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요약

형광 단백질 기반 접근 호스트 세포에 박테리아에 의해 은닉 하는 이펙터를 모니터링 하는 도전입니다. 형광 단백질 및 유형 III 분 비 시스템 간의 비 호환성 때문입니다. 여기, 최적화 된 분할 superfolder GFP 시스템 호스트 식물 세포에 박테리아에 의해 은닉 하는 이펙터의 시각화 사용 됩니다.

초록

박테리아, 다양 한 식물 질병의 원인이 되는 가장 중요 한 에이전트 중 하나는 호스트 식물 세포 식물 면역 체계를 파괴에 effector 단백질의 집합을 분 비. 감염 시 세포질 이펙터 유형 III 분 비 시스템 (T3SS)를 통해 호스트 cytosol에 전달 됩니다. 식물 세포에 배달, 후에 effector(s) 생존 및 병원 체의 복제에 대 한 호스트 세포 프로세스를 변조 하는 것 특정 compartment(s) 대상. 비록 pathogenicity에 형광 단백질을 사용 하 여 그들의 기능을 이해 하는 호스트 셀에 effector 단백질의 subcellular 지역화의 박테리아에서 직접 주입 하는 이펙터의 역학 조사에서 일부 연구 하고있다 T3SS와 형광 단백질 간의 비 호환성으로 인해 도전 하고있다.

여기, 우리가 호스트 셀에서 세균 T3SS 통해 전달 하는 이펙터의 지역화를 시각화 하기 위해 최적화 된 분할 superfolder 녹색 형광 단백질 시스템 (sfGFPOPT)의 최근 우리의 방법을 설명 합니다. sfGFP11 (11번째 β 물가의 sfGFP)-태그 이펙터는 T3SS을 통해 분 비 사이트에서 형광 방출에 표적으로 하는 특정 세포 기관이 sfGFP1-10선택 (1-10번째 β 물가의 sfGFP) 행간 조립 될 수 있다. 이 프로토콜 애기 Nicotiana benthamiana 식물에 특정 세포 기관이에 슈 도모 나 스 syringae 에서 effector 단백질으로 재구성된 sfGFP 형광 신호를 시각화 하는 절차를 제공 합니다.

서문

식물은 수많은 침입 병원 체 포함 박테리아, 곰 팡이, 바이러스, 곤충 및 nematodes 그들의 수명 주기 동안 발생 하는 착 유기 체. Phytopathogens, 중 녹 종 등 Ralstonia 종, 그램 음성 세균성 병원 체 상처 또는 stomata 및 hydathode 같은 자연 구멍을 통해 입력 하 여 그들의 호스트 식물을 감염1. 성공적으로 호스트 식물 식민지로 세균성 병원 균 독성 요인2의 다양 한 개발을 진화 했다. 박테리아는 기 주 식물을 침공, 그들은 일련의 독성 단백질 주사-이펙터로 알려진-그들의 pathogenicity 홍보를 식물 세포에 직접. 이 이펙터 억제 또는 공장 타고 난 면역을 조절 하 고 세균 생존3결과 호스트 세포 프로세스를 조작.

병원 성 박테리아는 주로 호스트 셀4에 직접 효과 기 단백질을 제공 하는 T3SS를 사용 합니다. T3SS는 호스트 셀5의 사출 사이트 내부와 외부 세균 막 비 계 단백질 구조에서 연결 바늘 같은 채널 분자 주사기를 유사 합니다. 이 이펙터 T3SS 중재 (T3E) 분 비 메커니즘은 인간 뿐만 아니라 식물의 다양 한 그램 음성 세균성 병원 체에 잘 보존. 대표적인 식물 병원 체, P. syringae pv 중 하나입니다. 토마토 DC3000 hrcC 돌연변이 일반적으로 결함이 있는 T3SS 완전히 억제 식물 면역 (effector 단백질을 주입)에 의해6에이 돌연변이의 무 능력으로 인해 식물에 성장을 제한 했다. 호스트 세포로 전, 시 이펙터 대상 다양 한 호스트 단백질 등 식물 방위 응답, 유전자 전사, 세포 죽음, 프로테아좀, 소포 매매, 호르몬 경로7 호스트 셀 시스템에 대 한 중요 한 , 8 , 9 , 10. 따라서, 추적 호스트 셀에 effector 단백질의 세포질 지 방화의 식물 면역의 변조에 관하여 그들의 기능을 이해 하는 매력적인 대상 이다.

