백신 목적을 위해 결합된 부자연스러운 아미노산 통합 및 클릭 화학에 의해 생성된 균일한 글리코콘주게이트

요약

유전코드 확장은 정의된 부위에서 담체 단백질에 바이오트호고날 기능군을 베어링하는 부자연스러운 아미노산의 도입을 위해 적용된다. 바이오트호고날 기능은 균질성 글리코콘주게이트 백신을 제공하기 위해 탄수화물 항원을 선별적으로 결합하는 데 더 많이 사용된다.

초록

유전 코드 확장은 부자연스러운 아미노산 (UAA)을 단백질에 도입하여 특성을 수정하거나 새로운 단백질 기능을 연구하거나 만들거나 단백질 컨쥬게이트에 액세스 할 수있는 강력한 도구입니다. 스톱 코돈 억제, 특히 앰버 코돈 억제는 정의된 위치에서 UAA를 유전적으로 도입하는 가장 인기있는 방법으로 부상했습니다. 본명에서 생물요르토곤 기능성 군을 수용하는 UAA를 함유하는 담체 단백질의 제조에 적용된다. 이 반응성 손잡이는 다음에 균일한 글리코콘주게이트 백신을 제공하기 위해 합성 올리고당카이라이드 햅텐을 구체적으로 효율적으로 이식하는 데 사용할 수 있습니다. 프로토콜은 1:1 탄수화물 hapten/반송파 단백질 비율에서 글리코콘주게이트의 합성으로 제한되지만 수많은 바이오트호고날 기능성 군으로 만만치 않습니다. 글리코코콘주게이트 백신 균질성은 완전한 물리화학적 특성화를 보장하기 위한 중요한 기준이며, 이로 인해 점점 더 까다로운 약물 규제 기관의 권고, 고전적인 융합 전략에 의해 충족되지 않은 기준을 충족시다. 더욱이, 이 프로토콜은 실제 컨쥬게이트 백신의 구조를 미세하게 조정하여 구조-면역원성 관계를 해결하는 도구를 제공할 수 있게 한다.

서문

글리코콘주게이트 백신은 전염병의 예방 치료에 사용할 수 있는 백신 무기고의 필수 요소입니다. 그들은 젊은 유아를 포함하여 광범위한 연령 집단에서 안전하고, 잘 용납되고 능률적입니다. 그들은 수막구균, 폐렴구균 또는 혈우병 인플루엔자 형 b^1과같은 캡슐화된 박테리아에 의한 감염에 대한 최적의 방어를 제공한다. 글리코코콘주게이트 백신은 담체 단백질에 공동으로 연결되는 이러한 표면 발현 다당류^2를모방한 박테리아 또는 합성 올리고당류의 캡슐을 형성하는 정제된 세균다당류로 만들어집니다. 담체 단백질의 존재는 탄수화물 항원^3에의해 표현된 항원 결정제에 대하여 지시된 보호적인 유머 면역 반응을 승진시키기 위하여 필수적이다 3. 탄수화물 항원의 신중한 선택 및 생산 외에도, 글리코콘주게이트 백신의 효능에 영향을 미치는 것으로 알려진 특징은 담체 단백질의 성질, 융합 화학(사용되는 경우 링커의 성질 및 길이 포함), 또는 당캐라이드/단백질 비^3이다. 명백하게, 사카라이드가 단백질에 접합되는 위치뿐만 아니라 연결점의 수는 면역원성에 관련이 있습니다. 현재까지, 이 두 매개 변수는 글리코콘주게이트의 준비가 주로 경험적으로 남아 있기 때문에 거의 연구되지 않았습니다. 그들의 합성은 일반적으로 담체 단백질 서열에 존재하는 리신 또는 아스파르트/글루타믹 산 측 사슬 잔류물의 아민 또는 카복실산 기능의 사용에 의존한다. 이것은 단일하지만 글리코콘주게이트의 이질적인 혼합물로 이어집니다.

