Questo lavoro è stato sostenuto dal Dipartimento della Pubblica Istruzione attraverso l&#39;assistenza Laurea in Aree di programma di fabbisogno nazionale (P200A100044).

Attenzione: Questo protocollo richiede una formazione adeguata per l&#39;uso e la manipolazione di materiali radioattivi. Si prega di utilizzare il dispositivo di protezione individuale richiesto durante l&#39;esecuzione di questo test, tra cui schermatura contro le radiazioni beta. I rifiuti radioattivi deve essere maneggiato con cura, come i grandi volumi di rifiuti sono generati durante la fase di lavaggio dell&#39;esperimento. Assicurarsi che la rifiuti sono stoccati in un contenitore in posizione verticale, come un grande secchio o una bottiglia che non sarà facilmente rovesciato o fuoriuscita. Una volta che l&#39;esperimento è concluso, trasferire accuratamente tutti i rifiuti liquidi ad segnato in modo appropriato contenitori per rifiuti radioattivi. Manipolare tutti i materiali con cura, e mantenere un contatore Geiger vicino per monitorare l&#39;area di lavoro per la contaminazione. NOTA: Questo protocollo è una versione rivista di un saggio riportato in precedenza dal nostro gruppo. 15 stabilità Phosphohistidine in H 3 PO 4 dovrebbe essere testato per qualsiasi istidina chinasi non caratterizzato prima di utilizzare questo metodo. Il phosphohistidine sttest di abilità è stato descritto in precedenza. 15 Un controllo negativo che non contiene chinasi deve essere incluso. Ciò è necessario per sottrarre il segnale di fondo da ogni campione e assicurarsi che [γ- 32 P] -ATP è sufficientemente lavato dalla membrana. 1. Preparazione dei reagenti e materiali <ol><li> Purificare chinasi istidina dalla coltura batterica prima di utilizzare questo test. <ol><li> Purificare una chinasi istidina (gene ID 1.189.383) da Vibrio parahaemolyticus (EB101, ATCC 17802) per lo sviluppo di questo test. Clonare il chinasi in vettore di espressione pET-23aHis-TEV con NdeI e siti di restrizione XhoI, ed effettuare mutagenesi sito-diretta per produrre il mutante costruire Vp1876 D499A. </li><li> Trasformare il plasmide in E. coli BL21 (DE3) pLysS, e far crescere le cellule in mezzi TB a 37 ° C. culture integrare con ampicillina (100 mg / ml) e cloramfenicolo (34 mg / ml), e crescere con l&#39;agitazione(250 rpm) ad una OD 600 di 0,6. </li><li> Indurre l&#39;espressione della proteina con IPTG ad una concentrazione finale di 25 micron, e far crescere le culture per una notte a 16 ° C. Celle di raccolta per centrifugazione (5000 x g), Lyse per sonicazione, e centrifugare per rimuovere i detriti cellulari (18.000 xg). </li><li> Purificare la chinasi His-tag utilizzando Ni-NTA agarosio. Confermare la purezza mediante SDS-PAGE. Ottimizzare la purificazione per ogni proteina, e confermare la purezza prima di utilizzare questo test. </li></ol></li><li> Preparare la mm H 3 PO 4 soluzione di lavaggio 25. Per 1 L di acqua deionizzata distillata, aggiungere H 3 PO 4 ad una concentrazione finale di 25 mM. Il pH di tale soluzione è circa 2,0. Posizionare 25 mM H 3 PO 4 su ghiaccio. </li><li> Preparare una soluzione 13x magazzino di 325 mm H 3 PO 4, da utilizzare per estinguere reazione chinasi. Il pH di tale soluzione è circa 1,5. Mettere 325 mm H 3 PO 4 sul ghiaccio. NOTA: H 3 PO 4 </sub&gt; Ad una concentrazione finale di 25 mM quenches sufficientemente la reazione, e aiuta anche a bloccare fosfato radiomarcato non associato ad istidina di legarsi alla membrana di nitrocellulosa. </li><li> Preparare una soluzione tampone di reazione 4x madre contenente 160 mM Tris-HCl pH 8.0, 600 mm KCl, 16 mM MgCl 2, e il 40% di glicerolo. </li><li> Quantificare istidina chinasi concentrazione di proteine con metodi stabiliti di concentrazione (Bradford, UV-Vis, etc.). 16,17 Preparare una soluzione istidina chinasi con una concentrazione che è 4 volte la concentrazione finale desiderata. Per ottenere adeguato segnale, la concentrazione proteica finale nella reazione dovrebbe essere idealmente almeno 5 micron. </li><li> Preparare una radiomarcato 4x [γ- 32 P] -ATP soluzione con la concentrazione 4x adeguata di ATP senza etichetta e l&#39;etichetta: il rapporto senza etichetta per l&#39;esperimento. NOTA: La quantità di [γ- 32 P] -ATP che dovrebbe essere incluso in questo mix dipende da quanto [^7; - 32 P] -ATP in ultima analisi, essere individuato per ogni reazione. Abbiamo ottenuto segnale adeguata, con concentrazioni finali comprese tra 0,1-5 uCi per reazione. È importante che l&#39;etichetta: senza etichetta rapporto ATP essere mantenuta costante per tutte le reazioni in un dato esperimento. diluizioni seriali devono essere effettuate quando più concentrazioni di ATP sono desiderati, in quanto questo e mantenere il etichettato: senza etichetta costante il rapporto ATP in tutte le concentrazioni. Le concentrazioni di ATP finali in genere varia da 10 micron a almeno 1 mm, e ogni concentrazione devono essere analizzati in triplice copia per ottenere dati cinetici affidabili. </li><li> 96- apparato ben Dot Blot <ol><li> Tagliare un pezzo x 12 cm 8 cm di membrana di nitrocellulosa (dimensione dei pori 0,2 micron). </li><li> Posizione nitrocellulosa in un apparato dot blot, assicurando che la membrana si adatta in modo tale che l&#39;apparecchio è sigillato, e tutti i pozzetti sono completamente coperta dalla membrana. Se montato correttamente, non ci dovrebbero essere perdite d&#39;aria quando il vuoto è applied. </li><li> Per raccogliere filtrato, collegare l&#39;apparecchio a un pallone braccio laterale secondario. Dal stelo della valvola, collegare il tubo adeguata in modo tale che il dispositivo può essere utilizzato comodamente senza ribaltare il matraccio secondario. </li><li> Collegare il pallone braccio laterale secondario per fonte di aspirazione / vuoto. </li><li> Prova che l&#39;apparecchio è completamente sigillato applicando vuoto per l&#39;apparato. Se l&#39;apparato viene montato correttamente, una