T3Es의 지역화 연구의 대부분 Agrobacterium-중재 overexpression 호스트 식물9큰 형광 단백질으로 고용 했다. 그러나, 다른 종에 도입 된 유전자의 분리 식 방법 잘못 지역화 된 또는 때때로 작동 하지11,,1213되도록 표시 되었습니다. 또한, 여러 연구 결과 세균성 이펙터는 호스트 셀14,15,,1617에서 적절 한 대상에 대 한 수정 받을 밝혔다. 따라서, 세포 기능 또는 양적 이펙터 병원 체 감염18시 T3SS에 의해 전달 되는 동일 하지 않을 수 있습니다 식물의 cytosol에서 이펙터 뚜렷이 표현. 또한, 대형 형광 태그 effector 단백질의 융합 적절 한 이펙터 배달 및 시각화18,19중단 될 수 있습니다. 따라서, T3E 함수 분석에이 접근 T3SS 분 비 이펙터의 네이티브 지역화를 완벽 하 게 반영 되지 않을 수 있습니다.

녹색 형광 단백질 (GFP)20발 색 단 포함 하는 중앙 물가 포함 하는 11-배가 좌초 하는 β-배럴의 구성 됩니다. Waldo 외. 작은 부품으로 구성 된 새로운 분할-GFP 시스템을 보고 (GFP β 물가 11; GFP11)와 대형 보완 조각 (GFP β 물가 1-10; GFP1-10)21. 조각을 스스로 형광 하지 않습니다 하지만 두 조각을 서로 가까운 근접에 있을 때 그들의 자기 협회에 형광. 단백질 접히는 효율성의 최적화에 대 한 강력한 접는 변종 GFP, 즉, sfGFP 및 sfGFP선택, 이후에 분할 GFP 시스템20,,2122개발 되었다. 최근, 단일 아미노산 돌연변이 sfGFP1-10선택-sfYFP1-10선택 및 sfCFP1-10선택-을 각각 sfGFP11 조각와 쇼 노란색과 청록색 형광 reconstitute 수, 생성 된23의 변형 . 또한, sfCherry, mCherry의 파생 분열 될 수 있다 sfGFP23와 같은 방식으로 sfCherry11와 sfCherry1-10 조각으로.

이 시스템은 고 살 모 넬 라24. 에서 이펙터를 사용 하 여 감염 동안 추적 하는 HeLa 세포에서 T3SS 이펙터에 맞게 되었습니다. 그러나, 그것은 이전 하지 최적화 호스트 식물 세균성 병원 체 시스템에 대 한. 최근에, 우리는 식물 세포25에 P. syringae 에서 전달 하는 T3Es의 subcellular 지 방화를 모니터링 하는 데 향상 된 sfGFP1-10선택 에 따라 분할 GFP 시스템 최적화. 식물 세포, 유전자 변형 애기 thaliana 집합에에서 다른 subcellular 구획을 T3Es의 지역화 연구를 촉진 하기 위하여 식물 다양 한 subcellular 구획 에서에서 sfGFP1-10OPT 를 표현 하기 위해 생성 된 25. 또한, 다양 한을 운반 하는 플라스 미드 세포 기관이 대상 sfGFP1-10선택 Agrobacterium에 대 한-중재 과도 overexpression 이펙터 T3SS 기반 배달에 대 한 sfGFP11 태그 벡터 또한 생성 했다. 다양 한 유전자 변형 애기 라인과 관심의 T3Es을 표현 하는 플라스 미드의 씨앗 테이블의 자료26,27에서 언급 한 소스에서 얻을 수 있습니다.