단백질내 아미노산 잔류물의 반응성, 접근성 또는 분포에 재생하면 saccharide/protein 연결^4의효과를 문서화하는 데 더 신뢰할 수 있는 보다 정의된 글리코콘주게이트가 발생합니다. 이러한 목표를 향한 한 걸음 앞으로 단백질 글리칸 커플링 기술, 세포 공장에서 제어글리코콘주게이트 백신의 생산을 허용하는 재조합 공정^5,6. 그러나, 글리코실레이션은 전적으로 D/EXNYS/T 세쿤 내의 아스파라진 잔류물에서 일어난다(X는 20가지 천연 아미노산 중 하나임), 담체 단백질에 자연적으로 존재하지 않는다.

사이트 선택적 돌연변이 발생 및 특히 시스테인의 편입이 고도로 선택적 반응성을 악용하는 대안^7,8로나타난다. 그들의 순서에 UAA를 통합하는 담체 단백질의 생산은 균일한 글리코콘주게이트 백신 준비를 위한 더 많은 융통성을 제공할 수 있습니다. 100개 이상의 UAA가 개발되어 다양한 단백질^9,10에추가로 통합되었다. 그들 중 많은 사람들이 일반적으로 포스트 번역 수정을 수행하거나 생체 물리학 프로브⁽¹² 또는 약^13)를 이식하는 데 사용되는 생물 ororthogonal 기능을 포함하지만 탄수화물 항원과의 추가 연상을위한 이상적인 핸들입니다. 성공적인 예는 세포 없는 단백질 합성을 사용하여 생명공학^14에 의해 주장되었습니다¹⁵ 그러나 이 전략에 따라 글리코콘주게이트 백신의 준비는 아직도 대중화되기를 기다립니다.

돌연변이 된 담체 단백질의 생산을 위한 생체 내 전략의 적용은 tRNA(도 1)16에 UAA의 전송을 구체적으로 촉매하는 특정 코돈, 코돈 및 아미노 아필 -tRNA 신디사이저 (aaRS)를 인식하는 tRNA를 포함하는 변형 된 번역 기계를 필요로한다( 도^{1) 16.} pyrrolysine 앰버 스톱 코돈 억제는 UAA, 특히 propargyl-lysine (PrK)^17을통합하는 가장 널리 사용되는 방법 중 하나입니다. 후자는 아지도 기능성 탄수화물 햅텐과 반응하여 완전히 정의된 균일한 글리코코콘쥬게이트를 제공할 수 있습니다. 본 원고에서는 알킨 핸들을 운반하는 UAA인 propargyl-L-lysine을 합성하는 방법, 박테리아에서 번역하는 동안 표적 단백질에 통합하는 방법, 마지막으로 수정된 단백질과 클릭 화학을 사용하여 아지드 기능을 운반하는 햅텐 사이의 연상을 수행하는 방법을 설명합니다.

