特定のタンパク質の段階的な破壊は、細胞周期の進行と完了に必要です。このようなタンパク質は、ユビキチンリガーゼによってユビキチン化され、その後プロテアソームによって破壊されます。SCF(Skp1/Cullin/F-box)と後期促進複合体(APC)は、細胞周期の進行に関与する2つの重要なユビキチンリガーゼです。SCFは細胞周期全体で活性化されますが、APCは中期から後期への移行中に活性化されます。Cdc20またはCdh1はAPCに結合して活性化し、それぞれAPC^Cdc20およびAPC^Cdh1複合体を形成します。Cdc20とCdh1は、APCがその基質を特定するのにも役立ちます。

APC^Cdc20は、中期から後期への移行において重要な役割を果たします。姉妹染色分体はコヒーシンによって一緒に保持されています。コヒーシン環は、姉妹染色分体が後期に反対の極に向かって移動できるように、酵素分離によって破壊される必要があります。しかし、セパラーゼ活性はタンパク質であるセクリンによって阻害されます。APC^Cdc20はセキュリンをユビキチン化し、プロテアソーム分解を引き起こします。これにより、その後の分離物の活性化がもたらされます。また、APC^Cdc20は有糸分裂性サイクリンをユビキチン化し、サイクリン依存性キナーゼ(Cdks)を不活性化します。Cdkの不活性化とそれに続くCdk-基質の脱リン酸化は、細胞分裂の完了に必要です。