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요약

This manuscript describes a step-by-step protocol for the generation and quantification of diverse reprogrammed cardiac subtypes using a retrovirus-mediated delivery of Gata4, Hand2, Mef2c, and Tbx5.

초록

Direct reprogramming of one cell type into another has recently emerged as a powerful paradigm for regenerative medicine, disease modeling, and lineage specification. In particular, the conversion of fibroblasts into induced cardiomyocyte-like myocytes (iCLMs) by Gata4, Hand2, Mef2c, and Tbx5 (GHMT) represents an important avenue for generating de novo cardiac myocytes in vitro and in vivo. Recent evidence suggests that GHMT generates a greater diversity of cardiac subtypes than previously appreciated, thus underscoring the need for a systematic approach to conducting additional studies. Before direct reprogramming can be used as a therapeutic strategy, however, the mechanistic underpinnings of lineage conversion must be understood in detail to generate specific cardiac subtypes. Here we present a detailed protocol for generating iCLMs by GHMT-mediated reprogramming of mouse embryonic fibroblasts (MEFs).

We outline methods for MEF isolation, retroviral production, and MEF infection to accomplish efficient reprogramming. To determine the subtype identity of reprogrammed cells, we detail a step-by-step approach for performing immunocytochemistry on iCLMs using a defined set of compatible antibodies. Methods for confocal microscopy, identification, and quantification of iCLMs and individual atrial (iAM), ventricular (iVM), and pacemaker (iPM) subtypes are also presented. Finally, we discuss representative results of prototypical direct reprogramming experiments and highlight important technical aspects of our protocol to ensure efficient lineage conversion. Taken together, our optimized protocol should provide a stepwise approach for investigators to conduct meaningful cardiac reprogramming experiments that require identification of individual CM subtypes.

서문

핵심은 배아 (1), (2)에서 개발 한 최초의 기능 기관이다. 순환계와 함께에서는 산소, 영양분, 개발시의 폐기물 처리 장치에 공급한다. 3 주 후, 수정, 인간 심장 처음 박동 및 적절한 조절은 심근 (CMS)에 의해 유지된다. 이들 특화된 세포의 비가역적인 손실 따라서 진보적 심부전의 기초가되는 기본적인 문제이다. 이러한 제브라 피쉬 제노와 같은 일부 유기체는 심장 재생 잠재력을 가지고 있지만, 성인 포유류 심장 3, 5, 6 개의 제한된다. 따라서, 심장의 중요한 기능을 제공, 심장 질환 혼자 7 미국에서 60 만 명이 사망를 차지, 세계에서 사망의 주요 원인이다 놀라운되지 않습니다. 그만큼효율적으로 복구하거나 손상된 심근을 대체 할 refore, 세포 기반 치료는 큰 임상 적 관심이다.

야마나카 동료 8 정액 연구는 네 개의 전사 인자 강제 발현이 다 능성 줄기 세포로 완전히 분화 된 섬유 아세포를 변환하기에 충분한 것으로 나타났다. 그러나, 모든 다 능성 줄기 세포의 종양 전략 용량은 치료 목적의 사용에 중요한 문제였다. 이것은 능성 단계를 피하면서 다른 방법은 세포를 transdifferentiate하는 검색 할 과학 분야 동기를 부여. 최근, 여러 그룹이 전사의 자궁외 식으로 유도 된 심근 유사 세포 (iCLMs)에 마우스 섬유 아세포의 직접 변환을 표시하여이 전략의 가능성을 보여 주었다 Gata4, Mef2c, Tbx5, 나중에, Hand2 (GMT 및 GHMT 요인 각각) 9,10. 작고에hermore 동일한 전략은 생체 내에서 인간 유래 조직 9, 11, 12에서 수행 될 수있다. 최근 연구에 추가적인 요소 또는 심부전 리 프로그래밍 효율을 13, 14, 15을 향상시키는 변조 될 수있는 신호 전달 경로를 강조하고있다. 함께 찍은, 이러한 연구는 재생 요법에 대한 감독 분화의 가능성을 보여줍니다. 그러나, 방법 론적 차이 16 CM 리 프로그래밍, 미지의 분자 메커니즘 일관성 재현성의 저 효율성 및 iCLMs의 이질적인 성질은 어드레싱 남아있다.

