私たちの研究室では、クロマチン関連タンパク質、ヒストン修飾、および低分子RNA経路因子が、発生と世代を超えたエピジェネティックな遺伝の文脈でどのように連携するかを調べています。GFPレポーターを用いたRNA遺伝アッセイは、非常に強力なツールとなっています。このプロトコールでは、ワームの調製、スコアリング、継代、および再現性のある結果の生成に役立つChIPサンプルの調製を標準化する方法を説明しています。
生殖細胞系に発現する導入遺伝子を研究する際の実験的課題の1つは、動物の生殖細胞系における影響を単離することです。現在、ChIPには全動物を用いていますが、将来的にはクロマチン、特に生殖細胞系で調べるアッセイを開発したいと考えています。当研究室では、ヒストンのメチル化と、その痕跡を認識するタンパク質に興味を持っています。
今後は、導入遺伝子におけるRNAi遺伝や内因性配列の制御など、これらのクロマチンリーダーとsmall RNA経路の相互作用について調べていきたいと考えています。