시작하려면 터미널에 명령을 입력하여 Conda 환경을 활성화하십시오. 이 명령을 사용하여 대화형 Python Notebook을 엽니다. 원하는 폴더에 새 Python Notebook을 만들고 적절한 이름을 제공합니다.
그런 다음, 첫 번째 셀에서 명령을 실행하여 정렬 함수가 포함된 Python 파일을 가져옵니다. 신진 데이터를 세포 주기 단계 데이터로 사용하는 경우. 새 셀에서 명령을 실행하여 각 시점에서 budded 백분율을 포함하는 데이터 프레임을 가져옵니다.
그런 다음 함수를 새 셀에 입력하여 시작 데이터를 라이프라인 포인트 시간 척도에 맞춥니다. 다음으로, 새 셀에서 명령을 실행하여 실험 데이터 프레임을 Notebook으로 가져옵니다. 함수를 새 셀에 입력하여 실험 데이터를 라이프라인 시점 척도에 맞춥니다.
그런 다음 새 셀에 명령을 입력하여 라이프라인 정렬 데이터 세트를 다운로드합니다. 조건 2 RNAseq에서 수집된 신진 데이터는 정렬되지 않은 시간 척도(분)와 라이프라인 포인트의 정렬된 시간 척도 모두에 대해 시간 경과에 따른 맞대기 비율을 보여주었습니다. 선택된 시점에 대해 플롯된 조건 2 데이터 세트에 대해 수집된 유세포 분석 데이터는 데이터가 정렬에 의해 결정된 위상과 일치함을 보여주었습니다.