직접 iCLM 얼룩을 평가하기 위해, 우리는 근절 개발 및 심장 계통 specificatio의 식별 이산 견고한 단일 세포 분석 설계N-이 기능 심근의 필요한 특성. 심방 (AM), 심실 (VM)와 조정기 (PM) 17, 18, 19, 20의 위치와 고유의 전기적 특성에 의해 정의되는 심장 CM의 적어도 세 가지의 유형이있다. 조율 된 조합, 그들은 혈액의 적절한 펌핑을 할 수 있습니다. 심장 손상 중에, 하나 또는 모든 아형의 영향을 야기 할 수 있으며 세포 치료의 유형은 경우에 따라 해결해야 할 것이다. 작은 일이 부속 명세서를 조절하는 분자 메커니즘을 연구하기 위해 수행되는 동안 현재 대부분의 전략은 심근 세포의 전체적인 생성에 초점을 맞춘다.

다음 연구는 제대로 잘 조직 된 근섬유 분절을 정량화 및 심근 서브 타입의 다양한 세트를 식별하는 방법을 자세히 설명합니다. 페이스 메이커 (PM) - 특정 기자 마우스를 사용하여, 우리는 난을 적용 할 수 있습니다mmunocytochemical 접근 방식은 유도 심방 같은 근육 세포 (IAM), 유도 심실 같은 근육 세포 (IVM)과 유도 PM-같은 근육 세포 (IPMS) (21)를 구별한다. 우리의 관찰에 기초하여, 전용 근절 조직을 나타내는 세포는 자율 박동 할 수있다. 이 독특한 프로그래밍 플랫폼 역할을 평가하기 위해 허용 단일 셀 해상도 근절 조직, 하위 사양 및 CM의 재 프로그래밍의 효율성의 특정 매개 변수를 설정합니다.

프로토콜

동물 관행과 관련된 모든 실험 절차는 UT 사우스 웨스턴 의료 센터의 기관 동물 관리 및 사용위원회에 의해 승인되었습니다.

Hcn4-GFP E12.5 마우스 배아 섬유 아세포 1. 분리 (MEFs에)

