרוטוקול זה, תוצאות ממחישות midpupal (42 שעות APF של 25 מעלות צלזיוס) דיסקי עין immunostained עם נוגדנים שונים מוצגים באיור 2. על ידי שימוש בנוגדן מכוון נגד שאריות phosphotyrosine, הקרום של התאים יכול להיות (איור 2 א) שנצפה. זה יכול לשמש כדי לזהות את ההסדר הקבוע של תאי o...

Watch this Scientific Journal Video about Dissection and Mounting of Drosophila Pupal Eye Discs at JoVE.com

Dissection and Mounting of Drosophila Pupal Eye Discs

The goal of this technique is to enable researchers to perform dissection, immunostaining and mounting of pupal eye discs from Drosophila melanogaster of any age.

נתיחה והתקנה<em&gt; דרוזופילה</em&gt; גלמי דיסקי העין

The Drosophila melanogaster eye disc is a powerful system that can be used to study many different biological processes.  It contains approximately 800 ...

dissection-and-mounting-of-drosophila-pupal-eye-discs

Research

JoVE Journal

Biology

Dissection and Mounting of Drosophila Pupal Eye Discs

12.0K Views.  University of California at Los Angeles (UCLA). The goal of this technique is to enable researchers to perform dissection, immunostaining and mounting of pupal eye discs from Drosophila melanogaster of any age.

Video: Dissection and Mounting of Drosophila Pupal Eye Discs

Dissection of Drosophila Ovaries

Dissection של תסיסנית השחלות

Dissection of Larval CNS in Drosophila Melanogaster

The central nervous system (CNS) of Drosophila larvae is complex and poorly understood.  One way to investigate the CNS is to use immunohistochemistry to examine the expression of various novel and marker proteins.  Staining of whole larvae is impractical because the tough cuticle prevents antibodies from penetrating inside the body cavity.  In order to stain these tissues it is necessary to dissect the animal prior to fixing and staining.  In this article we demonstrate how to dissect Drosophila larvae without damaging the CNS.  Begin by tearing the larva in half with a pair of fine forceps, and then turn the cuticle "inside-out" to expose the CNS.  If the dissection is performed carefully the CNS will remain attached to the cuticle.  We usually keep the CNS attached to the cuticle throughout the fixation and staining steps, and only completely remove the CNS from the cuticle just prior to mounting the samples on glass slides.  We also show some representative images of a larval CNS stained with Eve, a transcription factor expressed in a subset of neurons in the CNS.  The article concludes with a discussion of some of the practical uses of this technique and the potential difficulties that may arise.

In this article we demonstrate how to dissect the central nervous system from third instar Drosophila larvae.

Dissection של מערכת העצבים המרכזית הזחל ב תסיסנית melanogaster

The central nervous system (CNS) of Drosophila larvae is complex and poorly understood.  One way to investigate the CNS is to use immunohistochemistry to ...

Dissection of Imaginal Discs from 3rd Instar Drosophila Larvae

This protocol demonstrates the dissection technique used for isolating imaginal discs from drosophila larvae at the 3rd instar stage. Methods for fixing the tissue after saying and removing the wing, leg, and eye discs are demonstrated directly on a microscope slide for subsequent visualization.

Dissection של דיסקים דמותי מן הזחלים 3 תסיסנית Instar

Drosophila Larval NMJ Dissection

The Drosophila neuromuscular junction (NMJ) is an established model system used for the study of synaptic development and plasticity. The widespread use of the Drosophila motor system is due to its high accessibility. It can be analyzed with single-cell resolution. There are 30 muscles per hemisegment whose arrangement within the peripheral body wall are known. A total of 35 motor neurons attach to these muscles in a pattern that has high fidelity. Using molecular biology and genetics, one can create transgenic animals or mutants. Then, one can study the developmental consequences on the morphology and function of the NMJ. In order to access the NMJ for study, it is necessary to carefully dissect each larva. In this article we demonstrate how to properly dissect Drosophila larvae for study of the NMJ by removing all internal organs while leaving the body wall intact. This technique is suitable to prepare larvae for imaging, immunohistochemistry, or electrophysiology.

This protocol demonstrates how to dissect Drosophila larvae in preparation for immunohistochemistry and/or imaging of the neuromuscular junction.

