이 작품은 미국 육군 연구소와 미 육군 연구 사무실 부여 W911NF1110105 및 NSF 부여 IOS-1147097to 제이 Hegdé에 의해 부분적으로 지원되었다. 지원 또한 조지아 보건 과학 대학의 비전 발견 연구소에서 제이 Hegdé에 파일럿 보조금에 의해 제공되었다. 다니엘 Kersten은 교부금 ONR N00014-05-1-0124와 NIH R01 EY015261 의해 일부 한국의 국립 연구 재단을 통해 교육 과학 기술부의 지원을받는 WCU (세계 클래스 대학) 프로그램 (R31-10008에 의해 지원되었다 ). 카린 Hauffen는 미국 육군의 학부 연구 견습 프로그램 (URAP)에 의해 지원되었다.

1. VM을 사용하여 자연 가상 3-D 객체 만들기 <ol><li> 디지털 배아를 만들려면 디지털 배아 워크숍 사용 (이슬을, 표 1 참조). 각 실행은 단일 배아 14, 주어진 실행 (그림 1)에 사용되는 설정 (또는 &#39;유전자형&#39;)의 주어진 집합에 고유 한 모양을 생성합니다. 배의 &#39;세포&#39;는 삼각형 14로 표현됩니다. <ol><li> 배아의 원하는 번호를 생성 할 필요에 따라 몇 번으로 프로그램을 실행합니다. </li><li> 더 복잡한 모양을 원하는 경우, 배아의 세포가 분열하는 횟수 즉, 성장 사이클의 수를 늘리십시오. 이 또한 프로그램을 느리게됩니다. 이 디지털 배아가 아닌 다른 가상 객체를 생성 할 필요가있는 경우, 상업적으로 이용 가능한 3-D 모델링 도구를 사용하거나 상용 벤더 (표 1)에서 가상 객체를 얻습니다. </li></ol></li><li> 그것은 가상 객체를 저장하는 일반적으로 것이 좋습니다개체가 즉시 상용 3-D 모델링 툴킷로 가져올 수 있도록 같은 OBJ와 같은 일반적으로 사용되는 파일 형식에 s입니다. 이를 위해, 이슬은 기본적으로 OBJ 형식의 개체를 씁니다. </li><li> 시각적 자극은 3-D 모델링 및 렌더링 환경 (표 1)를 사용하여 하나 이상의 디지털 배아를 사용하여 생성 할 수 있습니다. 등의 방향, 크기, 조명, 표면 질감 및 (그림 2 참조) 원하는 자극을 만들 배경을 다양한 표준 그래픽 작업을 사용합니다. </li></ol> 2. VP를 사용하여 자연 개체 카테고리 만들기 <ol><li> 개체 카테고리를 생성하려면 위의 단계 1.1 프로세스의 목표 조합 (그림 3) 9,10,12,13를 사용하여 주어진 조상 (또는 &#39;부모&#39;) 객체의 자손 (또는 &#39;아동&#39;) 생성합니다. <ol><li> 일부 방법은 변형이나 주요 부품 (3 단계와 4 이하 참조) 부드러운 형상 변형, 작업 bett를 만들 아래에 설명어 모든 입력 개체가 세포의 동일한 번호와 객체의 정점들 사이에서 일대일 대응이있을 경우. 경우 이러한 개체를 만들 경우, 셀의 수를 변경하지 않으며 (참조, 예를 들어, 그림 3에서 G 3 세대 G 2) 물체 사이에 정점의 일대일 통신을 유지합니다 만 VM 프로세스를 사용합니다. 예를 들어, 세포 분열 및 프로그래밍 세포 죽음은 세포의 수를 변경하고, 개체의 특정 쌍의 정점 사이의 일대일 대응을 결정하기 위해 (17,18 불가능하지는 않았지만) 더 힘들어을합니다. 주어진 개체에 세포의 수를 변경하는 프로세스도 그 모양의 복잡성을 변경합니다. 일반적으로 세포의 큰 번호, 객체의 큰 모양의 복잡성과 그 표면 부드럽게. </li><li> 디지털 배아가 아닌 다른 필요한, 가상 객체가 VP에 입력 (그림 4)로 사용 할 수 있습니다. </li></ol></li><li> 기능 19 주어진 분포를 달성하기로 특정 카테고리 내의 개체가 더 있으므로 선택할 수 있습니다. 예를 들어, 하나는 선택적으로 객체 크기의 bimodal 분포를 생성하기 위해 특정 카테고리에서 중간 크기의 개체를 제거 할 수 있습니다. </li><li> 모든 카테고리에 대한 가능한 형태 정보를 측정하는 보편적 최적 단일 방법이 없으며, 분류 모든 개체에게 20-22를위한 최적 한 가지 방법이 있습니다. 따라서, experimentor 손 20-22시 해당 범주 및 전산 목표에 따라이 방법을 선택해야합니다. 4 단계이 가능 형상 정보의 다양한 측면을 조작하기위한 일반적으로 사용되는 방법을 설명합니다. </li><li> 카테고리 주어진 쌍 사이의 유사성은 객관적으로 가능한 phylogenetic 방법에게 23,24를 사용하여 측정 할 수 있습니다. 예를 들어, 카테고리 주어진 쌍 사이의 수직 (또는 &#39;진화&#39;) 거리가 같은 계층 CL에 의해 측정, R 통계 툴킷의 방법을 ustering는 카테고리 유사성 25,26의 목적 측정 한 것입니다. </li></ol> 3. 모양 변화 만들기의 추가 방법 : 디지털 변형 <ol><li> 한 개체의 각 정점이 다른 개체 (. 즉, 꼭지점 사이에 일대일 대응이있는 개체)의 정확히 하나의 정점에 해당되도록 개체의 쌍을 감안할 때, 변형은 간단 17,18,27-29입니다 :이 년 사건은 두 객체 사이의 부드러운 변화 (또는 &#39;morphs&#39;는) 자연스럽게 해당 정점과 normals (그림 5) 사이의 보간에 의해 생산됩니다. 선택한 객체의 쌍에 따라 변형이 카테고리 내에 새 카테고리 또는 추가 아동 될 것이다. <ol><li> 그림 5에 표시된 개체는 선형 변형 27-29를 사용하여 만들어졌습니다. 개체는 사용 가능한 다른 변형 기술 17,18의 광대 한 배열에 의해 (또는 뒤틀린) 변형 할 수 있습니다. </li&gt; </ol></li><li> 변형 형상의 목표 배포를 만들려면, 그에 따라 보간 점을 선택합니다. </li></ol> 4. 모양 변화 만들기의 추가 방법 : 주요 구성 요소 <ol><li> 형상 변화를 생성하는 주요 구성 요소를 사용하려면, 하나는 먼저 주요 구성 요소 15를 결정해야합니다. 주요 구성 요소는 그들에게 26 결정에 사용되는 객체의 주어진 관련이 있습니다. 좋은 결과를 얻으려면, 정점 26 사이의 일대일 대응으로 최소 30 개체를 사용합니다. </li><li> 평균 객체를 생성 N 입력 객체의 원하는 집합에서 별도로 모든 객체에서 각 정점의 좌표와 정상을 평균하여. 따라서, x는 주어진 정점 k를의 조정 X의 평균 등등 모든 N 객체의 정점 k를 좌표를, 그리고해야합니다. </li><li> MATLAB 기능 princomp을 사용하여N 객체의 주요 구성 요소를 결정합니다. 이것은 해당 N-1 고유 값 26과 함께 N-1이 아닌 제로 고유 벡터를 생성합니다. </li><li> 새 개체를 생성하는 특정 주요 구성 요소의 J P 전, 해당 고유 값 λ i와 원하는 중량 w j를하여 i를 P 증식 및 평균 객체에 추가합니다 : J = + w J λ 전 P 전 </li><li> 각각의 고유 한 w j는 고유의 객체를 생성합니다. 부드럽게 w를 변화함으로써, 하나는 주어진 주요 구성 요소를 따라 부드러운 형상 변화를 만들 수 있습니다. </li><li> 독립적 인 형상 치수를 따라 모양 변형을 만들려면 다른 주요 구성 요소를 사용하여 4.4 단계를 반복합니다. </li><li> 주어진 주요 구성 요소를 따라 모양 원하는 분포를 만들려면 w의 원하는 분포를 사용합니다. &lt;/ 리&gt; <li> 모양의 다차원 격자를 만들려면 몇 가지 주요 구성 요소 각각에 대해 가중치 집합을 사용 : <img alt="수식이" fo:src="/files/ftp_upload/3358/3358eq2highres.jpg" src="/files/ftp_upload/3358/3358eq2.jpg" /></li></ol> 5. 3-D 객체의 Haptic 버전 만들기 <ol><li> 3-D prototyper (또는 3-D &#39;프린터&#39;)를 사용하여 &#39;인쇄 아웃&#39;3-D 객체. 필요한 경우, 객체의 크기를 조정 사전 인쇄에 개체의 표면을 부드럽게. </li></ol> 6. 