  1. 동형 접합 Hcn4-GFP의 남성과 CD-1 여성 사이의 시간 제한 교배를 설정합니다.
  2. 이산화탄소 안락사 이후 자궁 전위에 의해 E12.5에서 임신 여성을 희생.
    1. 이전 23 22 설명 된대로 해부 집게와 자궁 뿔을 제거하고 칼슘 또는 마그네슘없이 1X 인산 완충 식염수 (PBS)와 얼음에 페트리 접시 2+에 배치합니다.
  3. 멸균 기법을 사용하여 조직 배양 후드에서 모든 후속 단계를 수행한다.
    1. 가위를 사용하여 집게를 해부 골목 자궁과 양수에서 배아를 제거합니다. 더 나은 처리를 위해 첨부 된 태반을 유지합니다. 레그나NT CD-1 여성은 일반적으로 10 ~ 14 새끼를 낳을.
    2. 집게를 해부 사용하여 격리 된 배아을 빠르게 70 % (v / v)의 EtOH로 두 번을 씻어.
      주 : 세척은 세포 사멸을 최소화하기 위해 빠른해야한다.
    3. 격리 된 배아에서 심장을 포함, 머리, 사지, 꼬리와 내장을 제거합니다.
    4. 약 1mm 3 크기로 멸균 면도날을 사용하여 1X PBS와 잘게 다진 1 mL를 10 cm 접시에 남아있는 조직을 놓습니다.
    5. PBS로 50 ML 원뿔 튜브에 다진 조직을 전송합니다.
    6. 3 분 동안 300 XG에 스핀. 조심스럽게 과량의 PBS를 대기음.
    7. 배아 당 멸균 0.25 % 트립신 - EDTA의 1 ML을 추가합니다. 15 분 동안 37 ° C의 수조에서 세포를 부화. 부드럽게 튜브마다 4 분을 섞는다. 오버 소화 조직의 크게 수율을 낮출 것이다.
    8. 4 초 동안 최대 속도 (3200 RPM)에서 소용돌이 세포 혼합물.
    9. 배아 당 섬유 아세포 미디어의 2 mL를 넣고 섞는다. 필터 t스트레이너를 통해 세포를 돕기 위해 피펫을 사용하여 100 μm의 셀 스트레이너 hrough. 이후의 모든 매체의 배합은 표 1을 참조하십시오.
    10. 4 분 동안 300 XG에 스핀. 조심스럽게 뜨는을 대기음.
    11. 3 배아 당 신선한 섬유 아세포 미디어의 10 ㎖를 추가하고 6 ~ 10 번 씹다.
    12. 준비 매 3 배아 1 15 cm 조직 배양 접시에 세포를 플레이트. 37 ° C, 5 % CO 2 배양기에서 문화 하룻밤.
    13. 밤새 배양 한 후, 접시 당 미디어의 신선한 30 mL로 미디어를 교체합니다. 밤새 다시 인큐베이터로 세포를 놓습니다.
      참고 : 형광 현미경 Hcn4-GFP + 세포의 오염을 확인합니다. 문화는 GFP해야한다 - 만 프로그래밍에 GFP +를하게된다.
    14. 다음날, 신선한 미리 예열 0.25 % 트립신 EDTA 3 mL를 수확 세포. 카운트 세포를 동결. 일반적으로 용액 당 3 × 10 6 세포에서 세포를 동결. 예상 yieLD는 배아 당 3 × 10 6 세포해야한다.

2. 레트로 바이러스 생산 및 재 프로그래밍

주의 : 다음 프로토콜은 감염성 레트로 바이러스의 생산 및 처리가 필요합니다. BSL-2 가이드 라인 및 무균 기술 하에서 바이오 안전성 레벨 2 장에서 다음 단계를 수행합니다. 레트로 바이러스에 노출 된 모든 자료를 폐기하는 10 % 표백제를 사용합니다.