תסיסנית הזחל Dissection NMJ

The Drosophila neuromuscular junction (NMJ) is an established model system used for the study of synaptic development and plasticity. The widespread use ...

Dissection and Staining of Drosophila Larval Ovaries

Many organs depend on stem cells for their development during embryogenesis and for maintenance or repair during adult life. Understanding how stem cells form, and how they interact with their environment is therefore crucial for understanding development, homeostasis and disease. The ovary of the fruit fly Drosophila melanogaster has served as an influential model for the interaction of germ line stem cells (GSCs) with their somatic support cells (niche) 1, 2. The known location of the niche and the GSCs, coupled to the ability to genetically manipulate them, has allowed researchers to elucidate a variety of interactions between stem cells and their niches 3-12.
Despite the wealth of information about mechanisms controlling GSC maintenance and differentiation, relatively little is known about how GSCs and their somatic niches form during development. About 18 somatic niches, whose cellular components include terminal filament and cap cells (Figure 1), form during the third larval instar 13-17. GSCs originate from primordial germ cells (PGCs). PGCs proliferate at early larval stages, but following the formation of the niche a subgroup of PGCs becomes GSCs 7, 16, 18, 19. Together, the somatic niche cells and the GSCs make a functional unit that produces eggs throughout the lifetime of the organism.
Many questions regarding the formation of the GSC unit remain unanswered. Processes such as coordination between precursor cells for niches and stem cell precursors, or the generation of asymmetry within PGCs as they become GSCs, can best be studied in the larva. However, a methodical study of larval ovary development is physically challenging. First, larval ovaries are small. Even at late larval stages they are only 100&mu;m across. In addition, the ovaries are transparent and are embedded in a white fat body. Here we describe a step-by-step protocol for isolating ovaries from late third instar (LL3) Drosophila larvae, followed by staining with fluorescent antibodies. We offer some technical solutions to problems such as locating the ovaries, staining and washing tissues that do not sink, and making sure that antibodies penetrate into the tissue. This protocol can be applied to earlier larval stages and to larval testes as well.

Dissection and Staining of Drosophila Larval Ovaries

How niches and stem cells form during development is an important question with practical implications. In the Drosophila ovary, germ line stem cells and their somatic niches form during larval development. This video demonstrates how to dissect, stain and mount female gonads from late third instar (LL3) Drosophila larvae.

Dissection ו מכתים של תסיסנית הזחל השחלות

Many organs depend on stem cells for their development during embryogenesis and for maintenance or repair during adult life. Understanding how stem cells ...

Drosophila Pupal Abdomen Immunohistochemistry

The Drosophila pupal abdomen is an established model system for the study of epithelial morphogenesis and the development of sexually dimorphic morphologies 1-3. During pupation, which spans approximately 96 hours (at 25 &deg;C), proliferating populations of imaginal cells replace the larval epidermis to generate the adult abdominal segments. These imaginal cells, born during embryogenesis, exist as lateral pairs of histoblast nests in each abdominal segment of the larvae. Four pairs of histoblast nests give rise to the adult dorsal cuticle (anterior and posterior dorsal nests), the ventral cuticle (ventral nests) and the spiracles associated with each segment (spiracle nests) 4. Upon puparation, these diploid cells (distinguishable by size from the larger polyploid larval epidermal cells- LECs) begin a stereotypical process of proliferation, migration and replacement of the LECs. Various molecular and genetic tools can be employed to investigate the contributions of genetic pathways involved in morphogenesis of the adult abdomen. Ultimate adult phenotypes are typically analyzed following dissection of adult abdominal cuticles. However, investigation of the underlying molecular processes requires immunohistochemical analyses of the pupal epithelium, which present unique challenges. Temporally dynamic morphogenesis and the interactions of two distinct epithelial populations (larval and imaginal) generate a fragile tissue prone to excessive cell loss during dissection and subsequent processing. We have developed methods of dissection, fixation, mounting and imaging of the Drosophila pupal abdominem epithelium for immunohistochemical studies that generate consistent high quality samples suitable for confocal or standard fluorescent microscopy.