forte depressione sarà presente in tutti i pozzetti. Tutti i collegamenti dei tubi possono essere avvolti in Parafilm o Saran Wrap per garantire una perfetta tenuta. </li><li> Facoltativamente, per testare il vuoto, pipetta 100 microlitri di tampone di reazione in un pozzetto. Il vuoto dovrebbe essere abbastanza forte per disegnare tutto il liquido attraverso il pozzo e sulla membrana. </li><li> Spegnere il vuoto fino a quando tutti i campioni sono pronti per essere individuati sulla membrana. </li></ol></li></ol> 2. Reazione Iniziazione e Tempra <ol><li> Miscelazione dei componenti di reazione <ol><li> Prima di initizione, preparare tutti i quattro componenti della reazione come soluzioni madre 4x: tampone di reazione (vedere paragrafo 1.4), istidina chinasi (1.5), [γ- 32 P] -ATP (1.6), e DDH 2 O. </li><li> Miscelare uguali volumi di tampone di reazione, istidina chinasi, e DDH 2 O. Lasciare questi componenti di reazione equilibrare a temperatura ambiente per un breve periodo (10 min). NOTA: Il volume finale di reazione dipende dal fatto che l&#39;esperimento è dipendente dal tempo, l&#39;enzima-dipendente, o substrato-dipendente. reazioni dipendenti dal tempo devono essere più grandi, come più aliquote sono prese dalla stessa reazione e raffreddati al punto di tempo desiderato. Il volume di reazione dipenderà dal numero di punti di tempo desiderati. Il test è ottimizzato per ciascuna macchia sulla membrana di nitrocellulosa per contenere 30 microlitri della reazione. Così, se 10 punti di tempo sono desiderati, il volume di reazione deve essere di almeno 300 ml (un volume superiore come 330 microlitri sarebbe preferibile nel caso di eventuali errori di pipettamento).Enzima e gli esperimenti substrato-dipendente richiedono volumi di reazione più piccoli. Il volume di reazione per questi esperimenti può essere piccolo come 30 microlitri, in quanto questo è il volume finale che sarà depositata su membrana di nitrocellulosa. </li><li> Per iniziare la reazione, aggiungere un volume della soluzione [γ- 32 P] -ATP alla reazione e mescolare pipettando su e giù. Traccia tempo di reazione trascorso con un timer e lasciare che la reazione di procedere per il tempo desiderato. </li><li> Per spegnere la reazione, aggiungere 1/13 del volume di reazione totale di ghiacciata 325 mM H 3 PO 4 alla reazione e mescolare pipettando su e giù. In alternativa, aggiungere una aliquota della reazione a 325 mM H 3 PO 4. NOTA: La concentrazione finale di H 3 PO 4 dovrebbe essere di 25 mM per placare sufficientemente la reazione. Ad esempio, aggiungere 2,5 microlitri 325 mm H 3 PO 4 a 30 microlitri di reazione, oppure aggiungere 30 microlitri di reazione a 2,5 microlitri 325 mm H 3 PO &lt;sub&gt; 4. Il pH finale della reazione è di circa 4,0. Questa concentrazione di H 3 PO 4 è stato testato e confermato per placare la reazione della chinasi in questo buffer senza degradare phosphohistidine. <ol><li> Ad esempio, mescolare 7,5 microlitri di buffer 4x reazione, 7,5 microlitri 4x istidina chinasi, e 7,5 ml DDH 2 O. Iniziato reazione con 7,5 ml [γ- 32 P] -ATP. Placare la reazione con 2,5 microlitri 325 mm H 3 PO 4. </li></ol></li><li> Porre immediatamente reazioni bonificati sul ghiaccio fino a quando tutte le reazioni sono stati terminati. NOTA: Per massimizzare l&#39;efficienza, si consiglia di avviare una reazione ogni 15 o 20 s fino a tutte le reazioni sono iniziati, e una volta che il tempo di reazione desiderata è passato, placare una reazione ogni 15 o 20 s fino a quando tutti sono state spente. Per coloro che utilizzano il test per la prima volta, un intervallo più lungo può essere più gestibile. </li></ol></li></ol> 3. Spotting oReazioni f bonificati di nitrocellulosa <ol><li> Inizia vuoto su 96 pozzetti apparato macchia dot <ol><li> Mettere l&#39;apparato preassemblato 96 pozzetti macchia punto (sezione 1.7) in un contenitore secondario. Questo contenitore deve essere abbastanza grande per l&#39;apparato di essere facilmente smontabile, come l&#39;apparato e la membrana sarà radioattivi dopo l&#39;uso. </li><li> Applicare il vuoto all&#39;apparato 96 pozzetti macchia punti. </li><li> Una volta che l&#39;apparato è sotto vuoto, pipettare attentamente la reazione bonificato direttamente sulla membrana di nitrocellulosa in ciascun pozzetto. Ripetere fino a quando tutte le reazioni sono caricati sulla membrana. Poiché la capacità di legame di nitrocellulosa (75 - 110 mg / cm 2) è maggiore della quantità di istidina chinasi che è individuato, si può presumere che quasi tutti chinasi si lega alla membrana quando caricato correttamente. NOTA: A seconda dello strumento utilizzato, bisogna fare attenzione a non forare la nitrocellulosa. Si osservi che tutti la reazione ha preso contatto con the nitrocellulosa. È facile per alcuni o tutti la reazione al bastone alle pareti del pozzo, e non raggiungono la nitrocellulosa. </li><li> Lavare i pozzetti con 100 ml di ghiacciata 25 mm H 3 PO 4. Ciò consentirà qualsiasi volume di reazione che può essere stato intrappolato nel pozzo per raggiungere la membrana, garantendo carico completo di tutte le reazioni. Consentire l&#39;intero volume di fluire attraverso la membrana. </li></ol></li><li> lo smontaggio e trasferimento Apparato membrana di nitrocellulosa <ol><li> Disassemblare con cura l&#39;apparato prima di spegnere il vuoto. Occorre considerare che sia l&#39;apparato e la membrana di nitrocellulosa sono radioattivi in ​​questo momento. Non rimuovere i componenti dell&#39;apparato dal contenitore secondario in questo momento. </li><li> Con pinze, trasferire accuratamente la membrana di nitrocellulosa dall&#39;apparato ad un contenitore di 200 ml circa 25 mM ghiacciato H 3 PO 4. Mettere un coperchio su questo contenitore, come il lavaggio sarà radioactive. In questo momento, il vuoto può essere spento. </li></ol></li></ol> 4. nitrocellulosa Processing <ol><li> nitrocellulosa lavaggio <ol><li> Posizionare il contenitore con la membrana lavaggio su un bilanciere. Lasciare la membrana al rock delicatamente per 20 min. </li><li> Dopo 20 min, con attenzione decantare la soluzione di lavaggio utilizzato in un grande secchio da utilizzare per lo stoccaggio temporaneo dei rifiuti. Aggiungere 200 ml di ghiacciata 25 mm H 3 PO 4 alla membrana e ripetere. NOTA: Almeno sono necessari per rimuovere lo sfondo [γ- 32 P] segnale -ATP dalla membrana tre 20 min lavaggi. Dopo il terzo lavaggio, testare la soluzione di lavaggio utilizzato per la radiazione con un contatore Geiger. Continuare lavare la membrana come descritto sopra finché nessun segnale è presente nella soluzione di lavaggio. </li></ol></li><li> nitrocellulosa essiccazione <ol><li> Dopo la membrana è sufficientemente lavato, consentire la membrana all&#39;aria brevemente secca. Questo richiede in genere 5 minuti o meno.