Method Article
Methods to accurately measure retinoic acid (RA) levels in small amounts of tissue do not exist. This protocol describes the easy, quantitative measurement of relative RA levels in E8.5 embryos and neurospheres using an RA reporter cell line.
Retinoic acid (RA) is an important developmental morphogen that coordinates anteroposterior and dorsoventral axis patterning, somitic differentiation, neurogenesis, patterning of the hindbrain and spinal cord, and the development of multiple organ systems. Due to its chemical nature as a small amphipathic lipid, direct detection and visualization of RA histologically remains technically impossible. Currently, methods used to infer the presence and localization of RA make use of reporter systems that detect the biological activity of RA. Most established reporter systems, both transgenic mice and cell lines, make use of the highly potent RA response element (RARE) upstream of the RAR-beta gene to drive RA-inducible expression of reporter genes, such as beta-galactosidase or luciferase. The transgenic RARE-LacZ mouse is useful in visualizing spatiotemporal changes in RA signaling especially during embryonic development. However, it does not directly measure overall RA levels. As a reporter system, the F9 RARE-LacZ cell line can be used in a variety of ways, from simple detection of RA to quantitative measurements of RA levels in tissue explants. Here we describe the quantitative determination of relative RA levels generated in embryos and neurosphere cultures using the F9 RARE-LacZ reporter cell line.
O ácido retinóico (RA) é um derivado metabolito de retinol ou vitamina A e é produzida através da actividade sequencial de várias desidrogenases celulares 1. Devido à sua natureza química anfifático, que atravessa facilmente membranas lipídicas e podem actuar como um factor morfogenético de 1 solúvel. É uma molécula essencial que regula numerosos processos celulares de desenvolvimento e adultos, actuando como um ligando para os receptores de retinóide nuclear e activação da expressão do gene de 10/02. Sem RA, estes receptores de AR (RAR) Rares ligamento no DNA e atuam como repressores; RA se ligar a esses receptores os transforma em activadores transcricionais, resultando na expressão do gene alvo 1,5,6.
Embora a via de sinalização RA está bem caracterizado, o tamanho pequeno (~ 300 Da) e da natureza anfipática da AR faz a visualização histológica direta e medição de RA atualmente tecnicamente inviável 11. O único método para direct medição de níveis de AR é através do isolamento de AR a partir de amostras de tecido, utilizando cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC) 11. Este método normalmente requer grandes quantidades de tecido, facilitados através da partilha de amostras diferentes 12. Assim, esta técnica é pouco adequado para a medição de níveis de AR em embriões individuais ou pequenas quantidades de amostra / tecido.
A fim de investigar a função celular de RA, vários métodos têm sido desenvolvidos para inferir indirectamente a presença de RA. Esses métodos fazem uso de sistemas repórter contendo o RAR-beta altamente responsivo RARO dirigir a expressão da beta-galactosidase ou luciferase 11,13,14. O ratinho transgénico repórter LacZ-RARA gerado por Rossant et ai. 13 é um sistema ideal para a visualização de regiões espaço-temporais da sinalização de AR in situ 11,13,15,16, mas não é adequada para medições quantitativas. A linha F9 celular RARE-LacZ 14, em tele outro lado, é útil para a detecção de RA e medições quantitativas dos níveis de RA em explantes de tecido 11,12,14,17,18.
Células de teratocarcinoma F9 expressam alfa endógeno, beta-, e gama-ácido retinóico receptores 19, e iniciar a diferenciação em endoderme parietal após exposição a RA 19-21. células F9 foram há muito estabelecida como um modelo para a diferenciação celular induzida por RA, o que é por isso que foi escolhido como uma linha celular ideal para um ensaio de repórter de RA. A linhagem de células repórter Sil-15 RA-F9 derivado gerado por Wagner et ai. 14 contém uma E. coli'LacZ gene a jusante de uma cópia do elemento retinóico 64-pb resposta ácido (raro) do gene (RAR-beta) beta-receptor do ácido retinóico humano. A fim de seleccionar e manter os clones estáveis, o construto também contém o gene de aminoglicósido fosfotransferase (neor) como um marcador seleccionável na presença de G418. Esta co construtonfers expressão indutível de b-galactosidase na presença de RA, o que pode ser visualizado por meio de coloração LacZ e esta resposta pode ser subsequentemente quantificado utilizando métodos colorimétricos 11,12,14,18.
