광학 Fractionator 표준 현미경 장비를 사용 하 여 마우스 Substantia Nigra에서 Dopaminergic 신경 수 stereological 추정

요약

이 작업 표준 현미경 장비 (즉, 가벼운 현미경 자동화 개체 테이블 (x, y, z를 사용 하 여 마우스 substantia nigra에서 dopaminergic 신경 세포 숫자의 편견된 stereological 추정에 대 한 단계별 프로토콜 제공 비행기), 그리고 디지털 이미지 분석을 위한 공개 소프트웨어.

초록

전 임상 파 킨 슨 병 연구에 substantia nigra에서 dopaminergic 신경 손실의 정량화를 포함 하 여 nigrostriatal로 분석은 필수적입니다. 총 dopaminergic 신경 세포 숫자를 예상 하려면 편견된 stereology 광학 fractionator 메서드를 사용 하 여 현재 이라고 여겨진다 금 표준. 광학 fractionator 메서드 뒤에 이론은 복잡 하 고 stereology 전문된 장비 없이 달성 하기 어렵습니다, 때문에 필요한 소프트웨어를 포함 하는 여러 상용 완료 stereology 시스템 존재, 순전히 있기 때문에 셀에 대 한 이유를 계산. 이 보고서에 dopaminergic 신경 세포의 stereological 추정 가벼운 현미경을 포함 하 여 표준 현미경 장비를 사용 하 여 계산에 대 한 방법을 설명 합니다 이후 특수 stereology 설치 구입은 항상 가능 하 고, 여러 가지 이유로, 한 이미징 소프트웨어와 분석에 대 한 컴퓨터 개체 테이블 (x, y, z 평면)를 자동화. 단계별 설명은 광학 fractionator 메서드를 사용 하 여 stereological 정량화를 수행 하는 방법에 부여 되 고 예상된 셀 개수 계산에 대 한 사전 프로그램 된 파일 제공 됩니다. 이 방법의 정확도 평가, 하 상용 stereology 장치에서 가져온 데이터에 대 한 비교는 수행 되었다. 유사한 핸드폰 번호가 프로토콜과 stereology 장치를 사용 하 여 따라서 편견된 stereology이이 프로토콜의 정밀도 보여주는 발견 됐다.

서문

신경 세포 수의 부 량은 neurodegeneration substantia nigra (SN)^1,2에서 레벨을 전 임상 파 킨 슨 병 연구에. 관심의 영역에 셀 수의 편견된 stereological 추정 금^3,,45으로 간주 됩니다.

편견된 stereology의 도래 하기 전에 섹션에서 신경 세포의 수는 뉴런 섹션에 광경에와 서 가변 확률에 대 한 수정 계산된 셀 프로 파일을 조작 하 여 평가 했다. 가장 일반적으로 사용 되는 방법 중 하나는 아베 크롬 비⁶에 의해 설명 된 정량된 셀의 정정 했다. 이 방법은 세포 조각 같은 셀의 인접 한 얇은 섹션에서 발견 되는 경우 여러 번 측정할 수는 계정에 걸릴 하려고 했습니다. 따라서, 아베 크롬 비와 다른 저자 모양, 크기, 및 계산된 셀^7,8의 방향에 대 한 정의 요구 하는 방정식을 생성. 그러나, 이러한 가정 일반적으로 하지 실현 되었고 따라서 실제 휴대폰 번호 (즉, 바이어스)에서 체계적인 오류 및 분기에 led. 또한, 바이어스 추가 샘플링³으로 줄일 수 없습니다.

Stereological 광학 fractionator를 사용 하 여 셀 수 추정에 대 한 수학적 원리 직접 정의 3 차원 볼륨에 직접 셀 숫자를 추정에 적용 됩니다. 이 방법의 장점은 그것은 모양, 크기, 및 계산 셀의 방향에 대 한 가정을 포함 하지 않습니다. 따라서, 예상된 핸드폰 번호는 참 값에 가까운 고 가까이 샘플 크기가 증가 (즉, 편견)³. Stereology 편견 메서드를 계속 사용 하는 경우 많은 규칙을 따라야 합니다, 때문에 준비-사용 상업 stereology 시스템 개발 되었습니다 (검토를 위해 참조 슈 미 츠, 호프, 2005⁴). 전문된 stereology 시스템 디자인-기반 stereological 메서드 구현 선험적 정의 프로브와 샘플링 방식을 모양, 크기, 공간 배급, 및의 방향에서 독립을 이끌어 내는 stereological 평가 분석 된^4,9에 셀. 그러나, 상용 stereology 시스템 비싸다; 이 새로운 연구에서 제한할 수 있습니다.