</li></ol></li></ol> 5. L&#39;esposizione a bagagli Phosphor schermo Nota: Questa sezione è facoltativa. Esponendo la membrana ad uno schermo al fosforo è vantaggiosa in quanto consente la visualizzazione dell&#39;intensità della chinasi radiomarcato in ogni punto sulla membrana. L&#39;intensità relativa di questi punti è direttamente proporzionale alla quantità di fosforilata istidina chinasi in ogni punto. L&#39;intensità può essere quantificata con un software di elaborazione delle immagini, e questi risultati può essere paragonato a quelli generati dalla sezione 7. Inoltre, questo passaggio consente un controllo di qualità. Anomalie visto in questa scansione potrebbero spiegare i risultati irregolari ottenuti dal conteggio a scintillazione. <ol><li> Preparazione schermo al fosforo <ol><li> Prima di esporre la membrana allo schermo di fosfori stoccaggio, esporre lo schermo al fosforo per luce bianca per almeno 5 minuti. Questo assicura che qualsiasi immagine residua che può essere tenuto dallo schermo viene cancellata. </li><li> Assicurarsi che lo schermo sia pulitoed asciutto. Se necessario, pulire delicatamente lo schermo con una soluzione di pulizia schermo al fosforo approvato dal produttore di schermi, e asciugare. </li></ol></li><li> preparazione membrana di nitrocellulosa <ol><li> spostare con attenzione la membrana di nitrocellulosa secca in un involucro di plastica sottile per evitare che l&#39;umidità residua da danneggiare lo schermo al fosforo. Assicurarsi che non vi siano grinze o bolle. </li></ol></li><li> L&#39;esposizione a schermo al fosforo <ol><li> Posizionare la membrana di nitrocellulosa avvolto nella schermata di cassette di archiviazione al fosforo, posizionare lo schermo a faccia in giù sulla membrana, e chiudere la cassetta. Non aprire la cassetta o spostare la membrana fino a quando è il momento di eseguire la scansione del schermo al fosforo, come lo spostamento della membrana durante l&#39;esposizione causerà una doppia immagine o macchiata da catturare. </li><li> Esporre per almeno 4 ore, o fino a quando il produttore schermo al fosforo suggerisce. </li><li> Dopo esposizione è stata completata, la scansione dello schermo fosforo e catturare l&#39;immagine con uno scanner fosforo. </li></ol></li></ol> 6. Preparazione nitrocellulosa a membrana per il conteggio a scintillazione <ol><li> Ponceau S colorazione e decolorazione <ol><li> Brevemente immergere la membrana di nitrocellulosa in soluzione colorante Ponceau S (0,1% Ponceau S (w / v) in 5% di acido acetico) per 1 - 2 min. Bagnare tutta la membrana con la macchia prima decolorazione. </li><li> Decantare eccesso Ponceau S dalla membrana. </li><li> Sciacquare la membrana con DDH 2 O fino a quando solo le macchie dalla chinasi istidina sono macchiati. Si noti che questa procedura funziona solo se tutti i punti contengono quantità rilevabili di proteine. NOTA: Questo passaggio è necessario confermare che la chinasi è legato alla nitrocellulosa, e che la proteina caricamento è ancora in tutti i punti. Consente inoltre chinasi maculato di essere facilmente tagliato fuori dalla membrana. </li></ol></li><li> Taglio macchie <ol><li> Utilizzando le forbici, tagliare ogni punto sulla membrana di nitrocellulosa. Non è necessario tagliare perfettamente along il bordo della macchia macchiato; se la membrana viene lavata sufficientemente, fondo dovuto al variare dimensioni delle macchie ritagliate sarà trascurabile. E &#39;importante solo per tagliare il posto intero per ogni reazione. </li><li> Utilizzando pinze, trasferire accuratamente ogni punto in fiale di scintillazione. No scintillazione cocktail è necessario in quanto il 32 P è facilmente rilevabile dalla radiazione Cherenkov. NOTA: In alternativa, il punto può essere tagliato utilizzando una sonda di carotaggio affilato. Rimuovere ogni punto dalla nitrocellulosa con la sonda di carotaggio, e spingerla in una fiala di scintillazione con uno spillo. Con questo metodo, la membrana non deve essere toccato, riducendo ulteriormente l&#39;esposizione alle radiazioni. </li></ol></li><li> Determinazione CPM / pmol di [γ- 32 P] -ATP soluzione <ol><li> Spot diverse diluizioni di [γ- 32 P] -ATP soluzione (paragrafo 1.5) sul 1 cm x 1 cm quadrati di nitrocellulosa. asciugare all&#39;aria brevemente. </li><li> Utilizzando pinze, trasferire accuratamente ogni quadrato in scintillazionefiale. No scintillazione cocktail è necessario. Questi campioni saranno utilizzati per generare una curva standard per determinare il CPM / pmol della soluzione ATP. </li></ol></li></ol> 7. il conteggio a scintillazione <ol><li> Caricare tutti fiale di scintillazione in cassette contatore a scintillazione. Inserire le cassette in contatore a scintillazione. </li><li> Eseguire programma di conteggio a scintillazione per misurare CPM per ogni flacone. Questi dati, insieme con il CPM / pmol della miscela ATP radiomarcato (dal punto 6.3), possono essere utilizzati per calcolare la quantità di fosforilata istidina chinasi presente in ogni punto, e quindi la velocità di autofosforilazione. 18,19 </li></ol>