프로토콜

1. UAA의 합성 : propargyl-리신 (PrK)

1. N ^α합성 -Boc-propargyl-리신¹⁸
   1. 500 mg의 Boc-L-Lys-OH(2.03 mmol)를 플라스크에 수성 1 M NaOH(5mL) 및 THF(5mL)를 혼합하여 블래스크에 넣고 플라스크에 실리콘 중격을 맞춥니다.
   2. 얼음 욕조에서 플라스크를 식힌 다음 교반하는 동안 미세한 고리를 사용하여 158 μL의 프로파일 클로로포메이트(1.62mmol)를 드롭와이즈(2-3분 동안)를 넣습니다.
   3. 반응 혼합물을 실온에 데우고 10 시간 동안 계속 저어줍니다.
   4. 디틸 에테르 50mL, 수성 1M 염산 50mL, 얼음 욕조에서 에틸 아세테이트 60mL의 냉각 솔루션을 식힙니다.
   5. 얼음 목욕에서 조잡한 반응 혼합물을 식히고 혼합물을 분리 깔때기에 붓습니다. 50mL의 다이틸 에테르로 혼합물을 추출한다. 유기 층을 폐기하십시오.
   6. 조심스럽게 분리 깔때기의 수성 상에 수성 1 M 염산을 추가합니다. 그런 다음 에틸 아세테이트 30mL를 사용하여 수성 층을 두 번 추출합니다. L2 Cl_{2-메탄올(9:1)을}용출물로 사용하여 TLC에 의해유기상에서 N-Boc-propargyl-lysine의 존재를 확인합니다.
   7. MgSO₄위에 결합된 유기 층을 건조시키고, 고체 위상을 걸러내고 회전 증발기에 압력을 줄인 후 여과를 농축한다.
   8. 유정 N^α-Boc-propargyl-lysine의 시료를 유정 클로로폼(CDCl_3)에녹이고 ^1HNMR로 그 정체성을 제어합니다.
      주의: 추출은 압력이 축적될 수 있습니다. 압력 축적을 자주 해제합니다.
2. 부자연스러운 아미노산 프로파질-L-리신의 합성 (PrK)
   1. N^α-Boc-propargyl-lysine을 원형 하단 플라스크에 중격이 장착된 다.
   2. N^α-Boc-propargyl-lysine를 용해시키기 위하여 아르곤 의 밑에 플라스크에 안수성 디클로로메탄 (CH₂Cl_2)의4mL를 추가합니다.
   3. 교반하는 동안 주사기를 사용하여 4mL의 트리플루오로아세트산(TFA)을 드롭방향으로 넣습니다.
   4. RT에서 1h에 대한 반응 혼합물을 저어주세요.
   5. 반응 혼합물을 감압 하에 농축합니다.
   6. 다이틸 에테르를 원유 잔류에 넣고 4°C에서 1h로 배양하여 PrK를 침전시합니다. 더 높은 규모로 작업할 때 PrK가 완전히 침전되지 않으면 삼중하여 침전시키고 필요한 경우 잠복 시간을 연장합니다.
   7. 프릿드 유리에 흰색 고체의 형태로 PrK를 필터링합니다.
   8. D₂O에서 PrK의 알리쿼트를 녹입니다. 그런 다음 NMR 분석을 수행하여 ID와 순도를 제어합니다.
   9. 추가 사용을 위해, 100 mMM의 최종 농도에서 증류수에 부자연스러운 아미노산 PrK를 용해하고 -20 °C에서 1 mL 알리쿼트로 저장합니다.