이 연구의 목표는 SN, 광학 fractionator 메서드를 사용 하 고 표준 현미경 장비 (즉, 빛을 사용 하 여 마우스에서 dopaminergic 셀의 디자인 기반 stereological 추정에 대 한 사용 가능한 기술을 개발 했다 현미경, 표준 현미경 소프트웨어 및는 자동화 한 x, y, z 단계). 이 위해, 마우스 뇌 조직 처리 하는 방법과 편견된 stereology 디자인-기반을 사용 하 여 SN 셀 숫자를 예측 하는 방법에 대 한 단계별 가이드를 제시 합니다. 또한, 예상된 셀 숫자의 계산 및 오류 (CE)의 계수에 대 한 템플릿은 제공 합니다.

여기에 설명 된 메서드는 SN의 분석에 국한 되지 않습니다 하지만 마우스 또는 쥐 뇌의 해부학 적 정의 다른 영역에 사용 하기 위해 적용할 수 있습니다. 예를 들어, 편견된 stereology 마¹⁰ 과 로커 스 coeruleus¹¹신경 세포 숫자를 추정 사용 되었습니다. 또한, 신경, 이다¹² 와 microglia¹³, 등 다른 세포 유형 뿐만 평가 될 수 있다. 따라서,이 방법은 그들의 연구에서 편견된 stereology를 구현 하고자 하지만 많은 stereology 시스템을 구입 하는 돈 지출 하고자 하는 과학자에 게 유용할 수 있습니다.

프로토콜

관심과 동물의 사용에 대 한 모든 해당 국제, 국가, 또는 기관 지침에 따라 했다. 프로토콜 Regierung 폰 인 운터 프랑 켄, 뷔르츠부르크, 독일에서 지방 자치 단체에 의해 승인 되었다.

1. 조직 처리 및 Immunohistochemistry

1. Euthanize 쥐 CO ₂ 또는 어떤 다른 승인 방법.
2. Perfuse 6 12 주 된 C56Bl/6N 남성 쥐 transcardially 10 mL의 0.1 M 인산 염 버퍼 식 염 수 (PBS) 25 G 바늘과 주입 펌프를 사용 하 여 다음 0.1 M PBS에 4 %paraformaldehyde (PFA)의 70 mL.
   주의: PFA는, 알레르기, 독성 및 발암 성.
3. Bregma (그림 25, Paxinos 및 프랭클린 마우스 뇌 아틀라스 ¹⁴)에서 +0.74 m m의 영역에서 두뇌 매트릭스 슬라이서와 코로나 비행기에 쥐의 뇌를 해 부.
4. SN를 포함 하 여 4%에서 뇌의 등 쪽 부분 침수-고정을 위한 4 ° C에서 1 d 0.1 M PBS에 PFA.
5. Cryo-보호에 대 한 30% 자당/0.1 mol PBS 솔루션 PFA 교환 하 고 다른 2 d 4에서 품 어 ° c.
6. 최적의 절삭 온도 (10 월)는 cryomold로 뇌의 등 쪽 부분 가득 넣어 컴파운드와 천천히 액체 드라이 아이스 냉각 isopentane는 조직의 동결.
   주의: 드라이 아이스는 매우 추운 (-78 ° C); 드라이 아이스와 함께 작업 하면서, 장갑 등 개인 보호 장비 (PPE)를 사용 합니다. 드라이 아이스 증발 CO ₂; 따라서, 연기 후드 작동.
7. 순차적으로 30 µ m cryo-섹션 코로나 비행기에서 잘라내어 Bregma (그림 51 Paxinos, 프랭클린 마우스 뇌 아틀라스 ¹⁴)에서 2.46 m m에서 시작 및 끝 Bregma에서 4.04 m m 섹션을 수집 (그림 64, Paxinos 및 프랭클린 마우스 뇌 아틀라스 ¹⁴).
8. 는 Cryoprotectant (30% 글리세롤, 30 %ethoxyethanol, 및 40 %PBS)-20 ° c.에로 채워진 튜브에 4 개의 시리즈를 저장 단면화 절차 동안 표시 오른쪽 반구 brainstem의 상위 영역에 작은 구멍을 puncturing.
9. Immunohistochemical 얼룩, 선택 마우스 당 섹션의 한 시리즈. 10% 정상 염소 혈 청 (0.1 mol 통에 PBS에에서 NGS)/2% BSA/0.5% 세제 1 시간에 대 한 preincubate 부동성 섹션. 섹션 4에서 하룻밤 2% NGS/2% BSA/0.5% 세제 0.1 mol PBS에에서 희석 토끼 반대로 마우스 티로신 hydroxylase (TH, 1:1,000 희석) 항 체로 품 어 ° c.
토끼에 대 한 항 체
10. 적용 보조 Igs (1: 100 희석) 실 온에서 2 h 뒤 avidin/비오 틴 시 약 (1: 100 희석). 품 어와 3, 3-diaminobenzidine-tetrahydrochloride (한 덩어리) 및 H ₂ O ₂와 얼룩. 코팅된 개체 슬라이드에 얼룩 후 섹션을 탑재.
    참고: 회 + dopaminergic SN 뉴런 그림 1a에 표시 됩니다. 얼룩 한 시리즈, 여 SN 동위 compacta (SNpc) 및 reticulata, 꼬리 부분에는 rostral에서 연장 13 SN 섹션의 평균은 동물 ( 그림 1b) 당 물 들 다. 섹션 120 µ m (1/4 시리즈)으로 구분 됩니다 ( 그림 1c).
    주의: 소량은 의심 되는 발암 물질 이다. 그것은 접촉 및 흡입 독성입니다. 소량 작업 시 보호구를 사용.