다음 프로토콜에서 우리는 분할 sfGFP 시스템을 사용 하 여 호스트 세포에 박테리아에 의해 전달 하는 이펙터의 역학을 모니터링 하는 최적화 된 시스템을 설명 합니다. SfGFP1-10선택 유전자 변형 녹 sfGFP11 재조합 플라스 미드를 들고와 표현 하는 식물의 감염 호스트 셀으로 모나 스 에서 sfGFP11 태그 이펙터의 전달 결과. 따라서, 이러한 단백질 재구성 되 고 특정 이펙터 대상 compartment(s)에 이동. 슈 도모 나 스 syringae pv입니다. 토마토 18 이펙터 삭제 됩니다, CUCPB5500 스트레인이이 스트레인 A. thaliana 및 북 아 일 benthamianas28에 낮은 또는 없음 세포 죽음을 보여주 때문에 사용 되었다. 그러나, 모든 자료와 여기에 설명 된 단계 교체 수 있습니다 또는 다른 생물학 질문 또는 지정 된 실험실 조건에서 최적화의 조사를 위해 분할 sfGFP 시스템에 맞게 수정.

프로토콜

참고: 모든 단계는 수행 실 온에서 달리 명시 하지 않는 한.

1. 식물 재료 (4 주)의 준비

  1. 명. benthamiana 식물에 대 한 준비
    1. 명. benthamiana 의 각 냄비의 토양 표면에 2 씨앗을 뿌리 다, 플라스틱 돔 트레이 커버 및 25 ° C, 16/8-h 명암 photoperiod 사이클 60% 습도 성장 챔버에에서 발 아를 씨를 허용.
    2. 2 주 후, 선택 하 고 각 냄비에 작은 경종을 폐기 단계 1.1.1에서에서 발 아에 대 한 적용 동일한 성장 조건 하에서 식물 성장을 계속. 매 2 일 트레이 당 물 1 리터를 추가 합니다.
      참고: 식물의 성장 조건 실험실에서 달라질 수 있습니다. 따라서, 건강 한 상태에 있는 식물을 성장 하는 일반 급수 프로토콜을 따릅니다.
    3. 일주일에 새로운 용지함에 식물을 전송 하 고 추가 성장 위한 충분 한 공간이 그들을 주선. 계속 그들은 나이의 4 주에 침투 될 준비가 될 때까지 단계 1.1.1에서에서 설명한 조건 하에서 식물 성장.
      참고: 식물 성장 연구소에서 성장 상태에 따라 달라질 수 있습니다. 일반적으로, 우리는 그 4 주 된 찾을 명. benthamiana 식물 약 6 잎 곰.
  2. A. thaliana 유전자 변형 식물에 대 한 준비
    1. 테이블의 자료 를 참조 하 고 유전자 변형 애기 씨앗 주문.
    2. 1 mL의 증류수에 50-100 유전자 변형 애기 씨를 담근 다 고 발 아의 발병을 동기화를 어둠 속에서 3 일 동안 4 ° C에서 그들을 저장 합니다.
    3. 플라스틱 돔 트레이 커버와 플러그 공장 트레이의 토양 표면에 2 ~ 3 씨를 뿌리 다. 23 ° C, 10/14-h 명암 photoperiod 사이클 60% 습도에서 발 아 씨앗을 허용 합니다.
      참고: 씨앗 homozygotes 이어야 한다입니다. 그러나, 일괄 처리에 있는 transgene의 존재를 재확인 하는 것이 좋습니다. 이 경우에, 2 분, 표 백제 50% 70% 에탄올으로 세척 하 여 씨앗을 소독 (약 2% 차 아 염소 산) 5-6 시간 살 균 두 배 증류수 (ddH2O)로 세척 하 여 5 분에 대 한 triton X-100 따라 0.05%를 포함 하. 살 균 후 4 ° C에서 3 일 동안 충 하 고 유전자 변형 식물 선택 hygromycin B의 25 µ g/L를 포함 하는 식물 발 아 미디어에 접시.
    4. 주 후에, 플러그 당 하나의 공장 두고 단계 1.2.3 사용 동일한 성장 조건 하에서 식물 성장을 계속.
      참고: 4 주 오래 된 식물 P. syringae 감염을 위해 사용 되었다. 물 식물 매일 식물의 건강을 유지.

