Nous étudions la dynamique structurale des protéines par spectroscopie RMN pour mieux comprendre la fonction moléculaire. RMN est l’abréviation de Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy. Il réduit l’effet que les spins nucléaires des atomes d’hydrogène peuvent passer entre deux états énergétiquement différents, et un champ magnétique automatique.
Nous pouvons utiliser la spectroscopie RMN pour étudier la dynamique structurale des protéines intrinsèquement désordonnées. Ces protéines sont très flexibles, changent constamment de forme et ne se replient souvent dans une structure stable que lorsqu’elles interagissent avec d’autres molécules. À l’aide d’expériences de relaxation RMN, nous étudions comment le squelette protéique se déplace sur des échelles de temps très courtes, allant de la picoseconde à la nanoseconde, tout en nous concentrant sur chaque résidu spécifique le long de la chaîne protéique.
Ce protocole vous guidera pas à pas dans la mise en place d’expériences de relaxation RMN sur un spectromètre RMN destiné aux scientifiques ayant des connaissances de base en RMN, il garantit une configuration rapide et précise et introduit les concepts clés de la dynamique du squelette des protéines de manière accessible. Ce protocole rend les séquences d’impulsions de relaxation RMN facilement accessibles aux scientifiques qui étudient la dynamique des protéines. Les expériences de relaxation RMN fournissent des informations dynamiques spécifiques aux résidus.
En utilisant cette approche expérimentale, vous pouvez mieux comprendre la dynamique du squelette dans les protéines, l’impact de l’interaction protéine-protéine sur la dynamique structurée et les changements structurels dans la réponse aux changements environnementaux.
