שיטות להפעלת תעתיק מרחבי של רקמות עצם

המטרה שלנו היא למצוא גישות טיפוליות טובות יותר לטיפול בסרטן עצם אנושי שנקרא אוסטאוסרקומה. לשם כך אנו רוצים לחשוף את התהליכים הביולוגיים האחראים להופעת הגידול הזה ובעיקר להתפתחות גרורותיו, שהיא מחיקת סיבת מותו של החולה. על ידי שימוש בניתוח שעתוק מרחבי על מספר דגימות תואמות של גרורות קו אוסטאוסרקומה ראשוניות אנושיות, איתרנו במספר אוכלוסיות תאים משותפים של חולים השוכנות בתוך אזורי הגידול, ועל ידי השוואה ביניהם, זיהינו מספר גנים מרכזיים שעשויים לייצג מטרות טיפוליות יקרות ערך למניעת גרורות ריאה.

ניתוח שעתוק מיוחד של רקמת לב, כגון עצם, היה מאתגר מאוד בגלל חוסר היכולת לשמר RNA באיכות טובה ומורפולוגיה של רקמות, ובמקביל לעבד את רקמת הלב לחתך. הפרוטוקול שלנו מטפל בפער זה, ומאפשר לחוקרים ליישם בהצלחה ניתוח שעתוק מיוחד גם על רקמות הלב.