Esta linha de células relatora extremamente versátil, tem sido amplamente utilizado na detecção da produção endógena de RA por meio de co-cultura de amostras de tecido com as células repórter, tais como a cóclea e 17 embrionárias explantes placa de fundo 14. Além disso, esta linha repórter foi utilizada para a quantificação dos níveis de RA na medula espinal em desenvolvimento, a cultura de secções de dados agregados de medulas espinais embrionários separadamente e adicionando meio condicionado a partir destas culturas de células F9 RARO-LacZ 18. A quantificação foi realizada após coloração LacZ através da leitura colorimétrica utilizando um leitor de placas ELISA padrão 11,12,18. Por último, esta linha de células relatora foi usado na detecção da presença de enzimas metabólicas RA por monitoring muda em níveis RA 12,18.
Aqui mostramos que a sensibilidade desta linhagem de células repórter também permite a medição dos níveis de RA gerada a partir de embriões E8.5 co-cultivadas individuais. Isto permite a comparação entre os embriões individuais de diferentes genótipos. Como um exemplo específico, Gpr161 é um GPCR órfãos que regula neurulação em parte, através da via de sinalização RA 22, e que relatam o uso desta linha de células relatora para investigar o efeito de uma mutação recessiva no Gpr161 (Gpr161 VL) sobre os níveis globais de RA no embrião. Além disso, a versatilidade e a facilidade de utilização deste sistema repórter permite a liberdade para medir e comparar os níveis de RA em amostras de tecido diferentes, mesmo em culturas de neuroesferas obtidos a partir de células estaminais de medula espinal adulta. Aqui descrevemos a determinação quantitativa dos níveis de AR relativas em embriões e culturas de neuroesferas através de co-cultura directa com o RA representante LacZ-RARE F9linha de células orter.
Todo o trabalho animal foi feito de acordo com métodos Rutgers-RWJMS IACUC aprovados.
1. Solução e Mídia Preparação
2. Cultura e Manutenção de células RARE-LacZ F9
3. Dissecção da E8.5 embriões
4. Laminectomy, Dissecção do Adulto lombar Spinal Cord e Cultura Neurosphere
5. RA Ensaio de E8.5 embriões e Medula Espinhal neuroesferas
6. Subclonagem de F9 raras células-LacZ
O LacZ-RARA F9 repórter é uma linha de células de carcinoma embrionário aderentes cultivadas na superfície revestida de gelatina. A construção repórter permite que as células respondam quantitativamente a RA com uma indução proporcional de beta-galactosidase. 11,12,14,18. Estas células exibem uma morfologia epitelial (Figura 1A). Devido à sua elevada taxa de duplicação, recomenda-se que estas células sejam divididas a cada 2 - 3 dias a uma razão de 1:10. Durante o nosso trabalho com esta linha de células relatora, observou-se que mesmo com a adição de G418 no meio de cultura, a resposta destas células a RA enfraquece depois de várias passagens (Figura 1B, à esquerda), e isso pode afectar a capacidade de repórter de esta linha de células. Esta perda de capacidade de resposta pode ser devida à perda parcial do transgene em passagens posteriores. Como tal, a subclonagem periódica é necessária para assegurar respondedores fortes e uniformes de RA (Figura1B, à direita).