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	<li>Stock, A. M., Robinson, V. L., Goudreau, P. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Two-component+signal+transduction.">Two-component signal transduction.</a> Annu. Rev. Biochem. 69, 183-215 (2000).</li><li>Jung, K., Fried, L., Behr, S., Heermann, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Histidine+kinases+and+response+regulators+in+networks.">Histidine kinases and response regulators in networks.</a> Curr. Opin. Microbiol. 15 (2), 118-124 (2012).</li><li>Parkinson, J. S., Kofoid, E. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Communication+modules+in+bacterial+signaling+proteins.">Communication modules in bacterial signaling proteins.</a> Annu. Rev. Genet. 26, 71-112 (1992).</li><li>Laub, M. T., Biondi, E. G., Skerker, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phosphotransfer+profiling:+systematic+mapping+of+two-component+signal+transduction+pathways+and+phosphorelays.">Phosphotransfer profiling: systematic mapping of two-component signal transduction pathways and phosphorelays.</a> Methods Enzymol. 423, 531-548 (2007).</li><li>Ronson, C. W., Nixon, B. T., Ausubel, F. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Conserved+domains+in+bacterial+regulatory+proteins+that+respond+to+environmental+stimuli.">Conserved domains in bacterial regulatory proteins that respond to environmental stimuli.</a> Cell. 49 (5), 579-581 (1987).</li><li>Szurmant, H., Bu, L., Brooks, C. L., Hoch, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+essential+sensor+histidine+kinase+controlled+by+transmembrane+helix+interactions+with+its+auxiliary+proteins.">An essential sensor histidine kinase controlled by transmembrane helix interactions with its auxiliary proteins.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 105 (15), 5891-5896 (2008).</li><li>Price, M. S., Chao, L. Y., Marletta, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Shewanella+oneidensis+MR-1+H-NOX+regulation+of+a+histidine+kinase+by+nitric+oxide.">Shewanella oneidensis MR-1 H-NOX regulation of a histidine kinase by nitric oxide.</a> Biochemistry. 46 (48), 13677-13683 (2007).</li><li>Zhulin, I. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+superfamily+of+chemotaxis+transducers:+from+physiology+to+genomics+and+back.">The superfamily of chemotaxis transducers: from physiology to genomics and back.</a> Adv. Microb. Physiol. 45, 157-198 (2001).</li><li>Robinson, V. L., Buckler, D. R., Stock, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+tale+of+two+components:+a+novel+kinase+and+a+regulatory+switch.">A tale of two components: a novel kinase and a regulatory switch.</a> Nature Struct. Biol. 7 (8), 626-633 (2000).</li><li>Attwood, P. V., Piggott, M. J., Zu, X. L., Besant, P. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Focus+on+phosphohistidine.">Focus on phosphohistidine.</a> Amino acids. 32 (1), 145-156 (2007).</li><li>Kee, J. -. M., Muir, T. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chasing+phosphohistidine,+an+elusive+sibling+in+the+phosphoamino+acid+family.">Chasing phosphohistidine, an elusive sibling in the phosphoamino acid family.</a> ACS Chem. Biol. 7 (1), 44-51 (2012).</li><li>Tawa, P., Stewart, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kinetics+of+CheA+Autophosphorylation+and+Dephosphorylation+Reactions.">Kinetics of CheA Autophosphorylation and Dephosphorylation Reactions.</a> Biochemistry. 33 (25), 7917-7924 (1994).</li><li>Marina, A., Mott, C., Auyzenberg, A., Hendrickson, W. A., Waldburger, C. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+and+mutational+analysis+of+the+PhoQ+histidine+kinase+catalytic+domain.+Insight+into+the+reaction+mechanism.">Structural and mutational analysis of the PhoQ histidine kinase catalytic domain. Insight into the reaction mechanism.</a> J. Biol. Chem. 276 (44), 41182-41190 (2001).</li><li>Fuhs, S. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Monoclonal+1-+and+3-Phosphohistidine+Antibodies:+New+Tools+to+Study+Histidine+Phosphorylation.">Monoclonal 1- and 3-Phosphohistidine Antibodies: New Tools to Study Histidine Phosphorylation.</a> Cell. 162 (1), 198-210 (2015).</li><li>Ueno, T. B., Johnson, R. A., Boon, E. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optimized+assay+for+the+quantification+of+histidine+kinase+autophosphorylation.">Optimized assay for the quantification of histidine kinase autophosphorylation.</a> Biochem. Biophys. Res. Commun. 465 (3), 331-337 (2015).</li><li>Bradford, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+rapid+and+sensitive+method+for+the+quantitation+of+microgram+quantities+of+protein+utilizing+the+principle+of+protein-dye+binding.">A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding.</a> Anal. Biochem. 7 (72), 248-254 (1976).</li><li>Stoscheck, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitation+of+protein.">Quantitation of protein.</a> Methods Enzymol. 182, 50-68 (1990).</li><li>Funt, B. L., Hetherington, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Scintillation+counting+of+beta+activity+on+filter+paper.">Scintillation counting of beta activity on filter paper.</a> Science. 131 (3413), 1608-1609 (1960).</li><li>Bem, E. M., Bem, H., Reimch&#252;ssel, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determination+of+phosphorus-32+and+calcium-45+in+biological+samples+by+&#268;erenkov+and+liquid+scintillation+counting.">Determination of phosphorus-32 and calcium-45 in biological samples by &#268;erenkov and liquid scintillation counting.</a> Int. J. Appl. Radiat. Isot. 31 (6), 371-374 (1980).</li></ol>