  1. 레트로 바이러스의 생산 및 MEFs에 준비
    참고 : 다음과 같은 프로토콜을 24 웰 플레이트에서 레트로 바이러스 6 웰 플레이트에서 생산 및 MEF 감염입니다. 다른 형식은 표 2를 참조하십시오. 타이밍 (섹션 2.3 및 그림 2 참조) 각 실험에 대해 적절하게 조정해야합니다 있도록 MEFs에이 일 -1에 도금되어있다.
    1. 플랫-E (PE) 제조업체의 권장 사항에 따라 세포를 유지한다. 간단히, DMEM에서 배양 PE 세포는 10 % FBS, 1 μg의 / ㎖로 보충 된 puromyCIN, 10 μg의 / ㎖의 블라스트, 페니실린 및 스트렙토 마이신. 통로 세포 1 : 문화 70~90%의 포화 상태에 도달 4 이틀.
    2. 일 -2 : 형질 전날, 형질 미디어에서 6 웰 플레이트에 / 잘 1 × 10 6 세포에서 플랫 - E 세포를 시드. 세포를 형질 감염시 70~80% 합류해야한다.
  2. 상업적 형질 전환 제를 이용하여 형질 전환.
    참고 : 상용 시약은 형질 전환 전에 실온 (RT)에 있어야합니다. DNA를 형질 들어 GHMT 칵테일 구를 형성하여 레트로 바이러스 플라스미드 DNA 각각 (G, H, M, 및 T)를 추가한다.
    1. 일 -1 : 15 ML 원뿔 폴리스티렌 튜브에서, 6 웰 플레이트 형식 반응 당 형질 감염 시약 6 μL의 혈청 감소 배지 중 60 μL를 혼합한다. 실온에서 5 분 동안 혼합물을 인큐베이션.
      주 : 여기에서 사용 된 트랜 스펙 션 시약 플라스틱 결합 때문에,직접 환원 혈청 배지에 형질 전환 효율의 임의의 감소를 피하기 위해 DD.
    2. 반응 당 GHMT 칵테일 2 μg의 총을 추가하고 부드럽게 섞어 누릅니다. 소용돌이하지 마십시오. RT에서 15 분 동안 반응물을 인큐베이션.
    3. 드롭 현명한 방식으로 PE 세포 단계 2.2.3에서 혼합물을 추가합니다.
    4. 37 ° C, 5 % CO 2 배양기에서 하룻밤 형질 플랫 - E 세포를 품어. 형질 전환의 시간을 기록한다.
  3. Hcn4-GFP 마우스 배아 섬유 아 세포의 시드.
    1. 1 시간 MEFs에 도금하기 전에, 면역 세포 화학에 대한 24 웰 플레이트를 준비합니다.
      1. 물론 당 12mm의 피브로넥틴의 커버 슬립을 추가합니다.
      2. (예 SureCoat) 소 콜라겐 용액 300 μL 및 코트 웰을 1 시간 동안 37 ° C의 배양기에서 배양한다.
      3. 바로 MEF 도금 전에 대기음 코팅 용액.
    2. Hcn4-GFP MEFs에의 냉동 병을 녹여 및 사전 예열 fibrobl에 1 개를 세척5 분 500 XG에 AST 미디어.
    3. 트리 판 블루 배제 또는 유사한 염료를 사용하여 세포 생존을 결정합니다. 다음 식을 사용하여 배양 용액 당 생존 세포의 수를 계산한다 :
      % 가능한 세포가 = [1.00 - (총 세포의 파란색 셀 수 / 수)] × 100
      1. 다음 식을 이용하여 생존 세포의 수를 계산한다 :
        세포 현탁액의 생균 = % 생존 세포의 X 희석 인자 X 10,000 X 전량
    4. 이전에 제조 된 소 콜라겐 솔루션 피브로넥틴 coverslip에있는 24 웰 플레이트 상에 잘 당 종자 3 × 104 세포.
  4. 형질 도입 및 MEFs에의 재 프로그래밍
    참고 : 제조업체의 메모에 따르면, 제대로 플랫 - E 세포를 1 × 10 7 감염 단위 / mL의 평균 역가를 생산 유지했다. 역가가 직접 각 실험 측정되지 않지만하는 GFP 제어는 항상 감염 효율에 대한 대용으로 포함된다.높은 GFP 발현 강도 (GFP +> 95 %)는 일반적 iCLMs 성공적 GHMT 매개 세대 연관.
    1. 0 일 24 시간 후 형질 감염은, 0.45 ㎛의 세공 크기의 계면 활성제가없는 셀룰로오스 아세테이트 필터를 통해 PE 레트로 매체 필터링하고 15ml의 원뿔형 튜브에 옮긴다. 8 μg / ML의 최종 농도로 폴리 브렌을 추가한다. 조심스럽게 새로운 형질 감염 배지 2 ㎖의 세포를 보충.
      주 : 매체가 너무 빠르게 변경되면 세포는 쉽게 판에서 분리합니다.
    2. 배양 MEFs에의 매체를 기음과 갓 수집 된 레트로 바이러스 매체를 추가; 그것은 6 웰 플레이트의 웰 당 미디어 1.7 mL로 산출한다. 24 웰 플레이트의 웰 당 ~ 800 μL를 추가합니다. 인큐베이터에 MEF 플레이트를 반환하고 밤새 품어.
    3. 1 일 : 반복 2.4.1와 2.4.2 단계를 반복합니다. 2 차 바이러스 수집 한 후 세포를 폐기하십시오. 인큐베이터에 감염된 MEFs에를 반환하고 하룻밤 휴식을 할 수 있습니다.
    4. 주 2 : 48 시간 후 유도, 1X PBS로 세포 조절 미디어 및 세척 1 개를 대기음. 24 웰 플레이트의 웰 당 500 μL 사전 예열 iCLM 미디어를 추가합니다.
    5. 삼일 - 매 2 iCLM 미디어를 교체합니다. 십사일 심장 프로그래밍의 면역 세포 (ICC) 분석을 위해 바이러스 유도 후 처리 플레이트.