2. 모나 스 문화 (~ 1 주)의 준비

  1. 모나 스 변환에 대 한 플라스 미드의 건설
    1. 테이블의 자료 를 참조 하 고 이펙터 T3SS 기반 배달 시스템 벡터25의 원하는 vector(s)를 주문.
    2. 사이트별 재결합25복제를 사용 하 여 이펙터 배달 벡터에 관심의 이펙터 유전자를 삽입 합니다.
      참고: 전체 길이 effector 단백질의 subcellular 지 방화, 모니터링 넣어에 전장 유전자 pBK-GW-1-2 또는 pBG-GW-1-2. 그것은 또한 pBK-GW-1-4를 선택할 수 또는 pBG-GW-1-4 포함 된 2에 대 한 x sfGFP11 증가 형광 신호. 신호 펩 티 드 부족 부분 이펙터, 경우 pBK-GW-2-2 또는 pBK-GW-2-4를 사용 합니다. 공원 외. 이펙터 배달 벡터25에 대 한 자세한 내용은 참조 하십시오.
  2. P. syringae pv sfGFP11 태그를 융합 하는 이펙터를 들고 플라스 미드를 변환. 토마토 (태평양 표준시) CUCPB5500 표준 electroporation29를 사용 하 여.
    참고: 필요한 경우 다른 녹 종자를 사용할 수 있습니다. SfGFP11 태그 시스템은 벡터30 의 광범위 한 범위에 대 한 구성 하 고 있는 이펙터의 유전자 발현 비교와 함께, 예를 들어, 슈 도모 나 스 fluorescens (이 단)31AvrRpm1 발기인에 의해 규제 됩니다.
  3. 임금의 B 한 천 배지 100 µ g/mL 리 팜 피신과 25 µ g/mL 대 또는 25 µ g/mL gentamycin 포함의 표면 변형 된 세균성 세포를 부드럽게 확산. 2 일 동안에 28 ° C를 품 어.
  4. 킹의 B 액체 미디어 사용, 벡터에 대 한 적절 한 항생제로 한 식민지를 접종 하 고 200 rpm에서 떨고와 28 ° C에서 하룻밤 세포 성장.
  5. 글리세롤 재고를 확인 합니다. 50%-80 ° c.에 게의 최종 농도에 압력가 글리세롤을 추가

3. 과도 식 세포 기관이 대상 sfGFP1-10선택 북 아 일 benthamiana (4 일)에서

  1. Agrobacterium 문화의 준비
    1. 주문 sfGFP1-10선택 plasmid(s) 세포 기관이 대상의 원하는 vector(s) ( 테이블의 자료를 참조).
    2. plasmid(s) Agrobacterium tumefaciens 스트레인 GV3101 셀32변환. 2 일 동안 50 µ g/mL 대와 28 ° C에서 50 µ g/mL 리 팜 피신 보충 Luria Bertani (파운드) 한 천 매체에 세포 성장.
    3. 파운드 한 천 매체에 단 하나 식민지에서 50 µ g/mL 대와 50 µ g/mL 리 팜 피신 보충 액체 LB 미디어의 5 mL로 세포를 접종. 200 rpm에서 떨고와 28 ° C에서 하룻밤 세포 성장.
    4. 10 분에 대 한 3000 x g에서 원심 분리 하 여 세포 표면에 뜨는 미디어에서 부와 갓의 1 mL에 펠 릿을 resuspend 수확이 했다 침투 버퍼를.
    5. 600의 흡 광도에서 광학 밀도 (OD) 값을 얻어서 Agrobacterium 의 수량을 측정 nm (Abs 600 nm). 0.5 침투 버퍼와 함께 박테리아의 세600 조정 합니다.
      참고: 서 스 펜 션의 1 mL 두 개의 관광 명소에 침투 하기 충분 하다.
    6. 실 온에서 문화를 침투 하기 전에 1-5 h에 대 한 부드러운 로커에 둡니다.
    7. 10 µ L 팁으로 침투 하는 나뭇잎의 중심에 구멍을 찌른. 1 mL needleless 주사기를 사용 하 여 침투 Agrobacterium 정지. 신중 하 고 천천히 주사 약 500 µ L 주사기를 통해 잎 adaxial 측면에 3.1.5 단계에서 준비 하는 정지의. 실험적인 복제에 대 한 적어도 3 개의 다른 식물에 침투를 반복 합니다.
      참고: 건강과 안전 이유를 위해 눈 보호 침투 동안 착용 되어야 한다.
    8. 잎에 남아 있는 세균 현 탁 액 떨어져 닦 고 침투 지역의 경계를 표시.
    9. 2 일 동안 단계 1.1.1 사용 동일한 성장 조건 하에서 침투 식물 유지.

