NMR ¹⁵N Релаксационные эксперименты для исследования пикосекундной и наносекундной структурной динамики белков

Мы исследуем структурную динамику белков с помощью ЯМР-спектроскопии, чтобы лучше понять молекулярную функцию. ЯМР расшифровывается как спектроскопия ядерного магнитного резонанса. Это уменьшает эффект, который ядерные спины атомов водорода могут переходить между двумя энергетически различными состояниями, а также автомагнитным полем.

Мы можем использовать ЯМР-спектроскопию для изучения структурной динамики внутренне неупорядоченных белков. Эти белки очень гибкие, постоянно меняют форму и часто сворачиваются в стабильную структуру только при взаимодействии с другими молекулами. Мы используем эксперименты по релаксации ЯМР, чтобы изучить, как белковый остов движется в очень коротких временных масштабах, от пикосекунд до наносекунд, фокусируясь на каждом конкретном остатке вдоль белковой цепи.

Этот протокол шаг за шагом проведет вас через постановку экспериментов по релаксации ЯМР на ЯМР-спектрометре, предназначенных для ученых с базовыми знаниями ЯМР, он обеспечивает быструю и точную настройку и знакомит с ключевыми концепциями динамики белковой магистрали в доступной форме. Этот протокол делает последовательности релаксационных импульсов ЯМР легко доступными для ученых, изучающих динамику белков. Эксперименты с релаксацией ЯМР позволяют получить динамические данные, специфичные для остатков.

Используя этот экспериментальный подход, можно лучше понять динамику скелета белков, влияние белок-белкового взаимодействия на структурированную динамику и структурные изменения в ответ на изменения окружающей среды.