Embora várias utilizações desta linha celular foi publicado anteriormente 12,14-18, aqui relatado é o uso desta linha de células para medir os níveis endógenos de AR a partir de embriões E8.5 individuais com diferentes genótipos. Os resultados Gpr161 VL / VL mutação no diminuiu RA embrionário de sinalização 22. Tal como mostrado por co-cultura de embriões dissociadas com raras células F9-LacZ, estes Gpr161 VL / VL embriões reduziram endógena RA em comparação com crias da mesma ninhada de tipo selvagem (Figura 2A). Devido à versatilidade desta linha de células relatora, também aqui relatado é uma nova utilização dessas células para detectar níveis RA produzidos por culturas de neuroesferas obtidos a partir de ratinhos adultos Gpr161 wt / wt (Figura 2B). Esta linha de células repórter foi capaz de demonstrar que as culturas de neuroesferas de células-tronco da medula espinhal adultos produzir RA endógeno. A grande diffrência na intensidade de coloração indica uma resposta de células repórter maior para neurospheres da medula espinhal, em comparação com embriões E8.5. Isto pode ser devido aos níveis muito mais elevados de AR gerados pelos neuroesferas ao longo do tempo em comparação com os embriões E8.5, o que pode ser devido ao facto de neuroesferas culturas são mais homogéneo do que os embriões E8.5 e, assim, conter mais células RA-produtoras.
A adição de diferentes concentrações de resultados a-AR em uma resposta linear dependente da dose das células repórter. Esta resposta pode ser medida colorimetricamente por leitura da absorvância a 610 nm. A curva padrão gerada pode então ser utilizada para quantificar os níveis de AR em amostras, tal como em culturas de tipo selvagem neuroesferas (Figura 3A) ou de embriões E8.5 (Figura 3B).
Figura 1. Manutenance e Subclonagem de raras células-LacZ F9. (A) Uma imagem de contraste de fase de células RARE-LacZ F9 é mostrado. Estas células têm um tempo de duplicação de 10 h ~ e tem de ser transmitido a cada 3 dias. (Aproximadamente 70 - 80% de confluência) com uma razão de 01:10 (B) controlo periódico de culturas com a adição de 1 nm a-AR e LacZ subsequente coloração deve ser feito para garantir culturas permanecem respondedores fortes e uniformes de RA (direita). Em caso de maus respondedores e não-uniformes (esquerda), deve ser realizada subclonagem. Escala de barras 100 mm. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Amostras Figura 2. LacZ Coloração de Co-cultura (dissociado E8.5 Embriões / neuroesferas) e F9 raras células-LacZ. (A) embrião de rato E8.5 s de vários genótipos foram dissociadas e semeadas em cima de raras células-LacZ F9. LacZ coloração 24 horas mais tarde permite a visualização de resposta das células F9 RARE-LacZ a RA endógena produzidos por amostras co-cultivadas. O Gpr161 vl mutação resulta na diminuição da RA endógena como visualizadas pela resposta reduzida das células repórter. (B) Esquerda. Uma imagem de contraste de fase de neuroesferas cultivadas a partir da medula espinhal células-tronco neurais adultas é mostrado. Certo. Neurospheres derivados de adulto Gpr161 medula espinhal p / p foram dissociadas e semeadas em cima de raras células-LacZ F9. A presença de precipitado azul após coloração LacZ indicar a presença de RA endógena nestes neuroesferas. A diferença na intensidade de coloração entre neuroesferas e embriões E8.5 co-culturas indicam maiores níveis de RA presente em neurospheres do que embriões E8.5. Escala das barras 100 um.target = "_ blank"> Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 3. Curva padrão e Colorimétrico quantificação dos níveis de RA. A resposta da linhagem de células repórter F9 RARO-LacZ pode ser medido colorimetricamente a 610 nm utilizando um leitor de placas ELISA padrão. (A) Curva padrão representativo, utilizado para quantificar os níveis relativos de RA tipo selvagem neurosphere cultura s. (B) Quantificação dos níveis relativos de AR a partir de embriões E8.5 co-cultivadas. N = 3; * P <0,05, teste t de estudante. As barras de erro SEM. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
StoBuffers ck / Soluções | componentes | Condições de armazenamento |
10% de desoxicolato de sódio mono-hidratado (C 24 H 39 NaO 4 · H2O) | 10 ml em 100 ml de dH2O | 4 ºC |
Cloreto de magnésio 1 M (MgCl2) | RT | |
100x ferrocianeto de potássio (K 4 [Fe (CN) 6] · 3 H 6 O) | 2,12 g em 10 ml de dH2O | RT no escuro |
100x ferricianeto de potássio (K 3 [Fe (CN) 6]) | 1,64 g em 10 ml de dH2O | RT no escuro |
20 mg / ml de X-gal (5-bromo-4-cloro-3-indolil-β-d-galactopiranósido) | adicionar 5 ml de dimetil formamida para fazer 20 mg solução estoque / ml | -20 ºC |
10 mM de (3 mg / ml), todos os trans ácido retinóico | Dissolve-se 50 mg em 16,67 ml de etanol absoluto. Prepare a aliquotas de 1 mL. | -80 ºC no escuro, em tubos de 1,5 ml âmbar microcentrífuga |
papaína | dissolver um frasco em 7 ml de HBSS | 4 ºC |
Tabela 1. Tampões e Soluções composições.
