Investigamos a dinâmica estrutural das proteínas por espectroscopia de RMN para entender melhor a função molecular. NMR significa Espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear. Reduz o efeito de que os spins nucleares dos átomos de hidrogênio podem fazer a transição entre dois estados energeticamente diferentes e um campo magnético automático.
Podemos usar a espectroscopia de RMN para estudar a dinâmica estrutural de proteínas intrinsecamente desordenadas. Essas proteínas são altamente flexíveis, mudam constantemente de forma e frequentemente só se dobram em uma estrutura estável quando interagem com outras moléculas. Usamos experimentos de relaxamento de RMN para estudar como a estrutura da proteína se move em escalas de tempo muito curtas, variando de picossegundos a nanossegundos, enquanto nos concentramos em cada resíduo específico ao longo da cadeia de proteínas.
Este protocolo irá guiá-lo passo a passo através da configuração de experimentos de relaxamento de RMN em um espectrômetro de RMN destinado a cientistas com conhecimento básico de RMN, garante uma configuração rápida e precisa e introduz conceitos-chave na dinâmica da espinha dorsal da proteína de forma acessível. Este protocolo torna as sequências de pulso de relaxamento de RMN facilmente acessíveis aos cientistas que estudam a dinâmica das proteínas. Os experimentos de relaxamento de RMN fornecem insights dinâmicos específicos do resíduo.
Usando essa abordagem experimental, você pode entender melhor a dinâmica da espinha dorsal nas proteínas, o impacto da interação proteína-proteína na dinâmica estruturada e as mudanças estruturais na resposta às mudanças ambientais.