2. 이미지의 수집

캡처 일 immunohistochemically

디지털 현미경에 결합 된 이미징 소프트웨어를 사용 하 여 SN 섹션 스테인드. 1 시리즈의 각 섹션을 별도로 분석.
1. 이미징 소프트웨어의 스캔 슬라이드 옵션을 사용합니다. 높은-품질의 이미지 (그림 2)에 대 한 TIFF 형식으로 저장.
   참고: 이미지 해상도 cm 당 312 픽셀.
2. 기자 " 취득 " 수집 창 (그림 2a) 여.
3. 설정 합니다 binning " 2 " 회색조 이미지.
   참고: 컬러 사진 대신 회색조 이미지의 인수 최종 스택 이미지 파일 (그림 2a)의 크기를 줄입니다.
4. 클릭 " 라이브 쇼 " 섹션의 라이브 이미지를 보여주는 새 창을 열려면 수집 창에서 (그림 2 a와 b).
5. 클릭 " 단계 " 수집 창에서. 선택 " 슬라이드 스캔 " 드롭다운 메뉴 및 확인란 (그림 2c).
   참고: 그러면 수집 및 z-비행기, 13 μ의 전체 범위에서 1 µ m의 연속 이미지 사이의 거리를 사용 하 여 스택 이미지의 수집 뿐만 아니라 x, y 평면에 고도의 확대 SN 이미지 (630 X 배율)의 맞춤 m.
6. SN에 대 한 검색을 2.5 X 목표를 선택 합니다.
7. X. 63 목표 변경
8. 왼쪽된 상단 (TopLeft) (그림 2c) 및 오른쪽 아래 모서리 (LowRight) (그림 2d) 섹션의 클릭 하 여 정의 " 세트. "
9. 클릭 " Z 시리즈 " 확인 하 고는 " Z-비행기 시리즈 " 상자 (그림 2e).
10. 결정 3 개의 무작위로 선택 된 계산에서 섹션의 실제 탑재 된 두께 이미징 소프트웨어를 사용 하 여 섹션 당 사이트. 클릭이 " 보기 상단 오프셋 " 정의 섹션 (그림 2e)의 상단을 클릭 " 중지 보기 톱 " (그림 2f). 그 후, 클릭 " 보기 아래쪽 오프셋 " (그림 2f)를 클릭 하 고 " 중지 보기 하단 " (그림 2 g). 섹션의 두께 적어 둡니다.
11. 빼기 3 µ m (가드 영역) 위에서 오프셋 하 고 최고 오프셋된 슬롯 (그림 2 h)에 결과 입력 합니다. 13 µ m (광 disector의 높이) 최고 오프셋된 수에서 뺍니다 고 맨 아래 오프셋된 슬롯 (그림 2i)에 결과 입력 합니다. 다음 매개 변수를 선택 합니다: 단계, 14; 크기, 1.00 (그림 2i).
    참고:이 연속 이미지 사이의 1 µ m 거리 13 µ m의 z 평면에 두께에 해당.
12. (그림 2j) 파일을 저장할 디렉터리를 선택 합니다.
13. 클릭 " 시퀀스 " (그림 2j) 수집을 시작 하.
14. 클릭 " 처리 " 고 다음과 같은 매개 변수 선택: " 모든 비행기 "에서 " 순서; " " 몽타주; "와 " 빠른 " 및 " 바느질 " 상자, 10% (그림 2)의 이미지 중복. 시작을 클릭 하 여 이미지를 " 시작 ".
    참고: 분석에 대 한 스택 이미지 생성 됩니다 (그림 2 l, 그림 3a -e).

