אנו חוקרים את הדינמיקה המבנית של חלבונים באמצעות ספקטרוסקופיית NMR כדי להבין טוב יותר את הפונקציה המולקולרית. NMR מייצג ספקטרוסקופיית תהודה מגנטית גרעינית. היא מפחיתה את ההשפעה על כך שהספינים הגרעיניים של אטומי מימן יכולים לעבור בין שני מצבים שונים אנרגטית, לבין שדה מגנטי אוטומטי.
אנו יכולים להשתמש בספקטרוסקופיית NMR כדי לחקור את הדינמיקה המבנית של חלבונים בעלי אי-סדר פנימי. חלבונים אלה גמישים מאוד, משנים את צורתם ללא הרף, ולעתים קרובות מתקפלים למבנה יציב רק כאשר הם מתקשרים עם מולקולות אחרות. אנו משתמשים בניסויי הרפיה של NMR כדי לחקור כיצד עמוד השדרה של החלבון נע על פני סקאלות זמן קצרות מאוד, החל מפיקושניות ועד ננו-שניות, תוך התמקדות בכל שארית ספציפית לאורך שרשרת החלבון.
פרוטוקול זה ידריך אותך צעד אחר צעד בהגדרת ניסויי הרפיה של NMR על ספקטרומטר NMR המיועדים למדענים עם ידע NMR בסיסי, הוא מבטיח התקנה מהירה ומדויקת, ומציג מושגי מפתח בדינמיקה של עמוד השדרה של חלבונים בצורה נגישה. פרוטוקול זה הופך את רצפי פולסי ההרפיה של NMR לנגישים בקלות למדענים החוקרים דינמיקה של חלבונים. ניסויי הרפיה של NMR מספקים תובנות דינמיות ספציפיות לשאריות.
באמצעות גישה ניסיונית זו, ניתן להבין טוב יותר את דינמיקת עמוד השדרה בחלבונים, את ההשפעה של אינטראקציה חלבון-חלבון על דינמיקה מובנית, ושינויים מבניים בתגובה לשינויים סביבתיים.