Drosophila Pupal Abdomen Immunohistochemistry

Antibody staining of the Drosophila pupae can enhance genetic analyses of adult abdominal developmental genetics. We present our protocol for dissection, fixation and antibody staining of staged Drosophila pupal abdomen.

תסיסנית גלמי אימונוהיסטוכימיה בטן

The Drosophila pupal abdomen is an established model system for the study of epithelial morphogenesis and the development of sexually dimorphic ...

Imaging Through the Pupal Case of Drosophila melanogaster

The longstanding use of Drosophila as a model for cell and developmental biology has yielded an array of tools. Together, these techniques have enabled analysis of cell and developmental biology from a variety of methodological angles. Live imaging is an emerging method for observing dynamic cell processes, such as cell division or cell motility. Having isolated mutations in uncharacterized putative cell cycle proteins it became essential to observe mitosis in situ using live imaging. Most live imaging studies in Drosophila have focused on the embryonic stages that are accessible to manipulation and observation because of their small size and optical clarity. However, in these stages the cell cycle is unusual in that it lacks one or both of the gap phases. By contrast, cells of the pupal wing of Drosophila have a typical cell cycle and undergo a period of rapid mitosis spanning about 20 hr of pupal development. It is easy to identify and isolate pupae of the appropriate stage to catch mitosis in situ. Mounting intact pupae provided the best combination of tractability and durability during imaging, allowing experiments to run for several hours with minimal impact on cell and animal viability. The method allows observation of features as small as, or smaller than, fly chromosomes. Adjustment of microscope settings and the details of mounting, allowed extension of the preparation to visualize membrane dynamics of adjacent cells and fluorescently labeled proteins such as tubulin. This method works for all tested fluorescent proteins and can capture submicron scale features over a variety of time scales. While limited to the outer 20 &#181;m of the pupa with a conventional confocal microscope, this approach to observing protein and cellular dynamics in pupal tissues in vivo may be generally useful in the study of cell and developmental biology in these tissues.

Imaging Through the Pupal Case of Drosophila melanogaster

This paper demonstrates the use of a fast scanning confocal microscope to image cell behavior directly through the puparium. By leaving the pupal case intact, this method allows observation and measurement of dynamic cell processes at a stage of Drosophila development that is difficult to study directly.

הדמיה באמצעות המקרה גלמי של<em&gt; Melanogaster דרוזופילה</em

The longstanding use of Drosophila as a model for cell and developmental biology has yielded an array of tools. Together, these techniques have enabled ...

Dissection and Immunostaining of Imaginal Discs from Drosophila melanogaster

A significant portion of post-embryonic development in the fruit fly, Drosophila melanogaster, takes place within a set of sac-like structures called imaginal discs. These discs give rise to a high percentage of adult structures that are found within the adult fly. Here we describe a protocol that has been optimized to recover these discs and prepare them for analysis with antibodies, transcriptional reporters and protein traps. This procedure is best suited for thin tissues like imaginal discs, but can be easily modified for use with thicker tissues such as the larval brain and adult ovary. The written protocol and accompanying video will guide the reader/viewer through the dissection of third instar larvae, fixation of tissue, and treatment of imaginal discs with antibodies. The protocol can be used to dissect imaginal discs from younger first and second instar larvae as well. The advantage of this protocol is that it is relatively short and it has been optimized for the high quality preservation of the dissected tissue. Another advantage is that the fixation procedure that is employed works well with the overwhelming number of antibodies that recognize Drosophila proteins. In our experience, there is a very small number of sensitive antibodies that do not work well with this procedure. In these situations, the remedy appears to be to use an alternate fixation cocktail while continuing to follow the guidelines that we have set forth for the dissection steps and antibody incubations.

Dissection and Immunostaining of Imaginal Discs from Drosophila melanogaster

The adult structures of Drosophila are derived from sac-like structures called imaginal discs. Analysis of these discs provides insight into many developmental processes including tissue determination, compartment boundary establishment, cell proliferation, cell fate specification, and planar cell polarity. This protocol is used to prepare imaginal discs for light/fluorescent microscopy.

נתיחה וImmunostaining של דמותי דיסקים מ<em&gt; Melanogaster דרוזופילה</em

A significant portion of post-embryonic development in the fruit fly, Drosophila melanogaster, takes place within a set of sac-like structures called ...