3. Stereological 평가 순서

1. NIH ImageJ 소프트웨어 버전 4.7 사용 하 여 SN 스택 이미지의 분석을 수행.
2. ImageJ.nih.gov 웹사이트에서 필요한 두 개의 플러그인 다운로드:는 " 그리드 오버레이 " 플러그인 ¹⁵와 " 셀 카운터 " 플러그인 ¹⁶. 설명 된 대로 두 플러그인 설치.
3. 편견된 stereological 평가 대 한 다음과 같은 세 매개 변수 정의: 그리드 크기 130 x 130 µ m; 계산 프레임, 50 x 50 µ m; 광 disector 높이, 13 & #181, m.
4. 클릭 하 여 이미지를 열고 " 파일 " → " 오픈 " (그림 4a)를 사용 하 여 이미지 축척을 설정에 " 분석 " → " 비율 설정 " 명령 (그림 4b). 이 단계에 대 한 정의 된 크기에서에서 변경 픽셀 µ m (그림 4c).
   참고: 분석 된 이미지에 대 한 425 픽셀 100 µ m에 해당.
5. 선택은 " 플러그인 " → " 그리드 " → " 격자 유형: 라인 " 그리드를 무작위로 삽입 하는 명령. 검사는 " 임의의 오프셋 " 상자. 130 µ m x 130 µ m으로 grid (그리드 사각형) 내 하나의 사각형의 크기를 정의 = 16900 µ m ² ( 그림 3b 및 그림 4 d 및 e).
6. 변경 이미지에서 유형 16-비트 RGB 색상 (클릭 " 이미지 " → " 유형 " → " RGB 색상 ") (그림 4 층). Baquet 외에 설명 된 대로 SNpc를, 찾습니다 ¹⁷.와 SNpc를 둘러싸 자는 " 페인트 브러시 도구 " (브러쉬 폭: 11) ( 그림 3 c 및 그림 4 g -난).
7. 실행 취소는 " 비율 설정 " 클릭 하 여 명령 " 분석 " → " 비율 설정 " → " 제거 규모를 클릭 " (그림 4j -l) 오히려 픽셀에 계산의 성능을 사용할 수 있도록 µ m 보다.
8. 화면 (그림 4 m)를 확인 하 고 이미지 파일 저장 ImageJ (그림 4n)으로 새 파일을 엽니다. 선택 " 포인트 " (그림 4o)와 25 (그림 4 p)의 브러시 폭. 그 연락처는 SN 광학 disector (그림 4 분기)의 배치에 대 한 모든 그리드 사각형을 표시 합니다. 개요 SN 부분적으로 또는 완전히 지역화 된 모든 광학 disectors에 셀 수의 분석을 수행.
9. SN의 부분을 포함 한 그리드 사각형을 선택 합니다. ImageJ는 x와 y를 정의 하에 커서를 놓고이 사각형의 왼쪽된 위 모퉁이 좌표 (4r 그림)와 함께 시작 하는 측정.
   참고: 광 disector를 사용 하 여 위치에 대 한 삽입 됩니다 좌표는 " 광학 disector 위치 " (그림 4s), 4 단계에서 설명한 대로.
10. , 스프레드시트 서식 파일을 사용 하 여 광학 disector 위치를 계산 " 광학 disector 위치, " 4 단계에서 설명한 대로.
11. 보정 광학 disector (매크로 추가 파일 크리스토퍼 S. 구 음)를 클릭 하 여 " 플러그인 " → " 매크로 " → " 편집 " (그림 4t), 열은 " opt_dis_ grid.txt " (4u 그림) 파일, 그리고 정의의 크기는 " usergrid " x, y 차원 광학 disector (그림 4v)의 해당 픽셀에. 50 µ m x 50 µ m의 크기를 선택 하는 usergrid의 1 개의 측의 크기는 212.5 픽셀 (픽셀 50 x 4.25)로 정의 됩니다.
12. 광학 disector (그림 4v)의 중심을 정의 하는 ImageX와 ImageY 좌표를 삽입 하 여 스택 이미지에서 광학 disector의 위치를 결정 합니다. 매크로 실행 (" 매크로 " → " 실행 매크로 ") (그림 4w).
    참고: 격자 ( 3d 그림 및 그림 4 x) 스택 이미지에서 사라져 버릴 것 이다. Z-평면 ( 3e 그림 및 그림 4 x)에서 이동할 때 광 disector 유지 됩니다.
13. 선택 " 플러그인 " → " 셀 카운터 " 셀 카운터 플러그인 (그림 4y) 시작. 셀 카운터를 초기화 하 고 표식 유형 (그림 4z)를 선택 합니다. 이미지에 확대 (클릭 " + ") 200%의 확대에 핸드폰 번호의 stereological 평가 수행 하는 고.
14. 식별 dopaminergic 신경 perikarya 그들의 둥근 또는 ovoid 모양 및 셀 크기 ( 그림 1a). Stereological 규칙을 사용 하 여 셀의 수를 계량.
    참고: 광 disector 3 차원 큐브 ( 그림 5a) 이기 때문에, 왼쪽, 앞으로 제외 측 및 큐브 (빨간색)의 최고의 측면 정의 합니다. 따라서, 돈 ' t 수 회 + 셀 레드 라인 (왼쪽 및 전면) 또는 상단 측면의 접촉으로 그 어 서. 준비 된 스프레드시트 파일에는 셀의 결과 추가 "의 세포 수 계산 " (5 단계).
15. SN 이미지에 따라 계산 다음 셀 개수에 대 한 광학 disector를 다음 그리드 스퀘어 사용 하 여 x, y 단계 overlying 그리드 ( 그림 5b)의 크기와 " 광학 disector 위치 " 4 단계에서 설명한 대로 스프레드시트 서식 파일.
16. 셀 번호 사용의 추정을 수행는 "의 세포 수 계산 " 스프레드시트 (5 단계).