Gli autori non hanno nulla da rivelare.

Il saggio di legame nitrocellulosa che abbiamo descritto ha molti vantaggi rispetto ai metodi utilizzati in precedenza per caratterizzare chinasi istidina. Rispetto ai tradizionali SDS / PAGE autoradiografia-based, il nostro metodo è maggiore produttività e meno tempo. La membrana di nitrocellulosa è facile da gestire rispetto gel SDS, e non deve essere fissato. Ponceau macchiare la nitrocellulosa consente per le macchie di proteine ​​per essere visualizzati. Questo fornisce un modo semplice per tagliare ogni spo...

risposta adattativa è cruciale per la sopravvivenza dei batteri. Al fine di rilevare e rispondere a cambiamenti ambientali, batteri usano un sistema stimolo-risposta nota come segnalazione bicomponente. 1,2 In un tipico sistema a due componenti, la chinasi istidina rileva uno stimolo affine, autophosphorylates suo residuo istidina conservati, poi trasferisce fosfato ad un residuo aspartato conservati nel dominio ricevente di una proteina regolatore di risposta. 3 Questo evento attiva un cambiamento nell&#39;attività del regolatore di risposta, che stimola un effetto valle. 4,5 Così, i batteri sono in grado di rilevare e adattarsi ai cambiamenti nell&#39;ambiente locale. Alcuni sistemi di segnalazione a due componenti si discostano da questo archetipo. In alcuni casi, il dominio sensoriale della chinasi istidina è una proteina stand-alone, che rileva direttamente l&#39;input sensoriale e modifica attività chinasica attraverso una interazione proteina-proteina. 6-8 Tuttavia, il fondoprocesso amental e il ruolo globale del sistema rimane lo stesso. segnalazione bicomponente è un sistema stimolo-risposta onnipresente che è essenziale per la sopravvivenza dei batteri, e chinasi istidina giocano un ruolo critico nella trasduzione del segnale. 9 Nonostante l&#39;importanza di istidina chinasi alla biologia batterica, rimangono poco caratterizzato. Ciò è dovuto alla instabilità intrinseca di phosphohistidine, e la mancanza di un metodo pratico per misurare autofosforilazione. Phosphohistidine è più labile di Fosfoserina, phosphothreonine, e fosfotirosina. 10 Così, le tecniche che vengono comunemente utilizzati per analizzare chinasi Ser / Thr / Tyr non sono applicabili per chinasi istidina. 11 saggi in vitro per lo studio chinasi istidina sono stati in gran parte limitato a SDS-PAGE autoradiografia. 12,13 In questo metodo, [γ- 32 P] -ATP viene incubata con chinasi, e la fosforilazione della chinasi viene analizzato dal polgel yacrylamide elettroforesi (PAGE) seguita da autoradiografia del gel. Questo metodo può essere usato per monitorare autofosforilazione chinasi, nonché phosphotransfer dalla chinasi ad un regolatore di risposta. Tuttavia, questo metodo ha notevoli carenze. test basato sulla pagina sono bassa produttività e che richiede tempo. Tali limitazioni non sono favorevoli a caratterizzare una proteina e accertare i parametri cinetici. Un metodo alternativo per lo studio chinasi istidina che è stato pubblicato di recente utilizza anticorpi per rilevare phosphohistidine autofosforilazione. 14 Mentre questo metodo ha il vantaggio di distinguere tra 1-phosphohistidine e 3-phosphohistidine, a seconda della strumentazione utilizzata per il rilevamento, questo metodo non può offrire una vasta gamma dinamica o limite superiore alta di rilevamento. Pertanto, vi è la necessità per un saggio rapido, meno faticoso e più sensibile che può essere usato per studiare queste proteine ​​importanti. Qui, descriviamo e demonstrate un saggio di legame nitrocellulosa accuratamente sviluppato che può essere utilizzato per quantificare autofosforilazione di purificati chinasi istidina batteriche in vitro. Questo saggio è un throughput più elevato e meno tempo rispetto test basato sulla pagina. Il metodo utilizza anche la radiazione Cherenkov per phosphohistidine quantificazione, che offre un elevato limite superiore di rilevazione e una vasta gamma dinamica. Il saggio può essere utilizzato per determinare i parametri cinetici per chinasi istidina.