재 프로그램 MEFs에 3. 면역 염색

  1. 14 일 후 유도, 신중하게 미디어를 대기음.
  2. 얼음처럼 차가운 1X PBS 300 μL 잘 각을 씻어. 초과 솔루션을 대기음.
  3. 24 웰 플레이트의 웰 당 4 % 파라 포름 알데히드 (PFA) 용액 250 μL와 세포를 수정. 실온에서 15 분을 품어.
    참고 : - 염색 전에 이주 고정 세포를 1 4 ° C에서 PBS에 저장할 수 있습니다.
  4. 300 μL 0.1 % PBS - 트리톤 100 (PBST)로 세척 웰 X3에 의해 Permeabilize 하시려면 세포. 세척 사이 RT에서 5 분을 품어. 마지막 세척 후 과잉 솔루션을 대기음.
  5. 10 블록300 μL / 웰의 1 배 범용 블록 버퍼와 RT에서 분.
  6. (ICC) 염색 버퍼를 준비합니다 버퍼를 차단 1X PBS 및 1X 유니버설의 1 : 1을 추가합니다. ICC 염색 버퍼에 차 항체를 희석하고 4 ℃에서 밤새 항체를 품어. 권장 희석 용 재료 섹션을 참조하십시오.
    1. Nppa IPM 및 IAM 식별을위한 마우스 α-티닌, 닭 αGFP, 토끼와 슬라이드의 한 쌍의 얼룩.
    2. IPM 및 IVM 식별을위한 마우스 α-티닌, 닭 αGFP, 토끼 Myl2으로 슬라이드 한 쌍의 얼룩.
  7. 다음 날, 300 μL 0.1 % PBST로 웰 X3 씻는다. 세척 사이 RT에서 5 분을 품어. 마지막 세척 후 과잉 솔루션을 대기음.
  8. ICC 염색 버퍼에 차 항체 희석을 준비합니다. 권장 희석 용 재료 섹션을 참조하십시오. 이차 항체를 빛으로부터 보호 실온에서 1 시간을 품어.
    1. 다음 보조 antibodie 모든 슬라이드를 얼룩S : 마우스 알렉사-555, 닭 알렉사-488을, 토끼 알렉사-647.
  9. 300 μL 0.1 % PBST로 웰 X3을 씻으십시오. 세척 사이 RT에서 5 분을 품어. 빛으로부터 보호합니다.
  10. 유리 현미경 슬라이드에 4 ', 6-diamidino-2-페닐 인돌 (DAPI)의 1.5 μg의 / mL로 포함하는 설치 매체의 2.4 μL를 추가합니다. 조심스럽게, 24 웰 플레이트의 우물에서 커버 슬립을 제거 여분의 용액을 제거하고 설치 매체를 사용하여 유리 슬라이드에 전송할 수 있습니다. 부드럽게 초과 볼륨과 공기를 제거하기 위해 커버 슬립을 누릅니다.
  11. 선호 매니큐어 또는 플라스틱 밀봉 제와 인감 슬라이드. 상점은 빛으로부터 보호 4 ° C에서 슬라이드를 장착.

