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Qui si descrive la citotossicità cellulare e singoli saggi di infettività rotonde che consentono lo screening rapido e preciso dei composti di determinare la loro citotossicità cellulare (CC 50) e valori di IC 50 contro WT e resistente di HIV-1 farmaco.
Sebbene un certo numero di farmaci anti HIV sono stati approvati, ci sono ancora problemi con la tossicità e la resistenza ai farmaci. Ciò dimostra la necessità di individuare nuovi composti in grado di inibire l'infezione da parte resistente droga comuni ceppi HIV-1 con tossicità minima. Qui si descrive un dosaggio efficace che può essere utilizzato per determinare rapidamente la citotossicità e l'efficacia di un composto contro i ceppi WT e mutanti cellulare.
La linea cellulare porta è seminato in una piastra a 96 pozzetti e, dopo una incubazione 24 ore, vengono aggiunti serialmente diluizioni dei composti da testare. Nessun ulteriore manipolazioni sono necessarie per i test di citotossicità cellulare; per anti HIV saggi una quantità predeterminata di una o WT o farmaco resistente HIV-1 vettore che esprime luciferasi viene aggiunta alle cellule. La citotossicità viene misurata utilizzando un saggio dipende luminescenza ATP e l'impatto dei composti sulla infettività viene misurata determinando la quantità di lucifeRASE in presenza o assenza di inibitori putativi.
Questo test di screening richiede quattro giorni per completare e composti multipli può essere proiettato in parallelo. I composti vengono proiettati in triplicato ei dati sono normalizzati ai livelli infettività / ATP in assenza di composti bersaglio. Questa tecnica fornisce una misurazione rapida e precisa della efficacia e la tossicità di potenziali composti anti-HIV.
La disponibilità di farmaci mirati diversi passaggi essenziali nella HIV-1 ciclo di vita virale ha portato alla terapia di combinazione farmaco (chiamato terapia altamente attiva antiretrovirale, o HAART), che ha notevolmente migliorato il trattamento delle infezioni da HIV-1, e la sopravvivenza a lungo termine dei pazienti. HAART, che utilizza tipicamente combinazioni di due nucleosidico della trascrittasi inversa (RT) e inibitori sia un inibitore della proteasi o un inibitore non nucleosidico RT, ha convertito una malattia mortale in una condizione di vita lunga 1-5. Tuttavia, nonostante i molti successi di HAART in soppressione sostenuta della replicazione virale, ma ha dei limiti. HAART non sradicare l'HIV, in modo che i pazienti non vengono curati e la terapia è lunga vita. Ci sono problemi con la tossicità della droga e con l'emergere di ceppi resistenti ai farmaci. La resistenza può nascere a tutti i farmaci anti-HIV approvati, tra cui i farmaci recentemente approvati che mirano HIV integrasi (IN). La resistenza ai farmaci probabilmente deriva Becauso di mutazioni spontanee che si verificano durante la replicazione virale (tasso di errore di 3 x 10 -5 ciclo mutazioni / base / replica) 6. Quando sorgono mutazioni nei geni che codificano per i bersagli di farmaci anti-retrovirali, un piccolo sottoinsieme di queste mutazioni porterà ad una riduzione di sensibilità del ceppo virale ai farmaci. Per evitare lo sviluppo di resistenza ai farmaci, le concentrazioni del farmaco devono essere mantenuti a livelli che sopprimono completamente replicazione dell'HIV. Scarsa aderenza al regime terapeutico aggrava il problema, e può portare al rapido sviluppo di resistenza 7-9. Anche se concentrazioni di farmaco possono variare in pazienti a causa di assorbimento differenti, il metabolismo, la distribuzione ei livelli di escrezione, elevate concentrazioni di droga possono portare a tossicità 10. Poiché la terapia continua per la vita del paziente, esistono gravi problemi di sicurezza circa la tossicità a lungo termine di anti antiretrovirali. Gli anti-retrovirali comunemente usati in HAART possono avere effetti negativi and ci sono stati episodi in cui gli effetti collaterali sono stati in pericolo di vita 11-15. I problemi riscontrati pazienti con lo sviluppo di resistenza e tossicità alla base della necessità di sviluppare nuovi farmaci che bloccano efficacemente la replicazione dei ceppi resistenti al farmaco comuni del virus con poca o nessuna tossicità a lungo termine.