견본 신청 : 이미지 카테고리의 베이지안 추론 <ol><li> 영상 처리에서 중요한 작업은 주어진 관측 개체가 속해​​있는 카테고리를 유추하고 있습니다. 이 추론의 정확한 메커니즘은 알 수 있지만, 그 객체의 범주를 유추 할 수있는 주어진 이미지에 객체의 알려진 기능에 대한 정보를 사용하여 포함하는 연산과 생리적 증거 9,12,13,30-32 모두이 있습니다. 여기, 우리는 illustra합니다테 방법이 날개 과정은 베이지안 프레임 워크에서 작동 할 수 있으며, 어떻게 디지털 배아이 지역에 연구에 유용 할 수 있습니다. </li><li> 편의를 위해, 우리는 분류 작업이 바이너리이며, 카테고리 L (그림 3)에서 구별 카테고리 K에 관련되어 있다는 것을 가정 한 것입니다. C는 카테고리 변수가 될 봅시다. 우리는 추측됩니다 C = K 나 C I 카테고리 K 또는 L에 속하는 관찰 된 이미지 여부에 따라 = L. 분류에 대한 일반적인 접근 방식은 포함 : <ol><li> 카테고리는 이미지의 정보 제공 K 있다는 가능성을 계산, P를 표시된 (C = K | I); </li><li> 카테고리는 이미지에서 정보를 제공 L이라는 확률을 계산, P를 표시된 (C = L | I), 그리고 </li><li> 높은 확률로 카테고리를 선택. </li></ol></li><li> 다음, 우리는 간단을 위해 가정 한 것입니다정확히 하나의 바이너리 기능 F가 있는지. 이 기능은 하나의 이미지에있는 (F = 1 표시됨) 또는 이미지 (F = 0 표시됨)에서 결석 할 수 있습니다. 이 예는 그림 8에 표시된 &#39;정보 조각&#39;기능을 사용합니다. 정보 조각이 처음 Ullman 및 동료 33에 의해 설명되었다. 본 경우에서, 우리는 기능으로 그림 8에 표시된 이미지 템플릿, 그리고 0.69의 임계 값을 사용합니다. 이 기능은 특정 이미지 (그림 3 행 G3의 가장 오른쪽 이미지를 말)의 존재 여부를 확인하기 위해, 우리는 다음 단계를 사용합니다 : <ol><li> 이미지의 가능한 모든 지역으로이 템플릿을 밀어 있으며, 각 위치에서, 템플릿 및 기본 하위 이미지 사이의 정규화 된 상호 상관 관계의 절대 값을 계산합니다. </li><li> 가장 높은 값 (본 경우에서 0.60)으로 이미지 위치를 선택합니다. </li><li> 이 값이 임계 값 이상이면, 결론저 사람이 기능은 존재하고, 그렇지 않으면,이 불참하는 결론. 가장 높은 상관 관계 0.60 아래 0.69의 문턱이기 때문에 우리의 경우, 우리는 기능이 이미지의 결석 결론. </li><li> 이러한 기능을 사용하는 근거와 기능을 선택하고 자신의 임계 값이 보고서의 범위를 벗어나므로 다루지 않습니다,하지만 결정의 메커니즘은 심판이 판결에 자세히 설명되어 있습니다. 33, 30. </li></ol></li><li> 기능 기반 추론의 틀 내에서, 우리는 내가, 이미지의 관찰자 추출물 모든 정보가이 기능의 가치에 포함되어 있다고 가정합니다. E, 그 P (C | I). = P (C | F). 따라서 작업이된다 주어진 이미지 (현재 또는 결석), 컴퓨팅 P (C = K | F)에 F의 값을 결정 및 그와 P (C = L | F)는 값이 F에 대한, 그리고 카테고리를 선택과 높은 probability. </li><li> 베이지안 프레임 워크에서, </li></ol><img alt="수식 3" fo:src="/files/ftp_upload/3358/3358eq3highres.jpg" src="/files/ftp_upload/3358/3358eq3.jpg" /> 따라서, <img alt="방정식 4" fo:src="/files/ftp_upload/3358/3358eq4highres.jpg" src="/files/ftp_upload/3358/3358eq4.jpg" /> 과 <img alt="수식 5" fo:src="/files/ftp_upload/3358/3358eq5highres.jpg" src="/files/ftp_upload/3358/3358eq5.jpg" /> 두 방정식의 분모가 동일합니다. (| F C = K) 및 P 따라서, P를 비교할 수 (C = L | F), 그것은 분모를 계산하는 필요가 없습니다, 대신에, 수량을 계산하기에 충분한 것입니다 P (C = K | F) α P (C = K) P (F | C = K) 과 P (C = L | F) α P (C = L) P (F | C = L) 일ESE는 때때로 &#39;unnormalized 확률&#39;이라고합니다. &#39;가능성&#39;이라고 | (C F)라는 용어는 P (C)는 &#39;이전&#39;이라는, 그리고 용어 P입니다. <ol start="6"><li> 편의를 위해, 우리는 가정합니다 전에 &#39;평면&#39;: P (C = K) = P (C = L) = 0.5. </li><li> (| C F), 주어진 카테고리 C의 이미지의 특정 기능 값의 확률이 작업은 P를 계산하는 지금입니다. <ol><li> (| C = L F = 1), 기능 범주 L의 이미지에 있는지 확률 우리는 P를 계산하는 예로서 카테고리 L의 여섯 이미지 (그림 3)을 사용합니다. </li><li> P을 계산하기 위해 (F = 1 | C = L) 먼저 L에 속하는 모든 교육 이미지를. 다시 말하지만,이 그림 3에 표시됩니다. </li><li> 각 이미지를 들어, 기능 값이 1 (존재 여부를 확인등 (6.3.1)에 설명) 또는 0 (결석), - (6.3.3). 우리의 경우, 그림 3의 여섯 이미지, 값은 : [0, 0, 1, 0, 1, 0]. </li><li> 기능 값이 1 인에서 이미지의 일부를 계산합니다. 우리의 경우는 육분의이 = 0.33입니다. </li><li> 따라서, P (F = 1 | C = L) = 0.33. 정확한 견적을 얻기 위해 유의 한 수업 당 최소 30 이미지를 사용해야합니다. </li><li> 비슷한 방식으로, 우리는 계산 할 수있는 P (F = 0 | C = L) = 0.67, P (F = 1 | C = K) = 0.83, P (F = 0 | C = K) = 0.17. </li></ol></li><li> 이 값을 감안할 때, 추론을 수행 할 수 있습니다. 우리가 새로운 이미지 (그림 9)을 제공하고, 작업의 범주 레이블을 결정하는 것입니다하는 가정합니다. 이것은 다음과 같이 수행됩니다 : <ol><li> (6.3.3) - 우리는 (6.3.1)에 설명 된대로 기능 F는 이미지의 존재 여부를 확인합니다. 우리의 경우, 유한 요소 분석법에진짜야는 현재이기 때문에, F = 1. </li><li> 방정식 (1)를 사용하고 (2), 그리고에 계산 값 (6.7.5) - (6.7.6)는, 우리는 계산 할 수있는 P (C = K | F = 1) = 0.42 및 P (C = L | F = 1) = 0.17. </li><li> 이 정보를 감안할 때, 그것은 이미지가 상대적으로 낮은 자신감을 갖고, 카테고리 K의 것을 결론 합리적입니다. </li></ol></li><li> 이 생물학적 체계 (말 psychophysically)에서 이러한 접근을 테스트 할 재미 있고 유용 할 수 있습니다. 이 경우, 행동 예측이 이루어과 같은 (6.8.2)에서 얻은 것과 같은 계산 결과와 비교 될 수 있습니다. 정확한 예측을 만들려면, P의 좋은 추정치 (F | C) 필요합니다. 이러한 추정은 그러나, 익숙한 개체를 얻을하기 어려울 수 있습니다. 그 이유는 즉 P의 피사체의 견적 (F | C) 직접 관찰 할 수 있으며,이 주제부터를 계산하는 것은 매우 어려운되지 않습니다자연 이미지의 사전 노출 통제 할 수없는 알 수없는 것입니다. 디지털 배아가 실험에 사용하는 경우 반면에, 다음 정확하게 주제에 노출되어있는 배아와 배아 카테고리 제어 할 수 있습니다. 이 쉽게 주제에 노출 된 동일 데이터를 관심 수량을 계산 할 수 있습니다. 그 피사체가 자연 범주와 같은 분류 전략을 사용하는 그 가능성이 만드는 것이므로 배아 &#39;외관은 자연이라는 사실은 도움이됩니다. </li></ol>