<table><tbody><tr><td>Phosphoric acid</td><td>VWR</td><td>AAAA18067-AP</td><td>For quenching reactions and washing nitrocellulose</td></tr><tr><td>Tris base</td><td>RPI</td><td>T60040-5000.0</td><td>Tris-HCl pH 8.0, for kinase reaction buffer</td></tr><tr><td>Potassium chloride</td><td>RPI</td><td>P41000-2500.0</td><td>For kinase reaction buffer</td></tr><tr><td>Magnesium chloride</td><td>RPI</td><td>M24000-500.0</td><td>For kinase reaction buffer</td></tr><tr><td>Glycerol</td><td>RPI</td><td>G22020-4000.0</td><td>For kinase reaction buffer</td></tr><tr><td>5&#039;-ATP</td><td>Promega</td><td>E6011</td><td>Kinase substrate</td></tr><tr><td>[&amp;gamma;-&lt;sup&gt;32&lt;/sup&gt;P]-5&#039;-ATP</td><td>Perkin Elmer</td><td>NEG002Z250UC&amp;nbsp;</td><td>6,000 Ci/mmol</td></tr><tr><td>96-well dot blot apparatus</td><td>Bio-rad</td><td>1706545</td><td>For spotting reactions</td></tr><tr><td>Nitrocellulose</td><td>Whatman</td><td>32-10401396-PK</td><td>For spotting reactions</td></tr><tr><td>Ponceau S</td><td>Sigma aldrich</td><td>P3504-50G</td><td>For staining nitrocellulose</td></tr></tbody></table>

quantification of bacterial histidine kinase autophosphorylation using a nitrocellulose binding assay

We demonstrate a useful method for quantifying autophosphorylation of purified bacterial histidine kinases. Histidine kinases are known for their involvement in two-component signal transduction, a ubiquitous system through which bacteria sense and respond to environmental stimuli. Two-component signaling features autophosphorylation of a histidine kinase, followed by phosphotransfer to the receiver domain of a response regulator protein, which ultimately leads to an output response. Autophosphorylation of the histidine kinase is responsive to the presence of a cognate environmental stimulus, thereby giving bacteria a means to detect and respond to changes in the environment. Despite their importance in bacterial biology, histidine kinases remain poorly understood due to the inherent lability of phosphohistidine. Conventional methods for studying these proteins, such as SDS-PAGE autoradiography, have significant shortcomings. We have developed a nitrocellulose binding assay that can be used to characterize histidine kinases. The protocol for this assay is simple and easy to execute. Our method is higher throughput, less time-consuming, and offers a greater dynamic range than SDS-PAGE autoradiography.

<html> Un insieme di dati rappresentativi è stato generato con un&#39;immagine catturata con un imager fosforo (Figura 1), Ponceau S macchia della membrana di nitrocellulosa (Figura 2), e dati di conteggio a scintillazione (Figura 3). La figura 3A mostra le costanti cinetiche degli enzimi in una trama Lineweaver-Burk. Questi risultati sono stati ottenuti utilizzando una chinasi istidina purificata dalla specie gram-negat...

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Quantification of Bacterial Histidine Kinase Autophosphorylation Using a Nitrocellulose Binding Assay

We report and demonstrate an optimized nitrocellulose binding assay that can be used to quantify autophosphorylation of purified bacterial histidine kinases. Our method has several advantages over traditional SDS-PAGE based techniques, providing a valuable alternative for characterizing these important proteins.

Quantificazione dei batteri istidina chinasi autophosphorylation usando un test nitrocellulosa Binding

We demonstrate a useful method for quantifying autophosphorylation of purified bacterial histidine kinases. Histidine kinases are known for their ...

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Research

JoVE Journal

Biochemistry

8.5K Views.  Stony Brook University. We report and demonstrate an optimized nitrocellulose binding assay that can be used to quantify autophosphorylation of purified bacterial histidine kinases. Our method has several advantages over traditional SDS-PAGE based techniques, providing a valuable alternative for characterizing these important proteins.

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Assaying Protein Kinase Activity with Radiolabeled ATP

Protein kinases are able to govern large-scale cellular changes in response to complex arrays of stimuli, and much effort has been directed at uncovering allosteric details of their regulation. Kinases comprise signaling networks whose defects are often hallmarks of multiple forms of cancer and related diseases, making an assay platform amenable to manipulation of upstream regulatory factors and validation of reaction requirements critical in the search for improved therapeutics. Here, we describe a basic kinase assay that can be easily adapted to suit specific experimental questions including but not limited to testing the effects of biochemical and pharmacological agents, genetic manipulations such as mutation and deletion, as well as cell culture conditions and treatments to probe cell signaling mechanisms. This assay utilizes radiolabeled [&#947;-32P] ATP, which allows for quantitative comparisons and clear visualization of results, and can be modified for use with immunoprecipitated or recombinant kinase, specific or typified substrates, all over a wide range of reaction conditions.

Protein kinases are highly evolved signaling enzymes and scaffolds that are critical for inter- and intracellular signal transduction. We present a protocol for measuring kinase activity through the use of radiolabeled adenosine triphosphate ([&#947;-32P] ATP), a reliable method to aid in elucidation of cellular signaling regulation.

Analizzare l&#39;attività della proteina con l&#39;ATP radioattivato

Protein kinases are able to govern large-scale cellular changes in response to complex arrays of stimuli, and much effort has been directed at uncovering ...

Ricerca

Biochimica

Identification of Cyclin-dependent Kinase 1 Specific Phosphorylation Sites by an In Vitro Kinase Assay

Cyclin-dependent kinase 1 (Cdk1) is a master controller for the cell cycle in all eukaryotes and phosphorylates an estimated 8 - 13% of the proteome; however, the number of identified targets for Cdk1, particularly in human cells is still low. The identification of Cdk1-specific phosphorylation sites is important, as they provide mechanistic insights into how Cdk1 controls the cell cycle. Cell cycle regulation is critical for faithful chromosome segregation, and defects in this complicated process lead to chromosomal aberrations and cancer.
Here, we describe an in vitro kinase assay that is used to identify Cdk1-specific phosphorylation sites. In this assay, a purified protein is phosphorylated in vitro by commercially available human Cdk1/cyclin B. Successful phosphorylation is confirmed by SDS-PAGE, and phosphorylation sites are subsequently identified by mass spectrometry. We also describe purification protocols that yield highly pure and homogeneous protein preparations suitable for the kinase assay, and a binding assay for the functional verification of the identified phosphorylation sites, which probes the interaction between a classical nuclear localization signal (cNLS) and its nuclear transport receptor karyopherin &#945;. To aid with experimental design, we review approaches for the prediction of Cdk1-specific phosphorylation sites from protein sequences. Together these protocols present a very powerful approach that yields Cdk1-specific phosphorylation sites and enables mechanistic studies into how Cdk1 controls the cell cycle. Since this method relies on purified proteins, it can be applied to any model organism and yields reliable results, especially when combined with cell functional studies.