4. 광학 Disector 위치를 사용 하 여 계산 된 " 광 Disector 위치 " 스프레드시트 서식 파일

1. 계산 크기와 SN (윤곽선 overlying 그리드에 배치 각 광 disector의 위치 그림 5b) 사용 하는 " 광학 disector position.xlsx " 스프레드시트 파일 (파일 추가).
2. 삽입 µ m, 당 픽셀의 변환에 의해 정의 된 대로 " 비율 설정 " 명령의 노란색 표시 된 위치에는 " 광학 disector position.xlsx " 파일 ( 그림 6a와 보충 파일 ).
3. 광학 disector의 계획 된 크기와 삽입 (µ m)에서 1 개의 측의 길이 의해 정의 된 overlying 그리드의 모눈 정사각형의 크기 오렌지 표시 위치.
   참고: 결과 주황색 상자 옆에 있는 빨간 상자에 묘사 된다.
4. 시작 지점으로 결정 했다 SN 윤곽선 그리드 사각형으로 시작 (하나의 그리드 사각형 선정 되었다로 시작 되기 위하여는, 단계 3.9에서 같이 위의).
5. 삽입 x 및 y 좌표를 기준으로 측정 단계는 파일의 녹색 상자에 3.9에서 (이러한 값, x, y 좌표를 사용 하 여이 첫 번째 사각형 내에서 광학 disector의 센터 계산 되 고 결과 파란색 상자에 묘사에 대 한). Opt_dis_grid.txt 매크로 (추가 파일) 실행.
6. 첫 번째 그리드 사각형 (갈색 상자) 기준으로 그리드 스퀘어 거리 (사각형의 수 측정)를 삽입 하 여 x, y 좌표 연속 광 disectors의 계산.
   참고: + x: 그리드 사각형은 오른쪽; -x: 그리드 사각형은 왼쪽; + y: 그리드-광장은 아래쪽에 위치 하 고 있습니다. -y: 그리드 사각형은 상단에 위치 하 고 있습니다. 결과 회색 상자에 표시 됩니다.