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관심 없음 충돌이 선언 없습니다.

인지 과학 연구의 VM 및 VP의 유용성 우리는 이전에 세부 l9 ,10,12-14에 VM과 VP의 유용성을 설명하고 있습니다. 이 소설을 만들기위한 원칙과 유연성 방법하지만, 자연 3-D 개체 14을 제공하기 때문에 간단히, VM, 특히 디지털 배아 방법이 유용합니다. 마찬가지로, VP는 자연 범주에게 9,10,12,13를 만드는 원리 방법을 제공합니다. 이 카테고리는 자연 계층 경향, 그리고 내 및 카테고리에서 기능 변화가 분류하기위한 독립적으로 실험과 알고리즘의 발생 사실 등의 자연 속에서 객체 범주와 VP 공유 많은 기능에 의해 생성 된 객체의 카테고리를 지적 가치 그 39. 현재 제한 사항 및 향후 방향 미래의 일에 대한 프로토콜과 방향의 세 가지 현재의 제한은 그들이 제안하는특히 주목할만한 위치 : 첫째, VM 및 VP 모두 생물학적 과정을 시뮬레이션. 우리는 비 생물학적 가상 개체가이 프로세스를위한 기판으로 사용할 수 있습니다 것을 보여 있지만, 기본 프로세스는 여전히 생물학적 동기입니다. 그러나, 자연물 - 모두 생물과 비 생물이 - 비 - 생물학적 힘에 의한 형태 변화를 거칩니다. 예를 들어, 바위 때문에 이러한 침식이나 침전 등의 지질 학적 프로세스 형태로 변경 될 수 있습니다. 바위의 새로운 카테고리가 다른 같은 지질 학적 과정에서 발생할 수 있습니다. 그것은 가능한 형태 변경 알고리즘의 레퍼토리로 이러한 프로세스를 통합 할 수 비교적 간단해야합니다. 우리 프로토콜의 두 번째 주요 제한은 동적 형상 변경 현재 레퍼토리가 오히려 제한된다는 점입니다. 이 같은 생물학적 움직임, 또는 바람, 물이나 중력 같은 외부 힘에 의한 운동과 같은 형태의 변화 큰 배열을 포함하는 것이 바람직하다. 우리는 wil 기대제가 동적 형상 변경 사항을 구현하기 위해 알려진 컴퓨터 애니메이션 알고리즘을 데려 올 상대적으로 간단합니다. 우리 프로토콜의 세 번째 주요 제한은 VM이 현재 gastrulation 36, 특히, 등 많은 다른 알려진 morphogenetic 프로세스를 포함하지 않습니다 것입니다. 또한 때문에 세포 벽 (36)의 같은 공장에서 morphogenesis이 가능한 거의 없거나 전혀없는 셀 운동, 성장에 의해 완전히 매개되어 있다는 사실로 알려진 제약, 통합되지 않습니다. 마찬가지로, VP는 유전자 표류 40 다른 알려진 phylogenetic 프로세스가 포함되어 있지 않습니다. 이러한 한계를 해결하면 발달, 생태 및 진화 시뮬레이션에서의 프로토콜의 사용을 촉진 크게 도움이 될 것입니다.

<table border="1"><tbody><tr><td> 툴킷 / 장비의 이름 </td><td> 회사 소개 / 저자 </td><td> 카탈로그 # </td><td> 코멘트 </td></tr><tr><td> 디지털 배아 워크숍 (이슬) </td><td> 마크 브래디와 댄 번지 </td><td></td><td> 이 사용자 친화적 인 메뉴 구동 도구에서 다운로드 1로 무료 다운로드 할 수 있습니다 <a href="http://www.hegde.us/DigitalEmbryos" target="_blank">http://www.hegde.us/DigitalEmbryos</a> . 는 Windows에 현재 사용할 수 있습니다. </td></tr><tr><td> Cygwin을위한 디지털 배아 도구 </td><td> 제이 Hegdé와 카린 Hauffen </td><td></td><td> 이 그리 사용자 친화적하지 프로그램의 느슨한 모음입니다. 그들은 Windows 용 Cygwin 리눅스 에뮬레이터의 명령 줄 인터페이스에서 실행하도록 설계되어 있습니다. 이 프로그램은에서 다운로드 2로 다운로드 할 수 있습니다 <a href="http://www.hegde.us/DigitalEmbryos" target="_blank">http://ww</a>w.hegde.us / DigitalEmbryos. Cygwin 인터페이스 자체는에서 무료로 다운로드 할 수 있습니다 <a href="http://www.cygwin.com" target="_blank">www.cygwin.com</a> . </td></tr><tr><td> 오토 데스크 3ds 맥스, 몬트리올, 퀘벡, 캐나다 </td><td> 오토 데스크 미디어 및 엔터테인먼트 </td><td> 3DS 맥스 </td><td> 이 유연한 플러그인 아키텍처 및 내장 된 스크립트 언어와 3-D 모델링, 애니메이션, 렌더링 툴킷입니다. 현재 운영 체제의 대부분에서 사용할 수 있습니다. </td></tr><tr><td> MATLAB </td><td> Mathworks 주식회사, Natic​​k, MA, USA </td><td> MATLAB </td><td> 이 많은 유용한 추가 기능 기능 수치 컴퓨팅 환경과 프로그래밍 언어입니다. 현재 운영 체제의 대부분에서 사용할 수 있습니다. </td></tr><tr><td> R 통계 툴킷 </td><td> 통계 컴퓨팅을위한 R 프로젝트 </td><td> R </td><td> 에서 다운로드 할 수 있습니다 무료로 담당 <a href="http://www.r-project.org/" target="_blank">http://www.rp</a>roject.org /. 현재 운영 체제의 대부분에서 사용할 수 있습니다. </td></tr><tr><td> OpenGL을 </td><td> Khronos 그룹 </td><td> OpenGL을 </td><td> 이 교차 언어, 크로스 플랫폼 그래픽 툴킷은에서 무료로 다운로드 할 수 있습니다 <a href="http://www.opengl.org" target="_blank">www.opengl.org</a> . </td></tr><tr><td> V-플래시 개인 프린터 </td><td> 3D 시스템 주식회사, 록 힐, SC, 미국 </td><td> V-플래시 </td><td> 이이 보고서에 설명 된 모든 3-D 인쇄 응용 프로그램에 대한 좋은 값입니다. 인쇄 자료도 3D 시스템에 의해 vended 있으며, 주식회사 저렴 모델은 RepRap (rapmanusa.com)와 MakerGear에서 오픈 소스 형태로 사용할 수 있습니다. 더 비싼 모델 (&gt; 30달러 K)는 Objet 구조, 3DS 시스템, Z-사, 크기 인쇄 등의 이용이 가능합니다 </td></tr><tr><td> <a href="http://www.TurboSquid.com" target="_blank">TurboSquid.com</a> </td><td> TurboSquid 주식회사, 뉴욕, LA </td><td> (각종 개체) </td><td> 다양한 가상 3-D 개체는 무료로이 사이트에서 또는 유료로 다운로드 할 수 있습니다. </td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td> 표 1. 특정 툴킷 및 장비의 표. </td></tr></tbody></table>

creating objects and object categories for studying perception and perceptual learning