Trabalhando Buffers / Soluções | componentes | Condições de armazenamento |
meio de cultura de células F9 RARE-LacZ | 50 mL de soro bovino fetal (FBS) (concentração final 10%) | Filtrar-esterilizar. |
5 ml de 100 x penicilina estreptomicina (final de 1X conc) | Armazenar a 4 ºC. | |
4ml 50 mg / ml de G418 (final de conc 0,4 mg / ml) | ||
para 500 ml de DMEM / F-12 (com L-glutamina e HEPES) | ||
0,2% de gelatina | 25 ml de 2,0% de gelatina | Armazenar a 4 ºC. |
80 ml de água destilada | ||
Misture bem | ||
70% de etanol | 30 ml de etanol a 95% | Coloque no frasco de spray. |
70 ml de água destilada | Armazenar a RT | |
meio de dissociação Neurosphere | 1 ml 20U papaína | preparar, de fresco cada vez |
100 ul 13 mg / ml de tripsina | ||
100 ul de 7 mg de ácido hialurónico / ml | ||
28 ul de 10 mg / ml de ADNasel | ||
50 ul de 4 mg / ml de ácido quinur�ico | ||
meio de cultura Neurosphere | DMEM / F-12 (com L-glutamina e HEPES) | preparar, de fresco cada vez |
2% suplemento B-27 | ||
20 factor de ng / mL de crescimento de fibroblastos (FGF) | ||
factor de crescimento epidermal 20 ng (EGF) | ||
2,5% de glutaraldeído | 250 ul 50% de glutaraldeído | preparar, de fresco cada vez |
4750 ul de 1x PBS | ||
solução de lavagem LacZ | 0,5 ml de 10% de desoxicolato (concentração final 0,1%) | Armazenar a 4 ºC. |
1,0 ml de 100% de NP-40 (concentrado final de 0,2%) | ||
50 ml de PBS 10X | ||
água destilada para 500 ml | ||
solução de coloração X-gal | ferrocianeto de potássio 1x | preparar, de fresco cada vez |
ferricianeto de potássio 1x | ||
1 mg / ml de X-gal | ||
ao volume apropriado usando solução de lavagem LacZ | ||
F9 LacZ RARO de médio congelamento | F9 meio de cultura RARE-LacZ + 5% de DMSO | preparar, de fresco cada vez |
Tabela 2. Os tampões de Trabalho e Solution composições.
A linha de células F9 RARO-LacZ 14 é um poderoso sistema que pode ser usado para a detecção de RA produzido por explantes de tecido 12,14,17,18. É sensível a concentrações de RA tão baixas como 100 fM, sem resposta não específica detectada em células não tratadas com RA 12,14,18. Além disso, as células repórter responder aos RA todo-trans de uma forma linear dentro de um intervalo específico de concentração, permitindo assim que a reacção de LacZ a ser quantificado e utilizado para determinar a magnitude de níveis RA 12,14,18. O ensaio de repórter RA rápido e fácil aqui apresentado utiliza a linha F9 de células repórteres RARE-LacZ para visualização (Figura 2) e medição quantitativa relativa (Figura 3) de embriões e adultos cultivadas células-tronco neurais. Este sistema repórter permite a comparação dos níveis endógenos de AR entre amostras individuais, como mostrado na Figura 2. É sensível o suficiente para ser capaz de detectar RAgerado por embriões E8.5 individuais (Figura 2A), bem como RA produzidos por neuroesferas cultivadas (Figura 2B). A resposta dose-dependente desta linha de células em diferentes concentrações de RA permite a quantificação dos níveis de RA (Figura 3A) nas amostras, bem como a comparação dos níveis relativos entre as amostras de RA (Figura 3B). É importante observar que a linhagem de células repórter RARO F9 mede a quantidade total de RA gerado pelas amostras de tecido ao longo do tempo de incubação. Isto é equivalente ao saldo líquido de síntese de RA e catabolismo.