4. 접종의 모나 스 (4 일)

  1. 2 일 동안 28 ° C에 적절 한 항생제와 킹의 B 천 미디어에 2.5 단계에서 글리세롤 재고에서 행진 변형된 녹 스트레인.
    참고: 녹 의 건강이 매우 중요 합니다. 식민지를 잘 형성 하지 않는다, 세포를 다시 행진 또는 진행 하기 전에 임금의 액체 매체에 있는 셀을 전파.
  2. 마 니 톨 조미료 (MG) 액체 미디어 28 ° C에서 하룻밤을 위해 200 rpm에서 떨고 있는 녹 셀의 loopful 접종
  3. 수확 10 분에 대 한 3000 x g에서 원심 분리에 의해 셀 부 표면에 뜨는 미디어 어 펠 릿 10 mm MgCl2, resuspend 고 명 benthamiana 잎 및 0.002 (1 x 106 세600 0.02 (1 x 107 cfu/mL)을 조정 cfu/mL) 애기 단풍. 에 대 한
  4. 명. benthamiana에 대 한 녹 서 스 펜 션 sfGFP1-10선택 구문을 들고 Agrobacterium 이전 (3.1.7 단계)에서 2 일을 침투 했다 잎의 영역으로 침투. sfGFP1-10선택 유전자 변형 애기, 대 두 4 주 오래 된 짧은 하루 성장 잎으로 녹 서 스 펜 션에 침투.
    참고: 적어도 3 개의 식물 실험 복제 필요 합니다.

5. sfGFP 신호 Confocal 현미경 검사 법 (1 일)을 통해 관찰

  1. 녹에서 잎 디스크 잘라-잎을 주사. 모나 스의 침투 후 특정 시간 점에, 40 X confocal 시스템 스캐닝 레이저를 사용 하 여 단일 공장에서 두 개의 2 cm2 잎 디스크 이미지 / 1.2 나 C-Apochromat 물 침수 목표 또는 63 / 0.8 X 나 C-Apochromat 기름 침수 목적입니다. 부상에 의해 살해 하는 죽은 세포를 방지 하려면 침투 구멍에서 세포를 관찰 합니다.
  2. 488 nm 아르곤 레이저의 저전력 설정에서 관측을 시작 합니다. 레이저 파워 sfGFP 탐지를 증가.
    참고: 우리가 일반적으로 형광 신호를 찾으려면를 레이저 강도의 2-15%를 사용 합니다. 그러나, 레이저 파워와 검색 설정을 조정 해야 사용자의 현미경 시스템에 따라. 여기, 방출 필터 520-550 nm로 설정 했다. 죽은 세포는 종종 488 nm 레이저 여기 아래 자동-형광 방출. 따라서, 부정적인 컨트롤 sfGFP11 태그를 하지 않고 같은 이펙터 침투 하 고 동일한 관측 조건 하에서 관찰 될 해야 합니다. 또한, 높은 레이저 여기 엽록소 autofluorescence를 유도할 수 있다. 따라서 엽록소 autofluorescence 유도를 하지 않도록 제어 식물 세포를 사용 하 여 레이저 강도 조정 합니다.
    1. 세포 벽의 counterstaining에 대 한 리프 디스크 관찰 전에 5-10 분에 20 m m propidium 요오드 화물 (PI)을 침투.
    2. 얼룩이 핵에 대 일 분 뒤에 물으로 세척 하 여 0.1 %paraformaldehyde 리프 디스크 잠수함. 그런 다음, 10mm, PI 리프 디스크 현미경 관찰 하기 전에 5-10 분에 침투. 실험 3 번 이상 반복 합니다.
      참고:이 단계는 아닙니다 중요 하지만 원형질 막 또는 핵에 이펙터 지역화를 정의 하는 데 도움이. 관심의 이펙터에 특정 세포 기관이 그들의 지역화 면, 주어진된 세포 기관이 대 한 마커를 사용 하 여는 이펙터의 지역화를 확인.