2. PrK에 의해 변형 된 재조합 단백질의 생산

1. 플라스미드 준비
   1. 표적 성숙한 폐렴구균 표면 접착제A(mPsaAA) 유전자(pET24d-mPsaAK32TAG-ENLYFQ-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH)를 구성합니다. ET24d-mpPsaA-WT는 pET24d 플라스미드의 BamHI 및 XhoI 제한 부위 사이의 삽입을 복제하여 담배 에칭 바이러스(TEV) 프로테아제 시퀀스를 따랐다. 이것은 단백질의 C 종자에서 그의₆ 태그를 소개합니다. 기존의 현장 지향 돌연변이 발생 기술을 사용하여 리신-32의 코돈을 호박 코돈(TAG)으로 교체한다.
   2. 메타노사르키나 미제이(MmPylRS)로부터 의 피롤리실-tRNA 합성제및 이전에 설명된^19와같은 해당 tRNA^Pyr에 대한 유전자 코딩 유전자코딩유전자에 대한 코딩유전자의 2개의 사본을 포함하는 제2발현 플라스미드(pEVOL-MmPylRS)를 구성한다. UAA의 효율적인 통합을 위해 특별히 설계된 플라스미드 벡터 pEVOL을 사용합니다.
      참고: 자세한 플라스미드 정보는 보충 파일 1에설명되어 있습니다.
2. 플라스미드를 표현 균주로 공동 변환
   1. 화학적으로 유능한 에체리치아 대장균 BL21(DE3)의 100μL 알리쿼트를 얼음 위에 5분 간 해동시다.
   2. 각 플라스미드(각 플라스미드의 50-100 ng)의 1μL을 세포에 넣고 얼음에 30분 동안 배양합니다.
   3. 42°C에서 42°C의 인큐베이터에서 해동된 유능한 셀로 1.5mL 마이크로튜브를 전송한 다음 2분 동안 얼음으로 다시 이동합니다.
   4. LB 배지의 900 μL을 추가하고 항생제 발현을 허용하기 위해 37°C에서 1시간 동안 흔들어서 배양합니다. 그런 다음 박테리아를 LB 한루에 카나마이신 25μg/mL, 클로람페니콜 30 μg/mL로 플레이트합니다. 37°C에서 하룻밤 사이에 박테리아의 성장을 허용하십시오.
3. PrK로 변형된 단백질의 발현
   1. 항생제 (카나마이신의 25 μg /mL 및 클로람페니콜의 30 μg/mL)와 LB 매체의 5 mL에서 단일 공동 변형 식민지를 접종합니다. 37°C에서 하룻밤 동안 배양하여 흔들어 보시합니다.
   2. 1차 배양(5mL)을 항생제를 함유한 자동 유도 배지 500mL로 희석하고, L-아라비노스의 0.02%, 부자연스러운 아미노산 PrK의 1mMMM로 희석하여 24시간 동안 37°C에서 배양한다. wt 단백질을 함유하는 클론의 배양을 수행함으로써 프릭없이 배양하고 양성 대조를 이겨음으로써 음의 대조를 포함한다.
   3. 500mL 배양 배지 중에서 알리쿼트 5mL 및 원심분리기는 5,000 x g에서10분 동안. 상체를 버리고 펠릿을 -20 °C에서 동결하십시오. 나머지 495mL에서 5,000 x g에서10분 동안 원심분리에 의해 세포를 수확한다. 상체를 버리고 펠릿을 -20 °C에서 동결하십시오.
4. SDS-PAGE 및 서부 블롯 분석을 통해 5mL 배양 샘플에서 원유 세포 추출물 분석
   1. 5mL 셀 펠릿을 250 μL로 리시스 버퍼(50mM Na₂HPO 4/NaH₂PO_4,150mM NaCl, pH 8, 5mM imidazole, 0.2 mM PMSF)로 재배치하여 1.5mL 마이크로튜브로 전송한다.
   2. 액체 질소의 튜브를 동결하여 세포를 lyse, 42 °C 목욕에 해동하고 30 s에 대한 고속으로 소용돌이. 이 단계를 3번 반복합니다.
   3. 원심분리기 샘플은 17,000 x g에서 10분 동안 세포 이물질을 제거합니다.
   4. 상체의 10 μL을 가지고 5 μL의 물과 5 μL의 적재 버퍼 (브로모페놀 블루, SDS, β-mercaptoethanol)를 추가합니다. 샘플을 100°C에서 5분 동안 가열하고 SDS-PAGE 및 서부 블롯 분석을 수행합니다.
5. 니켈-NTA 구슬을 이용한 중력 유동 벤치 친화성 크로마토그래피에 의한 단백질 정제
   1. 세포 펠릿(495mL 배양으로부터)을 20mL로 리시스 버퍼(50mM Na₂HPO_4/NaH2PO_4,150mM NaCl, pH 8, 5mM imidazole, 0.2 mM PMSF)로 되돌리펜한다.
   2. DNase I(1 mg/mL)와 리소지메 500 μL(50 mg/mL)을 현탁액에 넣고 30분 동안 37°C에서 서스펜션을 배양하여 리시스를 허용합니다.
   3. 5 분 동안 세포를 초음파 처리 (5 s-5 s의 사이클, 진폭 50%) 그런 다음 30분 동안 20,000 x g에서 원심분리로 세포 이물질을 제거하고 0.45 μm 필터에 여과합니다.
   4. 서스펜션에 Ni-NTA 수지를 추가하고(세포 배양 500mL용 500 μL)를 넣고 4°C에서 1시간 동안 부드럽게 섞는다.
   5. 서스펜션을 폴리프로필렌 컬럼에 붓고 언바운드 분수를 수집합니다.
   6. 수지 10mL의 세척 버퍼로 50m Na₂HPO₄/NaH₂PO_4,150 mM NaCl, 10 mM imidazole를 함유한 세척 버퍼로 세척하십시오. 수지 5mL(50m Na₂HPO_4/NaH2PO_4,150mM NaCl, 20m mM imidazole)로 수지세척을 두 번째로 세척합니다. 세척 분획을 수집합니다.
   7. 용출 완충제 1mL(50mM Na₂HPO_4/NaH2PO_4,150mM NaCl, 300 mM imidazole)로 태그된 단백질을 엘테. 이 단계를 4번 반복하고 모든 용출 분수를 수집합니다.
   8. 12% 아크릴아미드 젤로 SDS-PAGE의 7가지 정화 분획뿐만 아니라 원유 용액을 분석합니다.
   9. 순수히 그의 태그 단백질을 함유한 분획을 결합하고 투석막(컷오프 MW 6000-8000 Da)을 사용하여 하룻밤 사이에 TEV 프로테아제 버퍼(50m Tris-HCl, 0.5mM EDTA, pH 8)에 대해 투석합니다. mPsaA에 대한 37 360cm^-1∙M-1의음어 멸종 계수와 34.14 kDa의 분자량으로 280 nm에서 단백질의 농도를 측정한다.

