הדמיה ATG9A, חלבון ממברנה רב-מורחב

במעבדה שלנו, אנו מעוניינים להבין אילו ליפידים ומכונות חלבון מעורבים בסחר בשלפוחיות ATG9A. ATG9A חיוני במסלול האוטופגיה להיווצרות והבשלה של פאגופורים. עם זאת, לאחרונה חקרנו את ההשפעה של ATG9A על הומאוסטזיס אברונים.

האתגר הגדול ביותר הוא לחשוף את הפרטים המולקולריים של האופן שבו חלבונים ומכונות חלבונים פועלים. טכנולוגיות כגון הנדסת חלבונים, המבוססות על AlphaFold ו- cryo-EM באתרו ברזולוציה גבוהה מספקות כיום את ההתקדמות הרבה ביותר. עבודת המעבדה שלי ביססה תובנה בסיסית לגבי האופן שבו נוצרים אוטופגוזומים.

תובנות אלה נתמכות על ידי טכניקות מתקדמות של ביולוגיה מולקולרית של התא כמו זו המתוארת כאן. אנו מתארים כמה חסרונות בשימוש בתגי חלבון מסוימים וכיצד ההתנהגות של ATG9A יכולה להשתנות בהתאם ללוקליזציה של התג. אז, או N או C-terminus.

אנו מציעים גם דרכים לזהות חסרונות אלה וכיצד להימנע מהם. מלבד זאת, אנו מספקים גם זרימת עבודה של כימות פיזור ATG9A באופן הניתן לשחזור. כאן, אנו מספקים זרימת עבודה מאימונופלואורסנציה והדמיה חיה לרכישת תמונה וניתוח לניתוח הפיזור של ATG9 בין תאים שונים.

ואנחנו כן חושבים שסטנדרטיזציה של צינורות לניתוח תמונות היא בראש סדר העדיפויות של ביולוגים של התא כדי שיוכלו להגדיל את האמינות ואת יכולת השחזור של התוצאות שלנו.