양적 객체 인식을 연구하기 위해, 생물 시스템이나 기계, 속성 1, 바람직 자연, 정확하게 정의와 개체와 개체 카테고리를 생성 한 요구에 의해 그 인식합니다. 또한, 지각 학습에 대한 연구를 위해, 그것은 이러한 속성을 2 소설 개체와 개체 카테고리 (또는 개체 클래스)를 만들 때 유용합니다. 많은 혁신적이고 유용한 방법은 현재 새로운 개체와 개체 카테고리 3-6 (또한 심판이 판결을 참조하십시오. 7,8)을 만드는 존재합니다. 그러나, 일반적으로 기존의 방법은 결점 세 광범위한 종류를 가지고 말하기. 첫째, 형상 변화는 일반적으로 실험 5,9,10가 부과되며, 따라서 자연 카테고리의 다양성 다를 수 있습니다, 그리고 특정 인식 알고리즘에 최적화 된. 그것은 유사 콘텐츠가 exte 독립적으로 발생해야하는 것이 바람직 할 것rnally 제약 조건을 부과. 둘째, 기존의 방법은 어려움이 자연물 11-13의 형상의 복잡성을 캡처 수 있습니다. 목표는 자연 객체 인식을 공부하는 경우, 가능 confounds 및 특별한 경우를 방지 할 수 있도록, 개체와 자연이 될 객체 카테고리에 바람직하다. 셋째, 그것은 양적 종래의 방법에 의해 생성 된 자극에 사용할 수있는 정보를 측정하는 것이 어렵습니다. 그것은 가능한 정보를 정확하게 측정 할 수있는 개체와 개체 카테고리를 생성하는 것이 바람직이어야하며, 필요한 경우, 체계적으로 (또는 &#39;조정&#39;) 조작. 것 이 하나가 양적 측면에서 기본 객체 인식 작업을 책정 할 수 있습니다. 여기서 우리는 위의 조건이 모두 세 충족 알고리즘 또는 방법의 집합을 설명합니다. 가상 morphogenesis (VM)은이 &#39;디지털 배아&#39;이라는 소설 자연 가상 3-D 객체를 생성embryogenesis (14)의 생물학적 과정을 시뮬레이션. 가상 계통 발생 론 (VP)는 자연 선택 9,12,13의 진화 과정을 시뮬레이션하여 소설 자연 객체 카테고리를 만듭니다. 이 시뮬레이션에 의해 만들어 객체와 객체 카테고리가 추가로 형상 특성 15,16의 체계적 변화를 생성하기 위해 다양한 변형 방법으로 조작 할 수 있습니다. VP과 방법을 변형도 디지털 배아가 아닌 다른 소설 가상 개체에, 또는 실제 개체 9,13의 가상 버전, 원칙적으로 적용 할 수 있습니다. 이 방식으로 만든 가상 객체는 표면 질감, 조명, 크기, 시점과 배경의 원하는 조작으로 기존의 그래픽 툴킷을 사용하여 시각적 이미지로 렌더링 할 수 있습니다. 가상 개체는 또한 기존의 3-D prototyper를 사용하여 haptic 개체로 &#39;인쇄&#39;할 수 있습니다. 우리는 또한 illus 도움이 계산 알고리즘의 일부 구현을 설명알고리즘의 잠재력 유틸리티를 trate. 그것은 그들의 구현에서 알고리즘을 구별하는 것이 중요합니다. 구현은 기본 알고리즘의 &#39;원칙의 증거&#39;로 단독 제공 데모입니다. 그것은 일반적으로 계산 알고리즘의 구현은 종종 알고리즘 자체는하지 않는 한계를 가지고 있습니다하는 것이 중요합니다. 함께 이러한 방법은 모두 생물 및 전산 시스템에 의한 객체 인식 및 지각 학습을 공부에 대한 강력하고 유연한 도구의 집합을 나타냅니다. 적절한 확장을 통해 이러한 방법은 morphogenesis와 계통 발생 론의 연구에 유용 할 수 있습니다.