Enquanto o sistema repórter de células F9 RARE-LacZ é altamente sensível e versátil, existem várias etapas críticas de solução de problemas que temos incorporadas a fim de garantir a fiabilidade deste sistema. Em primeiro lugar, como se mostra na Figura 1, é importante para manter a saúde destas células através de passagens regulares sem que elas glinha até à confluência. Em segundo lugar, temos observado mais tarde passagens tendem a resultar em respostas RA inconsistentes, mesmo se as culturas são constantemente mantidos sob selecção com G418. Para solucionar isso, recomenda-se a descartar culturas após 20 passagens e descongelar um novo frasco. Além disso, os controlos regulares devem ser realizados para assegurar que as células repórter ainda apresentam uma resposta forte para a presença de RA nos meios de comunicação. Em terceiro lugar, se as primeiras passagens exibir fraca resposta ou não-uniforme para RA (Figura 1B, à esquerda), uma ou várias rondas de subclonagem podem ser necessários até respondedores fortes são obtidos (Figura 1B, righ t). Finalmente, antes da co-cultura, recomenda-se que as amostras de tecidos, tais como embriões e neuroesferas dissociadas são para células individuais. Temos observado que a dissociação das amostras Resultados das medições colorimétricas mais consistentes. Isto pode ser devido a uma distribuição mais uniforme da AR em poços de cultura, tal como as células dissociadas são em uniformulário de contato com as células repórter.
Várias modificações também foram feitas para o protocolo original de 14. Em primeiro lugar, a resposta RA das células F9 RARO-LacZ foram quantificadas directamente através da fixação das células e a medição da absorvência a 610 nm em vez de células de recolha e análise de lisado para a actividade de b-galactosidase 14. Outra modificação é a co-cultura directa de amostras dissociadas com F9 RARO-LacZ antes da quantificação da resposta RA. Métodos anteriores relataram a cultura de amostras separado e adicionando apenas a mídia a partir destas culturas a F9 RARE-LacZ 16,18.
Apesar de ser um sistema poderoso, o ensaio repórter RARE-LacZ F9 tem várias limitações. Uma limitação desta linha celular repórter é que, embora ele responde fortemente para a presença de todo-trans RA, que também responde a outros isómeros do ácido retinóico, incluindo 9-cis-RA e 13-cis-RA; no entanto, eles são 100 vezes mais sensíveis à all-trans-RA compavermelho para os outros isómeros 18. Uma outra limitação deste sistema é que a resposta dependente da dose linear só cai entre 10 -13 M a 10 -7 M a RA-14,18; Assim, se a comparação dos níveis de RA fora destes limites, pode ser necessário efectuar uma diluição de série da amostra até que as medições estão dentro do intervalo linear. Por último, uma vez que este é essencialmente um ensaio colorimétrico, o ponto final do desenvolvimento da cor pode variar entre amostras e experimentos. Assim, é importante que uma curva padrão estar sempre banhado em paralelo para cada experiência de forma a utilizá-lo para a quantificação da resposta das células repórter.
Em conclusão, nós relataram o uso da linha celular repórter RARE-LacZ RA F9 para medir os níveis de AR quantitativamente em embriões E8.5 e, anteriormente não declarada, em neurospheres. A versatilidade deste sistema repórter pode permitir que a quantificação dos níveis de RA em virtualmente qualquer tipo de célula ou tecido, e may resultar no desenvolvimento de aplicações variadas no futuro.
The authors have nothing to disclose.