Identification of Cyclin-dependent Kinase 1 Specific Phosphorylation Sites by an In Vitro Kinase Assay

Cyclin-dependent kinase 1 (Cdk1) is activated in the G2 phase of the cell cycle and regulates many cellular pathways. Here, we present a protocol for an in vitro kinase assay with Cdk1, which allows the identification of Cdk1-specific phosphorylation sites for establishing cellular targets of this important kinase.

Identificazione della chinasi Cyclin-dipendente 1 siti di fosforilazione specifico da una chinasi In Vitro test

Cyclin-dependent kinase 1 (Cdk1) is a master controller for the cell cycle in all eukaryotes and phosphorylates an estimated 8 - 13% of the proteome; ...

Single-Step Enrichment of a TAP-Tagged Histone Deacetylase of the Filamentous Fungus Aspergillus nidulans for Enzymatic Activity Assay

Class 1 histone deacetylases (HDACs) like RpdA have gained importance as potential targets for treatment of fungal infections and for genome mining of fungal secondary metabolites. Inhibitor screening, however, requires purified enzyme activities. Since class 1 deacetylases exert their function as multiprotein complexes, they are usually not active when expressed as single polypeptides in bacteria. Therefore, endogenous complexes need to be isolated, which, when conventional techniques like ion exchange and size exclusion chromatography are applied, is laborious and time consuming. Tandem affinity purification has been developed as a tool to enrich multiprotein complexes from cells and thus turned out to be ideal for the isolation of endogenous enzymes. Here we provide a detailed protocol for the single-step enrichment of active RpdA complexes via the first purification step of C-terminally TAP-tagged RpdA from Aspergillus nidulans. The purified complexes may then be used for the subsequent inhibitor screening applying a deacetylase assay. The protein enrichment together with the enzymatic activity assay can be completed within two days.

Single-Step Enrichment of a TAP-Tagged Histone Deacetylase of the Filamentous Fungus Aspergillus nidulans for Enzymatic Activity Assay

Class 1 histone deacetylases (HDACs) like RpdA have gained importance as potential targets to treat fungal infections. Here we present a protocol for the specific enrichment of TAP-tagged RpdA combined with an HDAC activity assay that allows in vitro efficacy testing of histone deacetylase inhibitors.

Arricchimento in un solo passaggio di un istone deacetilasi con tag TAP del fungo filamentoso Aspergillus nidulans per il saggio di attività enzimatica

Class 1 histone deacetylases (HDACs) like RpdA have gained importance as potential targets for treatment of fungal infections and for genome mining of ...

Kinase Inhibitor Screening In Self-assembled Human Protein Microarrays

The screening of kinase inhibitors is crucial for better understanding properties of a drug and for the identification of potentially new targets with clinical implications. Several methodologies have been reported to accomplish such screening. However, each has its own limitations (e.g., the screening of only ATP analogues, restriction to using purified kinase domains, significant costs associated with testing more than a few kinases at a time, and lack of flexibility in screening protein kinases with novel mutations). Here, a new protocol that overcomes some of these limitations and can be used for the unbiased screening of kinase inhibitors is presented. A strength of this method is its ability to compare the activity of kinase inhibitors across multiple proteins, either between different kinases or different variants of the same kinase. Self-assembled protein microarrays generated through the expression of protein kinases by a human-based in vitro transcription and translation system (IVTT) are employed. The proteins displayed on the microarray are active, allowing for measurement of the effects of kinase inhibitors. The following procedure describes the protocol steps in detail, from the microarray generation and screening to the data analysis.

A detailed protocol for the generation of self-assembled human protein microarrays for the screening of kinase inhibitors is presented.

Screening dell'inibitore della kinasi in microarray proteici umane auto-assemblati

The screening of kinase inhibitors is crucial for better understanding properties of a drug and for the identification of potentially new targets with ...

Nonradioactive Assay to Measure Polynucleotide Phosphorylation of Small Nucleotide Substrates

Polynucleotide kinases (PNKs) are enzymes that catalyze the phosphorylation of the 5&#39; hydroxyl end of DNA and RNA oligonucleotides. The activity of PNKs can be quantified using direct or indirect approaches. Presented here is a direct, in vitro approach to measure PNK activity that relies on a fluorescently-labeled oligonucleotide substrate and polyacrylamide gel electrophoresis. This approach provides resolution of the phosphorylated products while avoiding the use of radiolabeled substrates. The protocol details how to set up the phosphorylation reaction, prepare and run large polyacrylamide gels, and quantify the reaction products. The most technically challenging part of this assay is pouring and running the large polyacrylamide gels; thus, important details to overcome common difficulties are provided. This protocol was optimized for Grc3, a PNK that assembles into an obligate pre-ribosomal RNA processing complex with its binding partner, the Las1 nuclease. However, this protocol can be adapted to measure the activity of other PNK enzymes. Moreover, this assay can also be modified to determine the effects of different components of the reaction, such as the nucleoside triphosphate, metal ions, and oligonucleotides.

This protocol describes a nonradioactive assay to measure kinase activity of polynucleotide kinases (PNKs) on small DNA and RNA substrates.

Analisi nonradioattiva per misurare la fosforilazione polinucleoide dei substrati piccoli nucleotidi

Polynucleotide kinases (PNKs) are enzymes that catalyze the phosphorylation of the 5&#39; hydroxyl end of DNA and RNA oligonucleotides. The activity of ...