VM은 새로운 3-D 모양의 거의 무한한 공급을 생성하는 데 사용할 수 있습니다. VM 알고리즘을 사용하여 생성 일부 표본 디지털 배아는 그림 1의 하단 패널에 표시됩니다.이 16 배아의 각 40 성장 (표 1 참조) Cygwin의 디지털 배아 도구에서 &#39;growEmbryos.exe&#39;프로그램을 사용하여 생성 된 사이클. 다른 모든 성장 매개 변수는 프로그램에 의해 내부적으로 설정되었습니다. 이러한 매개 변수의 대부분은 (한 배아에서 다음과 동일, 즉) 상수했다. 이러한 morphogen 소스의 위치와 강도 등의 몇 가지 매개 변수는 각 실행에 대해 독립적으로 프로그램에 의해 내부적으로 설정 한 임의의 매개 변수를했다. 이 16 배아 간의 모양 변형이 임의의 매개 변수의 변화의 결과로 전적으로 나타났다. 일부 임의로 선택한 텍스처를 사용하여 표면 텍스처링 34,35의 예는 그림 2A에 표시됩니다. 의 시각적 장면rbitrary 복잡성은 그림의 2B에 표시된 상업적으로 이용 가능한 3-D 모델링 및 렌더링 환경을 사용하여 만들 수 있습니다. 디지털 배아를 사용 VP에 의해 생성 된 대표 &#39;가족 나무&#39;는 그림 3에 표시됩니다. 그림 4와 같이 비교 나무는 또한, 디지털 배아가 아닌 다른 개체를 사용하여 구성 할 수 있습니다. 실험은 또한 객체의 다른 집합으로 카테고리를 정의 할 수 있습니다하지만 두 경우 모두에 공통 조상을 공유하는 개체 straightforwardly, 카테고리를 구성합니다. 이 VM 및 VP 알고리즘의 현재 구현으로 계단이나 평면 개체에 반대 비교적 부드러운 곡선 표면을 생산하는 경향이 그림 4에서 지적 가치가있다. 그것은이 아마도 이러한 알고리즘 우리의 구현의 제한이 아닌 알고리즘 자체입니다 또한 지적 가치, biolological 프로세스부터 objec를 생성 할 수 있습니다평면 표면과 계단 개요 (예., 장미 잎)와 TS. 도 5 및 6은 객체 모양과 객체 카테고리의 원칙 유사 콘텐츠를 만들 수 두에 추가하여 사용할 수 있습니다 방법, 또는 그 대신, VP의 전형적인 결과를 보여줍니다. 그림 7의 상단 패널은 두 디지털 배아의 시각적 렌더링을 보여줍니다, 그리고 그림 7의 하단 패널은 상업적으로 이용 가능한 3-D의 prototyper에 의해 생성 된 해당 출력을 보여줍니다. 도 8 및 9는 특정 시각적 객체를 분류하는 이미지 조각을 사용하기위한 제 6 항에 설명되어있는 절차를 보여줍니다. <img alt="그림 1" fo:content-width="4in" fo:src="/files/ftp_upload/3358/3358fig1highres.jpg" src="/files/ftp_upload/3358/3358fig1.jpg" /> 1 그림. 가상 morphogenesis. </STRONG&gt; 아래 패널은 &quot;디지털 배아&quot;14라는 소설 자연, 가상 3-D 객체의 유형을 보여줍니다. morphogen로 인한 세포 분열, 세포 성장, 세포 이동 및 프로그래밍 세포 죽음을 7,8,36,37 : 디지털 배아는 생물학적 embryogenesis의 주요 프로세스의 일부 중 하나 이상을 시뮬레이션에 의해 생성 할 수 있습니다. 각 운영 icosahedron (맨 위 패널에 표시)로 시작, 그 배의 VM 매개 변수 설정 (또는 &#39;유전자형&#39;)에 따라 고유 한 배아를 생성합니다. 그들은 서로 다른 genotypes을 가지고 있기 때문에 따라서, 아래 패널의 16 배아는 다른 모양을 갖추고 있습니다. 필요에 따라 간단하거나 더 복잡한 모양이 배의 유전자형을 조작하여 (예를 들어, 최적의 시각적 계층 구조의 특정 수준의 뉴런을 자극하는)를 생성 할 수 있습니다. 프로그램 된 세포 사망을 제외한 상기 embryogenetic 프로세스의 모든 배아가 게재 생성에 시뮬레이션했다. 시뮬레이션 프로그램 된 세포 죽음은 특히이(미도시)에 타겟팅 된 들여 쓰기를 만들기위한 유용합니다. <img alt="그림 2" fo:content-width="3.6in" fo:src="/files/ftp_upload/3358/3358fig2highres.jpg" src="/files/ftp_upload/3358/3358fig2.jpg" /> 그림 2. 디지털 배아를 사용하여 시각적 자극을 만드는 중입니다. 모든 가상 3-D 객체와 마찬가지로, 디지털 배아는 그래픽 표준 3-D 그래픽 툴킷을 사용하여 임의의 복잡한 시각적 장면을 만들 조작 할 수 있습니다. 이 그림은 몇 가지 일반적인 조작을 보여줍니다. (A) 동일한 디지털 배아은 다양한 질감을 사용하여 질감이며, 왼쪽 상단에 눈에 보이지 않는 광원에서 불. (B) A 위장 현장이 크기 조정 및 디지털 배아를 재 오리엔테이션과에 의해 생성됩니다 디지털은과 질감있는 동일한 배경을 배치. 디지털 배아는 오른쪽 아래 사분면에있는 &#39;일반보기&#39;에서 찾을 수 있습니다. 시각적 자극 cre의 추가 예를 들어디지털 배아를 사용 ated, 심판이 판결을 참조하십시오. 9,10,12-14,38. <img alt="그림 3" fo:content-width="5in" fo:src="/files/ftp_upload/3358/3358fig3highres.jpg" src="/files/ftp_upload/3358/3358fig3.jpg" /> 그림 3. VP를 사용하여 디지털 배아 카테고리를 만듭니다. VP 알고리즘은 두 경우 모두, 소설 객체와 객체 카테고리에 같은 변화가 선택적으로 축적 물려 전할 수있는 등장한다는 점에서 생물학적 진화를 에뮬레이트합니다. 각 세대 G 전에서 선택된 배아가 생성 G 전 1로 이어지는, 낳다. 자손들은 부모의 형상 특성을 상속하지만, 개발로 자신의 형상 변화를 (그들의 유전자형의 작은 변화에 의해 결정) 발생합니다. 이 그림은 하나의 공통된 조상, icosahedron부터 후손의 세 세대의 &#39;가족 나무&#39;를 보여줍니다. 그이 경우 형상의 복잡성이 증가 icosahedron에서 generat에 있습니다이온 G 1,하지만 G 한 이후부터. 전화 번호의 증가 (예., 세포 분열) icosahedron에서 세대 G 1 허용 된 때문이다,하지만 G 한 이후부터. 일반적으로 세포 분열은 모양의 전반적인 복잡성을 변경하지 않고 셀 이동 및 세포 성장의 변화 모양과 같은 다른 morphogenetic 프로세스 반면, 모양의 복잡성을 증가하는 경향이있다. <img alt="그림 4" fo:content-width="6in" fo:src="/files/ftp_upload/3358/3358fig4highres.jpg" src="/files/ftp_upload/3358/3358fig4.jpg" /> 4 그림. VP는 디지털 배아가 아닌 다른 가상 개체를 사용하여.이 그림은 디지털 배아가 아닌 가상 개체가 VP에 대한 입력으로 사용할 수있는 일반 원칙을 설명하는 데 도움이됩니다. 현재 형태의 VP 알고리즘은 누구의 표면에 삼각형의 전적으로 구성되어있는 가상 3-D 개체에 작동 할 수 있습니다. 세대 G 한 compris의 에드 (왼쪽에서 오른쪽으로) 박, 다이아몬드, 얼굴 마스크, 사과, 록, 그리고 선인장. VP가 필요하지 않기 때문에,이 그림에서 세대 G 1 개체가 공통 조상을 가지고하지 않습니다. G 2, G 3 개체는 G 1의 바위의 자손을 나타냅니다. 어떤 세포 분열은 모든 형상 변화가 전적으로 운동 및 / 또는 주어진 개체의 개별 &#39;셀&#39;의 성장에서 발생한 있도록 모든 세대에 사용할 수 없습니다. <img alt="그림 5" fo:content-width="6.5in" fo:src="/files/ftp_upload/3358/3358fig5highres.jpg" src="/files/ftp_upload/3358/3358fig5.jpg" /> 그림 5. 모양의 부드러운 변화를 만들어 모핑 사용합니다. 변형이 포함됩니다 주어진 두 물체를 (이 그림 맨 왼쪽과 배아 맨 오른쪽) 복용하고 두 지정의 해당 꼭지점 사이에 보간하여 중간 개체 (배아를 개입) 계산차원 물체. 표시된 경우, 모든 꼭지점이 변형 선형의 결과, 같은 스칼라 요소를 사용하여 보간했다. 그러나, (미도시)에 비 선형 개체를 morph 할 수도 있습니다. 두 객체의 꼭지점 사이의 정확한 일대일 대응이있을 때 표시되는 경우에서와 같이 변형은 계산 간단합니다. 그래서 17,18 일에 대한 고유 한 원칙 방법은 없습니다하지만 그러나 그것은 관계없이 꼭지점이 정확히 일치 여부의 주어진 두 가상 객체 사이의 morph에, 원칙적으로 가능합니다. <img alt="그림 6" fo:content-width="6in" fo:src="/files/ftp_upload/3358/3358fig6highres.jpg" src="/files/ftp_upload/3358/3358fig6.jpg" /> 6 그림. 모양의 부드러운 변화를 만드는 주요 구성 요소를 사용합니다. (A) 평균 배아. 이 배아 400 배아의 산술 평균 (의 K와 L 카테고리에서 200 각 대표그림 3). 단계 4.3에 설명 된대로 주요 구성 요소가 계산되었습니다. 주요 구성 요소 (미도시) 25,26을 400 배아의 상호 독립적 인 추상적 형상 치수를 나타냅니다합니다. 400 배아 함께 모든 변화, 또는 태아의 총칭 사용할 수있는 형태의 정보에 대해 설명 399 비 제로 주요 구성 요소 25,26를 얻을 수 있습니다. 관례 상, 주요 구성 요소가 자신의 고유 값의 감소 순서하거나 25,26 설명 전체 분산의 비율에 배치된다. 이 경우, 처음 두 주요 구성 요소는 각각 73%와 400 배아에서 사용할 수있는 형태 정보의 19 %를 차지한다. (B) 주요 구성 요소 1 다른 가중치를 (또는 더 정확하게, 가중 고유 값) 대표 태아. 주요 Compon의 다른 가중치를 나타냅니다 -0.2의 동등한 단계 -2 (맨 오른쪽)에 +2 (맨 왼쪽)에서 다양한 무게는. (C) 태아다닐 2. 무게는 +2 (맨 왼쪽)에서 -0.2의 동등한 단계 -2 (맨 오른쪽)으로 다양. 주요 구성 요소를 조작하는 전용 (예., 경우에 배의 날개 표시) 배의 특정 특정 신체 부위를 조작하지 않습니다. 필요한 경우, 가상의 신체 부위를 3-D 개체가 (미도시) 상용화 3-D 모델링 환경의 대부분을 사용하는 임의의 사용자 정의 방식으로 조작 할 수 있습니다. <img alt="그림 7" fo:content-width="4in" fo:src="/files/ftp_upload/3358/3358fig7highres.jpg" src="/files/ftp_upload/3358/3358fig7.jpg" /> 그림 7. haptic 개체를 만듭니다. 가상 3-D 개체가 3-D &#39;프린터&#39;또는 ​​prototyper, 표준을 사용하여 haptic 개체로 상업적으로 이용 가능한 &#39;인쇄&#39;할 수 있습니다. 이 그림은 시각적 개체 (맨 위 행) 또는 해당 haptic 객체 (하단 행)로 렌더링 디지털 배아를 보여줍니다. haptic 객체들개체가 훨씬 작거나 큰 크기로 인쇄 할 수 있지만이 그림에서 hown는 약 6cm 폭 (규모 줄이 = 1 ㎝)로 인쇄했다. <img alt="그림 8" src="/files/ftp_upload/3358/3358fig8.jpg" /> 그림 8. 예를 들어 정보 조각에 대한 템플릿이 있습니다.이 예에서는 템플릿과 연결된 0.69의 임계 값이 있습니다. <img alt="그림 9" fo:content-width="2.5in" fo:src="/files/ftp_upload/3358/3358fig9highres.jpg" src="/files/ftp_upload/3358/3358fig9.jpg" /> 그림 9. 개체 카테고리가 알려진되지 않은 새로운 이미지를 결정해야합니다.