5. 셀 번호를 사용 하 여 추정은 " 세포 수 계산 " 스프레드시트

1. 계산 수식을 사용 하 여 동물 (N) 당 회 + SN 셀의 예상된 수 출판 서쪽 외 알., 1991 년 ³, 어디 ∑ Q ^- 일 + 신경 한 뇌 섹션의 모든 광학 disectors에 계산의 총 수로 정의 됩니다.
   참고: 측정된 두께 (t) 섹션의 관련 광학 disector (h)의 높이 방정식에 포함 됩니다. 지역 샘플링 분수 (asf) 표 (x, y 단계)의 사각형 크기 내에서 광학 disector (광 disector) 프레임 크기의 영역 (A)의 비율으로 정의 된다 (광 disector/A x, y 단계) ( 그림 3b), 그리고 섹션 샘플링 분수 (ssf) 전체 직렬 컷된 두뇌의 섹션의 비율으로 정의 됩니다:
   
   양적 높은 품질을 보장 하기 위해 추정 계수 오류 (CE) 0.10 보다 낮은 되어야 합니다. Keuker 외에 의해 수식을 사용 하 여 CE 확인., 2001 년 ¹⁰:
   
2. 각각의 SN 내 휴대폰 번호 stereological 추정에 대 한 마우스, 마우스 당 생성 된 시리즈의 총 수, 광 disector, x, y 영역 광학 disector (µ m ²: 광 disector), x, y 영역 (x, y 단계 모눈 정사각형의 높이 대 한 지정 된 정보를 삽입 µ m ²에), 평균 측정 (µ m)에서 사용 하 여 노란색 상자에 섹션의 두께 " 셀 count.xlsx의 계산 " 스프레드시트 ( 그림 6b 파일 및 보조 파일 ).
3. 같은 동물에서 각 SN 섹션 5 단계에서 설명한 대로 분석.
4. 삽입 셀 카운트 회색 상자에 각 광 disector 한 SN 섹션을 참조를 사용 하 여 각 줄에서 " 셀 count.xlsx의 계산 " 스프레드시트 파일 (파일 추가).
   참고: 예상된 휴대폰 번호 및 계산 된 CE 파란색 상자 ( 그림 6b)에서 묘사 된다.

6. 상업적으로 사용 가능한 Stereology 시스템을 사용 하 여 셀 번호의 추정

1. 시작 dopaminergic SNpc의 추정 셀 번호를 클릭 하 여 " 프로브 " → " 광학 Fractionator 워크플로 " 광학 Fractionator 여 워크플로 창.
   참고: 새 창이 나타납니다-SN의 새 시리즈 계산 될 것 이다 확인.
2. 클릭 하 여 일 + SN 섹션의 새로운 시리즈를 시작 " 새로운 주제를 시작 " 팝업 창에서.
3. 광학 Fractionator 워크플로의 다른 단계를 통해 이동합니다. 첫 번째 단계에서 주제를 설정 합니다. 이 위해 조사를 삽입 ' s 이름, 주제, ' s 이름 (SN 그룹), 및 기타 유용한 정보. 이 SN에 대 한 계산 섹션의 숫자를 삽입 합니다. 잘라 조직 단면도의 두께 삽입 합니다. 4이 경우에 섹션 간격을 삽입 합니다. 시작으로 임의로 결정된 섹션 번호 삽입.
4. 두 번째 단계에서 설정 낮은 확대 (2 X 목표)을 선택 현미경 " 탄 창 렌즈 X 2 " 메뉴에서.
5. Baquet 외에 설명 된 대로 SNpc은 마우스 왼쪽된 버튼으로 관심 영역을 추적 3 단계에서., 2009 ¹⁷.
6. 4 단계에서 높은 확대에 현미경을 설정합니다. 이 위해 100 X 목표를 변경 하 고 선택 " 100 X 매기 렌즈 " 드롭다운 메뉴에서.
7. 5 단계에서 초점을 맞춤 으로써 섹션의 하단을 상단에 탑재 된 두께 측정.
8. 단계에서 6, 50 x 50 µ m로 계산 프레임 크기를 정의; 광학 disector (x, y)의 크기입니다.
9. 7 단계에서 체계적인 무작위 샘플링 (SRS) 격자의 크기 130 x 130 µ m 설정.
10. 8 단계에서 3 µ m 감시 영역을 입력.
11. 9 단계에서 설정을 저장.
12. 는 마지막으로, 광학 Fractionator 워크플로의 단계 10에서에서 SRS 격자 내에서 광학 disectors의 각 목 + dopaminergic 셀을 계산합니다. 이 클릭 하 여 시작 된 " 계산 " 버튼.
13. 클릭 한 부분을 마치고는 " 다음 섹션 시작 " 같은 SN 시리즈의 다음 SN 섹션의 광학 Fractionator 워크플로 시작 하는 버튼.
14. 1 SN 시리즈의 마지막 SN 섹션 계량 되었습니다 때 클릭 " 나 ' ve 완료 센다. "
15. 클릭 합니다 " 결과 보기 " stereology 샘플링의 결과 표시 하려면 단추.