3. TEV 프로테아제 소화에 의한 히스티딘 태그 제거

1. 단백질 샘플을 50mL 튜브로 수집하고 2 mg/mL 농도에서 최대 1mL까지 TEV 버퍼(50m Tris HCl, 0.5mM EDTA, pH 8)를 추가합니다.
   참고: 농도는 이전 결과에 따라 달라질 수 있습니다. 우리가 테스트 한 단백질 농도는 전형적인 2-3 mg /mL 범위에 있습니다.
2. TEV 프로테아제 100 μL을 추가하십시오(소화할 단백질 20μg에 10단위의 TEV 프로테아제 10단위를 함유한 1μL을 추가합니다).
3. 0.1 M 디티오스리톨(DTT)의 50 μL을 추가합니다.
4. TEV 버퍼(50m Tris HCl, 0.5mM EDTA, pH 8)를 최대 5mL로 완료합니다.
5. 느린 흔들림으로 4 °C에서 하룻밤 동안 배양하십시오.
   참고: 소화가 완료되지 않은 경우 TEV 프로테아제더를 더 추가하고, 더 오랜 시간 동안 또는 최대 30°C의 높은 온도에서 배양합니다.
6. 소화단백질을 4°C에서 하룻밤 사이에 제거하고 인산염 완충액(50m MM Na₂HPO 4/NaH₂PO_4,150mM NaCl, 150m MM NaCl, 5mm imidazole)을 사용하여 투석막(컷오프 6000-8000 Da)을 이용하여 밤새 EDTA를 제거한다.
7. TEV 프로테아제와 소화되지 않은 단백질을 제거하려면 Ni-NTA 구슬과 혼합을 배양하고 4°C에서 1시간 동안 부드럽게 섞습니다.
8. 서스펜션을 폴리프로필렌 컬럼에 붓습니다. 언바운드 분획을 수집하고 5mL의 세척 버퍼로 컬럼을 세척(50mM Na₂HPO_4/NaH2PO_4,150mM NaCl, 10mM imidazole)
   참고: 관심 있는 단백질은 언바운드 및 세척 분수에서 회복되어야 합니다.
9. 열에 5mM ML의 용출 버퍼(50m MM Na₂HPO 4/NaH₂PO_4,150mM NaCl, 300mM imidazole)를 추가하여 TEV 프로테아제와 소화되지 않은 단백질을 엘테우테한다. 280 nm및 SDS-PAGE 분석을 통해 단백질 함량의 분획을 확인하십시오.
10. 소화되지 않은 단백질을 대조군으로 SDS PAGE에 소화된 샘플을 적재하여 소화효율을 확인합니다.
11. 투석막(컷오프 6000-8000 Da)을 통해 하룻밤 사이에 4°C에서 1L의 클릭 버퍼(50mM Na₂HPO_4/NaH2PO_4,pH8)에 대해 소화된 단백질을 투석하여 이미다졸을 제거하고 완충제교환, mPsaA의 mPsaA의 mPsaA(37 360cm^-1∙M-1 및 MW 34.14 kDa)의 mm 소멸 계수 및 분자량으로 280 nm에서 단백질의 농도를 측정한다.