공 초점 현미경을 사용하여 심장 서브 타입의 4 확인

주 : 촬상 들어, 공 초점 레이저 주사 현미경은 적어도 2 형광체 (405)에 스펙트럼 감지 가능한 감지기, 488, 555, 및 639 nm의 파장을 구비 IPMS, IAMS 및이 iVMS를 식별하기 위해 필요하다. IMAG플랜 - 고차 색지움 20X / 0.75 목적 또는 더 나은 사용하여 전자 셀. 제조업체의 이미지 분석 소프트웨어를 사용하여 40X 오일 침지 품질의 이미지를 얻을 수 확대 이미지를 스캔.

  1. 이미지 라이브러리 : DAPI, 알렉사-488, 알렉사-555, 알렉사-647 채널 8 비트 이미지를 가지고 (CH.). 픽셀을 2 6의 1024 프레임 크기, 라인 단계의 체류 시간, 및 (2)의 평균은 높은 해상도 이미지에 충분하다.
  2. 각 슬라이드를 들어, 하나의 가장자리에서 시작하고 최대 스캔 시작 α-티닌 + 근절 + 세포의 적색 형광 채널 (CH.)에서 아래 (예 3을 참조하십시오 그림 5A). 근절 줄무늬는 555 nm 파장에서 시각적으로 쉽게 식별 할 수 있습니다.
    1. α-티닌 + 근절 + 세포가 확인되면, 녹색 CH 전환. 이 긍정적 인 경우 (IPM)을 메모를 유지합니다. 원적외선 647 채널을 평가하기 위해 컴퓨터로 전환합니다. (IAM 또는 IVM).
      참고 : 있습니다 셀α-티닌 + / 근절 + / Hnc4-GFP + / Nppa - / Myl2은 - IPMS로 지정되어 있습니다. GFP 발현 세포 (도 4a)에 걸쳐 알 수있다.
    2. α-티닌 (마우스 Alexa555), Hcn4-GFP (닭 Alexa488)와 얼룩 슬라이드, Nppa (토끼 Alexa647) 및 DAPI. α-티닌 + / 근절 + / Hnc4-GFP있는 세포 - / Nppa +는 IAM 있습니다. Nppa 염색은 핵 주변 및 점상 (그림 4B)를 나타납니다.
    3. α-티닌 (마우스 Alexa555)와 얼룩 슬라이드, Hcn4-GFP (닭 Alexa488), Myl2 (토끼 Alexa647). α-티닌에 대한 긍정적 인 세포 + / 근절 + / Hnc4-GFP는 - / Myl2 +이 iVMS 있습니다. Myl2 염색은 근절 필라멘트를 따라 가로 무늬 양식을 전시 할 예정이다. 때문에 염색 및 Z 평면의 품질 변화에 줄무늬가 항상 (그림 4C) 쉽게 표시되지 않을 수 있습니다.

5. 부량

주 : 잠재적으로 재 프로그램 된 MEFs의 실제 수를 평가하기 위해, 24 웰 플레이트의 웰이 실험 웰에 병렬로 시딩하고, 도금 후 하루 수확. 도금 셀의 총 개수는 두 개의 웰을 평균함으로써 결정된다. 이 도금 실제 총 세포 (aTotal)을하게된다.