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Creating Objects and Object Categories for Studying Perception and Perceptual Learning

우리는 정확하게 정의 된 기능 변화와 자연 3-D 개체와 개체 카테고리를 만들기위한 새로운 방법을 설명합니다. 우리는 morphogenesis 다음 Visual 이미지 나 haptic 개체로 렌더링 할 수있는 소설, 자연 가상 3-D 개체와 개체 카테고리를 만들 계통 발생 론의 생물학적 과정의 시뮬레이션을 사용합니다.

지각과 지각 학습 유학을위한 객체와 객체 카테고리 만들기

In order to quantitatively study object perception, be it perception by biological systems or by machines, one needs to create objects and object ...

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Research

JoVE Journal

Neuroscience

11.7K 조회수.  Georgia Health Sciences University. 우리는 정확하게 정의 된 기능 변화와 자연 3-D 개체와 개체 카테고리를 만들기위한 새로운 방법을 설명합니다. 우리는 morphogenesis 다음 Visual 이미지 나 haptic 개체로 렌더링 할 수있는 소설, 자연 가상 3-D 개체와 개체 카테고리를 만들 계통 발생 론의 생물학적 과정의 시뮬레이션을 사용합니다.

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C. elegans Positive Butanone Learning, Short-term, and Long-term Associative Memory Assays

The memory of experiences and learned information is critical for organisms to make choices that aid their survival. C. elegans navigates its environment through neuron-specific detection of food and chemical odors1, 2, and can associate nutritive states with chemical odors3, temperature4, and the pathogenicity of a food source5.
Here, we describe assays of C. elegans associative learning and short- and long-term associative memory. We modified an aversive olfactory learning paradigm6 to instead produce a positive response; the assay involves starving ~400 worms, then feeding the worms in the presence of the AWC neuron-sensed volatile chemoattractant butanone at a concentration that elicits a low chemotactic index (similar to Toroyama et al.7). A standard population chemotaxis assay1 tests the worms' attraction to the odorant immediately or minutes to hours after conditioning.
After conditioning, wild-type animals' chemotaxis to butanone increases ~0.6 Chemotaxis Index units, its "Learning Index". Associative learning is dependent on the presence of both food and butanone during training. Pairing food and butanone for a single conditioning period ("massed training") produces short-term associative memory that lasts ~2 hours. Multiple conditioning periods with rest periods between ("spaced training") yields long-term associative memory (&lt;40 hours), and is dependent on the cAMP Response Element Binding protein (CREB),6 a transcription factor required for long-term memory across species.8
Our protocol also includes image analysis methods for quick and accurate determination of chemotaxis indices. High-contrast images of animals on chemotaxis assay plates are captured and analyzed by worm counting software in MatLab. The software corrects for uneven background using a morphological tophat transformation.9 Otsu's method is then used to determine a threshold to separate worms from the background.10 Very small particles are removed automatically and larger non-worm regions (plate edges or agar punches) are removed by manual selection. The software then estimates the size of single worm by ignoring regions that are above a specified maximum size and taking the median size of the remaining regions. The number of worms is then estimated by dividing the total area identified as occupied by worms by the estimated size of a single worm.
We have found that learning and short- and long-term memory can be distinguished, and that these processes share similar key molecules with higher organisms.6,8 Our assays can quickly test novel candidate genes or molecules that affect learning and short- or long-term memory in C. elegans that are relevant across species.

C. elegans Positive Butanone Learning, Short-term, and Long-term Associative Memory Assays

Here we describe methods to test C. elegans associative learning and short- and long-term associative memory. These population assays employ the worms abilities to chemotax toward volatile odorants, and form positive associations upon pairing food with the chemoattractant butanone. Increasing the number of conditioning periods induces long-term memory.

C. 엘레간스 긍정적인 Butanone 학습, 단기 및 장기 연관 메모리 Assays

The memory of experiences and learned information is critical for organisms to make choices that aid their survival. C. elegans navigates its environment ...

연구

신경과학

Using Affordable LED Arrays for Photo-Stimulation of Neurons

Standard slice electrophysiology has allowed researchers to probe individual components of neural circuitry by recording electrical responses of single cells in response to electrical or pharmacological manipulations1,2. With the invention of methods to optically control genetically targeted neurons (optogenetics), researchers now have an unprecedented level of control over specific groups of neurons in the standard slice preparation. In particular, photosensitive channelrhodopsin-2 (ChR2) allows researchers to activate neurons with light3,4. By combining careful calibration of LED-based photostimulation of ChR2 with standard slice electrophysiology, we are able to probe with greater detail the role of adult-born interneurons in the olfactory bulb, the first central relay of the olfactory system. Using viral expression of ChR2-YFP specifically in adult-born neurons, we can selectively control young adult-born neurons in a milieu of older and mature neurons. Our optical control uses a simple and inexpensive LED system, and we show how this system can be calibrated to understand how much light is needed to evoke spiking activity in single neurons. Hence, brief flashes of blue light can remotely control the firing pattern of ChR2-transduced newborn cells.

Adult-born neurons expressing ChR2 can be manipulated in slice electrophysiological preparations in order to examine their contribution towards the function of olfactory neural circuits.

뉴런의 사진 자극에 저렴한 LED 배열을 사용하여

Standard slice electrophysiology has allowed researchers to probe individual components of neural circuitry by recording electrical responses of single ...

Selective Viral Transduction of Adult-born Olfactory Neurons for Chronic in vivo Optogenetic Stimulation

Local interneurons are continuously regenerated in the olfactory bulb of adult rodents1-3. In this process, called adult neurogenesis, neural stem cells in the walls of the lateral ventricle give rise to neuroblasts that migrate for several millimeters along the rostral migratory stream (RMS) to reach and incorporate into the olfactory bulb. To study the different steps and the impact of adult-born neuron integration into preexisting olfactory circuits, it is necessary to selectively label and manipulate the activity of this specific population of neurons. The recent development of optogenetic technologies offers the opportunity to use light to precisely activate this specific cohort of neurons without affecting surrounding neurons4,5. Here, we present a series of procedures to virally express Channelrhodopsin2(ChR2)-YFP in a temporally restricted cohort of neuroblasts in the RMS before they reach the olfactory bulb and become adult-born neurons. In addition, we show how to implant and calibrate a miniature LED for chronic in vivo stimulation of ChR2-expressing neurons.