Pertanto, vi è la necessità di un metodo che può schermo per i composti che bloccano fasi essenziali del ciclo vitale del virus rapidamente. Qui si descrive un dosaggio efficace che può essere utilizzato per valutare la citotossicità di composti e la loro capacità di bloccare rapidamente ed efficacemente la replicazione di entrambi WT e ceppi di HIV resistenti ai farmaci. Il test utilizzato è simile a un saggio che è stato sviluppato per lo screening farmacoresistenza in virus isolato da pazienti 16-18.
Anche se il dosaggio può essere utilizzato senza modifiche per schermo per i composti che possono bloccare la trascrizione inversa dell'HIV, noi descrIBE utilizzando il test per valutare IN inibitori. IN è un enzima virale essenziale che inserisce il DNA virale nel genoma cellulare 19. Anche se si stanno sviluppando una serie di promettenti inibitori, alcuni dei quali sono attualmente in fase di sperimentazione clinica, solo Isentress 20, 21 (noto anche come raltegravir o RAL) e, più recentemente, Elvitegravir (EVG) 22 e dolutegravir (DTG) 23 sono stati approvato dalla FDA. Questi composti sono attivi contro l'HIV B e sottotipi non B in coltura cellulare e nei pazienti 24, 25. Tuttavia, il trattamento con RAL seleziona per farmaco-resistente di HIV-1 IN mutanti, tra cui Y143R, N155H, e G140S/Q148H 24, 26-31. N155H e G140S/Q148H anche ridurre l'efficacia di EVG, che sottolinea la necessità di progettare e sviluppare seconda generazione IN Inibitori di trasferimento del filamento (INSTIs) che sono efficaci contro queste mutazioni di resistenza.
1. Preparazione di titoli di Master
2. Preparazione delle piastre con 96 pozzetti per Compound Screening
3. Generazione di riserve di virus
Produrre VSV-g-pseudotyped HIV trasfettando cellule 293 (come mostrato in Figura 1, fase 1) 32-34.
4. Composto screening in piastre con 96 pozzetti
Schermo ciascun composto in triplice copia e media i risultati.
Nota: l'effetto di ciascun composto sulla replicazione virale viene corretto normalizzando il livello di replicazione ottenuto in assenza di qualsiasi composto.
5. Preparazione e misurazione della citotossicità ed infettività in piastre con 96 pozzetti
6. Determinazione del CC 50 e IC 50 valori per Composti
Se il test (Figura 1, punti 1 e 2) è stata eseguita con successo, allora i valori luciferasi dovrebbero somigliare i dati presentati nella tabella 2 Eseguire la scansione di tutti i range di concentrazione.; un composto potenzialmente potente rivelerà aumentando l'attività luciferasi da sinistra a destra, e il controllo deve avere la più alta attività luciferasi. Se l'attività luciferasi non superi 0,1 Unità luciferasi relative (RLU) su tutta la gamma di concentrazione, questo di solito indica che il composto ha ucciso le cellule. Se i dati luciferasi è maggiore o uguale a 2,0 RLU in tutte le diluizioni seriali, poi i composti non erano in grado di inibire HIV-1 infezioni alle concentrazioni testate.
Tracciando la concentrazione dei composti contro la percentuale di inibizione di attività di luciferasi in Kaleidagraph (Tabella 3, parte A), dopo l'esecuzione di analisi di regressione lineare, produrrà risultati simili a t tubo mostrato in tabella 3, parte B.