결과

GFP의 β 배럴 구조 11 β 물가의 구성 이며, 두 조각, 1-10번째 가닥 (GFP1-10선택)와 11일 (GFP11) 가닥으로 나눌 수 있습니다. 비록 둘 다 2 개의 파편 스스로 형광의 자기 조립된 sfGFP 근접 (그림 1A)에 존재 하는 2 개의 파편 때 형광을 내보낼 수 있습니다. 이 시스템에서는, sfGFP1-10선택-식물 녹 sfGFP11 태그 이펙터를 들고?...

토론

여기에 설명 된 프로토콜 모니터링 호스트 식물 세포 감염 시 세균 T3SS에 의해 주입 하는 effector 단백질의 정확한 지역화에 사용 됩니다. 이전, 분할 GFP 시스템 포유류 단백질23,36의 subcellular 지 방화, 살 모 넬 라 T3E 지역화, Agrobacterium VirE2 납품에 T4SS 통해 공부 하는 도구로 사용 되었다는 식물 세포37. 식물 세포에서이 시스...

공개

저자는 공개 관심의 없습니다 충돌 있다.

감사의 말

이 연구는 기초 과학 연구 프로그램을 통해 국가 연구 재단의 한국 (NRF) 사역의 과학, ICT 및 향후 계획 (NRF-2018R1A2A1A05019892) dc 및 식물 분자 번 식 센터 (에서 교부 금에 의해 투자에 의해 지원 되었다 PMBC) 에피소드를 농촌 개발 관리 (PJ013201)의 다음 세대 Biogreen 21 프로그램의 우리 confocal 현미경 촬영을 제공 하기 위해 환경 관리에 대 한 국립 계측 센터의 이미징 센터를 감사 합니다.