We would like to acknowledge Dr. Michael Wagner (SUNY Downstate Medical Center) and Ben Thiede (Dr. Jeff Corwin lab, University of Virginia) for providing us with the F9 RARE-LacZ cells and technical support. This study is funded by the New Jersey Commission on Spinal Cord Research (NJCSCR) (Grantnumber:10-3092-SCR-E-0) and the New Jersey Commission on Brain Injury Research (NJCBIR) (Grant number: CBIR13FEL006).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
C3H/HeSn-Gpr161vl/J mouse strain | Jackson Laboratory | 000316 | |
F9 RARE-LacZ reporter cell line | from Dr. Michael Wagner (SUNY Downstate Medical Center) and Ben Thiede (Dr. Jeff Corwin lab, University of Virginia) | ||
DMEM/F-12 (with L-glutamine and HEPES) | ThermoFisher Scientific | 11330-057 | |
Fetal Bovine Serum (FBS), qualified | ThermoFisher Scientific | 26140-079 | Store at -20 °C in 10-ml aliquots to avoid repeated freeze-thaw; warm in 37 °C for media preparation |
Penicillin/Streptomycin | ThermoFisher Scientific | 15140-122 | Store at -20 °C in 10-ml aliquots to avoid repeated freeze-thaw; light-sensitive |
G418 | ThermoFisher Scientific | 10131-027 | Store at 4 °C; light-sensitive |
2% Gelatin | Sigma Aldrich | G1393 | Store at 4 °C |
B-27 supplement (2 % stock solution) | ThermoFisher Scientific | 17504-044 | Store at -20 °C in 1-ml aliquots to avoid repeated freeze-thaw; warm at room temperature for media preparation |
Murine Epidermal Growth Factor (EGF) | PeproTech | 315-09 | Prepare 100 μg/ml stock solution in 0.1% bovine serum albumin (BSA) in 1xPBS; prepare working concentrations by diluting with 1x PBS; store at -20 °C |
Murine Fibroblast Growth Factor (FGF)-basic | PeproTech | 450-33 | Prepare 100 μg/ml stock solution in 0.1% bovine serum albumin (BSA) in 1x PBS; prepare working concentrations by diluting with 1x PBS; store at -20 °C |
50% glutaraldehyde | Amresco | M155 | Store at 4 °C |
Sodium deoxycholate monohydrate (C24H39NaO4 · H2O) | Sigma Aldrich | D5670 | Store at RT |
X-gal (5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-d-galactopyranoside) | Promega | V3941 | Store stock at -20 °C |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma Aldrich | 41639 | Store at RT |
all-trans Retinoic Acid (at-RA) | Sigma Aldrich | R-2625 | Store 1 ml aliquots of stock in -80 °C; extremely sensitive to light |
TrypLE Express | ThermoFisher Scientific | 12605-010 | Store at RT |
0.25% trypsin-EDTA | ThermoFisher Scientific | 25200-056 | alternative to TrypLE Express; aliquot and store at -20 °C |
Hank's Balanced Salt Solution (HBSS) | ThermoFisher Scientific | 14170-112 | Store at 4 °C |
10x phosphate buffered solution (PBS) | ThermoFisher Scientific | 10010-023 | Store at 4 °C |
Papain | Worthington | LK003176 | Store at 4 °C. |
Trypsin | Worthington | LS003703 | Store in 1 ml aliquots at -20 °C. |
Hyaluronic acid | Calbiochem | 385908 | Store 200 μl aliquots at -20 °C. |
DNaseI | Worthington | LS002139 | Store in 200 μl aliquots at -20 °C |
Kynurenic acid | Sigma Aldrich | K3375 | Store in 200 μl aliquots at -20 °C |
95% ethanol | |||
Mr. Frosty Freezing container | ThermoFisher Scientific | 5100-0001 | |
10 cm culture dish (non-cell culture treated) | |||
10 cm culture dish (cell culture treated) | |||
6 cm culture dish (non-cell culture treated) | |||
96-well cell culture plates | |||
1.5 ml microcentrifuge tubes | |||
1.5 ml amber microcentrifuge tubes | |||
1.5 ml cryovials | |||
37 °C water bath | |||
surgical scissors | |||
fine surgical scissors | |||
no. 5 forceps | |||
blunt-ended forceps | |||
scalpel blade | |||
glass pasteur pipettes | |||
cotton | |||
alcohol lamp | |||
ELISA plate reader | |||
stereomicroscope |
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