Selective Viral Transduction of Adult-born Olfactory Neurons for Chronic in vivo Optogenetic Stimulation

Adult-born neurons of the olfactory bulb can be optogenetically controlled using Channelrhodopsin2-expressing lentiviral injection in the rostral migratory stream and chronic photostimulation with an implanted miniature LED.

만성에 대한 성인 태어나 강한 뉴런의 선택 바이러스성 전달 생체내에 Optogenetic의 자극

Local interneurons are continuously regenerated in the olfactory bulb of adult rodents1-3. In this process, called adult neurogenesis, neural stem cells ...

MPI CyberMotion Simulator: Implementation of a Novel Motion Simulator to Investigate Multisensory Path Integration in Three Dimensions

Path integration is a process in which self-motion is integrated over time to obtain an estimate of one's current position relative to a starting point 1. Humans can do path integration based exclusively on visual 2-3, auditory 4, or inertial cues 5. However, with multiple cues present, inertial cues - particularly kinaesthetic - seem to dominate 6-7. In the absence of vision, humans tend to overestimate short distances (&lt;5 m) and turning angles (&lt;30&deg;), but underestimate longer ones 5. Movement through physical space therefore does not seem to be accurately represented by the brain.
Extensive work has been done on evaluating path integration in the horizontal plane, but little is known about vertical movement (see 3 for virtual movement from vision alone). One reason for this is that traditional motion simulators have a small range of motion restricted mainly to the horizontal plane. Here we take advantage of a motion simulator 8-9 with a large range of motion to assess whether path integration is similar between horizontal and vertical planes. The relative contributions of inertial and visual cues for path navigation were also assessed.
16 observers sat upright in a seat mounted to the flange of a modified KUKA anthropomorphic robot arm. Sensory information was manipulated by providing visual (optic flow, limited lifetime star field), vestibular-kinaesthetic (passive self motion with eyes closed), or visual and vestibular-kinaesthetic motion cues. Movement trajectories in the horizontal, sagittal and frontal planes consisted of two segment lengths (1st: 0.4 m, 2nd: 1 m; &plusmn;0.24 m/s2 peak acceleration). The angle of the two segments was either 45&deg; or 90&deg;. Observers pointed back to their origin by moving an arrow that was superimposed on an avatar presented on the screen.
Observers were more likely to underestimate angle size for movement in the horizontal plane compared to the vertical planes. In the frontal plane observers were more likely to overestimate angle size while there was no such bias in the sagittal plane. Finally, observers responded slower when answering based on vestibular-kinaesthetic information alone. Human path integration based on vestibular-kinaesthetic information alone thus takes longer than when visual information is present. That pointing is consistent with underestimating and overestimating the angle one has moved through in the horizontal and vertical planes respectively, suggests that the neural representation of self-motion through space is non-symmetrical which may relate to the fact that humans experience movement mostly within the horizontal plane.

An efficient way to gain insight into how humans navigate themselves in three dimensions is described. The method takes advantage of a motion simulator capable of moving observers in ways unattainable by traditional simulators. Results confirm that movement in the horizontal plane is underestimated, while vertical movement is overestimated.

MPI Cyber​​Motion 시뮬레이터 : 가로, 세로, 높이로 Multisensory 경로 통합을 조사할 소설 모션 시뮬레이터의 구현

Path integration is a process in which self-motion is integrated over time to obtain an estimate of one's current position relative to a starting point 1. ...

High-resolution Functional Magnetic Resonance Imaging Methods for Human Midbrain

Functional MRI (fMRI) is a widely used tool for non-invasively measuring correlates of human brain activity. However, its use has mostly been focused upon measuring activity on the surface of cerebral cortex rather than in subcortical regions such as midbrain and brainstem. Subcortical fMRI must overcome two challenges: spatial resolution and physiological noise. Here we describe an optimized set of techniques developed to perform high-resolution fMRI in human SC, a structure on the dorsal surface of the midbrain; the methods can also be used to image other brainstem and subcortical structures.
High-resolution (1.2 mm voxels) fMRI of the SC requires a non-conventional approach. The desired spatial sampling is obtained using a multi-shot (interleaved) spiral acquisition1. Since, T2* of SC tissue is longer than in cortex, a correspondingly longer echo time (TE ~ 40 msec) is used to maximize functional contrast. To cover the full extent of the SC, 8-10 slices are obtained. For each session a structural anatomy with the same slice prescription as the fMRI is also obtained, which is used to align the functional data to a high-resolution reference volume.
In a separate session, for each subject, we create a high-resolution (0.7 mm sampling) reference volume using a T1-weighted sequence that gives good tissue contrast. In the reference volume, the midbrain region is segmented using the ITK-SNAP software application2. This segmentation is used to create a 3D surface representation of the midbrain that is both smooth and accurate3. The surface vertices and normals are used to create a map of depth from the midbrain surface within the tissue4.
Functional data is transformed into the coordinate system of the segmented reference volume. Depth associations of the voxels enable the averaging of fMRI time series data within specified depth ranges to improve signal quality. Data is rendered on the 3D surface for visualization.
In our lab we use this technique for measuring topographic maps of visual stimulation and covert and overt visual attention within the SC1. As an example, we demonstrate the topographic representation of polar angle to visual stimulation in SC.

This article describes techniques to perform high-resolution functional magnetic resonance imaging with 1.2 mm sampling in human midbrain and subcortical structures using a 3T scanner. Use of these techniques to resolve topographic maps of visual stimulation in the human superior colliculus (SC) is given as an example.

인간 Midbrain위한 고해상도 기능성 자기 공명 영상 방법

Functional MRI (fMRI) is a widely used tool for non-invasively measuring correlates of human brain activity. However, its use has mostly been focused upon ...

Optical Recording of Suprathreshold Neural Activity with Single-cell and Single-spike Resolution

Signaling of information in the vertebrate central nervous system is often carried by populations of neurons rather than individual neurons. Also propagation of suprathreshold spiking activity involves populations of neurons. Empirical studies addressing cortical function directly thus require recordings from populations of neurons with high resolution. Here we describe an optical method and a deconvolution algorithm to record neural activity from up to 100 neurons with single-cell and single-spike resolution. This method relies on detection of the transient increases in intracellular somatic calcium concentration associated with suprathreshold electrical spikes (action potentials) in cortical neurons. High temporal resolution of the optical recordings is achieved by a fast random-access scanning technique using acousto-optical deflectors (AODs)1. Two-photon excitation of the calcium-sensitive dye results in high spatial resolution in opaque brain tissue2. Reconstruction of spikes from the fluorescence calcium recordings is achieved by a maximum-likelihood method. Simultaneous electrophysiological and optical recordings indicate that our method reliably detects spikes (&gt;97% spike detection efficiency), has a low rate of false positive spike detection (&lt; 0.003 spikes/sec), and a high temporal precision (about 3 msec) 3. This optical method of spike detection can be used to record neural activity in vitro and in anesthetized animals in vivo3,4.

Understanding the function of the vertebrate central nervous system requires recordings from many neurons because cortical function arises on the level of populations of neurons. Here we describe an optical method to record suprathreshold neural activity with single-cell and single-spike resolution, dithered random-access scanning. This method records somatic fluorescence calcium signals from up to 100 neurons with high temporal resolution. A maximum-likelihood algorithm deconvolves the underlying suprathreshold neural activity from the somatic fluorescence calcium signals. This method reliably detects spikes with high detection efficiency and a low rate of false positives and can be used to study neural populations in vitro and in vivo.