자료

NameCompanyCatalog NumberComments
Arabidopsis transgenic linesPark, E., Lee, H. Y., Woo, J., Choi, D. & Dinesh-Kumar, S. P. Spatiotemporal Monitoring of Pseudomonas syringae Effectors via Type III Secretion Using Split Fluorescent Protein Fragments. Plant Cell. 29 (7), 1571-1584 (2017)
CYTO-sfGFP1-10ABRCCS69831
NU-sfGFP1-10ABRCCS69832
PT-sfGFP1-10ABRCCS69833
MT-sfGFP1-10ABRCCS69834
PX-sfGFP1-10ABRCCS69835
ER-sfGFP1-10ABRCCS69836
GO-sfGFP1-10ABRCCS69837
PM-sfGFP1-10ABRCCS69838
Organelle-targeted sfGFP1-10OPT plasmidPark, E., Lee, H. Y., Woo, J., Choi, D. & Dinesh-Kumar, S. P. Spatiotemporal Monitoring of Pseudomonas syringae Effectors via Type III Secretion Using Split Fluorescent Protein Fragments. Plant Cell. 29 (7), 1571-1584 (2017)
CYTO-sfGFP1-10Addgene97387
NU-sfGFP1-10Addgene97388
PT-sfGFP1-10Addgene97389
MT-sfGFP1-10Addgene97390
PX-sfGFP1-10Addgene97391
ER-sfGFP1-10Addgene97392
GO-sfGFP1-10Addgene97393
PM-sfGFP1-10Addgene97394
ER-sfCherry1-10Addgene97403
ER-sfYFP1-10Addgene97404
CYTO-sfCFP1-10Addgene97405
sfGFP11-tagged Gateway compatible vector for T3SS-based effector delivery systemPark, E., Lee, H. Y., Woo, J., Choi, D. & Dinesh-Kumar, S. P. Spatiotemporal Monitoring of Pseudomonas syringae Effectors via Type III Secretion Using Split Fluorescent Protein Fragments. Plant Cell. 29 (7), 1571-1584 (2017)
pBK-GW-1-2Addgene98250pAvrRpm1:GW:HA-sfGFP11:AvrRpm1t; Resistant to Kanamycin (25 ug/ml)
pBK-GW-1-4Addgene98251pAvrRpm1:GW:HA-2xsfGFP11:AvrRpm1t; Resistant to Kanamycin (25 ug/ml)
pBK-GW-2-2Addgene98252pAvrRpm1:AvrRPM1sp:GW:HA-sfGFP11:AvrRpm1t; Resistant to Kanamycin (25 ug/ml)
pBK-GW-2-4Addgene98253pAvrRpm1:AvrRPM1sp:GW:HA-2xsfGFP11:AvrRpm1t; Resistant to Kanamycin (25 ug/ml)
pBG-GW-1-2Addgene98254pAvrRpm1:GW:HA-sfGFP11:AvrRpm1t; Resistant to Gentamycin (25 ug/ml)
pBG-GW-1-4Addgene98255pAvrRpm1:GW:HA-2xsfGFP11:AvrRpm1t; Resistant to Gentamycin (25 ug/ml)
pBG-GW-2-2Addgene98256pAvrRpm1:AvrRPM1sp:GW:HA-sfGFP11:AvrRpm1t; Resistant to Gentamycin (25 ug/ml)
pBG-GW-2-4Addgene98257pAvrRpm1:AvrRPM1sp:GW:HA-2xsfGFP11:AvrRpm1t; Resistant to Gentamycin (25 ug/ml)
Bacterial strains
Agrobacterium tumefaciens GV3101Csaba Koncz and Jeff Schell, The promoter of TL-DNA gene 5 controls the tissue-specific expression of chimaeric genes carried by a novel type of Agrobacterium binary vector. Mol Gen Genet. 204,383-396 (1986); Resistant to gentamycin (50 ug/ml) and rifampicin (50 ug/ml)
Pseudomonas syringae pv. Tomato CUCPB5500Kvitko, B. H. et al. Deletions in the repertoire of Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000 type III secretion effector genes reveal functional overlap among effectors. PLoS Pathog. 5 (4) (2009).; Resistant to rifampicin (100 ug/ml)
Media components
Plant germination mediaAdd 2.165g/L Murashige & Skoog powder, 10 g/L sucrose to water. Adjust to pH 5.8 and add 2.2 g/L phytagel. Autocalve.
Murashige & Skoog medium including vitaminsDuchefa BiochemieM0222Store at 4 °C.
SucroseDuchefa BiochemieS0809
PhytagelSigma-AldrichP8169
LB mediaAdd 10 g/L tryptone, 5 g/L yeast extract, 10 g/L NaCl to water. For solid media, add 15 g/L micro agar. Autoclave.  Allow solution to cool to 55 °C, and add antibiotic if needed.
TryptoneBD Bioscience211705
Yeast extractBD Bioscience212750
NaClDuchefa BiochemieS0520
Micro agarDuchefa BiochemieM1002
King's B media10 g/L protease peptone #2, 1.5 g/L anhydrous K2HPO4, 15 g/L of agar to water. Autoclave. Cool down to 55 °C and add sterile 15 ml/L glycerol, 5 ml/L MgSO4 to the medium. Add antibiotics if needed.
Proteose peptoneBD Bioscience212120
Anhydrous K2HPO4Sigma-Aldrich1551128 USP
GlycerolDuchefa BiochemieG1345
MgSO4Sigma-AldrichM7506
Bacto AgarBD Bioscience214010
Mannitol-Glutamate (MG) liquid media Add 10 g/L of mannitol, 2 g/L of L-glutamic acid, 0.5 g/L of KH2PO4, 0.2 g/L of NaCl, and 0.2 g/L of MgSO4 to water. Adjust to pH 7
MannitolDuchefa BiochemieM0803
L-glutamic acidDuchefa BiochemieG0707
KH2PO4Sigma-AldrichNIST200B
Infiltration buffer10 mM MES (2-(N-morpholino)-ethane sulfonic acid), 10 mM MgCl2, 150 µM acetosyringone. pH 5.6; Prepare a fresh buffer before use.
MESDuchefa BiochemieM1503Prepare 100 mM (pH 5.6) stock in water. Filter sterilize.
MgCl2Sigma-AldrichM8266Prepare 100 mM stock in water. Autoclave.
AcetosyringoneSigma-AldrichD134406Prepare 150 mM stock in DMSO.
Confocal microscope equipments/materials
710 laser scanning confocal systemCarl Zeiss
Axio observer Z1 inverted microscopeCarl Zeiss
Propidium iodideThermoFisherP1304MP

참고문헌

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