  1. 근절 +
    1. 시각적으로 적절한 α-티닌 + / 근절 + (오른쪽 패널 그림 3)과 기록 (그림 5B-1)에 대한 커버 슬립 각 셀을 검사합니다.
    2. 도금 실제 총 세포 (aTotal)에 의해 각각의 커버 슬립과 분할에 α-티닌 + / 근절 +의 총 수를 집계 (그림 5B-III). aTotal = 12,500 세포 및 100 세포가 α-티닌 된 경우, 예를 들어 + / + 근절 후, 도금 MEFs에 0.8 %가 다시 프로그램되었다. 평균reprograming 실험은 1 % α-티닌은 + / 근절 + 세포 (그림 5C)를 얻을 것입니다.
  2. 하위 유형 +
    참고 : 다음 단계는 대표 iCLM 정량 워크 플로우 5B / C 그림을 참조하십시오. 이 중 하위 유형 (그림 5B-1)에 대한 고유 한 경우 간단히, 각 근절 + 셀, 집계. 평균 근절 + X 100 세포 (도 5b-1)를 통해 부속 + 세포의 수를 나누어 % 하위 유형 (도 5b-III)을 계산한다. 절대 %의 하위 효율 (그림 5B-IV)를 계산하려면, 그림에서 하위 유형 + 세포 수를 분할 5B-난 × 100 (그림 5B-II) 시드 세포의 총 수에 의해.
    1. 그들은 GFP +, Nppa +, 또는 Myl2있는 경우, α-티닌의 각 + / 근절 + 세포의 경우, 평가 +입니다.
    2. / Myl2 - -, 티닌 + / 근절 + / Hnc4-GFP - / Nppa +, 및 α-티닌 + / 근절 + / Hnc4-GFP α-티닌 + / 근절 + / Hnc4-GFP + / Nppa의 총 수를 집계 - / Myl2 + 세포 (도 5b-1).
    3. 각 하위 유형의 비율을 계산하려면, 잘한다는 점에서 + / 근절 + 세포 α-티닌의 총 수에 의해 서브 타입 + 세포의 수를 분할하고 100 GHMT 곱 IPMS, IAMS, 그리고이 iVMS 대략 동일한 비율을 생성한다 (그림 5B-III).
    4. 아형 + 세포의 절대 수를 계산하기 aTotal하여 실험 조건 아형 + 세포의 총 수를 100 분할하고 (도 5b-II)로 곱한다. 평균 IPMS는 전체 감염 세포 인구의 0.3 %, IAMS 0.3 %를 나타낼과이 iVMS 0.25 % (그림 5B-IV).

결과

PM을 특정 리포터 마우스 활용, 우리는도 1에 도시 된 바와 같은 다양한 내인성 근세포를 식별하기 위해 멀티 플렉스 면역 전략을 개발했다. 도 2에 도시 된 프로그래밍 단계에 따라, 특정 아형의 CM 유도이라도 낮은 속도 빠르면 4 일째 21로 감지 할 수있다. 14 일으로 실험을 중지 할 수 있습니다 및 근절 조직 (그림 3)과

토론

본 연구는 심장 전사의 레트로 바이러스 - 매개 발현을 통해 심장 서브 타입의 다양한 세트로 MEFs에의 변환을위한 직접 프로그래밍 전략을 제공하는 Gata4, Mef2c, Tbx5 및 Hand2 (GHMT) 요인. PM 특정 리포터 마우스와 함께 면역 다중화 방식을 사용하여, 우리는 단일 세포 해상도에서 IAM,이 iVMS 및 IPMS를 식별 할 수있다. 이러한 분석은 하위 유형의 다양성과 근절 개발에 대한 개별 전사 인자의 기여를 분리 ?...

공개

The authors have nothing to disclose.

감사의 말

A.F.-P. was supported by the National Science Foundation Graduate Research Fellowship under Grant No.2015165336. N.V.M was supported by grants from the NIH (HL094699), Burroughs Wellcome Fund (1009838), and the March of Dimes (#5-FY14-203). We acknowledge Young-Jae Nam, Christina Lubczyk, and Minoti Bhakta for their important contributions to protocol development and data analysis. We also thank John Shelton for valuable technical input and members of the Munshi lab for scientific discussion.