4. 클릭 화학에 대한 부자연스러운 아미노산 propargyl-lysine 접근성 및 기능의 평가

참고: 클릭 화학에 대한 Presolski 외^20에 의해 설명된 프로토콜을 사용하여 6헥사클로로-플루오레세인 아지드로 MVPaA를 컨쥬게이트한다.

1. 2mL 마이크로튜브에 57.8 μM의 농도에서 PrK 돌연변이 단백질의 432.5 μL을 복용하십시오.
   참고: 알키네의 최소 농도 2 μM은 허용됩니다. 단백질 농도가 낮으면 원심 농축기로 농축하거나 아지드/알킨 어어비를 증가시켜 반응의 균형을 선호한다.
2. 5mM 6-헥사클로로-플루오레세인 아지드의 10μL을 추가한 다음 20mM에서 CuSO₄ 용액의 2.5 μL과 트리스(벤질트리아졸릴메틸)의 7.5μL(주용액 농도)의 프리믹스를 추가합니다.
   1. 수성 100mM 아미노구아니딘 염산염 25 μL을 추가합니다.
   2. 20 mg /mL의 25 μL을 추가하여 아스코바테 나트륨의 수성 용액을 현시대적으로 준비했습니다.
   3. 튜브를 닫고 여러 번 반전하여 혼합하고 실온에서 2 시간 동안 배양하십시오.
   4. 0.5 M EDTA의 50 μL을 추가하여 반응을 중지합니다.
   5. 반응 혼합물의 15 μL을 가지고 마이크로 튜브를 넣고, 적재 버퍼 (브로모페놀 블루, SDS, β-mercaptoethanol)의 5 μL을 추가, 5 분 동안 100 °C에서 혼합물을 가열 한 다음 12 % 아크릴아미드 젤로로드합니다. 이동 후 312 nm에서 UV 빛 아래 젤의 형광 회합을 시각화합니다.