Ex vivo Culture of Drosophila Pupal Testis and Single Male Germ-line Cysts: Dissection, Imaging, and Pharmacological Treatment

During spermatogenesis in mammals and in Drosophila melanogaster, male germ cells develop in a series of essential developmental processes. This includes differentiation from a stem cell population, mitotic amplification, and meiosis. In addition, post-meiotic germ cells undergo a dramatic morphological reshaping process as well as a global epigenetic reconfiguration of the germ line chromatin&#8212;the histone-to-protamine switch.
Studying the role of a protein in post-meiotic spermatogenesis using mutagenesis or other genetic tools is often impeded by essential embryonic, pre-meiotic, or meiotic functions of the protein under investigation. The post-meiotic phenotype of a mutant of such a protein could be obscured through an earlier developmental block, or the interpretation of the phenotype could be complicated. The model organism Drosophila melanogaster offers a bypass to this problem: intact testes and even cysts of germ cells dissected from early pupae are able to develop ex vivo in culture medium. Making use of such cultures allows microscopic imaging of living germ cells in testes and of germ-line cysts. Importantly, the cultivated testes and germ cells also become accessible to pharmacological inhibitors, thereby permitting manipulation of enzymatic functions during spermatogenesis, including post-meiotic stages.
The protocol presented describes how to dissect and cultivate pupal testes and germ-line cysts. Information on the development of pupal testes and culture conditions are provided alongside microscope imaging data of live testes and germ-line cysts in culture. We also describe a pharmacological assay to study post-meiotic spermatogenesis, exemplified by an assay targeting the histone-to-protamine switch using the histone acetyltransferase inhibitor anacardic acid. In principle, this cultivation method could be adapted to address many other research questions in pre- and post-meiotic spermatogenesis.

Ex vivo Culture of Drosophila Pupal Testis and Single Male Germ-line Cysts: Dissection, Imaging, and Pharmacological Treatment

This protocol describes the dissection and cultivation of intact testes and germ-line cysts from Drosophila melanogaster pupae. This method allows microscopic observation of spermatogenesis ex vivo. Furthermore, we describe a pharmacological assay of the effect of inhibitors on specific stages of germ-cell development in pupal testes.

אקס תרבות Vivo של דרוזופילה גלמי אשך וציסטות נבט אונליין רווק בן: Dissection, הדמיה, ותרופתי טיפול

During spermatogenesis in mammals and in Drosophila melanogaster, male germ cells develop in a series of essential developmental processes. This includes ...

Dissection and Flat-mounting of the Threespine Stickleback Branchial Skeleton

The posterior pharyngeal segments of the vertebrate head give rise to the branchial skeleton, the primary site of food processing in fish. The morphology of the fish branchial skeleton is matched to a species' diet. Threespine stickleback fish (Gasterosteus aculeatus) have emerged as a model system to study the genetic and developmental basis of evolved differences in a variety of traits. Marine populations of sticklebacks have repeatedly colonized countless new freshwater lakes and creeks. Adaptation to the new diet in these freshwater environments likely underlies a series of craniofacial changes that have evolved repeatedly in independently derived freshwater populations. These include three major patterning changes to the branchial skeleton: reductions in the number and length of gill raker bones, increases in pharyngeal tooth number, and increased branchial bone lengths. Here we describe a detailed protocol to dissect and flat-mount the internal branchial skeleton in threespine stickleback fish. Dissection of the entire three-dimensional branchial skeleton and mounting it flat into a largely two-dimensional prep allows for the easy visualization and quantification of branchial skeleton morphology. This dissection method is inexpensive, fast, relatively easy, and applicable to a wide variety of fish species. In sticklebacks, this efficient method allows the quantification of skeletal morphology in genetic crosses to map genomic regions controlling craniofacial patterning.

The branchial skeleton, including gill rakers, pharyngeal teeth, and branchial bones, serves as the primary site of food processing in most fish. Here we describe a protocol to dissect and flat-mount this internal skeleton in threespine sticklebacks. This method is also applicable to a variety of other fish species.

Dissection ו-הרכבה שטוחה של שלד Threespine קוצן branchial

The posterior pharyngeal segments of the vertebrate head give rise to the branchial skeleton, the primary site of food processing in fish. The morphology ...