자료

NameCompanyCatalog NumberComments
DMEMSigmaD5796Component of iCLM media, Plat-E media, fibroblast, and Transfection media
Medium 199Thermo Fisher Scientific11150059Component of iCLM media
Fetal bovine serrum (FBS)SigmaF2442Component of iCLM media, Plat-E media, fibroblast, and Transfection media
Insulin-Transferrin-Selenium GThermo Fisher Scientific41400-045Component of iCLM media
MEM vitamin solutionThermo Fisher Scientific11120-052Component of iCLM media
MEM amino acidsThermo Fisher Scientific1601149Component of iCLM media
Non-Essential amino acidsThermo Fisher Scientific11140-050Component of iCLM media
Antibiotic-AntimycoticsThermo Fisher Scientific15240062Component of iCLM media
B-27 supplementThermo Fisher Scientific17504044Component of iCLM media
Heat-Inactivated Horse SerumThermo Fisher Scientific26050-088Component of iCLM media
NaPyruvateThermo Fisher Scientific11360-70Component of iCLM media
Penicillin/StreptomycinThermo Fisher Scientific1514022Component of Plat-E media and fibroblast media
Puromycin Thermo Fisher ScientificA11139-03Component of Plat-E media
Blasticidin  Gemini Bio-Products400-128PComponent of Plat-E media
GlutamaxThermo Fisher Scientific35050-061Component of Fibroblast media
Confocal laser scanning LSM700ZeissFor confocal analysis
FuGENE 6 transfection ReagentPromegaE2692Transfection reagent 
Opti-MEM Reduced Serum MediumThermo Fisher Scientific31985-070Transfection reagent 
PolybreneMilliporeTR-1003-GInduction reagent. Use at a final concentration of 8 μM/mL
Platinium-E (PE) Retroviral Packagin Cell Line, EcotropicCellBiolabsRV-101Retroviral pacaking cell line
Trypsin 0.25% EDTAThermo Fisher ScientificFor MEFs and Plat-E dissociation
Mouse anti α-Actinin (Clone EA-53)SigmaA7811Antibody for confocal analysis. Use at 1:200
Chicken anti-GFP IgYThermo Fisher ScientificA10262Antibody for confocal analysis. Use at 1:200
Rabbit Pab anti-NPPA AbgentAP8534AAntibody for confocal analysis. Use at 1:400
Rabbit Pab anti Myl2 IgG ProteinTech10906-1-APAntibody for confocal analysis. Use at 1:200
Vectashield solution with DAPI (4',6-Diamidino-2-Phenylindole, Dihydrochloride)Vector LabsH-1500Dye for confocal analysis
Superfrost Plus Microscope slidesThermo Fisher Scientific12-550-1525 x 75 x 1.0 mm
BioCoat Fibronectin 12 mm coverslipsNeuVitro CorpGG-12-1.5Coverslips for confocal analysis
100 μm cell strainerThermo Fisher Scientific08-771-19
0.45 μm Syringes filters SFCA 25MMThermo Fisher Scientific09-740-106For virus filtration
6 mL SyringesCovidien8881516937For virus filtration
Goat anti-Chicken IgY (H&L) A488AbcamAB150169Secondary antibody for confocal analysis. Use at 1:400
Donkey anti-rabbit A647 IgG(H+L) Thermo Fisher ScientificA31573Secondary antibody for confocal analysis. Use at 1:400
Goat anti-mouse IgG(H+L) A555Thermo Fisher ScientificA21422Secondary antibody for confocal analysis. Use at 1:400
Triton X-100Sigma93443-100mlFor cell permeabilization 
Dulbecco's PBS without CaCl2 and MgCl2 (D-PBS)SigmaD8537
Power Block 10x Universal Blocking reagentThermo Fisher ScientificNC9495720Dilute to 1x in H2O
16% Paraformaldehyde aqueous solution (PFA)Electro Microscopy Sciences 15710Use at 4% diluted in dH2O
6 cm  platesOlympus25-260
6-well platesGenesee Scientific25-105
24-well platesGenesee Scientific25-107
10 cm Tissue culture dishesCorning4239
15 cm  Tissue culture dishesThermo Fisher Scientific5442
15 mL Conical tubesCorning4308
50 mL Conical tubesCorning4249
0.4% Trypan blue solutionSigmaT8154For viability
Ethyl Alcohol 200 proofThermo Fisher Scientific7005
BleachThermo Fisher Scientific6009

참고문헌

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