5. 클릭 화학에 의해 아지도 기능성 탄수화물 항원 (Pn14TS-N_3)와mpPsaA의 연상

1. 커플링
   1. 57.8 μM에서 PrK 돌연변이 단백질의 432.5 μL을 2mL 마이크로튜브로 섭취하십시오.
   2. 물에 5mM Pn14TS-N 3^21의 10 μL을 추가한 다음 CuSO₄ 용액의 2.5 μL을 20mMM에, THPTA7.5 μL을 50mMMMM에 추가합니다.
      참고: Pn14TS-N_3의합성, 연쇄상 구균 폐렴 혈청형 14 캡셀 폴리사카라이드를 모방한 테트라사카라이드, 참조 21에 기술되었다. 이론적으로, 아지드 기능을 함유하는 임의의 탄수화물 항원도 사용될 수 있다.
   3. 100mM 아미노구아니딘 염산염의 25 μL을 추가합니다.
   4. 20 mg /mL의 25 μL을 아스코바트 나트륨의 수성 용액을 익시적으로 준비했습니다.
   5. 튜브를 닫고, 여러 번 반전하여 혼합하고 2 시간 동안 RT에서 배양하십시오.
   6. 0.5 M EDTA의 50 μL을 추가하여 반응을 중지합니다.
   7. 15 μL의 샘플을 취하고 SDS-PAGE에서 분석하십시오.
2. 글리코콘주게이트의 젤 여과 정제
   1. 글리코콘주게이트를 스테릭 배제 아가로즈 컬럼(15 x 600 침대 치수, 3,000-70,000 분수 범위)에 적용하여 글리코콘주게이트를 정화하여 100mM PBS 버퍼로 평형, pH 7.3은 280nm의 검출을 통해 0.8mL/min 의 흐름으로 평가된다.
   2. 글리코콘주게이트를 함유한 분획을 수집합니다.
      참고: 장기간 보관을 위해 글리코콘주게이트를 H_2H의1L에 대해 2시간 동안 투석한 다음 4°C에서 투석막(절단 Mw 6000-8000 Da)을 사용한 다음 동결 건조하고 글리코콘주게이트를 -80°C에 보관합니다.

결과

이 프로젝트에서, 균일한 글리코콘주게이트 백신은 정의된부위(도 1)에서UAA를 도입하기 위한 호박스톱 코돈 억제 전략을 사용하여 제조하였다. 폐렴구균 표면 접착제 A는 담체 단백질 모이티로 선택되었다. 이 단백질은 염충균 폐렴^22의모든 변종에 의해 높게 보존되고 표현된다. 그것은 고액 면역원성 및 이전에 폐렴구균 백?...

토론

현장 지향 돌연변이 발생은 글리코콘주게이트 백신^7,8,14를준비하는 것을 목표로 거의 사용되지 않는 단백질의 정의된 위치에 특정 아미노산을 통합하는 간단한 전략이다. 20가지 천연 아미노산 접근법에 기초한 고전적인 돌연변이 발생은 번역 기계의 수정이 필요하지 않으므로 매우 효율적입니다. 시스테인 돌연변이는 일반?...

자료

Name	Company	Catalog Number	Comments
AIM (autoinductif medium)	Formedium	AIMLB0210	Solid powder
Boc-Lys-OH	Alfa-Aesar	H63859	Solid powder
BL21(DE3)	Merck Novagen	69450	E. coli str. B, F- ompT gal dcm lon hsdSB(rB-mB-) λ(DE3 [lacI lacUV5-T7p07 ind1 sam7 nin5]) [malB+]K-12(λS)
Dialysis membrane
DNAseI
Filter 0.45 µm
L-arabinose
lysozyme
Ni-NTA resin	Machery Nagel	Protino	Ni-NTA beads in suspension into 20% ethanol
Pall centrifugal device
pET24d-mPsaAK32TAG-ENLYFQ-HHHHHH	this study		same as pET24d-mPsaA-WT but with a K32TAG mutation in the mPsaA gene
pET24d-mPsaA-WT	this study		pET24d plasmide with the Wt mPsaA gene cloned between the BamHI and XhoI restriction sites with a TEV protease sequence followed by a His6 tag at the C-terminal end of mPsaA gene and carrying the Kanamycine resistance gene
pEVOL plasmid	gift fromEdward Lemke EMBL (ref 19)		plasmide with p15A origin, two copies of MmPylRS (one under GlnS promoter and one under pAra promoter), one copy of the tRNACUA under the ProK promoter, the chloramphenicol resistance gene
Propargyl chloroformate	Sigma-Aldrich	460923	Liquid
Sonicator	Thermo Fisher	FB120-220