단일 셀 및 단일 스파이크 해상도 suprathreshold 신경 활동의 광 기록

Signaling of information in the vertebrate central nervous system is often carried by populations of neurons rather than individual neurons. Also ...

Mapping Cortical Dynamics Using Simultaneous MEG/EEG and Anatomically-constrained Minimum-norm Estimates: an Auditory Attention Example

Magneto- and electroencephalography (MEG/EEG) are neuroimaging techniques that provide a high temporal resolution particularly suitable to investigate the cortical networks involved in dynamical perceptual and cognitive tasks, such as attending to different sounds in a cocktail party. Many past studies have employed data recorded at the sensor level only, i.e., the magnetic fields or the electric potentials recorded outside and on the scalp, and have usually focused on activity that is time-locked to the stimulus presentation. This type of event-related field / potential analysis is particularly useful when there are only a small number of distinct dipolar patterns that can be isolated and identified in space and time. Alternatively, by utilizing anatomical information, these distinct field patterns can be localized as current sources on the cortex. However, for a more sustained response that may not be time-locked to a specific stimulus (e.g., in preparation for listening to one of the two simultaneously presented spoken digits based on the cued auditory feature) or may be distributed across multiple spatial locations unknown a priori, the recruitment of a distributed cortical network may not be adequately captured by using a limited number of focal sources.
Here, we describe a procedure that employs individual anatomical MRI data to establish a relationship between the sensor information and the dipole activation on the cortex through the use of minimum-norm estimates (MNE). This inverse imaging approach provides us a tool for distributed source analysis. For illustrative purposes, we will describe all procedures using FreeSurfer and MNE software, both freely available. We will summarize the MRI sequences and analysis steps required to produce a forward model that enables us to relate the expected field pattern caused by the dipoles distributed on the cortex onto the M/EEG sensors. Next, we will step through the necessary processes that facilitate us in denoising the sensor data from environmental and physiological contaminants. We will then outline the procedure for combining and mapping MEG/EEG sensor data onto the cortical space, thereby producing a family of time-series of cortical dipole activation on the brain surface (or "brain movies") related to each experimental condition. Finally, we will highlight a few statistical techniques that enable us to make scientific inference across a subject population (i.e., perform group-level analysis) based on a common cortical coordinate space.

We use magneto- and electroencephalography (MEG/EEG), combined with anatomical information captured by magnetic resonance imaging (MRI), to map the dynamics of the cortical network associated with auditory attention.

동시 멕 / EEG와 해부학적인 몸의 구조 제약 최소 - 표준 견적을 사용하여 매핑 두피 역학 : 청각주의 예

Magneto- and electroencephalography (MEG/EEG) are neuroimaging techniques that provide a high temporal resolution particularly suitable to investigate the ...

Drosophila Adult Olfactory Shock Learning

Drosophila have been used in classical conditioning experiments for over 40 years, thus greatly facilitating our understanding of memory, including the elucidation of the molecular mechanisms involved in cognitive diseases1-7. Learning and memory can be assayed in larvae to study the effect of neurodevelopmental genes8-10 and in flies to measure the contribution of adult plasticity genes1-7. Furthermore, the short lifespan of Drosophila facilitates the analysis of genes mediating age-related memory impairment5,11-13. The availability of many inducible promoters that subdivide the Drosophila nervous system makes it possible to determine when and where a gene of interest is required for normal memory as well as relay of different aspects of the reinforcement signal3,4,14,16.
Studying memory in adult Drosophila allows for a detailed analysis of the behavior and circuitry involved and a measurement of long-term memory15-17. The length of the adult stage accommodates longer-term genetic, behavioral, dietary and pharmacological manipulations of memory, in addition to determining the effect of aging and neurodegenerative disease on memory3-6,11-13,15-21.
Classical conditioning is induced by the simultaneous presentation of a neutral odor cue (conditioned stimulus, CS+) and a reinforcement stimulus, e.g., an electric shock or sucrose, (unconditioned stimulus, US), that become associated with one another by the animal1,16. A second conditioned stimulus (CS-) is subsequently presented without the US. During the testing phase, Drosophila are simultaneously presented with CS+ and CS- odors. After the Drosophila are provided time to choose between the odors, the distribution of the animals is recorded. This procedure allows associative aversive or appetitive conditioning to be reliably measured without a bias introduced by the innate preference for either of the conditioned stimuli. Various control experiments are also performed to test whether all genotypes respond normally to odor and reinforcement alone.

Drosophila Adult Olfactory Shock Learning

The method to measure adult Drosophila associative memory is described. The assay is based on the ability of the fly to associate an odor presented with a negative reinforcer (electric shock) and then recall this information at a later time, allowing memory to be measured.

초파리 성인 후각 충격 학습

Drosophila have been used in classical conditioning experiments for over 40 years, thus greatly facilitating our understanding of memory, including the ...

Whole Mount Immunolabeling of Olfactory Receptor Neurons in the Drosophila Antenna

Odorant molecules bind to their target receptors in a precise and coordinated manner. Each receptor recognizes a specific signal and relays this information to the brain. As such, determining how olfactory information is transferred to the brain, modifying both perception and behavior, merits investigation. Interestingly, there is emerging evidence that cellular transduction and transcriptional factors are involved in the diversification of olfactory receptor neuron. Here we provide a robust whole mount immunological labeling method to assay in vivo olfactory receptor neuron organization. Using this method, we identified all olfactory receptor neurons with anti-ELAV antibody, a known pan-neural marker and Or49a-mCD8::GFP, an olfactory receptor neuron specifically expressed in Nba neuron using anti-GFP antibody.

Whole Mount Immunolabeling of Olfactory Receptor Neurons in the Drosophila Antenna

Herein we describe the process of whole mount immunostaining of Drosophila antennae, which enables us to better understand the molecular mechanisms involved in the diversification of olfactory receptor neurons (ORN)s.

에있는 후각 수용체 뉴런의 전체 마운트 Immunolabeling<em&gt; 초파리</em&gt; 안테나

Odorant molecules bind to their target receptors in a precise and coordinated manner. Each receptor recognizes a specific signal and relays this ...

Electrophysiological Method for Recording Intracellular Voltage Responses of Drosophila Photoreceptors and Interneurons to Light Stimuli In Vivo

Voltage responses of insect photoreceptors and visual interneurons can be accurately recorded with conventional sharp microelectrodes. The method described here enables the investigator to measure long-lasting (from minutes to hours) high-quality intracellular responses from single Drosophila R1-R6 photoreceptors and Large Monopolar Cells (LMCs) to light stimuli. Because the recording system has low noise, it can be used to study variability among individual cells in the fly eye, and how their outputs reflect the physical properties of the visual environment. We outline all key steps in performing this technique. The basic steps in constructing an appropriate electrophysiology set-up for recording, such as design and selection of the experimental equipment are described. We also explain how to prepare for recording by making appropriate (sharp) recording and (blunt) reference electrodes. Details are given on how to fix an intact fly in a bespoke fly-holder, prepare a small window in its eye and insert a recording electrode through this hole with minimal damage. We explain how to localize the center of a cell's receptive field, dark- or light-adapt the studied cell, and to record its voltage responses to dynamic light stimuli. Finally, we describe the criteria for stable normal recordings, show characteristic high-quality voltage responses of individual cells to different light stimuli, and briefly define how to quantify their signaling performance. Many aspects of the method are technically challenging and require practice and patience to master. But once learned and optimized for the investigator's experimental objectives, it grants outstanding in vivo neurophysiological data.

Electrophysiological Method for Recording Intracellular Voltage Responses of Drosophila Photoreceptors and Interneurons to Light Stimuli In Vivo

Sharp microelectrodes enable accurate electrophysiological characterization of photoreceptor and visual interneuron output in living Drosophila. Here we show how to use this method to record high-quality voltage responses of individual cells to controlled light stimulation. This method is ideal for studying neural information processing in insect compound eyes.