결과

제시 방법, 일 + 오른쪽 SN 7,363 및 7,987 세포 사이 원거리로 하 고, SN, 왼쪽에서 dopaminergic 신경의 예상된 번호를 사용 하 여 7,446 및 7,904 세포 사이. 따라서, dopaminergic 신경 (± SEM)의 평균 수 SN 오른쪽과 왼쪽 SN 7,675 ± 66에 대 한 7,647 ± 83 셀 이었다. 각 동물에 대 한 계산 된 CE는 0.08 보다 낮은 (범위: 0.073 0.079) (그림 7). 상업적으로 사용 가능 하 고 전문 ster...

토론

Stereology는 조직 처리를 시작합니다. SN 조직의 직렬 절단 stereological 분석 하는 동안 섹션의 손실을 방지 하기 위해 신중 하 게 수행 되어야 합니다. 또한, 하나의 필수 단계 stereology 수행할 때 SN 왼쪽에서 오른쪽을 구별 하기 위해 한 반구를 표시 하는. Brainstem의 상단 부분에 작은 구멍을 배치 제시 연구에서 최상의 결과 생성. 또한, 조직이 광학 fractionator 방법 요구 작업 이후 약 30-40 µ m 보다는 더 ?...

자료

Name	Company	Catalog Number	Comments
Paxinos mouse atlas			The Mouse Brain George Paxinos Keith B.J.FranklinCopyright @2001 by Academic Press CD Rom designet & created by Paul Halasz
brain matrix slicer mouse	Zivic Instruments	BSMAS 001-1
paraformaldehyde	Merck	1040051000
sucrose /D(+) Saccharose	Roth	4621.1
isopentane	Roth	3927.1
glycerol	Merck	1040931000
Ethanol	Sigma Aldrich	32205-1L
Name	Company	Catalog Number	Comments
phosphate buffered saline ingredients:
sodium chloride	Sigma Aldrich	31434-1KG-R
potassium dihydrogen phosphate	Merck	1048731000
di-sodium hydrogen phosphate dihydrate	Merck	1065801000
potassium chloride	Merck	1049360500
normal goat serum	Dako	X0907
bovine serum albumin	Sigma	A4503-100G
Triton X-100	Sigma Aldrich	X100-100ml	detergent
3,3-Diaminobenzidine-tetrahydrochlorid/DAB tablets 10mg pH 7.0	Kem En Tec	4170
H2O2/ Hydrogen peroxide 30%	Merck	1072090250
avidin/biotin reagent	Thermo Scientific	32050	Standard Ultra Sensitive ABC Staining Kit, 1:100
rabbit anti mouse tyrosine hydroxylase antibody	abcam	Ab112	1:1000
biotinylated goat-anti-rabbit IgG H+L	vector laboratories	BA-1000	1:100
StereoInvestigator version 11.07	MBF
BX53 microscope	Olympus
Visiview	Visitron Systems GmbH	3.3.0.2
Axiophot2	Zeiss
ImageJ software	NIH	Version 4.7
Tissue-TEK OCT	Sakura	4583
dry ice
grid overlay plugin	Wayne Rasband		https://imagej.nih.gov/ij/plugins/graphic-overlay.html
cell counter plugin	Kurt de Vos		https://imagej.nih.gov/ij/plugins/cell-counter.html).
optical disector macro	Christopher Ward
C57Bl/6N male mice	Charles River, Germany
SuperFrost Plus coated object slides	Langenbrinck, Germany
25G needle Microlance 3	BD	300400
REGLO Analog Infusion pump	Ismatec	ISM 829
StereoInvestigator system			StereoInvestigator version 11.07
BX53 microscope			BX53 microscope
self-assorted stereology			Visiview
Axiophot2			Axiophot2