Figura 1. Preparazione di HIV-1 Stocks virali e l'installazione di citotossicità cellulare e Single-round infettività saggi. Nella fase 1, cellule 293T sono trasfettate con pNL4.3ΔEnv.LUC e VSV-G ed incubato per 48 ore per produrre virus 34 . Il virus viene raccolto e conservato (congelato a -80 ° C in aliquote) finché non viene utilizzato nei saggi di infettività. Per il passaggio 2, cellule HOS vengono seminate in una piastra a 96 pozzetti e incubate per 24 ore. Le cellule sono poi pre-incubate con diluizioni seriali dei composti da testare per 3 ore e poi infettati con il virus (sia WT o resistenti ai farmaci). Dopo una incubazione 48 ore, l'attività della luciferasi è misurata.
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Tabella 1. Drug Screening Serial diluizione Prototype. Uno screening più rigoroso coinvolge 11 diluizioni seriali che in genere partono da 10 micron e finiscono a 0,0005 micron. Le diluizioni seriali sono preparati 10x; ci sono 100 microlitri di cellule e 100 ml di virus in ogni pozzetto). A questo volume e seguendo questi calcoli, le diluizioni seriali saranno sufficienti per 3 righe di un'intera piastra a 96 pozzetti. I saggi di citotossicità sono preparati allo stesso modo; tuttavia le diluizioni seriali 11 partono da 250 micron e terminano a 0.05 micron. Solo 11 ml delle diluizioni sono aggiunti ai pozzetti nella piastra che contengono 100 ml di cellule. Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa cifra.
Tabella 2. Luciferasi Lettura segnale dati e Determinazione della percentuale di inibizione di attività luciferasi. La tabella dati mostra un tipico insieme di dati luciferasi per un composto successo. La tabella mostra inoltre i calcoli aggiuntivi necessari per determinare la percentuale di inibizione dell'attività di luciferasi e il CC 50 e IC 50 valori. Cliccare qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Tabella 3. Linear Regression Analysis Tabella dati. Parte A. Graficamente la gamma di concentrazione utilizzata contro la percentuale di inibizione di attività di luciferasi in Kaleidagraph produrrà le relative curve di inibizione. Parte B, Le curve di inibizione sono definiti dalla 3 parametricofunzione sigmoidale e in forma di dati mediante regressione lineare analisi 18. Questa tabella dati viene quindi utilizzato in combinazione con Microsoft Excel per calcolare le concentrazioni di farmaco necessarie per inibire l'integrazione virus e citotossicità cellulare del 50%, ad esempio, IC 50 e CC 50. Cliccare qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Descriviamo un saggio rapido, efficiente e riproducibile che può essere utilizzato per composti schermo di citotossicità e per la loro capacità di inibire la replicazione del WT e resistente HIV-1 farmaco. La capacità di identificare rapidamente i composti e testare la loro efficacia e la citotossicità è cruciale nello sviluppo di farmaci nuovi e migliorati contro HIV-1. Una volta composti di piombo sono identificati, analoghi del composto guida possono essere prodotti e testati utilizzando lo stesso dosaggio. Il saggio è relativamente semplice. Ci sono entrambi i controlli positivi e negativi che consentono all'utente di diagnosticare i problemi più comuni (composti tossici, problemi con il vettore stock). L'uso di un insieme triplicato di pozzetti senza composto aggiunto indica che si è verificato l'infezione virale. Il fatto che la citotossicità è misurata in un saggio indipendente misinterpreting evita una riduzione della luciferasi citotossicità causata da un effetto specifico sulla replicazione virale.
I passaggi criticinel protocollo si preparano le piastre in modo che le cellule sono distribuiti uniformemente nei pozzetti, che i pozzetti hanno le concentrazioni appropriate dei composti da testare, aggiungendo la stessa quantità di virus a ciascuno dei pozzetti, e misurando l'attività di luciferasi per determinare il CC 50 e IC 50 valori.
Il saggio è sicuro, quantitativa e riproducibile. Il saggio è sicuro perché il vettore è la replica difettoso. Il saggio è quantitativa e riproducibile perché si basa su un singolo vettore rotonda che esprime la luciferasi, che può essere saggiata esattamente e convenientemente. In un round saggio più replicazione del virus, la misurata IC 50 dipende dal numero di cicli di vita virali; questo è un problema particolare quando i saggi coinvolgono sia WT e virus resistenti ai farmaci che potrebbero avere le capacità di replica significativamente diversi.