Measuring Plasma Membrane Protein Endocytic Rates by Reversible Biotinylation

Plasma membrane proteins are a large, diverse group of proteins comprised of receptors, ion channels, transporters and pumps.  Activity of these proteins is responsible for a variety of key cellular events, including nutrient delivery, cellular excitability, and chemical signaling.  Many plasma membrane proteins are dynamically regulated by endocytic trafficking, which modulates protein function by altering protein surface expression.  The mechanisms that facilitate protein endocytosis are complex and are not fully understood for many membrane proteins.  In order to fully understand the mechanisms that control the endocytic trafficking of a given protein, it is critical that the protein s endocytic rate be precisely measured.  For many receptors, direct endocytic rate measurements are frequently achieved utilizing labeled receptor ligands.  However, for many classes of membrane proteins, such as transporters, pumps and ion channels, there is no convenient ligand that can be used to measure the endocytic rate.  In the present report, we describe a reversible biotinylation method that we employ to measure the dopamine transporter (DAT) endocytic rate.  This method provides a straightforward approach to measuring internalization rates, and can be easily employed for trafficking studies of most membrane proteins.

Regulated endocytosis governs the cell surface expression levels of the majority of membrane proteins. Here we utilize reducible, membrane impermeant biotinylation reagents to measure the endocytic rate of the dopamine transporter (DAT), a polytopic membrane protein. The method facilitates a straightforward approach to measuring the endocytic rate of most plasma membrane proteins.

Misurazione delle proteine ​​plasmatiche Tariffe endocitico membrana da biotinilazione reversibile

Plasma membrane proteins are a large, diverse group of proteins comprised of receptors, ion channels, transporters and pumps.  Activity of these proteins ...

Biologia

An Optimized Single-Molecule Pull-Down Assay for Quantification of Protein Phosphorylation

Phosphorylation is a necessary posttranslational modification that regulates protein function and directs cell signaling outcomes. Current methods to measure protein phosphorylation cannot preserve the heterogeneity in phosphorylation across individual proteins. The single-molecule pull-down (SiMPull) assay was developed to investigate the composition of macromolecular complexes via immunoprecipitation of proteins on a glass coverslip followed by single-molecule imaging. The current technique is an adaptation of SiMPull that provides robust quantification of the phosphorylation state of full-length membrane receptors at the single-molecule level. Imaging thousands of individual receptors in this way allows for quantifying protein phosphorylation patterns. The present protocol details the optimized SiMPull procedure, from sample preparation to imaging. Optimization of glass preparation and antibody fixation protocols further enhances data quality. The current protocol provides code for the single-molecule data analysis that calculates the fraction of receptors phosphorylated within a sample. While this work focuses on phosphorylation of the epidermal growth factor receptor (EGFR), the protocol can be generalized to other membrane receptors and cytosolic signaling molecules.

The present protocol describes sample preparation and data analysis to quantify protein phosphorylation using an improved single-molecule pull-down (SiMPull) assay.

Un test di pull-down a singola molecola ottimizzato per la quantificazione della fosforilazione delle proteine

Phosphorylation is a necessary posttranslational modification that regulates protein function and directs cell signaling outcomes. Current methods to ...

Sviluppo di un test click-based per lo screening dell'attività dell'enzima HAT1

An Acetyl-Click Chemistry Assay to Measure Histone Acetyltransferase 1 Acetylation

HAT1, also known as Histone acetyltransferase 1, plays a crucial role in chromatin synthesis by stabilizing and acetylating nascent H4 before nucleosome assembly. It is required for tumor growth in various systems, making it a potential target for cancer treatment. To facilitate the identification of compounds that can inhibit HAT1 enzymatic activity, we have devised an acetyl-click assay for rapid screening. In this simple assay, we employ recombinant HAT1/Rbap46, which is purified from activated human cells. The method utilizes the acetyl-CoA analog 4-pentynoyl-CoA (4P) in a click-chemistry approach. This involves the enzymatic transfer of an alkyne handle through a HAT1-dependent acylation reaction to a biotinylated H4 N-terminal peptide. The captured peptide is then immobilized on neutravidin plates, followed by click-chemistry functionalization with biotin-azide. Subsequently, streptavidin-peroxidase recruitment is employed to oxidize amplex red, resulting in a quantitative fluorescent output. By introducing chemical inhibitors during the acylation reaction, we can quantify enzymatic inhibition based on a reduction of the fluorescence signal. Importantly, this reaction is scalable, allowing for high throughput screening of potential inhibitors for HAT1 enzymatic activity.

Autore in primo piano: Sviluppo del test dell'acetil-clic per lo screening degli inibitori di HAT1

Quick and accurate chemical assays to screen for specific inhibitors are an important tool in the drug development arsenal. Here, we present a scalable acetyl-click chemistry assay to measure the inhibition of HAT1 acetylation activity.

Un test chimico acetil-click per misurare l'acetiltransferasi istonica 1

HAT1, also known as Histone acetyltransferase 1, plays a crucial role in chromatin synthesis by stabilizing and acetylating nascent H4 before nucleosome ...

Quantificazione dei batteri istidina chinasi autophosphorylation usando un test nitrocellulosa Binding

Riepilogo

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Capitoli in questo video

Analizzare l'attività della proteina con l'ATP radioattivato

Identificazione della chinasi Cyclin-dipendente 1 siti di fosforilazione specifico da una chinasi In Vitro test

Arricchimento in un solo passaggio di un istone deacetilasi con tag TAP del fungo filamentoso Aspergillus nidulans per il saggio di attività enzimatica

Screening dell'inibitore della kinasi in microarray proteici umane auto-assemblati

Analisi nonradioattiva per misurare la fosforilazione polinucleoide dei substrati piccoli nucleotidi

Misurazione delle proteine plasmatiche Tariffe endocitico membrana da biotinilazione reversibile

Un test di pull-down a singola molecola ottimizzato per la quantificazione della fosforilazione delle proteine

Un test chimico acetil-click per misurare l'acetiltransferasi istonica 1

Un test chimico acetil-click per misurare l'acetiltransferasi istonica 1

Un test chimico acetil-click per misurare l'acetiltransferasi istonica 1

Quantificazione dei batteri istidina chinasi autophosphorylation usando un test nitrocellulosa Binding

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Un test di pull-down a singola molecola ottimizzato per la quantificazione della fosforilazione delle proteine

Un test chimico acetil-click per misurare l'acetiltransferasi istonica 1

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Misurazione delle proteine plasmatiche Tariffe endocitico membrana da biotinilazione reversibile