Ci sono stati diversi saggi enzimatici riferito in precedenza che possonoessere utilizzato per lo screening per gli inibitori IN. I saggi che coinvolgono tecnologia PCR real time per misurare il DNA integrato richiedono proteine ricombinanti purificate (s), e sono, in generale, sia più laborioso e costoso, 36, 37. Sebbene sia possibile utilizzare saggi enzimatici per misurare l'impatto dei composti sugli altri enzimi virali (RT e proteasi), ciascun enzima richiede un proprio sistema di dosaggio. L'unico test vettore rotonda, come descritto, può essere utilizzato, senza modifiche, per lo screening inibitori della RT. Un test simile può essere usato per individuare inibitori di proteasi; Tuttavia, in un saggio di inibitore della proteasi, i composti devono essere aggiunti alle cellule usate per produrre i vettori. Un saggio correlate, utilizzando cellule e vettori differenti, può anche essere usato per individuare busta (env) e inibitori entrata fusione HIV. Infine, il test può essere utilizzato, in scala ingrandita, con dispensatori robotici automatizzati. Così, il saggio può essere utilizzato per lo screening di grandi librerie di composti contro WT e mutant HIV. Tuttavia, il fatto che il test in grado di rilevare un inibitore della replicazione dell'HIV che agisce in diverse fasi del virali punti del ciclo di vita di una limitazione nell'interpretazione dei dati. Di per sé il saggio non definisce la fase del ciclo di vita è bloccato da un composto. Se si pone questa domanda, può essere risolto utilizzando il tempo di saggi di addizione 38, e testando il composto contro le proteine virali ricombinanti purificate.
Purtroppo, nonostante il successo di farmaci anti HIV, vi sono ancora problemi sia con resistenza e tossicità. In assenza di un vaccino efficace contro l'HIV, è necessario non solo per sviluppare nuovi farmaci terapeutici che saranno efficaci contro i mutanti resistenti ai farmaci esistenti, ma anche per sviluppare farmaci profilattici che possono ridurre la diffusione del virus. Se l'uso profilattico di farmaci anti-HIV incudes il trattamento delle persone infette, questo approccio un onere speciale sullo sviluppo di farmaci che hanno little o nessuna tossicità a lungo termine.
Gli autori hanno nulla da rivelare.
Questa ricerca è stata sostenuta dal programma di ricerca intramurale del NSC.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
DMSO | Sigma | D2650 | |
DMEM | Corning Cellgro | 10-017 | |
ATPlite Luminescence ATP Detection Assay System | Perkin Elmer | 6016941 | |
Steady Lite Plus High Sensitivity Luminescence Reporter Gene Assay System | Perkin Elmer | 6016751 | |
Dulbecco's PBS | Gibco-Life Technologies-Invitrogen | 14190-136 | |
SpectraMax Gemini EM | Molecular Devices | ||
KaleidaGraph | Synergy Software | ||
Nunc F96 Microwell White Polystyrene Plate | Thomas Scientific | 12-566-26 | |
Eppendorf Thermomixer Compact | Sigma Aldrich | T1442-1EA | |
Turbo DNase | Ambion-Life Technologies-Invitrogen | AM2238 | |
Millex HA Filter Unit, 0.45 µM | Millipore | SLAHA033SS | |
Alliance HIV-1 p24 Elisa Kit | Perkin Elmer | NEK050B001KT | |
HOS cells | ATCC | CRL-1543 | |
TZM-bl cells | NIH AIDS Reagent Program | 8129 | |
pNL4.3ΔEnv.LUC | NIH-NCI HIV Drug Resistance Program- Hughes Lab | ||
VSV-G | NIH-NCI HIV Drug Resistance Program- Hughes Lab | ||
SoftMax Pro | Molecular Devices | 0200-310 |
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